View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6872A_low_20 (Length: 435)

Name: NF6872A_low_20
Description: NF6872A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6872A_low_20
NF6872A_low_20
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (19-435)||(24529023-24529441)
chr5 (19-435)||(9077757-9078173)
chr5 (19-435)||(24493371-24493789)
chr5 (16-435)||(25421330-25421753)
chr5 (19-435)||(25431197-25431615)
chr5 (19-430)||(1096271-1096683)
chr5 (19-430)||(23390401-23390814)
chr5 (19-323)||(21997548-21997852)
chr5 (19-435)||(13095297-13095715)
chr5 (19-435)||(13025113-13025531)
chr5 (19-430)||(8286747-8287163)
chr5 (115-429)||(22412083-22412388)
chr5 (19-342)||(21808384-21808708)
chr5 (19-342)||(21729059-21729384)
chr5 (19-430)||(22074822-22075235)
chr5 (115-376)||(29329831-29330090)
chr5 (112-376)||(10732946-10733208)
chr5 (115-376)||(42245371-42245630)
chr5 (122-376)||(11581205-11581458)
chr5 (115-376)||(264774-265033)
chr5 (115-338)||(2154658-2154879)
chr5 (115-376)||(20908909-20909168)
chr5 (115-376)||(29345877-29346136)
chr5 (115-376)||(32027290-32027549)
chr5 (19-292)||(19660879-19661154)
chr5 (115-375)||(39245033-39245291)
chr5 (115-376)||(29348350-29348609)
chr5 (19-435)||(21292870-21293289)
chr5 (115-376)||(10775681-10775942)
chr5 (122-376)||(29350830-29351082)
chr5 (144-376)||(39363310-39363540)
chr5 (19-364)||(37723704-37724049)
chr5 (122-376)||(36154789-36155039)
chr5 (115-313)||(20918017-20918212)
chr5 (143-338)||(20902053-20902248)
chr5 (123-323)||(23064415-23064614)
chr5 (123-323)||(31060974-31061171)
chr5 (125-323)||(38619337-38619537)
chr5 (122-376)||(18319039-18319290)
chr5 (122-323)||(24067013-24067210)
chr5 (123-278)||(20806845-20806998)
chr5 (144-314)||(36314504-36314675)
chr5 (24-241)||(22107709-22107926)
chr5 (146-429)||(40725782-40726069)
chr5 (144-364)||(17517174-17517400)
chr5 (115-342)||(21565445-21565668)
chr5 (24-274)||(26703882-26704129)
chr5 (24-274)||(26973615-26973862)
chr5 (111-292)||(21329541-21329719)
chr5 (115-418)||(22143951-22144254)
chr5 (115-339)||(26012033-26012255)
chr5 (282-429)||(20766035-20766174)
chr5 (122-269)||(19668805-19668951)
chr5 (122-292)||(22959576-22959741)
chr5 (115-334)||(20026942-20027158)
chr5 (186-287)||(21502205-21502308)
chr5 (24-173)||(23201164-23201312)
chr5 (39-173)||(21873073-21873206)
chr5 (70-290)||(23501402-23501622)
chr5 (320-435)||(21986047-21986164)
chr5 (36-173)||(23571893-23572029)
chr5 (39-181)||(14078969-14079111)
chr5 (230-429)||(18418594-18418793)
chr5 (374-430)||(22107278-22107334)
chr5 (19-86)||(23064330-23064396)
chr5 (19-86)||(36314353-36314420)
chr5 (122-180)||(14047988-14048046)
chr5 (189-277)||(26740705-26740789)
chr5 (36-162)||(18770179-18770304)
chr5 (19-86)||(40725673-40725740)
chr5 (19-86)||(41095852-41095918)
chr5 (19-86)||(41095895-41095961)
chr5 (200-262)||(27989004-27989061)
chr5 (19-85)||(40725717-40725783)
chr5 (144-181)||(18418528-18418565)
chr5 (232-277)||(26732892-26732937)
chr5 (19-84)||(31060889-31060953)
chr5 (36-277)||(22032139-22032380)
chr5 (39-126)||(23511919-23512006)
chr5 (123-179)||(41095692-41095747)
chr5 (19-86)||(18418421-18418488)
chr5 (19-86)||(31060846-31060912)
chr5 (70-153)||(33895953-33896035)
chr5 (19-86)||(40725630-40725696)
chr5 (19-86)||(41095809-41095875)
chr5 (19-80)||(18418465-18418526)
chr5 (19-84)||(20807019-20807083)
chr5 (93-162)||(21366839-21366907)
chr5 (243-316)||(21873277-21873350)
chr5 (19-80)||(23064373-23064433)
chr5 (19-80)||(39363247-39363308)
chr5 (19-55)||(38619293-38619329)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (19-435)||(34509583-34510001)
chr1 (19-435)||(50210113-50210536)
chr1 (19-435)||(22532072-22532490)
chr1 (19-430)||(27250634-27251048)
chr1 (19-430)||(20134984-20135403)
chr1 (115-376)||(31612209-31612469)
chr1 (115-376)||(13988763-13989022)
chr1 (115-376)||(21923297-21923556)
chr1 (115-376)||(23593741-23594000)
chr1 (115-376)||(21475093-21475352)
chr1 (115-376)||(29298034-29298292)
chr1 (123-376)||(29776592-29776844)
chr1 (33-318)||(20847173-20847459)
chr1 (115-376)||(22123073-22123333)
chr1 (24-428)||(22468604-22469014)
chr1 (117-376)||(45574848-45575108)
chr1 (159-429)||(432952-433222)
chr1 (19-429)||(38801297-38801707)
chr1 (143-417)||(21346885-21347161)
chr1 (122-376)||(21711612-21711865)
chr1 (123-376)||(21707071-21707323)
chr1 (143-417)||(21342021-21342296)
chr1 (144-376)||(13212867-13213099)
chr1 (143-376)||(16361835-16362073)
chr1 (144-376)||(21840686-21840923)
chr1 (19-230)||(21477445-21477656)
chr1 (127-323)||(16275423-16275616)
chr1 (202-430)||(21026666-21026896)
chr1 (122-323)||(40389060-40389257)
chr1 (24-274)||(21714352-21714600)
chr1 (194-323)||(15860068-15860195)
chr1 (122-238)||(27161605-27161721)
chr1 (144-319)||(14295569-14295745)
chr1 (115-342)||(33680910-33681133)
chr1 (39-241)||(22131180-22131380)
chr1 (144-277)||(20454613-20454752)
chr1 (115-423)||(35260992-35261295)
chr1 (39-241)||(48603088-48603288)
chr1 (115-342)||(22237530-22237753)
chr1 (24-277)||(42865273-42865526)
chr1 (60-175)||(20916070-20916185)
chr1 (122-338)||(21753957-21754166)
chr1 (115-397)||(21896194-21896473)
chr1 (202-342)||(22921864-22922001)
chr1 (200-429)||(16758638-16758866)
chr1 (293-430)||(22354477-22354616)
chr1 (200-395)||(21861510-21861702)
chr1 (122-269)||(52928038-52928181)
chr1 (374-433)||(48603674-48603733)
chr1 (82-277)||(21161588-21161778)
chr1 (115-331)||(20248184-20248394)
chr1 (19-86)||(13213139-13213206)
chr1 (19-86)||(16361729-16361796)
chr1 (82-177)||(20091636-20091730)
chr1 (24-173)||(21788208-21788356)
chr1 (19-86)||(29776461-29776528)
chr1 (200-338)||(41050033-41050168)
chr1 (19-85)||(21840449-21840514)
chr1 (374-435)||(22356074-22356136)
chr1 (374-435)||(22357760-22357822)
chr1 (115-338)||(16368284-16368502)
chr1 (232-319)||(20918620-20918707)
chr1 (200-339)||(50614113-50614249)
chr1 (200-339)||(50621941-50622077)
chr1 (36-181)||(6151665-6151810)
chr1 (19-86)||(14295829-14295896)
chr1 (37-162)||(22831560-22831684)
chr1 (19-86)||(21840579-21840646)
chr1 (19-86)||(45575122-45575189)
chr1 (115-157)||(431655-431697)
chr1 (37-181)||(18182275-18182418)
chr1 (19-84)||(20454837-20454901)
chr1 (19-75)||(45575089-45575145)
chr1 (19-86)||(14295785-14295852)
chr1 (354-429)||(21477654-21477732)
chr1 (19-86)||(29776505-29776572)
chr1 (265-335)||(33797570-33797638)
chr1 (32-86)||(45575166-45575220)
chr1 (56-86)||(50210513-50210543)
chr1 (19-80)||(13213101-13213162)
chr1 (19-80)||(14295747-14295808)
chr1 (19-80)||(20454754-20454815)
chr1 (19-80)||(21840623-21840684)
chr1 (19-86)||(21341915-21341982)
chr1 (19-86)||(21346779-21346846)
chr1 (201-274)||(24783155-24783230)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (19-429)||(29060343-29060755)
chr6 (19-430)||(25629260-25629671)
chr6 (42-435)||(18409727-18410126)
chr6 (56-435)||(19303441-19303821)
chr6 (57-428)||(20593615-20593987)
chr6 (19-435)||(22780127-22780545)
chr6 (19-435)||(20638183-20638603)
chr6 (19-430)||(17287701-17288114)
chr6 (61-435)||(20360860-20361238)
chr6 (115-376)||(2291186-2291445)
chr6 (115-376)||(18334598-18334857)
chr6 (115-376)||(19004943-19005202)
chr6 (115-376)||(24422444-24422703)
chr6 (115-376)||(33861691-33861950)
chr6 (19-376)||(20076506-20076856)
chr6 (115-376)||(19858925-19859184)
chr6 (115-376)||(33864175-33864434)
chr6 (131-376)||(22782139-22782383)
chr6 (19-319)||(28496489-28496790)
chr6 (19-319)||(29808900-29809201)
chr6 (115-376)||(1595446-1595705)
chr6 (115-376)||(8054926-8055185)
chr6 (115-376)||(26924646-26924905)
chr6 (115-375)||(1540918-1541176)
chr6 (115-376)||(12742214-12742473)
chr6 (115-376)||(20556900-20557158)
chr6 (123-376)||(25754715-25754965)
chr6 (116-376)||(3852023-3852280)
chr6 (19-316)||(35245386-35245684)
chr6 (122-338)||(25688405-25688620)
chr6 (19-269)||(1561104-1561356)
chr6 (122-376)||(16448532-16448783)
chr6 (58-241)||(19773818-19774003)
chr6 (37-435)||(22831322-22831723)
chr6 (19-318)||(16920651-16920950)
chr6 (27-217)||(22805559-22805749)
chr6 (144-376)||(34963292-34963529)
chr6 (145-376)||(30676716-30676952)
chr6 (19-315)||(25611744-25612047)
chr6 (122-277)||(25714323-25714478)
chr6 (177-342)||(16496204-16496370)
chr6 (23-318)||(11185318-11185605)
chr6 (200-429)||(18456705-18456930)
chr6 (19-421)||(25603299-25603709)
chr6 (209-323)||(25656619-25656732)
chr6 (187-429)||(25644295-25644537)
chr6 (146-429)||(8227416-8227703)
chr6 (200-369)||(18461865-18462028)
chr6 (115-363)||(20109039-20109285)
chr6 (186-339)||(23019377-23019529)
chr6 (24-274)||(25642250-25642499)
chr6 (144-342)||(19847990-19848194)
chr6 (24-274)||(19862783-19863032)
chr6 (115-339)||(19652098-19652317)
chr6 (200-386)||(18821795-18821976)
chr6 (24-274)||(19872925-19873174)
chr6 (24-305)||(22432054-22432334)
chr6 (24-305)||(22438604-22438884)
chr6 (36-181)||(22335053-22335197)
chr6 (82-287)||(4185870-4186069)
chr6 (82-268)||(4186240-4186419)
chr6 (115-263)||(22080799-22080945)
chr6 (82-268)||(4738626-4738805)
chr6 (24-181)||(15894593-15894749)
chr6 (115-334)||(19668275-19668491)
chr6 (144-322)||(23992349-23992533)
chr6 (83-269)||(31155465-31155644)
chr6 (70-173)||(31165006-31165107)
chr6 (219-292)||(27333262-27333336)
chr6 (219-292)||(27394002-27394076)
chr6 (200-321)||(9098528-9098646)
chr6 (88-421)||(15041465-15041799)
chr6 (200-257)||(19008787-19008843)
chr6 (237-293)||(33443068-33443124)
chr6 (19-85)||(8227702-8227768)
chr6 (82-178)||(16965471-16965566)
chr6 (93-162)||(18692086-18692154)
chr6 (19-86)||(19848234-19848301)
chr6 (19-86)||(19848278-19848345)
chr6 (19-86)||(34963185-34963252)
chr6 (116-162)||(13019394-13019439)
chr6 (37-162)||(18906928-18907052)
chr6 (19-84)||(3852338-3852402)
chr6 (19-84)||(4642934-4642998)
chr6 (93-162)||(16523558-16523626)
chr6 (19-80)||(23992286-23992347)
chr6 (19-80)||(34963229-34963290)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (19-435)||(16377423-16377839)
chr4 (19-435)||(7893505-7893921)
chr4 (16-435)||(44052628-44053050)
chr4 (19-396)||(7798577-7798956)
chr4 (19-430)||(22636238-22636650)
chr4 (27-430)||(12902567-12902973)
chr4 (19-435)||(16239870-16240288)
chr4 (56-429)||(14038498-14038863)
chr4 (58-426)||(16270145-16270515)
chr4 (122-429)||(54798669-54798969)
chr4 (122-429)||(14280219-14280518)
chr4 (115-376)||(18215280-18215540)
chr4 (115-429)||(44928829-44929146)
chr4 (122-376)||(12313-12565)
chr4 (115-376)||(15118358-15118617)
chr4 (19-430)||(23374264-23374672)
chr4 (115-376)||(44773093-44773352)
chr4 (115-376)||(50222345-50222604)
chr4 (115-376)||(52312407-52312666)
chr4 (115-376)||(44615185-44615444)
chr4 (115-375)||(18239426-18239684)
chr4 (122-341)||(52873363-52873582)
chr4 (115-369)||(1837522-1837774)
chr4 (115-429)||(8574784-8575088)
chr4 (115-376)||(15355330-15355591)
chr4 (19-430)||(17046288-17046700)
chr4 (19-435)||(14053202-14053621)
chr4 (115-376)||(7641198-7641447)
chr4 (123-376)||(51463874-51464124)
chr4 (58-302)||(3096134-3096379)
chr4 (123-376)||(23803271-23803521)
chr4 (123-376)||(12610856-12611099)
chr4 (145-429)||(44102140-44102425)
chr4 (172-430)||(7088832-7089093)
chr4 (63-287)||(15551663-15551889)
chr4 (134-363)||(6899808-6900037)
chr4 (123-323)||(15369925-15370124)
chr4 (123-323)||(15371109-15371308)
chr4 (123-429)||(15367597-15367905)
chr4 (123-429)||(15402610-15402918)
chr4 (144-376)||(19618178-19618415)
chr4 (123-323)||(15373390-15373589)
chr4 (194-376)||(19242675-19242855)
chr4 (123-323)||(16223439-16223638)
chr4 (194-376)||(3514982-3515163)
chr4 (144-376)||(14970713-14970950)
chr4 (122-323)||(20149735-20149932)
chr4 (200-376)||(21815591-21815761)
chr4 (186-429)||(52243099-52243343)
chr4 (122-397)||(13789-14061)
chr4 (115-323)||(39706302-39706511)
chr4 (39-241)||(17048409-17048609)
chr4 (24-284)||(12569820-12570078)
chr4 (123-376)||(22353740-22353993)
chr4 (115-396)||(43198492-43198769)
chr4 (24-181)||(44675436-44675593)
chr4 (24-173)||(13569306-13569454)
chr4 (112-338)||(12773910-12774128)
chr4 (24-181)||(15125197-15125354)
chr4 (24-181)||(23843282-23843439)
chr4 (200-334)||(12288211-12288342)
chr4 (144-292)||(8846287-8846433)
chr4 (39-181)||(15093594-15093736)
chr4 (115-168)||(29267517-29267570)
chr4 (235-369)||(6190481-6190616)
chr4 (36-181)||(15121956-15122101)
chr4 (374-428)||(17047979-17048033)
chr4 (374-435)||(3096803-3096864)
chr4 (34-86)||(19618499-19618551)
chr4 (112-338)||(46640453-46640675)
chr4 (19-86)||(19242536-19242603)
chr4 (19-86)||(22353609-22353676)
chr4 (115-228)||(14927843-14927955)
chr4 (200-286)||(53082202-53082284)
chr4 (19-84)||(15705192-15705256)
chr4 (19-86)||(14971078-14971145)
chr4 (19-86)||(19242493-19242559)
chr4 (19-86)||(22353653-22353720)
chr4 (298-376)||(15464892-15464970)
chr4 (19-84)||(12610728-12610792)
chr4 (19-84)||(12610771-12610835)
chr4 (19-84)||(15367512-15367576)
chr4 (19-80)||(19242580-19242641)
chr4 (19-84)||(23803542-23803606)
chr4 (19-84)||(23803585-23803649)
chr4 (19-84)||(51464145-51464209)
chr4 (237-277)||(17333298-17333338)
chr4 (42-98)||(39706543-39706598)
[»] chr3 (130 HSPs)
chr3 (19-435)||(40213621-40214038)
chr3 (42-435)||(14972682-14973075)
chr3 (19-430)||(25476290-25476701)
chr3 (19-435)||(23083261-23083679)
chr3 (19-435)||(17487659-17488077)
chr3 (19-430)||(43840735-43841148)
chr3 (19-435)||(18438337-18438755)
chr3 (19-435)||(17499141-17499559)
chr3 (56-430)||(11424668-11425040)
chr3 (58-435)||(13442115-13442495)
chr3 (58-430)||(26686729-26687103)
chr3 (19-435)||(20698336-20698755)
chr3 (19-430)||(12399011-12399425)
chr3 (115-429)||(24153115-24153430)
chr3 (115-429)||(21618345-21618650)
chr3 (42-435)||(14576733-14577124)
chr3 (115-429)||(36166494-36166799)
chr3 (115-376)||(29172589-29172849)
chr3 (115-376)||(17463075-17463334)
chr3 (115-376)||(34159223-34159482)
chr3 (115-376)||(16454287-16454546)
chr3 (115-375)||(28848618-28848876)
chr3 (122-376)||(8898998-8899250)
chr3 (115-376)||(13151796-13152056)
chr3 (115-376)||(13154261-13154521)
chr3 (115-376)||(38961897-38962157)
chr3 (115-376)||(45606913-45607172)
chr3 (115-333)||(55500839-55501055)
chr3 (115-376)||(9707613-9707872)
chr3 (115-376)||(16282817-16283076)
chr3 (115-376)||(17446661-17446919)
chr3 (122-376)||(7781353-7781605)
chr3 (115-376)||(10247729-10247988)
chr3 (115-338)||(6469178-6469395)
chr3 (42-435)||(14572417-14572809)
chr3 (115-338)||(15977409-15977633)
chr3 (62-429)||(24340628-24340999)
chr3 (19-331)||(13210333-13210647)
chr3 (144-376)||(55476417-55476647)
chr3 (115-376)||(41123787-41124043)
chr3 (123-323)||(8499422-8499621)
chr3 (117-376)||(43550484-43550744)
chr3 (116-339)||(10556882-10557105)
chr3 (123-323)||(15412333-15412532)
chr3 (123-376)||(50242728-50242978)
chr3 (123-323)||(12119784-12119983)
chr3 (19-424)||(30029637-30030049)
chr3 (19-429)||(23274489-23274903)
chr3 (234-435)||(42386428-42386632)
chr3 (123-376)||(27165154-27165407)
chr3 (116-272)||(45577947-45578102)
chr3 (144-376)||(12567479-12567716)
chr3 (144-376)||(13543944-13544181)
chr3 (123-319)||(44494715-44494908)
chr3 (105-364)||(12510939-12511205)
chr3 (141-376)||(53301511-53301747)
chr3 (123-318)||(17737142-17737337)
chr3 (19-159)||(10542619-10542759)
chr3 (123-277)||(28194599-28194752)
chr3 (24-305)||(15878083-15878363)
chr3 (144-364)||(46822187-46822413)
chr3 (145-429)||(37642170-37642458)
chr3 (19-136)||(10542852-10542969)
chr3 (219-376)||(17672626-17672782)
chr3 (235-376)||(53070659-53070799)
chr3 (24-277)||(23408234-23408485)
chr3 (19-135)||(14682183-14682300)
chr3 (19-136)||(10542747-10542864)
chr3 (115-339)||(15470827-15471047)
chr3 (19-135)||(14670661-14670778)
chr3 (115-334)||(14234382-14234605)
chr3 (146-429)||(22147431-22147717)
chr3 (115-331)||(12174265-12174467)
chr3 (115-322)||(9512825-9513026)
chr3 (115-322)||(9520800-9521001)
chr3 (115-342)||(16103685-16103905)
chr3 (115-322)||(49668091-49668292)
chr3 (115-429)||(52523633-52523946)
chr3 (122-342)||(16097238-16097454)
chr3 (202-338)||(32307666-32307798)
chr3 (374-433)||(14179592-14179651)
chr3 (115-338)||(22110349-22110569)
chr3 (38-173)||(23077642-23077776)
chr3 (19-86)||(27165069-27165135)
chr3 (200-338)||(37251165-37251300)
chr3 (122-292)||(1644718-1644882)
chr3 (39-114)||(16796117-16796192)
chr3 (200-339)||(43925947-43926083)
chr3 (19-86)||(8499337-8499403)
chr3 (36-181)||(15067499-15067644)
chr3 (19-86)||(15412248-15412314)
chr3 (36-181)||(16369216-16369361)
chr3 (95-241)||(16796195-16796339)
chr3 (19-86)||(53301784-53301850)
chr3 (19-85)||(22147716-22147782)
chr3 (38-181)||(23053244-23053387)
chr3 (298-396)||(2051138-2051238)
chr3 (39-181)||(14878672-14878814)
chr3 (27-86)||(12120045-12120103)
chr3 (19-86)||(22147759-22147826)
chr3 (19-62)||(26683157-26683200)
chr3 (19-86)||(46822080-46822147)
chr3 (374-428)||(16796707-16796761)
chr3 (19-80)||(46822124-46822185)
chr3 (237-277)||(13919350-13919390)
chr3 (19-75)||(28194557-28194612)
chr3 (19-86)||(10556804-10556870)
chr3 (201-277)||(14665380-14665458)
chr3 (19-86)||(15076200-15076267)
chr3 (19-86)||(15076244-15076311)
chr3 (19-86)||(22147803-22147869)
chr3 (19-86)||(28194514-28194580)
chr3 (19-86)||(43550758-43550825)
chr3 (19-85)||(12120003-12120068)
chr3 (36-86)||(43550802-43550852)
chr3 (32-86)||(46822049-46822103)
chr3 (220-277)||(856140-856197)
chr3 (19-80)||(10556847-10556907)
chr3 (19-80)||(15412291-15412351)
chr3 (19-84)||(17737057-17737121)
chr3 (93-162)||(18384090-18384158)
chr3 (220-277)||(23077537-23077594)
chr3 (19-80)||(27165112-27165172)
chr3 (19-84)||(50242643-50242707)
chr3 (19-80)||(55476354-55476415)
chr3 (82-181)||(12172658-12172757)
chr3 (201-274)||(14668536-14668611)
chr3 (82-181)||(15051371-15051470)
chr3 (19-75)||(43550725-43550781)
chr3 (58-86)||(43840730-43840758)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (19-435)||(23060315-23060733)
chr2 (19-435)||(22336928-22337336)
chr2 (20-430)||(22731139-22731551)
chr2 (58-435)||(23076288-23076663)
chr2 (19-430)||(23654291-23654706)
chr2 (19-430)||(22738085-22738497)
chr2 (133-435)||(23659940-23660243)
chr2 (23-293)||(8946463-8946734)
chr2 (115-376)||(18808840-18809099)
chr2 (115-376)||(23712019-23712278)
chr2 (115-376)||(39682210-39682469)
chr2 (115-375)||(23135487-23135745)
chr2 (115-376)||(24367670-24367930)
chr2 (115-376)||(26505276-26505535)
chr2 (115-376)||(26507754-26508013)
chr2 (122-376)||(21155066-21155318)
chr2 (115-376)||(24905638-24905898)
chr2 (115-376)||(24908113-24908373)
chr2 (115-369)||(45029867-45030119)
chr2 (115-376)||(23709538-23709797)
chr2 (19-277)||(23040249-23040509)
chr2 (115-376)||(24898201-24898461)
chr2 (115-376)||(24900684-24900944)
chr2 (115-376)||(24903161-24903421)
chr2 (115-376)||(571294-571553)
chr2 (115-376)||(6725892-6726151)
chr2 (19-435)||(38016-38435)
chr2 (115-376)||(28576996-28577255)
chr2 (115-376)||(32039504-32039763)
chr2 (115-338)||(24529573-24529795)
chr2 (144-376)||(23130788-23131018)
chr2 (144-376)||(23133255-23133485)
chr2 (144-376)||(34402528-34402758)
chr2 (19-364)||(23103370-23103714)
chr2 (123-376)||(43137204-43137455)
chr2 (19-314)||(23071972-23072269)
chr2 (124-376)||(22105319-22105569)
chr2 (55-435)||(20308945-20309326)
chr2 (122-296)||(24643036-24643209)
chr2 (123-376)||(38967279-38967531)
chr2 (19-230)||(21900560-21900773)
chr2 (123-430)||(298719-299027)
chr2 (170-430)||(23285818-23286077)
chr2 (62-429)||(19671675-19672043)
chr2 (144-376)||(32214927-32215164)
chr2 (186-429)||(23708524-23708769)
chr2 (24-274)||(22741027-22741276)
chr2 (144-364)||(25616107-25616333)
chr2 (115-342)||(28405881-28406103)
chr2 (115-342)||(25175754-25175976)
chr2 (115-376)||(7694-7950)
chr2 (24-181)||(22758875-22759031)
chr2 (56-137)||(23657632-23657713)
chr2 (122-269)||(18786971-18787113)
chr2 (115-292)||(7679480-7679662)
chr2 (115-292)||(22134251-22134428)
chr2 (39-181)||(22799282-22799424)
chr2 (235-386)||(32451878-32452031)
chr2 (200-429)||(20520098-20520325)
chr2 (39-316)||(23019727-23020004)
chr2 (374-435)||(27753735-27753796)
chr2 (200-338)||(23207266-23207401)
chr2 (115-422)||(22413048-22413354)
chr2 (36-181)||(24673383-24673529)
chr2 (19-86)||(32215204-32215271)
chr2 (237-286)||(23287384-23287433)
chr2 (36-181)||(24680000-24680146)
chr2 (237-277)||(26392403-26392443)
chr2 (115-162)||(23713058-23713104)
chr2 (305-376)||(24642862-24642933)
chr2 (36-162)||(45678304-45678429)
chr2 (32-86)||(32215248-32215302)
chr2 (19-80)||(23130725-23130786)
chr2 (19-80)||(23133192-23133253)
chr2 (19-80)||(34402760-34402821)
chr2 (19-84)||(38967194-38967258)
chr2 (19-84)||(43137075-43137139)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (46-435)||(3051-3441)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (19-435)||(17115-17539)
scaffold0056 (235-369)||(79297-79430)
scaffold0056 (24-284)||(14139-14399)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (19-435)||(339850-340263)
scaffold0003 (115-376)||(158456-158716)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (56-435)||(4350-4728)
scaffold0228 (56-435)||(11932-12310)
scaffold0228 (56-435)||(21884-22262)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (19-430)||(18818314-18818727)
chr8 (19-430)||(22874872-22875281)
chr8 (56-435)||(16092241-16092621)
chr8 (63-435)||(28648944-28649322)
chr8 (43-435)||(6759088-6759477)
chr8 (19-430)||(7372581-7372986)
chr8 (22-430)||(23406185-23406597)
chr8 (19-430)||(22626540-22626951)
chr8 (19-435)||(18879137-18879547)
chr8 (19-430)||(20536011-20536424)
chr8 (42-435)||(21923828-21924222)
chr8 (58-435)||(21918900-21919279)
chr8 (19-435)||(23648350-23648774)
chr8 (115-429)||(26219613-26219918)
chr8 (19-435)||(45130898-45131316)
chr8 (115-376)||(5853298-5853557)
chr8 (115-362)||(26225268-26225513)
chr8 (115-376)||(1484299-1484558)
chr8 (115-376)||(20046201-20046460)
chr8 (115-376)||(20403124-20403383)
chr8 (115-376)||(4542379-4542638)
chr8 (115-376)||(22001651-22001909)
chr8 (116-429)||(41598086-41598399)
chr8 (122-376)||(15203237-15203489)
chr8 (115-376)||(19896162-19896424)
chr8 (58-435)||(31971097-31971476)
chr8 (115-319)||(45290758-45290961)
chr8 (19-319)||(5866292-5866594)
chr8 (123-376)||(14409450-14409702)
chr8 (19-435)||(21389353-21389770)
chr8 (115-376)||(14823671-14823929)
chr8 (19-266)||(21255024-21255272)
chr8 (19-402)||(13597550-13597937)
chr8 (19-266)||(21249186-21249434)
chr8 (19-402)||(13508018-13508403)
chr8 (19-319)||(17140715-17141019)
chr8 (144-376)||(4483207-4483436)
chr8 (19-417)||(21778697-21779096)
chr8 (23-433)||(21395885-21396296)
chr8 (23-433)||(21790378-21790789)
chr8 (19-313)||(21490796-21491092)
chr8 (70-435)||(16199546-16199913)
chr8 (123-376)||(25484281-25484524)
chr8 (144-376)||(16413322-16413547)
chr8 (116-429)||(17612018-17612332)
chr8 (144-338)||(26223841-26224037)
chr8 (194-323)||(19937065-19937192)
chr8 (112-342)||(38855246-38855474)
chr8 (144-364)||(32121654-32121880)
chr8 (115-334)||(6520267-6520486)
chr8 (235-429)||(19801333-19801527)
chr8 (232-323)||(15070571-15070661)
chr8 (115-342)||(23760839-23761062)
chr8 (186-339)||(21285569-21285720)
chr8 (112-337)||(26355699-26355919)
chr8 (123-223)||(22965608-22965707)
chr8 (116-334)||(983407-983622)
chr8 (115-342)||(21673608-21673830)
chr8 (36-181)||(16184537-16184682)
chr8 (24-241)||(44384944-44385160)
chr8 (115-397)||(20498466-20498745)
chr8 (24-363)||(17353912-17354255)
chr8 (189-364)||(18678075-18678256)
chr8 (25-181)||(19898900-19899056)
chr8 (39-181)||(21168887-21169031)
chr8 (39-173)||(23777000-23777133)
chr8 (353-428)||(25363047-25363124)
chr8 (70-181)||(24755565-24755676)
chr8 (24-181)||(19982897-19983054)
chr8 (43-181)||(20466197-20466335)
chr8 (235-403)||(37116366-37116537)
chr8 (19-86)||(14409721-14409787)
chr8 (19-85)||(18678273-18678339)
chr8 (115-339)||(17266990-17267211)
chr8 (235-417)||(17439423-17439609)
chr8 (19-86)||(22965521-22965588)
chr8 (19-84)||(26223692-26223756)
chr8 (200-339)||(24353009-24353144)
chr8 (378-429)||(26222987-26223039)
chr8 (19-86)||(17612344-17612410)
chr8 (35-86)||(18678316-18678367)
chr8 (82-140)||(377132-377189)
chr8 (19-80)||(4483144-4483205)
chr8 (19-80)||(14409684-14409744)
chr8 (19-80)||(17612307-17612367)
chr8 (19-84)||(25484588-25484652)
chr8 (19-80)||(26223778-26223839)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (19-435)||(51716-52134)
scaffold0011 (19-430)||(167884-168297)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (42-435)||(16500-16893)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (19-430)||(9508991-9509405)
chr7 (117-435)||(3564264-3564584)
chr7 (19-430)||(12698634-12699048)
chr7 (115-429)||(48273288-48273594)
chr7 (115-429)||(18456319-18456634)
chr7 (19-435)||(10588838-10589259)
chr7 (27-430)||(26211804-26212212)
chr7 (80-435)||(38227344-38227701)
chr7 (115-376)||(11972393-11972652)
chr7 (115-376)||(14949128-14949387)
chr7 (115-376)||(32125388-32125647)
chr7 (115-376)||(41522814-41523073)
chr7 (115-376)||(41525276-41525535)
chr7 (115-376)||(44116405-44116665)
chr7 (19-424)||(15143948-15144350)
chr7 (115-376)||(15376719-15376978)
chr7 (115-376)||(21189601-21189860)
chr7 (115-376)||(24702135-24702394)
chr7 (115-376)||(456218-456477)
chr7 (115-376)||(16232417-16232676)
chr7 (115-376)||(16409956-16410215)
chr7 (115-376)||(20385129-20385388)
chr7 (115-376)||(11393293-11393552)
chr7 (115-376)||(27216757-27217016)
chr7 (115-376)||(24704585-24704841)
chr7 (122-376)||(18640176-18640428)
chr7 (58-430)||(16386152-16386529)
chr7 (115-376)||(20110452-20110702)
chr7 (123-376)||(3386239-3386489)
chr7 (19-241)||(14258062-14258286)
chr7 (19-319)||(34200585-34200889)
chr7 (19-313)||(11996051-11996347)
chr7 (117-376)||(13647225-13647485)
chr7 (123-323)||(13869250-13869449)
chr7 (123-376)||(38898382-38898635)
chr7 (19-342)||(10063813-10064136)
chr7 (19-202)||(13032560-13032744)
chr7 (123-338)||(13831279-13831491)
chr7 (19-314)||(28505321-28505604)
chr7 (122-429)||(17061866-17062173)
chr7 (194-376)||(18430687-18430868)
chr7 (117-435)||(40443292-40443610)
chr7 (60-429)||(27847739-27848109)
chr7 (194-376)||(16213659-16213840)
chr7 (122-376)||(26355989-26356255)
chr7 (122-376)||(26358441-26358707)
chr7 (143-369)||(24275089-24275320)
chr7 (19-157)||(16579377-16579515)
chr7 (19-157)||(16586148-16586286)
chr7 (115-420)||(2280033-2280339)
chr7 (24-364)||(18154810-18155152)
chr7 (105-269)||(15754955-15755120)
chr7 (115-248)||(15082017-15082147)
chr7 (144-319)||(16495329-16495505)
chr7 (122-338)||(67651-67867)
chr7 (145-429)||(19486649-19486937)
chr7 (19-136)||(16461233-16461350)
chr7 (115-342)||(18005550-18005772)
chr7 (24-364)||(19649458-19649801)
chr7 (200-429)||(12756622-12756847)
chr7 (186-339)||(22072882-22073037)
chr7 (24-177)||(24054270-24054421)
chr7 (122-323)||(811145-811343)
chr7 (122-269)||(47831712-47831860)
chr7 (122-335)||(16219719-16219928)
chr7 (19-136)||(16461338-16461455)
chr7 (115-342)||(44014082-44014301)
chr7 (19-136)||(15755152-15755271)
chr7 (122-339)||(16056239-16056450)
chr7 (24-173)||(9703067-9703215)
chr7 (19-98)||(16461166-16461245)
chr7 (122-197)||(18427436-18427510)
chr7 (231-429)||(1867901-1868101)
chr7 (144-226)||(16213550-16213632)
chr7 (200-429)||(15008404-15008631)
chr7 (36-315)||(15211271-15211557)
chr7 (19-75)||(3564565-3564621)
chr7 (24-181)||(32216704-32216861)
chr7 (19-75)||(40443255-40443311)
chr7 (36-277)||(17138120-17138361)
chr7 (19-86)||(13869165-13869231)
chr7 (19-86)||(16213443-16213510)
chr7 (19-86)||(38898654-38898720)
chr7 (220-322)||(14932749-14932851)
chr7 (220-322)||(15356184-15356286)
chr7 (220-322)||(15360298-15360400)
chr7 (231-334)||(12901338-12901443)
chr7 (112-157)||(16461129-16461174)
chr7 (36-277)||(12186835-12187076)
chr7 (19-86)||(13647144-13647211)
chr7 (19-86)||(16495178-16495245)
chr7 (200-262)||(14044735-14044792)
chr7 (200-262)||(14354765-14354822)
chr7 (93-162)||(14429758-14429825)
chr7 (19-86)||(13647100-13647167)
chr7 (19-62)||(16402712-16402755)
chr7 (19-86)||(16495222-16495289)
chr7 (200-274)||(2832504-2832580)
chr7 (19-84)||(3386154-3386218)
chr7 (19-84)||(13831194-13831258)
chr7 (19-80)||(13869208-13869268)
chr7 (19-80)||(16213487-16213548)
chr7 (19-80)||(16495266-16495327)
chr7 (200-277)||(18203801-18203873)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (19-435)||(13015-13432)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (19-435)||(39716-40133)
scaffold0080 (200-337)||(19883-20017)
scaffold0080 (36-181)||(18870-19015)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (52-418)||(3103-3475)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (19-430)||(8438-8847)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (19-430)||(1654-2067)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (58-425)||(15955-16323)
scaffold0120 (42-430)||(32864-33250)
scaffold0120 (42-430)||(45755-46141)
scaffold0120 (42-278)||(17388-17623)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (19-430)||(3273-3686)
scaffold0292 (19-430)||(147-558)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (58-426)||(32783-33153)
scaffold0145 (58-435)||(38602-38981)
scaffold0145 (115-338)||(9645-9867)
scaffold0145 (58-206)||(32317-32465)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (70-435)||(39331-39697)
scaffold0141 (19-73)||(37151-37204)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (70-435)||(75115-75481)
scaffold0049 (19-73)||(77608-77661)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (59-430)||(25738-26111)
scaffold0026 (95-430)||(39736-40073)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (19-424)||(4652-5059)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (19-363)||(128554-128897)
scaffold0031 (200-430)||(20330-20554)
scaffold0031 (24-177)||(65958-66109)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (19-435)||(8282-8696)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (115-362)||(44682-44929)
scaffold0122 (223-435)||(25965-26179)
scaffold0122 (341-435)||(33395-33491)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (19-430)||(20711-21127)
scaffold0088 (19-68)||(10118-10167)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (19-435)||(31869-32285)
scaffold0113 (58-86)||(31864-31892)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (58-435)||(6021-6404)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (19-277)||(4893-5150)
scaffold0395 (293-417)||(881-1006)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (19-335)||(28215-28533)
scaffold0046 (19-269)||(4353-4605)
scaffold0046 (19-269)||(1798-2050)
scaffold0046 (177-319)||(11252-11395)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (19-435)||(4514-4932)
scaffold0358 (374-435)||(95-156)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (19-435)||(13297-13716)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (19-272)||(76-329)
scaffold0175 (19-291)||(33924-34199)
scaffold0175 (268-430)||(13144-13308)
scaffold0175 (58-86)||(33919-33947)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (19-423)||(1751-2161)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (115-376)||(20644-20903)
[»] scaffold0023 (13 HSPs)
scaffold0023 (115-376)||(94308-94567)
scaffold0023 (115-376)||(44351-44611)
scaffold0023 (19-287)||(119677-119947)
scaffold0023 (223-376)||(17446-17598)
scaffold0023 (115-342)||(100278-100500)
scaffold0023 (115-342)||(40169-40391)
scaffold0023 (115-269)||(101404-101552)
scaffold0023 (39-274)||(38542-38777)
scaffold0023 (19-86)||(17886-17953)
scaffold0023 (19-86)||(17842-17909)
scaffold0023 (32-86)||(17930-17984)
scaffold0023 (144-181)||(17765-17802)
scaffold0023 (19-80)||(17804-17865)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (81-430)||(954-1304)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (122-362)||(116332-116571)
scaffold0022 (200-339)||(128967-129102)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (19-316)||(11464-11763)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (115-376)||(37718-37977)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (19-430)||(15370-15784)
scaffold0114 (36-277)||(7112-7352)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (115-376)||(136577-136836)
scaffold0028 (115-376)||(139046-139305)
scaffold0028 (115-376)||(143984-144243)
scaffold0028 (115-376)||(134108-134367)
scaffold0028 (115-376)||(141515-141774)
scaffold0028 (115-319)||(132563-132762)
scaffold0028 (219-342)||(62201-62321)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (19-430)||(10331-10744)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (115-375)||(13289-13547)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (115-376)||(40297-40556)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (115-376)||(13844-14103)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (58-277)||(121607-121827)
scaffold0021 (19-364)||(174567-174912)
scaffold0021 (354-430)||(124723-124801)
scaffold0021 (235-334)||(136370-136471)
scaffold0021 (235-334)||(145078-145179)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (115-376)||(4110-4371)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (115-376)||(11960-12214)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (19-429)||(17932-18345)
scaffold0247 (116-420)||(2088-2394)
scaffold0247 (35-86)||(2406-2456)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (194-435)||(22861-23103)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (145-429)||(16710-16995)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (19-435)||(1090-1507)
scaffold0106 (115-277)||(15298-15460)
scaffold0106 (144-435)||(7193-7484)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (116-420)||(85539-85845)
scaffold0001 (144-376)||(501003-501240)
scaffold0001 (122-342)||(160594-160809)
scaffold0001 (27-86)||(85857-85915)
scaffold0001 (35-86)||(500912-500963)
scaffold0001 (19-80)||(85820-85880)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (19-335)||(5132-5448)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (19-424)||(46796-47202)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (19-243)||(31961-32188)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (123-376)||(12-262)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (124-376)||(81978-82228)
scaffold0037 (122-342)||(22665-22880)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (19-435)||(16082-16500)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (19-252)||(27681-27913)
scaffold0130 (298-435)||(27912-28051)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (116-376)||(161095-161355)
scaffold0007 (299-420)||(164550-164674)
scaffold0007 (19-86)||(161367-161433)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (55-435)||(952-1333)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (17-243)||(2494-2722)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (34-335)||(51397-51699)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (123-376)||(38663-38916)
scaffold0074 (19-86)||(38936-39002)
[»] scaffold0454 (4 HSPs)
scaffold0454 (144-376)||(10692-10929)
scaffold0454 (19-85)||(10455-10520)
scaffold0454 (19-86)||(10585-10652)
scaffold0454 (19-80)||(10629-10690)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (194-376)||(4669-4850)
[»] scaffold0363 (3 HSPs)
scaffold0363 (144-376)||(9161-9398)
scaffold0363 (19-85)||(8924-8989)
scaffold0363 (19-86)||(9054-9121)
[»] scaffold0149 (5 HSPs)
scaffold0149 (144-338)||(29856-30050)
scaffold0149 (24-181)||(3546-3703)
scaffold0149 (24-181)||(7977-8134)
scaffold0149 (19-86)||(29749-29816)
scaffold0149 (19-80)||(29793-29854)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (122-323)||(1340-1537)
scaffold0101 (24-177)||(9123-9275)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (42-430)||(4343-4739)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (144-376)||(12255-12492)
scaffold0494 (19-86)||(12532-12599)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (144-376)||(11207-11444)
scaffold0029 (36-181)||(12578-12723)
scaffold0029 (19-80)||(11144-11205)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (123-319)||(15570-15764)
scaffold0261 (24-173)||(1144-1292)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (276-435)||(3429-3591)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (123-402)||(11370-11652)
scaffold0461 (19-86)||(11240-11307)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (123-402)||(38189-38471)
scaffold0124 (19-86)||(38534-38601)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (234-430)||(24206-24406)
scaffold0042 (36-181)||(35074-35218)
scaffold0042 (19-56)||(24403-24440)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (24-269)||(36260-36503)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (39-241)||(3337-3539)
scaffold0165 (39-241)||(7401-7603)
scaffold0165 (112-420)||(27663-27969)
scaffold0165 (374-428)||(3641-3695)
scaffold0165 (374-428)||(7705-7759)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (222-376)||(4300-4453)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (112-420)||(16014-16320)
scaffold0357 (235-420)||(13147-13336)
scaffold0357 (200-262)||(2650-2707)
[»] scaffold0184 (4 HSPs)
scaffold0184 (144-319)||(1087-1263)
scaffold0184 (19-86)||(1347-1414)
scaffold0184 (19-86)||(1303-1370)
scaffold0184 (19-80)||(1265-1326)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (19-136)||(116718-116835)
scaffold0034 (115-339)||(32437-32658)
scaffold0034 (19-134)||(116823-116938)
scaffold0034 (27-136)||(116935-117044)
scaffold0034 (56-139)||(117025-117108)
scaffold0034 (235-386)||(51833-51985)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (115-342)||(19166-19390)
scaffold0102 (36-121)||(48661-48746)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (24-274)||(69599-69848)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (112-342)||(10536-10762)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (115-342)||(6436-6661)
scaffold0621 (115-363)||(8370-8613)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (19-167)||(10101-10247)
scaffold0084 (374-435)||(10323-10384)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (24-269)||(19786-20029)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (115-342)||(14692-14916)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (32-274)||(23658-23897)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (115-342)||(2801-3022)
scaffold0628 (115-157)||(3283-3324)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (115-269)||(1102-1256)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (115-269)||(6510-6664)
scaffold0333 (115-269)||(13890-14044)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (42-138)||(7386-7482)
scaffold0278 (115-342)||(5547-5769)
scaffold0278 (39-139)||(7486-7585)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (115-338)||(45791-46010)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (115-322)||(23898-24101)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (115-342)||(2640-2861)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (115-342)||(31-255)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (24-274)||(7880-8129)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (115-269)||(15845-15999)
scaffold0020 (24-274)||(178705-178952)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (201-323)||(6137-6259)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (112-339)||(10426-10650)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (115-342)||(129808-130031)
scaffold0010 (200-429)||(60620-60848)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (36-315)||(192997-193277)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (123-342)||(945-1158)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (200-397)||(53487-53681)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (115-319)||(32003-32202)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (115-334)||(12665-12884)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (23-181)||(5898-6056)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (115-341)||(12472-12693)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (89-165)||(20881-20957)
scaffold0096 (24-173)||(16513-16661)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (115-292)||(6721-6889)
scaffold0556 (291-339)||(8090-8138)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (115-334)||(12842-13057)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (39-177)||(18056-18193)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (115-292)||(28813-28986)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (200-298)||(11952-12044)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (39-274)||(15742-15976)
scaffold0297 (24-177)||(10681-10830)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (24-181)||(18610-18767)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (111-269)||(984-1135)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (281-430)||(6675-6826)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (24-181)||(10299-10456)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (115-397)||(7997-8277)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (174-292)||(8118-8233)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (115-334)||(103632-103848)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (39-266)||(4875-5104)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (42-100)||(4894-4952)
[»] scaffold0484 (3 HSPs)
scaffold0484 (39-120)||(466-547)
scaffold0484 (374-428)||(1074-1128)
scaffold0484 (90-241)||(539-688)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (19-77)||(20471-20529)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (39-181)||(14482-14624)
scaffold0081 (39-181)||(38922-39064)
scaffold0081 (39-181)||(23498-23640)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (115-277)||(30235-30392)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (291-418)||(225482-225611)
scaffold0012 (115-217)||(225353-225455)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (27-81)||(18-72)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (36-274)||(21866-22105)
scaffold0210 (36-274)||(29758-29997)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (36-181)||(1696-1842)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (122-162)||(6506-6546)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (24-107)||(32251-32334)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (231-293)||(25121-25184)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (36-162)||(281071-281196)
scaffold0005 (200-338)||(267649-267784)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (220-322)||(29558-29660)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (19-68)||(1193-1242)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (393-430)||(17892-17929)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (200-261)||(1874-1930)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (82-140)||(6361-6418)
scaffold0158 (36-140)||(2649-2752)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (237-286)||(206575-206624)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (298-342)||(2213-2257)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (36-72)||(4870-4906)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (36-68)||(14401-14433)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (36-68)||(12396-12428)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (304-376)||(13092-13164)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 24529023 - 24529441
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24529023 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtattaagtacaaagctc 24529122  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24529123 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaact 24529222  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  24529423 agattatagttaacatcat 24529441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 9077757 - 9078173
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9077757 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 9077854  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  9077855 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 9077954  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9077955 tcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 9078154  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  9078155 agattataattaacatcat 9078173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 24493371 - 24493789
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24493371 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 24493470  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24493471 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttatttcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 24493570  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24493571 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 24493669  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  24493670 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagcttca 24493769  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  24493770 cagattataattaacatcat 24493789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 435
Target Start/End: Original strand, 25421330 - 25421753
Alignment:
Q  16 ggacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc-catcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421330 ggacatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaa 25421429  T
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25421430 gctccagggcataaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaacctcttatataatccaataaattgg 25421529  T
Q  215 -aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421530 aaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 25421629  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 411  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25421630 caattgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagc 25421729  T
Q  412 ttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  25421730 ttcacagattataattaacatcat 25421753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 25431197 - 25431615
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431197 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 25431296  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  25431297 caggccatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataaattggaaac 25431396  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25431397 atcatcatcttcat-aaattagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 25431495  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | || | |||  |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25431496 tgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 25431595  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  25431596 cagattataattaacatcat 25431615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 1096271 - 1096683
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  1096271 catcaagcccccatcgctatta-agtattaatatactttcagggcatcaagcccc-atcgctatttgagctaaagctccatcatgttgagcacaaggctc 1096368  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-c 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1096369 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 1096468  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1096469 atcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaa 1096568  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1096569 tgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 1096668  T
Q  416 cagattataattaac 430  Q
     || |||||||||||    
T  1096669 taggttataattaac 1096683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23390814 - 23390401
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23390814 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcactgaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 23390715  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23390714 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 23390615  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23390614 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 23390415  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  23390414 agattataattaac 23390401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21997852 - 21997548
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21997852 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcgctatttgagctcaagctccatcatgttgagtacaaagctc 21997753  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21997752 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 21997653  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997652 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  319 gcaag 323  Q
    |||||    
T  21997552 gcaag 21997548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 13095297 - 13095715
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13095297 catcaagccctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctc 13095396  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13095397 cagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 13095496  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13095497 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaa 13095595  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| |||||   |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13095596 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttca 13095695  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  13095696 catattataattaacatcat 13095715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 13025113 - 13025531
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13025113 catcaagctctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcactatttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctc 13025212  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13025213 cagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 13025312  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13025313 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaa 13025411  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| |||||   |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13025412 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttca 13025511  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  13025512 catattataattaacatcat 13025531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8287163 - 8286747
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  8287163 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcctccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgggtacaaagct 8287064  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||| ||||||||||    
T  8287063 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaaccacttatattagtccagtaatttggaa 8286964  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtataca-aaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8286963 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatca 8286864  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    | |||||  || |||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8286863 attgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8286764  T
Q  414 cacagattataattaac 430  Q
    |||| | ||||||||||    
T  8286763 cacataatataattaac 8286747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Original strand, 22412083 - 22412388
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412083 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22412182  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22412183 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 22412281  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22412282 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22412373  T
Q  415 acagattataattaa 429  Q
    |||||||||||||||    
T  22412374 acagattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21808708 - 21808384
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21808708 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21808609  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  21808608 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaag-gctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 21808510  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21808509 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21808410  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||    
T  21808409 ttgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21729384 - 21729059
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21729384 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21729285  T
Q  118 ccaaggcatcaagccccc-aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21729284 ccaaggcatcaagccccccaacaatgacg-gctaatgcatgaactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 21729186  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 22074822 - 22075235
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| | |||  |||||||||||||    
T  22074822 catcaagcccccatcactatctgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatactcaaacgtggtgagtacaaagct 22074921  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  22074922 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcatct--attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 22075018  T
Q  217 cttcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22075019 catcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatca 22075118  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    | |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22075119 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 22075218  T
Q  414 cacagattataattaac 430  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22075219 cacatattataattaac 22075235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 29329831 - 29330090
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329831 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttcg 29329929  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329930 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29330028  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29330029 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29330090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 112 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10733208 - 10732946
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatt 211  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10733208 aaagctcaagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatt 10733110  T
Q  212 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10733109 tggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataat 10733011  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  10733010 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 10732946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42245630 - 42245371
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245630 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 42245532  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245531 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 42245433  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  42245432 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 42245371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11581458 - 11581205
