View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6871A_low_124 (Length: 250)

Name: NF6871A_low_124
Description: NF6871A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6871A_low_124
NF6871A_low_124
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (31-214)||(33423276-33423459)
chr7 (30-215)||(47740331-47740516)
chr7 (30-215)||(25893917-25894102)
chr7 (30-214)||(33839715-33839899)
chr7 (30-215)||(22979647-22979832)
chr7 (30-215)||(33695821-33696006)
chr7 (30-214)||(17855427-17855611)
chr7 (30-214)||(35355887-35356071)
chr7 (30-215)||(46913107-46913294)
chr7 (30-213)||(47066977-47067160)
chr7 (29-215)||(45690096-45690282)
chr7 (30-211)||(23393051-23393232)
chr7 (30-211)||(49171362-49171543)
chr7 (30-214)||(27018115-27018299)
chr7 (30-214)||(45482657-45482841)
chr7 (30-216)||(2341661-2341848)
chr7 (30-213)||(35328069-35328252)
chr7 (30-211)||(20165814-20165995)
chr7 (30-214)||(33411259-33411443)
chr7 (30-213)||(40670563-40670746)
chr7 (30-216)||(48609677-48609863)
chr7 (30-213)||(26579717-26579900)
chr7 (30-213)||(31586848-31587031)
chr7 (30-213)||(37846016-37846199)
chr7 (30-213)||(10028488-10028673)
chr7 (25-215)||(19563445-19563635)
chr7 (30-216)||(33332786-33332971)
chr7 (30-192)||(36389377-36389539)
chr7 (30-215)||(5712166-5712351)
chr7 (39-210)||(15877553-15877724)
chr7 (30-196)||(5183825-5183991)
chr7 (30-213)||(35757020-35757203)
chr7 (30-213)||(35767481-35767657)
chr7 (30-216)||(45063357-45063541)
chr7 (30-211)||(31625706-31625886)
chr7 (30-214)||(43499484-43499668)
chr7 (30-213)||(31429475-31429658)
chr7 (31-214)||(33870244-33870424)
chr7 (42-211)||(41990870-41991039)
chr7 (23-221)||(10618290-10618481)
chr7 (30-188)||(29446863-29447020)
chr7 (30-161)||(30076527-30076658)
chr7 (64-214)||(33720070-33720220)
chr7 (30-213)||(35752034-35752206)
chr7 (30-162)||(28233936-28234068)
chr7 (30-213)||(43489218-43489390)
chr7 (24-215)||(46817415-46817595)
chr7 (30-214)||(36816845-36817018)
chr7 (30-213)||(24923024-24923196)
chr7 (30-211)||(37127939-37128109)
chr7 (30-213)||(48085858-48086030)
chr7 (30-214)||(7876328-7876501)
chr7 (30-214)||(24228540-24228713)
chr7 (30-214)||(46898016-46898189)
chr7 (30-213)||(21718117-21718288)
chr7 (30-213)||(29610635-29610807)
chr7 (39-213)||(26941541-26941704)
chr7 (38-215)||(25037516-25037682)
chr7 (30-149)||(44405412-44405531)
chr7 (54-195)||(44564356-44564497)
chr7 (30-146)||(41904272-41904388)
chr7 (30-211)||(26371051-26371221)
chr7 (31-212)||(45502817-45502987)
chr7 (31-213)||(33393328-33393499)
chr7 (30-216)||(44003370-44003545)
chr7 (30-211)||(45237533-45237703)
chr7 (30-214)||(7257380-7257553)
chr7 (30-213)||(498188-498360)
chr7 (30-213)||(2332019-2332191)
chr7 (32-216)||(35484633-35484807)
chr7 (32-213)||(39453484-39453647)
chr7 (30-213)||(47906758-47906931)
chr7 (105-214)||(16482847-16482956)
chr7 (34-212)||(29098752-29098915)
chr7 (64-214)||(32556640-32556779)
chr7 (30-214)||(44659843-44660015)
chr7 (115-211)||(39866667-39866763)
chr7 (34-211)||(41855061-41855228)
chr7 (31-207)||(46103127-46103291)
chr7 (32-215)||(15643948-15644120)
chr7 (30-213)||(39323616-39323779)
chr7 (30-211)||(47460772-47460942)
chr7 (101-201)||(38448508-38448608)
chr7 (115-211)||(33455098-33455194)
chr7 (116-211)||(29863017-29863112)
chr7 (148-213)||(30077043-30077108)
chr7 (116-212)||(7720578-7720674)
chr7 (145-213)||(35557730-35557798)
chr7 (105-214)||(21649442-21649552)
chr7 (30-173)||(37443602-37443734)
chr7 (30-95)||(42272180-42272244)
chr7 (150-214)||(35823289-35823353)
chr7 (30-88)||(33455201-33455259)
chr7 (44-88)||(39866762-39866806)
chr7 (120-163)||(26456159-26456202)
chr7 (176-215)||(42272149-42272188)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (30-216)||(24253378-24253564)
chr5 (30-216)||(43262183-43262369)
chr5 (30-216)||(27501055-27501241)
chr5 (29-215)||(43326378-43326564)
chr5 (25-215)||(739699-739889)
chr5 (27-215)||(6901796-6901984)
chr5 (31-211)||(15398483-15398663)
chr5 (30-213)||(35626037-35626220)
chr5 (30-214)||(3466681-3466865)
chr5 (29-213)||(5184971-5185155)
chr5 (30-214)||(7722047-7722231)
chr5 (25-212)||(12648797-12648984)
chr5 (29-215)||(27938894-27939081)
chr5 (30-213)||(39932578-39932761)
chr5 (30-213)||(40886028-40886210)
chr5 (30-212)||(15683791-15683973)
chr5 (30-211)||(18479668-18479849)
chr5 (30-216)||(25831517-25831702)
chr5 (30-211)||(2484292-2484473)
chr5 (31-213)||(27278474-27278660)
chr5 (30-214)||(28424795-28424977)
chr5 (30-214)||(5137713-5137897)
chr5 (30-218)||(31938892-31939079)
chr5 (30-216)||(40278858-40279043)
chr5 (30-175)||(29789295-29789440)
chr5 (30-216)||(890902-891087)
chr5 (30-210)||(13504742-13504922)
chr5 (30-204)||(38756487-38756662)
chr5 (30-212)||(763723-763905)
chr5 (32-216)||(40110230-40110413)
chr5 (30-163)||(34451299-34451432)
chr5 (30-216)||(19295726-19295901)
chr5 (30-215)||(27503376-27503550)
chr5 (30-213)||(33617584-33617756)
chr5 (30-211)||(38015514-38015684)
chr5 (30-213)||(23195248-23195420)
chr5 (31-213)||(9424593-9424764)
chr5 (49-215)||(4149691-4149847)
chr5 (30-214)||(5497271-5497444)
chr5 (30-214)||(13957668-13957841)
chr5 (39-215)||(42658671-42658836)
chr5 (30-212)||(6973063-6973234)
chr5 (30-211)||(31293989-31294170)
chr5 (30-211)||(9374502-9374672)
chr5 (30-213)||(36365445-36365617)
chr5 (68-213)||(40632498-40632634)
chr5 (30-211)||(14971979-14972149)
chr5 (30-183)||(3656568-3656710)
chr5 (101-216)||(12558090-12558204)
chr5 (29-213)||(2585461-2585634)
chr5 (30-213)||(24167784-24167956)
chr5 (53-213)||(6206883-6207032)
chr5 (30-178)||(38492647-38492783)
chr5 (30-214)||(38637910-38638083)
chr5 (115-214)||(42247856-42247955)
chr5 (30-214)||(1402505-1402678)
chr5 (30-214)||(18327173-18327346)
chr5 (105-215)||(36472348-36472458)
chr5 (30-213)||(27390596-27390768)
chr5 (104-201)||(5120036-5120132)
chr5 (32-179)||(36948492-36948626)
chr5 (31-207)||(33623940-33624105)
chr5 (30-211)||(40686900-40687069)
chr5 (30-102)||(612757-612830)
chr5 (127-209)||(9171111-9171193)
chr5 (145-211)||(9527124-9527190)
chr5 (145-201)||(15300977-15301033)
chr5 (25-88)||(42247786-42247849)
chr5 (25-93)||(3940331-3940399)
chr5 (121-188)||(3940411-3940478)
chr5 (30-104)||(9171035-9171108)
chr5 (30-67)||(21785995-21786032)
chr5 (142-209)||(33316320-33316387)
chr5 (115-183)||(612830-612897)
chr5 (218-250)||(3623793-3623825)
chr5 (152-208)||(28756082-28756138)
[»] chr4 (123 HSPs)
chr4 (30-216)||(31532135-31532321)
chr4 (30-212)||(34276547-34276729)
chr4 (30-215)||(21366609-21366794)
chr4 (30-214)||(237475-237659)
chr4 (30-214)||(23437590-23437774)
chr4 (23-215)||(42085204-42085396)
chr4 (30-213)||(9798464-9798647)
chr4 (30-212)||(18462013-18462195)
chr4 (31-211)||(6019929-6020109)
chr4 (30-214)||(39077543-39077727)
chr4 (31-214)||(32366661-32366844)
chr4 (30-213)||(53854430-53854612)
chr4 (30-216)||(41632007-41632192)
chr4 (30-216)||(44984757-44984943)
chr4 (30-216)||(51363003-51363188)
chr4 (30-215)||(2826682-2826866)
chr4 (30-215)||(53461816-53462001)
chr4 (30-215)||(54574940-54575125)
chr4 (30-214)||(19387688-19387872)
chr4 (32-215)||(41702461-41702644)
chr4 (30-216)||(26091258-26091444)
chr4 (30-215)||(3170623-3170808)
chr4 (30-215)||(29478357-29478542)
chr4 (30-215)||(47344653-47344838)
chr4 (30-214)||(31914196-31914379)
chr4 (30-214)||(45797477-45797661)
chr4 (30-209)||(31972336-31972515)
chr4 (30-213)||(42765842-42766024)
chr4 (30-213)||(43471695-43471878)
chr4 (30-213)||(54607961-54608144)
chr4 (30-213)||(55056259-55056442)
chr4 (30-212)||(146429-146611)
chr4 (30-213)||(41949381-41949566)
chr4 (32-213)||(397401-397582)
chr4 (30-211)||(22618514-22618693)
chr4 (32-213)||(50457812-50457993)
chr4 (30-214)||(55776043-55776226)
chr4 (30-214)||(55840221-55840404)
chr4 (30-213)||(407753-407934)
chr4 (33-212)||(6285307-6285486)
chr4 (30-213)||(23609086-23609269)
chr4 (30-213)||(27373075-27373257)
chr4 (30-213)||(56022998-56023181)
chr4 (34-211)||(50534632-50534809)
chr4 (30-213)||(2243457-2243640)
chr4 (30-213)||(29777257-29777440)
chr4 (30-213)||(41560327-41560510)
chr4 (30-214)||(49881059-49881247)
chr4 (34-212)||(35446506-35446683)
chr4 (30-211)||(42222292-42222473)
chr4 (30-215)||(50233997-50234182)
chr4 (30-215)||(54086407-54086590)
chr4 (24-222)||(54805608-54805810)
chr4 (31-211)||(53834055-53834235)
chr4 (30-213)||(3692210-3692393)
chr4 (30-213)||(31070074-31070256)
chr4 (30-213)||(55519826-55520009)
chr4 (30-213)||(38591667-38591846)
chr4 (30-216)||(47662102-47662288)
chr4 (30-215)||(42033172-42033357)
chr4 (30-213)||(48313556-48313737)
chr4 (30-214)||(14017376-14017558)
chr4 (30-213)||(1932762-1932945)
chr4 (29-216)||(50536623-50536810)
chr4 (47-213)||(39587796-39587962)
chr4 (30-210)||(48657826-48658000)
chr4 (30-214)||(54424980-54425163)
chr4 (32-218)||(51951676-51951861)
chr4 (48-211)||(22468788-22468951)
chr4 (39-216)||(33897504-33897680)
chr4 (30-213)||(36532830-36533003)
chr4 (30-215)||(45633779-45633953)
chr4 (30-213)||(15060289-15060461)
chr4 (30-211)||(48259512-48259691)
chr4 (30-211)||(48654815-48655002)
chr4 (29-172)||(52728306-52728448)
chr4 (30-213)||(9997931-9998103)
chr4 (30-216)||(37239090-37239265)
chr4 (30-215)||(22620590-22620764)
chr4 (30-212)||(5117438-5117609)
chr4 (30-212)||(47811906-47812077)
chr4 (25-213)||(34552318-34552495)
chr4 (30-213)||(46708741-46708913)
chr4 (30-213)||(52688348-52688520)
chr4 (30-212)||(54715035-54715206)
chr4 (30-211)||(20351842-20352012)
chr4 (30-211)||(43890929-43891099)
chr4 (30-213)||(27873550-27873720)
chr4 (32-216)||(54216309-54216482)
chr4 (30-213)||(31881314-31881486)
chr4 (30-127)||(35595772-35595869)
chr4 (30-213)||(4486581-4486753)
chr4 (30-216)||(49014094-49014269)
chr4 (30-215)||(34835174-34835348)
chr4 (30-214)||(54216736-54216909)
chr4 (30-213)||(33289702-33289873)
chr4 (30-213)||(38547601-38547773)
chr4 (25-157)||(42509351-42509483)
chr4 (30-213)||(52461365-52461534)
chr4 (115-216)||(3293097-3293198)
chr4 (34-213)||(27398607-27398775)
chr4 (34-213)||(46720024-46720195)
chr4 (31-103)||(33048990-33049062)
chr4 (30-213)||(1662261-1662431)
chr4 (30-211)||(14335101-14335271)
chr4 (30-211)||(27580120-27580290)
chr4 (74-163)||(52396775-52396865)
chr4 (31-132)||(35344868-35344968)
chr4 (115-216)||(11972203-11972304)
chr4 (48-211)||(33557960-33558112)
chr4 (116-213)||(43231502-43231598)
chr4 (30-212)||(6371249-6371420)
chr4 (128-211)||(42557583-42557666)
chr4 (30-213)||(573802-573974)
chr4 (30-107)||(48259704-48259780)
chr4 (30-105)||(51981479-51981554)
chr4 (30-98)||(3291805-3291873)
chr4 (30-179)||(27872612-27872750)
chr4 (30-201)||(18206512-18206682)
chr4 (30-135)||(42558270-42558367)
chr4 (169-214)||(17555625-17555670)
chr4 (106-211)||(49057933-49058038)
chr4 (124-213)||(43478059-43478147)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (30-215)||(32984077-32984262)
chr8 (28-214)||(41862218-41862404)
chr8 (30-213)||(24079901-24080084)
chr8 (30-213)||(37956420-37956603)
chr8 (30-212)||(9303574-9303756)
chr8 (30-213)||(43328706-43328889)
chr8 (30-216)||(5946043-5946229)
chr8 (30-212)||(40435153-40435335)
chr8 (30-211)||(10646124-10646305)
chr8 (30-213)||(33730641-33730824)
chr8 (30-212)||(9734255-9734435)
chr8 (30-216)||(13356120-13356306)
chr8 (34-211)||(31830959-31831136)
chr8 (30-215)||(41653892-41654077)
chr8 (30-213)||(6365985-6366168)
chr8 (30-213)||(33981663-33981846)
chr8 (30-216)||(17718722-17718908)
chr8 (31-213)||(37301326-37301508)
chr8 (30-216)||(37419936-37420122)
chr8 (30-211)||(2714550-2714730)
chr8 (30-214)||(45236565-45236749)
chr8 (32-207)||(32114254-32114429)
chr8 (30-212)||(2275913-2276094)
chr8 (30-214)||(25185897-25186081)
chr8 (30-213)||(41231945-41232128)
chr8 (30-212)||(9013684-9013865)
chr8 (28-213)||(35628776-35628961)
chr8 (30-213)||(13760646-13760831)
chr8 (30-212)||(45066592-45066774)
chr8 (31-214)||(22878389-22878572)
chr8 (29-215)||(25248036-25248216)
chr8 (33-211)||(44088446-44088624)
chr8 (53-214)||(29048426-29048587)
chr8 (31-215)||(41639911-41640095)
chr8 (30-156)||(12032986-12033112)
chr8 (30-212)||(45258510-45258691)
chr8 (30-163)||(3904126-3904258)
chr8 (30-146)||(41981534-41981650)
chr8 (30-213)||(4447295-4447467)
chr8 (27-217)||(10378304-10378483)
chr8 (42-211)||(42701301-42701471)
chr8 (30-213)||(31940314-31940485)
chr8 (30-216)||(117329-117504)
chr8 (30-213)||(41843252-41843424)
chr8 (30-213)||(9713688-9713857)
chr8 (30-143)||(31336163-31336276)
chr8 (30-211)||(3211207-3211376)
chr8 (30-214)||(2379138-2379311)
chr8 (30-212)||(40458772-40458943)
chr8 (36-200)||(40649837-40649990)
chr8 (35-210)||(4975412-4975576)
chr8 (105-212)||(39915887-39915994)
chr8 (30-213)||(9509400-9509572)
chr8 (30-216)||(33896843-33897017)
chr8 (115-216)||(27243213-27243314)
chr8 (115-216)||(27254788-27254889)
chr8 (36-207)||(32373733-32373892)
chr8 (30-214)||(3490399-3490572)
chr8 (30-216)||(33622467-33622640)
chr8 (47-212)||(38631652-38631806)
chr8 (110-191)||(41981454-41981535)
chr8 (30-216)||(26196317-26196491)
chr8 (103-214)||(31148953-31149063)
chr8 (30-105)||(41425429-41425503)
chr8 (143-206)||(164728-164791)
chr8 (30-95)||(39901674-39901739)
chr8 (176-213)||(12032951-12032988)
chr8 (169-211)||(39901574-39901616)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (30-215)||(17600832-17601017)
chr2 (30-213)||(746464-746647)
chr2 (30-215)||(6594458-6594643)
chr2 (30-215)||(23901775-23901960)
chr2 (30-213)||(4034590-4034773)
chr2 (29-212)||(38997100-38997283)
chr2 (30-213)||(45370988-45371171)
chr2 (30-216)||(26710340-26710526)
chr2 (29-213)||(11184970-11185154)
chr2 (30-214)||(13815218-13815402)
chr2 (30-213)||(2324889-2325072)
chr2 (30-213)||(27651034-27651217)
chr2 (30-213)||(40635216-40635399)
chr2 (30-212)||(14660445-14660627)
chr2 (30-212)||(34518366-34518548)
chr2 (36-213)||(6430471-6430648)
chr2 (33-214)||(10424592-10424773)
chr2 (30-215)||(27400399-27400584)
chr2 (30-213)||(10244582-10244765)
chr2 (30-216)||(40735459-40735645)
chr2 (30-211)||(32327361-32327542)
chr2 (30-213)||(27024413-27024596)
chr2 (30-211)||(33427647-33427828)
chr2 (30-213)||(1091951-1092134)
chr2 (30-212)||(5726128-5726310)
chr2 (30-212)||(32948445-32948626)
chr2 (30-211)||(4609626-4609807)
chr2 (30-213)||(40037141-40037323)
chr2 (30-212)||(7892688-7892870)
chr2 (30-214)||(14697537-14697721)
chr2 (30-214)||(37255337-37255516)
chr2 (30-211)||(2914138-2914319)
chr2 (30-214)||(37620867-37621054)
chr2 (36-216)||(15925075-15925255)
chr2 (64-215)||(32608376-32608527)
chr2 (30-211)||(9444683-9444874)
chr2 (29-208)||(11159625-11159803)
chr2 (30-197)||(32856436-32856603)
chr2 (33-160)||(25294886-25295013)
chr2 (56-215)||(8432942-8433101)
chr2 (64-211)||(12842103-12842250)
chr2 (30-211)||(35158050-35158220)
chr2 (31-216)||(39103042-39103216)
chr2 (25-213)||(28641287-28641464)
chr2 (64-221)||(41172449-41172605)
chr2 (30-216)||(1229630-1229809)
chr2 (25-213)||(29687039-29687216)
chr2 (87-213)||(42899913-42900039)
chr2 (30-213)||(12730059-12730231)
chr2 (30-211)||(27331298-27331472)
chr2 (32-212)||(145281-145450)
chr2 (30-214)||(21734900-21735073)
chr2 (30-213)||(4258488-4258659)
chr2 (30-137)||(447633-447740)
chr2 (30-215)||(2688729-2688903)
chr2 (30-215)||(12333497-12333669)
chr2 (25-212)||(19428421-19428598)
chr2 (29-211)||(39301196-39301367)
chr2 (30-215)||(13543624-13543798)
chr2 (29-214)||(27764862-27765035)
chr2 (30-213)||(43898971-43899142)
chr2 (30-213)||(44481826-44481998)
chr2 (35-215)||(28566703-28566872)
chr2 (30-180)||(3711664-3711803)
chr2 (30-211)||(34249265-34249435)
chr2 (30-213)||(43356097-43356266)
chr2 (29-138)||(12827136-12827244)
chr2 (132-216)||(12814609-12814693)
chr2 (29-216)||(2000338-2000512)
chr2 (68-137)||(28014856-28014925)
chr2 (35-213)||(35126778-35126945)
chr2 (115-215)||(40544150-40544250)
chr2 (32-211)||(3266296-3266455)
chr2 (47-212)||(8056625-8056779)
chr2 (30-215)||(30545817-30545991)
chr2 (169-214)||(28019960-28020005)
chr2 (145-212)||(10176558-10176625)
chr2 (30-88)||(40544085-40544143)
chr2 (30-107)||(10176637-10176714)
chr2 (105-180)||(38985342-38985416)
chr2 (30-85)||(42900781-42900835)
chr2 (169-215)||(36216305-36216351)
chr2 (169-213)||(8264532-8264576)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (30-214)||(31307999-31308183)
chr1 (30-214)||(45538151-45538335)
chr1 (30-216)||(3611132-3611318)
chr1 (30-215)||(44661967-44662152)
chr1 (30-215)||(23984752-23984937)
chr1 (30-213)||(17994951-17995134)
chr1 (30-212)||(21139412-21139594)
chr1 (30-216)||(47671582-47671768)
chr1 (30-215)||(25058685-25058870)
chr1 (36-216)||(4068689-4068869)
chr1 (30-213)||(5981169-5981352)
chr1 (30-213)||(25678259-25678442)
chr1 (30-213)||(46967041-46967224)
chr1 (30-216)||(6327548-6327733)
chr1 (30-216)||(24245025-24245211)
chr1 (30-216)||(26277173-26277359)
chr1 (32-210)||(43251713-43251891)
chr1 (30-215)||(46616546-46616731)
chr1 (30-214)||(41999813-41999997)
chr1 (30-213)||(31040708-31040891)
chr1 (30-213)||(35273595-35273778)
chr1 (30-213)||(36566329-36566512)
chr1 (30-216)||(26085398-26085583)
chr1 (27-213)||(37620189-37620375)
chr1 (30-216)||(38331859-38332045)
chr1 (29-214)||(33112817-33113001)
chr1 (30-211)||(38790197-38790378)
chr1 (30-213)||(23932509-23932692)
chr1 (30-213)||(39646567-39646750)
chr1 (30-213)||(49253975-49254158)
chr1 (27-213)||(5980067-5980253)
chr1 (30-212)||(33884088-33884270)
chr1 (30-212)||(33959982-33960164)
chr1 (30-211)||(47317316-47317497)
chr1 (30-215)||(51057068-51057253)
chr1 (34-214)||(26794302-26794482)
chr1 (30-213)||(24885500-24885683)
chr1 (30-217)||(46784418-46784605)
chr1 (30-212)||(26524889-26525071)
chr1 (30-216)||(47187101-47187287)
chr1 (30-212)||(47383732-47383914)
chr1 (25-211)||(50774218-50774404)
chr1 (30-214)||(35692663-35692848)
chr1 (34-213)||(23220939-23221112)
chr1 (31-214)||(3285400-3285582)
chr1 (30-213)||(49398988-49399171)
chr1 (30-211)||(36003131-36003315)
chr1 (61-214)||(31844374-31844527)
chr1 (43-210)||(42863867-42864034)
chr1 (33-211)||(28888582-28888760)
chr1 (30-216)||(48373500-48373677)
chr1 (30-213)||(42313361-42313548)
chr1 (74-211)||(25518815-25518952)
chr1 (30-213)||(41467632-41467804)
chr1 (30-215)||(27983603-27983772)
chr1 (30-177)||(2450529-2450676)
chr1 (30-215)||(2657300-2657474)
chr1 (30-216)||(33073207-33073382)
chr1 (30-158)||(4808699-4808827)
chr1 (31-212)||(6626025-6626195)
chr1 (30-215)||(10928064-10928238)
chr1 (36-215)||(26472185-26472353)
chr1 (30-216)||(29770666-29770841)
chr1 (33-210)||(45475848-45476014)
chr1 (30-163)||(51045596-51045729)
chr1 (47-212)||(51403034-51403189)
chr1 (30-216)||(42234836-42235010)
chr1 (30-211)||(4953053-4953223)
chr1 (30-213)||(2954854-2955026)
chr1 (93-210)||(31979998-31980115)
chr1 (29-214)||(4243489-4243663)
chr1 (30-213)||(26685855-26686027)
chr1 (30-161)||(4156438-4156576)
chr1 (36-212)||(34752320-34752485)
chr1 (25-215)||(39475778-39475956)
chr1 (93-215)||(2556909-2557031)
chr1 (30-214)||(30289910-30290083)
chr1 (30-210)||(41895164-41895333)
chr1 (30-123)||(13312531-13312624)
chr1 (30-215)||(33187337-33187505)
chr1 (30-215)||(5961267-5961441)
chr1 (28-213)||(38716245-38716419)
chr1 (30-209)||(1388476-1388644)
chr1 (36-211)||(44544052-44544216)
chr1 (30-213)||(51155590-51155761)
chr1 (30-162)||(47772172-47772304)
chr1 (33-210)||(32448650-32448807)
chr1 (56-212)||(13281588-13281733)
chr1 (115-216)||(13313248-13313351)
chr1 (30-216)||(44293455-44293630)
chr1 (30-214)||(10920198-10920371)
chr1 (30-211)||(7561528-7561712)
chr1 (121-215)||(24649802-24649896)
chr1 (115-221)||(46428327-46428433)
chr1 (30-214)||(52323936-52324110)
chr1 (30-213)||(52367882-52368054)
chr1 (105-213)||(27924722-27924830)
chr1 (47-216)||(35991616-35991773)
chr1 (122-213)||(39637899-39637986)
chr1 (29-200)||(48683329-48683489)
chr1 (153-213)||(4156188-4156248)
chr1 (30-105)||(38718167-38718242)
chr1 (53-163)||(24215812-24215911)
chr1 (30-89)||(31286504-31286563)
chr1 (160-214)||(10919313-10919367)
chr1 (30-67)||(31844818-31844855)
chr1 (185-215)||(23994845-23994875)
chr1 (61-91)||(39359502-39359532)
chr1 (25-89)||(24649727-24649791)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (30-213)||(39556-39739)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (30-213)||(5882505-5882688)
chr6 (25-215)||(8615237-8615427)
chr6 (30-216)||(22551061-22551247)
chr6 (34-214)||(14891383-14891563)
chr6 (30-209)||(18101495-18101674)
chr6 (30-213)||(24168090-24168273)
chr6 (30-213)||(26377204-26377387)
chr6 (30-214)||(19415533-19415717)
chr6 (32-211)||(2892189-2892368)
chr6 (30-213)||(34527862-34528045)
chr6 (30-215)||(1970708-1970893)
chr6 (30-215)||(7393586-7393771)
chr6 (39-215)||(16703363-16703539)
chr6 (30-214)||(28947085-28947269)
chr6 (30-212)||(959904-960086)
chr6 (30-219)||(2593852-2594041)
chr6 (32-213)||(7345114-7345295)
chr6 (30-199)||(11988974-11989143)
chr6 (31-213)||(19281056-19281238)
chr6 (30-214)||(599890-600074)
chr6 (30-199)||(22341788-22341959)
chr6 (30-213)||(10507908-10508091)
chr6 (30-211)||(33452572-33452753)
chr6 (30-212)||(24224070-24224253)
chr6 (30-216)||(5294801-5294987)
chr6 (30-216)||(5299353-5299539)
chr6 (30-211)||(30743448-30743629)
chr6 (83-213)||(30467656-30467786)
chr6 (30-215)||(28948845-28949019)
chr6 (30-180)||(23261929-23262079)
chr6 (37-215)||(13329378-13329545)
chr6 (30-213)||(15965432-15965604)
chr6 (29-214)||(7167580-7167754)
chr6 (30-211)||(4487528-4487698)
chr6 (30-212)||(3786749-3786920)
chr6 (29-214)||(1398551-1398725)
chr6 (30-211)||(3291009-3291179)
chr6 (130-214)||(929657-929741)
chr6 (30-105)||(18661830-18661905)
chr6 (30-105)||(24913096-24913171)
chr6 (156-216)||(11743070-11743130)
chr6 (115-206)||(1939578-1939669)
chr6 (124-215)||(375807-375898)
chr6 (30-89)||(34262342-34262401)
chr6 (32-89)||(375729-375786)
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (30-214)||(49330035-49330219)
chr3 (30-213)||(40419834-40420017)
chr3 (30-213)||(47257792-47257975)
chr3 (30-212)||(27066978-27067160)
chr3 (30-216)||(37313395-37313581)
chr3 (30-215)||(40130959-40131144)
chr3 (30-215)||(41464349-41464534)
chr3 (30-214)||(43612047-43612231)
chr3 (30-216)||(7855114-7855300)
chr3 (30-216)||(24100279-24100464)
chr3 (30-211)||(38416724-38416905)
chr3 (30-214)||(22399095-22399278)
chr3 (30-214)||(28048392-28048576)
chr3 (30-213)||(47809596-47809780)
chr3 (30-214)||(48739233-48739417)
chr3 (31-215)||(51170034-51170218)
chr3 (31-215)||(55453245-55453429)
chr3 (30-213)||(40643799-40643982)
chr3 (30-216)||(32234398-32234583)
chr3 (30-216)||(40804510-40804696)
chr3 (30-216)||(51102378-51102564)
chr3 (30-215)||(29625827-29626012)
chr3 (30-214)||(42291840-42292024)
chr3 (30-215)||(41732525-41732710)
chr3 (34-214)||(35594119-35594299)
chr3 (30-214)||(44222827-44223011)
chr3 (25-213)||(52628953-52629140)
chr3 (30-213)||(2665999-2666182)
chr3 (30-213)||(7755307-7755489)
chr3 (30-213)||(20754393-20754576)
chr3 (30-213)||(35748311-35748494)
chr3 (30-212)||(39634572-39634753)
chr3 (30-212)||(51452751-51452932)
chr3 (30-215)||(43125828-43126012)
chr3 (30-213)||(39053393-39053576)
chr3 (30-216)||(37324537-37324723)
chr3 (32-215)||(48609719-48609903)
chr3 (30-213)||(44806683-44806866)
chr3 (30-213)||(51146215-51146398)
chr3 (45-211)||(52215077-52215243)
chr3 (30-211)||(46134357-46134538)
chr3 (30-213)||(53943588-53943770)
chr3 (55-213)||(24376572-24376730)
chr3 (31-211)||(43021715-43021896)
chr3 (30-215)||(52638839-52639024)
chr3 (30-210)||(41293319-41293498)
chr3 (32-207)||(43183917-43184092)
chr3 (28-216)||(5560023-5560218)
chr3 (30-226)||(36368925-36369120)
chr3 (32-212)||(53832486-53832666)
chr3 (30-213)||(41216454-41216637)
chr3 (30-189)||(46126010-46126168)
chr3 (30-211)||(18946904-18947085)
chr3 (32-213)||(47894822-47895003)
chr3 (63-212)||(53637841-53637990)
chr3 (32-215)||(48546842-48547014)
chr3 (30-214)||(25641644-25641817)
chr3 (30-213)||(42589829-42590001)
chr3 (30-216)||(34279721-34279896)
chr3 (30-215)||(51415966-51416140)
chr3 (32-215)||(54159000-54159173)
chr3 (30-215)||(54707220-54707394)
chr3 (30-213)||(55000178-55000350)
chr3 (30-212)||(38156632-38156803)
chr3 (66-216)||(37758925-37759075)
chr3 (30-213)||(54401186-54401358)
chr3 (33-215)||(49130575-49130746)
chr3 (30-213)||(39141125-39141298)
chr3 (30-214)||(47510940-47511113)
chr3 (30-213)||(41635800-41635972)
chr3 (47-208)||(46949379-46949538)
chr3 (30-211)||(31286793-31286963)
chr3 (30-213)||(55379984-55380156)
chr3 (30-216)||(25353550-25353725)
chr3 (25-215)||(37028720-37028899)
chr3 (30-145)||(33550467-33550582)
chr3 (35-211)||(40022075-40022240)
chr3 (28-216)||(51224036-51224212)
chr3 (30-152)||(52864550-52864671)
chr3 (30-213)||(53115446-53115618)
chr3 (32-213)||(45058882-45059052)
chr3 (55-215)||(17665549-17665698)
chr3 (28-212)||(24688114-24688287)
chr3 (116-216)||(28576187-28576287)
chr3 (101-216)||(2227995-2228110)
chr3 (30-215)||(30251501-30251675)
chr3 (81-166)||(47182046-47182131)
chr3 (31-211)||(51143818-51143987)
chr3 (26-211)||(43176734-43176908)
chr3 (101-203)||(47402810-47402911)
chr3 (116-213)||(48726073-48726170)
chr3 (31-213)||(42998790-42998960)
chr3 (116-211)||(41882066-41882161)
chr3 (30-213)||(44945935-44946101)
chr3 (30-105)||(48534007-48534082)
chr3 (116-216)||(21597223-21597323)
chr3 (30-215)||(50731914-50732087)
chr3 (30-215)||(50780769-50780942)
chr3 (30-183)||(52756067-52756213)
chr3 (30-211)||(40165653-40165822)
chr3 (30-114)||(30429227-30429311)
chr3 (139-213)||(52434138-52434213)
chr3 (139-212)||(48752085-48752158)
chr3 (30-82)||(40688431-40688483)
chr3 (169-213)||(51942544-51942588)
chr3 (160-214)||(37741433-37741487)
chr3 (30-181)||(41609098-41609238)
chr3 (116-211)||(177162-177257)
chr3 (101-216)||(8847718-8847832)
chr3 (30-72)||(41882011-41882053)
chr3 (36-89)||(52434291-52434344)
chr3 (185-213)||(33550581-33550609)
chr3 (31-71)||(37760346-37760386)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (30-213)||(13762-13945)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (25-213)||(2427-2615)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (30-215)||(11133-11317)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (30-210)||(1871-2051)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (30-213)||(75244-75427)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (30-213)||(18854-19037)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (30-213)||(278005-278190)
scaffold0007 (30-200)||(176666-176836)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (61-213)||(32560-32712)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (23-221)||(4589-4781)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (30-211)||(3089-3261)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (30-213)||(7089-7262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (29-212)||(20476-20648)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (30-216)||(14740-14915)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (30-216)||(98-272)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (30-215)||(4554-4729)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (30-215)||(3389-3564)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (64-218)||(17900-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (106-201)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 33423276 - 33423459
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33423276 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 33423375  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423376 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33423459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 47740331 - 47740516
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47740331 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 47740430  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47740431 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 25893917 - 25894102
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25893917 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25894016  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25894017 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25894102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 33839715 - 33839899
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33839715 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33839814  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839815 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33839899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 22979647 - 22979832
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22979647 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 22979746  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 22979832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 33695821 - 33696006
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33695821 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33695920  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 33696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17855611 - 17855427
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17855611 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 17855512  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17855511 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 17855427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35356071 - 35355887
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35356071 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 35355972  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35355971 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 35355887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46913294 - 46913107
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca--tttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  46913294 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatgaact 46913195  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913194 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46913107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 47066977 - 47067160
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47066977 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47067076  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47067077 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 47067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 45690096 - 45690282
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45690096 gggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45690195  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45690196 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaccctt 45690282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 23393051 - 23393232
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23393051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23393150  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23393151 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 23393232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 49171362 - 49171543
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49171362 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 49171461  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49171462 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 49171543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27018299 - 27018115
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27018299 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27018200  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018199 cttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 27018115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45482841 - 45482657
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45482841 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaactat 45482742  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45482741 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45482657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 2341661 - 2341848
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtaccc-atggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2341661 ggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaacta 2341760  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2341761 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 2341848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 35328069 - 35328252
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35328069 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35328168  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35328169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 35328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 20165814 - 20165995
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20165814 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 20165913  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20165914 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 20165995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33411443 - 33411259
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33411443 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33411344  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33411343 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacct 33411259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40670746 - 40670563
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40670746 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40670647  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670646 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40670563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 48609677 - 48609863
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  48609677 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaattat 48609776  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609777 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 48609863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 26579717 - 26579900
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26579717 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaactat 26579816  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26579817 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 26579900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31587031 - 31586848
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31587031 ggtgagaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31586932  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586931 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31586848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 37846016 - 37846199
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  37846016 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaattat 37846115  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37846116 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 37846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10028673 - 10028488
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggta--cccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10028673 ggtgacaactagggtatacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaact 10028574  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10028573 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 10028488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19563635 - 19563445
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19563635 tttttggtgacaattagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccttaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatga 19563536  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19563535 actatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 19563445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33332971 - 33332786
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  33332971 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 33332873  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332872 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 33332786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36389539 - 36389377
