View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6871A_low_31 (Length: 373)

Name: NF6871A_low_31
Description: NF6871A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6871A_low_31
NF6871A_low_31
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (6-373)||(19456333-19456700)
chr2 (6-370)||(21703079-21703443)
chr2 (6-369)||(27118650-27119013)
chr2 (6-373)||(34303215-34303582)
chr2 (6-368)||(3784616-3784978)
chr2 (6-368)||(16163561-16163923)
chr2 (6-368)||(34156973-34157334)
chr2 (6-368)||(31891245-31891607)
chr2 (48-373)||(27392973-27393298)
chr2 (114-373)||(40233581-40233840)
chr2 (42-373)||(23128478-23128809)
chr2 (110-373)||(27434356-27434619)
chr2 (42-373)||(28882212-28882543)
chr2 (42-373)||(12655540-12655871)
chr2 (114-365)||(9349902-9350153)
chr2 (42-373)||(20837916-20838247)
chr2 (110-373)||(22925940-22926203)
chr2 (114-373)||(37375231-37375490)
chr2 (110-343)||(34286420-34286653)
chr2 (110-343)||(34291480-34291713)
chr2 (110-370)||(34861746-34862006)
chr2 (114-373)||(260665-260924)
chr2 (42-373)||(11635098-11635429)
chr2 (114-373)||(12586880-12587139)
chr2 (110-373)||(21677094-21677357)
chr2 (110-373)||(31876347-31876610)
chr2 (110-373)||(37685821-37686084)
chr2 (110-373)||(37701086-37701349)
chr2 (42-373)||(37925491-37925822)
chr2 (120-373)||(16829250-16829503)
chr2 (120-373)||(16891978-16892231)
chr2 (110-373)||(11641287-11641550)
chr2 (114-373)||(13936456-13936715)
chr2 (42-259)||(34279447-34279664)
chr2 (114-373)||(27777292-27777551)
chr2 (114-373)||(27817050-27817309)
chr2 (110-373)||(32049864-32050127)
chr2 (114-373)||(12716514-12716773)
chr2 (114-373)||(27803777-27804036)
chr2 (114-373)||(39051734-39051993)
chr2 (120-373)||(39890150-39890403)
chr2 (120-373)||(19416411-19416664)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (6-373)||(16626470-16626837)
chr3 (31-371)||(18530340-18530680)
chr3 (6-368)||(4625871-4626233)
chr3 (6-368)||(17993753-17994115)
chr3 (6-369)||(5652314-5652677)
chr3 (36-373)||(32292709-32293046)
chr3 (36-373)||(31034081-31034418)
chr3 (110-368)||(5713258-5713516)
chr3 (110-368)||(5724168-5724426)
chr3 (110-368)||(5757051-5757309)
chr3 (110-368)||(5767942-5768200)
chr3 (42-373)||(18330632-18330963)
chr3 (24-373)||(15892670-15893019)
chr3 (42-373)||(8295935-8296266)
chr3 (42-373)||(15741058-15741389)
chr3 (42-373)||(18051225-18051556)
chr3 (110-373)||(22387542-22387805)
chr3 (110-373)||(4796617-4796880)
chr3 (42-373)||(8301231-8301562)
chr3 (42-373)||(6192279-6192610)
chr3 (42-373)||(7073175-7073506)
chr3 (114-373)||(10396168-10396427)
chr3 (110-373)||(29148719-29148982)
chr3 (42-370)||(4721594-4721922)
chr3 (114-373)||(11110313-11110572)
chr3 (42-373)||(35880729-35881060)
chr3 (110-373)||(4416950-4417213)
chr3 (110-373)||(28115918-28116181)
chr3 (114-373)||(48465962-48466221)
chr3 (114-373)||(4346651-4346910)
chr3 (110-373)||(5467016-5467279)
chr3 (129-373)||(8211788-8212032)
chr3 (42-373)||(18277016-18277347)
chr3 (42-373)||(18292317-18292648)
chr3 (42-373)||(18307618-18307949)
chr3 (110-373)||(28021306-28021569)
chr3 (114-373)||(29664934-29665193)
chr3 (110-373)||(36997041-36997304)
chr3 (110-373)||(51782054-51782317)
chr3 (129-373)||(22870820-22871064)
chr3 (129-373)||(22885879-22886123)
chr3 (114-373)||(6542426-6542685)
chr3 (42-373)||(17984920-17985251)
chr3 (126-373)||(21674740-21674987)
chr3 (110-373)||(31964437-31964700)
chr3 (110-373)||(50134035-50134298)
chr3 (110-373)||(51797143-51797407)
chr3 (110-373)||(5013743-5014006)
chr3 (110-373)||(5609286-5609549)
chr3 (114-373)||(20576811-20577070)
chr3 (110-373)||(28339333-28339596)
chr3 (110-373)||(47023484-47023747)
chr3 (120-373)||(5596321-5596574)
chr3 (114-347)||(32439189-32439422)
chr3 (120-373)||(18225232-18225485)
chr3 (120-373)||(18242780-18243033)
chr3 (114-347)||(20066078-20066311)
chr3 (120-373)||(24328200-24328453)
chr3 (110-373)||(7996593-7996856)
chr3 (110-373)||(10643101-10643364)
chr3 (114-244)||(4893245-4893375)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (6-373)||(15284851-15285218)
chr4 (6-373)||(15227851-15228218)
chr4 (6-368)||(24460533-24460895)
chr4 (6-370)||(1900238-1900602)
chr4 (6-373)||(14235448-14235818)
chr4 (31-343)||(15391291-15391603)
chr4 (42-373)||(17014017-17014348)
chr4 (110-373)||(24592237-24592500)
chr4 (120-373)||(14665113-14665366)
chr4 (114-373)||(36344438-36344697)
chr4 (110-373)||(6569938-6570201)
chr4 (110-373)||(5005958-5006221)
chr4 (42-373)||(14763227-14763558)
chr4 (110-373)||(31126441-31126704)
chr4 (126-373)||(18800536-18800783)
chr4 (126-373)||(40105561-40105808)
chr4 (110-373)||(14098626-14098889)
chr4 (110-373)||(27163240-27163503)
chr4 (114-347)||(34188909-34189142)
chr4 (110-373)||(30753839-30754102)
chr4 (114-373)||(33673721-33673980)
chr4 (114-347)||(24112751-24112984)
chr4 (110-373)||(54833472-54833735)
chr4 (114-373)||(39850727-39850986)
chr4 (135-373)||(21969811-21970049)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (6-373)||(2581-2948)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (6-373)||(20340258-20340625)
chr1 (31-373)||(20461071-20461413)
chr1 (6-373)||(16207954-16208318)
chr1 (36-373)||(28151857-28152194)
chr1 (110-373)||(10962739-10963002)
chr1 (129-373)||(51638306-51638550)
chr1 (110-373)||(28585050-28585313)
chr1 (110-373)||(41793231-41793494)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (6-370)||(16449810-16450174)
chr7 (6-370)||(16041290-16041654)
chr7 (6-368)||(31088278-31088640)
chr7 (6-368)||(45733427-45733789)
chr7 (36-373)||(26484691-26485028)
chr7 (36-370)||(2108817-2109151)
chr7 (36-373)||(39210832-39211169)
chr7 (45-373)||(2775365-2775693)
chr7 (174-373)||(26682809-26683008)
chr7 (174-373)||(4200682-4200881)
chr7 (42-373)||(5127995-5128326)
chr7 (42-373)||(11424585-11424916)
chr7 (42-373)||(16518225-16518556)
chr7 (36-347)||(18540796-18541107)
chr7 (110-373)||(2154644-2154907)
chr7 (42-373)||(10916677-10917008)
chr7 (42-373)||(16503189-16503520)
chr7 (42-373)||(5147149-5147480)
chr7 (110-373)||(26274903-26275166)
chr7 (110-373)||(26435328-26435591)
chr7 (110-373)||(3445377-3445640)
chr7 (110-373)||(4144932-4145195)
chr7 (120-373)||(24592350-24592603)
chr7 (120-373)||(31564199-31564452)
chr7 (110-373)||(11441643-11441906)
chr7 (110-373)||(26319678-26319941)
chr7 (110-373)||(9618722-9618985)
chr7 (110-373)||(26669723-26669986)
chr7 (110-373)||(45387414-45387677)
chr7 (126-373)||(26537679-26537926)
chr7 (110-373)||(16736269-16736532)
chr7 (110-373)||(16751323-16751586)
chr7 (110-373)||(17523603-17523866)
chr7 (110-373)||(17529349-17529612)
chr7 (120-373)||(31125001-31125254)
chr7 (114-347)||(5159594-5159827)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (6-370)||(22888445-22888809)
chr5 (6-373)||(25199004-25199371)
chr5 (6-368)||(13184473-13184835)
chr5 (6-373)||(33877222-33877589)
chr5 (6-368)||(13440319-13440681)
chr5 (6-368)||(11325769-11326131)
chr5 (12-373)||(29888902-29889263)
chr5 (24-373)||(23892199-23892548)
chr5 (110-373)||(24687977-24688240)
chr5 (42-373)||(23752270-23752601)
chr5 (110-373)||(9548363-9548626)
chr5 (110-373)||(33777566-33777829)
chr5 (42-373)||(11549365-11549696)
chr5 (42-373)||(23717808-23718139)
chr5 (42-373)||(30934644-30934975)
chr5 (42-373)||(24970029-24970360)
chr5 (120-373)||(22998934-22999187)
chr5 (110-373)||(15658580-15658843)
chr5 (110-373)||(9317530-9317793)
chr5 (110-373)||(12132234-12132497)
chr5 (110-373)||(30152097-30152360)
chr5 (114-373)||(37671303-37671562)
chr5 (110-373)||(18375232-18375495)
chr5 (126-373)||(28649330-28649577)
chr5 (110-373)||(31826227-31826490)
chr5 (114-373)||(32599292-32599551)
chr5 (126-370)||(18500553-18500797)
chr5 (110-373)||(8665295-8665558)
chr5 (110-373)||(15758677-15758940)
chr5 (126-373)||(31431535-31431782)
chr5 (126-373)||(43078347-43078594)
chr5 (120-373)||(29966886-29967139)
chr5 (120-373)||(30029504-30029757)
chr5 (120-373)||(33516445-33516698)
chr5 (120-373)||(37358463-37358716)
chr5 (110-347)||(41674788-41675025)
chr5 (110-373)||(2511130-2511393)
chr5 (114-373)||(3789624-3789883)
chr5 (110-373)||(6874384-6874647)
chr5 (110-373)||(26480471-26480734)
chr5 (110-373)||(5637989-5638252)
chr5 (114-373)||(13324649-13324908)
chr5 (120-373)||(34616607-34616860)
chr5 (114-373)||(24681523-24681782)
chr5 (114-373)||(24724050-24724309)
chr5 (126-373)||(30168564-30168811)
chr5 (126-373)||(37770807-37771054)
chr5 (114-373)||(40473369-40473628)
chr5 (114-347)||(33292608-33292841)
chr5 (126-373)||(37755075-37755322)
chr5 (120-373)||(28959606-28959859)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (31-370)||(20379-20717)
scaffold0124 (120-373)||(30532-30785)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (36-373)||(22456800-22457137)
chr6 (6-368)||(28162620-28162982)
chr6 (6-368)||(33374127-33374489)
chr6 (6-373)||(13521939-13522306)
chr6 (6-368)||(8892182-8892543)
chr6 (6-368)||(8903417-8903778)
chr6 (36-373)||(14143151-14143488)
chr6 (36-373)||(26787937-26788274)
chr6 (36-373)||(27196310-27196647)
chr6 (36-373)||(27252593-27252930)
chr6 (12-373)||(27290236-27290597)
chr6 (36-271)||(22477241-22477476)
chr6 (1-373)||(20160659-20161031)
chr6 (1-373)||(22171800-22172172)
chr6 (48-373)||(27272446-27272771)
chr6 (42-373)||(22934746-22935077)
chr6 (42-373)||(23857191-23857522)
chr6 (42-373)||(26918379-26918710)
chr6 (42-373)||(16749853-16750184)
chr6 (42-373)||(26989000-26989331)
chr6 (42-373)||(13298817-13299148)
chr6 (42-373)||(24304484-24304815)
chr6 (110-373)||(24863784-24864047)
chr6 (110-364)||(27000140-27000394)
chr6 (110-373)||(29549542-29549805)
chr6 (42-373)||(15424183-15424514)
chr6 (114-373)||(4773077-4773336)
chr6 (114-373)||(16674210-16674469)
chr6 (114-373)||(27007798-27008057)
chr6 (120-373)||(4757841-4758094)
chr6 (120-373)||(27359858-27360111)
chr6 (120-373)||(27450201-27450454)
chr6 (114-373)||(29573084-29573343)
chr6 (120-373)||(4545641-4545894)
chr6 (120-373)||(30557882-30558135)
chr6 (117-373)||(4525360-4525616)
chr6 (114-373)||(34463212-34463471)
chr6 (120-373)||(16943893-16944146)
chr6 (126-373)||(3696164-3696411)
chr6 (120-373)||(29501492-29501745)
chr6 (126-373)||(4724000-4724247)
chr6 (126-373)||(26116276-26116523)
chr6 (126-373)||(28207537-28207784)
chr6 (120-373)||(26777481-26777734)
chr6 (110-373)||(27044454-27044718)
chr6 (114-373)||(17025348-17025607)
chr6 (252-373)||(17092306-17092427)
chr6 (120-373)||(27485206-27485459)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (6-369)||(19658926-19659288)
chr8 (6-368)||(44563067-44563427)
chr8 (36-369)||(33244661-33244994)
chr8 (6-373)||(9354588-9354956)
chr8 (48-343)||(22080790-22081085)
chr8 (24-372)||(16283433-16283781)
chr8 (110-373)||(18710656-18710919)
chr8 (42-373)||(19688100-19688431)
chr8 (42-373)||(27608787-27609118)
chr8 (42-373)||(16277556-16277887)
chr8 (42-373)||(2137141-2137472)
chr8 (42-373)||(14557626-14557957)
chr8 (110-373)||(29829392-29829655)
chr8 (120-373)||(12092606-12092859)
chr8 (114-373)||(3329389-3329648)
chr8 (42-373)||(31354526-31354857)
chr8 (110-373)||(28361837-28362100)
chr8 (110-373)||(31489632-31489895)
chr8 (110-373)||(19208242-19208505)
chr8 (110-373)||(19674511-19674774)
chr8 (120-373)||(33258803-33259056)
chr8 (202-373)||(189256-189427)
chr8 (110-373)||(19286532-19286795)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (12-323)||(1-312)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (110-370)||(1844-2103)
scaffold0415 (126-370)||(6098-6344)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (48-343)||(21569-21864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (186-373)||(541-728)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (42-373)||(27294-27625)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (42-373)||(39992-40323)
scaffold0089 (42-373)||(46908-47239)
scaffold0089 (24-373)||(29747-30096)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (110-373)||(52-315)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (126-373)||(9652-9899)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (110-373)||(7162-7425)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (110-373)||(14853-15116)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (110-373)||(26124-26388)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (110-373)||(8989-9252)
scaffold0159 (110-373)||(20085-20348)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (126-373)||(8035-8282)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (279-334)||(46764-46819)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19456700 - 19456333
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19456700 caacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttc 19456601  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456600 tcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 19456501  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19456500 gggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctc 19456401  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19456400 gacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21703443 - 21703079
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21703443 caacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttc 21703344  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703343 tcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 21703244  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21703243 gggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctc 21703144  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703143 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 21703079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27118650 - 27119013
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||| |||||| |||||||    
T  27118650 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttc 27118749  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118750 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 27118849  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  27118850 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctc 27118949  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118950 gacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34303582 - 34303215
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  34303582 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 34303483  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34303482 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 34303383  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  34303382 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 34303283  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303282 gacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 34303215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 3784616 - 3784978
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  3784616 caacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 3784715  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3784716 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 3784815  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  3784816 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 3784915  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784916 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 16163561 - 16163923
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  16163561 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 16163660  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16163661 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 16163760  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  16163761 gggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 16163860  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163861 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 34156973 - 34157334
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  34156973 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 34157072  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34157073 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 34157172  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  34157173 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 34157271  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157272 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31891607 - 31891245
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  31891607 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 31891508  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  31891507 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccct 31891408  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||| ||    
T  31891407 gggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtc 31891308  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891307 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 373
Target Start/End: Original strand, 27392973 - 27393298
Alignment:
Q  48 agacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctg 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  27392973 agacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 27393072  T
Q  148 atccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 247  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27393073 acccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 27393172  T
Q  248 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
    ||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27393173 aaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcgag 27393272  T
Q  348 gtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
       ||||| |||| |||||| |||||    
T  27393273 acttatgaagaagttcccagtcttga 27393298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 40233581 - 40233840
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233581 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 40233680  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  40233681 atgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 40233780  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  40233781 tctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 40233840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23128809 - 23128478
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  23128809 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 23128710  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23128709 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 23128610  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  23128609 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 23128510  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23128509 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23128478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27434619 - 27434356
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  27434619 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggt 27434520  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  27434519 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgaca 27434420  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27434419 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27434356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 28882212 - 28882543
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  28882212 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 28882311  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28882312 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 28882411  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  28882412 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 28882511  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  28882512 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 28882543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 12655540 - 12655871
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  12655540 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 12655639  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12655640 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 12655739  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||    
T  12655740 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatg 12655839  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12655840 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 12655871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9350153 - 9349902
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  9350153 cactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 9350054  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9350053 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccc 9349954  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 365  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9349953 tcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 9349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 20837916 - 20838247
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  20837916 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 20838015  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  20838016 cacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 20838115  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||    
T  20838116 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttg 20838215  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20838216 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 20838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22926203 - 22925940
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  22926203 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 22926104  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  22926103 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 22926004  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22926003 atccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 22925940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 37375231 - 37375490
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37375231 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatg 37375330  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  37375331 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 37375430  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | || ||||||||| ||||||||    
T  37375431 tctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttga 37375490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 34286420 - 34286653