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581458 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaagtcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacttca 11581359  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581358 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 11581260  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||| ||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  11581259 agtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattat 11581205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 265033 - 264774
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  265033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 264935  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  264934 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 264836  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  264835 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 264774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2154879 - 2154658
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2154879 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 2154781  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154780 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 2154682  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    || |||||| ||||||| ||||||    
T  2154681 aactgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 20908909 - 20909168
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20908909 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 20909007  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20909008 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20909106  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20909107 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20909168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 29345877 - 29346136
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29345877 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 29345975  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29345976 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29346074  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29346075 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29346136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 32027290 - 32027549
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32027290 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32027388  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027389 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32027487  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32027488 aaatccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32027549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19661154 - 19660879
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  19661154 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 19661055  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19661054 ccatggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 19660956  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  19660955 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Original strand, 39245033 - 39245291
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagt-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 39245131  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245132 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 39245230  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 375  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  39245231 aaatgcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 29348350 - 29348609
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348350 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 29348448  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29348449 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29348547  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29348548 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29348609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21293289 - 21292870
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21293289 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21293190  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  21293189 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttgga 21293091  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    || |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  316 a-atgc-aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    | || | ||  || |||||||| |  |||||| | ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| ||| ||    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaact 21292893  T
Q  413 tcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21292892 tcacagattataattaacctcat 21292870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10775942 - 10775681
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10775942 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 10775843  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  10775842 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacac-agcagtatataaaaccagcatgacataataatatc 10775744  T
Q  315 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  10775743 aaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 10775681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 29350830 - 29351082
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350830 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 29350928  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29350929 tcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 29351027  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29351028 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29351082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 39363310 - 39363540
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39363310 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 39363408  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  39363409 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 39363507  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  39363508 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 39363540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 364
Target Start/End: Original strand, 37723704 - 37724049
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | || |||||| |||  ||||||||||||    
T  37723704 catcaagcccccatcgctattcgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 37723803  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  37723804 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatttagtccaataatttgga 37723902  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||   |||| |||||||| || |||||    
T  37723903 acttcaacatcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatc 37723999  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||  ||  || |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  37724000 aaattaaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 37724049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36155039 - 36154789
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  36155039 ggcatcaagccctcaactttaaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 36154940  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154939 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 36154844  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  36154843 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 36154789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 115 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20918212 - 20918017
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20918212 gctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatga-ctcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttgg 20918115  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20918114 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20902248 - 20902053
Alignment:
Q  143 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca-tcaacttagac 241  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20902248 aaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattcaacttagac 20902149  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20902148 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 23064415 - 23064614
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23064415 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaccccat 23064514  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23064515 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaa 23064613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 31060974 - 31061171
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31060974 gcatcaagctcccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 31061071  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31061072 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 31061170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 125 - 323
Target Start/End: Original strand, 38619337 - 38619537
Alignment:
Q  125 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacc---tcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38619337 atcaagcccctatcactgaaatgctaatgcatggactcgactaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatcaaataatttggaacctca 38619436  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619437 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38619535  T
Q  322 ag 323  Q
    ||    
T  38619536 ag 38619537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18319290 - 18319039
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  18319290 ggcatcaagccctcaactttaaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 18319193  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319192 -catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  322 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 18319039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Original strand, 24067013 - 24067210
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||       
T  24067013 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact--- 24067109  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20806998 - 20806845
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  20806998 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaattcat 20806901  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 278  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20806900 catcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagcgacac 20806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 36314504 - 36314675
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  36314504 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 36314603  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314604 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22107926 - 22107709
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  22107926 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagg 22107828  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||  ||||||||||||    ||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  22107827 gcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatagactcgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 22107729  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagac 241  Q
    | |||||||  |||||||||    
T  22107728 ttatcttcaaaaacttagac 22107709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 429
Target Start/End: Original strand, 40725782 - 40726069
Alignment:
Q  146 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 244  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  40725782 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 40725881  T
Q  245 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  40725882 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 40725980  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  40725981 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17517400 - 17517174
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||      |||||| ||||||||    
T  17517400 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttgaaacatcattatcaacatcttaatcaactt 17517301  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||| |    
T  17517300 agactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaattcaacaacatctta 17517201  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  17517200 aatattcaataatatctcaagtaatgc 17517174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 21565445 - 21565668
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | || |||||| || |||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  21565445 gctccagggcgtcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggtcacaacatcttaa-caacttagaacgacaacctcttaaataagtccaataatttg 21565542  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  21565543 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaata 21565638  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||| || |||||| ||||||||    
T  21565639 tcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatat 21565668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 26703882 - 26704129
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26703882 agcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 26703979  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||| ||  ||   |    
T  26703980 cat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttagaggttcaac 26704075  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704076 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26704129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 26973615 - 26973862
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26973615 agcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 26973712  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||| ||  ||   |    
T  26973713 cat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttagaggttcaac 26973808  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26973809 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26973862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21329719 - 21329541
Alignment:
Q  111 caaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataa 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || | ||||| |   ||||||| |||||||| | ||||||    
T  21329719 caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacc-tcttaga---acaacctcttatataaattcaataa 21329625  T
Q  210 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  21329624 tttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 418
Target Start/End: Original strand, 22143951 - 22144254
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatata---atccaataatt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |   | |||| |||| | | ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  22143951 gctccagggcatcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaaacaactcaacaacttagaacaacaacctcttatatatatatccaataatt 22144049  T
Q  212 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 310  Q
    ||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  22144050 tggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaa 22144143  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aa 407  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||| |||||||||  ||||||| ||    
T  22144144 tatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataa 22144243  T
Q  408 cagcttcacag 418  Q
    || ||||||||    
T  22144244 caacttcacag 22144254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26012255 - 26012033
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26012255 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacc-tcttataaacaacaacctcttatatatatccaataattt 26012158  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||    
T  26012157 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaat 26012061  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  26012060 atcaaatgtgaatcaacaacatctcaaa 26012033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  282 cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacat 381  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||  ||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacat 20766084  T
Q  382 cataatcaacatcaaaacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766083 cataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Original strand, 19668805 - 19668951
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 220  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  19668805 ggcatcaagcccccaagaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatc 19668902  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19668903 atcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaa 19668951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22959741 - 22959576
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22959741 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatca 22959645  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  22959644 tcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20027158 - 20026942
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  20027158 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttataaacaacgacctcttatataaatccaataattt 20027061  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 310  Q
    | |||   ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||||||    
T  20027060 gaaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataa 20026966  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  20026965 tatcaaatgcaattcaacaacatc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21502308 - 21502205
Alignment:
Q  186 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 283  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||    
T  21502308 acaacctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggca 21502209  T
Q  284 gtat 287  Q
    ||||    
T  21502208 gtat 21502205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 23201164 - 23201312
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23201164 agcccccatcgttatttaagtattaatatacttccagtgcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 23201262  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23201263 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 21873073 - 21873206
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21873073 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccattgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 21873170  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21873171 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 21873206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23501622 - 23501402
Alignment:
Q  70 cccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||    
T  23501622 cccccatcgctattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctc 23501524  T
Q  169 ttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaata 265  Q
    ||||||||| ||||   |  | ||  ||| | |||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  23501523 ttaaacatcataaa--catcatctcgtat-ttatccaatattttggaagttcaacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaata 23501427  T
Q  266 acaacagcaacacaagcagtataca 290  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||    
T  23501426 acaatagcagcacaggcagaataca 23501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986047
Alignment:
Q  320 caagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 417  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  418 gattataattaacttcat 435  Q
     |||||| ||||| ||||    
T  21986064 aattatagttaacatcat 21986047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 23571893 - 23572029
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  23571893 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttaagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 23571990  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
     |||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23571991 aaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 23572029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 14078969 - 14079111
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||    
T  14078969 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcat-gagcccccaa 14079066  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14079067 cacatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14079111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 429
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  230 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 328  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||  | ||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcatttgcaattc-ac 18418690  T
Q  329 aacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataa 425  Q
    |||||||  ||||| || | | |  ||||||||||   | || ||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18418691 aacatct-taatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22107334 - 22107278
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107334 tatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaac 22107278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 23064330 - 23064396
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  23064330 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 23064396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 36314353 - 36314420
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  36314353 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 36314420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Original strand, 14047988 - 14048046
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 180  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14047988 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 14048046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26740789 - 26740705
Alignment:
Q  189 acctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26740789 acctcttatataactccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18770304 - 18770179
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  18770304 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 18770207  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  18770206 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 18770179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 40725673 - 40725740
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40725673 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 40725740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41095918 - 41095852
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41095918 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 41095852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41095961 - 41095895
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41095961 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 41095895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27989061 - 27989004
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989061 aatccaataatttggaacatcatcat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 27989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 40725717 - 40725783
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  40725717 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttg 40725783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Original strand, 18418528 - 18418565
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18418528 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa 18418565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732892
Alignment:
Q  232 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 31060889 - 31060953
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31060889 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 31060953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Original strand, 22032139 - 22032380
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||  |||||     
T  22032139 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagccct 22032236  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 230  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  22032237 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 22032333  T
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  22032334 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 22032380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Original strand, 23511919 - 23512006
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 126  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  23511919 ttgaatattaatatacttccagggcat-aagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagggcat 23512006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41095747 - 41095692
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctt 179  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41095747 gcatcaagcctccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctt 41095692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 18418421 - 18418488
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  18418421 catcaagctccaatcgctatttgagtattattatacttccatagcatcaagccccaatcgctatttga 18418488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 31060846 - 31060912
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31060846 catcaaacccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 31060912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33896035 - 33895953
Alignment:
Q  70 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatg 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33896035 cccccatcactatt-gagctaaagcttcatcgtgttgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaactatgaaatgcaaatg 33895953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 40725630 - 40725696
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40725630 catcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 40725696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41095875 - 41095809
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41095875 catcaagcccctatcgctatttgagtatcattatact-ccagagcatcaaacccctatcgctatttga 41095809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 18418465 - 18418526
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  18418465 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 18418526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20807083 - 20807019
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  20807083 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagccactatcgctattt 20807019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21366907 - 21366839
Alignment:
Q  93 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  21366907 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 21366839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 316
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873350
Alignment:
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaa 21873350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 23064373 - 23064433
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23064373 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 23064433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 39363247 - 39363308
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  39363247 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 39363308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Original strand, 38619293 - 38619329
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttact 55  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38619293 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatact 38619329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 34509583 - 34510001
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34509583 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggacccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgctc 34509682  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34509683 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 34509782  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  34509983 agattataattaacatcat 34510001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 50210536 - 50210113
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttcc-agggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50210536 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatactttcgagggcatcaaacccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgct 50210437  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa- 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50210436 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaa 50210337  T
Q  217 ---cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210336 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 50210237  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210236 caaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 50210137  T
Q  412 ttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  50210136 ttcacagattataattaacatcat 50210113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 22532072 - 22532490
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22532072 catcaagtccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcggtaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 22532171  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22532172 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 22532271  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  22532272 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22532471  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    || | |||| |||| ||||    
T  22532472 agttcataaataacatcat 22532490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27251048 - 27250634
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  27251048 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctaggacatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaatgtggtgagtacaaagct 27250949  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  27250948 ccagggcatcaagcccctatcaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaatctcttatattagtccaataatttggaa 27250850  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27250849 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 27250750  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
     |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27250749 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 27250650  T
Q  415 acagattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||||    
T  27250649 acagattataattaac 27250634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 20134984 - 20135403
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20134984 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttacagggcatcaagcccccatcgctaaatgatctaaagctccaacgtgttgagtataaagctc 20135083  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  20135084 cagggcatcaagcccccaactatgaaatgctgatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 20135183  T
Q  219 tcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20135184 tcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataata 20135283  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 410  Q
    |||  |||||  ||||||||||| || ||| || | | |  ||||||||||| || || ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20135284 tcatgtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacag 20135383  T
Q  411 cttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20135384 cttcacagattataattaac 20135403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 31612209 - 31612469
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31612209 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttgg 31612308  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31612309 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 31612407  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  31612408 aaatgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 31612469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 13988763 - 13989022
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13988763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13988861  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13988862 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13988960  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13988961 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13989022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21923556 - 21923297
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923556 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21923458  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923457 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21923359  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21923358 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21923297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23594000 - 23593741
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23594000 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23593902  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23593901 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23593803  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23593802 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 23593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21475352 - 21475093
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21475254  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21475253 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21475155  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21475154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21475093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 29298034 - 29298292
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29298034 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttga 29298132  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29298133 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatga-ataataatatc 29298230  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29298231 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29298292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 29776592 - 29776844
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776592 gcatcaagccccaatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 29776691  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776692 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaa 29776790  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29776791 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29776844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20847459 - 20847173
Alignment:
Q  33 cgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagc 131  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20847459 cgctatttaagtattaatatacttccagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagc 20847360  T
Q  132 ccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttca 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847359 ccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 20847261  T
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  20847260 acaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22123333 - 22123073
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22123333 gctccagggcatcaagcccccaacaacgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22123235  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22123234 aacttcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatat 22123136  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||    ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22123135 caaatgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattat 22123073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22469014 - 22468604
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  22469014 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgggtactaagctccagg 22468916  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac---tt 219  Q
    |||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||   ||    
T  22468915 gcatga-gcccccaacaaatatatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaatcaaacaacctcgtatatagtccaaaaatttggaacatctt 22468817  T
Q  220 catca---tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    |||||   |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
     |||||  ||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  415 acagattataatta 428  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 117 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45575108 - 45574848
Alignment:
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45575108 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 45575010  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  45575009 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattat 45574848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 159 - 429
Target Start/End: Original strand, 432952 - 433222
Alignment:
Q  159 actcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  432952 actcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttag 433051  T
Q  259 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaag 358  Q
    ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||| |||||    
T  433052 ttaaat---aacggcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaag 433148  T
Q  359 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||| || |||||    
T  433149 taatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagctttacagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38801707 - 38801297
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  38801707 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagttaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 38801608  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38801607 tccagggcatcaagcccccaactatg-aatgcttatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 38801509  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |   |||| || |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgc---aacagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    |||| |||  || |||||| | | ||||||| | ||   ||||||||||| || || |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  413 tcacagattataattaa 429  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  38801313 tcacaaattatagttaa 38801297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 143 - 417
Target Start/End: Original strand, 21346885 - 21347161
Alignment:
Q  143 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21346885 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 21346984  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  21346985 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 21347083  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 417  Q
    | ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  21347084 ttcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 21711612 - 21711865
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21711612 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 21711711  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  21711712 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-tagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgca 21711810  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  21711811 agtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattat 21711865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 21707071 - 21707323
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21707071 gcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcat 21707170  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  21707171 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-tagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaa 21707269  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  21707270 gtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattat 21707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 143 - 417
Target Start/End: Original strand, 21342021 - 21342296
Alignment:
Q  143 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21342021 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg-acttcatcatcttaatcaacttagacc 21342119  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  21342120 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 21342218  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 417  Q
    | ||   |||| |||| |||||| |||| ||||  ||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  21342219 ttcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13213099 - 13212867
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13213099 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccg 13213000  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  13212999 actcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 13212901  T
Q  343 acattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
     ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  13212900 tcacaaataattcaattaatgcatatacaattat 13212867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 376
Target Start/End: Original strand, 16361835 - 16362073
Alignment:
Q  143 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaact 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || |||||||    
T  16361835 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaact 16361934  T
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16361935 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 16362033  T
Q  337 aaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16362034 aattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattat 16362073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 21840686 - 21840923
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt------catcatcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||| ||||||||    
T  21840686 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 21840785  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21840786 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 21840884  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  21840885 attattcacatataatttaagtaatgcatatataattat 21840923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 21477445 - 21477656
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21477445 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 21477543  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21477544 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 21477643  T
Q  218 ttcatcatcttca 230  Q
     ||| ||| ||||    
T  21477644 atcaacattttca 21477656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16275616 - 16275423
Alignment:
Q  127 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc 226  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275616 caagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacagc-tcttgtataatccaataatttagaacttcatcatc 16275519  T
Q  227 ttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 323  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275518 ttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 16275423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 430
Target Start/End: Original strand, 21026666 - 21026896
Alignment:
Q  202 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatg 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||    
T  21026666 tccaataatttggaacatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatg 21026765  T
Q  302 acataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaac 399  Q
    || |||  ||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21026766 acgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacac 21026865  T
Q  400 atcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026866 atcttaaacagcttcacagattataattaac 21026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Original strand, 40389060 - 40389257
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||       
T  40389060 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact--- 40389156  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 21714352 - 21714600
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21714352 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 21714450  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  21714451 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 21714546  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21714547 atcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 21714600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15860195 - 15860068
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15860195 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaa 15860098  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaag 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860097 acaacatgacataataatattaaatgcaag 15860068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27161721 - 27161605
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161721 ggcatccagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttca 27161622  T
Q  222 tcatcttcatcaactta 238  Q
    |||||  ||||||||||    
T  27161621 tcatcaacatcaactta 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14295745 - 14295569
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  14295745 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacattttagacc 14295646  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14295645 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 33680910 - 33681133
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  33680910 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacca-cttagaacaaccacctcttatataagtccaataatttg 33681007  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  33681008 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 33681103  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||    
T  33681104 tcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatat 33681133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22131380 - 22131180
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22131380 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 22131283  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 236  Q
    |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22131282 caaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 22131185  T
Q  237 tagac 241  Q
    |||||    
T  22131184 tagac 22131180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20454752 - 20454613
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      || ||||||||    
T  20454752 aatgttaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 20454653  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454652 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 35261295 - 35260992
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  35261295 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 35261198  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| | ||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||    
T  35261197 ggaacataat--tcttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaat 35261104  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aac 408  Q
    |||||||||||   | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||| || | |||||||||| ||||||| |||    
T  35261103 atcaaatgcaa---atcaacatctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataac 35261007  T
Q  409 agcttcacagattat 423  Q
    | ||||||| |||||    
T  35261006 aacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Original strand, 48603088 - 48603288
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  48603088 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 48603185  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 236  Q
    |||    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48603186 caaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 48603283  T
Q  237 tagac 241  Q
    |||||    
T  48603284 tagac 48603288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 22237530 - 22237753
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  22237530 gctccagggcatcaagcccccaacgatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttg 22237627  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
     ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  22237628 aaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaata 22237723  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  22237724 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 22237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42865526 - 42865273
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  42865526 agcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 42865428  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt- 219  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||     
T  42865427 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatgt-atccaataatttggaggttc 42865333  T
Q  220 --catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
      ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  42865332 aacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaaca 42865273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 20916070 - 20916185
Alignment:
Q  60 gggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatga 158  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20916070 gggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatgg 20916168  T
Q  159 actcgacctcttaaaca 175  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20916169 actcaacctcttaaaca 20916185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Original strand, 21753957 - 21754166
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  21753957 ggcatcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacaaca 21754053  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 320  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  21754054 tcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgc 21754149  T
Q  321 aagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  21754150 aa-tcaacaacatctcaa 21754166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21896473 - 21896194
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || || ||||||| || | |   ||| |||||||| |||||||||||    
T  21896473 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaacaatggcctcttatataaatccaataattt 21896376  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| || ||  ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
T  21896375 ggaacatcttc--cttcat---cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgatataacaat 21896282  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 397  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||| ||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  21896281 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 21896194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22922001 - 22921864
Alignment:
Q  202 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || |||    
T  22922001 tccaataatttggaacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcat 22921906  T
Q  301 gacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22921905 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 429
Target Start/End: Original strand, 16758638 - 16758866
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa-aacaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  |       
T  16758638 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagtt 16758732  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||| ||    
T  16758733 catgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcac-aacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaaca 16758831  T
Q  396 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16758832 aatcatattataacagcttcacagatcatcattaa 16758866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354477
Alignment:
Q  293 aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaa 390  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  391 catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 22354477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21861702 - 21861510
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |    
T  21861702 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagc 21861609  T
Q  299 atgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||    
T  21861608 atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 52928181 - 52928038
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 220  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52928181 ggcaccaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatc 52928084  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928083 accatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52928038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 433
Target Start/End: Original strand, 48603674 - 48603733
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603674 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 48603733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 277
Target Start/End: Original strand, 21161588 - 21161778
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctcca-tcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 180  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21161588 tttgagctaaagctccaatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgacatcttaaacatctta 21161687  T
Q  181 aatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 277  Q
    ||    |||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161688 aa----caacttcgtaaatagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Original strand, 20248184 - 20248394
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | || |||||| || |||| | |  || | | ||||| | |||||||||||||    
T  20248184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacatcatcatcttata-agtccaataatttgg 20248280  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  20248281 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 20248376  T
Q  314 caaatgcaagacaacaac 331  Q
    | |||||||  |||||||    
T  20248377 cgaatgcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13213206 - 13213139
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13213206 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 13213139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 16361729 - 16361796
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16361729 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16361796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20091730 - 20091636