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36389539 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 36389440  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttc 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36389439 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 36389377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5712351 - 5712166
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5712351 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 5712252  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5712251 cttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 5712166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15877724 - 15877553
Alignment:
Q  39 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15877724 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 15877625  T
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15877624 accaacaaattgctcattttcatttgttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 15877553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 5183825 - 5183991
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5183825 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 5183924  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaag 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5183925 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaag 5183991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 35757020 - 35757203
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35757020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc-atgaacta 35757118  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35757119 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaattatccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaacc 35757203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35767657 - 35767481
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35767657 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 35767558  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35767557 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattg--ggg-----tacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 35767481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 45063357 - 45063541
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45063357 ggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctcaac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45063454  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063455 cttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 45063541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31625886 - 31625706
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31625886 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactccaaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31625788  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31625787 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaa 31625706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43499668 - 43499484
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43499668 ggtgagaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 43499569  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43499568 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 43499484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 31429475 - 31429658
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31429475 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgagtaatttacttcaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtactat 31429574  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31429575 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatcacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 31429658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33870424 - 33870244
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  33870424 gtgacaactagagtacccat---agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatc 33870328  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33870327 ttgaccccaccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtgatctagaaaaaacct 33870244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 41990870 - 41991039
Alignment:
Q  42 ggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaacc 141  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  41990870 ggtacccatggaagaatggtgagtaatttatccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccacc 41990969  T
Q  142 aacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41990970 aacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 41991039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10618481 - 10618290
Alignment:
Q  23 agttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccat 122  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  10618481 agttttaggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcat 10618382  T
Q  123 gaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtttt 221  Q
    |||||||       | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10618381 gaactat-------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaaccatagtttt 10618290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29447020 - 29446863
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29447020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-actccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29446922  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcatt 188  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  29446921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 29446863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 30076527 - 30076658
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30076527 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgccaactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 30076626  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcat 161  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30076627 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcat 30076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 33720070 - 33720220
Alignment:
Q  64 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  33720070 gtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattg 33720169  T
Q  164 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33720170 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacct 33720220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 35752034 - 35752206
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  35752034 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 35752122  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35752123 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35752206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Original strand, 28233936 - 28234068
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28233936 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28234035  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcatt 162  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234036 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcatt 28234068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43489390 - 43489218
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  43489390 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 43489302  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43489301 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacc 43489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 46817415 - 46817595
Alignment:
Q  24 gttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatg 123  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||    
T  46817415 gttttaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catg 46817503  T
Q  124 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46817504 aactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 46817595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 36816845 - 36817018
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  36816845 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36816933  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36816934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 36817018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 24923024 - 24923196
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||| |||    
T  24923024 ggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaattat 24923112  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24923113 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 24923196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37128109 - 37127939
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||           |||||||||    
T  37128109 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatattt-----------atgaactat 37128021  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  37128020 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaa 37127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48086030 - 48085858
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  48086030 ggtgataattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 48085942  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48085941 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 48085858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 7876328 - 7876501
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||| ||||||||||    
T  7876328 ggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtac-----------atattcatgaactat 7876416  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7876417 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaacaacct 7876501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24228713 - 24228540
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||    
T  24228713 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 24228625  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24228624 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 24228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 46898016 - 46898189
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  46898016 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 46898104  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
     ||||||| | ||| ||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46898105 tttgaccccatcaataaattgctcatatttattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 46898189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21718288 - 21718117
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  21718288 ggtgacaactaggctacccatgaaa-aataatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 21718201  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||    
T  21718200 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccgttattcaaaggtaatttagaaaaaacc 21718117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29610807 - 29610635
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29610807 ggtggcaactatgctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29610719  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29610718 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 29610635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 213
Target Start/End: Original strand, 26941541 - 26941704
Alignment:
Q  39 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 138  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||     
T  26941541 taggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgacccc 26941629  T
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26941630 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttataaaaaacc 26941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 25037516 - 25037682
Alignment:
Q  38 ctagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccc 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||    
T  25037516 ctaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaatcaatacacatcagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccc 25037604  T
Q  138 aaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
     ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25037605 caccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25037682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44405531 - 44405412
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44405531 ggtgacaactagaatacccatggaagaatggtaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 44405432  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaatt 149  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  44405431 cttgaccctaccaataaatt 44405412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44564497 - 44564356
Alignment:
Q  54 agaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctc 153  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || || ||||||||     
T  44564497 agaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattgctt 44564398  T
Q  154 attttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaa 195  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44564397 atttttattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 44564356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41904388 - 41904272
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41904388 ggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41904289  T
Q  130 cttgacccaaccaacaa 146  Q
    |||||||  ||||||||    
T  41904288 cttgacctcaccaacaa 41904272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26371221 - 26371051
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||    
T  26371221 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcac-----------atattcatgaactat 26371133  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
     ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  26371132 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattcttcaaagataatttaaaaaaaa 26371051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 45502817 - 45502987
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||               
T  45502817 gtgacaactaaggtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatggtatc----------- 45502905  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45502906 ttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattactcaccattcttcaaagttaatctagaaaaaac 45502987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33393499 - 33393328
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||           |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  33393499 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattaacc-----------tttttaggtggtatccataaactatc 33393411  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  33393410 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccactattttttaaaggtaatctagaaaaaacc 33393328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 44003370 - 44003545
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  44003370 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 44003458  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44003459 cttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 44003545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 45237533 - 45237703
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           |||||| |||    
T  45237533 ggtgacaactaagctacccataaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaattat 45237621  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||  || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45237622 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacctatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 45237703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7257553 - 7257380
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||           ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  7257553 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataatcatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 7257465  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7257464 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcgaaggtaatctagaaaaaacct 7257380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 498188 - 498360
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  498188 ggtggcaactaggctagccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 498276  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  498277 cttgaccccacaaataaattactcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttataaaaaacc 498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2332191 - 2332019
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2332191 ggtgacaacttgggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaatacacagtaaccacataagcac-----------atattcatgaactat 2332103  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  2332102 cttgatcccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaagataatttagaaaaaacc 2332019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35484807 - 35484633
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  35484807 tgacaattaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaataatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatct 35484719  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaa-ttacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35484718 tgaccccataaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatttacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacctta 35484633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 39453484 - 39453647
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||                  ||||||||    
T  39453484 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccattacacattagtcacataaacacat------------------aactatct 39453565  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39453566 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39453647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 47906758 - 47906931
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaattt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  47906758 ggtggcaactaggctatccatgaaaaaatgatgggtaattttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 47906846  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47906847 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47906931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Original strand, 16482847 - 16482956
Alignment:
Q  105 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 204  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16482847 tttttaggtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 16482946  T
Q  205 gaaaaaacct 214  Q
    ||||||||||    
T  16482947 gaaaaaacct 16482956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29098915 - 29098752
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||               |||||||||||||    
T  29098915 acaactaggctatccatgaaaaaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatat---------------atgaactatcttg 29098831  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29098830 accccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaac 29098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 32556640 - 32556779
Alignment:
Q  64 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||    
T  32556640 gtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattg 32556728  T
Q  164 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32556729 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 32556779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44660015 - 44659843
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||    
T  44660015 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatggataatttactccaaccgatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 44659927  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44659926 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaatta-ccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44659843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39866763 - 39866667
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39866763 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 39866667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41855228 - 41855061
Alignment:
Q  34 acaactagg-gtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||           |||||||||||    
T  41855228 acaactaggagtatccatggaagaatgatgggtaatttatccaaactaatacacattagccacataagcatatattta-----------tgaactatctt 41855140  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||| | ||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  41855139 gactccaccaataaattgctcacattcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 41855061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46103291 - 46103127
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||     
T  46103291 gtgacaactagactacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaactaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatt 46103203  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 207  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  46103202 ttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggt-ggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaa 46103127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 15643948 - 15644120
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  15643948 tgacaactagtgtacccatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactattt 15644036  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15644037 tgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatctagaaaaaacctt 15644120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39323779 - 39323616
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                   | ||||||||||    
T  39323779 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacata-------------------ttcatgaactat 39323700  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39323699 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 39323616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 47460772 - 47460942
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  47460772 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 47460860  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| ||||||    
T  47460861 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattatccaccattttttaaaagtaatctaaaaaaaa 47460942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 38448508 - 38448608
Alignment:
Q  101 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  38448508 cacatttttaggtgatattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattatccacaatttttcaaaggtaa 38448607  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  38448608 t 38448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33455194 - 33455098
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33455194 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcataggtaatttagaaaaaa 33455098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29863112 - 29863017
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29863112 tatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaa 29863017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077108
Alignment:
Q  148 ttgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 30077108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Original strand, 7720578 - 7720674
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7720578 tatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcaagaaaaaac 7720674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35557798 - 35557730
Alignment:
Q  145 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  35557798 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtattctaaaaaaaacc 35557730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Original strand, 21649442 - 21649552
Alignment:
Q  105 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatca-ttcttcaaaggtaatct 203  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |  | || || ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21649442 tttttaggtggtatccataaactatcttaaatctactaataaattgctcattttcattggttaataagtaaattacccatcattttttcaaaggtaatct 21649541  T
Q  204 agaaaaaacct 214  Q
    | |||||||||    
T  21649542 aaaaaaaacct 21649552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 37443602 - 37443734
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| |||| || ||||||    
T  37443602 ggtgacaactagggtacccataaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatctataaactat 37443690  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggt 173  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  37443691 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggt 37443734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 42272244 - 42272180
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccac 95  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42272244 ggtgacaactagggtatc-atggaagaattatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccac 42272180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35823353 - 35823289
Alignment:
Q  150 gctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35823353 gctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacct 35823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 33455259 - 33455201
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 88  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33455259 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgatggacaatttacccaaaccaatacacat 33455201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 39866806 - 39866762
Alignment:
Q  44 tacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 88  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39866806 tacccatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacat 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26456202 - 26456159
Alignment:
Q  120 catgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  26456202 catgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattg 26456159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42272188 - 42272149
Alignment:
Q  176 attacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42272188 attagccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 42272149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24253564 - 24253378
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24253564 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24253465  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253464 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24253378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 43262183 - 43262369
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43262183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43262282  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43262283 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctta 43262369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 27501055 - 27501241
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27501055 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaacaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27501154  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27501155 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 27501241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 43326378 - 43326564
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43326378 gggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaacta 43326477  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326478 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 739699 - 739889
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  739699 ttttaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatga 739798  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739799 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 739889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6901984 - 6901796
Alignment:
Q  27 ttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6901984 ttggatgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaac 6901885  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6901884 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 6901796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398663
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 15398582  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15398583 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 15398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35626220 - 35626037
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35626220 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35626121  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35626120 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35626037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 3466681 - 3466865
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3466681 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 3466780  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5185155 - 5184971
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5185155 gggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 5185056  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185055 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7722231 - 7722047
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7722231 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7722132  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7722131 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 7722047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12648984 - 12648797
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12648984 ttttgggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 12648885  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12648884 actatcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaac 12648797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27939081 - 27938894
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggta-cccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27939081 gggtgacaactagggtaacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 27938982  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27938981 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaacctt 27938894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39932761 - 39932578
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932761 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39932662  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39932661 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 39932578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 40886028 - 40886210
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40886028 ggtgaaaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 40886126  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886127 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40886210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15683973 - 15683791
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15683973 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 15683874  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683873 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacacatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 15683791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 18479668 - 18479849
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18479668 ggtgactactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18479767  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18479768 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 18479849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25831702 - 25831517
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25831702 ggtgacaaataaggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaactat 25831603  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831602 -ttgaccccaccaacaaattgcttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 25831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 2484292 - 2484473
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2484292 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaactat 2484391  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2484392 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 2484473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278660
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa----c 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    |    
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattatc 27278573  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27278574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27278660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 28424795 - 28424977
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28424795 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 28424894  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28424895 cttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattacccactatccttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28424977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5137897 - 5137713
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5137897 ggtgacaactagggtattaatggaagaatggtggataatttactcaaatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 5137798  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137797 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 5137713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31939079 - 31938892
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31939079 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 31938980  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagt 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  31938979 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaat-aaaaaaaaaccttagt 31938892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 40278858 - 40279043
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40278858 ggtgacaactagggtattcatggaagaatgatgggtaatttatctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 40278957  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40278958 gttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat-taaaaaaaacctta 40279043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Original strand, 29789295 - 29789440
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 29789394  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaa 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29789395 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 891087 - 890902
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  891087 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 890989  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  890988 cttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 890902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 13504742 - 13504922
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13504742 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatcccaactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13504841  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  13504842 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcgatggtaatctagaaaaa 13504922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 38756487 - 38756662
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatgg-aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38756487 ggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctcaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 38756586  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 204  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38756587 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 38756662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 763905 - 763723
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  763905 ggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttaccccaactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaactat 763806  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||| || | ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  763805 cttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaac 763723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40110413 - 40110230
