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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6871A_low_176 (Length: 238)
Name: NF6871A_low_176
Description: NF6871A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6871A_low_176 |
 |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0692 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0395 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0315 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1140 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1404 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0407 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0434 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1753 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0462 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0750 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0051 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0269 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0225 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0808 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0244 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold2147 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0327 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0346 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21652877 - 21652694
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652877 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
21652778 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652777 |
aagaaaacatgttcatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
21652694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 11582564 - 11582743
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582564 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
11582663 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582664 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
11582743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 21392874 - 21393057
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392874 |
gtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
21392973 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392974 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
21393057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1170129 - 1169953
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1170129 |
gactcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
1170030 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1170029 |
catgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
1169953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 20710823 - 20711005
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20710823 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacattcgcattatc |
20710922 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20710923 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20711005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 28258286 - 28258470
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28258286 |
gtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
28258384 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaac-aatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28258385 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaatcatgattatcattaatcaacaaatgtcattca |
28258470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17473360 - 17473181
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17473360 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
17473261 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17473260 |
aaacatgcttatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattca |
17473181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1221319 - 1221143
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1221319 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1221221 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221220 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
1221143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22368072 - 22367896
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22368072 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22367974 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367973 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
22367896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 7424367 - 7424544
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7424367 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
7424464 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7424465 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
7424544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 11341326 - 11341503
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11341326 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
11341423 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11341424 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
11341503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4201554 - 4201380
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4201554 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
4201457 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4201456 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
4201380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21075077 - 21074901
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21075077 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21074979 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21074978 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcgttca |
21074901 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 23513486 - 23513665
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23513486 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattatcaaga |
23513584 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23513585 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtaatcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
23513665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24184681 - 24184505
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24184681 |
gactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
24184582 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24184581 |
catgtccatacacaaccaaatcatggaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
24184505 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25192586 - 25192408
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25192586 |
aaggactcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
25192488 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25192487 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
25192408 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 11044 - 11215
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11044 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
11141 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11142 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
11215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
110572 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
110474 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110473 |
aaacatgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattattaataatcaacaatgtcat |
110397 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
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Target Start/End: Complemental strand, 9732252 - 9732078
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
9732252 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
9732155 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9732154 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
9732078 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 16534999 - 16535174
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16534999 |
gacttgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16535097 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16535098 |
catgcccatatacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16535174 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22884771 - 22884592
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22884771 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
22884673 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
22884672 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
22884592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29192203 - 29192032
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29192203 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
29192106 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29192105 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
29192032 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 24595191 - 24595373
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24595191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24595288 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24595289 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
24595373 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Original strand, 20615305 - 20615476
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20615305 |
gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
20615402 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20615403 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatgtcat |
20615476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43445342 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
43445244 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43445243 |
aaacatgcccatacacaaataa-tcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatg |
43445171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10779767 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatatatgataacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10779669 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779668 |
aaacatgccc--acacaaataaatcataatattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
10779591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21234994 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21234897 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21234896 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
21234820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 48 - 224
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23510676 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
23510774 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23510775 |
aagaaaacatgcccacatgcaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg |
23510849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 56 - 231
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4863961 |
actcaataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4864059 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4864060 |
atgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
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| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
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T |
 |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
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18779485 |
aaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaatcatgattatcgataatcaacaatgtcattca |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 23327643 - 23327818
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23327643 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
23327740 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23327741 |
aaacatgtccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattca |
23327818 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 25425312 - 25425486
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25425409 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25425410 |
aa-catgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
25425486 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35792719 - 35792544
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
35792621 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35792620 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattca |
35792544 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
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Target Start/End: Original strand, 19498490 - 19498659
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaaga |
19498587 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19498588 |
aa-catgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 55 - 228
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37051775 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacgtaattatcaatagtcaacaatgtcat |
37051848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 21649523 - 21649698
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21649523 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21649621 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21649622 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacgatgtcattca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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21933748 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21933651 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21933650 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtca |
21933578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21939918 - 21939748
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21939821 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21939820 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtca |
21939748 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 35580944 - 35581114
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35580944 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
35581041 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35581042 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtca |
35581114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37010752 - 37010582
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
37010655 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcgtcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
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acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
19404367 |
T |
 |
| Q |
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gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19404368 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23453638 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23453737 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23453738 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaaaatcaa |
23453827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
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| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23465143 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23465242 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaaaatcaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
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| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27185203 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27185202 |
catgtctatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11338341 |
gtacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaa-ttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
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T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11338242 |
aagaaaacatgtccatacataatcaaatcataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcattca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |
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|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
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catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
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| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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gataatgcgaca-caatc-acaattttcaacacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcacaacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
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T |
 |
| Q |
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tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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Q |
| |
|
| || ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11213085 |
ccgcacacaattagatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
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Target Start/End: Original strand, 27008705 - 27008882
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| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| |
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|
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 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaa |
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| |
|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 212
Target Start/End: Original strand, 24474367 - 24474443
Alignment:
| Q |
136 |
atttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24474367 |
atttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaa |
24474443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 7727296 - 7727369
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7727296 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaa |
7727369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 3672685 - 3672780
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3672685 |
gactcgataatgcgatatcacatcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaagtatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
3672780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 23492722 - 23492794
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23492722 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattt-cattatcaagaaa |
23492794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32967608 - 32967547
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32967608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
32967547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37189561 - 37189501
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37189561 |
caatataaaggacaacctccaaatatattgatcatttccacaacatttgcatcatcaagaa |
37189501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 24470996 - 24471049
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24470996 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacat |
24471049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Original strand, 431149 - 431221
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
431149 |
aattttcacaacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
431221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 28888649 - 28888709
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28888649 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatatccactacatttgcattatcaagaa |
28888709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1169848 - 1169805
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1169848 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
1169805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5452285 - 5452190
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
5452285 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaacatattgatcatctccagaacaattgcattaccaag |
5452190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17473075 - 17473032
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17473075 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
17473032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43445060 - 43445017
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445060 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
43445017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Original strand, 21615735 - 21615804
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21615735 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
21615804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24226911 - 24226842
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24226911 |
aattttcacgacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacaattgcattatcaag |
24226842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Original strand, 19860967 - 19861025
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19860967 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
19861025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35792456 - 35792419
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35792456 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgt |
35792419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 18431322 - 18431505
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431322 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18431421 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431422 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18431505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18004448 - 18004265
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18004448 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18004349 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18004348 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18004265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25646302 - 25646119
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25646302 |
gtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattttattgattatctccacaacatttgcattatc |
25646203 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25646202 |
aaggaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattca |
25646119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35017152 - 35016973
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35017152 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
35017054 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35017053 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
35016973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15736656 - 15736473
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736656 |
gtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
15736557 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736556 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15736473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 18569280 - 18569458
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18569280 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
18569378 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18569379 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
18569458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27655555 - 27655379
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27655555 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaaga |
27655457 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27655456 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
27655379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 31627134 - 31627310
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627134 |
gactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
31627233 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627234 |
catgtccatacacaaacaaatcatagtattcatcaccacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
31627310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18088182 - 18088004
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18088182 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18088084 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18088083 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18088004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 11214836 - 11215011
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11214836 |
actctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
11214934 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11214935 |
atgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
11215011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 32897419 - 32897595
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32897419 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaattttattgatcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
32897518 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32897519 |
catgcccatacacaaataattcatggtattcatcatcacacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
32897595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16827346 - 16827168
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16827346 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaaga |
16827248 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16827247 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16827168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33316050 - 33315877
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33316050 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
33315952 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33315951 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatccacatgattatcaataatcaaccatgtcat |
33315877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 16230278 - 16230452
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16230278 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
16230375 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16230376 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16230452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 23976263 - 23976439
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23976263 |
aaggactcgataatgcggcaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
23976361 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23976362 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcagcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
23976439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 4989591 - 4989764
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4989591 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
4989689 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4989690 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
4989764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 16105254 - 16105431
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105254 |
gactcgataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16105353 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105354 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16105431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 25174253 - 25174424
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25174253 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
25174350 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25174351 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
25174424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13622589 - 13622405
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13622589 |
gtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13622490 |
T |
 |
| Q |
148 |
aag-aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13622489 |
aagaaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattattactaatcaacaacatcattca |
13622405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17343754 - 17343576
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17343754 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
17343656 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17343655 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
17343576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 16239057 - 16239237
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaa-tccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16239057 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