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 177  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20091730 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatc 20091636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21788356 - 21788208
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  21788356 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtactaagctccagg 21788258  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    | ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21788257 gtat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatagactcgatctcttaaa 21788208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 29776461 - 29776528
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  29776461 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 29776528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41050168 - 41050033
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| | |||||||| |||| |       
T  41050168 aatccaataatttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagtt 41050074  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41050073 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 41050033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 21840449 - 21840514
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21840449 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 21840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22356136 - 22356074
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaa-catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22356136 tatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcat 22356074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22357822 - 22357760
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaa-catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22357822 tatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcat 22357760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16368502 - 16368284
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||  ||||||| | |  | |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16368502 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttag-catcttagaacatcgacctcttatataaatccaataatttg 16368405  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataataa 310  Q
    |||| |||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||| |||  |||||||  ||||| |||| ||    
T  16368404 gaacatcatcat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacaattcatgatataacaa 16368311  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16368310 tatc-aatgcaaatcaacaacatctcaa 16368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 319
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918707
Alignment:
Q  232 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 20918707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50614249 - 50614113
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  50614249 aatccaataatttggaacaacatc--cttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 50614155  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50614154 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 50614113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50622077 - 50621941
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  50622077 aatccaataatttggaacaacatc--cttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 50621983  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50621982 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 50621941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 6151665 - 6151810
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  6151665 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 6151762  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  6151763 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 6151810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14295896 - 14295829
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14295896 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 14295829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22831684 - 22831560
Alignment:
Q  37 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 135  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22831684 attttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccc 22831587  T
Q  136 aacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    |||||    ||||||||||||| ||||    
T  22831586 aacaaatgtatgctaatgcatggactc 22831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 21840579 - 21840646
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21840579 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 21840646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45575189 - 45575122
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  45575189 catcaagctccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 45575122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 431655 - 431697
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  431655 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatg 431697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18182418 - 18182275
Alignment:
Q  37 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 135  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |  ||||| || | || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18182418 attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacattattttgagcaaatgctccttcgtggtgagtacaaagctccagggcatga-gccccc 18182321  T
Q  136 aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    |||||    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  18182320 aacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatcttaa 18182275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20454901 - 20454837
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  20454901 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 20454837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 45575145 - 45575089
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 75  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  45575145 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 45575089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14295852 - 14295785
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14295852 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 14295785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 429
Target Start/End: Original strand, 21477654 - 21477732
Alignment:
Q  354 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  21477654 tcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 21477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 29776505 - 29776572
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  29776505 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaattgctatttga 29776572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797638
Alignment:
Q  265 aacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatct 335  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 33797638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45575220 - 45575166
Alignment:
Q  32 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  45575220 tcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagctccaatcgctatttga 45575166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 50210543 - 50210513
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210543 tccagggcatcaaacccccatcgctatttga 50210513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 13213162 - 13213101
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  13213162 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 13213101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14295808 - 14295747
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  14295808 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 14295747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20454815 - 20454754
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  20454815 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 20454754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 21840623 - 21840684
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  21840623 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 21840684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 21341915 - 21341982
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgag-tattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21341915 catcaagcccccaacgctatttgagatattaatatact-ccagagcatcaagcccctatcgctatttga 21341982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 21346779 - 21346846
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgag-tattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21346779 catcaagcccccaacgctatttgagatattaatatact-ccagagcatcaagcccctatcgctatttga 21346846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24783230 - 24783155
Alignment:
Q  201 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24783230 atccaataatttggatttcatcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 24783155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 29060343 - 29060755
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060343 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 29060441  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29060442 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 29060541  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060542 atcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29060641  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060642 tgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 29060741  T
Q  416 cagattataattaa 429  Q
    ||||||||||||||    
T  29060742 cagattataattaa 29060755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25629671 - 25629260
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25629671 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 25629574  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  25629573 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacttcttatataatccaataatttggaaca 25629474  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25629473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 25629274  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  25629273 agattataattaac 25629260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 42 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18410126 - 18409727
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18410126 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccattgtgtggagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 18410027  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaactt 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||    
T  18410026 gaaatgataatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactt 18409927  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18409926 agaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctca 18409827  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |  || ||||||||| |||| |||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18409826 atcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacatcat 18409727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 56 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19303821 - 19303441
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303821 tccaaggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatactaatgca 19303722  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19303721 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagct 19303622  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  19303621 tagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttc 19303523  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||   |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303522 aagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagcttcacagattataattaacatcat 19303441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 57 - 428
Target Start/End: Original strand, 20593615 - 20593987
Alignment:
Q  57 ccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20593615 ccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccagcaatgaaatgctaatgcat 20593713  T
Q  157 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20593714 ggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctc 20593813  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 356  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  20593814 agttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatca 20593913  T
Q  357 agtaatgcgtataa-aat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593914 agtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 20593987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22780545 - 22780127
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22780545 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 22780446  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22780445 caaggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgactacctcttatataatccaataatttggaaca 22780346  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22780345 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaatt 22780246  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||    || ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22780245 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22780146  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  22780145 agattatgattaacatcat 22780127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20638603 - 20638183
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20638603 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20638504  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20638503 ccagggcgtcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatattaatccaataatttggaa 20638404  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638403 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
     |||||   | ||||||||  ||||| ||  |||   ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20638303 ttgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 20638204  T
Q  415 acagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20638203 acagattataattaacatcat 20638183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17288114 - 17287701
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  17288114 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctt 17288015  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17288014 cagggcatcaagcccacaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaagcatcttaattcggcaacctcttatataatccaataatttggaaca 17287915  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  17287914 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||||  ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagcttcac 17287715  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    || |||||||||||    
T  17287714 aggttataattaac 17287701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 61 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20361238 - 20360860
Alignment:
Q  61 ggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaa 159  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20361238 ggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaaactccaacgtgttgagtataaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 20361139  T
Q  160 ctcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20361138 ctcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttag 20361039  T
Q  259 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaag 358  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||    
T  20361038 ttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaag 20360939  T
Q  359 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20360938 taatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcat 20360860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2291445 - 2291186
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291445 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 2291347  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291346 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 2291248  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  2291247 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 2291186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18334857 - 18334598
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334857 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18334759  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334758 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18334660  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18334659 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18334598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 19004943 - 19005202
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19004943 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 19005041  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005042 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 19005140  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19005141 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19005202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 24422444 - 24422703
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422444 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24422542  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24422543 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24422641  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24422642 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24422703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 33861691 - 33861950
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861691 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 33861789  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33861790 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 33861888  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  33861889 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 33861950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 376
Target Start/End: Original strand, 20076506 - 20076856
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  20076506 catcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagcgaaagctccatcgtgttgagcataaggctc 20076602  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20076603 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaaaatcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 20076702  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20076703 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 20076801  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||   | |||||||| ||| || || | |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20076802 gcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattat 20076856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19859184 - 19858925
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19859184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttgg 19859086  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19859085 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 19858987  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19858986 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19858925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 33864175 - 33864434
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864175 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 33864273  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33864274 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 33864372  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  33864373 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 33864434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 131 - 376
Target Start/End: Original strand, 22782139 - 22782383
Alignment:
Q  131 cccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22782139 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttggaaattcatcatcttaa 22782238  T
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22782239 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22782337  T
Q  331 catctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22782338 cgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattat 22782383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28496790 - 28496489
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28496790 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctcacatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 28496691  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28496690 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 28496591  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |    
T  28496590 atcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcga 28496492  T
Q  317 atg 319  Q
    |||    
T  28496491 atg 28496489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29809201 - 29808900
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29809201 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctcacatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 29809102  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29809101 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 29809002  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |    
T  29809001 atcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcga 29808903  T
Q  317 atg 319  Q
    |||    
T  29808902 atg 29808900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 1595446 - 1595705
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595446 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1595544  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595545 aacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1595643  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  1595644 aaatgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattat 1595705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 8054926 - 8055185
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8054926 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 8055024  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8055025 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-aagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 8055123  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8055124 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 8055185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26924905 - 26924646
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924905 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26924807  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924806 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26924708  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26924707 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26924646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1541176 - 1540918
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1541176 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1541078  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1541077 aacttcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 1540979  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 375  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1540978 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 12742214 - 12742473
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742214 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaccttgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 12742312  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742313 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12742411  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12742412 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12742473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20557158 - 20556900
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20557158 gctccacgacatcaagcccacaacaatgaaatgttaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaaattgaaaacctcttatataatccaataatttgg 20557059  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20557058 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatggcataataatatc 20556960  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |  ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20556959 aaatgcaagtcaacaacgtctcaatttcacat--ataattcaagtaatgcatatacaattat 20556900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 25754715 - 25754965
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25754715 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 25754812  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25754813 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25754911  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  25754912 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 25754965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3852280 - 3852023
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  3852280 ctccaaagcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgga 3852183  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  3852182 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacatgataatataa 3852084  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  3852083 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 3852023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 316
Target Start/End: Original strand, 35245386 - 35245684
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  35245386 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 35245485  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  35245486 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttgg 35245584  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  35245585 aacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatat 35245681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Original strand, 25688405 - 25688620
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25688405 ggcatcaagccctcaactttgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcgtaaatcgataacctcttatataatccaataatttggaacctca 25688504  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25688505 ttatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgca 25688603  T
Q  322 agacaacaacatctcaa 338  Q
    || ||||||| ||||||    
T  25688604 agtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 1561104 - 1561356
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  1561104 catcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 1561203  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  1561204 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttgga 1561302  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16448783 - 16448532
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  16448783 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 16448686  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448685 -catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  322 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 16448532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19774003 - 19773818
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774003 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 19773904  T
Q  157 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19773903 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 19773818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 435
Target Start/End: Original strand, 22831322 - 22831723
Alignment:
Q  37 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22831322 atttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttagctaatgctccaacgtcgtgagtacaaagctccagggaatcaagcccc 22831421  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatca 233  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22831422 caactatgaa-tgctaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaaca 22831520  T
Q  234 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | | |   ||| |||||||||||| ||||||||| |||  || |||||    
T  22831521 tagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatcaaattcaattcatcaaca 22831617  T
Q  333 tctcaaa--tatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    ||| | |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  22831618 tcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagtta 22831716  T
Q  429 acttcat 435  Q
    || ||||    
T  22831717 acctcat 22831723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16920950 - 16920651
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  16920950 catcaagaccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccattgctatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 16920851  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  16920850 tccagggtgtcaagccccctactatgaa-tgctaatgcatggacttgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaacaatttgga 16920752  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatc 16920655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 22805559 - 22805749
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22805559 ccccatcgctatttaagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 22805658  T
Q  127 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22805659 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacttcttatataatccaataatttggaac 22805749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 34963292 - 34963529
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  34963292 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 34963391  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34963392 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 34963490  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34963491 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 34963529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30676952 - 30676716
Alignment:
Q  145 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactta 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||    
T  30676952 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactta 30676853  T
Q  239 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30676852 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T
Q  339 atatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
     ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30676753 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 30676716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25612047 - 25611744
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  25612047 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 25611948  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25611947 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatcctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaac 25611849  T
Q  218 ttcatcatcttca-------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 310  Q
     ||| ||||  ||       ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25611848 atcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaa 25611749  T
Q  311 tatca 315  Q
    |||||    
T  25611748 tatca 25611744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 277
Target Start/End: Original strand, 25714323 - 25714478
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25714323 ggcatcaagccctcaactttgaaaagttaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaaccggcaacctcttatataatccaataatttggaacatca 25714422  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714423 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Original strand, 16496204 - 16496370
Alignment:
Q  177 cttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 275  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496204 cttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 16496303  T
Q  276 cacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  16496304 cataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Original strand, 11185318 - 11185605
Alignment:
Q  23 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 120  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||   ||||||||||  ||||    
T  11185318 aagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgcggtgagtacaaaaatcca 11185417  T
Q  121 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaact 218  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  11185418 gggcatcaagcccccaactatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaaca 11185516  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
    ||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  11185517 tcaacat---------cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaa 11185604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 429
Target Start/End: Original strand, 18456705 - 18456930
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  18456705 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagca 18456798  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  18456799 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 18456897  T
Q  398 acatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
     |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456898 tcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25603709 - 25603299
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  25603709 catcaagcccccatttctatttgaatattaatatactaccagagcatcaagcccccatcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 25603610  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 217  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25603609 ccagggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaac 25603511  T
Q  218 ttcatcatcttca-------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 310  Q
     ||| ||||  ||       ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25603510 atcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaa 25603411  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaac 408  Q
    |||||  |  ||  | || ||||||||| ||| || | | |  ||||||||||  || || ||  |||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  25603410 tatcatttataattc-actacatctcaattattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaac 25603312  T
Q  409 agcttcacagatt 421  Q
    |||||||||||||    
T  25603311 agcttcacagatt 25603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 323
Target Start/End: Original strand, 25656619 - 25656732
Alignment:
Q  209 atttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 308  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25656619 atttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataat 25656717  T
Q  309 aatatcaaatgcaag 323  Q
    |||||||||||||||    
T  25656718 aatatcaaatgcaag 25656732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 429
Target Start/End: Original strand, 25644295 - 25644537
Alignment:
Q  187 caacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcag 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  25644295 caacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcag 25644389  T
Q  285 tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatc 382  Q
    ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  25644390 tatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatc 25644489  T
Q  383 ataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
    | || |||||||||| |||| || | ||||||||||||| || |||||    
T  25644490 aaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcattaa 25644537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8227703 - 8227416
Alignment:
Q  146 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 244  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  8227703 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacaacttggaccga 8227604  T
Q  245 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  8227603 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 8227505  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  8227504 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 369
Target Start/End: Original strand, 18461865 - 18462028
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  18461865 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagca 18461958  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  18461959 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Original strand, 20109039 - 20109285
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  20109039 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 20109136  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||    
T  20109137 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaat 20109233  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 363  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  20109234 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 20109285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Original strand, 23019377 - 23019529
Alignment:
Q  186 acaacctattatata-atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagca 283  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  23019377 acaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagca 23019474  T
Q  284 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23019475 gtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 23019529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25642499 - 25642250
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25642499 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 25642401  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  25642400 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatctt-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 25642305  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagca 25642250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19848194 - 19847990
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  19848194 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 19848095  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| ||  |||||| |||||||| |||||  |||||| |||| |    
T  19848094 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaattcaacaatatctta 19847995  T
Q  338 aatat 342  Q
    |||||    
T  19847994 aatat 19847990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 19862783 - 19863032
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19862783 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19862881  T
Q  123 gcatcaagcccccaac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt-- 219  Q
    ||||  ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||      
T  19862882 gcat-gagcccccaacttatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttca 19862976  T
Q  220 -catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19862977 acatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 339
Target Start/End: Original strand, 19652098 - 19652317
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19652098 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataactccaataatttg 19652195  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  19652196 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 19652291  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    || |||||||  |||||||||||||||    
T  19652292 tcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 19652317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18821976 - 18821795
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18821976 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagca 18821883  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-catctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataa 386  Q
    || ||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  18821882 tgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa 18821795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 19872925 - 19873174
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19872925 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19873023  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    |||| |  |||| ||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | ||||||||||||| |  ||       
T  19873024 gcatgagcccccaaattatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttgaaggtttaa 19873119  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19873174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 22432054 - 22432334
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||      
T  22432054 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccaga 22432152  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | || ||||||||||||  ||       
T  22432153 gcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatacaataatttggaggttcaa 22432248  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 305  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 22438604 - 22438884
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||      
T  22438604 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccaga 22438702  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | || ||||||||||||  ||       
T  22438703 gcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatacaataatttggaggttcaa 22438798  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 305  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22335197 - 22335053
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22335197 tatttgagtattaatatacttccagggcaa-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgcgtacaaagctccagggcat-gagcccc 22335100  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22335099 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaa 22335053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4186069 - 4185870
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||   |||  |||||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4186069 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagccccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa 4185970  T
Q  182 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaa 280  Q
        ||||| | ||| ||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |     
T  4185969 ----acaacttcttaaatagtccaataatttggaa---catcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacatag 4185877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Original strand, 4186240 - 4186419
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4186240 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgacctcgacctcttaaacatcttaa 4186339  T
Q  182 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 268  Q
        ||||| | ||| ||| |||||||||||||||    ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4186340 ----acaacttcttaaatagtccaataatttggaa---tatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4186419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22080945 - 22080799
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |  |  ||||| || |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22080945 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgtatggacacatcaacttaa-ca-cttaaaacaacaacctcttatataagtccaataatttg 22080849  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 263  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080848 gaacatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4738805 - 4738626
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4738805 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaa 4738706  T
Q  182 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 268  Q
        ||||  | ||| ||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738705 ----acaatttcttaaatagtccaataatttggaa---catcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15894749 - 15894593
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| | ||    
T  15894749 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgtgtactaagctctaggg 15894651  T
Q  124 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15894650 cat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15894593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Original strand, 19668275 - 19668491
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||||    
T  19668275 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaatcaacgacctcttatataaatccaataattt 19668372  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 310  Q
    |||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |   ||||| ||||| |   ||||| |||| ||    
T  19668373 ggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaa 19668467  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  19668468 tatcaaatgcaaatcaacaacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 322
Target Start/End: Original strand, 23992349 - 23992533
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  23992349 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatacaacgaccgcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 23992448  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  23992449 agactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 23992533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31155644 - 31155465
Alignment:
Q  83 ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31155644 ttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacatatgta-tgctaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaa 31155546  T
Q  182 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
        ||||| |  || ||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155545 ----acaacttcgtaaatagtccaataatttggaa---catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31165107 - 31165006
Alignment:
Q  70 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 169  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  31165107 cccccatcgctattcgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacaatg-tatgctaatgcatggactcgatctct 31165010  T
Q  170 taaa 173  Q
    ||||    
T  31165009 taaa 31165006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27333336 - 27333262
Alignment:
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27333336 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27394076 - 27394002
Alignment:
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27394076 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9098646 - 9098528
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa- 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||     
T  9098646 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgc-aaaacaat 9098553  T
Q  298 -catgacataataatatcaaatgca 321  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  9098552 tcatgatataacaatatcaaatgca 9098528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15041799 - 15041465
Alignment:
Q  88 ctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgac 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||  |    
T  15041799 ctaaagctccatcgtgttgagtactaagctctagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgttctcttaaaaatctcaa-tcatc 15041702  T
Q  188 aac-ctattatataatccaataatttggaacttca---tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagca 283  Q
    ||| || |||||||  |||||||||||||  ||||   |||||||  ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || | || | |||    
T  15041701 aactcttttatata--ccaataatttggaggttcaacatcatcttgttcatcttataaagactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggca 15041604  T
Q  284 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatc 382  Q
    |   |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||| || | | | ||||||||||||  ||| | |  | || |||    
T  15041603 gatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtattcaataaaatctcaagtaatgcacatacattaaaccaaatc 15041504  T
Q  383 ataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagatt 421  Q
     |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15041503 ttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagatt 15041465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 257
Target Start/End: Original strand, 19008787 - 19008843
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008787 aatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8227768 - 8227702
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  8227768 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttg 8227702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16965566 - 16965471
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatct 178  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16965566 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagagcat-aagcccccatcatatgaa-tactaatgcatggactcgatctcttaaacatct 16965471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18692154 - 18692086
Alignment:
Q  93 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  18692154 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactc 18692086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19848301 - 19848234
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  19848301 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccacaatcgctatttga 19848234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19848345 - 19848278
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19848345 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 19848278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 34963185 - 34963252
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  34963185 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcactatttga 34963252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 162
Target Start/End: Original strand, 13019394 - 13019439
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13019394 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 13019439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Original strand, 18906928 - 18907052
Alignment:
Q  37 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 135  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |  ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  18906928 attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccc 18907025  T
Q  136 aacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    |||||    ||||||||||||| ||||    
T  18907026 aacaaatgtatgctaatgcatggactc 18907052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3852402 - 3852338
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3852402 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 3852338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4642998 - 4642934
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||    
T  4642998 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tctagagcatcaagcccctatcgctattt 4642934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16523626 - 16523558
Alignment:
Q  93 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  16523626 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 16523558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 23992286 - 23992347
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23992286 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23992347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 34963229 - 34963290
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  34963229 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 34963290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16377839 - 16377423
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  16377839 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctt 16377740  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16377739 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttacataatccaataatttggaact 16377640  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  16377441 agattataattaacatcat 16377423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 7893505 - 7893921
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  7893505 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctc 7893604  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7893605 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 7893704  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7893705 atcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 7893804  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||  ||||  ||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||    
T  7893805 tgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagcttca 7893901  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  7893902 cagattataattaacatcat 7893921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 435
Target Start/End: Original strand, 44052628 - 44053050
Alignment:
Q  16 ggacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44052628 ggacatcaagcccccatcgatatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaa 44052727  T
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44052728 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcgtagattcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44052827  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44052828 aacatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    || |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagct 44053027  T
Q  413 tcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  44053028 tcacagattataattaacatcat 44053050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 396
Target Start/End: Original strand, 7798577 - 7798956
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7798577 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcttattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 7798676  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7798677 cagagcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttagaaca 7798776  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7798777 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 396  Q
    ||||| || |||||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 22636238 - 22636650
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  22636238 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagcacaaagctc 22636337  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  22636338 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaaa 22636437  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22636438 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttcac 22636636  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  22636637 agattataattaac 22636650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 430
Target Start/End: Original strand, 12902567 - 12902973
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggca 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  12902567 ccccttcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggca 12902666  T
Q  126 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  12902667 tcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatca 12902765  T
