View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6868A_low_48 (Length: 378)

Name: NF6868A_low_48
Description: NF6868A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6868A_low_48
NF6868A_low_48
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (23-371)||(6600335-6600683)
chr3 (23-371)||(53385212-53385560)
chr3 (23-371)||(15589586-15589934)
chr3 (23-371)||(10005188-10005536)
chr3 (23-371)||(10905798-10906146)
chr3 (23-371)||(16756779-16757127)
chr3 (23-371)||(20062248-20062596)
chr3 (23-371)||(13252278-13252626)
chr3 (23-371)||(16635361-16635709)
chr3 (23-371)||(43162685-43163033)
chr3 (23-371)||(48425035-48425383)
chr3 (23-372)||(15338857-15339206)
chr3 (23-372)||(15402703-15403052)
chr3 (23-371)||(15348439-15348787)
chr3 (23-372)||(26792592-26792941)
chr3 (23-371)||(5425124-5425471)
chr3 (23-372)||(15725127-15725475)
chr3 (23-372)||(16412475-16412824)
chr3 (23-371)||(12497836-12498184)
chr3 (23-371)||(17489438-17489786)
chr3 (23-372)||(14876692-14877041)
chr3 (23-371)||(16492375-16492723)
chr3 (23-372)||(16807119-16807468)
chr3 (23-371)||(16371001-16371349)
chr3 (23-371)||(16691748-16692096)
chr3 (23-371)||(9522307-9522655)
chr3 (23-371)||(15247735-15248083)
chr3 (23-371)||(15208479-15208827)
chr3 (23-294)||(15227247-15227518)
chr3 (23-287)||(13322919-13323183)
chr3 (23-294)||(18134606-18134877)
chr3 (58-287)||(13972387-13972616)
chr3 (58-294)||(10420305-10420541)
chr3 (23-287)||(15953235-15953499)
chr3 (23-287)||(12360809-12361073)
chr3 (23-287)||(14086271-14086535)
chr3 (25-329)||(14571448-14571752)
chr3 (23-287)||(47123542-47123806)
chr3 (23-371)||(8759265-8759613)
chr3 (23-287)||(10383567-10383831)
chr3 (23-287)||(11961301-11961565)
chr3 (23-304)||(13941622-13941903)
chr3 (23-304)||(41177120-41177401)
chr3 (23-275)||(16329938-16330190)
chr3 (58-279)||(12850554-12850775)
chr3 (23-191)||(11304136-11304304)
chr3 (178-343)||(15015966-15016131)
chr3 (119-304)||(16381180-16381362)
chr3 (119-206)||(16836858-16836945)
chr3 (119-200)||(44776941-44777022)
chr3 (23-110)||(31689067-31689154)
chr3 (23-110)||(31945070-31945157)
chr3 (148-304)||(8274660-8274816)
chr3 (148-304)||(15576473-15576629)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (24-370)||(23516734-23517080)
chr7 (23-372)||(18177700-18178049)
chr7 (23-372)||(11237176-11237525)
chr7 (23-371)||(8198586-8198934)
chr7 (23-372)||(15161020-15161369)
chr7 (23-371)||(8707563-8707911)
chr7 (23-371)||(10870953-10871301)
chr7 (23-371)||(44791315-44791663)
chr7 (23-371)||(18551722-18552070)
chr7 (23-371)||(13686021-13686370)
chr7 (23-371)||(11553066-11553414)
chr7 (23-371)||(14332355-14332703)
chr7 (23-371)||(14954578-14954926)
chr7 (23-371)||(12687459-12687807)
chr7 (23-372)||(17279-17628)
chr7 (23-371)||(15154621-15154964)
chr7 (23-350)||(14037765-14038092)
chr7 (23-350)||(14347795-14348122)
chr7 (23-371)||(15203837-15204185)
chr7 (58-371)||(15624545-15624858)
chr7 (23-295)||(12206818-12207090)
chr7 (23-287)||(19147170-19147434)
chr7 (23-287)||(20746569-20746833)
chr7 (23-290)||(15102624-15102891)
chr7 (23-287)||(14264270-14264534)
chr7 (250-371)||(9596242-9596363)
chr7 (23-287)||(11388454-11388717)
chr7 (23-287)||(11306289-11306553)
chr7 (23-287)||(16072320-16072584)
chr7 (23-287)||(8212154-8212418)
chr7 (23-329)||(13665512-13665813)
chr7 (23-372)||(16950412-16950761)
chr7 (23-287)||(14286402-14286666)
chr7 (23-287)||(49152260-49152524)
chr7 (169-341)||(35964844-35965016)
chr7 (23-287)||(6413470-6413734)
chr7 (23-371)||(18053895-18054243)
chr7 (23-287)||(14129832-14130096)
chr7 (23-287)||(14433650-14433914)
chr7 (27-190)||(1530-1693)
chr7 (225-368)||(11772208-11772351)
chr7 (23-202)||(13021316-13021495)
chr7 (148-304)||(4440011-4440167)
chr7 (23-287)||(12455662-12455925)
chr7 (34-287)||(21661933-21662183)
chr7 (119-293)||(23199763-23199937)
chr7 (119-293)||(23505890-23506064)
chr7 (31-192)||(26288157-26288318)
chr7 (196-304)||(12368607-12368715)
chr7 (119-287)||(26118631-26118799)
chr7 (23-142)||(15340455-15340574)
chr7 (161-304)||(14936443-14936586)
chr7 (161-304)||(15364036-15364179)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-372)||(109768-110117)
scaffold0029 (23-287)||(112559-112823)
scaffold0029 (58-293)||(96038-96273)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (23-371)||(27668627-27668975)
chr5 (23-372)||(14999875-15000224)
chr5 (23-372)||(22333023-22333372)
chr5 (23-371)||(40708681-40709029)
chr5 (23-371)||(41770743-41771091)
chr5 (23-371)||(19769861-19770209)
chr5 (23-371)||(27518308-27518656)
chr5 (23-371)||(34566395-34566743)
chr5 (23-372)||(27685536-27685885)
chr5 (23-371)||(16356403-16356751)
chr5 (23-371)||(27610255-27610603)
chr5 (23-372)||(29476209-29476558)
chr5 (23-369)||(22134569-22134915)
chr5 (25-372)||(37291632-37291979)
chr5 (23-372)||(22348326-22348673)
chr5 (23-371)||(23573643-23573991)
chr5 (23-372)||(18775678-18776027)
chr5 (23-372)||(23440126-23440475)
chr5 (23-371)||(20798661-20799009)
chr5 (24-372)||(23516443-23516791)
chr5 (23-371)||(21984442-21984790)
chr5 (23-371)||(25423090-25423438)
chr5 (23-371)||(26738842-26739190)
chr5 (23-371)||(20468233-20468581)
chr5 (23-371)||(23471130-23471478)
chr5 (65-371)||(21498173-21498479)
chr5 (23-219)||(20573422-20573618)
chr5 (23-293)||(22461835-22462105)
chr5 (58-303)||(28923973-28924218)
chr5 (23-200)||(21343666-21343843)
chr5 (23-372)||(24749690-24750039)
chr5 (58-303)||(28895147-28895392)
chr5 (23-287)||(22381082-22381346)
chr5 (23-287)||(23442514-23442778)
chr5 (23-287)||(24735832-24736096)
chr5 (23-373)||(22236055-22236405)
chr5 (23-281)||(24737012-24737270)
chr5 (23-372)||(23080225-23080574)
chr5 (58-314)||(20821371-20821627)
chr5 (23-287)||(21890980-21891244)
chr5 (58-294)||(20773678-20773914)
chr5 (198-371)||(21339423-21339596)
chr5 (23-287)||(20342165-20342429)
chr5 (23-263)||(21564211-21564451)
chr5 (23-287)||(22502562-22502826)
chr5 (23-287)||(37545717-37545982)
chr5 (23-287)||(14887212-14887476)
chr5 (23-287)||(25847958-25848222)
chr5 (23-278)||(24798627-24798882)
chr5 (119-304)||(17269537-17269722)
chr5 (23-219)||(21404737-21404933)
chr5 (23-247)||(21662301-21662524)
chr5 (23-247)||(21665762-21665985)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (23-371)||(19485268-19485616)
chr8 (23-371)||(17674421-17674769)
chr8 (23-371)||(20018148-20018496)
chr8 (23-371)||(19112725-19113073)
chr8 (23-372)||(22120571-22120920)
chr8 (23-371)||(30313542-30313890)
chr8 (23-371)||(19978002-19978350)
chr8 (23-372)||(22046408-22046757)
chr8 (23-371)||(15533415-15533763)
chr8 (23-371)||(23650076-23650424)
chr8 (23-370)||(22133440-22133787)
chr8 (23-370)||(22164590-22164937)
chr8 (26-371)||(16408443-16408788)
chr8 (23-363)||(32600179-32600519)
chr8 (31-371)||(21166935-21167275)
chr8 (23-371)||(21250977-21251324)
chr8 (23-371)||(21922133-21922481)
chr8 (23-371)||(21394263-21394611)
chr8 (23-371)||(21788756-21789104)
chr8 (23-295)||(22032067-22032339)
chr8 (23-371)||(22987236-22987584)
chr8 (22-372)||(21681867-21682217)
chr8 (23-215)||(15441216-15441408)
chr8 (23-287)||(1266274-1266538)
chr8 (23-371)||(20007885-20008233)
chr8 (23-247)||(23948924-23949148)
chr8 (26-371)||(20396523-20396868)
chr8 (143-371)||(22377851-22378079)
chr8 (143-371)||(22384026-22384254)
chr8 (23-294)||(20388134-20388405)
chr8 (23-372)||(21324806-21325156)
chr8 (264-372)||(18856853-18856961)
chr8 (23-287)||(22061915-22062179)
chr8 (23-287)||(29303908-29304172)
chr8 (25-287)||(19851448-19851710)
chr8 (25-287)||(19857484-19857746)
chr8 (23-372)||(23654962-23655311)
chr8 (23-287)||(20010382-20010646)
chr8 (23-287)||(14565177-14565441)
chr8 (23-287)||(6679146-6679410)
chr8 (23-371)||(21840452-21840800)
chr8 (23-254)||(16265133-16265364)
chr8 (23-286)||(31416957-31417220)
chr8 (23-287)||(804155-804419)
chr8 (23-287)||(6603693-6603957)
chr8 (226-371)||(23949158-23949302)
chr8 (23-304)||(31571307-31571588)
chr8 (23-287)||(12304793-12305057)
chr8 (23-198)||(27347261-27347436)
chr8 (291-372)||(22040162-22040243)
chr8 (23-263)||(28982392-28982632)
chr8 (23-263)||(28987612-28987852)
chr8 (133-206)||(22051008-22051081)
chr8 (148-311)||(21196960-21197123)
chr8 (148-304)||(16877560-16877716)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (23-371)||(27187269-27187617)
chr6 (23-371)||(27261623-27261971)
chr6 (23-371)||(28263297-28263645)
chr6 (23-371)||(28292472-28292820)
chr6 (23-371)||(28342046-28342394)
chr6 (23-371)||(29592020-29592368)
chr6 (23-372)||(25112385-25112734)
chr6 (23-371)||(24313268-24313616)
chr6 (23-371)||(16626817-16627165)
chr6 (23-372)||(1543183-1543532)
chr6 (23-372)||(2874902-2875251)
chr6 (23-372)||(12497859-12498208)
chr6 (23-372)||(12510693-12511042)
chr6 (23-372)||(12505188-12505537)
chr6 (23-371)||(19864520-19864868)
chr6 (23-371)||(25609961-25610309)
chr6 (23-371)||(25765390-25765737)
chr6 (23-368)||(16963470-16963815)
chr6 (23-371)||(5839319-5839667)
chr6 (23-371)||(22078788-22079136)
chr6 (23-371)||(16927740-16928088)
chr6 (23-371)||(18408043-18408391)
chr6 (23-371)||(27331533-27331881)
chr6 (23-371)||(27392273-27392621)
chr6 (23-371)||(22762555-22762903)
chr6 (23-371)||(23078302-23078650)
chr6 (23-210)||(17032395-17032582)
chr6 (23-280)||(21833172-21833429)
chr6 (58-294)||(15459204-15459440)
chr6 (23-287)||(21471434-21471698)
chr6 (23-287)||(14131363-14131627)
chr6 (23-281)||(25750642-25750900)
chr6 (23-369)||(18197649-18197995)
chr6 (23-371)||(25768024-25768372)
chr6 (250-371)||(22433929-22434050)
chr6 (23-314)||(8766305-8766596)
chr6 (23-279)||(19879131-19879387)
chr6 (23-287)||(22796816-22797080)
chr6 (23-287)||(10469033-10469297)
chr6 (40-287)||(11287782-11288029)
chr6 (58-287)||(18794558-18794787)
chr6 (23-287)||(21564316-21564580)
chr6 (40-287)||(11280689-11280936)
chr6 (69-287)||(17415365-17415583)
chr6 (196-296)||(11291818-11291918)
chr6 (23-117)||(22433830-22433924)
chr6 (23-287)||(24364245-24364509)
chr6 (58-287)||(34645770-34645999)
chr6 (23-293)||(27560795-27561065)
chr6 (133-294)||(1640715-1640876)
chr6 (82-287)||(14381651-14381856)
chr6 (121-372)||(18800873-18801124)
chr6 (152-263)||(25750908-25751019)
chr6 (119-304)||(28282980-28283165)
chr6 (23-111)||(18787721-18787809)
chr6 (25-101)||(1640634-1640710)
chr6 (148-304)||(16098008-16098164)
chr6 (148-304)||(23996206-23996362)
chr6 (163-311)||(25655456-25655604)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (23-371)||(41354496-41354844)
chr1 (23-371)||(16350626-16350974)
chr1 (23-372)||(21830287-21830636)
chr1 (23-371)||(33391056-33391404)
chr1 (23-371)||(51333520-51333868)
chr1 (23-371)||(21836934-21837282)
chr1 (23-372)||(19106351-19106700)
chr1 (23-371)||(17045042-17045390)
chr1 (23-371)||(20136762-20137110)
chr1 (23-371)||(20249834-20250182)
chr1 (23-372)||(16078678-16079008)
chr1 (23-371)||(21747519-21747866)
chr1 (23-371)||(50620271-50620619)
chr1 (23-371)||(19760893-19761241)
chr1 (23-371)||(16369281-16369629)
chr1 (23-314)||(19664960-19665251)
chr1 (23-212)||(50612602-50612791)
chr1 (23-314)||(20940147-20940438)
chr1 (23-372)||(19854298-19854647)
chr1 (23-293)||(20856866-20857136)
chr1 (23-137)||(21163264-21163378)
chr1 (23-287)||(20294396-20294660)
chr1 (58-372)||(20835914-20836231)
chr1 (23-311)||(22433203-22433491)
chr1 (23-287)||(37677063-37677328)
chr1 (23-287)||(31550292-31550556)
chr1 (23-276)||(20244184-20244437)
chr1 (121-287)||(41307907-41308073)
chr1 (119-287)||(11382674-11382842)
chr1 (23-263)||(20075194-20075434)
chr1 (23-197)||(20395194-20395368)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (23-371)||(8386381-8386729)
chr4 (23-372)||(14266593-14266942)
chr4 (23-371)||(18297174-18297522)
chr4 (23-371)||(19778488-19778836)
chr4 (23-371)||(29039099-29039447)
chr4 (23-372)||(14303672-14304020)
chr4 (23-371)||(23955716-23956064)
chr4 (23-371)||(27711305-27711653)
chr4 (23-371)||(12476569-12476917)
chr4 (23-372)||(40473009-40473358)
chr4 (23-371)||(8053318-8053666)
chr4 (23-372)||(12523645-12523994)
chr4 (23-371)||(14680536-14680884)
chr4 (23-371)||(16355140-16355488)
chr4 (23-372)||(16252139-16252488)
chr4 (23-371)||(7090402-7090749)
chr4 (23-372)||(18227140-18227489)
chr4 (23-247)||(15364355-15364579)
chr4 (23-371)||(14159461-14159809)
chr4 (23-332)||(15149740-15150049)
chr4 (23-371)||(14652277-14652625)
chr4 (23-365)||(14851067-14851409)
chr4 (23-371)||(15003319-15003667)
chr4 (189-352)||(16676417-16676580)
chr4 (23-287)||(16145881-16146145)
chr4 (23-287)||(15070382-15070646)
chr4 (23-372)||(33222887-33223236)
chr4 (23-287)||(11207270-11207534)
chr4 (23-287)||(3264833-3265097)
chr4 (23-287)||(15245893-15246157)
chr4 (193-371)||(1640120-1640298)
chr4 (23-174)||(14927151-14927302)
chr4 (23-287)||(1649316-1649580)
chr4 (23-287)||(29453576-29453840)
chr4 (23-287)||(44661905-44662169)
chr4 (23-304)||(51606203-51606484)
chr4 (130-314)||(27900462-27900646)
chr4 (121-287)||(15359129-15359295)
chr4 (23-188)||(42702872-42703037)
chr4 (194-293)||(15415059-15415158)
chr4 (41-183)||(18164332-18164474)
chr4 (23-73)||(18607823-18607873)
chr4 (130-287)||(16752669-16752826)
chr4 (327-371)||(15147579-15147623)
chr4 (23-91)||(15415214-15415282)
chr4 (225-304)||(13247816-13247895)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (23-371)||(16924860-16925208)
chr2 (23-371)||(16998600-16998948)
chr2 (23-371)||(16981752-16982100)
chr2 (23-371)||(17063317-17063665)
chr2 (23-371)||(9609736-9610084)
chr2 (23-371)||(27217616-27217964)
chr2 (23-372)||(24261970-24262319)
chr2 (23-371)||(22325351-22325699)
chr2 (23-371)||(24878490-24878838)
chr2 (23-371)||(10868450-10868798)
chr2 (23-371)||(24709633-24709981)
chr2 (23-371)||(27370869-27371217)
chr2 (23-371)||(44386064-44386412)
chr2 (23-372)||(21145524-21145873)
chr2 (23-371)||(17066978-17067323)
chr2 (23-371)||(24675089-24675437)
chr2 (23-371)||(23188608-23188956)
chr2 (23-371)||(21325761-21326109)
chr2 (23-371)||(24707977-24708325)
chr2 (23-366)||(22756963-22757306)
chr2 (23-371)||(23063677-23064025)
chr2 (23-236)||(27377101-27377314)
chr2 (81-367)||(24825781-24826067)
chr2 (23-296)||(23138637-23138910)
chr2 (23-296)||(23550427-23550700)
chr2 (23-163)||(41609047-41609187)
chr2 (23-294)||(23087050-23087321)
chr2 (23-287)||(27365658-27365922)
chr2 (23-314)||(23293558-23293849)
chr2 (23-287)||(11358453-11358717)
chr2 (23-372)||(23276376-23276725)
chr2 (23-287)||(31830258-31830522)
chr2 (23-192)||(24944967-24945136)
chr2 (24-192)||(24653946-24654114)
chr2 (23-287)||(30211496-30211760)
chr2 (23-287)||(20832585-20832849)
chr2 (27-371)||(45529121-45529459)
chr2 (23-278)||(1063351-1063606)
chr2 (23-294)||(27787341-27787612)
chr2 (319-372)||(41608879-41608932)
chr2 (119-188)||(12574049-12574118)
chr2 (162-304)||(22276018-22276160)
chr2 (250-304)||(27368394-27368448)
chr2 (23-84)||(24833355-24833416)
chr2 (148-304)||(12640481-12640637)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (23-372)||(620-969)
scaffold0044 (23-371)||(14360-14708)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (23-372)||(6937-7288)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (23-372)||(43154-43503)
scaffold0028 (23-372)||(8485-8834)
scaffold0028 (189-313)||(13832-13956)
scaffold0028 (58-287)||(50556-50785)
scaffold0028 (322-372)||(15246-15296)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (23-371)||(414-762)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (23-372)||(7377-7726)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (23-345)||(308659-308981)
scaffold0005 (23-371)||(278788-279136)
scaffold0005 (23-371)||(164667-165015)
scaffold0005 (23-287)||(260308-260572)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (23-371)||(65405-65753)
scaffold0042 (23-192)||(39926-40095)
scaffold0042 (250-371)||(39777-39898)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (23-372)||(33530-33879)
scaffold0109 (23-372)||(8596-8945)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (23-372)||(4362-4711)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (23-371)||(6372-6720)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (23-371)||(676-1024)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (124-372)||(737-985)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (23-371)||(63989-64337)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (23-371)||(6014-6362)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (23-371)||(652-999)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (23-371)||(6023-6371)
scaffold0120 (23-287)||(1566-1830)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (23-371)||(9343-9691)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (23-371)||(14039-14387)
scaffold0106 (261-367)||(17680-17786)
scaffold0106 (23-313)||(31410-31700)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (145-372)||(7519-7746)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (23-371)||(1139-1487)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (87-371)||(7854-8138)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (31-371)||(5229-5569)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (23-364)||(219382-219723)
scaffold0012 (23-371)||(229043-229391)
scaffold0012 (148-304)||(33020-33176)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (23-371)||(781-1128)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (23-371)||(180217-180565)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (88-371)||(21932-22215)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (23-371)||(2-350)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (23-371)||(32710-33058)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (23-371)||(127157-127505)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (23-371)||(15037-15385)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (23-371)||(4032-4380)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (23-360)||(15493-15829)
scaffold0333 (200-371)||(15832-16003)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (36-371)||(49506-49841)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (23-371)||(16987-17335)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (23-323)||(3140-3440)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (24-371)||(448060-448407)
scaffold0001 (23-286)||(162113-162376)
scaffold0001 (23-371)||(90890-91238)
scaffold0001 (121-191)||(175361-175431)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (58-371)||(16423-16736)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (23-371)||(25677-26025)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (23-371)||(14877-15225)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (23-371)||(26491-26839)
scaffold0011 (23-372)||(195660-196008)
scaffold0011 (23-192)||(68577-68746)
scaffold0011 (23-287)||(148570-148834)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (23-371)||(112021-112369)
scaffold0004 (23-314)||(322704-322995)
scaffold0004 (23-287)||(203510-203774)
scaffold0004 (23-371)||(117568-117916)
scaffold0004 (23-287)||(385819-386083)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (23-341)||(248-566)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (23-294)||(10774-11045)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (23-371)||(908-1256)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (23-371)||(116863-117211)
scaffold0037 (148-344)||(98140-98336)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (23-281)||(30-288)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (23-371)||(1005-1347)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (23-287)||(27967-28231)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (24-341)||(12965-13282)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (23-287)||(7078-7342)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (23-371)||(25029-25377)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (23-314)||(10098-10389)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (23-372)||(27519-27868)
scaffold0139 (23-287)||(1191-1454)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (23-371)||(16374-16722)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (23-304)||(191-472)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (23-287)||(3875-4139)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (23-281)||(26142-26400)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (23-279)||(5964-6219)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (23-287)||(19983-20247)
scaffold0298 (23-314)||(13376-13667)
scaffold0298 (23-314)||(17146-17437)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (23-317)||(6183-6478)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (23-208)||(16957-17142)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (100-371)||(9047-9318)
scaffold0507 (23-95)||(6977-7049)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (33-371)||(4760-5098)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (23-304)||(14276-14557)
scaffold0203 (23-167)||(9039-9183)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (23-372)||(13858-14207)
scaffold0034 (58-314)||(4968-5224)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-287)||(51905-52169)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (23-371)||(37202-37550)
scaffold0026 (121-281)||(27385-27545)
scaffold0026 (121-281)||(38222-38382)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (23-314)||(414-705)
scaffold0124 (23-314)||(10888-11179)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (23-314)||(42348-42639)
scaffold0010 (23-314)||(47414-47705)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (23-293)||(28805-29075)
scaffold0064 (23-293)||(40796-41066)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (58-287)||(18884-19113)
scaffold0090 (121-287)||(23109-23275)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (23-372)||(49164-49513)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (23-287)||(98-362)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (23-287)||(21713-21977)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (23-287)||(47124-47388)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (23-279)||(2751-3007)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-287)||(248613-248877)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (23-372)||(61170-61519)
scaffold0067 (23-372)||(67558-67907)
scaffold0067 (23-372)||(52136-52485)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (23-287)||(3891-4155)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (23-287)||(9798-10057)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (23-287)||(1211-1475)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (23-287)||(39739-40003)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (23-287)||(33719-33983)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (23-218)||(1177-1372)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (274-371)||(12738-12835)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (24-197)||(42784-42957)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (23-287)||(14086-14349)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (23-287)||(528-792)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (23-287)||(19120-19384)
scaffold0058 (67-287)||(58448-58668)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (23-206)||(57939-58122)
scaffold0053 (23-287)||(49075-49339)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (23-209)||(4259-4445)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (23-368)||(18498-18843)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (23-343)||(5577-5896)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (238-354)||(3694-3810)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (23-287)||(5044-5308)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (23-287)||(20122-20386)
scaffold0114 (23-311)||(43505-43793)
scaffold0114 (23-311)||(44517-44805)
scaffold0114 (23-188)||(36055-36220)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (23-287)||(25907-26171)
scaffold0113 (23-287)||(16676-16940)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (23-287)||(16755-17019)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (23-202)||(27226-27405)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (23-182)||(136119-136278)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (37-187)||(4567-4717)
scaffold0023 (225-371)||(4412-4558)
scaffold0023 (23-101)||(36974-37052)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (23-314)||(7253-7542)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (23-287)||(26261-26525)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (23-172)||(2023-2172)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (23-287)||(38929-39193)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (23-202)||(13380-13559)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (23-281)||(86552-86810)
scaffold0007 (326-372)||(46531-46577)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (310-371)||(1552-1613)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (23-372)||(12738-13087)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (137-286)||(1908-2057)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (119-287)||(5309-5477)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (310-371)||(6336-6397)
scaffold0358 (23-83)||(6273-6333)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (119-314)||(10865-11060)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (178-293)||(1270-1385)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (23-110)||(45845-45932)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (154-263)||(1-110)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (161-304)||(1079-1222)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (337-371)||(10-44)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (148-302)||(13033-13187)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (148-304)||(46279-46435)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (221-372)||(87-238)
scaffold1710 (148-293)||(946-1091)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (23-110)||(3487-3574)
scaffold0222 (254-314)||(3370-3430)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (161-209)||(14661-14709)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (148-304)||(14762-14918)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 6600335 - 6600683
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6600335 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaat 6600434  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6600435 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 6600534  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6600535 ttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 6600634  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600635 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 6600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 53385560 - 53385212
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  53385560 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 53385461  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53385460 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 53385361  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53385360 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 53385261  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385260 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 53385212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15589934 - 15589586
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15589934 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15589835  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15589834 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15589735  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15589734 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15589635  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15589634 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 15589586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 10005188 - 10005536
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10005188 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10005287  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10005288 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10005387  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10005388 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10005487  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10005488 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 10005536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 10905798 - 10906146
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10905798 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10905897  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  10905898 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 10905997  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905998 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10906097  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10906098 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 10906146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16757127 - 16756779
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16757127 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 16757028  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16757027 atgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 16756928  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16756927 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 16756828  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16756827 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaacca 16756779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20062596 - 20062248
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20062596 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 20062497  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20062496 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20062397  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20062396 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20062297  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20062296 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 20062248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 13252278 - 13252626
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13252278 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 13252377  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13252378 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 13252477  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252478 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 13252577  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13252578 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 13252626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16635361 - 16635709
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16635361 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16635460  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16635461 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16635560  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16635561 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16635660  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16635661 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16635709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 43162685 - 43163033
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43162685 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 43162784  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  43162785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 43162884  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43162885 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 43162984  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43162985 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 43163033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 48425035 - 48425383
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48425035 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 48425134  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  48425135 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 48425234  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48425235 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 48425334  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48425335 gctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 48425383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 15338857 - 15339206
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  15338857 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatat 15338956  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15338957 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15339056  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15339057 taaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15339156  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339157 gatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 15339206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15403052 - 15402703
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  15403052 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatat 15402953  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15402952 ctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15402853  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15402852 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15402753  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402752 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15348787 - 15348439
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15348787 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15348688  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  15348687 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15348588  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15348587 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15348488  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348487 gctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 15348439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26792941 - 26792592
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  26792941 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 26792842  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |     
T  26792841 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctccttct 26792742  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26792741 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 26792642  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792641 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 26792592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5425471 - 5425124
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5425471 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 5425372  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  5425371 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcc 5425273  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5425272 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 5425173  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  5425172 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 5425124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15725475 - 15725127
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15725475 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15725376  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15725375 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcc 15725276  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |    
T  15725275 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtct 15725177  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725176 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 15725127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16412824 - 16412475
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16412824 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16412725  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  16412724 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttca 16412625  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| || || |||||||  ||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16412624 tgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagttt 16412525  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412524 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 16412475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 12497836 - 12498184
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497836 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497935  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  12497936 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12498035  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  12498036 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12498135  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498136 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 12498184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 17489438 - 17489786
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17489438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17489537  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  17489538 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17489637  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  17489638 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 17489737  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17489738 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 17489786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14877041 - 14876692
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14877041 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14876942  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |     
T  14876941 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttct 14876842  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || || |    
T  14876841 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtct 14876742  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14876741 gctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccag 14876692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16492723 - 16492375
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16492723 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16492624  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16492623 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16492524  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  16492523 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 16492424  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16492423 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaacca 16492375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16807468 - 16807119
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||    
T  16807468 cataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatat 16807369  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |  ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16807368 ctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16807269  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |    
T  16807268 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtct 16807169  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807168 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 16807119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16371001 - 16371349
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  | ||    
T  16371001 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatat 16371100  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |     
T  16371101 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttct 16371200  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  16371201 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16371300  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16371301 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 16371349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16691748 - 16692096
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16691748 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatat 16691847  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16691848 ttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16691947  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||  | ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |    
T  16691948 tgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtct 16692047  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692048 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 16692096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 9522307 - 9522655
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||   | ||    
T  9522307 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatat 9522406  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  9522407 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9522506  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||    