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| | | |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40110413 tgacaattaggatactcatggaagaatggtagataatttaccctaactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 40110314  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40110313 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatatagaaaaaacctta 40110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34451432 - 34451299
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34451432 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34451333  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34451332 attgaccccaccaataaattgctcattttcattg 34451299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19295901 - 19295726
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  19295901 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atatacatgaactat 19295813  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19295812 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 19295726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27503550 - 27503376
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  27503550 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27503462  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27503461 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27503376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33617756 - 33617584
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  33617756 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 33617668  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33617667 cttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 38015514 - 38015684
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  38015514 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 38015602  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38015603 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 38015684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 23195248 - 23195420
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  23195248 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 23195336  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23195337 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 23195420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 9424593 - 9424764
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||||||    
T  9424593 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatc 9424681  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9424682 ttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9424764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4149847 - 4149691
Alignment:
Q  49 atggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaat 148  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          | |||| ||||||||||    
T  4149847 atggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca----------taaccccaccaacaaat 4149758  T
Q  149 tgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4149757 tgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctt 4149691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5497444 - 5497271
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  5497444 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 5497356  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
     ||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5497355 tttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacct 5497271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13957841 - 13957668
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||           ||||||||||    
T  13957841 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcgcatatt-----------catgaactat 13957753  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13957752 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 13957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 42658671 - 42658836
Alignment:
Q  39 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 138  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||||||||||     
T  42658671 taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgacccc 42658759  T
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42658760 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattttgaaaaaacctt 42658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6973234 - 6973063
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  6973234 ggtgtcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 6973146  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6973145 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 6973063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 31293989 - 31294170
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||     
T  31293989 ggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactccaaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggactac 31294088  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |  ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31294089 ccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 31294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 9374502 - 9374672
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||           ||||||||||    
T  9374502 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacctaaacacatatt-----------catgaactat 9374590  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  9374591 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 9374672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 36365445 - 36365617
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  36365445 ggtggcaactagactatccatgaaagaatgatggctaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36365533  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36365534 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36365617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40632634 - 40632498
Alignment:
Q  68 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40632634 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacc---------ggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttg 40632544  T
Q  168 atgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40632543 gtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40632498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14972149 - 14971979
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||| ||||||    
T  14972149 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaactat 14972061  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  14972060 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatttaaaaaaaa 14971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 3656568 - 3656710
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  3656568 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 3656656  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccca 183  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3656657 cttgaccccaaaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccca 3656710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 12558090 - 12558204
Alignment:
Q  101 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12558090 cacatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 12558188  T
Q  201 tctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  12558189 tctagaaaaaacctta 12558204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2585634 - 2585461
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||  ||||||  || ||||||| |||||    
T  2585634 gggtgacaattagggtatccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------caactttttagatggtatccataaacta 2585546  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2585545 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 24167784 - 24167956
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  24167784 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgttgagtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 24167872  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24167873 cttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24167956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6207032 - 6206883
Alignment:
Q  53 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgct 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||| |||||||  | || ||||||||    
T  6207032 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactattttgaccccccaaataaattgct 6206944  T
Q  153 cattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  6206943 cattttaattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaagtaatttaaaaaaaacc 6206883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38492783 - 38492647
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||    
T  38492783 ggtggcaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcac-----------atattcatgaactat 38492696  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatt 178  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38492695 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 38637910 - 38638083
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||           ||| ||||||  || ||||||| ||||||    
T  38637910 ggtgacaactagggtacccatggaaaaattgtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttagttggtatccataaactat 38637998  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38637999 cttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 38638083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 42247856 - 42247955
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42247856 atattcataaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 42247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 1402505 - 1402678
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||           ||| |||||  ||| ||||||| ||||||    
T  1402505 ggtgataactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttgggtggtatccataaactat 1402593  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1402594 cttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 1402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 18327173 - 18327346
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18327173 ggtgataactaaggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 18327261  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18327262 cttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 18327346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 36472348 - 36472458
Alignment:
Q  105 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 204  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36472348 ttttaaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 36472447  T
Q  205 gaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||    
T  36472448 gaaaaaacctt 36472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27390768 - 27390596
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27390768 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27390680  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27390679 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaactatccaccatttttcaaaggtaatctaaaaataacc 27390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5120132 - 5120036
Alignment:
Q  104 atttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5120132 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcatcaaaggtaat 5120036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 179
Target Start/End: Original strand, 36948492 - 36948626
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  36948492 tgacagctagggtactcatgcaagaatggtgggtaatttacccta-ccaatacacattagccacataagcac-----------atatccatgaactatct 36948579  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatta 179  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36948580 t-accctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 36948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 33623940 - 33624105
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||| ||||||| |||     
T  33623940 gtgacaattagggtatccattgaaaaatggtggataatttaccccaaccgatacacattagccacataagcac-----------atacccatgaattatt 33624028  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 207  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||    
T  33624029 ttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatctaccattattcaaaggtaatttagaa 33624105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40687069 - 40686900
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| ||||||  || ||| ||| ||||||    
T  40687069 ggtgacaattagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cac-tttttagatggtattcataaactat 40686982  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  40686981 cttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttctcaaaggtaatctagaaaaaa 40686900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 102
Target Start/End: Original strand, 612757 - 612830
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttac-cccaaccaatacacattagccacataagca 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  612757 ggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagca 612830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Original strand, 9171111 - 9171193
Alignment:
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 209  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9171111 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcatttgttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaa 9171193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 211
Target Start/End: Original strand, 9527124 - 9527190
Alignment:
Q  145 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527124 aaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 9527190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 15300977 - 15301033
Alignment:
Q  145 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15300977 aaattgctcattttcattggttgatgtgtaaattaccaatcattcttcaaaggtaat 15301033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Original strand, 42247786 - 42247849
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 88  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42247786 ttttaggtgtcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacat 42247849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 93
Target Start/End: Original strand, 3940331 - 3940399
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc 93  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3940331 ttttcggtgacaactaaggtatctatggaagaatgatgagtaatttattcgaaccaatacacattagcc 3940399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Original strand, 3940411 - 3940478
Alignment:
Q  121 atgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcatt 188  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  3940411 atgaattatcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattacccaccatt 3940478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Original strand, 9171035 - 9171108
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca 104  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  9171035 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacaagtaatttaccc-aatcaatacacattaaccacataagcaca 9171108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21786032 - 21785995
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21786032 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgataggtaa 21785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 33316320 - 33316387
Alignment:
Q  142 aacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||    
T  33316320 aacaaattgcttattttcattggttgataagtaaattacttgtcattctttaaaagtaatctagaaaa 33316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Original strand, 612830 - 612897
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccca 183  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  612830 atatcaataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttca-tggttggtggttaaattaccca 612897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3623825 - 3623793
Alignment:
Q  218 ttttgatattcttcacgtaaataattccattta 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3623825 ttttgatattcttcacgtaaataagtccattta 3623793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28756138 - 28756082
Alignment:
Q  152 tcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaa 208  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  28756138 tcattttcattgcttggtgggtaaattatccacctttctttaaaggtgatctagaaa 28756082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 123)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 31532135 - 31532321
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31532135 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31532234  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 31532321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34276729 - 34276547
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34276729 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34276630  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34276629 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 34276547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 21366609 - 21366794
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366609 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21366708  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21366709 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 21366794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 237659 - 237475
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  237659 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 237560  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  237559 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23437774 - 23437590
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23437774 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23437675  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 23437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42085396 - 42085204
Alignment:
Q  23 agttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccat 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42085396 agttttaggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 42085297  T
Q  123 gaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085296 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 42085204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9798647 - 9798464
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9798647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 9798548  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9798547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 9798464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 18462013 - 18462195
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462013 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 18462112  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462113 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 18462195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6020109 - 6019929
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6020109 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatt 6020010  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6020009 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 6019929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39077727 - 39077543
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39077727 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 39077628  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077627 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 39077543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 32366661 - 32366844
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32366661 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 32366760  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32366761 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 32366844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 53854430 - 53854612
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53854430 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53854528  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854529 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53854612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 41632007 - 41632192
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41632007 ggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaactat 41632106  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632107 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 41632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44984943 - 44984757
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44984943 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44984844  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  44984843 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaccctta 44984757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51363188 - 51363003
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51363188 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 51363090  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363089 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51363003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 2826682 - 2826866
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2826682 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 2826780  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2826781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggaatctagaaaaaacctt 2826866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 53461816 - 53462001
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53461816 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53461915  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53461916 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 53462001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 54574940 - 54575125
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54574940 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 54575039  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  54575040 cttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttctaagataatctagaaaaaacctt 54575125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 19387688 - 19387872
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19387688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 19387787  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19387788 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaacgtaatctagaaaaaacct 19387872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 41702461 - 41702644
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41702461 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 41702560  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702561 taaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41702644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 26091258 - 26091444
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26091258 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 26091357  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  26091358 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttccaagataatttagaaaaaacctta 26091444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3170808 - 3170623
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3170808 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 3170709  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170708 cttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 3170623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29478542 - 29478357
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29478542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 29478443  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478442 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29478357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47344838 - 47344653
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47344838 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 47344739  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344738 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47344653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31914379 - 31914196
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31914379 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31914281  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31914280 cttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 31914196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45797661 - 45797477
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45797661 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 45797562  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45797561 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 45797477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 31972336 - 31972515
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31972336 ggtgacaattagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 31972435  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31972436 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaa 31972515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 42765842 - 42766024
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42765842 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtat-catgaactat 42765940  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42765941 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 42766024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 43471695 - 43471878
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43471695 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaactat 43471794  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471795 cttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54608144 - 54607961
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54608144 ggtgactactagggtatccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaactat 54608045  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54608044 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 54607961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 55056259 - 55056442
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55056259 ggtgacaacaagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaactat 55056358  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55056359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55056442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 146429 - 146611
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146429 ggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 146528  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  146529 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41949566 - 41949381
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacata--agcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41949566 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41949467  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949466 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 41949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 397582 - 397401
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  397582 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatct 397483  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  397482 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 397401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 22618514 - 22618693
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22618514 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22618612  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22618613 cttgaccca-ccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22618693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 50457812 - 50457993
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50457812 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctcaaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 50457911  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457912 tgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 50457993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55776226 - 55776043
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55776226 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55776127  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55776126 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55840404 - 55840221
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55840404 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55840305  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55840304 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55840221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 407934 - 407753
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  407934 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 407837  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  407836 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 407753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6285486 - 6285307
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6285486 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatttt 6285387  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6285386 gaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaac 6285307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23609269 - 23609086
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23609269 ggtgacaaatagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaactat 23609170  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23609169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttgattggtgggtaaattacccactattcttcaaagataatctagaaaaaacc 23609086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27373257 - 27373075
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27373257 ggtgacaattagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 27373159  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27373158 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 27373075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 56022998 - 56023181
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56022998 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 56023097  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023098 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 56023181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50534809 - 50534632
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50534809 acaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 50534710  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50534709 accccaccaataaattgctcatttttattgattggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 50534632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2243640 - 2243457
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2243640 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactccaactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatgaactat 2243541  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243540 cttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2243457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 29777257 - 29777440
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29777257 ggtgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaactat 29777356  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777357 ctcgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 29777440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41560510 - 41560327
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41560510 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41560411  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41560410 cttgatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 41560327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 49881059 - 49881247
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaattta----ccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49881059 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaa 49881158  T
Q  126 ctatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49881159 ctatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49881247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35446683 - 35446506
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446683 acaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35446584  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35446583 accccatcaacaaattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattacccaccattcttaaaaggtaatctagaaaaaac 35446506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42222473 - 42222292
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42222473 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgtgtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaactat 42222374  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42222373 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50234182 - 50233997
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50234182 ggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaactat 50234083  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50234082 cttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 50233997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54086590 - 54086407
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  54086590 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaactat 54086491  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54086490 cttgaccc-accaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaa-gtaatctagaaaaaacctt 54086407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 54805608 - 54805810
Alignment:
Q  24 gttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataag----cacatttttaagtgatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||    
T  54805608 gttttgggtgacatctagggtacccatggaacaatgatgagtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatc 54805707  T
Q  120 catgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtt 219  Q
     |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54805708 tatgaactatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttggtt 54805807  T
Q  220 ttg 222  Q
    |||    
T  54805808 ttg 54805810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Original strand, 53834055 - 53834235
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834055 gtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacttcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 53834154  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834155 ttgaccgcaccaacaaattgctcattttcattgattgttgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaa 53834235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 3692210 - 3692393
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  3692210 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaataaactat 3692309  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3692310 cttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacc 3692393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 31070074 - 31070256
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31070074 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtat-catgaactat 31070172  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070173 cttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31070256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55520009 - 55519826
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55520009 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55519910  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55519909 cttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 55519826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38591846 - 38591667