Q  225 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaga 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||      
T  12902766 tcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaatt 12902865  T
Q  325 caacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagatta 422  Q
    || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12902866 catcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagatta 12902965  T
Q  423 taattaac 430  Q
    ||||||||    
T  12902966 taattaac 12902973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16240288 - 16239870
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16240288 catcaagctcccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatctgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctc 16240189  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  16240188 cagggcatcaagcccccatcaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatctaataatttggaaac 16240089  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16240088 atcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 16239990  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  | |||||||||  |||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16239989 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcg 16239890  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16239889 cagattataattaacatcat 16239870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 56 - 429
Target Start/End: Original strand, 14038498 - 14038863
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038498 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcatgttgagca-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 14038595  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14038596 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattt--------atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagct 14038687  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  14038688 tagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttc 14038787  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 429  Q
    |||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14038788 aagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacagattataattaa 14038863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 58 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16270515 - 16270145
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270515 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16270416  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270415 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagctt 16270316  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 356  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | |||  |||    
T  16270315 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttca 16270217  T
Q  357 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 426  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270216 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 16270145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 122 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 54798969 - 54798669
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54798969 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttca 54798870  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798869 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 54798770  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagat 420  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54798769 agtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagat 54798678  T
Q  421 tataattaa 429  Q
    ||| |||||    
T  54798677 tatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 429
Target Start/End: Original strand, 14280219 - 14280518
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14280219 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 14280318  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280319 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 14280417  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagat 420  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14280418 agtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagat 14280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18215540 - 18215280
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  18215540 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttga 18215441  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18215440 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18215342  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18215341 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18215280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44929146 - 44928829
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44929146 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgctaatccatggattcgacctcttaaacatctttaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44929047  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44929046 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtc 44928947  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 411  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||| ||||    
T  44928946 aaatgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagc 44928847  T
Q  412 ttcacagattataattaa 429  Q
    ||||||||| || |||||    
T  44928846 ttcacagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12565 - 12313
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12565 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 12467  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12466 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 12368  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12367 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15118617 - 15118358
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118617 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 15118519  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15118518 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15118420  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15118419 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15118358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23374672 - 23374264
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  23374672 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccaatcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 23374573  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23374572 ccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaactcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 23374474  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
          |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  23374473 ------catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 23374380  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
     |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  23374379 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttc 23374280  T
Q  415 acagattataattaac 430  Q
    | |||||||| |||||    
T  23374279 agagattatagttaac 23374264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44773352 - 44773093
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44773254  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44773253 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44773155  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44773154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattat 44773093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50222604 - 50222345
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222604 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 50222506  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50222505 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatc 50222407  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  50222406 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 50222345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 52312407 - 52312666
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312407 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 52312505  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52312506 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52312604  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  52312605 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 52312666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 44615185 - 44615444
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44615185 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 44615283  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44615284 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 44615382  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44615383 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 44615444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18239684 - 18239426
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239684 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18239586  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18239585 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18239487  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 375  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  18239486 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 52873582 - 52873363
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52873582 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatca 52873483  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52873482 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 52873383  T
Q  322 agacaacaacatctcaaata 341  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  52873382 agtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1837774 - 1837522
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837774 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1837676  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1837675 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatacc 1837577  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 369  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  1837576 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 1837522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8575088 - 8574784
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  8575088 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatccacaacctcttatataatccaatgctttgg 8574990  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574989 aacctcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 8574892  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 413  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  8574891 aaatgtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 8574800  T
Q  414 cacagattataattaa 429  Q
    || ||||||| |||||    
T  8574799 catagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15355591 - 15355330
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15355591 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaaatcgactacctcttatataatccaataatttgg 15355492  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15355491 aacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15355393  T
Q  315 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  15355392 aaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 15355330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 17046288 - 17046700
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||| ||||||    
T  17046288 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtgcaaagc 17046387  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  17046388 tccagggcatcaagccctcaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 17046486  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||   | |||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat---agaacaacatgacataattatatc 17046583  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaa-attat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 411  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   |||||||||  ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||  ||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaat--gtataaacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagc 17046681  T
Q  412 ttcacagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17046682 ttcacagattataattaac 17046700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14053621 - 14053202
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  14053621 catcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 14053522  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  14053521 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttacattagtccaataatttgga 14053423  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || |  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  315 aaatgcaagacaacaaca-tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    || | |||  || ||||| ||| |   |||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggct 14053225  T
Q  413 tcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  14053224 tcacagattataattaacctcat 14053202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7641447 - 7641198
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7641447 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 7641349  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||    
T  7641348 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatc 7641260  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7641259 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattat 7641198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 51464124 - 51463874
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51464124 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 51464027  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51464026 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 51463928  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  51463927 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattat 51463874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 302
Target Start/End: Original strand, 3096134 - 3096379
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3096134 cagggcgtcaagcccccatcgctaatttgagctaatgcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcat 3096232  T
Q  157 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatcc-aataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3096233 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattattctaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagct 3096332  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  3096333 tagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23803521 - 23803271
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||    
T  23803521 gcatcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttggaacttcat 23803424  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23803423 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 23803325  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| ||| || ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23803324 atcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 23803271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 12610856 - 12611099
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12610856 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtataatccaataatttggaacttcat 12610953  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12610954 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 12611045  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12611046 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 12611099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 429
Target Start/End: Original strand, 44102140 - 44102425
Alignment:
Q  145 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44102140 atgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 44102239  T
Q  245 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |    
T  44102240 ctcatgcagcttagttaaataacaacaataacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattc 44102338  T
Q  345 attcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    |   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  44102339 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 172 - 430
Target Start/End: Original strand, 7088832 - 7089093
Alignment:
Q  172 aacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 270  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088832 aacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 7088931  T
Q  271 agcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataa 370  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| | |||| ||   || | ||||||||||| || ||    
T  7088932 agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaa 7089031  T
Q  371 aat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
     ||  |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7089032 cattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaacttcacagattataattaac 7089093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 287
Target Start/End: Original strand, 15551663 - 15551889
Alignment:
Q  63 catcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 161  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15551663 catcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggact 15551761  T
Q  162 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 260  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551762 cgacctattaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagtt 15551861  T
Q  261 aaataac-aacagcaacacaagcagtat 287  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15551862 aaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 363
Target Start/End: Original strand, 6899808 - 6900037
Alignment:
Q  134 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttcatc 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6899808 ccaataatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaaacattttaattcgaaaacctcttatataattcaataatttggaaacatcatcatcttcatc 6899907  T
Q  233 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6899908 aacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 6900006  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatg 363  Q
    ||| |||||| || | |||  ||||||||||    
T  6900007 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 6900037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 15369925 - 15370124
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15369925 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15370023  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15370024 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15370122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 15371109 - 15371308
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15371109 gcatcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15371207  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15371208 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15371306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 429
Target Start/End: Original strand, 15367597 - 15367905
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 221  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  15367597 gcattaagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 15367695  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15367696 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15367794  T
Q  322 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 417  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| ||| || |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15367795 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 15367893  T
Q  418 gattataattaa 429  Q
    ||| || |||||    
T  15367894 gatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 429
Target Start/End: Original strand, 15402610 - 15402918
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15402610 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgcaaatgcatggactcgacttcttaaccatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15402708  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402709 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15402807  T
Q  322 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 417  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| ||| || |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15402808 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 15402906  T
Q  418 gattataattaa 429  Q
    ||| || |||||    
T  15402907 gatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19618415 - 19618178
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||      || ||||||||    
T  19618415 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaatagtttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 19618316  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19618315 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 19618217  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19618216 attattcacctataattcaagtaatgcatatataattat 19618178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 15373390 - 15373589
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  15373390 gcatcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgaaacatca 15373488  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15373489 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15373587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 19242675 - 19242855
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19242675 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa 19242772  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19242773 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 19242855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 16223439 - 16223638
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 221  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  16223439 gcattaagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 16223537  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16223538 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgca 16223636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 3514982 - 3515163
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3514982 ttatataatccaataatttagaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 3515080  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  3515081 acagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 3515163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14970950 - 14970713
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  14970950 aatgctaatgcatcgactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacattttaatcaactt 14970851  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14970850 agaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 14970752  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  14970751 attattcacatataattcaagtaatacatatataattat 14970713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Original strand, 20149735 - 20149932
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||       
T  20149735 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgataaactcttgtataatccaataatttggaact--- 20149831  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21815761 - 21815591
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  21815761 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagca 21815668  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21815667 tgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21815591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 52243343 - 52243099
Alignment:
Q  186 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 283  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  52243343 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 52243249  T
Q  284 gtatacaaa-aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcaca 380  Q
    |||| ||||  |   ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||  ||||  |||||||||| |||| |||  |||||||    
T  52243248 gtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcaca 52243149  T
Q  381 tcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  52243148 ttataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcattaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13789
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaat-cgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  || || |||||||||  | || |||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  14061 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgtgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttaaaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac-- 13966  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
     ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13965 -atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaat 13870  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 397  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  13869 gcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 13789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39706511 - 39706302
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctatta-tata-atccaataatt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  39706511 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatt 39706414  T
Q  212 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 310  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||    
T  39706413 tggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaa 39706315  T
Q  311 tatcaaatgcaag 323  Q
    |||| ||||||||    
T  39706314 tatcgaatgcaag 39706302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17048609 - 17048409
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  17048609 ttgagtattaatatacttccagggcat-atgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 17048512  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 236  Q
    |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17048511 caaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 17048414  T
Q  237 tagac 241  Q
    |||||    
T  17048413 tagac 17048409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Original strand, 12569820 - 12570078
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12569820 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 12569918  T
Q  124 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga--actt 219  Q
     || |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||||| |||||||||||||||   |      
T  12569919 tat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatat-atccaataatttggagttcaa 12570013  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcag 284  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  12570014 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 12570078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 22353740 - 22353993
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaact-t 219  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||  ||| |||||| |||| |||||||||| | | |    
T  22353740 gcatcaagccccaatcactgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaatttgac--cctcttatattaatcgaataatttgggaatat 22353836  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||  |  |  ||||||||||||||| |||||||| |     
T  22353837 catcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaatta 22353936  T
Q  320 caagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||  ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22353937 caattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22353993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 43198769 - 43198492
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || | ||||| |   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43198769 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacc-tcttagaa--acaacctcttatataaatccaataatttg 43198674  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataataa 310  Q
    ||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| | |||||||  ||||| ||||  |    
T  43198673 gaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgc-aaaacaattcatgatataacca 43198580  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 396  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  43198579 tatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 44675436 - 44675593
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  44675436 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 44675534  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  44675535 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 44675593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 13569306 - 13569454
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  13569306 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 13569404  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13569405 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 13569454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 338
Target Start/End: Original strand, 12773910 - 12774128
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatt 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | ||||||||||    
T  12773910 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatcgacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatt 12774006  T
Q  212 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 310  Q
    || |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||    
T  12774007 tgaa----catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaa 12774101  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  12774102 tatcgaatacaa-tcaacaacatctcaa 12774128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15125354 - 15125197
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  15125354 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 15125256  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    | ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15125255 gaat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15125197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 23843282 - 23843439
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  23843282 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagccaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 23843380  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23843381 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 23843439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12288342 - 12288211
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa-aacaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  |       
T  12288342 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagtt 12288248  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12288247 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 292
Target Start/End: Original strand, 8846287 - 8846433
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  8846287 aatgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttagacc 8846382  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  8846383 gacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 15093594 - 15093736
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  15093594 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagccaccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 15093691  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctct-taaacatcttaa 181  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  15093692 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctctaaaaacatcttaa 15093736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 168
Target Start/End: Original strand, 29267517 - 29267570
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29267517 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctc 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 369
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190616
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| |||||| |||| |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 369  Q
    |||||| ||| |||| | |  ||||||||||||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 6190616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15122101 - 15121956
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  15122101 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccattgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 15122004  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15122003 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15121956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17048033 - 17047979
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17048033 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaatta 17047979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 3096803 - 3096864
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3096803 tatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcat 3096864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19618551 - 19618499
Alignment:
Q  34 gctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19618551 gctatttgagtattattatacttccagagcatcaaaccccaatcgctatttga 19618499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46640675 - 46640453
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| || |||||| ||||||| | |  | |||| |||||||| |||||||||    
T  46640675 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacatcttaa-catcttagaccatcgacctcttatataaatccaataat 46640578  T
Q  211 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataat 308  Q
    ||| |||  |||  | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||||||| |||| |   ||||| ||||     
T  46640577 ttgaaacaacat--ttttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataac 46640483  T
Q  309 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  46640482 aatatcaaatgaaaatcaataacatctcaa 46640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 19242536 - 19242603
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19242536 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 19242603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 22353609 - 22353676
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22353609 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcactatttga 22353676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14927955 - 14927843
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||| ||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14927955 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaactt-aactttttataacaacaacctcttatatatatctaataatttg 14927858  T
Q  214 gaacttcatcatctt 228  Q
    |||| ||||||||||    
T  14927857 gaacatcatcatctt 14927843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53082284 - 53082202
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagta 286  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  53082284 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 15705192 - 15705256
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15705192 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatactt-cagagcatcaagcccctatcgctattt 15705256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14971145 - 14971078
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||    
T  14971145 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaggccccaatcgctatttga 14971078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 19242493 - 19242559
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19242493 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 19242559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 22353653 - 22353720
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22353653 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 22353720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464892
Alignment:
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattat 15464892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 12610728 - 12610792
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  12610728 catcaagcccttatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 12610792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 12610771 - 12610835
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  12610771 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 12610835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 15367512 - 15367576
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15367512 catcaagcccctgtcactatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 15367576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 19242580 - 19242641
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  19242580 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagcccctatcgct 19242641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23803606 - 23803542
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23803606 catcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccaaggcatcaagccccaatcgctattt 23803542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23803649 - 23803585
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23803649 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccaaggcatcaagccccaatcgctattt 23803585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 51464209 - 51464145
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  51464209 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 51464145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333338
Alignment:
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 17333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 39706598 - 39706543
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctcca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||    
T  39706598 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccaacg-taattgagctaaagctcca 39706543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 130)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40214038 - 40213621
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40214038 catcaagcccacatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 40213939  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || | |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40213938 caggacatcaagccatccacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 40213839  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacac-agcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40213639 agattataattaacatcat 40213621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 435
Target Start/End: Original strand, 14972682 - 14973075
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||    
T  14972682 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctccaggacatcaatcccccaacaat 14972779  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972780 gaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 14972879  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  14972880 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatata 14972979  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14972980 tacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 14973075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25476701 - 25476290
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25476701 catcaagccctcatcgctatt-gagtattaatatacttacagggcatcaa-cccccatcactatttgagctaaagctccatcttgttgagtacaaagctc 25476604  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25476603 cagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 25476504  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25476503 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttcac 25476304  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||| ||||||||    
T  25476303 agattgtaattaac 25476290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23083679 - 23083261
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  23083679 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaaactc 23083580  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23083579 caaggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 23083480  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  23083479 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |  ||  || ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagcttcac 23083280  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  23083279 agattgtaattaacatcat 23083261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 17487659 - 17488077
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17487659 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 17487758  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17487759 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 17487858  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17487859 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17488058  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  17488059 agattataattaacatcat 17488077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 43840735 - 43841148
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  43840735 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctctttcgtgttgagtacaaagctc 43840834  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43840835 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 43840934  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  43840935 tcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 43841034  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43841035 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 43841134  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  43841135 agattataattaac 43841148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 18438337 - 18438755
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18438337 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccccttcactatttgagctaaaactccatcgtgttgagtacaaagctc 18438435  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttg-gaac 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  18438436 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaac 18438535  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18438536 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 18438635  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| |||||||||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18438636 tgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttca 18438735  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  18438736 cagattatagttaacatcat 18438755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 17499141 - 17499559
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17499141 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 17499240  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17499241 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 17499340  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17499341 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17499540  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  17499541 aaattataattaacatcat 17499559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 56 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 11425040 - 11424668
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425040 tccagagcatcaagcccccatcactatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 11424941  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11424940 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagct 11424841  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||   | ||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  11424840 tagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattc 11424745  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11424744 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagcttcacagattaaaattaac 11424668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 13442115 - 13442495
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13442115 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatattaatgcat 13442214  T
Q  157 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442215 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 13442314  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 356  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||    
T  13442315 agttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttca 13442414  T
Q  357 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13442415 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 13442495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 430
Target Start/End: Original strand, 26686729 - 26687103
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686729 cagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaaactccaacatgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 26686828  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 257  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26686829 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagctta 26686928  T
Q  258 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaa 357  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |  | |||  ||||    
T  26686929 gttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaa 26687028  T
Q  358 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687029 gtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 26687103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20698755 - 20698336
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20698755 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttgcatagcatcaagcccccatcgctaatttgagttaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20698656  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 216  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20698655 ccagggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 20698556  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20698555 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaa 20698456  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
     |||||  || |||||||| | |||| ||   ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20698455 ttgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagcttca 20698356  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20698355 cagattataattaacatcat 20698336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 12399011 - 12399425
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||  |||    
T  12399011 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagtgct 12399110  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12399111 ccagggcatcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 12399209  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12399210 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 12399309  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  12399310 atgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagcttc 12399409  T
Q  415 acagattataattaac 430  Q
    |||||||||| |||||    
T  12399410 acagattatagttaac 12399425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24153430 - 24153115
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24153430 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24153331  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24153330 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 24153232  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| ||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24153231 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 24153132  T
Q  413 tcacagattataattaa 429  Q
    |||||||||||||||||    
T  24153131 tcacagattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Original strand, 21618345 - 21618650
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21618345 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 21618444  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21618445 aacttcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 21618542  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21618543 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 21618634  T
Q  414 cacagattataattaa 429  Q
    || ||||||| |||||    
T  21618635 catagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14577124 - 14576733
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14577124 agtattaatatacgtccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaaaat 14577026  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 240  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||  ||| |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||    
T  14577025 gaaatgcaaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaataacaacctcttaagtaagtccaataatttggaa---catcatcaacatcaacttaga 14576929  T
Q  241 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaat 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14576928 ccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaat 14576830  T
Q  341 atacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    || || | |||  ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14576829 attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcat 14576733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Original strand, 36166494 - 36166799
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36166494 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcggcctctttaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 36166593  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36166594 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 36166691  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  36166692 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 36166783  T
Q  414 cacagattataattaa 429  Q
    || ||||||| |||||    
T  36166784 catagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29172849 - 29172589
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29172849 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttga 29172750  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29172749 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29172651  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29172650 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29172589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 17463075 - 17463334
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463075 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 17463173  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17463174 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17463272  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17463273 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 17463334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 34159223 - 34159482
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159223 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 34159321  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34159322 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 34159420  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34159421 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 34159482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16454546 - 16454287
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454546 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16454448  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16454447 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16454349  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16454348 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16454287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28848876 - 28848618
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848876 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 28848778  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28848777 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 28848679  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 375  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  28848678 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 8898998 - 8899250
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898998 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 8899096  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899097 tcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 8899195  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8899196 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 8899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13152056 - 13151796
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13152056 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13151958  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13151957 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 13151859  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13151858 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13151796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13154521 - 13154261
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154521 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13154423  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13154422 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 13154324  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13154323 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13154261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38962157 - 38961897
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38962157 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatagactcgatctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 38962058  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38962057 aacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 38961959  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  38961958 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 38961897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45607172 - 45606913
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45607172 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45607074  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45607073 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 45606975  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  45606974 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 45606913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 333
Target Start/End: Original strand, 55500839 - 55501055