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  34286420 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 34286519  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    || ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||  | || |||||||||||||    
T  34286520 cacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgaca 34286619  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34286620 atcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 34291480 - 34291713
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  34291480 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 34291579  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    || ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||  | || |||||||||||||    
T  34291580 cacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgaca 34291679  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34291680 atcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 370
Target Start/End: Original strand, 34861746 - 34862006
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  34861746 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 34861845  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  34861846 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 34861945  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  34861946 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 34862006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 260924 - 260665
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  260924 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 260825  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||    
T  260824 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcc 260725  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||| ||| ||||||||    
T  260724 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttga 260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11635429 - 11635098
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  11635429 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 11635330  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  11635329 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagta 11635230  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
    ||| || || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  11635229 catcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 11635130  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  11635129 atcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 11635098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 12586880 - 12587139
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  12586880 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 12586979  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  12586980 atgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 12587079  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  12587080 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 12587139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21677357 - 21677094
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  21677357 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 21677258  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  21677257 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 21677158  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  21677157 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 21677094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 31876347 - 31876610
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||    
T  31876347 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggt 31876446  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  31876447 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 31876546  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  31876547 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 31876610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37686084 - 37685821
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  37686084 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 37685985  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  37685984 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 37685885  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  37685884 atccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 37685821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37701349 - 37701086
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  37701349 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 37701250  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  37701249 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 37701150  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  37701149 atccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 37701086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 37925491 - 37925822
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  37925491 caagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 37925590  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    |||| || ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  37925591 cacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 37925690  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  37925691 tatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatg 37925790  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  37925791 atcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 37925822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16829503 - 16829250
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  16829503 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 16829404  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  16829403 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 16829304  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  16829303 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 16829250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 16891978 - 16892231
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  16891978 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 16892077  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  16892078 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 16892177  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  16892178 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 16892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11641550 - 11641287
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  11641550 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 11641451  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| |    
T  11641450 catgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgata 11641351  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  11641350 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 11641287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13936715 - 13936456
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  13936715 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 13936616  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || |||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  13936615 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 13936516  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  13936515 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 13936456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 34279447 - 34279664
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  34279447 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 34279546  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  34279547 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 34279646  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcat 259  Q
     || || || ||||||||    
T  34279647 tatcgtgaagaagctcat 34279664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 27777292 - 27777551
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  27777292 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 27777391  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  27777392 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 27777491  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27777492 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27777551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 27817050 - 27817309
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  27817050 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 27817149  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  27817150 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 27817249  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27817250 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27817309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 32049864 - 32050127
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  32049864 agggcattgtacaactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 32049963  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  32049964 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 32050063  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| ||| ||||||||    
T  32050064 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 32050127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12716773 - 12716514
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  12716773 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 12716674  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  12716673 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 12716574  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12716573 gctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 12716514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 27803777 - 27804036
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || ||||    
T  27803777 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatg 27803876  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  27803877 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 27803976  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27803977 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27804036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39051993 - 39051734
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || ||||    
T  39051993 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatg 39051894  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  39051893 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 39051794  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  39051793 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 39051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 39890150 - 39890403
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  39890150 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 39890249  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||| ||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  39890250 aggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 39890349  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  39890350 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 39890403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19416664 - 19416411
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  19416664 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 19416565  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || |||||||| || || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || ||    
T  19416564 aggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctacc 19416465  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  19416464 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 19416411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16626837 - 16626470
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  16626837 caacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttc 16626738  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626737 ttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 16626638  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  16626637 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctt 16626538  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626537 gacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 371
Target Start/End: Original strand, 18530340 - 18530680
Alignment:
Q  31 aacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagaca 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18530340 aacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagaca 18530439  T
Q  131 gggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctac 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530440 gggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctac 18530539  T
Q  231 gctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530540 gctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctg 18530639  T
Q  331 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530640 ctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagactt 18530680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 4625871 - 4626233
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  4625871 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 4625970  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4625971 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 4626070  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  4626071 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 4626170  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4626171 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccaga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17994115 - 17993753
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  17994115 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 17994016  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17994015 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctat 17993916  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  17993915 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 17993816  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993815 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 5652314 - 5652677
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |    
T  5652314 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcc 5652413  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652414 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 5652513  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  5652514 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 5652613  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5652614 gacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Original strand, 32292709 - 32293046
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  32292709 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 32292808  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32292809 agtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 32292908  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32292909 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 32293008  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32293009 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 32293046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31034418 - 31034081
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  31034418 cagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 31034319  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31034318 agcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 31034219  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31034218 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 31034119  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31034118 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 31034081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 5713258 - 5713516
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5713258 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5713357  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5713358 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgaca 5713457  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713458 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 5724168 - 5724426
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5724168 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5724267  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5724268 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgaca 5724367  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724368 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5757309 - 5757051
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5757309 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5757210  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5757209 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgaca 5757110  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757109 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5768200 - 5767942
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5768200 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5768101  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5768100 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgaca 5768001  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768000 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 18330632 - 18330963
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  18330632 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 18330731  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18330732 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 18330831  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  18330832 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 18330931  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  18330932 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 18330963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15893019 - 15892670
Alignment:
Q  24 caacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaa 123  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || ||||    
T  15893019 caacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 15892920  T
Q  124 ccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  15892919 ccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 15892820  T
Q  224 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 323  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15892819 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaat 15892720  T
Q  324 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15892719 catgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 8295935 - 8296266
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| | || |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  8295935 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 8296034  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  8296035 tacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 8296134  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  8296135 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 8296234  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  8296235 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 8296266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15741389 - 15741058
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  15741389 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 15741290  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  15741289 cacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagta 15741190  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  15741189 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 15741090  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15741089 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15741058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 18051225 - 18051556
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | ||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  18051225 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 18051324  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | || || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18051325 cacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 18051424  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  18051425 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatg 18051524  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18051525 attgaagtatgtgagaaagctcctagacttga 18051556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22387805 - 22387542
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  22387805 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 22387706  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  22387705 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 22387606  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22387605 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22387542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4796880 - 4796617
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  4796880 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 4796781  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  4796780 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 4796681  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4796680 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 4796617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8301562 - 8301231
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  8301562 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 8301463  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  8301462 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagta 8301363  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  8301362 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 8301263  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  8301262 atcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 8301231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 6192279 - 6192610