16239155 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16239156 |
aaaacatgcccacacacaaatagatcatcgtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattca |
16239237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Original strand, 18128981 - 18129129
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18128981 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
18129079 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatg |
204 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18129080 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatg |
18129129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1659182 - 1659003
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1659182 |
aaggactcgataatgtgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1659084 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1659083 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatggtcatcaataatcaacaatgttattca |
1659003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 10487573 - 10487743
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10487573 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10487670 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10487671 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
10487743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16377754 - 16377584
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16377754 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16377657 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16377656 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
16377584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16385078 - 16384908
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16385078 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16384981 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16384980 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
16384908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 23151956 - 23152131
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23151956 |
gactcgataatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatactgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
23152054 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| | | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23152055 |
catgctcattcacaattgaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
23152131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14628079 - 14627902
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
14628079 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
14627982 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14627981 |
aaacatgcccatacacaattacatcataacattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
14627902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Original strand, 15861425 - 15861593
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15861425 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaa |
15861521 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15861522 |
catgctcacacacaaataaatcatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgt |
15861593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 18775907 - 18776080
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18775907 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
18776005 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18776006 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
18776080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19984671 - 19984497
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19984671 |
gactagataattcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19984574 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19984573 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
19984497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13016260 - 13016088
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13016260 |
gtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
13016162 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
13016161 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcatgtcaacatgattctcaa-aatcaacaa |
13016088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 23993858 - 23994034
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23993858 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
23993955 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23993956 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
23994034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16557483 - 16557311
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16557483 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16557386 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16557385 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcat |
16557311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16650713 - 16650541
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16650713 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16650616 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16650615 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcat |
16650541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29870943 - 29870770
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29870943 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
29870846 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29870845 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
29870770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 18397622 - 18397799
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18397622 |
gactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattatattgattatccccacaacattttcattatcaagaaaa |
18397721 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18397722 |
catgtccatacacaatcaattcataatactcatcatcaccacatcaatatgatcatcaatactcaacaatgtcattca |
18397799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Original strand, 26088532 - 26088703
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
26088532 |
gactcgataatgcaacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaag |
26088629 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26088630 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
26088703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18825225 - 18825053
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
18825225 |
actcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattattcatctccacatcatt-gcattatcaagaaa-c |
18825129 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18825128 |
atgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatttcattca |
18825053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18843286 - 18843121
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| || | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18843286 |
actcgataatgcgacgacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattataatgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
18843189 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18843188 |
atgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaaaaatcaacaat |
18843121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 22430944 - 22431119
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22430944 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttaaaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
22431042 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22431043 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattc |
22431119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1651420 - 1651243
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1651420 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
1651323 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1651322 |
aaacatgtccacacacaattatatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
1651243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
Target Start/End: Original strand, 1554536 - 1554703
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554536 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaa |
1554633 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554634 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaat |
1554703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Original strand, 19609191 - 19609310
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19609191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
19609288 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataa |
173 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19609289 |
aaacatgcccatacacaaataa |
19609310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25745763 - 25745624
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| Q |
93 |
aatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
192 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
25745763 |
aataaataggacaacacccaattatattgttcatctacacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatca |
25745664 |
T |
 |
| Q |
193 |
-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25745663 |
ccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
25745624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22227111 - 22226936
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22227111 |
aaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22227013 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22227012 |
aaacatatccacacacaaataaatcaaagtactcatcatcacacgtcaacatatttatcagtaatcaacaatgtcat |
22226936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 16084112 - 16084215
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084112 |
gactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16084211 |
T |
 |
| Q |
155 |
catg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
16084212 |
catg |
16084215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28196255 - 28196147
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
28196255 |
acaaagactcgataatgcgacaacactccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaccaattgcattatcaa |
28196156 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
28196155 |
gaaatcatg |
28196147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Original strand, 22866864 - 22867031
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22866864 |
gactcaataatgcgaaatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaataaattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
22866963 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaaca |
221 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22866964 |
catgtccatacacaatcaaatgataagattcattatcaccacatcaacatgattatcaaaaatcaaca |
22867031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25368827 - 25368728
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25368827 |
gactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
25368728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 15738945 - 15739043
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15738945 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaatttttaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
15739043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Original strand, 18741146 - 18741203
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18741146 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaa |
18741203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16889183 - 16889122
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16889183 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
16889122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 33323532 - 33323605
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33323532 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
33323605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35137399 - 35137326
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35137399 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
35137326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 1554817 - 1554860
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554817 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
1554860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Original strand, 16084882 - 16084953
Alignment:
| Q |
161 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084882 |
catacacaattaaatcgtagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16084953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Original strand, 22846867 - 22846923
Alignment:
| Q |
94 |
atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
22846867 |
atataaaggataacttccaaatatattgattatctccacaacaattgaattatcaag |
22846923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 821646 - 821404
Alignment:
| Q |
4 |
ataataaggctattgaattaccnnnnnnntataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaat---------------ccacaattttca |
88 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
821646 |
ataataaggctattgaattaccaaaaaaagataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaattcataattttcacctccacaattttca |
821547 |
T |
 |
| Q |
89 |
cctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821546 |
cctcaatatatacgacaacatccaattatattgattatcttcacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
821447 |
T |
 |
| Q |
189 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821446 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
821404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 33738948 - 33739131
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33738948 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaaaacatttgcattatc |
33739047 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33739048 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcaccttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
33739131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12901240 - 12901066
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12901240 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12901141 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12901140 |
catgcccatacacaaataattcatagcattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatatcatt |
12901066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 44054612 - 44054788
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054612 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
44054711 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054712 |
catgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
44054788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53909238 - 53909062
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53909238 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
53909139 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53909138 |
catgcccacacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
53909062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53706261 - 53706082
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53706261 |
aaggactcgataatgcaataataatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
53706162 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53706161 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
53706082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 44345510 - 44345694
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44345510 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
44345609 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44345610 |
aagaaatcatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacattaacatgattattaataatcaacaatgtcattca |
44345694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 16521479 - 16521654
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521479 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16521577 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521578 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16521654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 19999215 - 19999391
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19999215 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
19999313 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19999314 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
19999391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45460432 - 45460248
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45460432 |
gtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctctacaacatttgcattatc |
45460333 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45460332 |
aagaaaacatgtccgtacacaattaaatcataagattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
45460248 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7133924 - 7133741
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48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7133924 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
7133825 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7133824 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcgcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
7133741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8873961 - 8873786
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8873961 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaaaatttgcattatcaagaaaa |
8873863 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8873862 |
catgcccatacacaattaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
8873786 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 10642874 - 10643053
Alignment:
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10642972 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10642973 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
10643053 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 18167481 - 18167656
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18167481 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18167578 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18167579 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18167656 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15288479 - 15288302
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15288479 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15288382 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15288381 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattca |
15288302 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21961036 - 21960862
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21961036 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcttgattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21960937 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21960936 |
catgctcatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
21960862 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 110171 - 110346
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110171 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
110269 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110270 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
110346 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 10487358 - 10487532
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10487358 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
10487455 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10487456 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
10487532 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15274226 - 15274052
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
15274226 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
15274129 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15274128 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15274052 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 9294212 - 9294389
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9294212 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaaga |
9294309 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9294310 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
9294389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22356033 - 22355856
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22356033 |
aaggactcgataatgcgacaacagttcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattggttatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22355936 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22355935 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaatattcaacaatgtcattca |
22355856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16329393 - 16329219
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16329393 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16329296 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16329295 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
16329219 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26338173 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
26338270 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26338271 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattca |
26338348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13245139 |
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13245236 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13245237 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaaatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattca |
13245316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
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| T |
15295589 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattctcaaga |
15295492 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15295491 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacctatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattca |
15295412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
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54119634 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
54119633 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgat |
54119579 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
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18246978 |
T |
 |
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156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
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| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
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|
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47356013 |
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47356111 |
T |
 |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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Q |
| |
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|||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
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| T |
47356112 |
aaacattcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
47356192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 14950707 - 14950884
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14950707 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaatatt-gcattatcaaga |
14950804 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || || ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14950805 |
aaacatgcccacacaaaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
14950884 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Original strand, 8373042 - 8373219
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| Q |
53 |
aggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373042 |
aggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagag |
8373140 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373141 |
aacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaccgcaacatgattatcaataaccaacaatgtcattca |
8373219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 14994888 - 14995061
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14994888 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatatagattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
14994986 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14994987 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
14995061 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25120589 - 25120414
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25120589 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
25120491 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25120490 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcgtcaatgtcattca |
25120414 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30233998 - 30233835
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| Q |
69 |
acaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgca |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
30233998 |
acaacaatccacaattttcacctcgatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacaca |
30233899 |
T |
 |
| Q |
169 |
aataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
| || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30233898 |
atcaaattataagattcatcatcaccacatcaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
30233835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 34393744 - 34393920
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34393744 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
34393842 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34393843 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
34393920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5684370 - 5684194
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5684370 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttgtccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5684272 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5684271 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
5684194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18495880 - 18495698
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495880 |
acaaagactcgataatgcgacatctttccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatcttcacaacatttgcattatcaa |
18495781 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495780 |
gaaaacatgtccatacccaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
18495698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 15212032 - 15212208
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212032 |
gactcgataatgcgacaacaatt-acaattttatccacaatatataggacaacatccgattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
15212130 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212131 |
catgcccacacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
15212208 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13049630 - 13049455
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13049630 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13049533 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13049532 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattca |
13049455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 26678732 - 26678896
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat-------- |
26678821 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| | | |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26678822 |
--acatgcccatacacaatttaatcatgatattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatgtcat |
26678896 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 13811103 - 13810995
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13811103 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgattatttccacaacaattccattatcaa |
13811004 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
13811003 |
gaaatcatg |
13810995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23271342 - 23271222
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| Q |
104 |
caacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacat |
203 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
23271342 |
caacattcaattatattaattatcttcacaacatt-gcattaacaagaaaacatgcccacacacaaataaatcgtagtattcatcatcgcacaacaacat |
23271244 |
T |
 |
| Q |
204 |
gattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23271243 |
gattatcaataatcaacaatgt |
23271222 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #42
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgat |
123 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13751769 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattgat |
13751694 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43282855 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
43282757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52266938 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggataacttccaaatatattgatcatctctacaacaattgcattatcaagaaa |
52266840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
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| Q |
105 |
aacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatg |
204 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18294580 |
aacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcac-----cacatg |
18294486 |
T |
 |
| Q |
205 |
attatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18294485 |
atcatcaataatcaacaatgttattca |
18294459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15852769 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
15852696 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #47
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128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
8044021 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacctcaacatgatcataaacaatcaacaatgtt |
8044120 |
T |
 |
| Q |
227 |
attca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
8044121 |
attca |
8044125 |
T |
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Target: chr4; HSP #48
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145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15043631 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15043721 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15110793 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15110703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 27959759 - 27959820
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27959759 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccactacgtttgcattatcaagaaa |
27959820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34197605 - 34197544
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34197605 |
caatataaaggacaacttccaaatatattggtcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
34197544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5684088 - 5684045
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5684088 |
catcacacataaaaatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
5684045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 8373431 - 8373474
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373431 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
8373474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18294354 - 18294311
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18294354 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18294311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 19019390 - 19019433
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19019390 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
19019433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 34394020 - 34394070
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34394020 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
34394070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Original strand, 47356297 - 47356339
Alignment:
| Q |
189 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47356297 |
atcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
47356339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37958489 - 37958436
Alignment:
| Q |
100 |
aggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37958489 |
aggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
37958436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41167375 - 41167314
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41167375 |
caatataaatgacaactttcaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
41167314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18110038 - 18110001
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18110038 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgt |
18110001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41257797 - 41257728
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41257797 |
aattttcacaacaatataaaggataacttccaattatattgatcatctcaaccacaattgcattatcaag |
41257728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22407676 - 22407493
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407676 |
gtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
22407577 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407576 |
aagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
22407493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 49966331 - 49966514
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966331 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
49966430 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966431 |
aagaaaacatgtccataaacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
49966514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2422445 - 2422269
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422445 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
2422346 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2422345 |
catgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcgacaatgtcattca |
2422269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 41210732 - 41210911
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41210732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
41210831 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41210832 |
aaacatggccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
41210911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 18506043 - 18506221
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18506043 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccgcaacattagcattatcaaga |
18506142 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| |||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18506143 |
aaa-atgcccacacacaagtaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18506221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35523894 - 35523723
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35523894 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35523795 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35523794 |
catgtccatacgcaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
35523723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20895169 - 20894989
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20895169 |
aaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
20895071 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20895070 |
aaacatgcccacacacaattaaataatagtattcatcatcacacatcaacatgattttcaataatcaacaatatcattcaca |
20894989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20826696 - 20826522
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
20826696 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
20826599 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20826598 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20826522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44036373 - 44036198
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036373 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatgtataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
44036275 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036274 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
44036198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15862908 - 15862731
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15862908 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgaatatctccacaacatt-gcattatcaagg |
15862811 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862810 |
aaacatgcccacacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15862731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 22034535 - 22034710
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22034535 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22034632 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22034633 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattca |
22034710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22250430 - 22250251
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22250430 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggactacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
22250332 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22250331 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
22250251 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37845939 - 37845764
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37845939 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37845841 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37845840 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
37845764 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 21858246 - 21858421
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858246 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21858344 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858345 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
21858421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 22352814 - 22352993
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22352814 |
aaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22352912 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22352913 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcattacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
22352993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 22365441 - 22365620
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22365441 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22365539 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22365540 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagcattcatcattatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
22365620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 17147468 - 17147645
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17147468 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
17147565 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17147566 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattca |
17147645 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7642068 - 7641893
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
7642068 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatgatctccacaacatt-gtattatcaaga |
7641971 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7641970 |
aaacatacccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
7641893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21651412 - 21651238
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21651412 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21651315 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21651314 |
caacatgcccatgcacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
21651238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 231
Target Start/End: Original strand, 20444442 - 20444611
Alignment:
| Q |
61 |
ataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgct |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20444442 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20444540 |
T |
 |
| Q |
161 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20444541 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20444611 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 231
Target Start/End: Original strand, 20530207 - 20530376
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| Q |
61 |
ataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgct |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530207 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20530305 |
T |
 |
| Q |
161 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530306 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20530376 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 22226667 - 22226848
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| Q |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22226667 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22226765 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22226766 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
22226848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5676074 - 5675899
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5676074 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5675976 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5675975 |
catgtctatatacaatcaattcatagtatccaccttcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
5675899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18061085 - 18060907
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
18061085 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggactacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattaccaagg |
18060988 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18060987 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
18060907 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 51451299 - 51451473
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51451299 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
51451396 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51451397 |
gaacatgcccataaacaattaaatcatagcattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
51451473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21716895 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgctcatctccacaacatttgcattatcaaaaaaa |
21716994 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21716995 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacatatcaacatgattatc---aatcaacaatgtcattca |
21717068 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35053532 |
gactcaataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35053630 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35053631 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
35053705 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41218143 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacattatttgcattatcaagaaaa |
41218241 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41218242 |
catgctcatacacaattaaatcatagaattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17003511 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
17003608 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17003609 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagaattcatcatcccacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
17003681 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| || ||| |||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
20526808 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaactttctccacaatatataggacaccacccagttatattgttcatctccacatgatttacattatcaagaaga |
20526906 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20526907 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20526983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 45050370 - 45050547
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
45050370 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
45050467 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45050468 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
45050547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Original strand, 20930163 - 20930327
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20930163 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20930261 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20930262 |
catgctcatacacaattaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaa |
20930327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 22029383 - 22029559
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22029383 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
22029480 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22029481 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaatagtcaacaatgtcattca |
22029559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9785707 - 9785551
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9785707 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgttcctctccacatcatttgcattatcaagaaag |
9785609 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9785608 |
catgcacatacacaattaaatcatagtattcatcatcgcacatcaacatgattatcaa |
9785551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 41393138 - 41393315
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41393138 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcagtatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
41393235 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41393236 |
aaacatgtctacacacagttacatcatagcattcatcatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattca |
41393315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18602518 - 18602341
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18602518 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
18602421 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18602420 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaatatctttcaca |
18602341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5073775 - 5073598
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5073775 |
gactcgataatgcgacaccaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
5073678 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5073677 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaatatctttcaca |
5073598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20122098 - 20121965
Alignment:
| Q |
90 |
ctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20122098 |
ctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcctca |
20122000 |
T |
 |
| Q |
190 |
tcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20121999 |
tcacaccaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
20121965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51657805 - 51657612
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51657805 |
gtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
51657706 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||| || ||||| | ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51657705 |
atgaaatcatgtccatacacaatcaaatcataattcaattaagattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
51657612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38035070 - 38034997
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38035070 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
38034997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22836723 - 22836628
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22836723 |
gactcgataatgcgacatcacctcataattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatttccacaacaattgcattaccaag |
22836628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
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Target Start/End: Original strand, 27673543 - 27673641
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27673543 |
gactcgataatgcgacaccacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaaaacaattgtattatcaagaaa |
27673641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36357786 - 36357713
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36357786 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
36357713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22031078 - 22031014
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| Q |
167 |
caaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22031078 |
caaataaatcatagtattcctcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattca |
22031014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20956416 - 20956341
Alignment:
| Q |
78 |
cacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20956416 |
cacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
20956341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 19601911 - 19601972
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19601911 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatgatctccacaacatttgcattgtcaagaaa |
19601972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 20253246 - 20253289
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20253246 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20253289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37235405 - 37235336
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37235405 |
aattttcacaacaatttaaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
37235336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 22353097 - 22353140
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22353097 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatatcattca |
22353140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5471816 - 5471758
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5471816 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcacctccaccacaattgcattatcaag |
5471758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8539396 - 8539328
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8539396 |
aattttcacgacaatataaatgataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
8539328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8604635 - 8604567
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8604635 |
aattttcacgacaatataaatgataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
8604567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13867552 - 13867375
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13867552 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacttcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13867453 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13867452 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
13867375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 44863930 - 44864112
Alignment:
| Q |
49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44863930 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacagcatttgcattatca |
44864029 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44864030 |
agaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattagcatgattatcaatgatcaacaatgtcattca |
44864112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45453728 - 45453551
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcc-aattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45453728 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacttcccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
45453629 |
T |
 |
| Q |
154 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45453628 |
acatgcccatacacaaataattcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
45453551 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 7291540 - 7291722
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291540 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
7291638 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291639 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
7291722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12545190 - 12545007
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12545190 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttccattatc |
12545091 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12545090 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
12545007 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 47288461 - 47288644
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288461 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
47288560 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288561 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
47288644 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 369580 - 369751
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
369580 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
369679 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
369680 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
369751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26071743 - 26071561
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26071743 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
26071644 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26071643 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
26071561 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26095530 - 26095348
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26095530 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
26095431 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26095430 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
26095348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15952563 - 15952391
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15952563 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
15952465 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15952464 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15952391 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15823888 - 15823707
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15823888 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaattaacaatcttcacctcaatataaaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
15823789 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatag----tattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15823788 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtatatattcaccatcacatattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
15823707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18981379 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18981282 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18981281 |
aaacatgcccacatacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18981202 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
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Target Start/End: Original strand, 142313 - 142497
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
142313 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
142412 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
142413 |
aagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacataatcatcaataatcaacaatgttattca |
142497 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2192169 - 2191991
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2192169 |
aaggactcgataatgcgacagcaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaaga |
2192071 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2192070 |
aaacatgcccatacaaaaataaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattca |
2191991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 2027250 - 2027424
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2027250 |
gactcgataatgcgacaacaatcacaaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2027349 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
229 |
Q |
| |
|
|| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2027350 |
cacgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcatt |
2027424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3058741 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
3058839 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
3058840 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtatcattca |
3058916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15443031 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15442934 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15442933 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
15442857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 16417162 - 16417333
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16417162 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
16417259 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16417260 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16417333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13757270 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
13757367 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13757368 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
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52 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16210471 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
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T |
 |
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152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16210569 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccaacacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13038576 - 13038401
Alignment:
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54 |
ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13038576 |
ggactcaataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccgattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaa |
13038479 |
T |
 |
| Q |
154 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13038478 |
acatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
13038401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32496025 - 32495849
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32496025 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32495927 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32495926 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
32495849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 112767 - 112592
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
112767 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacatcacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
112669 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
112668 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtgtcattca |
112592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11582311 - 11582137
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582311 |
gactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaaa |
11582214 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582213 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
11582137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 11285904 - 11286082
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11285904 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggagaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
11286003 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccat--cacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11286004 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
11286082 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 36051355 - 36051532
Alignment:
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
36051355 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattattaagt |
36051452 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36051453 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattttcaataatcaacaatgtcattca |
36051532 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13912582 - 13912411
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
13912582 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
13912485 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13912484 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacatttcaacataattatcaataatcaacaatgtcat |
13912411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15525957 - 15525778
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15525957 |
aaggactcgataatgcgacaacgattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15525859 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15525858 |
aaacatgcacacacacaaatagatcatagtattcatcattcacataataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
15525778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27103019 - 27102849
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27103019 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
27102922 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27102921 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
27102849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27110367 - 27110197
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27110367 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
27110270 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27110269 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
27110197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 27175307 - 27175477
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27175307 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
27175404 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27175405 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
27175477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38785111 - 38784941
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38785111 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
38785014 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38785013 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
38784941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16480408 - 16480231
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16480408 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
16480311 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16480310 |
aaacatgcccatatacaattacatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16480231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42057632 - 42057456
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
42057632 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
42057535 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42057534 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
42057456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1938240 - 1938066
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1938240 |
gactcgataatgcgacaacaattca--attttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
1938143 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1938142 |
catgctcattcataattaaatcataatattcatcattacacatcaacattattatcaataatcaacaatgtcattca |
1938066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 125520 - 125695
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
125520 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
125618 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
125619 |
catgcccattcacgattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
125695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 7821615 - 7821785
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7821615 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7821712 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7821713 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtca |
7821785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7828926 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7829023 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7829024 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
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| |
|
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| T |
12753575 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattt-caccacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12753673 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12753674 |
catgtccatacacaaacaaattatagtactcatctccacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattca |
12753750 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12249584 - 12249407
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
12249584 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaactaccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12249485 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12249484 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
12249407 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 15926058 - 15926233
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15926058 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
15926155 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15926156 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15926233 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 11514816 - 11514986
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
11514816 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaa |
11514913 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11514914 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtca |
11514986 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30263593 - 30263423
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
30263593 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaa |
30263496 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30263495 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtca |
30263423 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
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Target Start/End: Complemental strand, 26010663 - 26010486
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26010663 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
26010566 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || || || ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26010565 |
aaacatgtccacacacagttacatcaaagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatccacaatgtcattca |
26010486 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
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Target Start/End: Original strand, 3893789 - 3893962
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
3893789 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatatatgacaacacccatttatattgttcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
3893887 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3893888 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
3893962 |
T |
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Target: chr7; HSP #46
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Target Start/End: Complemental strand, 15761839 - 15761672
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761839 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcctcatcatttgcattatcaagaaaa |
15761742 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761741 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaat |
15761672 |
T |
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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18255295 - 18255115
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatccccacaaca-ttacattatcaagc |
18255197 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| | |||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
18255196 |
aaaacatgcccacatacaaatagattatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagacattca |
18255115 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 13571525 - 13571700
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13571525 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataagacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13571622 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13571623 |
catgcccaaacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattca |
13571700 |
T |
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Target: chr7; HSP #49
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Target Start/End: Original strand, 2436315 - 2436456
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2436315 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
2436413 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca |
194 |
Q |
| |
|
||| ||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2436414 |
aaaaatgtccacacacaattaattcatagtattcatcatcaca |
2436456 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 25293747 - 25293608
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25293747 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
25293650 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25293649 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaca |
25293608 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 16571568 - 16571384
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| Q |
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16571568 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16571469 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16571468 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
16571384 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16594094 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16594193 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16594194 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
16594278 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 10988303 - 10988479
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10988303 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaag- |
10988399 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
10988400 |
gaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaccaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattc |
10988479 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
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149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13273431 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaactttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
13273530 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
13273531 |
gaaatcatg |
13273539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
15629459 |
acaaagactcgataatgcgacgtcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatttccacaacaattgtattatcaa |
15629558 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
15629559 |
gaaatcatg |
15629567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
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Target Start/End: Complemental strand, 39048042 - 39047986
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39048042 |
tcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgccattca |
39047986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 50 - 158
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49049277 |
acaaagactcgataatgcgacatcaactcacaatttccaccacaatataaaggacaactttcaaatatgttgatcatctccaccacaattgcattatcaa |
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T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
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gaaatcatg |
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T |
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Target: chr7; HSP #58
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81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9058076 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
9058007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10862326 - 10862231
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccac-aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10862326 |
actcgataatgcgacatcacctcacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatacattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
10862231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15761558 - 15761515
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761558 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15761515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15913874 - 15913817
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15913874 |
caatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
15913817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 15851163 - 15851195
Alignment:
| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15851163 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15851195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 153
Target Start/End: Original strand, 13376423 - 13376461
Alignment:
| Q |
115 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376423 |
tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
13376461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2191884 - 2191847
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2191884 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgt |
2191847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Original strand, 15629613 - 15629650
Alignment:
| Q |
194 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15629613 |
acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
15629650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24718887 - 24718708
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24718887 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
24718788 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24718787 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
24718708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 25121227 - 25121410
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25121227 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
25121326 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25121327 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacataattatcaataatcaacaaggtcattca |
25121410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6775701 - 6775523
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6775701 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
6775603 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6775602 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
6775523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 41245348 - 41245531
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41245348 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggactactcccaattatattgattatctccataacatttgcattatc |
41245447 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41245448 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcttcttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
41245531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19994626 - 19994442
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19994626 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactatattgattatctccatttcatttacattatc |
19994527 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19994526 |
aagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
19994442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3433044 - 3432867
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3433044 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
3432947 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3432946 |
aaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
3432867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22908956 - 22908776
Alignment:
| Q |
49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22908956 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatca |
22908858 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22908857 |
agaaaacatgcccata--caaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
22908776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43375051 - 43374874
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43375051 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
43374954 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43374953 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
43374874 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 224631 - 224452
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
224631 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
224533 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
224532 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
224452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 701044 - 700865
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
701044 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
700946 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
700945 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
700865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 738254 - 738075
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
738254 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
738156 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
738155 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
738075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 862149 - 861970
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
862149 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
862051 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
862050 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
861970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20648906 - 20648733
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20648906 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatatagaacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
20648807 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||| | ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20648806 |
catacccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcat |
20648733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 5236883 - 5237057
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5236883 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
5236980 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5236981 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
5237057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13664105 - 13663927
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13664105 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13664007 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13664006 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
13663927 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
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Target Start/End: Complemental strand, 13723380 - 13723202
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| Q |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13723380 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13723282 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13723281 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
13723202 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
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48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22322909 |
gtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatt |
22322811 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatc-aacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
22322810 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcacatcaacatgattatcaataatcaaaaaatgtcattca |
22322726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24662715 - 24662541
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24662715 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24662618 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24662617 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
24662541 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 43684342 - 43684516
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43684342 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
43684439 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43684440 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
43684516 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16874407 - 16874230
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16874407 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
16874310 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16874309 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattca |
16874230 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target Start/End: Complemental strand, 20655491 - 20655318
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20655491 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
20655392 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
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|
|
| T |
20655391 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcat |
20655318 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24930582 - 24930405
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
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| T |
24930582 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
24930483 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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|||| | ||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24930482 |
catgtccctacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
24930405 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24387175 - 24387000
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24387175 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaagaaaa |
24387077 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24387076 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
24387000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 16416945 - 16417128
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16416945 |
gtacaaagactcgataatgtgacaattatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
16417044 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
16417045 |
aagaaaacatgtccacgcacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaatactcaacaatgttattc |
16417128 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
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Target Start/End: Complemental strand, 22089911 - 22089739
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22089911 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22089814 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22089813 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcat |
22089739 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
272671 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
272574 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
272573 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
272501 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 52 - 227
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
643178 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
643275 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
643276 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
643348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
828984 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
829081 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
829082 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
829154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24108050 |
actcgataatgcgacaaca--ccacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
24107954 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24107953 |
atgcccgtacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
24107878 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15320527 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15320430 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15320429 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcat |
15320355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15500896 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15500799 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15500798 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcat |
15500724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20568734 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20568635 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20568634 |
catgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
20568557 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20574927 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20574828 |
T |
 |
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155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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Q |
| |
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|||| ||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
20574827 |
catgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
20574750 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 37610059 - 37610235
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37610059 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37610157 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37610158 |
tatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
37610235 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
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Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29758984 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatgttgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
29759082 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29759083 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
29759159 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16195202 - 16195028
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| Q |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195202 |
ctcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaaca |
16195104 |
T |
 |
| Q |
157 |
tgctcatacgcaa-ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16195103 |
tgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaatatgattatcaataatcaataatgtcattca |
16195028 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270429 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
270527 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
270528 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
270585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
645491 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcaacatcatttgcattatcaagaaaa |
645393 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
645335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
831226 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
831128 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
831127 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
831070 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22007948 |
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22007850 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22007849 |
aaacattcccatacacaattaaatcatagaattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaa |
22007788 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 24547909 - 24548086
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24547909 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
24548006 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24548007 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
24548086 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 21696253 - 21696430
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21696253 |
gactcgataatgcaacatcaatccacagtattcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
21696352 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || ||||| ||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21696353 |
tatgcccatacacaaacaaatcataagattcattatcgcaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
21696430 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 21679889 - 21680071
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679889 |
acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagatgacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
21679988 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679989 |
gagaacatgtccatacacaatgaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
21680071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16675791 - 16675614
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16675791 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
16675694 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16675693 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaatatctttcaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17730936 |
acaaagactcgataatgcgacatcaccccacaattttc-ccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattaacaa |
17730838 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17730837 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
17730755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28543628 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattatcaccacaatatagaggacaacttccacatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
28543727 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| || ||||| || ||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28543728 |
catgttcatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
28543802 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21853361 |
gactcgataatgcgacagcaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
21853264 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
21853263 |
catgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaacaaattgattatcaacaatcaataacatcattcaca |
21853185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 28836353 - 28836459
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attatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaaca |
221 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28836353 |
attatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaaca |
28836449 |
T |
 |
| Q |
222 |
atgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
28836450 |
atgtcattca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20480365 |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20480463 |
catgtctatacacaattaaatcataacattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
20480537 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
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| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37605685 |
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 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
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| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
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21845858 |
catgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaacaaattgattatcaacaatcaataacatcattcaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16203804 - 16203739
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattg |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16203804 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg |
16203739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16040748 - 16040651
Alignment:
| Q |
135 |
catttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16040748 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
16040651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16042424 - 16042327
Alignment:
| Q |
135 |
catttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16042424 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
16042327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39448271 - 39448198
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39448271 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
39448198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Original strand, 38532336 - 38532439
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
38532336 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttctaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattatattatcaa |
38532435 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
38532436 |
gaaa |
38532439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21199608 - 21199547
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21199608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
21199547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31195719 - 31195658
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31195719 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccgcaacatttgcattatcaagaaa |
31195658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 224348 - 224305
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
224348 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
224305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 700761 - 700718
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
700761 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
700718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 737971 - 737928
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
737971 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
737928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 861866 - 861823
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
861866 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
861823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17151335 - 17151292
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17151335 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
17151292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 18618138 - 18618181
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18618138 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18618181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Original strand, 23148624 - 23148682
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23148624 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaag |
23148682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21192181 - 21192120
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21192181 |
caatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgtattatcaagaaa |
21192120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13663823 - 13663780
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13663823 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13663780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13722358 - 13722315
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722358 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13722315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13722506 - 13722463
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722506 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13722463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13722654 - 13722611
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722654 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13722611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13722802 - 13722759
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722802 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13722759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13722950 - 13722907
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722950 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13722907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13723098 - 13723055
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13723098 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattca |
13723055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22737349 - 22737250
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaa-tccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || || |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22737349 |
gactcgataatgtgacatcacctcaacaattttcaccaccatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaccacaaatgcattaccaagaaa |
22737250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Original strand, 23835950 - 23836008
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23835950 |
caatataaaggaaaacttccaaatatattgatcatttcctcaacaattgcattatcaag |
23836008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Original strand, 38532490 - 38532527
Alignment:
| Q |
194 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38532490 |
acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
38532527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6148315 - 6148133
Alignment:
| Q |
49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6148315 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatgtaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttacattatca |
6148216 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6148215 |
agaaaacaagcccatacacaaataaatcatagtattcaccattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
6148133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 13816200 - 13816379
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13816200 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
13816299 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13816300 |
aaacatgcccacacacaattgaatcatagcattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
13816379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19572242 - 19572063
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19572242 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
19572143 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| | | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19572142 |
aaacatggccacacacaattgaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
19572063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16183489 - 16183301
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaat----atataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16183489 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttacacctcaatcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcat |
16183390 |
T |
 |
| Q |
144 |
tatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16183389 |
tgtcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16183301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15860617 - 15860442
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15860617 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15860519 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15860518 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtatttatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
15860442 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 8630538 - 8630713
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8630538 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaga |
8630636 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8630637 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaaagtcattca |
8630713 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16819597 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16819694 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
16819772 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 17099397 - 17099581
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48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
17099496 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || | ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17099497 |
aagaaaacatgtccataaacaatcaaattataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
17099581 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 18909378 - 18909553
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18909378 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18909475 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18909476 |
aaacatccacacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18909553 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22145740 |
gactcgataatgcgataacaatccacaattttcacctcaatatataggaca-cacccaattatattgattatctccacaac-tttgcattatcaagaaaa |
22145643 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22145642 |
catgcccctacaccattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
22145566 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 27839394 - 27839575
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27839394 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
27839492 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
27839493 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacattaacatgatcatcaacaatcaacattatcattcaca |
27839575 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 50113602 - 50113424
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113602 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattt-cacctcaatatataggacaaca----attatattgattacctccacaacatttgcattatc |
50113508 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113507 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcactcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
50113424 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8269870 - 8269695
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8269870 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8269773 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8269772 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
8269695 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8276981 - 8276806
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8276981 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8276884 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8276883 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
8276806 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17957704 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17957703 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273737 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
22273834 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273835 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
22273908 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33340534 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
33340632 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33340633 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
33340709 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35122377 |
gactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35122476 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35122477 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattgtcaataatcaacaatgtcattca |
35122553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
53769350 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
53769447 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53769448 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
53769524 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057531 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacaacatttgcattatc |
25057629 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057630 |
aagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcat |
25057710 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
49230901 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
49230999 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
49231000 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
49231080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51159945 |
gactcgataatgcgacaccaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
51159847 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51159846 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
51159770 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
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|
|
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318983 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
318982 |
catgcccatacacgattaaatcataacattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
318905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 2048751 - 2048927
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048751 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2048849 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048850 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
2048927 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2450791 - 2450621
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2450791 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
2450694 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2450693 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattc-ccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
2450621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 7852499 - 7852674
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7852499 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttacattatcaagaaaa |
7852597 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7852598 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcctcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatgtcattca |
7852674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 19230751 - 19230926
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19230751 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19230849 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19230850 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcattatcacacatcaacataattatcaataatcaacaacgtcattca |
19230926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 30152023 - 30152195
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30152023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
30152120 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30152121 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatattaatcaataatcaacaatgtcat |
30152195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1469121 - 1468951
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1469121 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1469024 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1469023 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
1468951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 16259732 - 16259907
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16259732 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16259830 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16259831 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgataatcaataatcaacaacatcattca |
16259907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17913717 - 17913543
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17913717 |
gactagataatgcgaca-caatc-acaattgtcaacacaatatataggacgacatccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
17913620 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17913619 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgcttatcaataatcaacaatgccattca |
17913543 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 14294114 - 14294296
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14294114 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14294213 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14294214 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
14294296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16745639 - 16745471
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16745639 |
aaggactcgataatgcgacaaccatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16745542 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa |
222 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16745541 |
aaacatgcccaaacacaattaaatcatagtattcaccaacacacttcaacatgattaacaataatcaacaa |
16745471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 30205137 - 30205274
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30205137 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattatattgattatctccacaac-tttgctttatc |
30205235 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30205236 |
aagaaaacatgcacatacacaattaattcatagtattca |
30205274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14522775 - 14522598
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14522775 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14522676 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14522675 |
catgcccatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
14522598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 19945317 - 19945493
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19945317 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19945415 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19945416 |
catgctcatacacaattaaatcatatcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
19945493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15469931 - 15469760
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
15469931 |
actcgataatgcgacaataatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaggaa-c |
15469836 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15469835 |
atgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
15469760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
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50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11199045 |
acaaagacttgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
11198946 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11198945 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
11198863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 14299741 - 14299923
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299741 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14299840 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299841 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
14299923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 14297188 - 14297365
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14297188 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14297287 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14297288 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
14297365 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 14302815 - 14302992
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14302815 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14302915 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
14302992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 44228115 - 44228293
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
44228115 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
44228212 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | | ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44228213 |
aaacatgcccatacacgattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
44228293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53899989 - 53899814
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53899989 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
53899890 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
53899889 |
catgtccatatacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatatcattca |
53899814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 15574730 - 15574907
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15574730 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
15574827 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15574828 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
15574907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 231
Target Start/End: Original strand, 23491202 - 23491372
Alignment:
| Q |
60 |
gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23491202 |
gataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
23491300 |
T |
 |
| Q |
160 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23491301 |
ccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacgtgattatcaataatcaacgatgtcattca |
23491372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12265960 - 12265785
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
12265960 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
12265862 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12265861 |
aaacatgtccacagacaaataaatcatagtatttatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