T  9522507 tgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagttt 9522606  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9522607 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaacca 9522655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 15247735 - 15248083
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  15247735 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 15247834  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||| |     
T  15247835 ctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15247934  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||   | ||| |||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15247935 tgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15248034  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15248035 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaacca 15248083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 15208479 - 15208827
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||  | ||    
T  15208479 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccgttccaattctttctgatat 15208578  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||| |     
T  15208579 ctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15208678  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||  | ||| |||||||  ||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15208679 tgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15208778  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15208779 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaacca 15208827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 15227247 - 15227518
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15227247 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15227346  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  15227347 ctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 15227446  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15227447 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctct 15227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13323183 - 13322919
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |  | ||| ||||| |||||||   | ||||| ||    
T  13323183 catacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactgttccaatcctctccaatat 13323084  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  13323083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcc 13322984  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  13322983 tgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 13322919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18134877 - 18134606
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  18134877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 18134778  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | || ||  ||    
T  18134777 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcc 18134678  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18134677 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 18134606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13972616 - 13972387
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13972616 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttct 13972517  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  | | ||||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  13972516 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 13972417  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  13972416 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 13972387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10420541 - 10420305
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  10420541 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 10420442  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  10420441 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggta 10420342  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10420341 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 10420305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15953499 - 15953235
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15953499 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatat 15953400  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| ||| || || |||||  |     
T  15953399 ctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctct 15953300  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15953299 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15953235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12361073 - 12360809
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||    
T  12361073 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgaaat 12360974  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  12360973 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 12360874  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  12360873 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcat 12360809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14086271 - 14086535
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  14086271 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 14086370  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  14086371 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 14086470  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14086471 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14086535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 329
Target Start/End: Original strand, 14571448 - 14571752
Alignment:
Q  25 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 124  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || || ||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  14571448 tacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatct 14571547  T
Q  125 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcccta 224  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||  | |     
T  14571548 gataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttg 14571647  T
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgc 324  Q
    |||||||||  | || ||||||| |||| | ||| ||||  || ||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| ||     
T  14571648 aaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtggtctga 14571747  T
Q  325 tgaac 329  Q
    |||||    
T  14571748 tgaac 14571752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 47123542 - 47123806
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  47123542 catacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 47123641  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||  ||    
T  47123642 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 47123741  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||  |||||||||| || |||||    
T  47123742 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 47123806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8759613 - 8759265
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  8759613 catacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 8759514  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||  |     
T  8759513 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 8759414  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || || || |    
T  8759413 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 8759314  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  8759313 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaacca 8759265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 10383567 - 10383831
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  10383567 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 10383666  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  10383667 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10383766  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10383767 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 10383831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11961565 - 11961301
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| |||||||||  |||||||| | ||  ||||    
T  11961565 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagccactattccaactctctctgaaat 11961466  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  11961465 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11961366  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | || || |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  11961365 tgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcat 11961301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Original strand, 13941622 - 13941903
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  13941622 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 13941721  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||  |     
T  13941722 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 13941821  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  13941822 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatct 13941903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Original strand, 41177120 - 41177401
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  41177120 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 41177219  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||  |     
T  41177220 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 41177319  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  41177320 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatct 41177401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16330190 - 16329938
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16330190 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16330091  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  16330090 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16329991  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctg 275  Q
    | |||||||||| | |||||  ||| |||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  16329990 tgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctg 16329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12850775 - 12850554
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12850775 tgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttct 12850676  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || ||| |  | | |||||||||  | ||| | |||| |||||| ||    
T  12850675 tagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtcatggta 12850576  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgac 279  Q
    | |||| ||| |||||||||||    
T  12850575 actcttctgtcgactctgcgac 12850554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11304304 - 11304136
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  | ||    
T  11304304 catacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaaccctctctgatat 11304205  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 191  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11304204 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagg 11304136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15016131 - 15015966
Alignment:
Q  178 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcg 277  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||  |||||| |    
T  15016131 acaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgag 15016032  T
Q  278 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtccta 343  Q
    |||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15016031 acgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtccta 15015966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16381362 - 16381180
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||    
T  16381362 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcacc 16381263  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||  |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| ||   ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  16381262 atcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatct 16381180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16836945 - 16836858
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  16836945 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaa 16836858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 44776941 - 44777022
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  44776941 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactct 44777022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 31689154 - 31689067
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  31689154 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactgttccaac 31689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 31945070 - 31945157
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||    
T  31945070 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaac 31945157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8274816 - 8274660
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | |||||||| ||| ||||| | ||    
T  8274816 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 8274717  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  8274716 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 8274660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Original strand, 15576473 - 15576629
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||| |||||||| ||| ||||| | ||    
T  15576473 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 15576572  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15576573 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 15576629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23517080 - 23516734
Alignment:
Q  24 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517080 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatc 23516981  T
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23516980 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 23516881  T
Q  224 aaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttg 323  Q
     ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23516880 gaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttg 23516781  T
Q  324 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacc 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516780 ctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaacc 23516734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 18177700 - 18178049
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18177700 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18177799  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18177800 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcc 18177899  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  18177900 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagttt 18177999  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178000 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 18178049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11237525 - 11237176
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11237525 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 11237426  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  11237425 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 11237326  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11237325 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 11237226  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237225 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 11237176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 8198586 - 8198934
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8198586 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8198685  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  8198686 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8198785  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8198786 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8198885  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8198886 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 8198934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15161369 - 15161020
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15161369 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15161270  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  15161269 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15161170  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15161169 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15161070  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161069 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 15161020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 8707563 - 8707911
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8707563 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8707662  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  8707663 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8707762  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8707763 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8707862  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8707863 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 8707911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 10870953 - 10871301
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10870953 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10871052  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10871053 ctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10871152  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10871153 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10871252  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10871253 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 10871301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44791663 - 44791315
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44791663 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44791564  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  44791563 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 44791464  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44791463 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44791364  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44791363 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 44791315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18552070 - 18551722
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18552070 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18551971  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  18551970 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18551871  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18551870 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18551771  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18551770 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 18551722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 13686021 - 13686370
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaa-cattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13686021 catactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 13686120  T
Q  122 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcc 221  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13686121 tttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 13686220  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtt 321  Q
     |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13686221 ttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 13686320  T
Q  322 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686321 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 13686370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11553414 - 11553066
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  11553414 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccgatat 11553315  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11553314 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 11553215  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11553214 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 11553115  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553114 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 11553066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14332355 - 14332703
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  14332355 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 14332454  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14332455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14332554  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14332555 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14332654  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  14332655 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaacca 14332703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14954578 - 14954926
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  14954578 catacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 14954677  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14954678 cttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14954777  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  14954778 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14954877  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954878 gctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 14954926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 12687459 - 12687807
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  12687459 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 12687558  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12687559 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcc 12687658  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  12687659 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12687759 gttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaacca 12687807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 17279
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17628 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17529  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  17528 ctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17429  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  17428 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17329  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17328 gctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccag 17279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15154964 - 15154621
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  15154964 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 15154865  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  15154864 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 15154765  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  15154764 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 15154665  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154664 gttgaacaatc-----tcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 15154621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 14037765 - 14038092
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14037765 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14037864  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  14037865 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14037964  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  14037965 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14038064  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 350  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14038065 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 14347795 - 14348122
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14347795 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14347894  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  14347895 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14347994  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  14347995 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14348094  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 350  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14348095 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 15203837 - 15204185
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||   |||    
T  15203837 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaat 15203936  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| |  | ||||||| |||||||| ||||||||| |     
T  15203937 ctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttct 15204036  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||| || ||| ||||| || ||||    
T  15204037 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagttt 15204136  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||  |||||||| || || || || |||||| |||| |||||    
T  15204137 gctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaacca 15204185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 371
Target Start/End: Original strand, 15624545 - 15624858
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||     
T  15624545 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatttcc 15624644  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||    
T  15624645 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgata 15624744  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 357  Q
    | |||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||    
T  15624745 actcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattacactctca 15624844  T
Q  358 cctgactcaaacca 371  Q
    |||||||| |||||    
T  15624845 cctgactcgaacca 15624858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12207090 - 12206818
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||  | ||    
T  12207090 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttgcaactctctcagatat 12206991  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  12206990 ctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 12206891  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctctt 295  Q
    | ||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12206890 tgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 12206818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 19147170 - 19147434
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  19147170 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 19147269  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  19147270 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 19147369  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19147370 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19147434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20746569 - 20746833
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20746569 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20746668  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  20746669 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20746768  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  20746769 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 20746833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15102891 - 15102624
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15102891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 15102792  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||  |     
T  15102791 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15102692  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcatttt 290  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15102691 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatttt 15102624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14264534 - 14264270
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  14264534 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctttcagatat 14264435  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  14264434 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14264335  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14264334 tgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14264270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Original strand, 9596242 - 9596363
Alignment:
Q  250 tcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 349  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596242 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagacca 9596341  T
Q  350 ctctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9596342 ctctttcacctgactcaaacca 9596363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11388717 - 11388454
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  11388717 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 11388618  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |     
T  11388617 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-ct 11388519  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||| | || || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  11388518 tgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11388454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11306553 - 11306289
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11306553 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11306454  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  11306453 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11306354  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  11306353 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11306289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16072584 - 16072320
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||    | ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  16072584 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactgttccaaccctctcagatat 16072485  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  16072484 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 16072385  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || || |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  16072384 tgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 16072320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8212418 - 8212154
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  8212418 catacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 8212319  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  8212318 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 8212219  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  8212218 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 8212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 329
Target Start/End: Original strand, 13665512 - 13665813
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  13665512 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 13665611  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||     ||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||| |  |     
T  13665612 ctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctct 13665706  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| || ||||    
T  13665707 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagttt 13665806  T
Q  323 gctgaac 329  Q
    | |||||    
T  13665807 gatgaac 13665813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16950761 - 16950412
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  16950761 catacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 16950662  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  16950661 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 16950562  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  ||||||||||| || |    
T  16950561 tgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 16950462  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  ||  |||| || || || || ||||||||||||||||||    
T  16950461 gatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccag 16950412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14286666 - 14286402
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | |   ||||    
T  14286666 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaat 14286567  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||  ||    
T  14286566 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 14286467  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||    ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  14286466 tgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcat 14286402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 49152260 - 49152524
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  49152260 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 49152359  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  49152360 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 49152459  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  49152460 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 49152524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964844
Alignment:
Q  169 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgtt 268  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||     
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  269 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcc 341  Q
     |||||||||||||||||| || |||   |||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcc 35964844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 6413470 - 6413734
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  6413470 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 6413569  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||  | |||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || ||  ||    
T  6413570 ctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 6413669  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||   | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  6413670 tgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcat 6413734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18054243 - 18053895
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  18054243 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 18054144  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || ||  |     
T  18054143 ctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 18054044  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || || |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || || || |    
T  18054043 tgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 18053944  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     |||||| |  || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  18053943 cctgaaccaaatccggtcccaacacaactctttctcctgactcgaacca 18053895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14129832 - 14130096
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14129832 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14129931  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||  ||    
T  14129932 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14130031  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || || ||||  ||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  14130032 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 14130096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14433650 - 14433914
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14433650 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14433749  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||  ||    
T  14433750 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14433849  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || || ||||  ||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  14433850 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 14433914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1693 - 1530
Alignment:
Q  27 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 126  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  ||||  ||||||||    
T  1693 cttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctga 1594  T
Q  127 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatag 190  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1593 tacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatag 1530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11772351 - 11772208
Alignment:
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgc 324  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||  | ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||     
T  11772351 aaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgt 11772252  T
Q  325 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 368  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11772251 tgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaa 11772208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Original strand, 13021316 - 13021495
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  13021316 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 13021415  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 202  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  13021416 ctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccctca 13021495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Original strand, 4440011 - 4440167
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||  ||| ||||||||  || || || | ||    
T  4440011 gtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 4440110  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4440111 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatct 4440167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 12455662 - 12455925
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| | || ||||||||| |||| |||| | ||  ||||    
T  12455662 catacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagccactgttctaactctctctgaaat 12455760  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  12455761 ctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 12455860  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  12455861 tgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 12455925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 21661933 - 21662183
Alignment:
Q  34 agttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggac 133  Q
    ||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||  |||||| ||| | |||||||||| || |    
T  21661933 agttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggc 21662032  T
Q  134 caatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaag 233  Q
    |||| ||| |||| || |  |||||||| || |  || ||||| ||||| || | |||  |||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||    
T  21662033 caataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcct---tgaaactcaag 21662129  T
Q  234 atcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    ||| || |||||||  ||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  21662130 atccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcat 21662183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23199937 - 23199763
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23199937 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23199838  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
      | | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23199837 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23506064 - 23505890
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23506064 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23505965  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
      | | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23505964 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23505890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26288318 - 26288157
Alignment:
Q  31 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 130  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||  ||||  |||||||||| |    
T  26288318 cgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacg 26288219  T
Q  131 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 192  Q
     ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  26288218 taccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcatagga 26288157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368607
Alignment:
Q  196 actctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctctt 295  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||| ||| |||| ||| ||||| | ||  ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  296 ggatcatct 304  Q
    |||||||||    
T  12368615 ggatcatct 12368607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26118799 - 26118631
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||    
T  26118799 aaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26118700  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      ||| ||||||||| || || || |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  26118699 ctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 26118631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Original strand, 15340455 - 15340574