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  6192279 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 6192378  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6192379 cacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 6192478  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  6192479 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 6192578  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6192579 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 6192610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 7073175 - 7073506
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || || || ||||| |||||||| |    
T  7073175 caagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccc 7073274  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  7073275 cgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 7073374  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  7073375 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatg 7073474  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  7073475 atcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 7073506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 10396168 - 10396427
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10396168 cactgcacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatg 10396267  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  10396268 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 10396367  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  10396368 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 10396427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29148982 - 29148719
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  29148982 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 29148883  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  29148882 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 29148783  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  29148782 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 29148719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 370
Target Start/End: Original strand, 4721594 - 4721922
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  4721594 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 4721693  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  4721694 cacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagta 4721793  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || ||||| |||||  | ||||||||  | || ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||    
T  4721794 tatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatg 4721893  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    || || |||| |||||||||||| |||||    
T  4721894 atcgaagtatgtgaggaagctcctagact 4721922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11110572 - 11110313
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  11110572 cactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 11110473  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  11110472 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 11110373  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  11110372 tctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttga 11110313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 35880729 - 35881060
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||||| |||||| ||||| |    
T  35880729 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccc 35880828  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  35880829 cacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 35880928  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  35880929 tatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 35881028  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  35881029 atcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 35881060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 4416950 - 4417213
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  4416950 agggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 4417049  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  4417050 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 4417149  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4417150 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4417213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28116181 - 28115918
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||    
T  28116181 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggt 28116082  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  28116081 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 28115982  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  28115981 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 28115918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 48465962 - 48466221
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  48465962 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 48466061  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  48466062 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 48466161  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  48466162 tctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 48466221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4346910 - 4346651
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  4346910 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 4346811  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||| |||||    
T  4346810 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcc 4346711  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4346710 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4346651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 5467016 - 5467279
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5467016 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5467115  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  5467116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 5467215  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  5467216 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 5467279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 373
Target Start/End: Original strand, 8211788 - 8212032
Alignment:
Q  129 cagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || |    
T  8211788 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 8211887  T
Q  229 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 328  Q
    | ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8211888 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 8211987  T
Q  329 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  8211988 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 8212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18277347 - 18277016
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  18277347 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 18277248  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  18277247 cacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 18277148  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  18277147 tatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatg 18277048  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18277047 atcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18277016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18292648 - 18292317
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  18292648 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 18292549  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  18292548 cacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 18292449  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  18292448 tatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatg 18292349  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18292348 atcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18292317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18307949 - 18307618
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  18307949 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 18307850  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  18307849 cacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 18307750  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  18307749 tatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatg 18307650  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18307649 atcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18307618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 28021306 - 28021569
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  28021306 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 28021405  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
     ||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  28021406 tatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgaca 28021505  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  28021506 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 28021569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29665193 - 29664934
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  29665193 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatg 29665094  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  29665093 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 29664994  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  29664993 tcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 29664934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36997304 - 36997041
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  36997304 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 36997205  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  36997204 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgaca 36997105  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  36997104 atccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 36997041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 51782054 - 51782317
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  51782054 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 51782153  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  51782154 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 51782253  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  51782254 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 51782317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22871064 - 22870820
Alignment:
Q  129 cagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || |    
T  22871064 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 22870965  T
Q  229 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 328  Q
    | ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  22870964 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 22870865  T
Q  329 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  22870864 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 22870820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22886123 - 22885879
Alignment:
Q  129 cagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || |    
T  22886123 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 22886024  T
Q  229 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 328  Q
    | ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  22886023 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 22885924  T
Q  329 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  22885923 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 22885879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6542685 - 6542426
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||    
T  6542685 cactgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatg 6542586  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  6542585 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 6542486  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| ||||||||    
T  6542485 actaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttga 6542426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17985251 - 17984920
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| | |  || || ||||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  17985251 caagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccac 17985152  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  17985151 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagta 17985052  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  17985051 tatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 17984952  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  17984951 atcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttga 17984920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 21674740 - 21674987
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  21674740 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 21674839  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  21674840 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatca 21674939  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  21674940 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 21674987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31964700 - 31964437
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  31964700 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 31964601  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  31964600 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 31964501  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31964500 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31964437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50134298 - 50134035
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  50134298 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 50134199  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  50134198 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 50134099  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  50134098 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 50134035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 51797143 - 51797407
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatccca-ggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggg 208  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| || || ||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||    
T  51797143 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttagg 51797242  T
Q  209 tcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgac 308  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||    
T  51797243 tcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgac 51797342  T
Q  309 aatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  51797343 aatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 51797407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 5013743 - 5014006
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  5013743 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 5013842  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  5013843 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 5013942  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  5013943 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 5014006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5609549 - 5609286
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  5609549 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 5609450  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  5609449 catgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 5609350  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  5609349 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 5609286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20577070 - 20576811
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  20577070 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 20576971  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  20576970 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 20576871  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20576870 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20576811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 28339333 - 28339596
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||    
T  28339333 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggt 28339432  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  28339433 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 28339532  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  28339533 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 28339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 47023484 - 47023747
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  47023484 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 47023583  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  47023584 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 47023683  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  47023684 atccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 47023747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5596574 - 5596321
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  5596574 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 5596475  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||    
T  5596474 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 5596375  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  5596374 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 5596321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Original strand, 32439189 - 32439422
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||    
T  32439189 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatg 32439288  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  32439289 atgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 32439388  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32439389 gctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 18225232 - 18225485
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || |    
T  18225232 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcg 18225331  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  18225332 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 18225431  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  18225432 aaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttga 18225485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 18242780 - 18243033
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |    
T  18242780 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcg 18242879  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||    
T  18242880 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 18242979  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18242980 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18243033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Original strand, 20066078 - 20066311
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |  || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||    
T  20066078 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatg 20066177  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  20066178 atgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatcc 20066277  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20066278 gctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 24328200 - 24328453
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  24328200 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 24328299  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || ||    
T  24328300 aggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctacc 24328399  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  24328400 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 24328453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 7996593 - 7996856
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  7996593 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 7996692  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  7996693 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 7996792  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  7996793 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttga 7996856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 10643101 - 10643364
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  10643101 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 10643200  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  10643201 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 10643300  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  10643301 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttga 10643364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Original strand, 4893245 - 4893375
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || | ||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||    
T  4893245 cactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatg 4893344  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 244  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  4893345 atgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15285218 - 15284851
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  15285218 caacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttc 15285119  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285118 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 15285019  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15285018 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctc 15284919  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15284918 gacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Original strand, 15227851 - 15228218
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15227851 caacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttc 15227950  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227951 tcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 15228050  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15228051 gggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctc 15228150  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15228151 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttga 15228218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24460895 - 24460533