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55500839 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 55500937  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55500938 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 55501036  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacat 333  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  55501037 aaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9707872 - 9707613
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  9707872 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgg 9707774  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9707773 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 9707675  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  9707674 aaatacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 9707613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16283076 - 16282817
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16283076 gctccagggcatcaagcccccaacaataaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16282978  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16282977 aactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatt 16282879  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
     |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16282878 gaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16282817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17446919 - 17446661
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446919 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgggctcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 17446821  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17446820 aacttcatcatcttaatcaacttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17446723  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  17446722 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattat 17446661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7781605 - 7781353
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781605 ggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 7781507  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781506 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 7781408  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |  ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7781407 aatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 7781353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10247988 - 10247729
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10247988 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttgg 10247890  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10247889 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 10247791  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  10247790 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 10247729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6469395 - 6469178
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469395 gctccagggcatcaagcccccaacaatgacatgctaatgcatggactcgacctctta-----cttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 6469301  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6469300 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 6469202  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  6469201 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 435
Target Start/End: Original strand, 14572417 - 14572809
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14572417 agtattaatatacttccagagcatcaagccctcatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaat 14572516  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 240  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  ||| |||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||    
T  14572517 gaaatgcaaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaaaacaacatcctcttaagtaagtccaataatttggaa---caacatcaacatcaacttaga 14572613  T
Q  241 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  14572614 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatcttaaat 14572712  T
Q  341 atacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    || || | |||  |||| |||||   | || ||  ||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  14572713 attcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataattaacatcat 14572809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 15977409 - 15977633
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15977409 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttgtataatccaataatt 15977507  T
Q  212 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977508 tggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacaacatgacataataat 15977606  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15977607 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 62 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24340999 - 24340628
Alignment:
Q  62 gcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 161  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24340999 gcatcaagcctctatcgctatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggact 24340900  T
Q  162 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 260  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24340899 cgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagtt 24340800  T
Q  261 aaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagt 359  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||| | | |||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||    
T  24340799 aattaacaatcagcaacatatgcagtatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagt 24340701  T
Q  360 aatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  24340700 aatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13210647 - 13210333
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  13210647 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 13210548  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  13210547 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgaa 13210449  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  315 aaatgcaagacaacaac 331  Q
     |||||||  |||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 55476417 - 55476647
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55476417 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 55476515  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  55476516 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 55476614  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  55476615 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 55476647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 41123787 - 41124043
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41123787 gctccagggcattaaggccccatcaatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaa-catcttaaatcgacaaccttttatataatccaataatttgg 41123885  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41123886 aactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41123981  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41123982 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41124043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 8499422 - 8499621
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499422 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 8499521  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499522 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 8499620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 117 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43550744 - 43550484
Alignment:
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43550744 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 43550646  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43550645 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattat 43550484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Original strand, 10556882 - 10557105
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10556882 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataattcaataatttgga 10556981  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10556982 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-atcagcatacaaaaacggcatgacataataatatca 10557080  T
Q  316 aatgcaagacaa-caacatctcaaa 339  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10557081 aatgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 15412333 - 15412532
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412333 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 15412432  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412433 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15412531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 50242728 - 50242978
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50242728 gcatcaagcccccaacaaagaac-gttgatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 50242825  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242826 cattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 50242924  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  50242925 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 50242978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12119983 - 12119784
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119983 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggcctttacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 12119884  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12119883 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 12119785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 424
Target Start/End: Original strand, 30029637 - 30030049
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  30029637 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagg-cat-aagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacatgttgagtacaaagctc 30029734  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 216  Q
    || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||| |||||||||||||||    
T  30029735 cagggcatcaagcccccatcactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttgtatagtccaataatttggaa 30029834  T
Q  217 cttcatcatcttca------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 310  Q
    | ||||||||  ||      ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |  |||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  30029835 catcatcatcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaa 30029934  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaac 408  Q
    |||||  |||||  | ||||| ||| |||||| || | | |  ||||||||||   | || ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30029935 tatcatttgcaattc-acaacgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaac 30030033  T
Q  409 agcttcacagattata 424  Q
    ||||||||| ||||||    
T  30030034 agcttcacatattata 30030049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 23274489 - 23274903
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  23274489 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 23274587  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaa 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||    
T  23274588 ccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaatttgacaaccttttataatagtccaatactttgaaa 23274687  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    | ||| |||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||     
T  23274688 catcaacatcttcgatgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 23274786  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaa-acagct 412  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| |  |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||| |||| |||  |||||    
T  23274787 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagct 23274886  T
Q  413 tcacagattataattaa 429  Q
    |||||||| || |||||    
T  23274887 tcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 435
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  234 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacat 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  334 ctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  431 ttcat 435  Q
     ||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 27165154 - 27165407
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165154 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 27165253  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  27165254 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaatgca 27165352  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || || ||| ||||||||||| |||  |||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  27165353 agtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattat 27165407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45578102 - 45577947
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45578102 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga 45578004  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578003 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 12567479 - 12567716
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  12567479 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcataaacaacatcttaatcaactt 12567578  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12567579 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 12567677  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12567678 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 12567716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 13543944 - 13544181
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  13543944 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 13544043  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13544044 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 13544142  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13544143 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 13544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 319
Target Start/End: Original strand, 44494715 - 44494908
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  44494715 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgttaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttagaacttcat 44494812  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44494813 catcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 364
Target Start/End: Original strand, 12510939 - 12511205
Alignment:
Q  105 tgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatc 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  12510939 tgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattaatc 12511038  T
Q  204 caataatttggaacttcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa 297  Q
    |||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||||    
T  12511039 caataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaa 12511138  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  12511139 caagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgc 12511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 141 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53301747 - 53301511
Alignment:
Q  141 tgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53301747 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttaga 53301648  T
Q  241 ccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagaca-acaacatctcaa 338  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  53301647 ccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaa 53301549  T
Q  339 atatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||| |||  |||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  53301548 atattcatatataattcaagtattacgtatacaattat 53301511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 318
Target Start/End: Original strand, 17737142 - 17737337
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17737142 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgataatgcatagactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtatgatccaataacttggaacttcat 17737239  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta---tacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17737240 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10542759 - 10542619
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542759 catcaagcccccatcgctatttgaatattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542660  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaa 159  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10542659 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatgaa 10542619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Original strand, 28194599 - 28194752
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28194599 gcatcaaacccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacctcat 28194696  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194697 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28194752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15878363 - 15878083
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15878363 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 15878265  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  15878264 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 15878169  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 305  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||  ||||| ||||| |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 144 - 364
Target Start/End: Original strand, 46822187 - 46822413
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  46822187 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 46822286  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  46822287 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 46822386  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  46822387 aatattcaataatatctcaagtaatgc 46822413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37642458 - 37642170
Alignment:
Q  145 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||    
T  37642458 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 37642359  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||     
T  37642358 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 37642260  T
Q  343 acattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
     ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  37642259 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10542969 - 10542852
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542969 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542870  T
Q  119 caaggcatcaagccccca 136  Q
    || |||||||||||||||    
T  10542869 cagggcatcaagccccca 10542852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672782
Alignment:
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||  ||||||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattat 17672782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070659
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  335 tcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 53070659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 23408234 - 23408485
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  23408234 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctaggg 23408332  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
    |||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  23408333 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctcttaaacatc-aaaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 23408428  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  23408429 atcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaaca 23408485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 14682183 - 14682300
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14682183 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 14682282  T
Q  118 ccaaggcatcaagccccc 135  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14682283 ccaaggcatcaagccccc 14682300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10542864 - 10542747
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542864 catcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542765  T
Q  119 caaggcatcaagccccca 136  Q
    || |||||||||||||||    
T  10542764 cagggcatcaagccccca 10542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 339
Target Start/End: Original strand, 15470827 - 15471047
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  15470827 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcattgacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 15470924  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  15470925 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 15471020  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    || |||||||| || ||||||||||||    
T  15471021 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 15471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 14670661 - 14670778
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  14670661 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatgcttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgactacaaagct 14670760  T
Q  118 ccaaggcatcaagccccc 135  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14670761 ccaaggcatcaagccccc 14670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Original strand, 14234382 - 14234605
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-----atccaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |   ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||     ||||||||    
T  14234382 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaataacttaa-cttcttataaacaacaaccttttatatatatatatccaata 14234479  T
Q  209 atttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataa 307  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||    
T  14234480 atttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataa 14234578  T
Q  308 taatatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
     |||||| |||||||| || |||||||    
T  14234579 caatatcgaatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22147717 - 22147431
Alignment:
Q  146 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 244  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  22147717 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 22147618  T
Q  245 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
     ||||||||||||||||  |||  | |||||||  | || |||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  22147617 gtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 22147519  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  22147518 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12174467 - 12174265
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |         ||||||||| | | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  12174467 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacac---------aacatcttagaacaacaacctcttata-agtccaataatttgg 12174379  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  12174378 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 12174283  T
Q  314 caaatgcaagacaacaac 331  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  12174282 cgaatgcaaaacaacaac 12174265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 322
Target Start/End: Original strand, 9512825 - 9513026
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  9512825 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 9512921  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  9512922 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 9513017  T
Q  314 caaatgcaa 322  Q
    | |||||||    
T  9513018 cgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 322
Target Start/End: Original strand, 9520800 - 9521001
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| ||||||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  9520800 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-catcttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 9520896  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  9520897 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 9520992  T
Q  314 caaatgcaa 322  Q
    | |||||||    
T  9520993 cgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 16103685 - 16103905
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |  | |||||  || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  16103685 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacatcatcttag-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 16103781  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  16103782 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 16103877  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16103878 cgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 16103905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49668292 - 49668091
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  49668292 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 49668196  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  49668195 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 49668100  T
Q  314 caaatgcaa 322  Q
    | |||||||    
T  49668099 cgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 52523946 - 52523633
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  || || ||||||| ||   |||| || |||||||| |||||||||||    
T  52523946 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaataacaaactcttatataaatccaataattt 52523849  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 310  Q
    |||||   ||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||| ||    
T  52523848 ggaac---atcttctg--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaa 52523754  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aa 407  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||    
T  52523753 tatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatc-aatcatcttataa 52523655  T
Q  408 cagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||||||| ||||| || |||||    
T  52523654 cagcttctcagatcatcattaa 52523633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 342
Target Start/End: Original strand, 16097238 - 16097454
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || | || |||||| || |||| | | |||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16097238 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaattcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaatctcttaaataagtccaataatttggaacatc 16097335  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||  || ||| | |||| |||||| ||||    
T  16097336 atcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaat-catcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  320 caagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatat 16097454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 32307666 - 32307798
Alignment:
Q  202 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacat 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || |||    
T  32307666 tccaataatttggaacaacatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcat 32307761  T
Q  301 gacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    || |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32307762 gatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 32307798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 433
Target Start/End: Original strand, 14179592 - 14179651
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179592 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 14179651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22110569 - 22110349
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  22110569 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 22110472  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 310  Q
    ||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||    
T  22110471 ggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaa 22110377  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22110376 tatcaaatgcaaatcaacagcatctcaa 22110349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23077776 - 23077642
Alignment:
Q  38 tttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccca 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  23077776 tttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctagtttgagataatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagccccca 23077679  T
Q  137 aca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    ||| |||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  23077678 acatatg-tatgctaatgaatggactcgatctcttaaa 23077642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 27165069 - 27165135
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  27165069 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 27165135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37251300 - 37251165
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |       
T  37251300 aatccaataatttggaac---atcatcttc--catcttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 37251206  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37251205 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 37251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1644882 - 1644718
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | ||||||||||||||||   |    
T  1644882 ggcatcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaac---a 1644789  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  1644788 acatcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Original strand, 16796117 - 16796192
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  16796117 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaa 16796192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Original strand, 43925947 - 43926083
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  43925947 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagct 43926041  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43926042 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 43926083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 8499337 - 8499403
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  8499337 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 8499403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 15067499 - 15067644
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  15067499 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 15067596  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  15067597 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 15067644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 15412248 - 15412314
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15412248 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 15412314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 16369216 - 16369361
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  16369216 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagctcc 16369313  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  16369314 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 16369361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 241
Target Start/End: Original strand, 16796195 - 16796339
Alignment:
Q  95 tccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctat 194  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |    
T  16796195 tccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctct 16796291  T
Q  195 tata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16796292 tatattagtgcaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagac 16796339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53301850 - 53301784
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  53301850 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt-cagagcatcaagcccctatcgctatttga 53301784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22147782 - 22147716
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  22147782 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttg 22147716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23053387 - 23053244
Alignment:
Q  38 tttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccca 136  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  23053387 tttgagtattaatatatttccagggcat-aagcccccatttctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaaggcat-gatccccca 23053290  T
Q  137 aca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  23053289 acatatg-tatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 23053244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  396 a 396  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14878814 - 14878672
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||  ||||||| |    
T  14878814 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaatctccagggcat-gagcccccta 14878717  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14878716 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14878672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12120103 - 12120045
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  12120103 ccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 12120045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22147826 - 22147759
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147826 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 22147759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 26683157 - 26683200
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccaggg 62  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26683157 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaggg 26683200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 46822080 - 46822147
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46822080 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 46822147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 16796707 - 16796761
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16796707 tatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataatta 16796761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 46822124 - 46822185
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46822124 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 46822185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919390
Alignment:
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 13919390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 28194557 - 28194612
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 75  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28194557 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaaccccca 28194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 10556804 - 10556870
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10556804 catcaagcccccatcgctatttgagtattaccatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 10556870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Original strand, 14665380 - 14665458
Alignment:
Q  201 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14665380 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 14665458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15076267 - 15076200
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15076267 catcaagccccaatctctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 15076200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15076311 - 15076244
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15076311 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatctctatttga 15076244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22147869 - 22147803
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147869 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 22147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 28194514 - 28194580
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28194514 catcaagcctcaatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 28194580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43550825 - 43550758
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||    
T  43550825 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaagcatcaagccctaatcgctatttga 43550758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12120068 - 12120003
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  12120068 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccaaagcatcaagcccctatcgctatttg 12120003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43550852 - 43550802
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  43550852 tatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 43550802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Original strand, 46822049 - 46822103
Alignment:
Q  32 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46822049 tcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 46822103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 277
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856197
Alignment:
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaaca 856197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 10556847 - 10556907
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  10556847 catcaagcccctatcgctatttgagtattactatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 10556907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 15412291 - 15412351
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  15412291 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 15412351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 17737057 - 17737121
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17737057 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 17737121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18384158 - 18384090
Alignment:
Q  93 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  18384158 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 18384090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077537
Alignment:
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 27165112 - 27165172
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  27165112 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 27165172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 50242643 - 50242707
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  50242643 catcaagcccctatcgttatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 50242707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 55476354 - 55476415
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  55476354 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 55476415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 12172658 - 12172757
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatctta 180  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  12172658 tttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctacagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctta 12172756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 274
Target Start/End: Original strand, 14668536 - 14668611
Alignment:
Q  201 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14668536 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 14668611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 15051371 - 15051470
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatctta 180  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || |||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  15051371 tttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gaggccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctta 15051469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 43550781 - 43550725
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 75  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  43550781 catcaagccctaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 43550725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 86
Target Start/End: Original strand, 43840730 - 43840758
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840730 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 43840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 23060315 - 23060733
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060315 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 23060414  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23060415 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 23060514  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060515 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 23060614  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060615 tgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 23060714  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  23060715 ca-attataattaacatcat 23060733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 22336928 - 22337336
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22336928 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgcaatttgagctaaagctccattgtgttgagtacaaagctc 22337025  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||        ||||||||     
T  22337026 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaattcgacaacctcttatataa--------tttggaaca 22337117  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22337118 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaacttcac 22337317  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  22337318 aaattataattaacatcat 22337336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22731551 - 22731139
Alignment:
Q  20 atcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcc 119  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22731551 atcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttcaagggcaccaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctcc 22731452  T
Q  120 aaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22731451 agggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttagacatctttattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacat 22731352  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22731351 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 22731252  T
Q  320 caagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 417  Q
    |||  || |||||| | |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22731251 caattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 22731152  T
Q  418 gattataattaac 430  Q
    |||||||||||||    
T  22731151 gattataattaac 22731139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 23076288 - 23076663
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076288 cagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgt-----gtacaaaggttcagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 23076382  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076383 gactcggcctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagctt 23076482  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || | |||  |||    
T  23076483 agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttca 23076582  T
Q  357 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23076583 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 23076663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23654706 - 23654291
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23654706 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 23654607  T
Q  118 ccaaggcatcaagccccc-aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  23654606 ccagggcatcaagccccccaacaatgaa-tgctagtgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 23654508  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    | |||||  || |||||||| |||||| ||   || ||||||||||||| || || ||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  414 cacagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||||    
T  23654307 cacagattataattaac 23654291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22738497 - 22738085
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  22738497 catcaagcccccatcgctaattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcactaattgagttaaagctccaacgtgttgagtacagagctc 22738398  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22738397 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggatccgaccttttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 22738298  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22738297 tcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22738199  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22738198 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22738099  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  22738098 agattataattaac 22738085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 133 - 435
Target Start/End: Original strand, 23659940 - 23660243
Alignment:
Q  133 cccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23659940 cccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatc 23660039  T
Q  233 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23660040 aacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatac-gaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23660138  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23660139 tcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttacaaattataattaac 23660238  T
Q  431 ttcat 435  Q
     ||||    
T  23660239 atcat 23660243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Original strand, 8946463 - 8946734
Alignment:
Q  23 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8946463 aagcccccattgctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 8946562  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttca 221  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8946563 gcatcaagtccctaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatca 8946662  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8946663 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 18808840 - 18809099
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18808840 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18808938  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18808939 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18809037  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18809038 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18809099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23712278 - 23712019
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712278 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23712180  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23712179 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23712081  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23712080 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23712019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 39682210 - 39682469
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682210 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 39682308  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39682309 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 39682407  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  39682408 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 39682469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Original strand, 23135487 - 23135745
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135487 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23135585  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23135586 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23135684  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 375  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23135685 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 24367670 - 24367930
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367670 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24367769  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24367770 aacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24367868  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24367869 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24367930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 26505276 - 26505535
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26505276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26505374  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26505375 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 26505473  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26505474 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26505535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 26507754 - 26508013
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26507754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26507852  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26507853 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 26507951  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26507952 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26508013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21155318 - 21155066
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21155318 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttct 21155220  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21155066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24905898 - 24905638
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905898 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24905800  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24905799 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24905701  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24905700 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24905638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24908373 - 24908113
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908373 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24908275  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24908274 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24908176  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24908175 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24908113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45030119 - 45029867
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45030119 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45030021  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030020 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatc 45029922  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 369  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  45029921 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 45029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23709797 - 23709538
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709797 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23709699  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23709698 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23709600  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23709599 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23709538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23040509 - 23040249
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||  |    
T  23040509 catcaagctcccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaaatt 23040410  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23040409 tcaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgcactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 23040310  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040309 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24898461 - 24898201
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898461 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24898363  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24898362 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24898264  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24898263 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24898201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24900944 - 24900684
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900944 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24900846  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24900845 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24900747  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24900746 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24900684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24903421 - 24903161
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903421 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24903323  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24903322 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24903224  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24903223 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24903161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 571294 - 571553
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571294 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 571392  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  571393 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 571491  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | | ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  571492 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 571553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 6725892 - 6726151
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6725892 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttacatcgacaacctcttatataattcaataatttgg 6725990  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6725991 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 6726089  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  6726090 aaatgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 6726151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38435 - 38016
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  38435 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 38336  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaat-cgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38335 tccagggcatcaagcccc-aacaatgaa-tgctaatgcatggactccacctcttaaaacaacataaattcgacaacctcttatattagtccaataatttg 38238  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38237 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatat 38139  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    ||| | | |  || || ||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||    
T  38138 caatttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagct 38039  T
Q  413 tcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  38038 tcagagattataattaacctcat 38016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 28576996 - 28577255