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||    
T  38591846 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaactat 38591751  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38591750 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 38591667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 47662102 - 47662288
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47662102 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccattaactat 47662201  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
     ||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47662202 attgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47662288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42033357 - 42033172
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42033357 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42033258  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42033257 cttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 42033172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48313737 - 48313556
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48313737 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 48313639  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313638 cttgaccca-ccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 48313556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 14017376 - 14017558
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  14017376 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaactat 14017473  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017474 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 14017558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1932945 - 1932762
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1932945 ggtgataactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 1932846  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932845 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacctactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 216
Target Start/End: Original strand, 50536623 - 50536810
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  50536623 gggtaacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatccattaacta 50536722  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50536723 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcatcggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 50536810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 39587796 - 39587962
Alignment:
Q  47 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39587796 ccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 39587895  T
Q  147 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587896 attgctcatattcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39587962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48658000 - 48657826
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48658000 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48657901  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||      ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  48657900 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtggg------acccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaa 48657826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54425163 - 54424980
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  54425163 ggtgacaactagtgtacc-atggaagaatcgtgggtaatttaccccaaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 54425065  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  54425064 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcatagggaatctagataaaacct 54424980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51951861 - 51951676
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51951861 tgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacac-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatct 51951763  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagt 218  Q
    |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51951762 tgactccattaacaaattgttcattttcattgattggtggataaattactcatcattcttcaaaagtaatctagaaaaaatcttagt 51951676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Original strand, 22468788 - 22468951
Alignment:
Q  48 catggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaa 147  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  22468788 catggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaaa 22468887  T
Q  148 ttgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22468888 ttgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22468951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 33897504 - 33897680
Alignment:
Q  39 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 138  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33897504 tagggtacctatagaagaatggtgggtaatttattccaattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 33897603  T
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33897604 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta-aaaaaacctta 33897680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 36532830 - 36533003
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36532830 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36532929  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||          ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36532930 cttgaccccaccaacaaattgctc----------attgtggtgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36533003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 45633779 - 45633953
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  45633779 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 45633867  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45633868 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacctt 45633953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 15060289 - 15060461
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  15060289 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 15060377  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15060378 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 15060461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 48259512 - 48259691
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  48259512 ggtgataagtagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaactat 48259609  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48259610 cttgactccaccaactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaa 48259691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48655002 - 48654815
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat------tagccacataagcacatttttaagtgatatccatg 123  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  48655002 ggtgacaattagggtagccatggaagaatggtaggtaatttaccccaaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatc 48654903  T
Q  124 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48654902 aactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 48654815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Original strand, 52728306 - 52728448
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  52728306 gggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 52728404  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatggg 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52728405 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 52728448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 9997931 - 9998103
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  9997931 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 9998019  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9998020 cttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9998103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 37239090 - 37239265
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  37239090 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 37239178  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37239179 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37239265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22620764 - 22620590
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  22620764 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 22620676  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22620675 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaagataatttagaaaaaacctt 22620590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 5117438 - 5117609
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  5117438 ggtgacaactagactatccattaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 5117526  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5117527 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 5117609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47812077 - 47811906
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  47812077 ggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47811989  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47811988 cttgactcaatcaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 47811906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34552495 - 34552318
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||           |||| |||||    
T  34552495 tttttggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccgcataagcac-----------atattcatga 34552407  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34552406 actatcttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 34552318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 46708741 - 46708913
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  46708741 ggtgacaactaggctatcaatgaaagaatgatgggtgatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 46708829  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46708830 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaataacc 46708913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52688520 - 52688348
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| ||||||||||    
T  52688520 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------tatattcatgaactat 52688432  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
     |||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52688431 tttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 52688348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54715206 - 54715035
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  54715206 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaactaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 54715118  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54715117 gttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 54715035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 20351842 - 20352012
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  20351842 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 20351930  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||| || || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20351931 cttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 20352012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43891099 - 43890929
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  43891099 ggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 43891011  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
     ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  43891010 attgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 43890929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 27873550 - 27873720
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  27873550 ggtgacaactaggctacccaa--aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27873636  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27873637 cttaaccccacaaataaattactcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 27873720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54216482 - 54216309
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  54216482 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatcgataatttaccccaaccaatacacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 54216394  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54216393 tgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 54216309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 31881314 - 31881486
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31881314 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31881402  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31881403 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 31881486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35595869 - 35595772
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35595869 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 4486581 - 4486753
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||    
T  4486581 ggtgacaactagactatctatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaattat 4486669  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  4486670 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccgttcttcaaagataatttagaaaaaacc 4486753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49014269 - 49014094
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||           ||||||||||    
T  49014269 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagtacatatt-----------catgaactat 49014181  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  49014180 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtgatttaaaaaaaacctta 49014094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34835348 - 34835174
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| ||||||  || ||| ||| ||||||    
T  34835348 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttagatggtattcataaactat 34835260  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34835259 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 34835174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 54216736 - 54216909
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54216736 ggtgataactagggtatccatggaagaatggagggtaatttatcccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactat 54216824  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54216825 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 54216909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33289873 - 33289702
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| ||||||||||    
T  33289873 ggtgacaa-taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactat 33289786  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33289785 cttgatcctacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33289702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 38547601 - 38547773
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  38547601 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 38547689  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38547690 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 38547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42509483 - 42509351
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42509483 tttttggtgataactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcctaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatga 42509384  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattt 157  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  42509383 actattttgaccccaccaataaattggtcattt 42509351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52461534 - 52461365
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  52461534 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 52461446  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||||||    
T  52461445 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacacca---ttcaaaggtaatttagaaaaaacc 52461365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 3293097 - 3293198
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3293097 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3293196  T
Q  215 ta 216  Q
    ||    
T  3293197 ta 3293198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 27398607 - 27398775
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||            ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27398607 acaactagggtaccaatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattt-----------acatttttaagtggtatccataaactatcttg 27398695  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27398696 accccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacc 27398775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46720195 - 46720024
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||       |||  ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  46720195 acaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacat-------atat-cacctttttaggtggtatccataaactatcttg 46720104  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||| | ||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46720103 accccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagttaatctagaaaaaacc 46720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33049062 - 33048990
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049062 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac 33048990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 1662261 - 1662431
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||             |  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1662261 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatgaacat-------------atctttttaggtggtatccataaactat 1662347  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1662348 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1662431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 14335101 - 14335271
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||   ||||           ||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  14335101 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaaacaatgagcatt-----------cacctttttaggtggtatctatgaactat 14335189  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14335190 cttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 14335271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27580290 - 27580120
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27580290 ggtgacaaataagatacccatggaaaaatgatggataatttaccccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 27580202  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27580201 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 27580120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 52396865 - 52396775
Alignment:
Q  74 ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc-ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52396865 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattg 52396775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataatttacca-aaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactatc 35344870  T
Q  131 tt 132  Q
    ||    
T  35344869 tt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 11972203 - 11972304
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11972203 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 11972302  T
Q  215 ta 216  Q
    ||    
T  11972303 ta 11972304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Original strand, 33557960 - 33558112
Alignment:
Q  48 catggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaa 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||           |||||||||||||||||| || || |||    
T  33557960 catgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaatacatatt-----------catgaactatcttgaccctacaaataaa 33558048  T
Q  148 ttgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  33558049 ttcctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaa 33558112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43231598 - 43231502
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43231598 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattacccaccattcttcaaa-gtaatctagaaaaaacc 43231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 6371249 - 6371420
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| || || | || |||    
T  6371249 ggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccctaaattat 6371337  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6371338 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 6371420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42557666 - 42557583
Alignment:
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42557666 atcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42557583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 573974 - 573802
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  573974 ggtgacaactagtgtactcatggaaaaatagtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 573886  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  573885 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattacccaccattttttaaaggtaatctagaaacaacc 573802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Original strand, 48259704 - 48259780
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacattt 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48259704 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacatattagccacataagcacattt 48259780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 51981479 - 51981554
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 105  Q
    ||||| ||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981479 ggtgataactagtctaccaatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 51981554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Original strand, 3291805 - 3291873
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 98  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3291805 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 3291873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27872750 - 27872612
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27872750 ggtgacaactacggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27872662  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatta 179  Q
    ||||| || || || |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  27872661 cttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaatta 27872612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 18206512 - 18206682
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||   |||||    |   ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18206512 ggtgacaactaaggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatttcaaccaatgaacatt---cacatttttaa--ttttaggtggtatccatgaactat 18206606  T
Q  130 ----cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 201  Q
        |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18206607 atatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaat 18206682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42558367 - 42558270
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42558367 ggtgacaactaagatacccatggaagaatggtggataatttaccctaatcaatacacattagcc--------acatttttaagtggtatctatgaactat 42558276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 214
Target Start/End: Original strand, 17555625 - 17555670
Alignment:
Q  169 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555625 tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 17555670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 211
Target Start/End: Original strand, 49057933 - 49058038
Alignment:
Q  106 ttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctag 205  Q
    |||||| || |||| ||||||||| || |||  | ||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  49057933 ttttaaatggtatctatgaactattttaacctcatcaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctag 49058032  T
Q  206 aaaaaa 211  Q
    ||||||    
T  49058033 aaaaaa 49058038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43478147 - 43478059
Alignment:
Q  124 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||    
T  43478147 aactatcttgaccacactaataaattgctcattt-cattggttgatcgataaattacccatggttctttgaaagtaatctagaaaaaacc 43478059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 32984077 - 32984262
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32984077 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 32984176  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984177 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32984262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41862404 - 41862218
Alignment:
Q  28 tgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862404 tgggtgacaattaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 41862305  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862304 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41862218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 24079901 - 24080084
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24079901 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24080000  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24080001 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctacaaaaaacc 24080084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37956603 - 37956420
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37956603 ggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37956504  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956503 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37956420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 9303574 - 9303756
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9303574 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 9303673  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9303674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaac 9303756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43328889 - 43328706
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43328889 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43328790  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328789 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5946229 - 5946043
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5946229 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5946130  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946129 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 5946043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 40435153 - 40435335
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40435153 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40435252  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435253 cttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 40435335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10646305 - 10646124
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10646305 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaactat 10646206  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10646205 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 10646124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 33730641 - 33730824
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33730641 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33730740  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33730741 cttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 33730824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9734435 - 9734255
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9734435 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 9734338  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734337 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9734255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 13356120 - 13356306
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13356120 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 13356219  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13356220 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacctttcttcaaatgtaatctaaaaaaaacctta 13356306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Original strand, 31830959 - 31831136
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31830959 acaactagggtacccatggaagaatggtaggtaatttacccaaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 31831058  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31831059 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 31831136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41654077 - 41653892
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41654077 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 41653978  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653977 tttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41653892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6366168 - 6365985
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6366168 ggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6366069  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366068 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 6365985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 33981663 - 33981846
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33981663 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33981762  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33981763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacc 33981846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 17718722 - 17718908
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17718722 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17718821  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17718822 cttgaccccatcaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatctta 17718908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 37301326 - 37301508
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  37301326 gtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatt 37301425  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301426 ttggccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37301508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37420122 - 37419936
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37420122 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccttaatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 37420023  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37420022 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37419936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2714730 - 2714550
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2714730 ggtgacaactaaagtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2714632  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2714631 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2714550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 45236565 - 45236749
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45236565 ggtgacaactaggatacccataaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45236664  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236665 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45236749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32114429 - 32114254
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32114429 tgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 32114330  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32114329 tgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 32114254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2276094 - 2275913
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2276094 ggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 2275996  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275995 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 2275913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25186081 - 25185897
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25186081 ggtgacgattagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 25185982  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25185981 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaatacct 25185897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41232128 - 41231945
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41232128 ggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41232029  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41232028 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 41231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9013865 - 9013684
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9013865 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 9013767  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013766 cttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9013684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35628961 - 35628776
Alignment:
Q  28 tgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  35628961 tgggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattcttgaact 35628862  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35628861 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctaaaaaaaacc 35628776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 13760646 - 13760831
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtac--ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13760646 ggtgacaactagggtacacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaact 13760745  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13760746 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcttgaaaaaacc 13760831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 45066592 - 45066774
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45066592 ggtgagaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttattataatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45066691  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45066692 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccattattcttcaaaggtaatctataaaaaac 45066774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22878572 - 22878389
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22878572 gtgacaactagggtacccatagaagaattgtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 22878473  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||   | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878472 ttgaccccaacaaaaaattgatcattttcattggaaggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22878389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25248216 - 25248036
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25248216 gggtgacaattagggtatccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaacta 25248117  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248116 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttt------ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25248036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Original strand, 44088446 - 44088624
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44088446 gacaattagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 44088545  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088546 gatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgagtaaattattcatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 44088624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 29048426 - 29048587
Alignment:
Q  53 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgct 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29048426 aagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 29048525  T
Q  153 cattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29048526 cattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 29048587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41640095 - 41639911
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41640095 gtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatc 41639996  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639995 ttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattactcatcattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 41639911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12033112 - 12032986
