View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6868A_low_93 (Length: 302)

Name: NF6868A_low_93
Description: NF6868A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6868A_low_93
NF6868A_low_93
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (19-302)||(15284851-15285134)
chr4 (16-302)||(15227935-15228221)
chr4 (24-302)||(24460533-24460811)
chr4 (16-302)||(1900322-1900608)
chr4 (19-302)||(14235448-14235731)
chr4 (49-302)||(15391291-15391544)
chr4 (14-284)||(17014083-17014353)
chr4 (14-284)||(24592232-24592502)
chr4 (14-272)||(14665113-14665371)
chr4 (14-284)||(5005956-5006226)
chr4 (14-284)||(36344433-36344703)
chr4 (14-284)||(6569936-6570206)
chr4 (14-284)||(14763222-14763492)
chr4 (14-284)||(18800531-18800801)
chr4 (14-284)||(40105556-40105826)
chr4 (14-284)||(14098624-14098894)
chr4 (14-284)||(31126436-31126706)
chr4 (14-284)||(30753837-30754107)
chr4 (14-284)||(33673716-33673986)
chr4 (45-284)||(34188909-34189148)
chr4 (14-284)||(27163235-27163505)
chr4 (14-284)||(54833470-54833740)
chr4 (45-284)||(24112745-24112984)
chr4 (14-284)||(39850721-39850991)
chr4 (14-260)||(21969808-21970054)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (16-302)||(18530399-18530685)
chr3 (19-302)||(16626470-16626753)
chr3 (24-302)||(4625955-4626233)
chr3 (24-302)||(17993753-17994031)
chr3 (14-302)||(31034076-31034364)
chr3 (14-302)||(32292763-32293051)
chr3 (23-302)||(5652398-5652677)
chr3 (24-284)||(5713256-5713516)
chr3 (24-284)||(5724166-5724426)
chr3 (24-284)||(5757051-5757311)
chr3 (24-284)||(5767942-5768202)
chr3 (14-284)||(18330698-18330968)
chr3 (14-284)||(22387537-22387807)
chr3 (14-299)||(8295986-8296271)
chr3 (14-284)||(4796612-4796882)
chr3 (14-284)||(15741053-15741323)
chr3 (14-284)||(15892665-15892935)
chr3 (14-272)||(18051303-18051561)
chr3 (14-284)||(8301226-8301496)
chr3 (14-284)||(29148714-29148984)
chr3 (14-284)||(6192345-6192615)
chr3 (14-284)||(4721660-4721930)
chr3 (14-284)||(10396162-10396432)
chr3 (14-284)||(4416948-4417218)
chr3 (14-284)||(11110308-11110578)
chr3 (14-284)||(28115913-28116183)
chr3 (14-284)||(35880795-35881065)
chr3 (14-284)||(5467014-5467284)
chr3 (14-284)||(7073241-7073511)
chr3 (14-284)||(48465956-48466226)
chr3 (14-284)||(4346646-4346916)
chr3 (14-284)||(18277011-18277281)
chr3 (14-284)||(18292312-18292582)
chr3 (14-284)||(18307613-18307883)
chr3 (14-284)||(28021304-28021574)
chr3 (14-284)||(29664929-29665199)
chr3 (14-284)||(36997036-36997306)
chr3 (14-284)||(51782052-51782322)
chr3 (14-284)||(6542421-6542691)
chr3 (14-284)||(8211767-8212037)
chr3 (14-284)||(21674722-21674992)
chr3 (14-284)||(31964432-31964702)
chr3 (14-284)||(50134030-50134300)
chr3 (14-284)||(51797141-51797412)
chr3 (14-284)||(5609281-5609551)
chr3 (14-284)||(17984915-17985185)
chr3 (14-284)||(20576806-20577076)
chr3 (14-284)||(28339331-28339601)
chr3 (14-272)||(5596316-5596574)
chr3 (14-284)||(22870815-22871085)
chr3 (14-284)||(22885874-22886144)
chr3 (45-284)||(32439183-32439422)
chr3 (14-284)||(5013741-5014011)
chr3 (14-272)||(18242780-18243038)
chr3 (14-284)||(47023482-47023752)
chr3 (45-284)||(20066072-20066311)
chr3 (14-284)||(7996591-7996861)
chr3 (14-284)||(10643099-10643369)
chr3 (14-272)||(18225232-18225490)
chr3 (14-272)||(24328200-24328458)
chr3 (148-284)||(4893239-4893375)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (19-302)||(19456333-19456616)
chr2 (16-302)||(21703073-21703359)
chr2 (23-302)||(27118734-27119013)
chr2 (14-302)||(34303210-34303498)
chr2 (24-302)||(3784700-3784978)
chr2 (24-302)||(16163645-16163923)
chr2 (24-302)||(34157057-34157334)
chr2 (19-302)||(27393015-27393298)
chr2 (24-302)||(31891245-31891523)
chr2 (14-284)||(27434351-27434621)
chr2 (14-284)||(40233575-40233845)
chr2 (14-284)||(23128473-23128743)
chr2 (14-284)||(28882278-28882548)
chr2 (14-284)||(12655606-12655876)
chr2 (14-284)||(9349889-9350159)
chr2 (14-284)||(20837982-20838252)
chr2 (14-284)||(22925935-22926205)
chr2 (14-284)||(12586874-12587144)
chr2 (14-284)||(21677089-21677359)
chr2 (14-284)||(37375225-37375495)
chr2 (14-284)||(11635093-11635363)
chr2 (14-284)||(11641282-11641552)
chr2 (14-284)||(13936451-13936721)
chr2 (14-272)||(16829245-16829503)
chr2 (14-272)||(16891978-16892236)
chr2 (14-284)||(260660-260930)
chr2 (14-284)||(27777286-27777556)
chr2 (14-284)||(27817044-27817314)
chr2 (14-284)||(31876345-31876615)
chr2 (14-284)||(34861744-34862014)
chr2 (14-284)||(37685816-37686086)
chr2 (14-284)||(37701081-37701351)
chr2 (49-284)||(34286418-34286653)
chr2 (49-284)||(34291478-34291713)
chr2 (14-284)||(12716509-12716779)
chr2 (14-284)||(37925557-37925827)
chr2 (14-284)||(39051729-39051999)
chr2 (17-284)||(27803771-27804038)
chr2 (14-284)||(32049862-32050132)
chr2 (14-272)||(39890150-39890408)
chr2 (133-284)||(34279513-34279664)
chr2 (14-272)||(19416406-19416664)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (14-302)||(2576-2864)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (14-302)||(22456795-22457083)
chr6 (24-302)||(33374127-33374405)
chr6 (14-302)||(14143146-14143434)
chr6 (14-302)||(26787991-26788279)
chr6 (14-302)||(27196364-27196652)
chr6 (14-302)||(27252588-27252876)
chr6 (19-302)||(13521939-13522222)
chr6 (24-302)||(8892182-8892459)
chr6 (24-302)||(8903417-8903694)
chr6 (24-302)||(28162704-28162982)
chr6 (14-302)||(27290231-27290519)
chr6 (121-302)||(22477241-22477422)
chr6 (19-302)||(20160748-20161031)
chr6 (19-302)||(22171800-22172083)
chr6 (14-272)||(22934741-22934999)
chr6 (14-272)||(23857186-23857444)
chr6 (14-299)||(27272441-27272726)
chr6 (14-284)||(26918445-26918715)
chr6 (17-284)||(16749919-16750186)
chr6 (14-284)||(13298812-13299082)
chr6 (14-284)||(24304479-24304749)
chr6 (14-284)||(24863782-24864052)
chr6 (14-272)||(26989078-26989336)
chr6 (28-284)||(27000138-27000394)
chr6 (14-284)||(15424178-15424448)
chr6 (14-284)||(29549540-29549810)
chr6 (14-284)||(4773071-4773341)
chr6 (14-284)||(16674204-16674474)
chr6 (14-284)||(27007792-27008062)
chr6 (13-272)||(27359852-27360111)
chr6 (13-272)||(27450195-27450454)
chr6 (14-284)||(4525351-4525621)
chr6 (14-272)||(4757841-4758099)
chr6 (14-284)||(29573078-29573348)
chr6 (14-272)||(30557877-30558135)
chr6 (14-284)||(3696146-3696416)
chr6 (14-272)||(4545636-4545894)
chr6 (14-284)||(34463207-34463477)
chr6 (14-284)||(4723995-4724265)
chr6 (14-284)||(28207519-28207789)
chr6 (14-272)||(29501492-29501750)
chr6 (14-266)||(26116271-26116523)
chr6 (13-272)||(26777475-26777734)
chr6 (14-284)||(27044452-27044723)
chr6 (14-272)||(16943888-16944146)
chr6 (14-284)||(17025342-17025612)
chr6 (14-140)||(17092301-17092427)
chr6 (14-272)||(27485206-27485464)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (14-302)||(20340253-20340541)
chr1 (16-302)||(20461130-20461416)
chr1 (16-302)||(16207951-16208237)
chr1 (14-302)||(28151911-28152199)
chr1 (14-284)||(10962737-10963007)
chr1 (14-284)||(41793226-41793496)
chr1 (14-284)||(51638285-51638555)
chr1 (14-284)||(28585048-28585318)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (16-302)||(16041374-16041660)
chr7 (22-302)||(16449810-16450090)
chr7 (24-302)||(31088278-31088556)
chr7 (14-302)||(26484745-26485033)
chr7 (22-302)||(2108817-2109097)
chr7 (14-302)||(2775410-2775698)
chr7 (24-296)||(45733517-45733789)
chr7 (14-302)||(39210827-39211115)
chr7 (14-218)||(26682804-26683008)
chr7 (14-218)||(4200682-4200886)
chr7 (12-284)||(5128061-5128333)
chr7 (14-284)||(2154642-2154912)
chr7 (14-284)||(11424580-11424850)
chr7 (15-284)||(16518221-16518490)
chr7 (14-284)||(10916672-10916942)
chr7 (15-284)||(16503185-16503454)
chr7 (45-302)||(18540850-18541107)
chr7 (14-284)||(3445375-3445645)
chr7 (14-284)||(26274898-26275168)
chr7 (14-284)||(11441641-11441911)
chr7 (14-284)||(26435326-26435596)
chr7 (14-284)||(4144927-4145197)
chr7 (14-284)||(5147144-5147414)
chr7 (14-272)||(24592345-24592603)
chr7 (14-284)||(26319673-26319943)
chr7 (14-272)||(31564194-31564452)
chr7 (14-266)||(26537674-26537926)
chr7 (14-284)||(9618720-9618990)
chr7 (14-284)||(26669718-26669988)
chr7 (14-284)||(45387412-45387682)
chr7 (14-284)||(16736264-16736534)
chr7 (14-284)||(16751318-16751588)
chr7 (14-284)||(17523601-17523871)
chr7 (14-284)||(17529344-17529614)
chr7 (14-272)||(31125001-31125259)
chr7 (45-284)||(5159588-5159827)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (16-302)||(20438-20723)
scaffold0124 (14-272)||(30532-30790)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (16-302)||(22888529-22888815)
chr5 (16-302)||(25199088-25199374)
chr5 (24-302)||(13184473-13184751)
chr5 (14-302)||(29888897-29889185)
chr5 (24-302)||(13440319-13440597)
chr5 (14-299)||(23892268-23892553)
chr5 (19-302)||(33877306-33877589)
chr5 (24-302)||(11325853-11326131)
chr5 (14-284)||(24687972-24688242)
chr5 (14-284)||(33777564-33777834)
chr5 (14-284)||(23752265-23752535)
chr5 (14-284)||(9548358-9548628)
chr5 (14-284)||(11549431-11549701)
chr5 (14-272)||(22998929-22999187)
chr5 (14-284)||(23717803-23718073)
chr5 (14-284)||(24970095-24970365)
chr5 (14-272)||(30934722-30934980)
chr5 (14-284)||(15658575-15658845)
chr5 (14-284)||(37671298-37671568)
chr5 (14-284)||(28649312-28649582)
chr5 (14-284)||(31826222-31826492)
chr5 (14-284)||(8665290-8665560)
chr5 (14-284)||(9317528-9317798)
chr5 (14-284)||(12132232-12132502)
chr5 (14-284)||(15758672-15758942)
chr5 (14-284)||(30152095-30152365)
chr5 (14-284)||(31431517-31431787)
chr5 (13-284)||(32599286-32599557)
chr5 (14-284)||(2511128-2511398)
chr5 (14-284)||(6874382-6874652)
chr5 (14-284)||(18375227-18375497)
chr5 (22-284)||(18500553-18500815)
chr5 (14-284)||(26480469-26480739)
chr5 (14-272)||(33516445-33516703)
chr5 (14-272)||(37358458-37358716)
chr5 (14-284)||(13324644-13324914)
chr5 (14-284)||(43078329-43078599)
chr5 (14-284)||(3789618-3789888)
chr5 (14-284)||(24681517-24681787)
chr5 (14-284)||(24724044-24724314)
chr5 (14-272)||(29966881-29967139)
chr5 (14-272)||(30029504-30029762)
chr5 (14-284)||(30168546-30168816)
chr5 (14-284)||(40473364-40473634)
chr5 (14-266)||(37770802-37771054)
chr5 (45-284)||(41674786-41675025)
chr5 (14-284)||(5637987-5638257)
chr5 (14-266)||(37755075-37755327)
chr5 (45-284)||(33292602-33292841)