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28576996 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacttcttatataatccaataatttgg 28577094  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28577095 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 28577193  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  28577194 aaatgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 28577255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32039763 - 32039504
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32039665  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32039664 aacttcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32039566  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32039565 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32039504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24529795 - 24529573
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24529795 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24529696  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24529695 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24529597  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    || ||||||  |||||| ||||||    
T  24529596 aagtgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 23130788 - 23131018
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23130788 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23130886  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  23130887 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23130985  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23130986 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23131018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 23133255 - 23133485
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23133255 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23133353  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  23133354 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23133452  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23133453 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23133485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34402758 - 34402528
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34402758 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 34402660  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  34402659 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 34402561  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34402560 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 34402528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23103714 - 23103370
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  23103714 catcaagcccccatcgctatttgagtagtaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 23103615  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||| ||||||    
T  23103614 tccagggcatcaagcccc-aacaatgag-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaatattttgga 23103517  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||| |||  || |||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgc 23103370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 43137204 - 43137455
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43137204 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttaat 43137302  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137303 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 43137401  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||||||| |||||| | | ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  43137402 gtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 43137455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23072269 - 23071972
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  23072269 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 23072170  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23072169 tctagagcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgaaaacctcttatattaatccaataatttgga 23072071  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 376
Target Start/End: Original strand, 22105319 - 22105569
Alignment:
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatc 223  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105319 catcaagtccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgaaacttcatc 22105416  T
Q  224 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22105417 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22105516  T
Q  324 acaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
     ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22105517 tcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22105569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 435
Target Start/End: Original strand, 20308945 - 20309326
Alignment:
Q  55 ttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaat 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20308945 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaat 20309043  T
Q  153 gcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgc 251  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20309044 gcatggactcgacatcttaaacaacttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgc 20309143  T
Q  252 agcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcat 350  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||||||   ||    
T  20309144 agcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatat 20309240  T
Q  351 aactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
       ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20309241 tcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagttaacctcat 20309326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24643209 - 24643036
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24643209 ggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatcatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcg 24643110  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-atcagtatacaaaaaca 24643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 38967279 - 38967531
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38967279 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaaactcctatataatccaatattttggaacttcat 38967377  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  38967378 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaa-caatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaa 38967476  T
Q  323 gacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  38967477 gtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 38967531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21900773 - 21900560
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  21900773 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 21900674  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21900673 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 21900574  T
Q  217 cttcatcatcttca 230  Q
    | ||||||||||||    
T  21900573 catcatcatcttca 21900560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 123 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 299027 - 298719
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  299027 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatgttaaatcgacaac-tcttgtataatccaaaaatttgaaacttcat 298930  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  298929 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 298830  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacaga 419  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  |||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  298829 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttcacata 298730  T
Q  420 ttataattaac 430  Q
    ||||| |||||    
T  298729 ttatagttaac 298719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 430
Target Start/End: Original strand, 23285818 - 23286077
Alignment:
Q  170 taaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 268  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285818 taaacatcttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 23285917  T
Q  269 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtat 368  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||    |   ||||||||||| ||     
T  23285918 acagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataa 23286013  T
Q  369 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286014 aacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 23286077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 429
Target Start/End: Original strand, 19671675 - 19672043
Alignment:
Q  62 gcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 161  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  19671675 gcatcaagcccctatcgctaattgagcttaagcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagctcccaaccatgaaatgctaatgcatagact 19671774  T
Q  162 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 260  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19671775 cgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagtt 19671874  T
Q  261 aaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagt 359  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||    
T  19671875 aattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaa-tattcacatataattcaagt 19671972  T
Q  360 aatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||||    
T  19671973 aatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaat-catcatagatcagcttcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32215164 - 32214927
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  32215164 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 32215065  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32215064 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 32214966  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32214965 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 32214927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23708769 - 23708524
Alignment:
Q  186 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagca 283  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  23708769 acaacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggca 23708672  T
Q  284 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacat 381  Q
    |||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||  || | |||||||||| || ||   |||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  23708671 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacat 23708573  T
Q  382 cataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
     |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  23708572 tataaacaacatcaattcatcttataacagcttcacagatcatcattaa 23708524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22741276 - 22741027
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22741276 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 22741178  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  22741177 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatctt-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 22741082  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagca 22741027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 364
Target Start/End: Original strand, 25616107 - 25616333
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  25616107 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattattaacatcttaatcaactt 25616206  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  25616207 agactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 25616306  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  25616307 aatattcaataatatctcaagtaatgc 25616333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 28405881 - 28406103
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  28405881 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 28405977  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  28405978 aaaatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatat 28406074  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  28406075 cgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 25175754 - 25175976
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  25175754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 25175850  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  25175851 gaacatcatcatc---atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 25175946  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25175947 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7950 - 7694
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  7950 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 7853  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    |||||   ||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  7852 ggaac---atcttctt--tcatcttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaat 7759  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  7758 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattat 7694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22759031 - 22758875
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  22759031 agcccccatcgttatttgagtatttatatacttccagggcat-aggcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagg 22758933  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  22758932 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttatacatcttaa 22758875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 23657632 - 23657713
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23657632 tccagggtatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaa 23657713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18787113 - 18786971
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  18787113 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac-- 18787018  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787017 -atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 292
Target Start/End: Original strand, 7679480 - 7679662
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || |  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7679480 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacttcaacctcttatatatatccaataattt 7679577  T
Q  213 ggaacttcatc----atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    ||||| |||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  7679578 ggaacatcatccatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 7679662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22134428 - 22134251
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||  | | ||||| | |||||||||||||    
T  22134428 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacttcatcttata-agtccaataatttgg 22134332  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaactt---agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    ||| |||||||| |||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  22134331 aacatcatcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22799424 - 22799282
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  22799424 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 22799327  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  22799326 catatg-tatgctaatgcatggactcggtctcttaaaacatcttaa 22799282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451878
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaattatcacatcataa 386  Q
    |||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacataatatcacatcataa 32451878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20520325 - 20520098
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| |       
T  20520325 aatccaataatttggaac---attatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagtt 20520231  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | | ||||||    
T  20520230 catgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatca 20520133  T
Q  396 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  20520132 aatcatcttataacaacttcacagattatcattaa 20520098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23020004 - 23019727
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||  | ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23020004 ttgagtattaatatacatccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaattcaccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23019907  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatc 232  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  23019906 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatat-atccaataatttggaggttcgacatcatcttaatc 23019811  T
Q  233 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||| || | ||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  23019810 atcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaa 23019727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 27753735 - 27753796
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  27753735 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcat 27753796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 23207266 - 23207401
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| |||| |       
T  23207266 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 23207360  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  23207361 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaa 23207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22413354 - 22413048
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22413354 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttaaaacattgacctcttatataaatccaataatttg 22413257  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataata-- 309  Q
    ||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |      
T  22413256 gaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaat 22413162  T
Q  310 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-a 406  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || |||  |||| ||| ||||||| |||| | |  |||||||| || | |||||||||| ||||||| |    
T  22413161 atatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacat-cataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttata 22413064  T
Q  407 acagcttcacagatta 422  Q
    ||||||||||||||||    
T  22413063 acagcttcacagatta 22413048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 24673383 - 24673529
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 133  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24673383 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-ctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 24673480  T
Q  134 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    |||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  24673481 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 24673529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 32215271 - 32215204
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32215271 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 32215204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 24680000 - 24680146
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 133  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24680000 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttatttttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 24680097  T
Q  134 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    |||||||    ||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||    
T  24680098 ccaacaaatgtatgctaatgcattgactcaatctcttaaaacatcttaa 24680146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392443
Alignment:
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26392443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23713104 - 23713058
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23713104 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 23713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642862
Alignment:
Q  305 taataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24642862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45678429 - 45678304
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  45678429 tattttagtattaatatactttcagtgcattag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 45678332  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  45678331 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 45678304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 32215302 - 32215248
Alignment:
Q  32 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32215302 tcgctatttgagtattattatacttacagagcatcaagccccaatcgctatttga 32215248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 23130725 - 23130786
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23130725 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23130786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 23133192 - 23133253
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23133192 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23133253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 34402821 - 34402760
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  34402821 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 34402760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 38967194 - 38967258
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38967194 catcaagcccctatcactatttgagtattattatact-ccagagcatcaaacccctatcgctattt 38967258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 43137075 - 43137139
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  43137075 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 43137139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 46 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3051
Alignment:
Q  46 ttaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaa 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3441 ttaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaa 3342  T
Q  146 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgac 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341 tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgac 3242  T
Q  246 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatataca 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3241 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatataca 3143  T
Q  346 ttcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3142 ttcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggttataattaacatcat 3051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17539 - 17115
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17539 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaacctc 17440  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-- 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  17439 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcgtaaacatcttaattcgacaacctctcatataatccaataatttggaaac 17340  T
Q  217 --cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatac--aaaaacaacatgacataataata 312  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  17339 atcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataata 17240  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 410  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17239 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacag 17140  T
Q  411 cttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17139 ctttacagattataattaacatcat 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 235 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79297
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacga-cagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  335 tcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 369  Q
    |||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 79297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14399 - 14139
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14399 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 14301  T
Q  124 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttgga--act 218  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||||| |||||||||||||||   |     
T  14300 cat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatatatatccaataatttggagttca 14205  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcag 284  Q
     ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  14204 acatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 14139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 340263 - 339850
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  340263 catcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaattttagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 340166  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  340165 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttgaact 340066  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  339868 agattataattaacgtcat 339850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 158716 - 158456
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  158716 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 158617  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  158616 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 158518  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  158517 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 158456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 435
Target Start/End: Original strand, 4350 - 4728
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4350 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 4447  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4448 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 4546  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4547 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 4646  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4647 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 435
Target Start/End: Original strand, 11932 - 12310
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11932 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 12029  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12030 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 12128  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12129 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 12228  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12229 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 12310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 435
Target Start/End: Original strand, 21884 - 22262
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21884 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 21981  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21982 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 22080  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22081 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 22180  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22181 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 22262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18818727 - 18818314
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18818727 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 18818628  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18818627 cagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 18818528  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18818527 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18818328  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  18818327 agattataattaac 18818314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 22874872 - 22875281
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  22874872 catcaagcccccgtcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 22874967  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  22874968 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaatatcttaaatcaacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 22875067  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875068 tcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 22875166  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttca 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22875167 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 22875266  T
Q  416 cagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||    
T  22875267 cagattataattaac 22875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16092621 - 16092241
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16092621 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtattgagca-aaggctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgca 16092524  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092523 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 16092424  T
Q  256 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16092423 tagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattt 16092324  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  16092323 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaacttcgcatattataattaacatcat 16092241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 63 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28649322 - 28648944
Alignment:
Q  63 catcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28649322 catcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 28649223  T
Q  163 gacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649222 gacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 28649123  T
Q  259 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaag 358  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  28649122 ttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaag 28649023  T
Q  359 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28649022 taatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacatcat 28648944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 43 - 435
Target Start/End: Original strand, 6759088 - 6759477
Alignment:
Q  43 gtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatg 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6759088 gtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtattgagca-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatg 6759185  T
Q  143 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6759186 aaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga-catcatcatcttcatcaacttagacc 6759284  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    
T  6759285 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag---tcaacatctcaattat 6759381  T
Q  343 acattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6759382 acactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagattataattaacatcat 6759477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 7372581 - 7372986
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372581 catcaatcccccatcgctgtttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcaatatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 7372680  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7372681 cagtgcatcaagcccccaacaatgaaatgttgatgcatggactcaacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 7372780  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7372781 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacag 418  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  ||||||||||| ||      ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgctta------tatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 7372974  T
Q  419 attataattaac 430  Q
    ||||||||||||    
T  7372975 attataattaac 7372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 430
Target Start/End: Original strand, 23406185 - 23406597
Alignment:
Q  22 caagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 121  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||     
T  23406185 caagcacccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccaccatcgctaattgagctaaggctccaacgtgttgagtacaaagctccag 23406284  T
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23406285 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatca 23406384  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406385 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 23406484  T
Q  322 agacaac--aacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 417  Q
    || ||||  | ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23406485 agtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 23406584  T
Q  418 gattataattaac 430  Q
     ||||||||||||    
T  23406585 tattataattaac 23406597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 22626540 - 22626951
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22626540 catcaagcccccatcgctata--agtattattatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctcaatcgtgttgagtacaaggctc 22626637  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttg-gaac 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  22626638 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaac 22626737  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22626738 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaa 22626836  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    | |||  ||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22626837 tacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttca 22626936  T
Q  416 cagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||    
T  22626937 cagattataattaac 22626951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18879547 - 18879137
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18879547 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccaccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 18879448  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18879447 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa--tgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 18879350  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     ||||||||||||||| |    
T  18879349 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaatt 18879255  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  18879254 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagcttcac 18879156  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  18879155 agattatagttaacatcat 18879137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 20536011 - 20536424
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  20536011 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattaagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 20536110  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||||||     
T  20536111 tagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttagacatcttaattcaacaatctcttatataattcaataatttggaaca 20536210  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20536211 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaacttcac 20536410  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  20536411 agattataattaac 20536424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21924222 - 21923828
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21924222 agtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacttgttgcgtacaaagctccagggcattaagcccc-aacaat 21924124  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21924123 gaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttacataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 21924024  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  21924023 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 21923924  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    | || | |||  |||||||||||  ||||  |||  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21923923 ttcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 21923828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21919279 - 21918900
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21919279 cagggcatcaaacccccatcgctatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatg 21919181  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21919180 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt 21919081  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac-attcataactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| | | | ||   ||    
T  21919080 agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttc 21918981  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21918980 aagtaatgcataaacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagcttcacagatcgtaattaacctcat 21918900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 23648350 - 23648774
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  23648350 catcaagcccccatcgctaattgagtattaatagacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaatgtgttgagtacaaagctc 23648449  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  23648450 cagggcatcaagcccccaactgtgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 23648549  T
Q  219 tcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23648550 tcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataata 23648649  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 410  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||| || | | |  |||||||||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23648650 tcatttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 23648749  T
Q  411 cttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  23648750 cttaacagattataattaacatcat 23648774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Original strand, 26219613 - 26219918
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26219613 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 26219712  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26219713 aacttcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatac-aaaatagtatgacataataatatc 26219810  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26219811 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 26219902  T
Q  414 cacagattataattaa 429  Q
    || ||||||| |||||    
T  26219903 catagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45131316 - 45130898
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  45131316 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 45131217  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  45131216 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttgga 45131118  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  316 aatgc-aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    | | | ||  || |||||||| |  |||||| | ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagctt 45130920  T
Q  414 cacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  45130919 cacagattataattaacctcat 45130898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5853557 - 5853298
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853557 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 5853459  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5853458 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 5853360  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  5853359 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 5853298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26225513 - 26225268
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26225513 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 26225414  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  26225413 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-caatatac-aaaacagtatgacataataatatc 26225316  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaat 362  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26225315 aaatacaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 1484299 - 1484558
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484299 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1484397  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1484398 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 1484496  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1484497 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 1484558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20046460 - 20046201
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20046362  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046361 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20046263  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20046262 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20046201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 20403124 - 20403383
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403124 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20403222  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20403223 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20403321  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20403322 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20403383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4542638 - 4542379
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542638 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 4542540  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4542539 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-caagatacaaaaacagcatgacataataatatc 4542441  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  4542440 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattat 4542379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 22001651 - 22001909
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001651 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catgttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22001748  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22001749 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22001847  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22001848 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22001909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 429
Target Start/End: Original strand, 41598086 - 41598399
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41598086 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttgga 41598184  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41598185 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 41598283  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagct 412  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||| |    
T  41598284 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtt 41598382  T
Q  413 tcacagattataattaa 429  Q
    |||||||| || |||||    
T  41598383 tcacagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15203489 - 15203237
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203489 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 15203391  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15203390 tcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 15203292  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15203291 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15203237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 19896162 - 19896424
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19896162 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 19896260  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgac---ataataat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  19896261 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cggtatacaaaaacagcatgacataataataat 19896359  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19896360 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19896424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 31971097 - 31971476
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971097 cagggcatcaaacccccatcgctaaattgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcat 31971195  T
Q  157 gaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc 254  Q
    | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31971196 ggactcgatctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagc 31971295  T
Q  255 ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataact 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   |    
T  31971296 ttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctt 31971394  T
Q  355 caagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31971395 caagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatcttcacagattataattaacctcat 31971476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45290961 - 45290758
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45290961 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45290862  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45290861 aacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 45290763  T
Q  315 aaatg 319  Q
    |||||    
T  45290762 aaatg 45290758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5866594 - 5866292
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  5866594 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 5866495  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5866494 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 5866396  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  315 aaatg 319  Q
     ||||    
T  5866296 gaatg 5866292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14409702 - 14409450
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409702 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 14409603  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14409602 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 14409504  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14409503 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21389770 - 21389353
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21389770 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21389671  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21389670 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttgga 21389572  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  413 tcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 14823671 - 14823929
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14823671 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 14823769  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14823770 aacttcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14823867  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14823868 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14823929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 266
Target Start/End: Original strand, 21255024 - 21255272
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21255024 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21255123  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21255124 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 21255222  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 266  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255223 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13597937 - 13597550
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  13597937 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccagtcgctaatttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 13597838  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaa 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  13597837 ccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaa 13597738  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    | ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||||| |||||||||||     
T  13597737 cgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 13597639  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 402  Q
    || |||||  ||||||||| ||||||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13597638 aacgcaagtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 13597550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 266
Target Start/End: Original strand, 21249186 - 21249434
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21249186 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21249285  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21249286 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcggcctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 21249384  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 266  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249385 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13508403 - 13508018
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13508403 catcaagcctctatcgttatttgagtattactatact-ccagggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 13508305  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 217  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13508304 cagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 13508205  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  13508204 gtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgc-acaacatcatgatataataatatcga 13508106  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 402  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13508105 acgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 13508018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 17140715 - 17141019
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctattt-gagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  17140715 catcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaa 17140814  T
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17140815 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tactaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 17140913  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||  || |||||||||||||||    
T  17140914 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataata 17141012  T
Q  313 tcaaatg 319  Q
    || ||||    
T  17141013 tcgaatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 4483207 - 4483436
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4483207 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 4483305  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  4483306 actcatgcagcttagtt-aataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 4483403  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4483404 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 4483436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21779096 - 21778697
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21779096 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21778997  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21778996 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttgga 21778898  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21396296 - 21395885
Alignment:
Q  23 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21396296 aagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 21396197  T
Q  121 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttggaactt 219  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  21396196 gggcataaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacat 21396098  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21396097 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaat 21396001  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
     |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||    
T  21396000 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21395902  T
Q  417 agattataattaacttc 433  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21395901 agattacaattaacttc 21395885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21790789 - 21790378
Alignment:
Q  23 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21790789 aagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 21790690  T
Q  121 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttggaactt 219  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  21790689 gggcataaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacat 21790591  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21790590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaat 21790494  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
     |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||    
T  21790493 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21790395  T
Q  417 agattataattaacttc 433  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21790394 agattacaattaacttc 21790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 21490796 - 21491092
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21490796 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccacaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21490895  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  21490896 ccagggcatcaagcccccaacaacgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaattcaataatttgga 21490994  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16199913 - 16199546
Alignment:
Q  70 cccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacct 167  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16199913 cccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacct 16199815  T
Q  168 cttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 266  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199814 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 16199715  T
Q  267 c-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcg 365  Q
    | |||||||||| |  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||  || | |||||| |  ||||||   ||   |||||||||||     
T  16199714 caaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgca 16199617  T
Q  366 tataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    || | | | ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16199616 taaacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcat 16199546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25484524 - 25484281
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25484524 gcatcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttagaacttcat 25484427  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25484426 catcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25484335  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  25484334 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 25484281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16413547 - 16413322
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |  |||| ||| ||| ||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||    
T  16413547 aatgctaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaattaaatgacctcttaaatagtccaataatttggaac------atcttaatcaacttagaccg 16413454  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  16413453 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16413355  T
Q  344 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16413354 cacatataattcaagtaatgcatatataattat 16413322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17612332 - 17612018