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  15340455 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 15340554  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaact 142  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15340555 ctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936586
Alignment:
Q  161 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagt 260  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||| ||||||||  || ||||| | ||  ||||||||| |    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  261 cttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    ||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatct 14936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364179
Alignment:
Q  161 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagt 260  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||| ||||||||  || ||||| | ||  ||||||||| |    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  261 cttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    ||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 15364179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 110117 - 109768
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  110117 catacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 110018  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  110017 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 109918  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  109917 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 109818  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109817 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 109768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 112559 - 112823
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  112559 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 112658  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  112659 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 112758  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  112759 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 112823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 96273 - 96038
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  96273 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 96174  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  96173 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 96074  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  96073 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 96038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27668975 - 27668627
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27668975 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27668876  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27668875 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27668776  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27668775 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27668676  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27668675 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 27668627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15000224 - 14999875
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15000224 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15000125  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  15000124 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15000025  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15000024 tggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14999925  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999924 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 14999875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22333372 - 22333023
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22333372 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22333273  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  22333272 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 22333173  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |    
T  22333172 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtct 22333073  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333072 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 22333023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 40708681 - 40709029
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40708681 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 40708780  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  40708781 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttct 40708880  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40708881 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 40708980  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40708981 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 40709029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 41770743 - 41771091
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770743 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41770842  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41770843 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41770942  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41770943 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 41771042  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  41771043 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 41771091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 19769861 - 19770209
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  19769861 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 19769960  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  19769961 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19770060  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19770061 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19770160  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19770161 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 19770209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 27518308 - 27518656
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27518308 catactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27518407  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27518408 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcc 27518507  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27518508 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27518607  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27518608 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 27518656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 34566395 - 34566743
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34566395 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 34566494  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  34566495 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 34566594  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34566595 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 34566694  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34566695 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 34566743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27685885 - 27685536
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27685885 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27685786  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  27685785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27685686  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27685685 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27685586  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685585 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 27685536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16356403 - 16356751
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16356403 catactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16356502  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16356503 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16356602  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16356603 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16356702  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16356703 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16356751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 27610255 - 27610603
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27610255 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27610354  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27610355 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27610454  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27610455 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27610554  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27610555 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 27610603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29476558 - 29476209
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |     
T  29476558 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatac 29476459  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29476458 ctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 29476359  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  29476358 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtct 29476259  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476258 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 29476209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 22134569 - 22134915
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22134569 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 22134668  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22134669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22134768  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  22134769 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 22134868  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaac 22134915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37291979 - 37291632
Alignment:
Q  25 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 124  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37291979 tactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatct 37291880  T
Q  125 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcccta 224  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |     
T  37291879 gatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttg 37291780  T
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgc 324  Q
     |||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  37291779 gaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgc 37291680  T
Q  325 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291679 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 37291632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 22348326 - 22348673
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22348326 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactctttccaatat 22348425  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22348426 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22348525  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
      ||||||||||  |||||||||||  || |||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22348526 cgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 22348623  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22348624 gctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccag 22348673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23573643 - 23573991
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23573643 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23573742  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  23573743 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23573842  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  23573843 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 23573942  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23573943 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 23573991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 18775678 - 18776027
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||| | ||    
T  18775678 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatat 18775777  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  18775778 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcc 18775877  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  18775878 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 18775977  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775978 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 18776027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 23440126 - 23440475
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23440126 catacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23440225  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  23440226 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23440325  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  23440326 tgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagttt 23440425  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23440426 gctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccag 23440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 20798661 - 20799009
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||    
T  20798661 catatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatat 20798760  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  20798761 ttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 20798860  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |    
T  20798861 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 20798960  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20798961 gctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaacca 20799009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 372
Target Start/End: Original strand, 23516443 - 23516791
Alignment:
Q  24 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||    
T  23516443 atacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatc 23516542  T
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccct 223  Q
    | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23516543 taatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 23516642  T
Q  224 aaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttg 323  Q
     ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||| ||||  || |||||    
T  23516643 gaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttg 23516742  T
Q  324 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23516743 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccag 23516791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21984790 - 21984442
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||    
T  21984790 catacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatat 21984691  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  |     
T  21984690 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctct 21984591  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  21984590 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21984491  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984490 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 21984442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 25423090 - 25423438
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25423090 catagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25423189  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  25423190 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 25423289  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  25423290 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25423389  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423390 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 25423438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26739190 - 26738842
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  26739190 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 26739091  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |  || |||| | |     
T  26739090 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttct 26738991  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26738990 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 26738891  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26738890 gttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaacca 26738842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20468581 - 20468233
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||| | | | |||| || ||    
T  20468581 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgccactgtttctattctttctaatat 20468482  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||| | |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  20468481 ctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 20468382  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||||  ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  20468381 tgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagttt 20468282  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  20468281 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaacca 20468233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23471130 - 23471478
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |     
T  23471130 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatac 23471229  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| || || |||||| |     
T  23471230 ctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 23471329  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||  |||||||  ||||||| | |||||||  ||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||| | ||||    
T  23471330 tgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagttt 23471429  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| | ||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  23471430 gttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaacca 23471478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498173
Alignment:
Q  65 tcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgactt 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  165 caaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttt 264  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||  || || |||||  | | |||||| |  ||| | |||||||  ||||| ||| |||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  265 tgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgact 364  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgact 21498180  T
Q  365 caaacca 371  Q
    |||||||    
T  21498179 caaacca 21498173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 20573422 - 20573618
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  20573422 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 20573521  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcct 219  Q
    |||||| |||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  20573522 ctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatctcct 20573618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Original strand, 22461835 - 22462105
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  22461835 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 22461934  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||| ||    
T  22461935 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 22462034  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22462035 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 22462105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28924218 - 28923973
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28924218 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28924119  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  28924118 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28924019  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 303  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  28924018 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 28923973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21343843 - 21343666
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  21343843 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 21343744  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 200  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21343743 cttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24750039 - 24749690
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24750039 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24749940  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  24749939 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24749840  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || || || |    
T  24749839 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24749740  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||||    
T  24749739 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccag 24749690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28895392 - 28895147
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28895392 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28895293  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  28895292 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28895193  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 303  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  28895192 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 28895147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22381082 - 22381346
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||  ||||    
T  22381082 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctctgaaat 22381181  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  22381182 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22381281  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  22381282 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 22381346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23442778 - 23442514
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | |     
T  23442778 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataa 23442679  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |     
T  23442678 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 23442579  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  23442578 tgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 23442514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24736096 - 24735832
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24736096 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24735997  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  24735996 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24735897  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  24735896 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 24735832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22236405 - 22236055
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22236405 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatat 22236306  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  22236305 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 22236206  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||  |||||||| || || |    
T  22236205 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtct 22236106  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaga 373  Q
    | ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||    
T  22236105 gatgaaccaactccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaga 22236055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24737270 - 24737012
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24737270 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24737171  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  24737170 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24737071  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  24737070 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgc 24737012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23080574 - 23080225
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23080574 catacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 23080475  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  23080474 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 23080375  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||  ||  | ||||| |||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||||||| || |    
T  23080374 tgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 23080275  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
      || || |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  23080274 catgcaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccag 23080225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 314
Target Start/End: Original strand, 20821371 - 20821627
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  20821371 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 20821470  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||| ||| ||| ||||| |||||  |||||| |||||| ||    
T  20821471 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggta 20821570  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  |||||||||    
T  20821571 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctc 20821627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21891244 - 21890980
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21891244 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21891145  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  21891144 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctct 21891045  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||| |||||    
T  21891044 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcat 21890980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Original strand, 20773678 - 20773914
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  20773678 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 20773777  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| || ||| | ||| ||| ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  20773778 tcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgata 20773877  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20773878 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 20773914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339423
Alignment:
Q  198 tctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttgg 297  Q
    ||||||||| || ||||||| | | | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||     
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  298 atcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaacca 21339423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20342165 - 20342429
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20342165 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20342264  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||| || || || |   ||    
T  20342265 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcc 20342364  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  20342365 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20342429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564211
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || | |||| | ||  | ||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||  |||| | || ||||||||| |||||| ||||||||| |     
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtctt 263  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactctt 21564211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22502562 - 22502826
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  22502562 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 22502661  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  22502662 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22502761  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  22502762 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcat 22502826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37545982 - 37545717
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37545982 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctcagaaat 37545883  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca-aaaacacgtggtctcctcc 221  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| |||| || || || ||  |    
T  37545882 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctc 37545783  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    || |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | || ||| |||||||||| || |||||    
T  37545782 ctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcat 37545717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14887476 - 14887212
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  14887476 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 14887377  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  14887376 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14887277  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  14887276 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 14887212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 25847958 - 25848222
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  25847958 catacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgccacagttccaactctctctgaaat 25848057  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || || || ||  ||    
T  25848058 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcc 25848157  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||| | |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25848158 tgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 25848222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24798882 - 24798627
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24798882 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 24798783  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||  ||    
T  24798782 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 24798683  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcga 278  Q
      |||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  24798682 agaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcga 24798627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17269722 - 17269537
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  17269722 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 17269623  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      | | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  17269622 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatct 17269537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 21404737 - 21404933
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||| ||||    
T  21404737 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaat 21404836  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcct 219  Q
    |||||| |  ||||| |||  ||| ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| || ||||||    
T  21404837 ctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatgatctcct 21404933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21662524 - 21662301
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21662524 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21662425  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| || |     
T  21662424 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21662326  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  21662325 tgaaattcaaggtctttcctacgct 21662301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21665985 - 21665762
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21665985 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21665886  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| || |     
T  21665885 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21665787  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  21665786 tgaaattcaaggtctttcctacgct 21665762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19485616 - 19485268
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19485616 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 19485517  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19485516 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19485417  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19485416 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 19485317  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19485316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaacca 19485268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17674769 - 17674421
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17674769 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17674670  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  17674669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17674570  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674569 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17674470  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17674469 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 17674421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20018496 - 20018148
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  20018496 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 20018397  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20018396 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20018297  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20018296 tcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20018197  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20018196 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 20018148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 19112725 - 19113073
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  19112725 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 19112824  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  19112825 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19112924  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19112925 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19113024  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19113025 gctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 19113073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22120920 - 22120571
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22120920 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22120821  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22120820 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22120721  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  22120720 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 22120621  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22120620 gctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccag 22120571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30313890 - 30313542
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  30313890 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 30313791  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30313790 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 30313691  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  30313690 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 30313591  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313590 gctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaacca 30313542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 19978002 - 19978350
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19978002 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatat 19978101  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  19978102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19978201  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  19978202 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 19978301  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19978302 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 19978350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 22046408 - 22046757
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22046408 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22046507  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22046508 ctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22046607  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |||||||||||||| || || || |  ||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  22046608 taaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 22046707  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22046708 gctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccag 22046757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 15533415 - 15533763
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15533415 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15533514  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  15533515 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15533614  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || |    
T  15533615 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtct 15533714  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533715 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 15533763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23650076 - 23650424
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||    
T  23650076 catacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccgttccaactcttttcgatat 23650175  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |     
T  23650176 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 23650275  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||| || || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  23650276 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 23650375  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650376 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 23650424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22133787 - 22133440
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22133787 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22133688  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||   ||||||| ||    
T  22133687 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcc 22133588  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22133587 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22133488  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacc 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22133487 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacc 22133440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22164937 - 22164590
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22164937 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatat 22164838  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||   ||||||| ||    
T  22164837 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcc 22164738  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22164737 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22164638  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacc 370  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22164637 gctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacc 22164590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16408788 - 16408443
Alignment:
Q  26 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  16408788 acttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctg 16408689  T
Q  126 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaa 225  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||| | |      
T  16408688 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgg 16408589  T
Q  226 aactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgct 325  Q
    |||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  16408588 aacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 16408489  T
Q  326 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16408488 gaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 16408443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 32600179 - 32600519
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  32600179 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 32600278  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32600279 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 32600378  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |    
T  32600379 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 32600478  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600479 actgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 32600519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21167275 - 21166935
Alignment:
Q  31 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 130  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |    
T  21167275 cgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacg 21167176  T