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  24460895 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 24460796  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24460795 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 24460696  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  24460695 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 24460596  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24460595 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccaga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Original strand, 1900238 - 1900602
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1900238 caacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttc 1900337  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900338 tcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 1900437  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||||||     
T  1900438 gggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtcctt 1900537  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900538 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 1900602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14235818 - 14235448
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaa---gctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctac 102  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||| |||   ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | | |||||| || |    
T  14235818 caacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgc 14235719  T
Q  103 ttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgc 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14235718 ttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgc 14235619  T
Q  203 tctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtc 302  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||    
T  14235618 tctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtc 14235519  T
Q  303 ctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||    
T  14235518 ctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttga 14235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15391603 - 15391291
Alignment:
Q  31 aacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagaca 130  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15391603 aacagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggca 15391504  T
Q  131 gggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctac 230  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15391503 ggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttac 15391404  T
Q  231 gctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctg 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  15391403 gctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctg 15391304  T
Q  331 ctgtgaacatgat 343  Q
    |||||||||||||    
T  15391303 ctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 17014017 - 17014348
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  17014017 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 17014116  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17014117 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 17014216  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  17014217 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 17014316  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17014317 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 17014348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24592500 - 24592237
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  24592500 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 24592401  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  24592400 catgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 24592301  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24592300 atcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24592237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 14665113 - 14665366
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  14665113 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 14665212  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14665213 aggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttcc 14665312  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14665313 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 14665366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36344697 - 36344438
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  36344697 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatg 36344598  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  36344597 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 36344498  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  36344497 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 36344438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 6569938 - 6570201
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||    
T  6569938 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggt 6570037  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  6570038 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 6570137  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  6570138 atcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 6570201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 5005958 - 5006221
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  5005958 agggcattgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 5006057  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| || || || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  5006058 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 5006157  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  5006158 atcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 5006221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14763558 - 14763227
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  14763558 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 14763459  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  14763458 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 14763359  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  14763358 tatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatg 14763259  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  14763258 atcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 14763227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31126704 - 31126441
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  31126704 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 31126605  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  31126604 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 31126505  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  31126504 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 31126441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18800783 - 18800536
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  18800783 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 18800684  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  18800683 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 18800584  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18800583 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18800536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40105808 - 40105561
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || |    
T  40105808 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggt 40105709  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  40105708 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 40105609  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  40105608 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 40105561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 14098626 - 14098889
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  14098626 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 14098725  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  14098726 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 14098825  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  14098826 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 14098889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27163503 - 27163240
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  27163503 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 27163404  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  27163403 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 27163304  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27163303 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27163240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34189142 - 34188909
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  34189142 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatg 34189043  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  34189042 atgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 34188943  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34188942 gctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 30753839 - 30754102
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  30753839 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 30753938  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  30753939 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 30754038  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  30754039 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 30754102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33673980 - 33673721
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  33673980 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 33673881  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||    
T  33673880 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 33673781  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  33673780 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 33673721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Original strand, 24112751 - 24112984
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||    
T  24112751 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatg 24112850  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  24112851 atgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 24112950  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24112951 gctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 54833472 - 54833735
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  54833472 agggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 54833571  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  54833572 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 54833671  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  54833672 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 54833735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 39850727 - 39850986
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  39850727 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatg 39850826  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||    
T  39850827 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaaccc 39850926  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  39850927 ccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 39850986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 373
Target Start/End: Original strand, 21969811 - 21970049
Alignment:
Q  135 aagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctt 234  Q
    ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||    
T  21969811 aagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctt 21969910  T
Q  235 tgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 334  Q
    ||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21969911 tgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgt 21970010  T
Q  335 gaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| ||||||||  | | |||||||| ||| ||||||||    
T  21970011 gaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttga 21970049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2948 - 2581
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  2948 caacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttc 2849  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2848 tcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 2749  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2748 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctc 2649  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 2581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20340625 - 20340258
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  20340625 caacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttc 20340526  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340525 tcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 20340426  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  20340425 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctc 20340326  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340325 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 20340258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 373
Target Start/End: Original strand, 20461071 - 20461413
Alignment:
Q  31 aacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagaca 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20461071 aacaacagcaacaagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagaca 20461170  T
Q  131 gggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctac 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20461171 gggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctac 20461270  T
Q  231 gctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20461271 gctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctg 20461370  T
Q  331 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20461371 ttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttga 20461413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16208318 - 16207954
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  16208318 caacaacagccaccagttcaacaacaacatcaaca---agctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttc 16208222  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208221 tcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 16208122  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  16208121 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctc 16208022  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16208021 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttga 16207954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Original strand, 28151857 - 28152194
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  28151857 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 28151956  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28151957 agcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 28152056  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28152057 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 28152156  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28152157 aacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttga 28152194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 10962739 - 10963002
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  10962739 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggt 10962838  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  10962839 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 10962938  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| ||||||||    
T  10962939 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttga 10963002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 373
Target Start/End: Original strand, 51638306 - 51638550
Alignment:
Q  129 cagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || |    
T  51638306 cagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 51638405  T
Q  229 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 328  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  51638406 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 51638505  T
Q  329 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  51638506 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 51638550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 28585050 - 28585313
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||    
T  28585050 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggt 28585149  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  28585150 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 28585249  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  28585250 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 28585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41793494 - 41793231
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  41793494 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 41793395  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  41793394 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 41793295  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  41793294 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 41793231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16450174 - 16449810
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16450174 caacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttc 16450075  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450074 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 16449975  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16449974 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctc 16449875  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449874 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Original strand, 16041290 - 16041654
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16041290 caacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttc 16041389  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16041390 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctct 16041489  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  16041490 gggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctc 16041589  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16041590 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagact 16041654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31088640 - 31088278
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  31088640 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 31088541  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31088540 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 31088441  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  31088440 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 31088341  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088340 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 45733427 - 45733789
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |   || |||||||    
T  45733427 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttc 45733526  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45733527 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 45733626  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  45733627 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 45733726  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733727 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Original strand, 26484691 - 26485028
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  26484691 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 26484790  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26484791 agcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 26484890  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26484891 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 26484990  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26484991 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26485028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2109151 - 2108817
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  2109151 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 2109052  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2109051 agcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 2108952  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2108951 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 2108852  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108851 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39211169 - 39210832
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  39211169 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 39211070  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39211069 agcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 39210970  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39210969 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 39210870  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39210869 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 39210832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 45 - 373
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775693
Alignment:
Q  45 gctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccac 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  145 ctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 244  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  245 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 344  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2775664  T
Q  345 gaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2775665 gaggtatatgaggaagctcccggacttga 2775693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 174 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682809
Alignment:
Q  174 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  274 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 174 - 373
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200881
Alignment:
Q  174 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  274 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 5127995 - 5128326
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  5127995 caagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccc 5128094  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5128095 cacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagta 5128194  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  5128195 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatg 5128294  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  5128295 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 5128326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11424916 - 11424585
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  11424916 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggcaagcccc 11424817  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  11424816 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 11424717  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  11424716 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 11424617  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  11424616 atcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 11424585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16518556 - 16518225
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16518556 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 16518457  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | |||||||||    
T  16518456 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagta 16518357  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  16518356 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 16518257  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16518256 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16518225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 347
Target Start/End: Original strand, 18540796 - 18541107
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  18540796 cagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacagggga 18540895  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    |||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| |    
T  18540896 agcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctct 18540995  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
     |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||    
T  18540996 aaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtg 18541095  T
Q  336 aacatgattgag 347  Q
    || |||||||||    
T  18541096 aatatgattgag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 2154644 - 2154907
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||    
T  2154644 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggt 2154743  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  2154744 catgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 2154843  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  2154844 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 2154907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10917008 - 10916677
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  10917008 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 10916909  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  10916908 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 10916809  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  10916808 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 10916709  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10916708 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 10916677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16503520 - 16503189
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16503520 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 16503421  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | |||||||||    
T  16503420 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagta 16503321  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  16503320 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 16503221  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16503220 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16503189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5147480 - 5147149
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  5147480 caagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 5147381  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  5147380 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 5147281  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  5147280 tatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 5147181  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  5147180 atcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 5147149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26275166 - 26274903
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  26275166 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 26275067  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26275066 catgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26274967  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  26274966 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 26274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 26435328 - 26435591
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  26435328 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 26435427  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26435428 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26435527  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26435528 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 26435591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 3445377 - 3445640
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  3445377 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 3445476  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  3445477 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 3445576  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  3445577 atccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 3445640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4145195 - 4144932
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  4145195 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 4145096  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  4145095 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 4144996  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  4144995 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 4144932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24592603 - 24592350
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || |    
T  24592603 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcg 24592504  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24592503 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 24592404  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  24592403 aaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 24592350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31564452 - 31564199
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  31564452 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcg 31564353  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  31564352 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 31564253  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31564252 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31564199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 11441643 - 11441906
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  11441643 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 11441742  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  11441743 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 11441842  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11441843 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 11441906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26319941 - 26319678
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  26319941 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 26319842  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26319841 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26319742  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  26319741 atcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 26319678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 9618722 - 9618985
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  9618722 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 9618821  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  9618822 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 9618921  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  9618922 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 9618985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26669986 - 26669723
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  26669986 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 26669887  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26669886 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26669787  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  26669786 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 26669723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 45387414 - 45387677
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  45387414 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 45387513  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  45387514 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 45387613  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  45387614 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttga 45387677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26537926 - 26537679
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  26537926 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 26537827  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  26537826 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatca 26537727  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26537726 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 26537679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16736532 - 16736269
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  16736532 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 16736433  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  16736432 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 16736333  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  16736332 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 16736269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16751586 - 16751323
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  16751586 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 16751487  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  16751486 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 16751387  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  16751386 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 16751323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 17523603 - 17523866
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  17523603 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 17523702  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  17523703 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 17523802  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  17523803 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 17523866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17529612 - 17529349
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  17529612 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 17529513  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  17529512 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 17529413  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  17529412 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 17529349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 31125001 - 31125254
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |    
T  31125001 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcg 31125100  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || ||    
T  31125101 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctacc 31125200  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31125201 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31125254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Original strand, 5159594 - 5159827
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||    
T  5159594 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatg 5159693  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    ||||| | || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  5159694 atgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 5159793  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     || || ||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  5159794 gctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgag 5159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Original strand, 22888445 - 22888809
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  22888445 caacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttc 22888544  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888545 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 22888644  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22888645 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctc 22888744  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22888745 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagact 22888809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Original strand, 25199004 - 25199371
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25199004 caacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttc 25199103  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199104 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 25199203  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  25199204 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctc 25199303  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25199304 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttga 25199371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13184835 - 13184473
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  13184835 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 13184736  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13184735 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 13184636  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13184635 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 13184536  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184535 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Original strand, 33877222 - 33877589
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  33877222 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 33877321  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877322 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 33877421  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33877422 gggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctc 33877521  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33877522 gacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13440681 - 13440319
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||    
T  13440681 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttc 13440582  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13440581 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 13440482  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13440481 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 13440382  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440381 gacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 11325769 - 11326131
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  11325769 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 11325868  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11325869 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctct 11325968  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11325969 gggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctc 11326068  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326069 gacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29888902
Alignment:
Q  12 cagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaag 111  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||| ||| ||| || |||||||||| ||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagag 29889164  T
Q  112 ggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889163 ggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 29889064  T
Q  212 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 311  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29889063 tgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaat 29888964  T
Q  312 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29888963 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttga 29888902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Original strand, 23892199 - 23892548
Alignment:
Q  24 caacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaa 123  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23892199 caacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaa 23892298  T
Q  124 ccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23892299 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaag 23892398  T
Q  224 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 323  Q
    |||||| ||| |||||||||| || || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892399 atgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 23892498  T
Q  324 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892499 catgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 23892548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24688240 - 24687977
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24688240 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggt 24688141  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  24688140 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 24688041  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24688040 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24687977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23752601 - 23752270
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  23752601 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 23752502  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23752501 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 23752402  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  23752401 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 23752302  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23752301 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9548626 - 9548363
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  9548626 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggt 9548527  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  9548526 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 9548427  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  9548426 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 9548363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 33777566 - 33777829
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  33777566 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 33777665  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  33777666 catgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 33777765  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  33777766 atcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 33777829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 11549365 - 11549696
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  11549365 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 11549464  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  11549465 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 11549564  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  11549565 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 11549664  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11549665 atcgaagtatgcgaggaagctcctagacttga 11549696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23718139 - 23717808
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  23718139 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 23718040  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23718039 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 23717940  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  23717939 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 23717840  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23717839 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23717808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 30934644 - 30934975
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | ||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  30934644 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 30934743  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  30934744 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 30934843  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | |||    
T  30934844 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatg 30934943  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30934944 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 30934975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 24970029 - 24970360
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  24970029 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 24970128  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  24970129 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 24970228  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||    || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  24970229 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatg 24970328  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||  | |||  |||||||||||| ||||||||    