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12033112 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12033013  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcatt 156  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12033012 cttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45258691 - 45258510
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45258691 ggtgataactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 45258593  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45258592 cttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattaccgaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaac 45258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3904258 - 3904126
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3904258 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 3904160  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3904159 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41981650 - 41981534
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41981650 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41981551  T
Q  130 cttgacccaaccaacaa 146  Q
    |||||||| ||||||||    
T  41981550 cttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 4447295 - 4447467
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  4447295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 4447383  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4447384 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 4447467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10378483 - 10378304
Alignment:
Q  27 ttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           |||||||    
T  10378483 ttgggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaac 10378395  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttag 217  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10378394 tatcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttag 10378304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 42701301 - 42701471
Alignment:
Q  42 ggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacattttt---aagtgatatccatgaactatcttgaccca 138  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  42701301 ggtacccatggaaggatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcaca--agcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgacccc 42701398  T
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42701399 actaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 42701471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31940485 - 31940314
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31940485 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31940398  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31940397 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 31940314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 117329 - 117504
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  117329 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 117417  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  117418 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaatctta 117504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41843424 - 41843252
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  41843424 ggtgataactaagctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 41843336  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    || ||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41843335 ctggaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41843252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9713857 - 9713688
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  9713857 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 9713769  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9713768 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattg---gttgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9713688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31336276 - 31336163
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31336276 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgccccaaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 31336177  T
Q  130 cttgacccaaccaa 143  Q
    |||||||| |||||    
T  31336176 cttgaccccaccaa 31336163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3211376 - 3211207
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  3211376 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaacgaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 3211288  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  3211287 cttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatttagaaaaaa 3211207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2379311 - 2379138
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2379311 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcac-----------atattcatgaactat 2379223  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
     |||| || || || |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2379222 tttgatcccacaaataaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 2379138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 40458772 - 40458943
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||           ||||||||||    
T  40458772 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacaaaaacacatatt-----------catgaactat 40458860  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  40458861 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattgagaaaaaac 40458943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Original strand, 40649837 - 40649990
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| ||| ||||     
T  40649837 aactaggctacccatgaaagaatgatgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaattattttgat 40649925  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40649926 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattctttaaaggtaa 40649990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Original strand, 4975412 - 4975576
Alignment:
Q  35 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 134  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  4975412 caactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccatataagcacatatt-----------catgaactatcttga 4975500  T
Q  135 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4975501 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaa 4975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915994
Alignment:
Q  105 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataattta 39915986  T
Q  205 gaaaaaac 212  Q
    ||||||||    
T  39915987 gaaaaaac 39915994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 9509400 - 9509572
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  9509400 ggtgaaaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataaaaatttgccacataaacacatatt-----------catgaactat 9509488  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9509489 cttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 9509572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 33896843 - 33897017
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||           ||  |||||| ||| |||| || ||||||    
T  33896843 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatctataaactat 33896931  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33896932 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 33897017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 27243213 - 27243314
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27243213 atattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 27243312  T
Q  215 ta 216  Q
    ||    
T  27243313 ta 27243314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 27254788 - 27254889
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27254788 atattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 27254887  T
Q  215 ta 216  Q
    ||    
T  27254888 ta 27254889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Original strand, 32373733 - 32373892
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  32373733 aactaggttatccatggaagaatggtgg-taatttaccccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 32373820  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 207  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  32373821 cccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaatttagaa 32373892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 3490399 - 3490572
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| || |||| || |||    
T  3490399 ggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtagtttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccataaattat 3490487  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3490488 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 33622467 - 33622640
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  33622467 ggtgacaactaggctacc-atgaaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagtcacataaccacatatt-----------catgaactat 33622554  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
     ||||||||   || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  33622555 tttgacccata-aatatattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaagctta 33622640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38631806 - 38631652
Alignment:
Q  47 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 146  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||           |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  38631806 ccattgaagaatggtggataatttatcccaaccaatacatattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccacaccaataa 38631718  T
Q  147 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38631717 attgctcatattcattggttgatgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 38631652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981454
Alignment:
Q  110 aagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattctt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattctt 41981454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 26196317 - 26196491
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  26196317 ggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 26196405  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
     ||||||| ||||| |||||| | ||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26196406 tttgaccccaccaataaattgtt-attatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 26196491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 214
Target Start/End: Original strand, 31148953 - 31149063
Alignment:
Q  103 catttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatc 202  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31148953 catttttaagtggtatc-atgaactatcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattacccaccatttttcaaaggtaatc 31149051  T
Q  203 tagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||||||    
T  31149052 tagaaaaaacct 31149063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 41425429 - 41425503
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 105  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41425429 ggtggcaactaggctacccataaaagaattatggataatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 41425503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 164791 - 164728
Alignment:
Q  143 acaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctaga 206  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  164791 acaaattgctcatttttattggttggtggataaattacccatcattccttaaaggtaatctaga 164728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39901739 - 39901674
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccac 95  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39901739 ggtgacaactaaggtatccattgaagaatggtggataatttacctcaaccaataaacattagccac 39901674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12032988 - 12032951
Alignment:
Q  176 attacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032988 attacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 12032951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39901616 - 39901574
Alignment:
Q  169 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39901616 tgggtaagttacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 39901574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17601017 - 17600832
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17601017 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17600918  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17600917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 17600832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 746647 - 746464
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  746647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 746548  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  746547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 6594458 - 6594643
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6594458 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6594557  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594558 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 6594643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23901960 - 23901775
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901960 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23901861  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23901860 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 23901775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4034773 - 4034590
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4034773 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4034674  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034673 cttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38997283 - 38997100
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38997283 gggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 38997184  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997183 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 38997100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45371171 - 45370988
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45371171 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45371072  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371071 cttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 45370988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710340
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26710526 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26710427  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710426 cttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26710340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11185154 - 11184970
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11185154 gggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 11185055  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185054 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 11184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 13815218 - 13815402
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13815218 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13815317  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815318 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 13815402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 2324889 - 2325072
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2324889 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2324988  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324989 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2325072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 27651034 - 27651217
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27651034 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27651133  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651134 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27651217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40635399 - 40635216
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40635399 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40635300  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40635299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 40635216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14660627 - 14660445
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14660627 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14660528  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14660527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaac 14660445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34518548 - 34518366
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34518548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34518449  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34518448 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaac 34518366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6430648 - 6430471
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6430648 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 6430549  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6430548 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 6430471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10424773 - 10424592
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10424773 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 10424674  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424673 gaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 10424592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27400584 - 27400399
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27400584 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 27400485  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400484 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27400399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 10244582 - 10244765
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10244582 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10244681  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10244682 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 10244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40735645 - 40735459
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40735645 ggtgacaattagggtactcatggaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtatccataaactat 40735546  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735545 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 40735459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32327542 - 32327361
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32327542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 32327443  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32327442 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 32327361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27024596 - 27024413
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27024596 ggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccatgaactat 27024497  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024496 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27024413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 33427647 - 33427828
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33427647 ggtgataactagggtacccatgaaagaatggtgtgtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 33427746  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33427747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 33427828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 1091951 - 1092134
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1091951 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 1092050  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1092051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 1092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5726310 - 5726128
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5726310 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaactat 5726211  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5726210 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 5726128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32948626 - 32948445
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32948626 ggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact-t 32948528  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32948527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 32948445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4609807 - 4609626
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4609807 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttaccccaaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4609708  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4609707 cttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 4609626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40037323 - 40037141
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40037323 ggtgacaactagggtacccatgaaa-aatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 40037225  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40037224 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40037141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 7892688 - 7892870
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7892688 ggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 7892787  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892788 attgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 7892870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 14697537 - 14697721
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14697537 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14697636  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14697637 cttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaacct 14697721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 37255337 - 37255516
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37255337 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37255436  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255437 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt-----ccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 37255516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 2914138 - 2914319
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2914138 ggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2914237  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2914238 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 2914319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 37620867 - 37621054
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37620867 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatccaaaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37620966  T
Q  130 cttg---acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37620967 cttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 37621054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15925255 - 15925075
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15925255 aactagggtatctatgaaagaatgatggataatttacctcaaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 15925156  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15925155 cccaccaataaattactcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttgaaaggtaatctagaaaaaacctta 15925075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32608527 - 32608376
Alignment:
Q  64 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  32608527 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctcattttcattg 32608428  T
Q  164 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608427 gttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32608376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9444874 - 9444683
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgg---gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9444874 ggtgacaactagggtatccatggaagaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 9444775  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattg-------atgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||       || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9444774 tatcttgaccccaccagcaaattgctcattttcattggttggtgggtaattggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaa 9444683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11159803 - 11159625
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11159803 gggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccatccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaacta 11159704  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaa 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  11159703 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaatta-ccaccatttttcaaaggtaatcaagaaa 11159625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 32856436 - 32856603
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32856436 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatgaactat 32856535  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaagg 197  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32856536 cttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagg 32856603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25295013 - 25294886
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25295013 gacaactagggtactcatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 25294914  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttca 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25294913 gaccccaccaacaaattgctcattttca 25294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 8432942 - 8433101
Alignment:
Q  56 aatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcat 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8432942 aatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctcat 8433041  T
Q  156 tttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8433042 tttcattggttggcaggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 8433101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12842250 - 12842103
Alignment:
Q  64 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  12842250 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcattttcattg 12842151  T
Q  164 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12842150 gttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaa 12842103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 35158050 - 35158220
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  35158050 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 35158138  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35158139 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 35158220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39103216 - 39103042
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||     
T  39103216 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatt 39103128  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39103127 ttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 39103042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 28641287 - 28641464
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||         |||| |||||    
T  28641287 tttttggtgacaactaggctacccatgaaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa--acat---------atattcatga 28641375  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28641376 actatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 28641464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41172605 - 41172449
Alignment:
Q  64 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  41172605 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattg 41172506  T
Q  164 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtttt 221  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  41172505 gttggtgggtaaattacccatcattcttcaaatgtaattta-aaaaaaccttaatttt 41172449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1229809 - 1229630
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggta-cccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1229809 ggtgacaacttgggtaacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 1229710  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||         |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1229709 tcttgaccccatcaacaaattgttcattttcattga--------caaattacctaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctta 1229630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29687216 - 29687039
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||    
T  29687216 tttttggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catga 29687128  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29687127 actatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 29687039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42900039 - 42899913
Alignment:
Q  87 attagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||    
T  42900039 attagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaacca 42899940  T
Q  187 ttcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42899939 ttcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 42899913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12730231 - 12730059
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  12730231 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagtcacataagcacatattta-----------tgaactat 12730143  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12730142 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 12730059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27331472 - 27331298
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  27331472 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacatattagccacataagcacatat-------atattcatgaactat 27331380  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27331379 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 27331298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145281
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           ||||||||||||    
T  145450 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacgtatt-----------catgaactatct 145362  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  145361 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 145281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 21734900 - 21735073
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  21734900 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 21734988  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21734989 cttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 21735073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4258659 - 4258488
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  4258659 ggtgacaactaggctacccatgaacgaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 4258571  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4258570 cttgaccc-acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 4258488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 447633 - 447740
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  447633 ggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 447732  T
Q  130 cttgaccc 137  Q
    ||||||||    
T  447733 cttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 2688729 - 2688903
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2688729 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 2688817  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2688818 cttgaccctacaaataaattgctaattttcattaatcggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 2688903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 12333497 - 12333669
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  12333497 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 12333583  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12333584 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 12333669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 19428421 - 19428598
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||    
T  19428421 tttttggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatga 19428509  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaa-ggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19428510 actatcttgaccccacaagtaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggtaatttagaaaaaac 19428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Original strand, 39301196 - 39301367
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||           |||||||||    
T  39301196 gggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagtcatataagcacatatt-----------catgaacta 39301284  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39301285 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 39301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 13543624 - 13543798
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  13543624 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 13543712  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  13543713 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttaaaaagaacctt 13543798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 27764862 - 27765035
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  27764862 gggtggcaactaggctacccatgaaaga-tgatggttaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 27764949  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27764950 ttttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaacct 27765035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 43898971 - 43899142
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  43898971 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 43899058  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43899059 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43899142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44481998 - 44481826
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  44481998 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacttt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 44481910  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44481909 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 28566703 - 28566872
Alignment:
Q  35 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 134  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  28566703 caactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 28566791  T
Q  135 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||| |  || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28566792 ccccagaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacctt 28566872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3711803 - 3711664
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||| ||||||||||    
T  3711803 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcac-----------atattcatgaactat 3711715  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac 180  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3711714 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 3711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34249435 - 34249265
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||           |||| ||| ||||||    
T  34249435 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagtcacataagcac-----------atattcataaactat 34249347  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||||    
T  34249346 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattactcaccattcttcaaagataatttaaaaaaaa 34249265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43356266 - 43356097