Q  131 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactc 230  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  21167175 gaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactc 21167076  T
Q  231 aagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaaca 330  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  21167075 aagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaaca 21166976  T
Q  331 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21166975 atctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaacca 21166935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 21250977 - 21251324
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21250977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 21251076  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  21251077 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 21251176  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  21251177 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttca-tctctctttaatcatcttaaccttctcggtagttt 21251275  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21251276 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 21251324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21922481 - 21922133
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21922481 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21922382  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  21922381 ctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 21922282  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||    
T  21922281 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagttt 21922182  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21922181 gctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaacca 21922133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21394611 - 21394263
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21394611 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21394512  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21394511 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21394412  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||  | ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  21394411 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21394312  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21394311 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaacca 21394263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21789104 - 21788756
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21789104 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21789005  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21789004 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21788905  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||  | ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  21788904 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21788805  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21788804 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaacca 21788756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 22032067 - 22032339
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| ||||| ||||| | ||    
T  22032067 catacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatat 22032166  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||   |||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22032167 ctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcc 22032266  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctctt 295  Q
    |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22032267 taaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 22987236 - 22987584
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   | ||    
T  22987236 catacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatat 22987335  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||||| ||||| || || |||||| |     
T  22987336 ctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 22987435  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||||||| | ||||    
T  22987436 tgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagttt 22987535  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| | || |||||| ||||| || |||||| |||| |||||    
T  22987536 gttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaacca 22987584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21682217 - 21681867
Alignment:
Q  22 tcatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |    
T  21682217 tcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagata 21682118  T
Q  122 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcc 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |    
T  21682117 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 21682018  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtt 321  Q
     | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| || ||     
T  21682017 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 21681918  T
Q  322 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    || ||||| |  |||||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  21681917 tgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccag 21681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 15441216 - 15441408
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15441216 catacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15441315  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtc 215  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15441316 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtc 15441408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 1266274 - 1266538
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  1266274 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 1266373  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  1266374 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 1266473  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1266474 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 1266538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 20007885 - 20008233
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20007885 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 20007984  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  20007985 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 20008084  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| || || |    
T  20008085 tggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtct 20008184  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  20008185 gatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaacca 20008233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Original strand, 23948924 - 23949148
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || | ||||  | ||    
T  23948924 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatat 23949023  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  23949024 ctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23949123  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    | ||||||||| || || |||||||    
T  23949124 tgaaactcaaggtccttcctacgct 23949148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20396868 - 20396523
Alignment:
Q  26 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 125  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  | |||||    
T  20396868 acttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctg 20396769  T
Q  126 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaa 225  Q
    |||  ||||||| ||  |  | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| |    
T  20396768 atacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctga 20396669  T
Q  226 aactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgct 325  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||| || ||| |||||||| ||||| |    
T  20396668 aactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgtt 20396569  T
Q  326 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||| || ||| |||| || || || || || |||||||| |||||    
T  20396568 gaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaacca 20396523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22378079 - 22377851
Alignment:
Q  143 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttct 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| || ||| |||||||| |||||| ||    
T  22378079 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22377980  T
Q  243 acgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 342  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  22377979 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22377880  T
Q  343 aagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22377879 aaaaccacactctcacccgactcgaacca 22377851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22384254 - 22384026
Alignment:
Q  143 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttct 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| || ||| |||||||| |||||| ||    
T  22384254 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22384155  T
Q  243 acgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 342  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  22384154 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22384055  T
Q  343 aagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22384054 aaaaccacactctcacccgactcgaacca 22384026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 20388134 - 20388405
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| || |||||| | ||  | ||    
T  20388134 catacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagatat 20388233  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || |||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   || ||||||||| |||||| ||||||||| |     
T  20388234 ctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttct 20388333  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    | ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  20388334 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctct 20388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21325156 - 21324806
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaa-gatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   | |    
T  21325156 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctatgata 21325057  T
Q  122 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcc 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  |    
T  21325056 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 21324957  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtt 321  Q
    || |||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || |||   |||||||  |||||||| || ||     
T  21324956 ctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 21324857  T
Q  322 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    || ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  21324856 tgatgaaccaaatccggtcccaacaccacactatctcctgactcaaaccag 21324806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 264 - 372
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856961
Alignment:
Q  264 ttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 363  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  364 tcaaaccag 372  Q
    |||||||||    
T  18856953 tcaaaccag 18856961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22062179 - 22061915
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22062179 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgatat 22062080  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || ||  ||    
T  22062079 ttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 22061980  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22061979 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 22061915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29304172 - 29303908
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||  ||||    
T  29304172 catacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaattctctctgaaat 29304073  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  29304072 ctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29303973  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||    
T  29303972 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcat 29303908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Original strand, 19851448 - 19851710
Alignment:
Q  25 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19851448 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19851547  T
Q  125 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcccta 224  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || |||||  | |     
T  19851548 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19851647  T
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    |||||||||  | |||||||||| | |||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19851648 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19851710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Original strand, 19857484 - 19857746
Alignment:
Q  25 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19857484 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19857583  T
Q  125 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctcccta 224  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || |||||  | |     
T  19857584 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19857683  T
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    |||||||||  | |||||||||| | |||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19857684 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 23654962 - 23655311
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |  |||  |||| |||| |||  | ||  | ||    
T  23654962 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatat 23655061  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  || |||||  |     
T  23655062 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtct 23655161  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| || || |    
T  23655162 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 23655261  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||    
T  23655262 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccag 23655311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20010646 - 20010382
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20010646 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20010547  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  20010546 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20010447  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | ||  |||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  20010446 tgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 20010382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14565177 - 14565441
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || | || |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  14565177 catacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 14565276  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  14565277 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14565376  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| | || ||| |||||||||| || |||||    
T  14565377 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcat 14565441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 6679146 - 6679410
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  6679146 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 6679245  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  6679246 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6679345  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  6679346 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 6679410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 21840452 - 21840800
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21840452 catacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21840551  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||| | ||||| | |||||| || |||||  |     
T  21840552 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttagaaacacatgatctccctct 21840651  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || || |||| |||||| ||| | || ||| ||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| || || |    
T  21840652 tgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 21840751  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21840752 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaacca 21840800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16265364 - 16265133
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  16265364 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 16265265  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  16265264 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcc 16265165  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatg 254  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  16265164 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatg 16265133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31417220 - 31416957
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  31417220 catacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 31417121  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  31417120 ctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31417021  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttca 286  Q
    | |||||||||  | ||| | ||||  ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31417020 tgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttca 31416957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 804419 - 804155
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  804419 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 804320  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  804319 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 804220  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| | || ||| |||||||||| || |||||    
T  804219 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcat 804155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 6603693 - 6603957
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  6603693 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 6603792  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  6603793 ttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6603892  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  6603893 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 6603957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 371
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949302
Alignment:
Q  226 aactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgct 325  Q
    |||||||| || || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  326 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     ||| || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  23949258 -aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaacca 23949302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31571588 - 31571307
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  31571588 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 31571489  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || ||  |     
T  31571488 ctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 31571389  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  31571388 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatct 31571307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 12304793 - 12305057
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  12304793 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaat 12304892  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || ||  ||    
T  12304893 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcc 12304992  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  12304993 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 12305057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 27347261 - 27347436
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |  ||||| |||  ||| ||||| || |||||  | ||  ||||    
T  27347261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaat 27347360  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 198  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  27347361 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 372
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040243
Alignment:
Q  291 ctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccag 22040243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 28982392 - 28982632
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28982392 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28982491  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  28982492 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28982591  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtctt 263  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  28982592 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 28987612 - 28987852
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28987612 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28987711  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  28987712 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28987811  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtctt 263  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  28987812 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051081
Alignment:
Q  133 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaa 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaa 22051081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21197123 - 21196960
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| || || ||||| | |||| | |||||||||||||| || || ||| ||| |||||||| ||| ||||| | ||    
T  21197123 gtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctct 21197024  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 311  Q
      ||||||||| || | ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21197023 tatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 21196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16877716 - 16877560
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  ||| |||||||| ||| || || | ||    
T  16877716 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 16877617  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16877616 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 16877560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 27187269 - 27187617
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27187269 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27187368  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27187369 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27187468  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27187469 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27187568  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187569 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 27187617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27261971 - 27261623
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27261971 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27261872  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27261871 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27261772  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27261771 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27261672  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261671 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 27261623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28263645 - 28263297
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28263645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28263546  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28263545 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28263446  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28263445 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28263346  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28263345 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 28263297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28292820 - 28292472
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28292820 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 28292721  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28292720 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28292621  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28292620 ttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28292521  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292520 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 28292472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28342394 - 28342046
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28342394 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28342295  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28342294 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28342195  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28342194 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28342095  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28342094 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 28342046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29592368 - 29592020
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29592368 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29592269  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  29592268 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29592169  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29592168 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29592069  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29592068 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 29592020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 25112385 - 25112734
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  25112385 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 25112484  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25112485 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 25112584  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25112585 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 25112684  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112685 gctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 25112734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24313616 - 24313268
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24313616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24313517  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  24313516 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24313417  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24313416 tggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24313317  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24313316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 24313268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16627165 - 16626817
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16627165 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16627066  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16627065 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16626966  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16626965 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagttt 16626866  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16626865 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16626817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1543532 - 1543183
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1543532 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 1543433  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1543432 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 1543333  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  1543332 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 1543233  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543232 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 1543183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2875251 - 2874902
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2875251 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 2875152  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  2875151 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttct 2875052  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2875051 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 2874952  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2874951 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccag 2874902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 12497859 - 12498208
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497859 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497958  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12497959 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12498058  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12498059 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12498158  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12498159 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccag 12498208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12511042 - 12510693
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12511042 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12510943  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12510942 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12510843  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12510842 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12510743  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12510742 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccag 12510693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 12505188 - 12505537
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12505188 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12505287  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12505288 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12505387  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || |    
T  12505388 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtat 12505487  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12505488 gatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccag 12505537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 19864520 - 19864868
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  19864520 catacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatat 19864619  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |     
T  19864620 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttct 19864719  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || |    
T  19864720 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 19864819  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19864820 gctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 19864868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25610309 - 25609961
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25610309 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25610210  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |     
T  25610209 ctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 25610110  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  25610109 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25610010  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25610009 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 25609961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25765737 - 25765390
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||    
T  25765737 catacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatat 25765638  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  25765637 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagcg-tgactctcaaaagcacgtggtctccttct 25765539  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |    
T  25765538 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtct 25765439  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25765438 gctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaacca 25765390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16963815 - 16963470
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  16963815 catactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcgttccaactatttccgatat 16963716  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  16963715 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttct 16963616  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  16963615 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtct 16963516  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16963515 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaa 16963470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5839667 - 5839319
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  5839667 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 5839568  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |     
T  5839567 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttct 5839468  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| || || |    
T  5839467 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtct 5839368  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  5839367 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaacca 5839319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22079136 - 22078788
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  22079136 catacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatat 22079037  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  22079036 ctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 22078937  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  22078936 tgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggttt 22078837  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22078836 gttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaacca 22078788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16928088 - 16927740
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16928088 catactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16927989  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16927988 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16927889  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| | || || |    
T  16927888 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtct 16927789  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16927788 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 16927740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18408391 - 18408043
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  18408391 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 18408292  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| || |     
T  18408291 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttct 18408192  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| | |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| || ||||    
T  18408191 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagttt 18408092  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18408091 gttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaacca 18408043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27331881 - 27331533
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27331881 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27331782  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |     
T  27331781 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27331682  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  27331681 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27331582  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27331581 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaacca 27331533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27392621 - 27392273
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27392621 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27392522  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |     
T  27392521 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27392422  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  27392421 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27392322  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27392321 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaacca 27392273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22762903 - 22762555
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  22762903 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatat 22762804  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |     
T  22762803 ctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttct 22762704  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||| | |||||||  ||||  ||| ||| |||| |||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||  |||    
T  22762703 tgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 22762604  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22762603 gttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaacca 22762555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23078302 - 23078650
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  23078302 catacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatat 23078401  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  23078402 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctct 23078501  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  23078502 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 23078601  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  23078602 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaacca 23078650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 17032395 - 17032582
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17032395 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 17032494  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacg 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17032495 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21833429 - 21833172
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  21833429 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 21833330  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  21833329 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttct 21833230  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacg 280  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  21833229 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Original strand, 15459204 - 15459440
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  15459204 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 15459303  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  15459304 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggta 15459403  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15459404 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 15459440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 21471434 - 21471698
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  21471434 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 21471533  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| |     
T  21471534 ctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttct 21471633  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21471634 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 21471698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14131627 - 14131363
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  14131627 catacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 14131528  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| ||    
T  14131527 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcc 14131428  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||| || || || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14131427 tgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 25750642 - 25750900
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25750642 catacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25750741  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||| || |||||| |     
T  25750742 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25750841  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  25750842 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18197995 - 18197649
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| | ||    
T  18197995 catacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgatat 18197896  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | || ||||| ||| ||| || || | |||  |     
T  18197895 cttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctct 18197796  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||| ||| ||||| | |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  || |||||||| || |    