T  24970329 atcaaagtacgtgaggaagctcctagacttga 24970360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22999187 - 22998934
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  22999187 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 22999088  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22999087 aggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcc 22998988  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22998987 aaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22998934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15658843 - 15658580
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  15658843 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 15658744  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  15658743 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 15658644  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||    
T  15658643 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttga 15658580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 9317530 - 9317793
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  9317530 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 9317629  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  9317630 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 9317729  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  9317730 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 9317793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 12132234 - 12132497
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  12132234 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 12132333  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  12132334 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 12132433  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  12132434 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 12132497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 30152097 - 30152360
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  30152097 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 30152196  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  30152197 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 30152296  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  30152297 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 30152360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37671562 - 37671303
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  37671562 cactgcacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 37671463  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  37671462 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 37671363  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  37671362 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 37671303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18375495 - 18375232
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  18375495 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 18375396  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  18375395 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 18375296  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  18375295 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18375232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 28649330 - 28649577
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  28649330 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 28649429  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  28649430 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 28649529  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  28649530 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 28649577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31826490 - 31826227
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  31826490 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 31826391  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  31826390 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 31826291  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  31826290 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 31826227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32599551 - 32599292
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  32599551 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatg 32599452  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    | || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  32599451 acgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcc 32599352  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||||||    
T  32599351 gctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttga 32599292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18500797 - 18500553
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  18500797 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 18500698  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  18500697 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 18500598  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18500597 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8665558 - 8665295
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  8665558 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 8665459  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  8665458 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 8665359  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  8665358 atccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 8665295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15758940 - 15758677
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  15758940 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 15758841  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  15758840 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 15758741  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  15758740 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 15758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 31431535 - 31431782
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||    
T  31431535 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggat 31431634  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31431635 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatca 31431734  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31431735 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31431782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 43078347 - 43078594
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  43078347 agacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 43078446  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43078447 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatca 43078546  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  43078547 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 43078594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29967139 - 29966886
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  29967139 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 29967040  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  29967039 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 29966940  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  29966939 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 29966886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 30029504 - 30029757
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  30029504 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 30029603  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  30029604 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 30029703  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  30029704 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 30029757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 33516445 - 33516698
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  33516445 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 33516544  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  33516545 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 33516644  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  33516645 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 33516698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37358716 - 37358463
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |    
T  37358716 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcg 37358617  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  37358616 aggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttcc 37358517  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  37358516 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 37358463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 347
Target Start/End: Original strand, 41674788 - 41675025
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||     
T  41674788 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggc 41674887  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| |    
T  41674888 catgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgata 41674987  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41674988 atccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 2511130 - 2511393
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  2511130 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 2511229  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  2511230 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 2511329  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  2511330 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 2511393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 3789624 - 3789883
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||    
T  3789624 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatg 3789723  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  3789724 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 3789823  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  3789824 gctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 3789883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 6874384 - 6874647
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  6874384 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 6874483  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  6874484 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 6874583  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  6874584 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 6874647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 26480471 - 26480734
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  26480471 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 26480570  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26480571 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26480670  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  26480671 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 26480734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 5637989 - 5638252
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5637989 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5638088  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||| || ||  |||| || ||||||||||    
T  5638089 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgaca 5638188  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  5638189 atcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 5638252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13324908 - 13324649
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  13324908 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatg 13324809  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||    
T  13324808 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 13324709  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  13324708 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 13324649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 34616607 - 34616860
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  34616607 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 34616706  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||    
T  34616707 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 34616806  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  34616807 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 34616860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 24681523 - 24681782
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  24681523 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 24681622  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  24681623 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 24681722  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24681723 gctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24681782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 24724050 - 24724309
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  24724050 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 24724149  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  24724150 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 24724249  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24724250 gctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24724309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 30168564 - 30168811
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  30168564 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 30168663  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  30168664 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatca 30168763  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  30168764 tgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttga 30168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37771054 - 37770807
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  37771054 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 37770955  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || |||||    
T  37770954 gttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatca 37770855  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||| | ||||||||    
T  37770854 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttga 37770807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40473628 - 40473369
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  40473628 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 40473529  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  40473528 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 40473429  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  40473428 tctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 40473369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Original strand, 33292608 - 33292841
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||    
T  33292608 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatg 33292707  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  33292708 atgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 33292807  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     || || ||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  33292808 gctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 37755075 - 37755322
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  37755075 agacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 37755174  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||||    
T  37755175 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatca 37755274  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  37755275 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 37755322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28959859 - 28959606
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  28959859 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 28959760  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||    
T  28959759 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 28959660  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||  |||| ||||||||    
T  28959659 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttga 28959606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 370
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20717
Alignment:
Q  31 aacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagaca 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20379 aacagcagcaacaagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagaca 20478  T
Q  131 gggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctac 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20479 gggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctac 20578  T
Q  231 gctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctg 330  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579 gctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctg 20677  T
Q  331 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20678 ctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagact 20717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 30532 - 30785
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  30532 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 30631  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30632 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 30731  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30732 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 30785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22457137 - 22456800
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  22457137 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggca 22457038  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22457037 agcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcttt 22456938  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
     ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456937 aaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 22456838  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456837 aacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 22456800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 28162620 - 28162982
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  28162620 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 28162719  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28162720 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 28162819  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  28162820 gggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 28162919  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162920 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33374489 - 33374127
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  33374489 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 33374390  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33374389 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 33374290  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33374289 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctc 33374190  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374189 gacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13522306 - 13521939
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  13522306 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 13522207  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522206 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 13522107  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13522106 gggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctc 13522007  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13522006 gacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8892543 - 8892182
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  8892543 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 8892444  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8892443 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 8892344  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  8892343 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 8892245  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8892244 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccaga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8903778 - 8903417
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  8903778 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 8903679  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8903678 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 8903579  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  8903578 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtc 8903480  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8903479 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccaga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14143488 - 14143151
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  14143488 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacagggga 14143389  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14143388 agcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 14143289  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14143288 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 14143189  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14143188 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 14143151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Original strand, 26787937 - 26788274
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  26787937 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacagggga 26788036  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26788037 agcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 26788136  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26788137 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 26788236  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26788237 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26788274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Original strand, 27196310 - 27196647