12265785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 15613749 - 15613926
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15613749 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattaatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
15613846 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15613847 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
15613926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11062504 - 11062328
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11062504 |
gactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa-aaaa |
11062406 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11062405 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
11062328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 10737247 - 10737386
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10737247 |
gactcgataatgcgacaacaata-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattgtattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
10737345 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac |
195 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10737346 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatgacac |
10737386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12351312 - 12351137
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12351312 |
gactcgataattcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12351214 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
|||| | || ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12351213 |
catgtccgcacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacaacaacatgatcatcaataatcaacaatgttattc |
12351137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17523884 - 17523703
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17523884 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatgtgcattatc |
17523785 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17523784 |
aagaaatcatgtccatacacaattaattcatactactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaataatgtcattca |
17523703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 45859709 - 45859886
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45859709 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacatccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
45859806 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
45859807 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattcaca |
45859886 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 55315085 - 55315262
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
55315085 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
55315182 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
55315183 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaatatctttcaca |
55315262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14846131 - 14846034
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14846131 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
14846034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 40938421 - 40938598
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40938421 |
gactcgataatgcgacaccaatttacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaaa |
40938520 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40938521 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacttgatcatcaacaatcaacaatgtcattca |
40938598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Original strand, 5227406 - 5227575
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5227406 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5227504 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | | | ||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5227505 |
catgctcatatacaattca---aatgtattcatcattacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
5227575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47786314 - 47786175
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47786314 |
caatatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacattttcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatc |
47786215 |
T |
 |
| Q |
192 |
acacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47786214 |
acacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattca |
47786175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
150 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15939930 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatgtatatgacaacacccaattatattgattatccccataaca-ttgaattatcaagc |
15939832 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15939831 |
aaaacatgcccacatacaaatagatcatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagtcattca |
15939750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8305790 - 8305693
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8305790 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
8305693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12562944 - 12562769
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58 |
tcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaaca |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562944 |
tcgataatgcgacaacacttcacaaattttcaccacaatatagaggaaaaattccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaaaca |
12562845 |
T |
 |
| Q |
157 |
tgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562844 |
tgtccgtacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
12562769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16935286 - 16935176
Alignment:
| Q |
115 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaata |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16935286 |
tatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaata |
16935190 |
T |
 |
| Q |
215 |
atcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
16935189 |
atcaacaatgtcat |
16935176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 41268931 - 41269108
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | |||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
41268931 |
gactcgataatgcgacaacatttctcaatct-caactcaatacataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagagaa |
41269028 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca-ttaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||| | || || || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
41269029 |
catacccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacagacaacttgattatcaacaatcaacaatatctttcaca |
41269108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18905267 - 18905171
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18905267 |
aaggactcaataatgcgaaaacaatc-acaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
18905171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13977101 - 13976964
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13977101 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13977004 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
192 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13977003 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca |
13976964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13956269 - 13956132
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13956269 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattattttgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13956172 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
192 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13956171 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca |
13956132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 151
Target Start/End: Original strand, 17138157 - 17138253
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
17138157 |
gactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaactatattgatcatctccacaacaattgaattatcaaga |
17138253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12031364 - 12031275
Alignment:
| Q |
143 |
ttatcaagaaaacatgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| | ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12031364 |
ttatcaagaaaacacgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaataatgtcattca |
12031275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 147
Target Start/End: Original strand, 12951743 - 12951835
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12951743 |
gactcgataatgcgacatcatctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
12951835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 15874893 - 15874953
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15874893 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaa |
15874953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11330442 - 11330382
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330442 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaa |
11330382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 15516426 - 15516521
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15516426 |
gacttgataatgcgacatcaactcaaaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
15516521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 38812436 - 38812367
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38812436 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
38812367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12490177 - 12490105
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12490177 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacattttcattatcaagaaa |
12490105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 14287780 - 14287828
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatata |
98 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14287780 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatata |
14287828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 39654607 - 39654695
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39654607 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcat |
39654695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9303802 - 9303759
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9303802 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
9303759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11883735 - 11883645
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11883735 |
gactcgataatgcgacatcacctcacactttccacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacattagcatta |
11883645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 11813553 - 11813586
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
85 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11813553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
11813586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Original strand, 17937333 - 17937363
Alignment:
| Q |
201 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17937333 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattca |
17937363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14060675 - 14060614
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14060675 |
caatataaaggacaacttcaaactatattgatcatccccacaatatttgcattatcaagaaa |
14060614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
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Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16260014 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgt |
16260051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18898045 - 18897992
Alignment:
| Q |
175 |
tcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18898045 |
tcatagtattcatcatcccacatcaacgtatttatcaataatcaacaatgtcat |
18897992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 55442218 - 55442145
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacat-ccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
55442218 |
caattttcacaacaatataaaggacatctttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattattaagaa |
55442145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 47786339 - 47786311
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
83 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47786339 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
47786311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 8125 - 8301
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8125 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8224 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8225 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
8301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 6232 - 6415
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6232 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
6331 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6332 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
6415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0692 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:
Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 688
Alignment:
| Q |
58 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
861 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatttgcattatcaagaaatcat |
762 |
T |
 |
| Q |
158 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
761 |
gcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatttacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15338 - 15158
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15338 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
15240 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15239 |
aagaaaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
15158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 256384 - 256201
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
256384 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacattt-cattatc |
256286 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
256285 |
aagaaaacatgctcatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattca |
256201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262807
Alignment:
| Q |
63 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
262975 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgctca |
262877 |
T |
 |
| Q |
163 |
tacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
262876 |
tacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattca |
262807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 124762 - 124585
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
124762 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
124665 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
124664 |
aaacatgcccacacccaattaaatcatagtattcatcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaaaatcattca |
124585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 193303 - 193480
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
193303 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattaacaaga |
193400 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193401 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
193480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 76163 - 75986
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
76163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggatgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
76066 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
76065 |
aaacatgtccacactcaattaaatcatagtattcttcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatttcattca |
75986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28752
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28574 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
28672 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28673 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
28752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 28857 - 28900
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28857 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
28900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 95006 - 95187
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95006 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
95105 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95106 |
aagaaaacatgcccatacacagttaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
95187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 66907 - 66731
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
66907 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
66810 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
66809 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaatttgattatcaacaatcaataacatcattcaca |
66731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 95294 - 95337
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95294 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
95337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 78241 - 78420
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78241 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatcaaga |
78340 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
78341 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattca |
78420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 38903 - 39080
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38903 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
39002 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39003 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
39080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 44513 - 44667
Alignment:
| Q |
78 |
cacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||| |
|
|
| T |
44513 |
cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatca |
44612 |
T |
 |
| Q |
178 |
tagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44613 |
taggattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattca |
44667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 109553 - 109375
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
109455 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109454 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
109375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Original strand, 54330 - 54486
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54330 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
54428 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54429 |
catgcacattcataattaaatcatagtattcatcattacacattaacatgattatcaa |
54486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38807 - 38625
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38807 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
38709 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38708 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
38625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 40184 - 40359
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40184 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
40282 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40283 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattca |
40359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26200 - 26018
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26200 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
26102 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26101 |
aagaaaacatgtctatacacagataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
26018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 70873 - 70690
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
70873 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaagtttctcctcaatatataggataacacccatttatattaatcatctccacaacatttgaattatc |
70774 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70773 |
aagaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
70690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 2133
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2317 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatattgattatctccacatcatttgcattatc |
2218 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2217 |
aagaaaacatgcccacacacaattaaattatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
2133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6837 - 6653
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6837 |
gtacaaggactcgataatgctacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
6738 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||| ||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6737 |
aagaaaacatgcctatacacaattaaatcatagcatccatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
6653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 21351 - 21527
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21351 |
gactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
21450 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21451 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
21527 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 129668 - 129504
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
129668 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaacaaaa |
129570 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || ||||||||||| || | || || |||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
129569 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcgtcaccgcatatcaacatggttatcaacaatcaa |
129504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13217 - 13034
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |
|
|
| T |
13217 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaacatttgcattgtc |
13118 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13117 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
13034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 161 - 193
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
161 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36892185 - 36892003
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36892185 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacattttcattatc |
36892086 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36892085 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
36892003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5889765 - 5889589
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5889765 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
5889667 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5889666 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
5889589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 34822886 - 34823063
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34822886 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
34822983 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34822984 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
34823063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3800581 - 3800408
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3800581 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3800483 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3800482 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaaccatgtcat |
3800408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 24966987 - 24967164
Alignment:
| Q |
54 |
ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24966987 |
ggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
24967086 |
T |
 |
| Q |
154 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24967087 |
acatgcccatacacgaataaatcatagtattcatcaccacacgttatcatgattatcaataatcaacaacatcattca |
24967164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21275995 - 21275819
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21275995 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21275897 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21275896 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
21275819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 25600652 - 25600828
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25600652 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttttaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatttgcattatcaagaaaa |
25600751 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25600752 |
catgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
25600828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
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Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12726741 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
12726838 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12726839 |
aaacatgcccatacacaattaaatcttagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
12726918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4449698 - 4449523
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4449698 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattatattgatcattttcgcaacatttgcattatcaagaaaa |
4449599 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4449598 |
catgtccatacacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
4449523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 8942334 - 8942513
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
8942334 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
8942432 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
8942433 |
aaacatgctcatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattca |
8942513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 8886832 - 8887007
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8886832 |
gactcgataatgcgataacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
8886930 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8886931 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19888243 - 19888072
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19888243 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
19888146 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
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| T |
19888145 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
19888072 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 21140569 - 21140740
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56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
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| T |
21140569 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag-aaac |
21140666 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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|||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21140667 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
21140740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 22862179 - 22862354
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
22862179 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgtttatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
22862277 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
22862278 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattca |
22862354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 461426 - 461603
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
461426 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
461523 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
461524 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattca |
461603 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12643491 - 12643317
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
12643491 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
12643394 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
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|||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
12643393 |
catggccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
12643317 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14907907 - 14907733
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14907907 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
14907810 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14907809 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