T  18197795 tgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtct 18197696  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaac 369  Q
    | | ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| ||||    
T  18197695 gttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaac 18197649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 25768024 - 25768372
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25768024 catacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25768123  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || |||||| |     
T  25768124 ctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25768223  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || ||||| || ||||    
T  25768224 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagttt 25768323  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  25768324 gatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaacca 25768372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434050
Alignment:
Q  250 tcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 349  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagacca 22434028  T
Q  350 ctctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  22434029 ctctttctcctgactcaaacca 22434050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8766596 - 8766305
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  8766596 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 8766497  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||| | | || |||| |||||| || || ||  ||    
T  8766496 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 8766397  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  8766396 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 8766305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Original strand, 19879131 - 19879387
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  19879131 catacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 19879230  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  19879231 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 19879330  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgac 279  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  19879331 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgac 19879387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796816
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     |||||  ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcat 22796816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10469297 - 10469033
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  10469297 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgaaat 10469198  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  10469197 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10469098  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10469097 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 10469033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11288029 - 11287782
Alignment:
Q  40 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 139  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11288029 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11287930  T
Q  140 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttt 239  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |||||  | | ||||||||| || ||    
T  11287929 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11287830  T
Q  240 tctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
     ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  11287829 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Original strand, 18794558 - 18794787
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18794558 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18794657  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  | | ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  18794658 tagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgata 18794757  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  18794758 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 18794787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21564580 - 21564316
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21564580 catacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccctctcagatat 21564481  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  21564480 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 21564381  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || ||||| | |||||||||  |||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  21564380 tgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcat 21564316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11280936 - 11280689
Alignment:
Q  40 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 139  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11280936 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11280837  T
Q  140 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttt 239  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||| |||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || |||||  | | ||||||||| || ||    
T  11280836 actttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11280737  T
Q  240 tctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
     ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  11280736 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 287
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415583
Alignment:
Q  69 aagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaa 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  169 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgtt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  | | |||||||||  | |||||||||| | |||| ||| |||| |||     
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  269 gactctgcgacgccttcat 287  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcat 17415583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  196 actctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctctt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  296 g 296  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 22433830 - 22433924
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttcc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22433830 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcc 22433924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 24364245 - 24364509
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24364245 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 24364344  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  24364345 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 24364444  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  24364445 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 24364509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34645999 - 34645770
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || | || ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  34645999 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 34645900  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | || || || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||  | | ||||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  34645899 tagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 34645800  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  34645799 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27561065 - 27560795
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  27561065 catacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 27560966  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||  |     
T  27560965 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctct 27560866  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  27560865 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 27560795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640876
Alignment:
Q  133 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaa 232  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||  ||||||| | |||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  233 gatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    | || |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 1640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14381856 - 14381651
Alignment:
Q  82 aaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacac 181  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14381856 aaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacac 14381757  T
Q  182 cagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||| |||||||||  | ||||| |||| ||| |||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  14381756 ccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgc 14381657  T
Q  282 cttcat 287  Q
     |||||    
T  14381656 tttcat 14381651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 18800873 - 18801124
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||      
T  18800873 atctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccct 18800972  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggt 320  Q
    | | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| || ||    
T  18800973 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 18801072  T
Q  321 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| |||||||||||    
T  18801073 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccag 18801124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Original strand, 25750908 - 25751019
Alignment:
Q  152 acttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtc 251  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| || |||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||    
T  25750908 acttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtc 25751007  T
Q  252 atgataagtctt 263  Q
    ||| ||| ||||    
T  25751008 atggtaactctt 25751019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28283165 - 28282980
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  28283165 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 28283066  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      | | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  28283065 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatct 28282980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 18787721 - 18787809
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaact 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |  || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18787721 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactgttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 101
Target Start/End: Original strand, 1640634 - 1640710
Alignment:
Q  25 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| |||||    
T  1640634 tacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Original strand, 16098008 - 16098164
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||||||||| || || ||  ||| |||||||| ||| ||||| | ||    
T  16098008 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 16098107  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16098108 tatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatct 16098164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Original strand, 23996206 - 23996362
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | | |||||||| ||| || || | ||    
T  23996206 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 23996305  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  23996306 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 23996362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655604
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtct 262  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  || | |||||||||||||| || || ||  ||| ||||||||  || ||||| | ||  | ||||||| |||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  263 tttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 311  Q
    | |||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41354844 - 41354496
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41354844 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 41354745  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41354744 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41354645  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41354644 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 41354545  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41354544 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaacca 41354496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16350974 - 16350626
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16350974 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16350875  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16350874 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16350775  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16350774 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16350675  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16350674 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16350626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 21830287 - 21830636
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21830287 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21830386  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21830387 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21830486  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  21830487 tgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagttt 21830586  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830587 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 21830636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33391404 - 33391056
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33391404 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 33391305  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  33391304 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 33391205  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33391204 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 33391105  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33391104 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 33391056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 51333868 - 51333520
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51333868 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 51333769  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  51333768 atgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 51333669  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51333668 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 51333569  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51333568 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 51333520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 21836934 - 21837282
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21836934 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21837033  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21837034 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21837133  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21837134 tggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagttt 21837233  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21837234 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 21837282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 19106351 - 19106700
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19106351 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 19106450  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19106451 ctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19106550  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19106551 tgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 19106650  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19106651 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccag 19106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17045390 - 17045042
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17045390 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17045291  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17045290 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcc 17045191  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  17045190 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17045091  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045090 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 17045042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 20136762 - 20137110
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||| | ||    
T  20136762 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgatat 20136861  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  20136862 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttct 20136961  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20136962 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 20137061  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137062 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaacca 20137110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 20249834 - 20250182
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  20249834 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 20249933  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  20249934 cttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 20250033  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  20250034 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 20250133  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20250134 gttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaacca 20250182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16079008 - 16078678
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  16079008 catacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 16078909  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||        
T  16078908 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc---- 16078813  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
                   || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  16078812 ---------------ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16078728  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078727 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 16078678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 21747519 - 21747866
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21747519 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21747618  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | |||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||| |     
T  21747619 ctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttct 21747718  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
      |||||||||||| ||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  21747719 agaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 21747817  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21747818 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaacca 21747866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50620619 - 50620271
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50620619 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50620520  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |  |     
T  50620519 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctct 50620420  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  50620419 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 50620320  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
      ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50620319 attgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaacca 50620271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19761241 - 19760893
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  19761241 catactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatat 19761142  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  19761141 ctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 19761042  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  19761041 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 19760942  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  19760941 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaacca 19760893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16369281 - 16369629
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  16369281 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactctttctgatat 16369380  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| || || |||||| |     
T  16369381 ctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 16369480  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || ||||| ||||| |||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  || || ||| | ||||    
T  16369481 tggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagttt 16369580  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  16369581 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaacca 16369629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19665251 - 19664960
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19665251 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19665152  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||  |     
T  19665151 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19665052  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  19665051 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 19664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50612791 - 50612602
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50612791 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50612692  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 212  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  50612691 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20940438 - 20940147
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20940438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 20940339  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  20940338 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 20940239  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || |||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  20940238 tgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 20940147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 19854298 - 19854647
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19854298 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19854397  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||  |     
T  19854398 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19854497  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| || || |    
T  19854498 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19854597  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  19854598 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccag 19854647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20857136 - 20856866
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  20857136 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 20857037  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||| ||    
T  20857036 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 20856937  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
    | |||| |||| || || ||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  20856936 tgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctc 20856866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 21163264 - 21163378
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21163264 catacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 21163363  T
Q  123 ctgatatggaccaat 137  Q
    |||||| ||||||||    
T  21163364 ctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20294396 - 20294660
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20294396 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20294495  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  |     
T  20294496 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctct 20294595  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  20294596 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20294660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20836231 - 20835914
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaact--- 154  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||       
T  20836231 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttct 20836132  T
Q  155 tctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatg 254  Q
    |||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  ||||||||| |||  | || | ||||| ||||||    
T  20836131 tcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtcatg 20836032  T
Q  255 ataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctt 354  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| || || || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  20836031 ataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacactc 20835932  T
Q  355 tcacctgactcaaaccag 372  Q
    || |||||||||||||||    
T  20835931 tctcctgactcaaaccag 20835914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22433491 - 22433203
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  22433491 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttgcaaccctctctgaaat 22433392  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||| || || ||  ||    
T  22433391 ctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcc 22433292  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 311  Q
    | |||||||||    ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||    
T  22433291 tgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaacttt 22433203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 37677063 - 37677328
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37677063 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 37677162  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctcctcc 221  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||| || || || ||  |    
T  37677163 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctc 37677262  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  37677263 ctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 37677328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31550556 - 31550292
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31550556 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 31550457  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  31550456 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 31550357  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||| ||||| || |||||    
T  31550356 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcat 31550292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Original strand, 20244184 - 20244437
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20244184 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaat 20244283  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  20244284 ctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcc 20244383  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgc 276  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  20244384 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 41307907 - 41308073
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || |||| |||||| ||||||||      
T  41307907 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccct 41308006  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | | |||||||||    |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  41308007 cttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 41308073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Original strand, 11382674 - 11382842
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||    
T  11382674 aaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcacc 11382773  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      ||| |||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  11382774 ctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20075434 - 20075194
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||| | ||  ||||    
T  20075434 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttcccactctctctgaaat 20075335  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || ||  ||    
T  20075334 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcc 20075235  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtctt 263  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  20075234 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactctt 20075194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20395368 - 20395194
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || | ||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||| | ||  ||||    
T  20395368 catacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaactctctctgaaat 20395269  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 197  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||    
T  20395268 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 8386381 - 8386729
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8386381 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8386480  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8386481 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8386580  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8386581 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8386680  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8386681 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 8386729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14266942 - 14266593
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14266942 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14266843  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14266842 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 14266743  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  14266742 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagttt 14266643  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266642 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 14266593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 18297174 - 18297522
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18297174 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18297273  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  18297274 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18297373  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18297374 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18297473  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18297474 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 18297522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19778836 - 19778488
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19778836 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccaatat 19778737  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  19778736 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19778637  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778636 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19778537  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  19778536 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 19778488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29039447 - 29039099
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29039447 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29039348  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  29039347 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29039248  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29039247 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29039148  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29039147 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 29039099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14304020 - 14303672
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14304020 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14303921  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  14303920 ctgatacggaccaatgaacttcggg-tcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 14303822  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  14303821 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 14303722  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303721 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 14303672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23955716 - 23956064
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23955716 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 23955815  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  23955816 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23955915  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23955916 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 23956015  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23956016 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 23956064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 27711305 - 27711653
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27711305 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27711404  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  27711405 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27711504  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27711505 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27711604  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27711605 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 27711653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 12476569 - 12476917
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12476569 catactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 12476668  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  12476669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12476768  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12476769 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagttt 12476868  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12476869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 12476917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 40473009 - 40473358
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  40473009 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 40473108  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  40473109 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 40473208  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  40473209 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagttt 40473308  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40473309 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccag 40473358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8053666 - 8053318
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  8053666 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtat 8053567  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8053566 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8053467  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8053466 tgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8053367  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8053366 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaacca 8053318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 12523645 - 12523994
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12523645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12523744  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  12523745 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12523844  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12523845 tgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12523944  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12523945 gctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccag 12523994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14680536 - 14680884
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14680536 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14680635  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  14680636 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcc 14680735  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  14680736 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14680835  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680836 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 14680884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16355488 - 16355140
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  16355488 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatat 16355389  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16355388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttct 16355289  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  16355288 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16355189  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16355188 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 16355140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16252488 - 16252139
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  16252488 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 16252389  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16252388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16252289  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |    
T  16252288 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 16252189  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252188 gctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 16252139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 7090402 - 7090749
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  7090402 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 7090501  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  7090502 ctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 7090600  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  7090601 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 7090700  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7090701 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 7090749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18227489 - 18227140
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  18227489 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 18227390  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18227389 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcc 18227290  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||  || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |    
T  18227289 tgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtct 18227190  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18227189 tctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccag 18227140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Original strand, 15364355 - 15364579
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15364355 catactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15364454  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15364455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15364554  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    | ||| |||||||||||||||||||    
T  15364555 tgaaattcaagatcttttctacgct 15364579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14159461 - 14159809
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14159461 catacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatat 14159560  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||     
T  14159561 ctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctcct 14159660  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| || |    
T  14159661 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtct 14159760  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||  | |||||||||||||||||    
T  14159761 gttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaacca 14159809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15150049 - 15149740
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||    
T  15150049 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgatat 15149950  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  15149949 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15149850  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | || |    
T  15149849 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 15149750  T
Q  323 gctgaacaat 332  Q
    ||||||||||    
T  15149749 gctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14652277 - 14652625