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  43356266 ggtgacaactaggctaaccatgaaagaatcatgggtaatttactcaaaccaatacaaattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43356178  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43356177 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggt---ttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43356097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12827244 - 12827136
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12827244 gggtgacaactagagcacctgtggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaacta 12827146  T
Q  129 tcttgaccca 138  Q
    |||| |||||    
T  12827145 tcttaaccca 12827136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814609
Alignment:
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 12814609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 216
Target Start/End: Original strand, 2000338 - 2000512
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||           |||||||    
T  2000338 gggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgagtaatttaccccaac-aatacatatgagccacgtaagcacatattta-----------tgaacta 2000424  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    | |||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2000425 ttttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 2000512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 28014856 - 28014925
Alignment:
Q  68 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28014856 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccc 28014925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35126945 - 35126778
Alignment:
Q  35 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 134  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  35126945 caactagggtatctatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatcttga 35126857  T
Q  135 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  35126856 ccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccgtttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 35126778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 215
Target Start/End: Original strand, 40544150 - 40544250
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40544150 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaactatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 40544249  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  40544250 t 40544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3266455 - 3266296
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||| ||           ||||||||||||    
T  3266455 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacat---------aagcacatatt-----------catgaactatct 3266376  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3266375 tgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaa 3266296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8056779 - 8056625
Alignment:
Q  47 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 146  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||           ||||||||||||| || | || || ||    
T  8056779 ccatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagctacataagcgcatatt-----------catgaactatcttcactccacaaataa 8056691  T
Q  147 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    || | |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8056690 atagttcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 8056625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30545991 - 30545817
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||           || |||||||  |  |||||| |||||||    
T  30545991 ggtgacaactagggtatctatggaggaatgatgggtaatttacctgaaccaatgaacatt-----------catatttttagattgtatccacgaactat 30545903  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30545902 cttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaattatccaccattcttcaaaaataatctaaaaaaaacctt 30545817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 214
Target Start/End: Original strand, 28019960 - 28020005
Alignment:
Q  169 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019960 tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10176625 - 10176558
Alignment:
Q  145 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10176625 aaattgctcattttcattaattggtgaataagttacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 10176558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Original strand, 40544085 - 40544143
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 88  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40544085 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgtgtaatttacctcaaccaatacacat 40544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10176714 - 10176637
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacattt 107  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  10176714 ggtgataactagggtgtccatggaagaataatggttaatttacttcaaccaataaacattagttacataaacacattt 10176637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 180
Target Start/End: Original strand, 38985342 - 38985416
Alignment:
Q  105 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac 180  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  38985342 tttttaggtggtatccatgaactatcttgacatatc-aataaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 38985416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42900835 - 42900781
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataca 85  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  42900835 ggtgacaactagg-tacacatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaataca 42900781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 36216305 - 36216351
Alignment:
Q  169 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36216305 tgggtaaattacccatgagttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 36216351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8264576 - 8264532
Alignment:
Q  169 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  8264576 tgggtaaattacccatgaattttcaaaggtaatttagaaaaaacc 8264532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31308183 - 31307999
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31308183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31308084  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308083 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 31307999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45538335 - 45538151
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45538335 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45538236  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3611318 - 3611132
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3611318 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 3611219  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3611218 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 3611132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44662152 - 44661967
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44662152 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 44662053  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662052 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 44661967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23984937 - 23984752
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23984937 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23984838  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984837 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23984752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 17994951 - 17995134
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17994951 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 17995050  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 17995134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 21139412 - 21139594
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21139412 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21139511  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21139512 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatacttcaaaggtaatctagaaaaaac 21139594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47671768 - 47671582
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47671768 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47671669  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671668 cttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47671582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25058870 - 25058685
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058870 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25058771  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058770 tttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 4068689 - 4068869
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4068689 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 4068788  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4068789 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaagcctta 4068869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5981352 - 5981169
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5981352 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5981253  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981252 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5981169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 25678259 - 25678442
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25678259 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25678358  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25678359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 25678442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 46967041 - 46967224
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46967041 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46967140  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967141 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 46967224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 6327548 - 6327733
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6327548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6327646  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327647 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 6327733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 24245025 - 24245211
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24245025 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24245124  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245125 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24245211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26277359 - 26277173
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26277359 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtatccatgaactat 26277260  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277259 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26277173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43251891 - 43251713
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43251891 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43251792  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251791 tgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 43251713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46616731 - 46616546
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46616731 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 46616632  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46616631 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46616546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41999997 - 41999813
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41999997 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 41999898  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41999897 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41999813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31040891 - 31040708
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31040891 ggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 31040792  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31040791 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31040708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35273778 - 35273595
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35273778 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35273679  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35273678 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 35273595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36566512 - 36566329
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36566512 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36566413  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566412 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgaatatattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36566329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 26085398 - 26085583
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26085398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 26085497  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26085498 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc-aaggtaatctagtaaaaacctta 26085583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 213
Target Start/End: Original strand, 37620189 - 37620375
Alignment:
Q  27 ttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37620189 ttgggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaac 37620288  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37620289 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 37620375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 38331859 - 38332045
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38331859 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactat 38331958  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38331959 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 38332045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 33112817 - 33113001
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33112817 gggtgacaactagggtacc-atgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 33112915  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112916 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33113001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 38790197 - 38790378
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38790197 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaactat 38790296  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38790297 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 38790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 23932509 - 23932692
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23932509 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaactat 23932608  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23932609 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacc 23932692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39646750 - 39646567
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39646750 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatgacctat 39646651  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39646650 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacc 39646567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 49253975 - 49254158
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49253975 ggtgataattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaactat 49254074  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49254075 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49254158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5980253 - 5980067
Alignment:
Q  27 ttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||    
T  5980253 ttgggtgacagctagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaac 5980154  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980153 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5980067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33884270 - 33884088
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  33884270 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33884171  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884170 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33884088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 33959982 - 33960164
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  33959982 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33960081  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33960082 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33960164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47317497 - 47317316
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47317497 ggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 47317398  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  47317397 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaatataaaaaaaa 47317316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51057253 - 51057068
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51057253 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctcaactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatctat 51057154  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51057153 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51057068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26794482 - 26794302
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26794482 acaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttg 26794383  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26794382 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacct 26794302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24885683 - 24885500
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24885683 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 24885584  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885583 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24885500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 46784605 - 46784418
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46784605 ggtgacaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46784506  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttag 217  Q
    ||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46784505 ctttacttctccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaactttag 46784418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 26524889 - 26525071
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  26524889 ggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaactat 26524988  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26524989 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 26525071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47187287 - 47187101
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47187287 ggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 47187188  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47187187 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcatcaatcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47187101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 47383732 - 47383914
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47383732 ggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatcccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47383831  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47383832 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaac 47383914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50774404 - 50774218
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50774404 ttttaggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatcccaaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatccatga 50774305  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50774304 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 50774218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 35692663 - 35692848
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35692663 ggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatgaactat 35692762  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatggg-taaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 35692848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 23220939 - 23221112
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23220939 acaactagggtacccatggaagaatggtggata------cccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 23221032  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221033 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 23221112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3285582 - 3285400
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3285582 gtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatc 3285484  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285483 ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3285400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 49398988 - 49399171
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49398988 ggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaactat 49399087  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49399088 cttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36003315 - 36003131
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatg---gaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36003315 ggtgacaactagggtacctatgaaagaagaatggtgggtaatttatccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 36003216  T
Q  127 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36003215 tatcttgaccccaccagtaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 36003131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31844527 - 31844374
Alignment:
Q  61 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttca 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31844527 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcattttca 31844428  T
Q  161 ttgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31844427 ttggttggtgggtaaattatccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaacct 31844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42864034 - 42863867
Alignment:
Q  43 gtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaacca 142  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42864034 gtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccacca 42863935  T
Q  143 acaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42863934 acaaatagctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtagtctagaaaaa 42863867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28888760 - 28888582
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28888760 gacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatctcaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 28888661  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888660 gatcccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaa 28888582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48373677 - 48373500
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48373677 ggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48373587  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373586 cttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 48373500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 42313361 - 42313548
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  42313361 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaactat 42313460  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac----ccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42313461 cttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaattatatatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 42313548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25518952 - 25518815
Alignment:
Q  74 ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25518952 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 25518853  T
Q  174 aaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25518852 aaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 25518815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 41467632 - 41467804
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  41467632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 41467720  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41467721 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41467804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 27983603 - 27983772
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||               
T  27983603 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtat----------- 27983691  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983692 -----ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27983772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2450676 - 2450529
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2450676 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 2450577  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaat 177  Q
    |||||  | || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2450576 cttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2657474 - 2657300
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2657474 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 2657386  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2657385 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacctt 2657300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33073382 - 33073207
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  33073382 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 33073294  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33073293 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 33073207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4808827 - 4808699
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4808827 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4808728  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt 158  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  4808727 cttgaccctatcaataaattgttcatttt 4808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 6626025 - 6626195
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||    
T  6626025 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatc 6626113  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6626114 ttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 6626195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10928238 - 10928064
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  10928238 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 10928150  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10928149 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 10928064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 26472185 - 26472353
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  26472185 aactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaagacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 26472273  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26472274 cccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 26472353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29770841 - 29770666
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29770841 ggtggcaactaggctacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29770753  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29770752 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 29770666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 45475848 - 45476014
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  45475848 gacaactagggtacca--gaaagaatggtgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatctt 45475944  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45475945 gaccccaccaataaattgctcattttcattgattggtgggta--------accattcttcaaaggtaatctagaaaaa 45476014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Original strand, 51045596 - 51045729
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  51045596 ggtgacaactaggatacccgtagaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaactat 51045695  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51045696 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattg 51045729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 51403034 - 51403189
Alignment:
Q  47 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 146  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||         ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51403034 ccatggaagaatggtgagtaatttatcccaaccaatacatat---------aagcacatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 51403123  T
Q  147 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403124 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 51403189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42235010 - 42234836
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  42235010 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 42234923  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42234922 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 42234836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4953223 - 4953053
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  4953223 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 4953135  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4953134 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagagaaaa 4953053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2955026 - 2954854
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |           ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  2955026 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacaat-----------cacctttttaagtggtatccattaactat 2954938  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2954937 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattacccaccatttgtcaaaggtaatctagaaaaaacc 2954854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 210
Target Start/End: Original strand, 31979998 - 31980115
Alignment:
Q  93 cacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttc 192  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31979998 cacataaggacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 31980097  T
Q  193 aaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31980098 aaaggtaatctagaaaaa 31980115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 4243489 - 4243663
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||| ||| |||||    
T  4243489 gggtgacaactagactacccatgaaagaattatgggtaatttaccccatccaatacacattagccacataagcac-----------atattcataaacta 4243577  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4243578 tcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacct 4243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26686027 - 26685855
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  26686027 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 26685939  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26685938 cttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 26685855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4156576 - 4156438
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta- 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  4156576 ggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaactat 4156477  T
Q  129 ------tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcat 161  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4156476 attgagtcttgaccccaccaacaaattggtcattttcat 4156438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Original strand, 34752320 - 34752485
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||| |     
T  34752320 aactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatcttaag 34752408  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    || || || ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34752409 cccacaaataaattgctcattttatttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 34752485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 39475778 - 39475956
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||           |||||||||| ||| ||||||| |    
T  39475778 tttttggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggttatttatcccaaccaataaacgtt-----------cacatttttaggtggtatccataa 39475866  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39475867 actatcttgaccca-ccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtactctagaaaaaacctt 39475956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Original strand, 2556909 - 2557031
Alignment:
Q  93 cacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttc 192  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  2556909 cacataaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttcattagttagtggataaattatccaccattcttc 2557008  T
Q  193 aaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2557009 aaaggtaatctagaaaaaacctt 2557031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 30289910 - 30290083
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  30289910 ggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcac-----------atattcatgaactat 30289998  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30289999 cttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaacacct 30290083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 41895164 - 41895333
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  41895164 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 41895252  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    |||||||  || || |||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  41895253 cttgacctcacaaataaattgctaattgttattggttggtgggtaaattacccacaattctttaaaggtaatttagaaaaa 41895333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 13312531 - 13312624
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13312531 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtatccatg 13312624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33187505 - 33187337
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||                 |||||||| |||| || ||||||    
T  33187505 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatatt-----------------tttaagtggtatctataaactat 33187423  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33187422 cttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattctttaaagataatctagaaaaaacctt 33187337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 5961267 - 5961441
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  5961267 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 5961355  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5961356 cttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacctt 5961441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 38716245 - 38716419
Alignment:
Q  28 tgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| || |    
T  38716245 tgggtgacaacaagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaatt 38716333  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  38716334 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatctagaaaaaacc 38716419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1388644 - 1388476
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1388644 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 1388556  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 209  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  1388555 cttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaatgtaatctagaaaa 1388476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Original strand, 44544052 - 44544216
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 135  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||| ||           ||||||||||||||||    
T  44544052 aactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccctaactaatatacattagttacataagtacatatt-----------catgaactatcttgac 44544140  T