chr5 (14-272)||(34616607-34616865)
chr5 (13-272)||(28959600-28959859)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (16-282)||(1838-2103)
scaffold0415 (22-284)||(6080-6344)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (23-302)||(19658926-19659204)
chr8 (23-302)||(33244715-33244994)
chr8 (24-302)||(44563151-44563427)
chr8 (49-302)||(22080790-22081043)
chr8 (14-302)||(9354672-9354961)
chr8 (14-299)||(16283502-16283787)
chr8 (14-284)||(18710654-18710924)
chr8 (14-284)||(19688166-19688436)
chr8 (14-284)||(27608782-27609052)
chr8 (14-284)||(16277622-16277892)
chr8 (14-284)||(2137136-2137406)
chr8 (14-284)||(14557692-14557962)
chr8 (14-284)||(29829390-29829660)
chr8 (14-284)||(31354592-31354862)
chr8 (14-284)||(31489627-31489897)
chr8 (14-284)||(3329384-3329654)
chr8 (14-272)||(12092601-12092859)
chr8 (14-284)||(19208237-19208507)
chr8 (14-284)||(19674509-19674779)
chr8 (14-284)||(28361832-28362102)
chr8 (14-284)||(19286530-19286800)
chr8 (14-190)||(189256-189432)
chr8 (14-272)||(33258803-33259061)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (69-302)||(1-234)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (49-302)||(21611-21864)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (14-284)||(39987-40257)
scaffold0089 (14-272)||(46903-47161)
scaffold0089 (14-284)||(29831-30101)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (14-206)||(536-728)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (14-284)||(47-317)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (15-284)||(27360-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (14-284)||(9634-9904)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (14-284)||(7157-7427)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (14-284)||(8984-9254)
scaffold0159 (14-284)||(20083-20353)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (14-284)||(14848-15118)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (14-284)||(26119-26390)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (14-284)||(8017-8287)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (58-266)||(46764-46981)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285134
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 15285134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227935
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggag 15227935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460811
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24460733 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 24460811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900322
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| |    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900408 gtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 1900322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235731
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14235648 gaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggag 14235731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 302
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391544
Alignment:
Q  49 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  149 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  249 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggag 15391544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014083
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 17014083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592502
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24592502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665113
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 14665113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005956
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctct 5005956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344703
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 36344703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569936
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 6569936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763492
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 14763492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800801
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 18800801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105826
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 40105826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098624
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 14098624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126706
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 31126706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753837
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 30753837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33673986
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 33673986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189148
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 34189148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163505
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 27163505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833470
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctct 54833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112745
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 24112745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850721
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 39850721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969808
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgcc 260  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgcc 21969808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530399
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggag 18530399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626753
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggag 16626753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4625955
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4626033 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 4625955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17994031
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17993953 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 17994031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034364
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 31034364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292763
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 32292763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652398
Alignment:
Q  23 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  123 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 222  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  223 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggag 5652398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713256
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5713317  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5713316 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5713256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724166
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5724227  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5724226 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5724166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757311
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5757250  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5757251 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5757311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768202
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5768141  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5768142 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5768202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330698
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 18330698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387807
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 22387807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8295986
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 299  Q
    || || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcgg 8295986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796882
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 4796882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741323
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 15741323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892935
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 15892935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051303
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || || ||   |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 18051303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301496
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 8301496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148984
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 29148984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192345
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 6192345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721660
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 4721660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396162
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
    ||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctct 10396162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416948
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctct 4416948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110578
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 11110578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116183
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 28116183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880795
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctct 35880795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5467014