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14652277 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 14652376  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  14652377 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14652476  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  14652477 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 14652576  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| |||||    
T  14652577 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaacca 14652625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14851409 - 14851067
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  14851409 catacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatat 14851310  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| || || |||||| |     
T  14851309 ctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 14851210  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||    
T  14851209 tgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagttt 14851110  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactc 365  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14851109 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactc 14851067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15003667 - 15003319
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15003667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15003568  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||  |     
T  15003567 ctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15003468  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||   ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| || || |    
T  15003467 tgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 15003368  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  15003367 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaacca 15003319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  189 aggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcatt 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  289 ttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 352  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16145881 - 16146145
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16145881 catacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 16145980  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtc-tcctcc 221  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || |||| |    
T  16145981 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcct-c 16146079  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    || |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  16146080 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 16146145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 15070382 - 15070646
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||||||| | || || ||    
T  15070382 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatat 15070481  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  15070482 ctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 15070581  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15070582 tgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 15070646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 33222887 - 33223236
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | |   ||||    
T  33222887 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctttgaaat 33222986  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  33222987 ctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 33223086  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    |||| ||  ||||||||||| ||||    
T  33223087 tgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagttt 33223186  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  33223187 catgaaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccag 33223236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11207534 - 11207270
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11207534 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11207435  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||  ||    
T  11207434 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11207335  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  11207334 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11207270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3265097 - 3264833
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  3265097 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 3264998  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  3264997 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 3264898  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  3264897 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 3264833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 15245893 - 15246157
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||    ||    
T  15245893 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttat 15245992  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| || || |||||  ||    
T  15245993 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcc 15246092  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||   | || ||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15246093 tgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15246157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1640298 - 1640120
Alignment:
Q  193 ctgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttct 292  Q
    |||| ||||||||| || || |||||| | |  |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |    
T  1640298 ctgagtctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatctttt 1640199  T
Q  293 cttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  1640198 cttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaacca 1640120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14927302 - 14927151
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  14927302 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactgttccaactctttccgatat 14927203  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgt 174  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927202 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1649580 - 1649316
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  1649580 catacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacagttccaatcctctctgatat 1649481  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || ||  ||    
T  1649480 ctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcc 1649381  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || || |||| ||| || ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  1649380 tgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 1649316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29453840 - 29453576
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  29453840 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 29453741  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  29453740 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29453641  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  29453640 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 29453576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44662169 - 44661905
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  44662169 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 44662070  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  44662069 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 44661970  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  44661969 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 44661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51606484 - 51606203
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  51606484 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 51606385  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||  |     
T  51606384 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 51606285  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    | |||||||||  | ||||| || | |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  51606284 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatct 51606203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 314
Target Start/End: Original strand, 27900462 - 27900646
Alignment:
Q  130 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaact 229  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||| |||||    
T  27900462 ggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 27900561  T
Q  230 caagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  27900562 caaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 27900646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15359295 - 15359129
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || |||||      
T  15359295 atctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccct 15359196  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | | |||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15359195 cttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 15359129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Original strand, 42702872 - 42703037
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  42702872 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 42702971  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  42702972 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcat 42703037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15415158 - 15415059
Alignment:
Q  194 tgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15415158 tgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  41 acacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaa 140  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  141 cttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacca 183  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18607873 - 18607823
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagat 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18607873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 287
Target Start/End: Original strand, 16752669 - 16752826
Alignment:
Q  130 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaact 229  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||  ||| |||||    
T  16752669 ggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 16752768  T
Q  230 caagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    ||||  | ||||| ||||  ||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  16752769 caagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147579
Alignment:
Q  327 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaacca 15147579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15415282 - 15415214
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||| || || ||||||||||    
T  15415282 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Original strand, 13247816 - 13247895
Alignment:
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    |||||||| ||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13247816 aaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatct 13247895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16924860 - 16925208
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16924860 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16924959  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16924960 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16925059  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925060 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16925159  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16925160 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16925208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16998600 - 16998948
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16998600 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16998699  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16998700 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16998799  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16998800 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16998899  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16998900 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16998948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16981752 - 16982100
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16981752 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16981851  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16981852 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16981951  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16981952 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16982051  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16982052 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 16982100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 17063317 - 17063665
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17063317 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17063416  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  17063417 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17063516  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17063517 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17063616  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17063617 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 17063665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 9609736 - 9610084
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9609736 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 9609835  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  9609836 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9609935  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9609936 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 9610035  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9610036 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 9610084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 27217616 - 27217964
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27217616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27217715  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27217716 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27217815  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27217816 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagttt 27217915  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27217916 gctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 27217964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 24261970 - 24262319
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24261970 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24262069  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  24262070 atgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24262169  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24262170 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24262269  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262270 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 24262319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22325699 - 22325351
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22325699 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22325600  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22325599 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22325500  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22325499 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 22325400  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  22325399 gctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 22325351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24878838 - 24878490
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24878838 catactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24878739  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24878738 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 24878639  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  24878638 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagttt 24878539  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878538 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 24878490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 10868450 - 10868798
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10868450 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 10868549  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10868550 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10868649  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10868650 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10868749  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10868750 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaacca 10868798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 24709633 - 24709981
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24709633 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24709732  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  24709733 ctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24709832  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24709833 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24709932  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24709933 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 24709981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 27370869 - 27371217
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27370869 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27370968  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  27370969 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27371068  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27371069 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27371168  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27371169 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 27371217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44386412 - 44386064
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44386412 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44386313  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44386312 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 44386213  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44386212 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44386113  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  44386112 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 44386064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21145873 - 21145524
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21145873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcgttccaactctttccaatat 21145774  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21145773 ctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 21145674  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21145673 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 21145574  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21145573 gctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccag 21145524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 17066978 - 17067323
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17066978 catactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccgttccaactctttccaatat 17067074  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  17067075 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17067174  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17067175 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17067274  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17067275 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaacca 17067323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 24675089 - 24675437
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24675089 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24675188  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |     
T  24675189 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24675288  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  24675289 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24675388  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24675389 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 24675437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23188608 - 23188956
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  23188608 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatat 23188707  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23188708 ctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 23188807  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | | ||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||| |||||||| || |    
T  23188808 tgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtct 23188907  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188908 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 23188956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21326109 - 21325761
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  21326109 catacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 21326010  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21326009 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21325910  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21325909 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggttt 21325810  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21325809 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaacca 21325761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24708325 - 24707977
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24708325 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24708226  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  24708225 ctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24708126  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  24708125 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24708026  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24708025 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 24707977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22757306 - 22756963
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22757306 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22757207  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |     
T  22757206 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttct 22757107  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||  | |    
T  22757106 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatct 22757007  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactca 366  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22757006 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactca 22756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 23063677 - 23064025
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23063677 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagatat 23063776  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||| | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |     
T  23063777 ctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttct 23063876  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  23063877 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 23063976  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23063977 gttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaacca 23064025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27377314 - 27377101
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  27377314 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 27377215  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27377214 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27377115  T
Q  223 taaaactcaagatc 236  Q
    | ||||||||||||    
T  27377114 tgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825781
Alignment:
Q  81 taaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctaca 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||  | |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  181 ccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacg 280  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  281 ccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaa 367  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaa 24825781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 23138637 - 23138910
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23138637 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23138736  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||| |     
T  23138737 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23138836  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttg 296  Q
    | |||||| || |||||  ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23138837 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23138910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 23550427 - 23550700
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23550427 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23550526  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||| |     
T  23550527 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23550626  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttg 296  Q
    | |||||| || |||||  ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23550627 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23550700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41609187 - 41609047
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41609187 catacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41609088  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41609087 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 23087050 - 23087321
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  23087050 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgccactgttccaactctctcagatat 23087149  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  23087150 ctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23087249  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    | |||||||||  | ||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  23087250 tgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctct 23087321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27365922 - 27365658
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  27365922 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 27365823  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||  |     
T  27365822 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctct 27365723  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27365722 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 27365658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 23293558 - 23293849
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23293558 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 23293657  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  23293658 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 23293757  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  23293758 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 23293849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11358717 - 11358453
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||  ||||    
T  11358717 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactttctctgaaat 11358618  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||  ||    
T  11358617 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11358518  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  11358517 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11358453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 23276376 - 23276725
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  23276376 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 23276475  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |||||||| | | ||||| ||| || || || ||  ||    
T  23276476 ctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcc 23276575  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   |||||||| || || |    
T  23276576 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtct 23276675  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  23276676 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccag 23276725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 31830258 - 31830522
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31830258 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 31830357  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||  ||    
T  31830358 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31830457  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||  |||||||||| || |||||    
T  31830458 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 31830522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 24944967 - 24945136
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  24944967 catacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaat 24945066  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 192  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24945067 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 24945136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654114
Alignment:
Q  24 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||  |  |||||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 192  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcatagga 24654114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30211760 - 30211496
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||   |||||||||||| ||||    
T  30211760 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaat 30211661  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  || ||||| ||||| |||| | |  ||||||| |||||||| ||||||||| |     
T  30211660 ctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttct 30211561  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| || |||||||  ||| | ||| ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  30211560 tgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcat 30211496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20832585 - 20832849
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20832585 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20832684  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  20832685 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20832784  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  20832785 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcat 20832849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 371
Target Start/End: Original strand, 45529121 - 45529459
Alignment:
Q  27 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 126  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||   | || ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  45529121 cttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaatctga 45529220  T
Q  127 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaa 226  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||||      | ||    
T  45529221 tatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtct------tcaa 45529314  T
Q  227 actcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctg 326  Q
    |||||||||| || ||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||| || |||   |||| || ||| |||| ||| || || ||    
T  45529315 actcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgttg 45529414  T
Q  327 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  45529415 aacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcatacca 45529459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Original strand, 1063351 - 1063606
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  1063351 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccacagtaccaattctctctgaaat 1063450  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  1063451 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 1063550  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcga 278  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  1063551 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcga 1063606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 27787341 - 27787612
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  27787341 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 27787440  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||  |     
T  27787441 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 27787540  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27787541 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 27787612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41608932 - 41608879
Alignment:
Q  319 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608932 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 41608879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 188
Target Start/End: Original strand, 12574049 - 12574118
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  12574049 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcat 12574118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 304
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276160
Alignment:
Q  162 cttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtc 261  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  ||| |||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||| ||    
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  262 ttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    || |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22276118 ttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 22276160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27368448 - 27368394
Alignment:
Q  250 tcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27368448 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 27368394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24833416 - 24833355
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaa 84  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24833416 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaa 24833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12640637 - 12640481
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  ||| |||||||| ||| || || | ||    
T  12640637 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 12640538  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12640537 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 12640481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 620 - 969
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  620 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 719  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  720 ttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 819  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  820 tgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtct 919  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14360 - 14708
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14360 catacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14459  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14460 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcc 14559  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  14560 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14659  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14660 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacca 14708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7288
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaaga-tgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6937 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 7036  T
Q  122 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctc-aaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  7037 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctcctt 7136  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggt 320  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  7137 cttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagt 7236  T
Q  321 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7237 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 7288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 43154 - 43503
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43154 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccgttccaactctttccaatat 43253  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43254 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 43353  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||| | ||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  43354 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 43453  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43454 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 43503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 8485 - 8834
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  8485 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactctttccaatat 8584  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8585 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 8684  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  8685 taaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 8784  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8785 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccag 8834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 313
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13956
Alignment:
Q  189 aggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcatt 288  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  289 ttctcttggatcatctgaactttct 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttct 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50785 - 50556
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  50785 tgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 50686  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  | | ||||||||| || || ||||||| || |||| |    
T  50685 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgaca 50586  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  50585 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 50556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Original strand, 15246 - 15296
Alignment:
Q  322 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15246 tgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccag 15296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 414 - 762
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  414 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 513  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  514 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 613  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  614 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 713  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  714 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaacca 762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 7377 - 7726
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  7377 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatat 7476  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7477 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 7576  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  7577 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 7676  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7677 gttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccag 7726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 345
Target Start/End: Original strand, 308659 - 308981
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  308659 catactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 308758  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  308759 ctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 308858  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  308859 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 308958  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaag 345  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  308959 gctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 279136 - 278788
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  279136 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 279037  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  279036 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 278937  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  278936 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 278837  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  278836 gctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaacca 278788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 165015 - 164667