14907733 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 20013810 - 20013984
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20013810 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
20013907 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20013908 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
20013984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 23818867 - 23819041
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23818867 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
23818964 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23818965 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
23819041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43644442 - 43644268
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43644442 |
actcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
43644344 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43644343 |
atgcccattcacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattca |
43644268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12637633 - 12637457
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12637633 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggataacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
12637536 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12637535 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
12637457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 22273577 - 22273752
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273577 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
22273675 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22273676 |
catgcacattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
22273752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25877399 - 25877242
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| Q |
74 |
aatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataa |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
25877399 |
aatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatggccatacacaattaa |
25877301 |
T |
 |
| Q |
174 |
ctcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25877300 |
ttcatagtattcattatcacacatcaacatgattatcaataatcaacgaatgtcattca |
25877242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24687136 - 24686964
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24687136 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
24687039 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24687038 |
aaacatg--cctacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcat |
24686964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11232720 - 11232550
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11232720 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
11232623 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11232622 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
11232550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22514567 - 22514397
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22514567 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22514470 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22514469 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
22514397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 23773225 - 23773400
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23773225 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcgacaacatt-gcattatcaaga |
23773322 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23773323 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttataaataatcaacaatgtcattca |
23773400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 55 - 220
Target Start/End: Original strand, 15632088 - 15632252
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15632088 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaacacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcaattgcattatcaagaaaa |
15632186 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15632187 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcccacattaacatgattatcaataatcaac |
15632252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24828034 - 24827861
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24828034 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
24827936 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24827935 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
24827861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
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| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28777168 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
28777071 |
T |
 |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
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Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28777070 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagaattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
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Target Start/End: Complemental strand, 20628864 - 20628690
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20628864 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
20628767 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20628766 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacat---catgattatcaataatcaacaatgacattca |
20628690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 22282810 - 22282985
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22282810 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacagcacctaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
22282908 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22282909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattca |
22282985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 7320174 - 7320356
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320174 |
acaaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacatttgcattatcaa |
7320273 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320274 |
gaaaacatgtccatacaaaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
7320356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22691426 - 22691316
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22691426 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22691327 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22691326 |
aagaaaacatg |
22691316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22696073 - 22695963
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22696073 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22695974 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22695973 |
aagaaaacatg |
22695963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Original strand, 27260274 - 27260415
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260274 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcccaattatattgaccatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27260373 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
196 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27260374 |
catgtccatatacaatcaattcatagtattcatcatcacaca |
27260415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 6878134 - 6878310
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6878134 |
gactcgataatgcgaccacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
6878232 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc-acacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6878233 |
catgtccatacataattaaatcatagcattcatcatcgccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
6878310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24572865 - 24572684
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24572865 |
acaaagactcgataatgcgataacacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
24572766 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24572765 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcacaagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaaaaatcaacaatgtcattc |
24572684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 269878 - 269981
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
269878 |
gactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
269977 |
T |
 |
| Q |
155 |
catg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
269978 |
catg |
269981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9654296 - 9654140
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9654296 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatatagagcaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattaacaagaaaa |
9654198 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
9654197 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcatcacataacaacatgattatcaa |
9654140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22581402 - 22581225
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22581402 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacgtttgcattatcaagaaaa |
22581303 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || || ||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22581302 |
catgtccatacataatcaaatcataagattcattctcacaacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgtcattca |
22581225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17398061 - 17397884
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17398061 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
17397964 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17397963 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacagaaacaacttgattatcaacaatcaacaatatctttcaca |
17397884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 28972727 - 28972907
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
28972727 |
acaaagactcgataatgcgacaccaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacatccatatatattgatcatctccac-acatttgcattactaa |
28972825 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28972826 |
g-aaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
28972907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 721162 - 721257
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
721162 |
gactcgataatgcgacatcactacacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
721257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
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| Q |
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23822967 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23822894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23824911 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23824838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23832046 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23831973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
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| Q |
138 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22693040 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
22693135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 22697687 - 22697782
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| Q |
138 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22697687 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
22697782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22787506 |
gactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
22787408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19670576 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22692978 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22693028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22697625 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22697675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24088810 - 24088752
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
24088810 |
caatataaaggacaacttccaattatattgattatctccacaacaattgcattaccaag |
24088752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4663
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4735 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaa |
4663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24296031 - 24295958
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24296031 |
caattttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaa |
24295958 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 19658678 - 19658739
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19658678 |
caatataaaggacaacttccagatatgttgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
19658739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 155821 - 155649
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
155821 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
155723 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
155722 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
155649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 742
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
914 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
817 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
816 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 35023 - 35163
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
35023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
35120 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca |
194 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35121 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagttttcatcatcaca |
35163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 87127 - 87307
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
87127 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat--tc |
87223 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
87224 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcgtagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
87307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 138286 - 138105
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
138286 |
gtacagggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-cacttcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt-gtattatc |
138189 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138188 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
138105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 10351 - 10534
Alignment:
| Q |
49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10351 |
tacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatca |
10450 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10451 |
agaaaacatatccatacacaatcaaagcataagattcattatcaccatatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
10534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 103
Target Start/End: Original strand, 77069 - 77124
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77069 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
77124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 71921 - 71745
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71921 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaattttcaccacaatatataggataactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
71822 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71821 |
catgctcatacacaaataattcatagtattcatcatcgcacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
71745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19050 - 18877
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19050 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaaga |
18951 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18950 |
aaacatgcacatgcacaaataaatcatagtattcacaattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
18877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18724
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18767 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0395 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:
Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 14364 - 14548
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14364 |
gtacaaggactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaatatttgcattatc |
14463 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataa-tcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14464 |
aagaaatcatgtctatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataattcaacaatgtcattca |
14548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 32268 - 32451
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32268 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
32367 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32368 |
aagaaaacatgtacatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcgacaatgtcattca |
32451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 90353 - 90178
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
90353 |
aaggactcgataatgcgacaa---tccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
90258 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
90257 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
90178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 129075 - 129251
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
129075 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
129173 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
129174 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcaccatcatgcctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
129251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 78410 - 78471
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78410 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
78471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1232
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1057 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
1155 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1156 |
catgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
1232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 5926 - 6099
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
6024 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6025 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
6099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
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Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1336 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
1379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 8771 - 8947
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8771 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8870 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8871 |
catgtccatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcatcatgttcatcaataatcaacaatgtcattca |
8947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 4530 - 4709
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4530 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-tagcattatcaaga |
4628 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4629 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattca |
4709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3045 - 2870
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3045 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
2948 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2947 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
2870 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23168 - 22995
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23168 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
23069 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23068 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaca |
22995 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 40291 - 40466
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40291 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctacacaacatttgcattatcaagaaaa |
40389 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40390 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
40466 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27983 - 27806
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27983 |
aaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
27886 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27885 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
27806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Original strand, 145223 - 145392
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
145223 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattattaagaaaa |
145321 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
145322 |
catgcccatacataaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
145392 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Original strand, 147482 - 147646
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
147482 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattatcaagaaaa |
147580 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaa-ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
147581 |
catgccaattcacaatttaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaacaatcaa |
147646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 145502 - 145543
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt |
229 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
145502 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcatt |
145543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3163 - 2984
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3065 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3064 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtatttaccattcacacattaacttgattatgaacaatcaacaatgtcattca |
2984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0315 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:
Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 17340 - 17515
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17340 |
gactcgataatgcgacaacaatcc-caattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17438 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17439 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaactcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
17515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7947
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8123 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8024 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8023 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattca |
7947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13512 - 13336
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13512 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
13413 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13412 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattca |
13336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18175
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18000 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
18098 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18099 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
18175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20259
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20084 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20182 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20183 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
20259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14735 - 14565
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14735 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
14638 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14637 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
14565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23862 - 23801
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23862 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccataacatttgcattatcaagaaa |
23801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Original strand, 28261 - 28366
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128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
28360 |
T |
 |
| Q |
226 |
cattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
28361 |
tattca |
28366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Original strand, 40257 - 40362
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tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40257 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
40356 |
T |
 |
| Q |
226 |
cattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
40357 |
tattca |
40362 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 40468 - 40518
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40468 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
40518 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 28472 - 28515
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28472 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattca |
28515 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 5874 - 6045
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5874 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
5971 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5972 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
6045 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 217218 - 217035
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
217218 |
gactcgataatgcgacaacaatc-ataattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
217120 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
217119 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
217035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1140 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:
Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 1873 - 2050
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1873 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
1970 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1971 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattca |
2050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Original strand, 69456 - 69634
Alignment:
| Q |
53 |
aggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69456 |
aggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaa |
69555 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69556 |
aacatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcatcatgataatcaataatcaacaatgtcattca |
69634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 30768 - 30945
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30768 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
30867 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30868 |
catgtccatacacaatcaaatcataacattcattatcaccacatgaacaagatcatcaataatcaacaatgtcattca |
30945 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:
Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2593 - 2425
Alignment:
| Q |
62 |
taatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctc |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2593 |
taatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtcc |
2495 |
T |
 |
| Q |
162 |
atacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2494 |
atacacatttaaatcatagtattcaccatcacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
2425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 30041 - 30213
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30041 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
30138 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30139 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
30213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 12891 - 13067
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12891 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12989 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12990 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacctcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
13067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1404 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:
Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 244 - 423
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
244 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-taacattatcaaga |
342 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
343 |
aaacatacccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattca |
423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0407 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:
Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5903
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| Q |
63 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6069 |
aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgccca |
5972 |
T |
 |
| Q |
163 |
tacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5971 |
cacacaattaaatcatagtatttatcatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
5903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32660 - 32485
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32660 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32562 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32561 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattca |
32485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 159
Target Start/End: Original strand, 34037 - 34147
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34037 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
34135 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
34136 |
aagaaaacatgc |
34147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 25591 - 25765
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25591 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25688 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25689 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
25765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 21336 - 21510
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21336 |
aaggactcgataatgcgataacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21433 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21434 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcat |
21510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52743 - 52568
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
52743 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
52645 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52644 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
52568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 56695 - 56520
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56695 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
56597 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56596 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
56520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6443
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
6523 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6522 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattca |
6443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 7485 - 7662
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7485 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaaa |
7584 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7585 |
catgtccatgcacaatcaaatcataagattcatcatcaccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
7662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 106689 - 106869
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
106689 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
106787 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
106788 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
106869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1923
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2095 |
gactctataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcgacaacatttgcattatcaagaaaa |
1996 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1995 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtca |
1923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0434 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:
Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 3352 - 3528
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3352 |
gactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatatccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3451 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3452 |
tatgtccatacacaatcaattcatagcattcctcatcacacatcaacatgattatcgataatcaacaatgtcattca |
3528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 37977 - 38147
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37977 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
38074 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38075 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtca |
38147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 249008 - 248833
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
249008 |
gactcgataatgcaacaaaaatc-acaattttctccacaatatataagacaacacccaattatattgttcattcccacatcatctgcattatcaagaaaa |
248910 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
248909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
248833 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 16132 - 16313
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
16132 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagg |
16230 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16231 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
16313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13660 - 13488
Alignment:
| Q |
58 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13660 |
tcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatat |
13562 |
T |
 |
| Q |
158 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
| || || ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13561 |
gtccacacccaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattc |
13488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 41399 - 41575
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41399 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
41497 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41498 |
catgcccattcacaattaagtcatagcactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
41575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1753 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:
Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 154 - 329
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaactcccagttatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
252 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
253 |
tatgtccatacataattaaatcatagtatccaccatcacacatcgacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11219
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11394 |
gactcgataatgcgacaaaaatc-acaattttctccacaatatataggacaagacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
11296 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11295 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcaacattacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattca |
11219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6438
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
6522 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6521 |
aaacatgcccacacacaaataaatcaaagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcacaa |
6438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 106370 - 106297
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106370 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
106297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 108343 - 108446
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
108343 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaatttccaccacaatataaaggacaatttctaaatatattgatcatctccagaacaattgcattattaagaaat |
108442 |
T |
 |
| Q |
155 |
catg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
108443 |
catg |
108446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 113883 - 113851
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
113883 |
aacatgattatcaattatcaacaatgtcattca |
113851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
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Target Start/End: Original strand, 3318 - 3491
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3318 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3416 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3417 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
3491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
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Target: scaffold0213; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 27714 - 27890
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27714 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
27812 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27813 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccattcacaaaataacttatttatcaaaaatcaacaatgtcattca |
27890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 51719 - 51899
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
51719 |
aaggaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
51817 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
51818 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttggttatcaacaatcaacaatatcattcaca |
51899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
46819 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
46916 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46917 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattca |
46994 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 60267 - 60442
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
60267 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
60364 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
60365 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattca |
60442 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0462; HSP #1
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56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4823 |
actcgataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4922 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacat |
203 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4923 |
atgcccacacgcaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacat |
4970 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
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Target: scaffold0009; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 270813 - 270990
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270813 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctccatatcatttgcattatcaagaaaa |
270911 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
270912 |
catgcccatacacaattaaaaccatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
270990 |
T |
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Target: scaffold0009; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 236874 - 237050
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
236874 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttccaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcttttgcattatcaagaaaa |
236972 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc-acacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
236973 |
tatgtccatacataattaaatcatagcattcatcatctccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
237050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
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Target: scaffold0467; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 11504 - 11332
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11504 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
11406 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat |
228 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11405 |
catgcccacatacaattaaatcatagtattcatcatcacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcat |
11332 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
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Target: scaffold0039; HSP #1
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128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20692 |
tccacaacacttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
20593 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20592 |
ttca |
20589 |
T |
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Target: scaffold0039; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 20716 - 20686
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20716 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
20686 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0750 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:
Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
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Target Start/End: Complemental strand, 6805 - 6632
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6805 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaaaatttgcattatcatgaaaa |
6706 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6705 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaca |
6632 |
T |
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Target: scaffold0498 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
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Target: scaffold0498; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 7673 - 7837
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7673 |
gactcgataatacgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatatagttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
7771 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7772 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcaccacacaacaacatgattatcaacaatcaa |
7837 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
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Target: scaffold0051; HSP #1
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aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
58899 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgatcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaacatgccca |
58998 |
T |
 |
| Q |
163 |
tacgcaaataactcatag |
180 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
58999 |
tacacaaataattcatag |
59016 |
T |
 |
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Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Original strand, 59375 - 59422
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| Q |
176 |
catagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
59375 |
catagtattcaccatcacacatcatcatgatcatcaataatcatcaat |
59422 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 4902
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5067 |
gactcgacaatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
4969 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaa--ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4968 |
catgcccatacacaattaaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaa |
4902 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
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Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1076
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-----tcac-ctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1263 |
aaggactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcatta |
1165 |
T |
 |
| Q |
146 |
tcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
1164 |
ccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacattatcattcaca |
1076 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17561 - 17384
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17561 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaatgatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
17464 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || ||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17463 |
aaacatgtctacacacagttacatcacagcattcatcatcacacatcaacacgattatcagtaatcaacaatgtcattca |
17384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0269 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:
Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 165
Target Start/End: Original strand, 771 - 880
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
771 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
869 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatac |
165 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
870 |
catgcccatac |
880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 165
Target Start/End: Original strand, 15027 - 15136
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15027 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
15125 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatac |
165 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
15126 |
catgcccatac |
15136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
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Target Start/End: Original strand, 6570 - 6678
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6570 |
acaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgaattatcaa |
6669 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatg |
158 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6670 |
gaaaacatg |
6678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
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| Q |
194 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6724 |
acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
6761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
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Target: scaffold0183; HSP #1
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68 |
gacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacg |
166 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
5700 |
gacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctcaacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac- |
5796 |
T |
 |
| Q |
167 |
caaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcacaatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5797 |
-aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatacaaaatcaa |
5867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
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Target Start/End: Complemental strand, 9397 - 9291
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
9397 |
aaggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacagcacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
9299 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
9298 |
aaacatgc |
9291 |
T |
 |
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatt |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14987 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt |
15073 |
T |
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Target: scaffold0483; HSP #1
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4218 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
4120 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
4119 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
4092 |
T |
 |
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Target: scaffold0109; HSP #1
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49058 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
48960 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
48959 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
48932 |
T |
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Target: scaffold0342; HSP #1
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
4534 |
gactcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattattttgatcatctccacaacatttgcatcatcaataaaa |
4633 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaa |
169 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
4634 |
tatgtccatacgcaa |
4648 |
T |
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Target: scaffold0120 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
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Target: scaffold0120; HSP #1
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118 |
attgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataa-t |
216 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
29942 |
attgatcatctccacaacatttgcattatcataaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattaccaataatt |
30041 |
T |
 |
| Q |
217 |
caacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
30042 |
caacaatgtcattca |
30056 |
T |
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Target: scaffold0120; HSP #2
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48 |
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124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattgatt |
27336 |
T |
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Target: scaffold0014; HSP #1
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50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
145616 |
acaaagacttgataatgcgacatcaattcacgattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatatattgatcatctccacaacattagcattatc |
145715 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
145716 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaca |
145796 |
T |
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Target: scaffold0150 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
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Target: scaffold0150; HSP #1
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaa |
20489 |
T |
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Target: scaffold0150; HSP #2
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27220 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaa |
27318 |
T |
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Target: scaffold0004; HSP #1
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattat |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
197572 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat |
197482 |
T |
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gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4469 |
gataatgcgacaacaattctcaatctcgac-tcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgc |
4566 |
T |
 |
| Q |
160 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
|| || || ||| ||| |||||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
4567 |
ccacacacagttaaatcacagtatttatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatataattcaca |
4641 |
T |
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Target: scaffold0808; HSP #1
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
2942 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattttattatcaa |
2843 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2842 |
gaaa |
2839 |
T |
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2783 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
2751 |
T |
 |
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Target: scaffold0092; HSP #1
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58 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2114 |
tcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttttattattaagaaa |
2209 |
T |
 |
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tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17797 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
17698 |
T |
 |
| Q |
227 |
attca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
17697 |
attca |
17693 |
T |
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tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24216 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
24117 |
T |
 |
| Q |
227 |
attca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24116 |
attca |
24112 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34334 |
tccacatcatttgtattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt |
34433 |
T |
 |
| Q |
227 |
attca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
34434 |
attca |
34438 |
T |
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4801 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
4728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7114 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
7041 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7290 |
gactcgataatgcgacatcaccccacaatttccacaacaatataaaggacaacatccaaatatattgatcacctctacaacaattacattatcaagaa |
7387 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0058; HSP #1
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
71728 |
caattttcacaacaatataaaggacaccttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
71655 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0243; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3739 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
3667 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 91
Target Start/End: Original strand, 991 - 1030
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
991 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
1030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23941
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23898 |
catcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
23941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6116 - 6021
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6116 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacaatttcattatcaag |
6021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:
Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 4759 - 4820
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4759 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatctgcattctcaagaaa |
4820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 118049 - 117977
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
118049 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattattaagaaa |
117977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 164 - 207
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 231
Target Start/End: Original strand, 1 - 58
Alignment:
| Q |
175 |
tcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1 |
tcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattca |
58 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 53279 - 53322
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53279 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
53322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 153
Target Start/End: Original strand, 12936 - 12986
Alignment:
| Q |
103 |
acaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12936 |
acaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
12986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0346 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:
Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3124 - 3086
Alignment:
| Q |
193 |
cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3124 |
cacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
3086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 233
Target Start/End: Original strand, 2696 - 2763
Alignment:
| Q |
167 |
caaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaca |
233 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2696 |
caaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattcaca |
2763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 78265 - 78206
Alignment:
| Q |
93 |
aatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
78265 |
aatataaaggacagcctccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaa |
78206 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Original strand, 34203 - 34261
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34203 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
34261 |
T |
 |
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