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 5467014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073241
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctct 7073241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465956
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 48465956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346916
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 4346916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277281
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 18277281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292582
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 18292582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307883
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 18307883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021304
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 28021304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665199
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 29665199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997306
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 36997306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782052
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542691
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctct 6542691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211767
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctct 8211767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674722
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 21674722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964702
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31964702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134300
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 50134300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797141
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  214 aggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609551
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 5609551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985185
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 17985185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577076
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 20577076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339331
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 28339331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596574
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 5596574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871085
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctct 22871085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886144
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctct 22886144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439183
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 32439183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013741
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5013741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242780
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 18242780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023482
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 47023482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066072
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||      
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggc 20066112  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  20066111 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 20066072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996591
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 7996591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10643099
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 10643099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225232
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 18225232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328200
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893239
Alignment:
Q  148 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 247  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  248 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 4893239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456616
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggag 19456616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703359
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 21703359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118734
Alignment:
Q  23 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  123 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 222  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  223 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 27118734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303498
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 34303498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784700
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3784778 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 3784700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163645
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16163723 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 16163645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34157057
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34157135 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 34157057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27393015
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggag 27393015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891523
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||      
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacc 31891444  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31891445 tgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 31891523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434621
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 27434621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233575
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 40233575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128743
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 23128743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882278
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 28882278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655606
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 12655606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350159
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 9350088  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  9350089 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctct 9350159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20837982
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 20837982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926205
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 22926205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586874
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 12586874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677359
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 21677359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375225
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 37375225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635363
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 11635363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641552
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 11641552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936721
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 13936721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829503
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 16829503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891978
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 16891978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260930
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 260930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777286
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 27777286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27817044
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 27817044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876345
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 31876345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861744
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 34861744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686086
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 37686086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701351
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 37701351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286418
Alignment:
Q  49 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 148  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  149 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 248  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  249 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 34286418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291478
Alignment:
Q  49 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 148  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  149 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 248  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  249 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 34291478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716779
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 12716779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925557
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 37925557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39051999
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 39051999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803771