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  165015 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 164916  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  164915 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 164816  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  164815 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 164716  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| |||||    
T  164715 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaacca 164667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 260308 - 260572
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  || || ||||  |||| ||| |||||||||| ||   | ||  ||||    
T  260308 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaat 260407  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||  ||    
T  260408 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 260507  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  260508 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 260572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 65405 - 65753
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  65405 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 65504  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  65505 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 65604  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  65605 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 65704  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65705 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 65753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40095 - 39926
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  40095 catacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccgttccaactctttcccatat 39996  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 192  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  39995 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacagga 39926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39898 - 39777
Alignment:
Q  250 tcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 349  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39898 tcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 39799  T
Q  350 ctctttcacctgactcaaacca 371  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  39798 ctttttcacctgattcaaacca 39777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33879 - 33530
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  33879 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 33780  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  33779 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcc 33680  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  33679 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 33580  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33579 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 8596 - 8945
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  8596 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 8695  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| |     
T  8696 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 8795  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  8796 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 8895  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8896 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 8945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4362
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  4711 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 4612  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| |     
T  4611 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 4512  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  4511 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 4412  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4411 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 4362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 6372 - 6720
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  6372 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccaccatcccaactctttccaatat 6471  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  6472 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 6571  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  6572 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagttt 6671  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6672 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 6720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 676 - 1024
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| |||||||  ||||| | ||    
T  676 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccaccattccaaccctttccgatat 775  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  776 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 875  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  876 tgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 975  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  976 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaacca 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 124 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 737
Alignment:
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  224 aaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttg 323  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  324 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 64337 - 63989
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  64337 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 64238  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  64237 ctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 64138  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| || |    
T  64137 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 64038  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  64037 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaacca 63989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6362
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||    
T  6014 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccaccattccaactctttctaatat 6113  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |     
T  6114 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctct 6213  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| |  || ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  6214 tgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 6313  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6314 gctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 6362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 652
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | ||    
T  999 catacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatat 900  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||| |     
T  899 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaaaa-cacgtggtctccttct 801  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  800 tgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 701  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  700 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 6023 - 6371
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  6023 catacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 6122  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  6123 ctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 6222  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  6223 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 6322  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6323 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaacca 6371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1830 - 1566
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  1830 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgatat 1731  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||| |  ||    
T  1730 ctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacc 1631  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || |||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  1630 tgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 1566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 9343 - 9691
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  9343 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 9442  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |     
T  9443 ctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttct 9542  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| || ||||    
T  9543 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagttt 9642  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9643 gttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaacca 9691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14039 - 14387
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14039 catacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14138  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || |||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |     
T  14139 ctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttct 14238  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  || ||||    
T  14239 tgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagttt 14338  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14339 gctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 14387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 367
Target Start/End: Original strand, 17680 - 17786
Alignment:
Q  261 cttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 360  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 17779  T
Q  361 gactcaa 367  Q
    |||||||    
T  17780 gactcaa 17786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 313
Target Start/End: Original strand, 31410 - 31700
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  31410 catacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaacctatcagatat 31509  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||| || | |||  |     
T  31510 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctct 31609  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 313  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||    
T  31610 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttct 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 145 - 372
Target Start/End: Original strand, 7519 - 7746
Alignment:
Q  145 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7519 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 7618  T
Q  245 gctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaa 344  Q
    |||  ||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7619 gcttatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaa 7718  T
Q  345 gaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7719 gaccactctttcacctaactcaaaccag 7746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 1139 - 1487
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  1139 catacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 1238  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |     
T  1239 ctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttct 1338  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  1339 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 1438  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1439 gttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaacca 1487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 87 - 371
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8138
Alignment:
Q  87 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  187 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttca 286  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  287 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacca 8138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 371
Target Start/End: Original strand, 5229 - 5569
Alignment:
Q  31 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 130  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||      
T  5229 cgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgataca 5328  T
Q  131 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactc 230  Q
    ||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| | | ||||||    
T  5329 gaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactc 5428  T
Q  231 aagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaaca 330  Q
    ||||||||| || || |   |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  5429 aagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaaca 5528  T
Q  331 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5529 atctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaacca 5569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 219723 - 219382
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  219723 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 219624  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |     
T  219623 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttct 219524  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  219523 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 219424  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgact 364  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  219423 gttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgact 219382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 229043 - 229391
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  229043 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 229142  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||| |     
T  229143 ctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 229242  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  229243 tgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 229342  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  229343 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaacca 229391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33176 - 33020
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | || ||||||||||| || || ||  | | |||||||| ||| ||||| | ||    
T  33176 gtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 33077  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| || || || |||||||    
T  33076 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatct 33020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 781
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||  | ||    
T  1128 catacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgatattccacctttccatctttttcttatat 1029  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  1028 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttct 930  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  929 tggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 830  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  829 gttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaacca 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 180217 - 180565
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| ||||  | ||    
T  180217 catacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactgttctaactctttctgatat 180316  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||  |     
T  180317 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 180416  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | || |    
T  180417 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 180516  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  180517 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 180565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 371
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22215
Alignment:
Q  88 actcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  188 taggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || || | ||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  288 tttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 22215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 2 - 350
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||    
T  2 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgatat 101  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |  ||  |     
T  102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctct 201  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| | || |    
T  202 tgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtct 301  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  302 gctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaacca 350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33058 - 32710
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  33058 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 32959  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  32958 ctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 32859  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  32858 taaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagttt 32759  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32758 gttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaacca 32710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 127505 - 127157
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  127505 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaactctttctgatat 127406  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |     
T  127405 ctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttct 127306  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  127305 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 127206  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  127205 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaacca 127157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15385 - 15037
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  15385 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 15286  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||| | || || |||||| ||    
T  15285 ctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcc 15186  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  15185 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 15086  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  15085 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaacca 15037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 4032 - 4380
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||  | ||    
T  4032 catacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatat 4131  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||| |     
T  4132 ctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 4231  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  ||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  4232 taaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 4331  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
      ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || |||||    
T  4332 attgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaacca 4380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 15493 - 15829
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15493 catacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatat 15591  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | |||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||| |     
T  15592 ctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttct 15691  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||| || | ||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  15692 tgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 15791  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 360  Q
    | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15792 gttgaacaatctcgagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 371
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16003
Alignment:
Q  200 tcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggat 299  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  300 catctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaacca 16003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49841
Alignment:
Q  36 ttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggacca 135  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  136 atgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagat 235  Q
    || ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  236 cttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctc 335  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||   |||||||||||| ||| | || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  336 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
      ||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaacca 49841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 16987 - 17335
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  16987 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 17086  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  17087 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 17186  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  17187 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagttt 17286  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||  || |||||||| || || ||  | ||||||||||| |||||    
T  17287 gttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaacca 17335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Original strand, 3140 - 3440
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||    
T  3140 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaatat 3239  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||| |     
T  3240 ctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 3339  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  3340 tgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 3439  T
Q  323 g 323  Q
    |    
T  3440 g 3440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 371
Target Start/End: Original strand, 448060 - 448407
Alignment:
Q  24 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||     
T  448060 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatt 448159  T
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccct 223  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||| | |    
T  448160 tgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttctt 448259  T
Q  224 aaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttg 323  Q
     ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||  |||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  448260 gaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 448359  T
Q  324 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  448360 ttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaacca 448407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 162113 - 162376
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  162113 catacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 162212  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |     
T  162213 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttct 162312  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttca 286  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  162313 tgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 91238 - 90890
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  91238 catacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 91139  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  91138 ctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 91039  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| || || |    
T  91038 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 90939  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||    
T  90938 gatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaacca 90890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 175361 - 175431
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 191  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  175361 atctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16736 - 16423
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||| | ||| || | ||||||||||    
T  16736 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttct 16637  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||    
T  16636 ttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggta 16537  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 357  Q
    | ||||||||  |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||    
T  16536 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctca 16437  T
Q  358 cctgactcaaacca 371  Q
    ||||||||||||||    
T  16436 cctgactcaaacca 16423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26025 - 25677
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  26025 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacggttccaattctttctgatat 25926  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| || | || |  ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||    
T  25925 ctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcc 25826  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||  || || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| | || ||| |||||||| ||||    
T  25825 tgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagttt 25726  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  25725 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaacca 25677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 14877 - 15225
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatat 14976  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| || || |||||| |     
T  14977 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttca 15076  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||| || | ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15077 tgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15176  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  15177 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaacca 15225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26839 - 26491
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||  | ||    
T  26839 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgatat 26740  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  26739 ctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcc 26640  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  26639 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 26540  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| | | ||||||| ||||| || |||||| |||| |||||    
T  26539 gttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaacca 26491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 196008 - 195660
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  196008 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgatat 195909  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  195908 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcc 195810  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| | |||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| || || |    
T  195809 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtct 195710  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  195709 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccag 195660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 68746 - 68577
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  68746 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 68647  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 192  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  68646 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 68577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 148570 - 148834
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  148570 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatat 148669  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  |     
T  148670 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctct 148769  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    || |||| |||  | |||||||| | |||||| ||| ||||  || ||||||||||||| |||||    
T  148770 tagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcat 148834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 112021 - 112369
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  112021 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 112120  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  112121 ctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 112220  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| || ||  ||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| || ||  |||| || |||||||||| || ||| |||||| | ||||    
T  112221 tgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagttt 112320  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| |||||    
T  112321 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaacca 112369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 322704 - 322995
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  | ||  | ||    
T  322704 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgatat 322803  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  ||    
T  322804 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 322903  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  322904 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 322995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 203774 - 203510
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||   | ||    
T  203774 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactcttttagatat 203675  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| | || ||||||| | |||||| ||||||||| |     
T  203674 ctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttct 203575  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||| ||||| ||||| || ||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  203574 tgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcat 203510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 117568 - 117916
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  117568 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 117667  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  117668 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 117767  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| || || |    
T  117768 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtat 117867  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||    
T  117868 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaacca 117916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 385819 - 386083
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  385819 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 385918  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |  || |||||  |     
T  385919 ctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctct 386018  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||    ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  386019 tgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcat 386083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 566 - 248
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||  | ||    
T  566 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgatat 467  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |     
T  466 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttct 367  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  366 tgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 267  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcc 341  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  266 gctgtacaatttctggtcc 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11045 - 10774
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  11045 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactgttccaactttctcagatat 10946  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  10945 ctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 10846  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctct 294  Q
    |  ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10845 tgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 10774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 908 - 1256
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  908 catacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatat 1007  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  1008 ctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcc 1107  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||||| || || || |||||||||  || ||  |||||||| ||||    
T  1108 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagttt 1207  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  1208 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaacca 1256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 117211 - 116863
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  | ||    
T  117211 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatat 117112  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| || || |||| | |     
T  117111 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttct 117012  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  117011 tgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 116912  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  116911 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaacca 116863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 344
Target Start/End: Original strand, 98140 - 98336
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | | |||||||| ||| || || | ||    
T  98140 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcctct 98239  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaa 344  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  |||||||||||    
T  98240 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaa 98336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 30
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  288 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatat 189  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || || |||||| |     
T  188 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 89  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  88 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1347
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  1005 catactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatat 1104  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||| || || || |||||| |     
T  1105 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttct 1204  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    |  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||| ||| ||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  1205 ttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagttt 1303  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||     ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  1304 gttg-----tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaacca 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 27967 - 28231
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  27967 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 28066  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||  |     
T  28067 ctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 28166  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28167 tgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 12965
Alignment:
Q  24 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || || ||||||||||||| ||| || ||| |||| | | ||||  | |||    
T  13282 atacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatc 13183  T
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccct 223  Q
    ||||| | || ||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  13182 tgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttctt 13083  T
Q  224 aaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttg 323  Q
     ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13082 gaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttg 12983  T
Q  324 ctgaacaatctctggtcc 341  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  12982 ctgaagaatttctggtcc 12965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7342 - 7078
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  7342 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactctctcagatat 7243  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || |||||  |     
T  7242 ctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 7143  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | | |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  7142 tgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25377 - 25029
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  25377 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctttccgatat 25278  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |  ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| |     
T  25277 ctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgct 25178  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||   || | || ||| || || || || |    
T  25177 tgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtct 25078  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  25077 ggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaacca 25029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 10098
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  || |    
T  10389 catacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaact 10290  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  10289 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 10190  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  10189 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 10098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 27519 - 27868
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27519 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 27618  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  ||    
T  27619 cttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcc 27718  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||| || || |    
T  27719 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtct 27818  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | |||||    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  27819 gatgaaccgaatctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccag 27868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1454 - 1191
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||    ||||| |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1454 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactgttccaaccctctcagatat 1355  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||  |     
T  1354 ctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctct 1256  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  1255 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16722 - 16374
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||| | ||||  | ||    
T  16722 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccaccattccaattctttctgatat 16623  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  ||| |||| || ||||| || || |||||| |     
T  16622 cttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttct 16523  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||   |||||| |  |||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  16522 tgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 16423  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | |||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  16422 gttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaacca 16374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Original strand, 191 - 472
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  191 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaaat 290  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||  ||    
T  291 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcc 390  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  391 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatct 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 3875 - 4139
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3875 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagatat 3974  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||  |     
T  3975 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctct 4074  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| |||| ||| || ||| |||||| |||||    
T  4075 tgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcat 4139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 26142 - 26400
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  26142 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 26241  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |     