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  27196310 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacagggga 27196409  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27196410 agcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 27196509  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27196510 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 27196609  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27196610 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 27196647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27252930 - 27252593
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  27252930 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacagggga 27252831  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27252830 agcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt 27252731  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27252730 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtg 27252631  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27252630 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 27252593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290236
Alignment:
Q  12 cagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaag 111  Q
    ||||| || |||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 27290498  T
Q  112 ggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 211  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290497 ggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 27290398  T
Q  212 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  27290397 tgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaat 27290298  T
Q  312 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | |||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27290297 cttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttga 27290236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22477476 - 22477241
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  22477476 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggca 22477377  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22477376 agcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcttt 22477277  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaa 271  Q
     ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22477276 aaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 20160659 - 20161031
Alignment:
Q  1 aaaaacaacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccct 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||  |    
T  20160659 aaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaacttt 20160758  T
Q  101 acttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggt 200  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  20160759 acttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggt 20160858  T
Q  201 gctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatg 300  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| ||| |||||||||    
T  20160859 gccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatg 20160958  T
Q  301 tcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20160959 ttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22172172 - 22171800
Alignment:
Q  1 aaaaacaacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccct 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||  |    
T  22172172 aaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaacttt 22172073  T
Q  101 acttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggt 200  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  22172072 acttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggt 22171973  T
Q  201 gctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatg 300  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| ||| |||||||||    
T  22171972 gccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatg 22171873  T
Q  301 tcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  22171872 ttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27272771 - 27272446
Alignment:
Q  48 agacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctg 147  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27272771 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctg 27272672  T
Q  148 atccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 247  Q
    |||||| || |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27272671 atccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 27272572  T
Q  248 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 347  Q
     |||||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  27272571 gaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 27272472  T
Q  348 gtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27272471 gtatgtgaggtagctcctagacttga 27272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22935077 - 22934746
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | ||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  22935077 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 22934978  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  22934977 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 22934878  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  22934877 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 22934778  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22934777 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22934746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23857522 - 23857191
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | ||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  23857522 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 23857423  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23857422 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 23857323  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  23857322 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 23857223  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23857222 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23857191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 26918379 - 26918710
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  26918379 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 26918478  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  26918479 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 26918578  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  26918579 tatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 26918678  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  26918679 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 26918710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 16749853 - 16750184
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  16749853 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 16749952  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16749953 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 16750052  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  16750053 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 16750152  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16750153 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16750184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 26989000 - 26989331
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | ||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  26989000 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 26989099  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  26989100 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 26989199  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  26989200 tatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 26989299  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  26989300 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 26989331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13299148 - 13298817
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  13299148 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 13299049  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  13299048 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagta 13298949  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  13298948 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 13298849  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13298848 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 13298817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24304815 - 24304484
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  24304815 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 24304716  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| | |||||||||    
T  24304715 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagta 24304616  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  24304615 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 24304516  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24304515 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24304484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 24863784 - 24864047
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  24863784 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 24863883  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  24863884 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 24863983  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24863984 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24864047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Original strand, 27000140 - 27000394
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  27000140 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 27000239  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  27000240 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 27000339  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 364  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000340 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 29549542 - 29549805
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  29549542 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 29549641  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  29549642 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 29549741  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  29549742 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttga 29549805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15424514 - 15424183
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  15424514 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccc 15424415  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  15424414 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 15424315  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  15424314 tatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 15424215  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||  | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15424214 atcaaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15424183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 4773077 - 4773336
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  4773077 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatg 4773176  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||    
T  4773177 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 4773276  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4773277 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4773336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 16674210 - 16674469
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  16674210 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 16674309  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  16674310 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 16674409  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  16674410 tctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 16674469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 27007798 - 27008057
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  27007798 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 27007897  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||| |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||    
T  27007898 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 27007997  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| ||||||||    
T  27007998 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttga 27008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 4757841 - 4758094
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  4757841 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 4757940  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  4757941 agggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 4758040  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4758041 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4758094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27360111 - 27359858
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  27360111 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 27360012  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  27360011 agggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 27359912  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27359911 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27359858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27450454 - 27450201
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  27450454 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 27450355  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  27450354 agggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 27450255  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27450254 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27450201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 29573084 - 29573343
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  29573084 cactgcacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatg 29573183  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  29573184 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcc 29573283  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  29573284 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 29573343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4545894 - 4545641
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  4545894 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcg 4545795  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || ||    
T  4545794 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactacc 4545695  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4545694 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4545641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30558135 - 30557882
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  30558135 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 30558036  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30558035 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 30557936  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  30557935 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 30557882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 373
Target Start/End: Original strand, 4525360 - 4525616
Alignment:
Q  117 tgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatg 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  4525360 tgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatg 4525459  T
Q  217 ttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctct 316  Q
    | || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||    
T  4525460 tcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccact 4525559  T
Q  317 tccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4525560 accaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4525616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34463471 - 34463212
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  34463471 cactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatg 34463372  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  34463371 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 34463272  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  34463271 gctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 34463212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16944146 - 16943893
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  16944146 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 16944047  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  16944046 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 16943947  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  16943946 aaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 16943893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 3696164 - 3696411
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  3696164 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 3696263  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  3696264 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 3696363  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| ||||||||    
T  3696364 tgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttga 3696411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 29501492 - 29501745
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  29501492 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 29501591  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||    
T  29501592 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 29501691  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  29501692 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 29501745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4724247 - 4724000
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  4724247 agacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 4724148  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || || |||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || ||||||||||||||||| || || |||||    
T  4724147 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatca 4724048  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4724047 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4724000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26116523 - 26116276
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  26116523 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 26116424  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||||    
T  26116423 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatca 26116324  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26116323 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 26116276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 28207537 - 28207784
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || |    
T  28207537 agacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggt 28207636  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28207637 gttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatca 28207736  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  28207737 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 28207784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26777734 - 26777481
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  26777734 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 26777635  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  26777634 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 26777535  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||  ||| ||||||||    
T  26777534 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttga 26777481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 27044454 - 27044718
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  27044454 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 27044553  T
Q  210 catgatgttgaaggat-gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgac 308  Q
    |||||||| || || | | || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||    
T  27044554 catgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgac 27044653  T
Q  309 aatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27044654 aatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27044718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 17025348 - 17025607
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || ||||    
T  17025348 cactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatg 17025447  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||    
T  17025448 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 17025547  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  17025548 tcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 17025607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092306
Alignment:
Q  252 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 351  Q
    ||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  352 atgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttga 17092306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 27485206 - 27485459
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |    
T  27485206 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcg 27485305  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || ||    
T  27485306 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctacc 27485405  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  27485406 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 27485459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19659288 - 19658926
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  19659288 caacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttc 19659189  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19659188 tcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 19659089  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  19659088 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctc 19658990  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658989 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 44563067 - 44563427