Alignment:
Q  17 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  117 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 216  Q
     |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  217 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 27803771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049862
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctct 32049862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890150
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 39890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279513
Alignment:
Q  133 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 232  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  233 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 34279513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416664
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2864
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggag 2864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457083
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggag 22457083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374405
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33374327 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 33374405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143434
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 14143434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26787991
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 26787991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196364
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 27196364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252876
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 27252876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522222
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 13522222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892459
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8892381 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 8892459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903694
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8903616 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 8903694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162704
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28162782 ggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 28162704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290519
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggag 27290519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 302
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477422
Alignment:
Q  121 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 220  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  221 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggag 22477422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160748
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggag 20160748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172083
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggag 22172083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22934999
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 22934999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857444
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 23857444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272726
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
    ||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 299  Q
    ||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcgg 27272726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918445
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 26918445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749919
Alignment:
Q  17 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  117 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 216  Q
     |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  217 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 16749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299082
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 13299082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304749
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24304749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863782
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24863782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989078
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 26989078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000138
Alignment:
Q  28 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 127  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  128 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 227  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  228 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 27000138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424448
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 15424448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549540
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 29549540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773071
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 4773071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674204
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 16674204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007792
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 27007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360111
Alignment:
Q  13 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  113 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27360111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450454
Alignment:
Q  13 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  113 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27450454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525351
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
     | |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctct 4525351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757841
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 4757841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573078
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 29573078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558135
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696146
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 3696146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545894
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 4545894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463477
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctct 34463477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724265
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctct 4724265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207519
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctct 28207519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501492
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 29501492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116523
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 266  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777734
Alignment:
Q  13 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 112  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  113 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 26777734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044452
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc-atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || | | || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 27044452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944146
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025342
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 17025342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092427
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagctt 140  Q
     || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485206
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 27485206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340541
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggag 20340541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461130
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 20461130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208237
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 16208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151911
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 28151911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962737
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 10962737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793496
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 41793496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638285
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctct 51638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28585048
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || |||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 28585048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041374
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 16041374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450090
Alignment:
Q  22 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  122 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 221  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  222 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    | | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 16450090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088556
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31088478 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 31088556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484745