T  26242 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 26341  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | |||||||||  | |||||||||| || ||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  26342 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 26400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6219 - 5964
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  6219 catacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagatat 6121  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| ||  ||||  |     
T  6120 ctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctct 6021  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgac 279  Q
    | |||||||||  | |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  6020 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgac 5964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 19983 - 20247
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  19983 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatat 20082  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||  |     
T  20083 ctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 20182  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  20183 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcat 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13667 - 13376
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  13667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 13568  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || ||  ||    
T  13567 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcc 13468  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  13467 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 13376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17437 - 17146
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  17437 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 17338  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || ||  ||    
T  17337 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 17238  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  17237 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 17146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Original strand, 6183 - 6478
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||| | |  || ||||| | || ||| ||||| ||||||| | ||||  ||||    
T  6183 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaat 6282  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca-aaaacacgtggtctcctcc 221  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||  ||| || ||||| ||| |    
T  6283 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttc 6382  T
Q  222 ctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagt 317  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  6383 ctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagt 6478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 16957 - 17142
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  16957 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatat 17056  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaaca 208  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17057 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 371
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9318
Alignment:
Q  100 accgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactc 199  Q
    |||||||||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  200 tcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggat 299  Q
    ||||||| || || || ||| | | ||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  300 catctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     |||| ||| |||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaacca 9318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 6977 - 7049
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgata 95  Q
    ||||||| | |||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  6977 catactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaacccactcgata 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 371
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5098
Alignment:
Q  33 aagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatgga 132  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||| ||| |||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  133 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaa 232  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||  | | ||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  233 gatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaat 332  Q
    |  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  ||||||||||| || || ||||| |     
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 5059  T
Q  333 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5060 atctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaacca 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14557 - 14276
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  14557 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 14458  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  14457 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 14358  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    |||||||||||  | || |||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  14357 taaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatct 14276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9183 - 9039
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  9183 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 9084  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaa 167  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  9083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14207 - 13858
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   ||||  | ||    
T  14207 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactgttccaatcctttctgatat 14108  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || ||  |     
T  14107 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 14008  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||||||| || |    
T  14007 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 13908  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  13907 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccag 13858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4968
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtc-tcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgat 256  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || |||| ||| |||||||||  | || ||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcct-cctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgat 5026  T
Q  257 aagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    || |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  5025 aactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52169 - 51905
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  52169 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 52070  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  52069 ctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 51970  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  51969 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcat 51905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 37202 - 37550
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  37202 catacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 37301  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| || ||||  ||     
T  37302 ctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccct 37401  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | ||||||||   | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||||||||| || || |    
T  37402 tgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtct 37501  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    | ||||| |  || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||    
T  37502 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaacca 37550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27545 - 27385
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||      
T  27545 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 27446  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | | |||||||||  | || ||||||| ||| || ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27445 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 27385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38382 - 38222
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||      
T  38382 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 38283  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | | |||||||||  | || ||||||| ||| || ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  38282 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 38222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 414
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  705 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 606  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || ||  ||    
T  605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 506  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  505 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 10888 - 11179
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  10888 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 10987  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || ||  ||    
T  10988 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 11087  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  11088 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42639 - 42348
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  42639 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 42540  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  42539 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 42440  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  42439 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctc 42348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47705 - 47414
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  47705 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 47606  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  47605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 47506  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  47505 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctc 47414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29075 - 28805
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  29075 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 28976  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  28975 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 28876  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
    | ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  28875 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 28805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41066 - 40796
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  41066 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 40967  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  40966 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 40867  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
    | ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  40866 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Original strand, 18884 - 19113
Alignment:
Q  58 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 157  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18884 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18983  T
Q  158 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgata 257  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | | ||||||||| || ||  |||||| |||||||||    
T  18984 tagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgata 19083  T
Q  258 agtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19084 gctcttctgttgactctgcgacgctttcat 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 23109 - 23275
Alignment:
Q  121 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctc 220  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||      
T  23109 atctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccct 23208  T
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | | ||||||||| || ||  |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23209 cttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 23275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 49513 - 49164
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  49513 catacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 49414  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || || ||  |     
T  49413 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctct 49314  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||| || || || |    
T  49313 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtct 49214  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  49213 catgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccag 49164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 98 - 362
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  98 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 197  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||  |     
T  198 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 297  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  |  ||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  298 tgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcat 362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21977 - 21713
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  21977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 21878  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||  ||  |     
T  21877 cttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctct 21778  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21777 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 21713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 47124 - 47388
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  47124 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 47223  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| | || |||| |||||| || |||||  |     
T  47224 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 47323  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || |||||||  ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  47324 tgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 47388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Original strand, 2751 - 3007
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  2751 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 2850  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || | |||  |     
T  2851 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctct 2950  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgac 279  Q
    | |||||||||  | |||||||||| |||||| |||  ||| ||| |||||||||||    
T  2951 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgac 3007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 248613 - 248877
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||    
T  248613 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaat 248712  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  248713 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 248812  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||| ||    ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  248813 tgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 248877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 61519 - 61170
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  61519 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 61420  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  61419 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 61320  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| || || |    
T  61319 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  61219 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccag 61170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 67907 - 67558
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  67907 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 67808  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  67807 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 67708  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| || || |    
T  67707 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 67608  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  67607 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccag 67558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52485 - 52136
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  52485 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 52386  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  52385 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 52286  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| || || |    
T  52285 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  52185 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccag 52136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4155
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| | |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactgttccaaccctctcagatat 3990  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  3991 ctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatct 4090  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  4091 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcat 4155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 9798 - 10057
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  9798 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 9897  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  9898 ctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 9997  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||| |     | ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  9998 tgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 10057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1475 - 1211
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| | |   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1475 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccctctctgatat 1376  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  1375 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 1276  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  1275 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 39739 - 40003
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  39739 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 39838  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || |||||  ||    
T  39839 cggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcc 39938  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39939 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 40003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33719
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  33983 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 33884  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |     
T  33883 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 33784  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  33783 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 33719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1372
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | |   | ||    
T  1177 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatat 1276  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  1277 ctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 1372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Original strand, 12738 - 12835
Alignment:
Q  274 tgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaacca 12835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 42784 - 42957
Alignment:
Q  24 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||  |||||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  124 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 197  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgac 42957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14349
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| |||||||| ||| |  | ||    
T  14086 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccttt-cagatat 14184  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||  || | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |     
T  14185 ctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14284  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | |||||| ||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14285 tgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 528 - 792
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  528 catactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 627  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || |||||  |     
T  628 ttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctct 727  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || || ||||||| |||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  728 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcat 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19384
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcat 19384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  67 gaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttca 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  167 aagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttg 266  Q
      ||| |||| ||||| |||| | || || ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| || ||| |||  ||||||||| |||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  267 ttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    |  ||| |||||||| |||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 58122 - 57939
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  58122 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 58023  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaa 206  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  58022 ctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaa 57939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49339 - 49075
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||   || ||| | ||||||||  | ||  | ||    
T  49339 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatat 49240  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||| || | |||  |     
T  49239 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcagaaacacatgatttccctct 49140  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| | | |||||||||| || |||||    
T  49139 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcat 49075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4259
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  4445 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctttgaaat 4346  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacac 209  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  4345 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacac 4259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18843 - 18498
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||| |||  | ||  | ||    
T  18843 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatat 18744  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||  |     
T  18743 ctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 18644  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || |||   |||||||  |||||||| || || |    
T  18643 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 18544  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 368  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  18543 gatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaa 18498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5896 - 5577
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| || || || |||||| |||   ||||    
T  5896 catacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaat 5797  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| | |||| | ||| |||| | ||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| |     
T  5796 atgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttct 5697  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||   |||| || ||| ||||| || ||||    
T  5696 tgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgttt 5598  T
Q  323 gctgaacaatctctggtccta 343  Q
    | |||||||| || |||||||    
T  5597 gttgaacaatttcaggtccta 5577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 238 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3694
Alignment:
Q  238 tttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctg 337  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  338 gtcctaagaccactctt 354  Q
    |||||||||||||||||    
T  3710 gtcctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 5044
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||  ||||||||  | |   | ||    
T  5308 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatat 5209  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||  |     
T  5208 ctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctct 5109  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  5108 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 5044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20122 - 20386
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  20122 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 20221  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || | || |||| |||||| || || ||  ||    
T  20222 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 20321  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  20322 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 20386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 43505 - 43793
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  43505 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 43604  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || ||  ||    
T  43605 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 43704  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 311  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| ||||||  || |||| | | |||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||    
T  43705 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaacttt 43793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 44517 - 44805
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  44517 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 44616  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || ||  ||    
T  44617 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 44716  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 311  Q
    | |||||||||  | ||||| |||| ||||||  || |||| | | |||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||    
T  44717 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaacttt 44805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Original strand, 36055 - 36220
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  36055 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 36154  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 188  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36155 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25907
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  26171 catatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatat 26072  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || ||  |     
T  26071 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctct 25972  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  25971 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 25907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16676 - 16940
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| || | ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  16676 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgccactattccaaccctctctgaaat 16775  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  16776 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16875  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||  |||||||||| || |||||    
T  16876 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17019 - 16755
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  17019 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16920  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  16919 ctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16820  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||| || |||||    
T  16819 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcat 16755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Original strand, 27226 - 27405
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27226 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacggttccaaccctctctgatat 27325  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 202  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  27326 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctca 27405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 136119 - 136278
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  136119 catacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 136218  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 182  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  136219 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  37 tgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaa 136  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||| |||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  137 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 187  Q
    | ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4558 - 4412
Alignment:
Q  225 aaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggtttgc 324  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||  || ||||| |||||     
T  4558 aaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtttgt 4459  T
Q  325 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  4458 tgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaacca 4412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37052 - 36974
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| |||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  37052 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7542 - 7253
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |   ||||    
T  7542 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctg--aaat 7445  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | || |||| ||| || || || ||  ||    
T  7444 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 7345  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    | ||||| |||  | || ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  7344 tgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 7253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 26261 - 26525
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |||||  ||| ||||||||| ||||| ||  | ||  ||||    
T  26261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagccactgttcccaccctctctgaaat 26360  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||  ||    
T  26361 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 26460  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | |||||||||| | ||||| | || |||||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  26461 tgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 26525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2172 - 2023
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  2172 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatat 2073  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcac 172  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2072 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39193 - 38929
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || || | |||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| | ||||||| | ||  ||||    
T  39193 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgctccaactctctctgaaat 39094  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||  ||    
T  39093 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 38994  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  38993 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcat 38929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13559 - 13380
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  13559 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagatat 13460  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 202  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13459 ctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 86810 - 86552
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || |  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||| ||||    
T  86810 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgacccaactctttccgaaat 86711  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
     ||||| || ||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||| |||| |     
T  86710 ttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttct 86611  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgc 281  Q
    | |||||||||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  86610 tgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgc 86552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 372
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46577
Alignment:
Q  326 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 46577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 371
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1613
Alignment:
Q  310 ttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13087 - 12738
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||||  || |||||||||||||   | ||  ||||    
T  13087 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaat 12988  T
Q  123 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccc 222  Q
    || ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||  ||    
T  12987 ctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 12888  T
Q  223 taaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggttt 322  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||| | || | | |||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  12887 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 12788  T
Q  323 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
    | ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  12787 gatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccag 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2057
Alignment:
Q  137 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatc 236  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  | | |||||||||  |    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  237 ttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttca 286  Q
     || ||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttca 2057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5477
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  5309 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 5408  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcat 287  Q
      ||| |||||||||  | || || ||||  ||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  5409 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 371
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6397
Alignment:
Q  310 ttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6336 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 83
Target Start/End: Original strand, 6273 - 6333
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaa 83  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6273 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 314
Target Start/End: Original strand, 10865 - 11060
Alignment:
Q  119 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 218  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || || | |||||| || || ||    
T  10865 aaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcacc 10964  T
Q  219 tccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
      ||| |||||||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||    
T  10965 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctc 11060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1270
Alignment:
Q  178 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcg 277  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  278 acgccttcattttctc 293  Q
    |||| ||||| |||||    
T  1285 acgctttcatcttctc 1270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 45845 - 45932
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45845 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Original strand, 1 - 110
Alignment:
Q  154 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcat 253  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  | | |||||||||  | || ||||||| |||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  254 gataagtctt 263  Q
    | ||| ||||    
T  101 ggtaactctt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1079
Alignment:
Q  161 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagt 260  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| || || || ||  ||  |||||||| ||||||||| | ||  ||||||||| |    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  261 cttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
    ||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatct 1079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 371
Target Start/End: Original strand, 10 - 44
Alignment:
Q  337 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaacca 44  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 302
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13187
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| ||||| || || ||  ||| |||||||| ||| ||||| | ||    
T  13033 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 13132  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 302  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13133 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcat 13187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Original strand, 46279 - 46435
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| || | |||| | || ||||||||||| || || ||  | | |||||||| ||| ||||| | ||    
T  46279 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 46378  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  46379 tatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 46435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 372
Target Start/End: Original strand, 87 - 238
Alignment:
Q  221 cctaaaactcaagatcttttctacgctggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtggt 320  Q
    |||||||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| || ||    
T  87 cctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 186  T
Q  321 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccag 372  Q
     || ||||| |  |||||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  187 ctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccag 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1091 - 946
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | |||||||| ||| ||||| | ||    
T  1091 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 992  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctc 293  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  991 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctc 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3487
Alignment:
Q  23 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3574 catacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3430 - 3370
Alignment:
Q  254 gataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 314  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  3430 gataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctc 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14709
Alignment:
Q  161 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacac 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacac 14709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14918 - 14762
Alignment:
Q  148 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctccctaaaactcaagatcttttctacgct 247  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||  |||| | || | || ||||||||||| || || ||  ||| ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14918 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctct 14819  T
Q  248 ggtcatgataagtcttttgttgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 304  Q
      ||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14818 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatct 14762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University