Q  136 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44544141 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 44544216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 51155590 - 51155761
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  51155590 ggtgacagctaaggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagtcacataaacacatatt-----------catgaactat 51155677  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  51155678 cttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 51155761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Original strand, 47772172 - 47772304
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||  || ||||||    
T  47772172 ggtgacaattaaggtacccatggaagaatggtgtgtaatttactccaaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaactat 47772271  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcatt 162  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47772272 tttgaccctaccaacaaattgcttattttcatt 47772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32448807 - 32448650
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||           |||| |||||||||||||    
T  32448807 gacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaata---------cacttaagcac-----------atattcatgaactatctt 32448728  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32448727 gaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaa 32448650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 13281588 - 13281733
Alignment:
Q  56 aatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcat 155  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||| ||||||| || || |||||| ||||    
T  13281588 aatgatggataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccacaaataaattgttcat 13281676  T
Q  156 tttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13281677 tgtcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 13281733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 13313248 - 13313351
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaagg--taatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13313248 atatccatgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccacaattcttcaaaggtataatctagaaaaaac 13313347  T
Q  213 ctta 216  Q
    ||||    
T  13313348 ctta 13313351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 44293455 - 44293630
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||           ||||||||||    
T  44293455 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaactaatatatattagccacataagtacatatt-----------catgaactat 44293543  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  44293544 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattacctactattcttcaaaggtaattttaaaaaaacctta 44293630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10920371 - 10920198
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  10920371 ggtgacaactaaggtatccatggaaaaatggtcggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 10920283  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10920282 cttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10920198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 7561528 - 7561712
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattag--ccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || | |   |||  || |       
T  7561528 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccccacgtaagcacatattcatgaactataaattatgg 7561627  T
Q  128 at-cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
     |  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  7561628 gtaattgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 7561712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Original strand, 24649802 - 24649896
Alignment:
Q  121 atgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649802 atgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 24649896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 46428327 - 46428433
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  46428327 atattcatgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttgctgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacat 46428426  T
Q  215 tagtttt 221  Q
    || ||||    
T  46428427 tattttt 46428433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52324110 - 52323936
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||  |||||           ||| |||||| ||| ||| ||| || |||    
T  52324110 ggtgacaactagggtacccatggaagattggtgggtaatttactccaatcaatgaacattt----------cacctttttaggtggtattcataaattat 52324021  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52324020 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 52323936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52368054 - 52367882
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  || ||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  52368054 ggtgacaactagggtacctatggaaaaatgatgggtaatttatctaaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 52367966  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  52367965 cttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccacaattttttaaaggtaatccagaaaaaacc 52367882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Original strand, 27924722 - 27924830
Alignment:
Q  105 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 204  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  27924722 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatcta 27924821  T
Q  205 gaaaaaacc 213  Q
    |||||||||    
T  27924822 gaaaaaacc 27924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Original strand, 35991616 - 35991773
Alignment:
Q  47 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 146  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||           |||||||||||||||||| || || ||    
T  35991616 ccatgaaagaatgatagctaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataa 35991704  T
Q  147 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35991705 attgctcattttcaattgttggtggataaattacccacaattcttcaaaggtaattta-aaaaaacctta 35991773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39637986 - 39637899
Alignment:
Q  122 tgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39637986 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggt----gggtaaattacccaccattcttcataggtaatctagaaaaaacc 39637899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 200
Target Start/End: Original strand, 48683329 - 48683489
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| |||||    
T  48683329 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaacta 48683417  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  48683418 tcttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaa 48683489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Original strand, 4156188 - 4156248
Alignment:
Q  153 cattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156188 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 38718167 - 38718242
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttac-cccaaccaatacacattagccacataagcacat 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38718167 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagcacat 38718242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24215911 - 24215812
Alignment:
Q  53 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgct 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||         |||| ||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  24215911 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataa--acat---------atattcatgaactatcttgatcctacaaataaattgct 24215823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Original strand, 31286504 - 31286563
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31286504 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 31286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 10919313 - 10919367
Alignment:
Q  160 attgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10919313 attggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10919367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 31844855 - 31844818
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31844855 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaa 31844818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23994875 - 23994845
Alignment:
Q  185 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994875 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23994845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 39359532 - 39359502
Alignment:
Q  61 tgggtaatttaccccaaccaatacacattag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359532 tgggtaatttaccccaaccaatacacattag 39359502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 24649727 - 24649791
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||  |||| |||| |||||    
T  24649727 ttttgggtgacaactagggtatccttgaaagaatggtggataatttacatcaactaataaacatt 24649791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 39556 - 39739
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39556 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39655  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39656 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5882688 - 5882505
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5882688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5882589  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882588 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5882505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8615427 - 8615237
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8615427 tttttggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 8615328  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615327 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 8615237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 22551061 - 22551247
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22551061 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtggtatccatgaactat 22551160  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551161 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 22551247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Original strand, 14891383 - 14891563
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891383 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 14891482  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14891483 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 14891563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 18101495 - 18101674
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18101495 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18101594  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 209  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18101595 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 18101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24168273 - 24168090
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24168273 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24168174  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168173 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 26377204 - 26377387
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26377204 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26377303  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26377304 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 26377387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 19415533 - 19415717
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19415533 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgagctat 19415632  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415633 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 19415717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2892368 - 2892189
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2892368 tgacaactagggtacccatagaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 2892269  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2892268 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 34527862 - 34528045
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34527862 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 34527961  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34527962 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 34528045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1970893 - 1970708
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1970893 ggtgacaactaaagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 1970794  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970793 cttgaccccaccaacaaattgtttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 1970708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 7393586 - 7393771
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7393586 ggtgacaattatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7393685  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393686 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 7393771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16703539 - 16703363
Alignment:
Q  39 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  16703539 taggatacccatggaagaatgatgcgtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgacccc 16703440  T
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703439 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28947269 - 28947085
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  28947269 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaattat 28947170  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947169 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 959904 - 960086
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  959904 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatgaattat 960003  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  960004 cttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 960086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Original strand, 2593852 - 2594041
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2593852 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2593951  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtt 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2593952 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaagataatctagaaaaaacctaagtt 2594041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 7345114 - 7345295
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  7345114 tgacaactaaggtagacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 7345213  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345214 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7345295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 11988974 - 11989143
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11988974 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 11989073  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11989074 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 11989143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281238
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactatc 19281155  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19281156 ttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 19281238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 600074 - 599890
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  600074 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatcccaaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 599975  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599974 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 599890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 22341788 - 22341959
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22341788 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22341887  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgat--tgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22341888 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgtgttgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 22341959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 10507908 - 10508091
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10507908 ggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10508007  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10508008 cttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 10508091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 33452572 - 33452753
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33452572 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 33452671  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33452672 cttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 33452753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 24224070 - 24224253
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24224070 ggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24224169  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggt-aatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24224170 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaaatctagaaaaaac 24224253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 5294801 - 5294987
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5294801 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5294900  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5294901 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 5294987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 5299353 - 5299539
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5299353 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5299452  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5299453 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 5299539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 30743448 - 30743629
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30743448 ggtgataattagggtatccatgaaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 30743547  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30743548 cttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 30743629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 213
Target Start/End: Original strand, 30467656 - 30467786
Alignment:
Q  83 acacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30467656 acacattagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattaccc 30467755  T
Q  183 atcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30467756 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 30467786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 28948845 - 28949019
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||| |||    
T  28948845 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------tatattcatgaattat 28948933  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28948934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 28949019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 180
Target Start/End: Original strand, 23261929 - 23262079
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261929 ggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttaccccaaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 23262028  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac 180  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23262029 cttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23262079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13329545 - 13329378
Alignment:
Q  37 actagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacc 136  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| |||    
T  13329545 actaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattt-----------atgaactatcttaacc 13329457  T
Q  137 caaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    | || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13329456 ccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 13329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15965604 - 15965432
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| |||||| |||    
T  15965604 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacac-----------atattcatgaagtat 15965516  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15965515 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 15965432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7167754 - 7167580
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  7167754 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 7167666  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167665 tcttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 7167580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4487698 - 4487528
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||| ||||||||||    
T  4487698 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatgagtac-----------atattcatgaactat 4487610  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  4487609 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcataggaaatttaaaaaaaa 4487528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3786920 - 3786749
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  3786920 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 3786832  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
     ||||||| || || |||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3786831 attgaccccacaaataaattcttcattttcattgattggtaggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaac 3786749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1398725 - 1398551
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||           |||| ||| |||||    
T  1398725 gggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacatattagccacataagcac-----------atattcatcaacta 1398637  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1398636 tcttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatttagaaaaaacct 1398551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3291179 - 3291009
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  3291179 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacatattagccacataagcacatattta-----------tgaactat 3291091  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||| |||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3291090 cttaaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 3291009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929657
Alignment:
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 929657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18661905 - 18661830
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18661905 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacat 18661830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 24913096 - 24913171
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 105  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24913096 ggtgacaactaagctactcatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacat 24913171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 11743070 - 11743130
Alignment:
Q  156 tttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11743070 tttcattgattgatggataaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaacctta 11743130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Original strand, 1939578 - 1939669
Alignment:
Q  115 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctaga 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1939578 atatccatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaattatccaccattcttcaaagataatttaga 1939669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Original strand, 375807 - 375898
Alignment:
Q  124 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||  ||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  375807 aactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctaaaaaaaacctt 375898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34262401 - 34262342
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34262401 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcacaaccaataaacatt 34262342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 89
Target Start/End: Original strand, 375729 - 375786
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 89  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  375729 tgacaattaaggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 375786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49330219 - 49330035
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49330219 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 49330120  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330119 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49330035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40420017 - 40419834
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40420017 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40419918  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40419834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47257975 - 47257792
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47257975 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 47257876  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257875 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 47257792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 27066978 - 27067160
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27066978 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 27067077  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27067078 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 27067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37313581 - 37313395
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37313581 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 37313482  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313481 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37313395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 40130959 - 40131144
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40130959 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40131058  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131059 cttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 40131144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41464534 - 41464349
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41464534 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41464435  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464434 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41464349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 43612047 - 43612231
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43612047 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43612146  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43612147 cttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacct 43612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 7855114 - 7855300
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7855114 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaactat 7855213  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7855214 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 7855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24100464 - 24100279
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  24100464 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 24100366  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100365 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24100279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 38416724 - 38416905
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38416724 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38416823  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416824 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 38416905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22399278 - 22399095
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22399278 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaactat 22399180  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22399179 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22399095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 28048392 - 28048576
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28048392 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28048491  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28048492 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 28048576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 47809596 - 47809780
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47809596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 47809695  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47809696 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47809780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 48739233 - 48739417
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48739233 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 48739332  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48739333 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacct 48739417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 51170034 - 51170218
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51170034 gtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 51170133  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170134 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 51170218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 55453245 - 55453429
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55453245 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 55453344  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55453345 ttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaacctagaaaaaacctt 55453429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40643982 - 40643799
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40643982 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccataaactat 40643883  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40643882 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 40643799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 32234398 - 32234583
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32234398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 32234496  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234497 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 32234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 40804510 - 40804696
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40804510 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40804609  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40804610 cttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatctta 40804696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 51102378 - 51102564
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102378 ggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaactat 51102477  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102478 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51102564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 29625827 - 29626012
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29625827 ggtgataattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29625926  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29625927 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29626012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42292024 - 42291840
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  42292024 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaactat 42291925  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291924 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 42291840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41732710 - 41732525
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41732710 ggtgacaactggggtatccatggaaggatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41732611  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41732610 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattgattgatggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41732525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35594299 - 35594119
Alignment:
Q  34 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594299 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35594200  T
Q  134 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35594199 accccatcaacaaattgctcatttttattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 35594119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44223011 - 44222827
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  44223011 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaat 44222912  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44222911 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44222827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52629140 - 52628953
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52629140 tttttggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatga 52629042  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52629041 actatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaataaacc 52628953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2666182 - 2665999
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2666182 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaactat 2666083  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666082 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2665999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 7755307 - 7755489
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  7755307 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatgatgggttatttaccccaagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatctat 7755405  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7755406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7755489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 20754393 - 20754576
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20754393 ggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatgaactat 20754492  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20754493 cttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 20754576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 35748311 - 35748494
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35748311 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 35748410  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35748411 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaagctaatctaaaaaaaacc 35748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 39634572 - 39634753
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39634572 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39634671  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39634672 -ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaaatacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 39634753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 51452751 - 51452932
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51452751 ggtgacaattagggtacc-atggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 51452849  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452850 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 51452932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43126012 - 43125828
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43126012 ggtgacaactagg-tacctataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43125914  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125913 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattgattagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43125828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39053576 - 39053393