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 26484745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109097
Alignment:
Q  22 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  122 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 221  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  222 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
      ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 2109097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775410
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 2775410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733517
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 296  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45733589 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 45733517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211115
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 39211115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  214 aggtc 218  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  214 aggtc 218  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5128061
Alignment:
Q  12 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  112 aaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacact 211  Q
    || || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  212 tgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    |||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctct 5128061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154642
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 2154642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424850
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctct 11424850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518490
Alignment:
Q  15 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  115 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 214  Q
    || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  215 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 16518490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10916942
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 10916942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503454
Alignment:
Q  15 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  115 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 214  Q
    || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  215 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 16503454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540850
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 18540850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445375
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 3445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275168
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 26275168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441641
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 11441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435326
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 26435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145197
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 4145197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147414
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5147414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592603
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26319943
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 26319943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564452
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 31564452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26537926
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 266  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618720
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 9618720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26669988
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 26669988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387412
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 45387412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736534
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 16736534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751588
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 16751588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523601
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 17523601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529614
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 17529614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125001
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31125001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159588
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 5159588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20438
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 20438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30532
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888529
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22888615 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggag 22888529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199088
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 25199088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184751
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13184673 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 13184751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889185
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggag 29889185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440597
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13440519 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 13440597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892268
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 299  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 23892268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877306
Alignment:
Q  19 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  119 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 218  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  219 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 33877306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325853
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11325931 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 11325853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688242
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24688242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777564
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 33777564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752535
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 23752535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548628
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 9548628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549431
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 11549431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999187
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 22999187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718073
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 23718073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970095
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     ||    |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24970095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934722
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 30934722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658845
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 15658845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671568
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 37671568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649312
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 28649312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826492
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31826492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665560
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 8665560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317528
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 9317528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132232
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 12132232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15758942
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 15758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152095
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 30152095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431517
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 31431517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599557
Alignment:
Q  13 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 112  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  113 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 32599557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511128
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 2511128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874382
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 6874382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375497
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 18375497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500815
Alignment:
Q  22 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  122 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 221  Q
    |||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  222 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
       |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 18500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480469
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 26480469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516445