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttgg 214  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  17612332 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttataatagtccaataatttgg 17612233  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  17612232 aacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatat 17612134  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagct 412  Q
    |  | | |||  ||||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||  || ||| || ||||||||| |||| |||| |||||    
T  17612133 cgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca-cattataaacatcaaatcatcataaatcagct 17612035  T
Q  413 tcacagattataattaa 429  Q
    |||||||| || |||||    
T  17612034 tcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Original strand, 26223841 - 26224037
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca---tcttcatcaacttaga 240  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||    
T  26223841 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcaacatcttaatcaacttaga 26223940  T
Q  241 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26223941 tcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19937192 - 19937065
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19937192 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa 19937095  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaag 323  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19937094 acagcatgacataataagatcaaatgcaag 19937065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38855474 - 38855246
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataat 210  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38855474 aaagctccagtgcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatata-tccaataat 38855378  T
Q  211 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 309  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |    
T  38855377 ttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataaca 38855279  T
Q  310 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  38855278 atatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 364
Target Start/End: Original strand, 32121654 - 32121880
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  32121654 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaactcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 32121753  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  32121754 agaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 32121853  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  32121854 aatattcaataatatctcaagtaatgc 32121880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Original strand, 6520267 - 6520486
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6520267 gctccagggcatcaagcccccgacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataattt 6520364  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6520365 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 6520463  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||| |||||||| || |||||||    
T  6520464 atcgaatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  335 tcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcata-atcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    |||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||| |||  ||| | |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070661
Alignment:
Q  232 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15070661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23761062 - 23760839
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   || |||||| || |||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23761062 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacaaaacatcttaa-caacttagaacaataacctcttatataagtccaataatttg 23760965  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| ||||    
T  23760964 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgatataacaata 23760869  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23760868 ttgaattcaaatcaacaacatctcaaatat 23760839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Original strand, 21285569 - 21285720
Alignment:
Q  186 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 283  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||    
T  21285569 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggca 21285665  T
Q  284 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21285666 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 21285720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26355919 - 26355699
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| ||| ||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  26355919 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaaccat-ttagaacaacaacctcttaaataagtccaataat 26355822  T
Q  211 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 309  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |    
T  26355821 ttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataaca 26355726  T
Q  310 atatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  26355725 atatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 26355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 22965608 - 22965707
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965608 gcatcaagccccaatcactgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcggcaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 22965706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 983622 - 983407
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattat-ataatccaataatttg 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  ||| ||||||||| || | || |||| |||| | ||||||||||||||    
T  983622 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgcgaatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctcttataaaaatccaataatttg 983525  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaa-aacaacatgacataataat 311  Q
    |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||   ||||| |||| |||    
T  983524 gaa---catcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaat 983430  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
     ||||||||||  ||||||||||    
T  983429 ctcaaatgcaattcaacaacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 21673608 - 21673830
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21673608 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 21673704  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  21673705 gaacatgatcatc---atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaata 21673800  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  21673801 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 16184537 - 16184682
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16184537 tatttgagtattaatattcttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccc 16184634  T
Q  135 caaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16184635 caacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 16184682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44385160 - 44384944
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||| | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  44385160 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctcaatcgttaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagg 44385062  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcg-acctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttc 220  Q
    ||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  44385061 gcat-gagcccccaacaaatgaatgctaatgcatggactcgaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatc 44384965  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  44384964 atcatcttcaacaacttagac 44384944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 397
Target Start/End: Original strand, 20498466 - 20498745
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || |  ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  20498466 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcag-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 20498563  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    |||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||  ||||  | ||||| |||| |||    
T  20498564 ggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaat 20498657  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 397  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  20498658 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 20498745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17354255 - 17353912
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  17354255 agcccccatcgttaattgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagg 17354157  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  |||||| |||||    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  17354156 gcat-gagcccctaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 17354061  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata-----atatc 314  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||  ||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 363  Q
    |||| ||||  | || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatg 17353912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18678256 - 18678075
Alignment:
Q  189 acctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagc 282  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||    
T  18678256 acctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggc 18678157  T
Q  283 agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||    
T  18678156 agattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 18678075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 19898900 - 19899056
Alignment:
Q  25 gcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19898900 gcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagcgaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 19898998  T
Q  124 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19898999 cat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 19899056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21169031 - 21168887
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21169031 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 21168934  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatg--aactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || |||  |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21168933 catatg-tatgctaatgcatggaaactcgatctcttaaaacatcttaa 21168887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23777133 - 23777000
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23777133 ttgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23777036  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23777035 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23777000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25363124 - 25363047
Alignment:
Q  353 ctcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    |||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363124 ctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 25363047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 181
Target Start/End: Original strand, 24755565 - 24755676
Alignment:
Q  70 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 168  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  24755565 cccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgta-tgctaatgcatggactcgatctc 24755662  T
Q  169 tt-aaacatcttaa 181  Q
    || |||||||||||    
T  24755663 ttaaaacatcttaa 24755676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 19982897 - 19983054
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  19982897 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctagtgctccatcgtgttgactactaagctccagg 19982995  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  19982996 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 19983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20466335 - 20466197
Alignment:
Q  43 gtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||     
T  20466335 gtattaatatactttcagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaa 20466238  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
       ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  20466237 tgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 20466197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116537
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatct 403  Q
    ||||||| || |||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  37116466 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct 37116537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14409787 - 14409721
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14409787 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 14409721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18678339 - 18678273
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  18678339 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttg 18678273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17267211 - 17266990
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||   || |||| |||||||| |||||||||||    
T  17267211 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataattt 17267114  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 310  Q
    |||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||| | ||||     ||||| |||| ||    
T  17267113 ggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaa 17267019  T
Q  311 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17267018 tatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 17266990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439423
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcaca 417  Q
    ||||||| || |||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  17439509 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 22965521 - 22965588
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22965521 catcaaggccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 22965588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 26223692 - 26223756
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  26223692 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 26223756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Original strand, 24353009 - 24353144
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  24353009 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 24353103  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  24353104 catgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaa 24353144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  378 acatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17612410 - 17612344
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17612410 catcaagcccccatcgctatttgagtatcaatatac-tccggagcatcaagcccctatcgctatttga 17612344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18678367 - 18678316
Alignment:
Q  35 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  18678367 ctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 18678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Original strand, 377132 - 377189
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  377132 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 377189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 4483144 - 4483205
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  4483144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 4483205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14409744 - 14409684
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  14409744 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 14409684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17612367 - 17612307
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  17612367 catcaagcccctatcgctatttgagtatcaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 17612307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25484652 - 25484588
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25484652 catcaagcccttatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 25484588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 26223778 - 26223839
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  26223778 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 26223839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 51716 - 52134
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51716 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 51815  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  51816 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaacaaaaacctcttatataatccaataatttggaaca 51915  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51916 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagcttcac 52115  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  52116 agattataattaacatcat 52134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 168297 - 167884
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  168297 catcaagcccccatcgctatttgagtattaaaatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 168198  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  168197 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 168099  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  168098 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 167999  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
     |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  167998 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttca 167899  T
Q  416 cagattataattaac 430  Q
     ||||||||||||||    
T  167898 aagattataattaac 167884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16893 - 16500
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16893 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggcttcagggcatcaagcctccaacaat 16796  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16795 gaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacatcatcatcttcatcaatttagac 16696  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  16695 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaagta 16596  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16595 tacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagactataattaacatcat 16500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 9508991 - 9509405
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9508991 catcatgcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagct 9509090  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509091 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaac 9509190  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  9509191 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaat 9509290  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaa--ttatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9509291 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 9509390  T
Q  416 cagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||    
T  9509391 cagattataattaac 9509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 117 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3564584 - 3564264
Alignment:
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3564584 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttagaa 3564485  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564484 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 3564385  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 414  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3564384 atgtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttc 3564285  T
Q  415 acagattataattaacttcat 435  Q
    | || ||||||||||| ||||    
T  3564284 ataggttataattaacatcat 3564264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 12698634 - 12699048
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12698634 catcaagccgccatcactatttgagtattaatatacttccaaggaatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 12698733  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12698734 caggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttagacatcttaattcaacaaccttttatataatccaataatttggaaca 12698833  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  12698834 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 12699033  T
Q  416 cagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||    
T  12699034 cagattataattaac 12699048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Original strand, 48273288 - 48273594
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48273288 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 48273387  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48273388 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 48273487  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48273488 aaatgcaagtcaacaacatctc-aatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagctt 48273578  T
Q  414 cacagattataattaa 429  Q
    |||||||||| |||||    
T  48273579 cacagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 115 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18456634 - 18456319
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456634 gctccagggcatcaagcccctaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18456535  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456534 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 18456436  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18456435 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 18456336  T
Q  413 tcacagattataattaa 429  Q
    |||||||||||||||||    
T  18456335 tcacagattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 10588838 - 10589259
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  10588838 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 10588937  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaa--tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10588938 ccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 10589037  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589038 aacatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    || |||||  |||||||||||  ||| | ||   ||   ||||| ||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcataaacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  414 cacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcat 10589259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 430
Target Start/End: Original strand, 26211804 - 26212212
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaa-cccccatcgctatt-tgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggc 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||    
T  26211804 ccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggcccccatcgctaatctgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggc 26211903  T
Q  125 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatc 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26211904 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 26212002  T
Q  224 at-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26212003 attcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 26212102  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagat 420  Q
      ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26212103 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagat 26212202  T
Q  421 tataattaac 430  Q
    ||||||||||    
T  26212203 tataattaac 26212212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 435
Target Start/End: Original strand, 38227344 - 38227701
Alignment:
Q  80 tatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctt 179  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227344 tatttgagctatagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaattctaatgcatggactcgacctcttaaacatctt 38227443  T
Q  180 aaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 278  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38227444 aatttgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacat 38227543  T
Q  279 aagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg--cgtataaaattat 376  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| |||||  | ||| |   |||    
T  38227544 aggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatat 38227642  T
Q  377 cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38227643 cacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatcttcacatattataattaacatcat 38227701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 11972393 - 11972652
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972393 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 11972491  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972492 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 11972590  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  11972591 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 11972652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14949387 - 14949128
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949387 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 14949289  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14949288 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14949190  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14949189 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14949128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 32125388 - 32125647
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32125486  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125487 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32125585  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32125586 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32125647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 41522814 - 41523073
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41522814 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 41522912  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41522913 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41523011  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41523012 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41523073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 41525276 - 41525535
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 41525374  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525375 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41525473  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41525474 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41525535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 44116405 - 44116665
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44116405 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44116504  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116505 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 44116603  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  44116604 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattat 44116665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15144350 - 15143948
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  15144350 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaaatcctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 15144254  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 216  Q
    || |||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15144253 cagggcatctagcccccatcgctatgaaatactaatgcatgaactcgacatcttaaacctctttaaacaacaacctcttatataatccaataatttggaa 15144154  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||| || || || ||||||||||    
T  15144153 catcatcatc----tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-tctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaa 15144059  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagctt 413  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15144058 atgcaagccaacaacatctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagctt 15143959  T
Q  414 cacagattata 424  Q
     ||||||||||    
T  15143958 gacagattata 15143948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15376978 - 15376719
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376978 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 15376880  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15376879 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15376781  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15376780 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15376719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21189860 - 21189601
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189860 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21189762  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21189761 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21189663  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21189662 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21189601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 24702135 - 24702394
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702135 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24702233  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702234 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 24702332  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24702333 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24702394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 456218 - 456477
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456218 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 456316  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  456317 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 456415  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  456416 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 456477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 16232417 - 16232676
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232417 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16232515  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232516 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16232614  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16232615 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16232676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 16409956 - 16410215
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16409956 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacgtcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16410054  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16410055 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16410153  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  16410154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattat 16410215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20385388 - 20385129
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20385290  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20385289 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20385191  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20385190 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20385129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11393552 - 11393293
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11393552 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 11393454  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11393453 aactccatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 11393355  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  11393354 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 11393293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 27216757 - 27217016
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27216757 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 27216855  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27216856 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27216954  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27216955 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 27217016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 24704585 - 24704841
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24704585 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24704683  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24704684 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaa---gacataataatatc 24704779  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24704780 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24704841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 18640176 - 18640428
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18640176 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaactcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttggaccttca 18640274  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640275 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18640373  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18640374 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18640428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16386529 - 16386152
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16386529 cagggcatcaagcccccatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtaaaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 16386431  T
Q  156 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc 254  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16386430 tggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagc 16386331  T
Q  255 ttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataac 353  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| || |   || |||||||| |||||| ||  ||   |    
T  16386330 ttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattc 16386231  T
Q  354 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||||| || || ||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16386230 tcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattatagttaac 16386152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 20110452 - 20110702
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20110452 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20110551  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20110552 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatc 20110640  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20110641 aaatgcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20110702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 3386239 - 3386489
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386239 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatgaactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 3386336  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3386337 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaa 3386435  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  3386436 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattat 3386489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 14258062 - 14258286
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14258062 catcaagcccccatcgataattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 14258161  T
Q  119 caaggcatcaagccccc-aacaa-tgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 216  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14258162 cagggcatcatgccccccaacaaatgaaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 14258261  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14258262 catcatcatcttcatcaacttagac 14258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 34200585 - 34200889
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctattt-gagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaag 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||    
T  34200585 catcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccaaggcatcaaaccctcatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaag 34200684  T
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttg 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34200685 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 34200783  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  34200784 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataata 34200882  T
Q  313 tcaaatg 319  Q
    || ||||    
T  34200883 tcgaatg 34200889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11996347 - 11996051
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  11996347 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 11996248  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11996247 ccagagcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 11996149  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 117 - 376
Target Start/End: Original strand, 13647225 - 13647485
Alignment:
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13647225 tccaaggcattaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 13647323  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13647324 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13647485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Original strand, 13869250 - 13869449
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869250 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 13869349  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13869350 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 13869448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38898635 - 38898382
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38898635 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcac 38898536  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  323 gacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattat 38898382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10064136 - 10063813
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  10064136 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttc-agggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 10064038  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 217  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  10064037 cagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttcattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 10063938  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
     ||| || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | || |||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  10063937 atcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatcga 10063839  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |  ||||  |||||||||||||||||    
T  10063838 acacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 13032560 - 13032744
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13032560 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccattgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagct 13032659  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataat 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13032660 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataat 13032744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 123 - 338
Target Start/End: Original strand, 13831279 - 13831491
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831279 gcatcaagcctccaaccaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 13831376  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13831377 catcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacac-ggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaa 13831475  T
Q  323 gacaacaacatctcaa 338  Q
    | ||||||| ||||||    
T  13831476 gtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28505604 - 28505321
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  28505604 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 28505505  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||              ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28505504 tccagggca--------------atgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 28505420  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17062173 - 17061866
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  17062173 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggatt-gacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgaaacttca 17062075  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17062074 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactc-agcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaatgc 17061977  T
Q  321 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 417  Q
    ||| || |||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  17061976 aagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 17061878  T
Q  418 gattataattaa 429  Q
    ||| || |||||    
T  17061877 gatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 18430687 - 18430868
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18430687 ttatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaa 18430785  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18430786 acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18430868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 117 - 435
Target Start/End: Original strand, 40443292 - 40443610
Alignment:
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  40443292 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaaccttttatattagtccaataatttgga 40443390  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40443391 atatcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatc 40443488  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    || | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||    
T  40443489 aatttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 40443588  T
Q  414 cacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  40443589 cacagattataattaacctcat 40443610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27848109 - 27847739
Alignment:
Q  60 gggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27848109 gggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagcttcagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatg 27848011  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27848010 gactcgacctcttaaacaacttaattcggcaacctcttatactagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagctt 27847911  T
Q  257 agttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 355  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||| |||   ||||  |||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||    
T  27847910 agttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttc 27847814  T
Q  356 aagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27847813 aagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagttaa 27847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 16213659 - 16213840
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16213659 ttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 16213757  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16213758 acaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 16213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26356255 - 26355989
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26356255 ggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 26356157  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------agcagtatacaaaaacaacatgacataat 308  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  309 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26355989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26358707 - 26358441
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26358707 ggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 26358609  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------agcagtatacaaaaacaacatgacataat 308  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  309 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26358441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 369
Target Start/End: Original strand, 24275089 - 24275320
Alignment:
Q  143 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca------tcttcatcaact 236  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||| |||||||    
T  24275089 aaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacgtcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaact 24275188  T
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24275189 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 24275287  T
Q  337 aaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 369  Q
    || ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  24275288 aattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 16579377 - 16579515
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16579377 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 16579476  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579477 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16579515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16586286 - 16586148
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16586286 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 16586187  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586186 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16586148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2280339 - 2280033
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  2280339 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 2280242  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  2280241 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataat 2280145  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aac 408  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2280144 atcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataac 2280045  T
Q  409 agcttcacagat 420  Q
    ||||||||||||    
T  2280044 agcttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18155152 - 18154810
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18155152 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 18155054  T
Q  124 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca- 221  Q
    |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||||     
T  18155053 cat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-tcaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 18154959  T
Q  222 --tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 314  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||     |||| ||||||  |||||    
T  18154958 cttcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 18154859  T
Q  315 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||  || |||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  18154858 aaat--aaaacaagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 18154810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15755120 - 15754955
Alignment:
Q  105 tgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||| |||    
T  15755120 tgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaat 15755022  T
Q  203 ccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15755021 ccaattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15082147 - 15082017
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15082147 gctccagggcatcaagccccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttgg 15082048  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactca 248  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  15082047 aactt---catcttaatcaacttagaccgactca 15082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 319
Target Start/End: Original strand, 16495329 - 16495505
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16495329 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 16495428  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16495429 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Original strand, 67651 - 67867
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataatttggaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  67651 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacat 67748  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  67749 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 67847  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  67848 gcaaatcaacaacatctcaa 67867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19486937 - 19486649
Alignment:
Q  145 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||    
T  19486937 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 19486838  T
Q  244 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||     
T  19486837 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 19486739  T
Q  343 acattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
     ||   |||| |||||| |||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19486738 tcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16461350 - 16461233
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16461350 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgttttgagtacaaagctc 16461251  T
Q  119 caaggcatcaagccccca 136  Q
    || |||||||||||||||    
T  16461250 cagggcatcaagccccca 16461233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 18005550 - 18005772
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  18005550 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatgaacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataattcg 18005646  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| || ||||| |||| ||||    
T  18005647 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaata 18005742  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18005743 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19649801 - 19649458
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19649801 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19649703  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  19649702 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaatatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 19649607  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 314  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |  |||  ||||| ||||     |||| |||||| ||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacatcacataacaatatc 19649507  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    ||||  || ||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  19649506 aaat-aaaaacagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 19649458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12756847 - 12756622
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12756847 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaaca 12756754  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||   | || ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  12756753 tgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 12756655  T
Q  398 acatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
     |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  12756654 tcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Original strand, 22072882 - 22073037
Alignment:
Q  186 acaacctattatata-atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 283  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  22072882 acaacctcttatatatatccaatagtttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 22072981  T
Q  284 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22072982 ctatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 22073037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Original strand, 24054270 - 24054421
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  24054270 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatctctatttgagctaaagctccatcgcgttgagtacaaagctccaggg 24054368  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 177  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24054369 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatcacttaaacatc 24054421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 811343 - 811145
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  811343 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacat 811246  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  811245 catcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Original strand, 47831712 - 47831860
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctatta-tata-atccaataatttggaact 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||     
T  47831712 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaaca 47831809  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831810 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 47831860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16219928 - 16219719
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  16219928 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtcgaataatttggaacatc 16219831  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16219830 atcatcttca---acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16219735  T
Q  320 caagacaacaacatct 335  Q
    |||| || ||||||||    
T  16219734 caagtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16461455 - 16461338
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  16461455 catcaagcccccaacgctatttgagtactaatatactttcagggcatcaagccctcatcgctaattgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctc 16461356  T
Q  119 caaggcatcaagccccca 136  Q
    || |||||||||||||||    
T  16461355 cagggcatcaagccccca 16461338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 44014082 - 44014301
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  44014082 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 44014178  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  44014179 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 44014274  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||   | |||||||||||||||    
T  44014275 tcgaatgcaa---atcaacatctcaaatat 44014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15755271 - 15755152
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||   ||||||||| |    
T  15755271 catcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggcgagtacaaacc 15755172  T
Q  117 tccaaggcatcaagccccca 136  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15755171 tccaaggcatcaagccccca 15755152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 339
Target Start/End: Original strand, 16056239 - 16056450
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  16056239 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaac-- 16056334  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16056335 -atcttctt--tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaat 16056429  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  16056430 gcaaatcaacaacatctcaaa 16056450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 9703067 - 9703215