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  44563067 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttc 44563166  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44563167 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 44563266  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  44563267 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtc 44563365  T
Q  306 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563366 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Original strand, 33244661 - 33244994
Alignment:
Q  36 cagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggta 135  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33244661 cagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggca 33244760  T
Q  136 agcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt 235  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33244761 agcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgtt 33244860  T
Q  236 gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtg 335  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  33244861 gaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgta 33244960  T
Q  336 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33244961 aacatgattgaggtatatgaggaagctctcagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Original strand, 9354588 - 9354956
Alignment:
Q  6 caacaacagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |    
T  9354588 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcc 9354687  T
Q  106 tcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9354688 tcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctat 9354787  T
Q  206 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt-aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcct 304  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||    
T  9354788 gggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtcct 9354887  T
Q  305 cgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  9354888 tgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 9354956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 48 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22081085 - 22080790
Alignment:
Q  48 agacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctg 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| | | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  22081085 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccaccta 22080986  T
Q  148 atccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 247  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080985 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 22080886  T
Q  248 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 343  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080885 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 372
Target Start/End: Original strand, 16283433 - 16283781
Alignment:
Q  24 caacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaa 123  Q
    |||||| |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| || | |||||| || ||||    
T  16283433 caacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaa 16283532  T
Q  124 ccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  16283533 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagg 16283632  T
Q  224 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 323  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16283633 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaat 16283732  T
Q  324 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttg 372  Q
    || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  16283733 catgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttg 16283781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 18710656 - 18710919
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  18710656 agggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggt 18710755  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  18710756 catgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 18710855  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18710856 accctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 18710919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 19688100 - 19688431
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  19688100 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 19688199  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  19688200 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 19688299  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || |||||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  19688300 tatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 19688399  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  19688400 atcgaagtatgcgaggaagctcctagacttga 19688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27609118 - 27608787
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  27609118 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 27609019  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27609018 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagta 27608919  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  27608918 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatg 27608819  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27608818 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27608787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 16277556 - 16277887
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16277556 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 16277655  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  16277656 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 16277755  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||    
T  16277756 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatg 16277855  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16277856 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16277887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2137472 - 2137141
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  2137472 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 2137373  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  2137372 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 2137273  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  2137272 tatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 2137173  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || | || |||| ||||||| ||||||||    
T  2137172 atcgaagcatgtgagaaagctcctagacttga 2137141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 14557626 - 14557957
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| |||||      
T  14557626 caagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccct 14557725  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  14557726 cgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 14557825  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||    
T  14557826 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtg 14557925  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14557926 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 14557957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 29829392 - 29829655
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||    
T  29829392 agggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 29829491  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  29829492 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 29829591  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  29829592 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 29829655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12092859 - 12092606
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  12092859 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcg 12092760  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  12092759 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 12092660  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  12092659 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 12092606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3329648 - 3329389
Alignment:
Q  114 cactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatg 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  3329648 cactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatg 3329549  T
Q  214 atgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcc 313  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  3329548 atgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 3329449  T
Q  314 tcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  3329448 tcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 3329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 31354526 - 31354857
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |  || ||  |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  31354526 caagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctc 31354625  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || |||||||||||    
T  31354626 cacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagta 31354725  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  31354726 tatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatg 31354825  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || || | |||||||||||||||||||||    
T  31354826 atcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttga 31354857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28362100 - 28361837
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  28362100 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 28362001  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  28362000 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 28361901  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  28361900 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 28361837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31489895 - 31489632
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||    
T  31489895 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggt 31489796  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  31489795 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 31489696  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  31489695 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 31489632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19208505 - 19208242
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  19208505 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 19208406  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  19208405 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 19208306  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  19208305 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 19208242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 19674511 - 19674774
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  19674511 agggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 19674610  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| ||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  19674611 catgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 19674710  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  19674711 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 19674774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 373
Target Start/End: Original strand, 33258803 - 33259056
Alignment:
Q  120 acaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  33258803 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 33258902  T
Q  220 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 319  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  33258903 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 33259002  T
Q  320 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  33259003 aaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 33259056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 373
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189427
Alignment:
Q  202 ctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgt 301  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  302 cctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 189427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 19286532 - 19286795
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  19286532 agggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 19286631  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  19286632 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 19286731  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  19286732 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 19286795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 1
Alignment:
Q  12 cagcccccagctcaacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaag 111  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 213  T
Q  112 ggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 211  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 ggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 113  T
Q  212 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaat 13  T
Q  312 cctcttccgaat 323  Q
    ||||||||||||    
T  12 cctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1844
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagact 1844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 370
Target Start/End: Original strand, 6098 - 6344
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttc-catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagga 224  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  | ||||||||||| || ||     
T  6098 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggg 6197  T
Q  225 tgctacgcttt-gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 323  Q
    || || ||||| |||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  6198 tgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 6297  T
Q  324 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 370  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6298 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 343
Target Start/End: Original strand, 21569 - 21864
Alignment:
Q  48 agacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctg 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  21569 agacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 21668  T
Q  148 atccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 247  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21669 acctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgt 21768  T
Q  248 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 343  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21769 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 541
Alignment:
Q  186 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  286 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    | ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| |||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttga 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Original strand, 27294 - 27625
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  27294 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 27393  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  27394 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 27493  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  27494 tatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 27593  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27594 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40323 - 39992
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  40323 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 40224  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  40223 cacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 40124  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || ||  |||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  40123 tatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 40024  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  40023 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 39992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47239 - 46908
Alignment:
Q  42 caagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggtaagcctc 141  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | ||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  47239 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 47140  T
Q  142 cacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  47139 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 47040  T
Q  242 cattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 341  Q
     || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  47039 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatg 46940  T
Q  342 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  46939 atcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 46908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Original strand, 29747 - 30096
Alignment:
Q  24 caacaaaaacaccagcaccaagctagacctacctttcccccgatcccaatgttatatgccgagttacccccgaccctacttctcaaagggcactgcacaa 123  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |  | |||||| || ||||    
T  29747 caacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 29846  T
Q  124 ccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  29847 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggg 29946  T
Q  224 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 323  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29947 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaat 30046  T
Q  324 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    || ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  30047 catgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttga 30096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 315 - 52
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||    
T  315 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggt 216  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  215 catgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 116  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  115 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 9652 - 9899
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  9652 agacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 9751  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  9752 gttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 9851  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  9852 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 9899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7425 - 7162
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  7425 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 7326  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  7325 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 7226  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  7225 atcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 7162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15116 - 14853
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  15116 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 15017  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  15016 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 14917  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  14916 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 14853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26388 - 26124
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatccca-ggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggg 208  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||    
T  26388 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctagg 26289  T
Q  209 tcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgac 308  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26288 tcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgac 26189  T
Q  309 aatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| ||||||||    
T  26188 aatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttga 26124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9252 - 8989
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  9252 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 9153  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  9152 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 9053  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  9052 atcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 20085 - 20348
Alignment:
Q  110 agggcactgcacaaccagacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  20085 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 20184  T
Q  210 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 309  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  20185 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 20284  T
Q  310 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  20285 atcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 20348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 8035 - 8282
Alignment:
Q  126 agacagggtaagcctccacctgatccgttgcatcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 225  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || |    
T  8035 agacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggt 8134  T
Q  226 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 325  Q
    | || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8135 gttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatca 8234  T
Q  326 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 373  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  8235 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46819 - 46764
Alignment:
Q  279 tttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 334  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46819 tttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgt 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University