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 33516445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358716
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 37358716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324914
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 13324914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078329
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctct 43078329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789618
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 3789618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681517
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 24681517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24724044
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 24724044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967139
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029504
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168546
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 30168546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473634
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 40473634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771054
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 266  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 37771054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674786
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  41674825 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 41674786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5637987
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5637987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755075
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 266  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 37755075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292602
Alignment:
Q  45 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  145 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 244  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  245 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 33292602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616607
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 34616607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959859
Alignment:
Q  13 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  113 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 28959859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 282
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2103
Alignment:
Q  16 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 115  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  116 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 215  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  216 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6080
Alignment:
Q  22 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  122 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtca 219  Q
    |||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  220 gaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659204
Alignment:
Q  23 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  123 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 222  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  223 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggag 19659204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244715
Alignment:
Q  23 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  123 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 222  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  223 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
     ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33244794 cggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggag 33244715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563151
Alignment:
Q  24 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  124 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  224 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44563229 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggag 44563151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 302
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081043
Alignment:
Q  49 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  149 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  249 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggag 22081043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354672
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 212  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  213 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggag 9354672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283502
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgg 299  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcgg 16283502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710654
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 18710654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688166
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 19688166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609052
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 27609052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277622
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 16277622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137406
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 2137406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557692
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 14557692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829390
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctct 29829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354592
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31354592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489897
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31489897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329654
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 3329654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092859
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 12092859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208507
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 19208507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674509
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctct 19674509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362102
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 28362102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286530
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctct 19286530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 190  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258803
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 69 - 302
Target Start/End: Original strand, 1 - 234
Alignment:
Q  69 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  169 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  269 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21611
Alignment:
Q  49 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  149 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 248  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  249 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggag 21611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40257
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 40257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47161
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 272  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 47161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29831
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 29831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 206  Q
     ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 47 - 317
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27360
Alignment:
Q  15 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  115 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 214  Q
    || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  215 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 27360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9634
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 9634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7427
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 7427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9254
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20083
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 20083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15118
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 15118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26390
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  214 aggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 26390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 8017
Alignment:
Q  14 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  114 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  214 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 284  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctct 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 266
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46981
Alignment:
Q  58 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtactt 155  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || |||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatactt 46863  T
Q  156 caaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtg 250  Q
    |||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  46864 caaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtg 46963  T
Q  251 gaggc--ttgccctgtct 266  Q
    | |||  |||||||||||    
T  46964 ggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University