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39053576 ggtgacaactagagtatccataaaaaaatgatgggtaatttaccccaacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39053477  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053476 cttgaccccatcaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39053393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37324723 - 37324537
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37324723 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaactat 37324624  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37324623 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37324537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48609903 - 48609719
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48609903 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 48609804  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatc-tagaaaaaacctt 215  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  48609803 taaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcgaaggtaatcttaaaaaaaacctt 48609719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44806866 - 44806683
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44806866 ggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44806767  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806766 cttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44806683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 51146215 - 51146398
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51146215 ggtggcaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaactat 51146314  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51146315 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgatgtgtaaattacctaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 51146398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52215243 - 52215077
Alignment:
Q  45 acccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaac 144  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52215243 acccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaac 52215144  T
Q  145 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52215143 aaattgctcatgttcattagttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 52215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46134538 - 46134357
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46134538 ggtgacaattagggtatccatgaaagaatggtgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46134439  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46134438 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 46134357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 53943588 - 53943770
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  53943588 ggtgacaactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 53943686  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53943687 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53943770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24376730 - 24376572
Alignment:
Q  55 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctca 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24376730 gaatggtgggtaatttaccccaacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctca 24376631  T
Q  155 ttttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376630 ttttcattggttggtgcgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021715
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatc 43021797  T
Q  131 ttga-cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43021796 ttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 43021715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52639024 - 52638839
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  52639024 ggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaattat 52638925  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52638924 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 52638839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 41293319 - 41293498
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  41293319 ggtgacaattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaattat 41293417  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41293418 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 41293498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183917
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43183993  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 207  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43183992 tgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaa 43183917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Original strand, 5560023 - 5560218
Alignment:
Q  28 tgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatta--gccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5560023 tgggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaa 5560122  T
Q  126 ctatcttgacccaaccaacaaattgctcattt-----tcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||     |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5560123 ctatcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 5560218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36369120 - 36368925
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36369120 ggtgataactagagcacccatggaaga-tggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36369022  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagttttgatat 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  36369021 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattagttggtgggtaaattatcgaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccatattttttatat 36368925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Original strand, 53832486 - 53832666
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  53832486 tgacaactagggaacacatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatct 53832585  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53832586 tgacaccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 53832666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41216637 - 41216454
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41216637 ggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatcccaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41216538  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
     || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41216537 attaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattacccaccatcctttaaaggtaatctagaaaaaacc 41216454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46126168 - 46126010
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46126168 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaactat 46126070  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattc 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  46126069 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattc 46126010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18947085 - 18946904
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18947085 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgtctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaactat 18946986  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18946985 cttgaccccacaaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacgcaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 18946904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 47894822 - 47895003
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47894822 tgacaactagggtacccatggaagaatggtggatgatttacctcaactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 47894921  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47894922 tgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtaggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacc 47895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53637990 - 53637841
Alignment:
Q  63 ggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcatt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53637990 ggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcatt 53637891  T
Q  163 gattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53637890 ggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 53637841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 48546842 - 48547014
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  48546842 tgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttaccccaatcaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaactat-t 48546931  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48546932 tgaccca-ccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 48547014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25641817 - 25641644
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  25641817 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaactat 25641729  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25641728 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 25641644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42590001 - 42589829
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  42590001 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 42589913  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42589912 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 42589829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Original strand, 34279721 - 34279896
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  34279721 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 34279809  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279810 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 34279896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51416140 - 51415966
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  51416140 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 51416052  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51416051 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51415966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 54159000 - 54159173
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54159000 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatt-accccaaccaatacaca---------taagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 54159089  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54159090 tgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctt 54159173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 54707220 - 54707394
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54707220 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 54707308  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54707309 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 54707394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 55000178 - 55000350
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  55000178 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 55000266  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55000267 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 55000350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 38156632 - 38156803
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  38156632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 38156720  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38156721 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 38156803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37759075 - 37758925
Alignment:
Q  66 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |    
T  37759075 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggt 37758976  T
Q  166 tgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37758975 tgatggataaattattcaccattcttcaaaagcaatctagaaaaaacctta 37758925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54401358 - 54401186
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54401358 ggtggcaattaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 54401270  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54401269 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 54401186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49130746 - 49130575
Alignment:
Q  33 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||    
T  49130746 gacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatctt 49130658  T
Q  133 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||  | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49130657 gacctcatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 49130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 39141125 - 39141298
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||    
T  39141125 ggtgataactaggttacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacat---------atattcatgaactat 39141214  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39141215 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39141298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 47510940 - 47511113
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  47510940 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47511028  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  47511029 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 47511113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 41635800 - 41635972
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  41635800 ggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41635888  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41635889 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46949538 - 46949379
Alignment:
Q  47 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  46949538 ccatggaagaatggtgggtaatttatcc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaacaa 46949440  T
Q  147 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaa 208  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||    
T  46949439 attgttcattttcattggtcggtgggtaaattacacacca-tcttcaaagataatctagaaa 46949379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 31286793 - 31286963
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31286793 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31286881  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31286882 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 31286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55380156 - 55379984
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  55380156 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 55380068  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55380067 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55379984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25353725 - 25353550
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  25353725 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 25353637  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25353636 cttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 25353550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37028899 - 37028720
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| |||||    
T  37028899 tttttggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacac-----------atattcatga 37028811  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  37028810 actatcttgactccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattctttaaaggtaatttaaaaaaaacctt 37028720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 33550467 - 33550582
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33550467 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 33550566  T
Q  130 cttgacccaaccaaca 145  Q
    ||| |||| |||||||    
T  33550567 cttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40022240 - 40022075
Alignment:
Q  35 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 134  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  40022240 caactacgctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 40022152  T
Q  135 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40022151 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 40022075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Original strand, 51224036 - 51224212
Alignment:
Q  28 tgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||           ||||||||    
T  51224036 tgggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatatattagtcacataagcacatatt-----------catgaact 51224124  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51224125 atcttgaccccacaaataaattgctcatttttattg-ttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 51224212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 52864671 - 52864550
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52864671 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactc-aaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 52864573  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgct 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  52864572 cttgaccccaccaacaaattgct 52864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53115618 - 53115446
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  53115618 ggtgacaactagggtacctatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaagtggtatccataaactat 53115530  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53115529 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53115446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45059052 - 45058882
Alignment:
Q  32 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 131  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  45059052 tgacaactaggctgcccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatatacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 45058964  T
Q  132 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  45058963 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 45058882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 17665549 - 17665698
Alignment:
Q  55 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctca 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||           |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  17665549 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgctca 17665637  T
Q  155 ttttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17665638 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 17665698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24688287 - 24688114
Alignment:
Q  28 tgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||    
T  24688287 tgggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccagtagacattagccacataaacacatatt-----------catgaact 24688199  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    || ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24688198 attttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacaatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 24688114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Original strand, 28576187 - 28576287
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28576187 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattacccatcatacttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 28576286  T
Q  216 a 216  Q
    |    
T  28576287 a 28576287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 2227995 - 2228110
Alignment:
Q  101 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  2227995 cacattttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatttcccaccatttttcaaaggtaa 2228094  T
Q  201 tctagaaaaaacctta 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  2228095 tctagaaaaaacctta 2228110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 30251501 - 30251675
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  30251501 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttagcccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 30251589  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30251590 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattacccaccatttttcaaaggtagtctagaaaaaacctt 30251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 47182131 - 47182046
Alignment:
Q  81 atacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgatt 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47182131 atacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgatt 47182046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 51143987 - 51143818
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||     
T  51143987 gtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactata 51143899  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51143898 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 51143818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Original strand, 43176734 - 43176908
Alignment:
Q  26 tttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||            ||| |||||| ||| ||||||| ||    
T  43176734 tttgggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaataaacat-----------ccacctttttaggtggtatccataaa 43176822  T
Q  126 ctatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||   ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43176823 ctatcttgacatcaccaataaattgttcattatgattggttggtggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 43176908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 203
Target Start/End: Original strand, 47402810 - 47402911
Alignment:
Q  101 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402810 cacatttttaaatggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattacccaccattctttaaaggtaa 47402908  T
Q  201 tct 203  Q
    |||    
T  47402909 tct 47402911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 213
Target Start/End: Original strand, 48726073 - 48726170
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48726073 tatccatgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 48726170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 42998790 - 42998960
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 130  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42998790 gtgacaactaaggtactcatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataagcatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatc 42998878  T
Q  131 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42998879 ttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatctagaaaaaacc 42998960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Original strand, 41882066 - 41882161
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41882066 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 41882161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 44945935 - 44946101
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||    
T  44945935 ggtgacaactaggctacgcatgaaagaatgatgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------------ctat 44946017  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  44946018 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatttaaaaaaaacc 44946101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 48534007 - 48534082
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 105  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48534007 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccgatacacattagccacataagcacat 48534082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Original strand, 21597223 - 21597323
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21597223 tatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 21597322  T
Q  216 a 216  Q
    |    
T  21597323 a 21597323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 50731914 - 50732087
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||           |||  |||||  || ||||||| |||||     
T  50731914 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50732002  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50732003 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta-aaaaaacctt 50732087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50780942 - 50780769
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||           |||  |||||  || ||||||| |||||     
T  50780942 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50780854  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50780853 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta-aaaaaacctt 50780769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 52756067 - 52756213
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacac----attagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||           |||| ||||||    
T  52756067 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccaaaccaatacacattaattagccacataagcac-----------atattcatgaa 52756155  T
Q  126 ctatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccca 183  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  52756156 ctatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaataaccca 52756213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40165822 - 40165653
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  40165822 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 40165734  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  40165733 cttgactccaccaataaattactcattatgattgcttggtgggtaaatta-ccattatttttcaaagataatttagaaaaaa 40165653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 30429227 - 30429311
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg 114  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30429227 ggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatcccaattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtg 30429311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52434213 - 52434138
Alignment:
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaa-ttacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52434213 accaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 52434138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48752158 - 48752085
Alignment:
Q  139 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48752158 accaataaattgcacattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaac 48752085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 40688483 - 40688431
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaat 82  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40688483 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaat 40688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 213
Target Start/End: Original strand, 51942544 - 51942588
Alignment:
Q  169 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51942544 tgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 51942588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37741487 - 37741433
Alignment:
Q  160 attgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37741487 attggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 37741433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41609238 - 41609098
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||           |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  41609238 ggtgacaactaatgtacccatggaagaatgacggataatttacctcaaccaatgaacatt-----------cacatttttaggtagtatccatgaactat 41609150  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacc 181  Q
     || || | || || ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  41609149 tttaactccactaataaattgctcattttcattagttggtaggtaaattacc 41609098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 177257 - 177162
Alignment:
Q  116 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| || | |||| ||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  177257 tatccataaagtatcttgatcccaccaataaattactcgttatgattggttggtgactaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 177162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 8847718 - 8847832
Alignment:
Q  101 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||  ||| |  ||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  8847718 cacatttttaagtggtattcgtgaactattttgatcccaccaataaattgttcatttttattagttggtatgtaaattatacactattcttcaaaggtaa 8847817  T
Q  201 tctagaaaaaacctta 216  Q
    | || |||||||||||    
T  8847818 ttta-aaaaaacctta 8847832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Original strand, 41882011 - 41882053
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttac 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  41882011 ggtgacaactagggtacccgtggaagaatggtggataatttac 41882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 52434344 - 52434291
Alignment:
Q  36 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 89  Q
    |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52434344 aactagggtacctatagaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt 52434291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 213
Target Start/End: Original strand, 33550581 - 33550609
Alignment:
Q  185 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550581 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 33550609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 37760386 - 37760346
Alignment:
Q  31 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaattta 71  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37760386 gtgataactagggtacctatggaagaatggtgggtaattta 37760346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 13762 - 13945
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13762 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13861  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13862 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2615
Alignment:
Q  25 ttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 124  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2427 tttttggtgataactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 2526  T
Q  125 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2527 actatcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11317
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11133 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11232  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11233 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctt-aaaggtaatctagaaaaaccctt 11317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1871
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 1952  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1951 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 75244 - 75427
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  75244 ggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaactat 75343  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75344 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 75427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 18854 - 19037
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18854 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 18953  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18954 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 278190 - 278005
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagt--gatatccatgaact 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  278190 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatgaact 278091  T
Q  128 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278090 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 278005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 176836 - 176666
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  176836 ggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaactat 176737  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  176736 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 176666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32712 - 32560
Alignment:
Q  61 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttca 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32712 tgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttca 32613  T
Q  161 ttgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32612 ttggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 4589 - 4781
Alignment:
Q  23 agttttgggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4589 agtttttggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 4688  T
Q  123 gaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtttt 221  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4689 aaactatctttaccccaccaacaaattgttcatttttattagttggtg------ttacccaccattattcaaagttaatctagaaaaaatcttagtttt 4781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3261 - 3089
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3261 ggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 3162  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 211  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||          ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3161 cttgatcccaccaacaaattgctcatttt---------gtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 3089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7089
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  7262 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 7174  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt-cattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 213  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7173 cttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 212
Target Start/End: Original strand, 20476 - 20648
Alignment:
Q  29 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| || ||    
T  20476 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaatta 20564  T
Q  129 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 212  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20565 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 20648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14915 - 14740
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  14915 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtaggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 14827  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14826 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagacaaaacctta 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 98
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  272 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtggg-aatttacctcaaccaattaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 185  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 216  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  184 cttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4729
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||||           ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4554 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 4642  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt-cattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4643 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatctagaaaaaacctt 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3564 - 3389
Alignment:
Q  30 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||||           ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3564 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 3476  T
Q  130 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt-cattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 215  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3475 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatctagaaaaaacctt 3389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18043 - 17900
Alignment:
Q  64 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           ||| || ||| ||||| | | ||| |||||| |||| |||||||    
T  18043 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacgtatt-----------cataaaatattttgactccatcaataaattgatcatattcattg 17955  T
Q  164 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagt 218  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17954 gttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccgtagt 17900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19327 - 19228
Alignment:
Q  106 ttttaagtgatatccatgaac----tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 201  Q
    ||||| ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19327 ttttaggtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaat 19228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University