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  9703067 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 9703165  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9703166 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 9703215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16461245 - 16461166
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctcca 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16461245 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctcca 16461166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Original strand, 18427436 - 18427510
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18427436 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat 18427510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867901
Alignment:
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| |||||||   |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  329 aacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 426  Q
    ||||||||||| || |||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatcat 1867904  T
Q  427 taa 429  Q
    |||    
T  1867903 taa 1867901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 16213550 - 16213632
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16213550 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaatgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatc 16213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15008631 - 15008404
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | |||||| |||| |       
T  15008631 aatccaataatttggaacatcat--tcttcatc---ttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagtt 15008537  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  15008536 catgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatca 15008439  T
Q  396 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15008438 aatcatcttataacagcttcacagattatcattaa 15008404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 15211271 - 15211557
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15211271 tatttgaatattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccc 15211368  T
Q  135 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttca- 230  Q
    ||||  |||  ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  ||     
T  15211369 caacttatg-tatgctaatgcatggactctaactcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcaacat 15211465  T
Q  231 ------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
          ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15211466 cttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatca 15211557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3564621 - 3564565
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3564621 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 3564565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32216861 - 32216704
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || || || ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  32216861 agcccccatcgctatttgagtattaaaatattttcaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttaagtactaagctccagg 32216763  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  32216762 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 32216704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 40443255 - 40443311
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40443255 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 40443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17138361 - 17138120
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  17138361 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 17138264  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 230  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  17138263 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 17138167  T
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  17138166 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 17138120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 13869165 - 13869231
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13869165 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 13869231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 16213443 - 16213510
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16213443 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16213510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38898720 - 38898654
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  38898720 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 38898654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932749
Alignment:
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  320 caa 322  Q
    |||    
T  14932751 caa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356184
Alignment:
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  320 caa 322  Q
    |||    
T  15356186 caa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360298
Alignment:
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  320 caa 322  Q
    |||    
T  15360300 caa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901443
Alignment:
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||| ||| |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  329 aacatc 334  Q
    ||||||    
T  12901438 aacatc 12901443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16461174 - 16461129
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461174 aaagctccagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16461129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Original strand, 12186835 - 12187076
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  12186835 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctctagggcat-gagcccc 12186932  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 230  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  12186933 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 12187029  T
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  12187030 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 13647144 - 13647211
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  13647144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaattgctatttga 13647211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 16495178 - 16495245
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495178 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16495245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 14044735 - 14044792
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 262  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044735 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14044792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 14354765 - 14354822
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 262  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354765 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14354822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Original strand, 14429758 - 14429825
Alignment:
Q  93 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14429758 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaatg-tatgctaatgcatggactc 14429825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 13647100 - 13647167
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13647100 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccaaagcatcaagccccaatcgctatttga 13647167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16402755 - 16402712
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccaggg 62  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16402755 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccaggg 16402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 16495222 - 16495289
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495222 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 16495289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2832580 - 2832504
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2832580 aatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 2832504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 3386154 - 3386218
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3386154 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 3386218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 13831194 - 13831258
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  13831194 catcaagcccctatcgctatttgaatattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 13831258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 13869208 - 13869268
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13869208 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 13869268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 16213487 - 16213548
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16213487 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 16213548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 16495266 - 16495327
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16495266 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 16495327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 277
Target Start/End: Original strand, 18203801 - 18203873
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18203801 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaaca 18203873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 13015 - 13432
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13015 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 13114  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13115 cagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 13213  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13214 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 13413  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  13414 aaattataattaacatcat 13432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 39716 - 40133
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39716 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagctcccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 39815  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39816 cagggcatcaagtccccaacaatgaaatgctaatgcatggacccgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 39915  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39916 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 40014  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||    | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40015 gcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagcttcac 40114  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40115 agattataattaacatcat 40133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20017 - 19883
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |       
T  20017 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 19923  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19922 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19015 - 18870
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  19015 tattttagtattaatatactttcagggcataagacccc-atcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 18918  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  18917 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 18870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 52 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3475 - 3103
Alignment:
Q  52 tacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaa 151  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3475 tacttctagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaa 3376  T
Q  152 tgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaacttagaccgactc 247  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3375 tgcatggactcgacctcttaaatatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactc 3276  T
Q  248 atgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3275 atgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaagtatacatt 3176  T
Q  348 cataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacag 418  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3175 cataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8847 - 8438
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8847 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcactaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 8748  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8747 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 8648  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8647 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat---aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaatt 8552  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8551 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 8452  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  8451 agattataattaac 8438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 1654 - 2067
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1654 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcactgaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 1753  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1754 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 1853  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1854 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 2053  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  2054 agattataattaac 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 58 - 425
Target Start/End: Original strand, 15955 - 16323
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15955 cagggcatcaagcccccatcgctatttgaactaaagctccatcgttttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16054  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 257  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16055 gactcgacctcttaaacatcttaattcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 16154  T
Q  258 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaa 357  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16155 gttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaa 16254  T
Q  358 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataa 425  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16255 gtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatc--aacatcttaaaacagcttcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 33250 - 32864
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33250 agtattaatatacttccagggcatcaagctcttatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 33152  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151 gaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 33052  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  33051 cgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaata 32953  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    | |||| |||  || |||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32952 ttcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatc--agcatcataaaatagcttcacagattataactaac 32864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 430
Target Start/End: Original strand, 45755 - 46141
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45755 agtattaatatacttccagggcatcaagctcttatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 45853  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45854 gaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 45953  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  45954 cgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaata 46052  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    | |||| |||  || |||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46053 ttcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatc--agcatcataaaatagcttcacagattataactaac 46141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17623 - 17388
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17623 agtattaatatacttccagggcatcaagcccgtatcgctatt-gagctatagctccatcgtgttgagcacaaggctctagggcattaagcccccaacaat 17525  T
Q  142 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17524 gaaatgttaatgcatggactcaacctcttaaacattttagaacgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 17425  T
Q  242 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17424 cgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 3273 - 3686
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  3273 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacgtccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaatctc 3372  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3373 tagggcatctagcccccaaaaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 3472  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 3672  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||    
T  3673 agattataattaac 3686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 147 - 558
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  147 catcaagcccccatcactatttgagtattaatataattccagcgcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtgcaaagctc 246  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||     
T  247 cagggcatcaagcccccaacaaagaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgac-acctcttatatagtctaataatttggaaca 345  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |    
T  346 tcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaatt 444  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| |  | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  445 ggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 544  T
Q  417 agattataattaac 430  Q
    | ||||||||||||    
T  545 atattataattaac 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 58 - 426
Target Start/End: Original strand, 32783 - 33153
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32783 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 32882  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32883 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagctt 32982  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 356  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | |||  |||    
T  32983 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttca 33081  T
Q  357 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 426  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 33153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 38602 - 38981
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38602 cagggcatcaagcccccatcgatatttgcgctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 38701  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
     ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38702 gactagaactcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagctt 38801  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 356  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| || | |||  |||    
T  38802 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttca 38900  T
Q  357 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38901 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcat 38981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 9645 - 9867
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9645 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaaaaataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcctatataatccaataatttgg 9744  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9745 gacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 9843  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    || |||||| ||||||| ||||||    
T  9844 aagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 206
Target Start/End: Original strand, 32317 - 32465
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 32416  T
Q  158 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaa 206  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32417 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaa 32465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 435
Target Start/End: Original strand, 39331 - 39697
Alignment:
Q  70 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 169  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39331 cccccatcgctatttaggccaaagctcaatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctct 39429  T
Q  170 taaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 268  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39430 taaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 39529  T
Q  269 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtat 368  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  39530 acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 39628  T
Q  369 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39629 aacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 39697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Original strand, 37151 - 37204
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc 73  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37151 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 37204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 75481 - 75115
Alignment:
Q  70 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 169  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  75481 cccccatcgctatttaggccaaagctcaatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctct 75383  T
Q  170 taaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 268  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75382 taaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 75283  T
Q  269 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtat 368  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  75282 acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 75184  T
Q  369 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  75183 aacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 75115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 77661 - 77608
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc 73  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  77661 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 77608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 59 - 430
Target Start/End: Original strand, 25738 - 26111
Alignment:
Q  59 agggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatga 158  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25738 agggcatcaagcccccatcgttatttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatgg 25837  T
Q  159 actcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25838 actcgacctcttatacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagctta 25937  T
Q  258 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaa 357  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||  ||||    
T  25938 gttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaa 26036  T
Q  358 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26037 gtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacagattataattaac 26111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 95 - 430
Target Start/End: Original strand, 39736 - 40073
Alignment:
Q  95 tccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctat 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  39736 tccatcgtgttgagtacaaagctccagggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaaacttaattcgacaacctct 39835  T
Q  195 tatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  39836 tatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaa 39934  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaac 391  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  39935 atatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaac 40034  T
Q  392 atcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40035 atcaacgcatcttaaacagcttcacaaattataattaac 40073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 424
Target Start/End: Original strand, 4652 - 5059
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  4652 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgacctaaagctccaacgtggtgagtacaaaactc 4751  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaac 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  4752 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaaattaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaac 4850  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4851 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaa 4950  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
    |||||  ||||||||||| || ||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4951 tgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttca 5050  T
Q  416 cagattata 424  Q
    |||||||||    
T  5051 cagattata 5059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 363
Target Start/End: Original strand, 128554 - 128897
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  128554 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttcaagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 128653  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  128654 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 128753  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  128754 tcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaat 128852  T
Q  319 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 363  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || | |||  ||||||||||    
T  128853 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 128897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20330
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  20554 aatccaataagttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caaca 20462  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaac 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||  ||  |||   ||||||||| |    
T  20461 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaaacatcaaatc 20362  T
Q  400 atcttaaa-cagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  20361 atcataaatcagcttcacagatcatcattaac 20330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 66109 - 65958
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  66109 agcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagttcaaagctccaggg 66011  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 177  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66010 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc 65958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 8282 - 8696
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatt--tgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| |||| ||||||  ||  |||||||||||     
T  8282 catcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagtccccatcgctaatgttgagctaatgctccaatgtggtgagtacaaaga 8381  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8382 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 8479  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8480 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaa 8579  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 416  Q
     |||||| ||||||||||| ||| || ||    ||  |||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8580 ttgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta--acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagcttcac 8677  T
Q  417 agattataattaacttcat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  8678 agattgtaattaacatcat 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 115 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44929 - 44682
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44929 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 44830  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44829 aacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44730  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaat 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44729 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 223 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25965
Alignment:
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagat 420  Q
      ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  421 tataattaacttcat 435  Q
    |||||||||| ||||    
T  25979 tataattaacatcat 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33491 - 33395
Alignment:
Q  341 atacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33491 atacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcat 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Original strand, 20711 - 21127
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20711 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20810  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20811 ccaaggcatcaatcccccaacaatgaaatcctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 20910  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    | ||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20911 catcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatca 21010  T
Q  316 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    | |||||  ||||||||||| | |||| ||    |    |||||||||| || || ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21011 attgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagctt 21110  T
Q  414 cacagattataattaac 430  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21111 cacaggttataattaac 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 10118 - 10167
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 68  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10118 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 10167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 31869 - 32285
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  31869 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 31968  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31969 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 32067  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32068 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaa 32165  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
     | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||    
T  32166 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttca 32265  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32266 cagattataattaacctcat 32285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 86
Target Start/End: Original strand, 31864 - 31892
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31864 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 31892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6404 - 6021
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6404 cagggcatcaagcccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagcttcagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcat 6305  T
Q  157 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
      ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304 agactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatataatccaaaaatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 6205  T
Q  257 agttaaataacaacagcaacacaa---gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataac 353  Q
    ||||||||||||||| |||||  |   | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||       
T  6204 agttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattct 6105  T
Q  354 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6104 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacattttataattaacatcat 6021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5150 - 4893
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5150 catcaagcccccatcgctatt-gagcattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctagttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 5052  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5051 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 4952  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4951 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 881
Alignment:
Q  293 aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaa 390  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| ||||| |    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcga 908  T
Q  391 catcaaaacatcttaaacagcttcaca 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  907 catcaacacatcttaaacagcttcaca 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 28215 - 28533
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||| | || ||||| ||||| ||||| | |  |||||||||||||    
T  28215 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggctttaagcccccattgttaatttgagctaaacctccaacatggtgagtacaaagct 28314  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  28315 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaatagtttggaa 28414  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28415 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 28514  T
Q  317 atgcaagacaacaacatct 335  Q
     |||||  |||||||||||    
T  28515 ttgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 4353 - 4605
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||   |||||||||||||    
T  4353 catcaagccccaatcgatatttgagtattattatacttcaaaggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgaggtgagtacaaagct 4452  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4453 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctctaaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 4551  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 1798 - 2050
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  1798 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttctagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 1897  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1898 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttgga 1996  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 319
Target Start/End: Original strand, 11252 - 11395
Alignment:
Q  177 cttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagca 274  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11252 cttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagca 11351  T
Q  275 acacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11352 acataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 4514 - 4932
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  4514 catcaagcccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 4613  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa- 216  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4614 ccagggcatcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaa 4712  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||    
T  4713 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaa 4812  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 415  Q
     |||||  || ||| |||| |  ||||||   ||   |||||||| || || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||    
T  4813 ttgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttca 4912  T
Q  416 cagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  4913 cagattatacttaacctcat 4932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 95 - 156
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  95 tatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcat 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 13297 - 13716
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  13297 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 13396  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13397 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgg 13495  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13496 aacatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatc 13594  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    || | | |  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||    
T  13595 aatttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  414 cacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  13695 cacagattataattaacctcat 13716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 76 - 329
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  76 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatctctaattgagctaaagctccaacgcattaagtacaaagctc 175  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  176 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 275  T
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  276 tcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 33924 - 34199
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||     
T  33924 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagt 34023  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34024 tgcagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 34122  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaa 291  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 430
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13308
Alignment:
Q  268 aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgta 367  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  368 taaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaac 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 86
Target Start/End: Original strand, 33919 - 33947
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33919 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 33947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 423
Target Start/End: Original strand, 1751 - 2161
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta----tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 114  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  1751 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaa 1850  T
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1851 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttg 1949  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1950 gaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatat 2049  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 411  Q
    ||| |||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||| | ||| || |||||    
T  2050 caattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagc 2149  T
Q  412 ttcacagattat 423  Q
    || ||| |||||    
T  2150 tttacatattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 20644 - 20903
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20644 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20742  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20743 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20841  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20842 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 13)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 94308 - 94567
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94308 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 94406  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94407 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 94505  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  94506 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 94567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 44351 - 44611
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44351 gctccagggcatcaagtccccaacaattaaaagctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttg 44449  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatac-aaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44450 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 44548  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44549 caaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattat 44611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Original strand, 119677 - 119947
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||| ||||    
T  119677 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagagct 119776  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 216  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  119777 ccagggcatcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 119875  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtat 287  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  119876 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17446
Alignment:
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 100278 - 100500
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  100278 gctccagggcatcaagctcccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaaaaacaacctcttatata-tccaataatttg 100374  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  100375 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataata 100470  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  100471 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 100500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40391 - 40169
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  40391 gctccacggcatcaagtccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaccaacaacctcttata-agtccaataatttg 40295  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  | ||| || ||||| |||| ||||    
T  40294 gaacatcatcatc---atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaata 40199  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40198 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Original strand, 101404 - 101552
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | ||||||||||| |    
T  101404 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttag 101500  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  101501 aacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaa 101552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38777 - 38542
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  38777 ttgagtattaatatacttctagggcat-aagcccccattgctaatttgagctaatgctcaatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 38680  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatc 232  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  38679 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttata-aatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 38584  T
Q  233 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38583 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagca 38542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17953 - 17886
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17953 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 17886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17842
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17909 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 17842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17984 - 17930
Alignment:
Q  32 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17984 tcgctatttgagtattattatacttctagagcatcaagccccaatcgctatttga 17930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17802 - 17765
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 181  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17802 aatgctaatgcacggactcgacctcttaaacatcttaa 17765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17865 - 17804
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  17865 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcattaagccccaatcgct 17804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1304 - 954
Alignment:
Q  81 atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 180  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1304 atttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 1206  T
Q  181 aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca 279  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1205 attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 1106  T
Q  280 agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatca 378  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || | | | |||||    
T  1105 ggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatca 1006  T
Q  379 catcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1005 catcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttcaaagattataattaac 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 362
Target Start/End: Original strand, 116332 - 116571
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatcc-aataatttggaacttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  116332 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaaatactttggaacttc 116431  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  116432 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgc 116529  T
Q  321 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaat 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  116530 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 129102 - 128967
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa- 297  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |  |||||||     
T  129102 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagtt-aataacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacaat 129010  T
Q  298 -catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  129009 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 128967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11763 - 11464
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  11763 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 11664  T
Q  118 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11663 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 11565  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 37718 - 37977
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37718 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 37816  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37817 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 37915  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  37916 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15784 - 15370
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  15784 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 15685  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15684 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactagacctcttaaaacaacttgattcgacaacctcttatattagtccaataatttgg 15586  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15585 aacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 15487  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    || | |||  || |||||||| |  |||| |   ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||    
T  15486 aatttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  414 cacagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaac 15370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7352
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||      
T  7112 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaa-cccaa 7209  T
Q  136 aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcat 231  Q
    |||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| ||    
T  7210 aacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaat 7306  T
Q  232 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    || |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7307 catcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 136577 - 136836
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136577 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 136675  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  136676 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 136774  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  136775 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 136836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 139046 - 139305
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  139046 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 139144  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  139145 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 139243  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  139244 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 139305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 143984 - 144243
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  143984 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 144082  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  144083 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 144181  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  144182 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 144243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 134108 - 134367
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  134108 gctccacggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 134206  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  134207 aacttcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 134305  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  134306 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 134367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 141515 - 141774
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141515 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 141613  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  141614 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 141712  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  141713 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 141774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 319
Target Start/End: Original strand, 132563 - 132762
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  132563 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 132659  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| | || |||||    
T  132660 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatat 132756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 342
Target Start/End: Original strand, 62201 - 62321
Alignment:
Q  219 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 317  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  62201 tcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaa 62299  T
Q  318 tgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  62300 tgc---acaacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10744 - 10331
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  10744 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 10645  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10644 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 10546  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  10545 aacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataataatat 10449  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgt-ataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    ||| | |||  ||||||||||| || ||||||   ||   ||||||||||| | || |   |||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||    
T  10448 caatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  413 tcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10348 tcacagattataattaac 10331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Original strand, 13289 - 13547
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13289 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13387  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13388 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13486  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 375  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  13487 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 40297 - 40556
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40297 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 40395  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40396 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatc 40494  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   | || ||||||||||| |||| ||||||    
T  40495 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattat 40556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 13844 - 14103
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13844 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13942  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13943 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14041  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14042 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 277
Target Start/End: Original strand, 121607 - 121827
Alignment:
Q  58 cagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121607 cagggcatcaaacccccatcgctaaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 121706  T
Q  157 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 256  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121707 ggactcgacctcttaaacatattaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 121806  T
Q  257 agttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  121807 agttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 364
Target Start/End: Original strand, 174567 - 174912
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||  |||||  ||  ||||||||||||    
T  174567 catcaagccaccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaattctccaatgtggtgagtacaaagc 174666  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  174667 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgataacctcttaatttagtccaataatttgga 174765  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
     | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| |||||||| || |||||    
T  174766 gcatcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatc 174862  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 364  Q
    |||| |||  ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  174863 aaattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 174912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 430
Target Start/End: Original strand, 124723 - 124801
Alignment:
Q  354 tcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124723 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 124801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |||||| |||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  333 tc 334  Q
    ||    
T  136371 tc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |||||| |||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  333 tc 334  Q
    ||    
T  145079 tc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 4110 - 4371
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4110 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 4209  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4210 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacac-agcagtatacaaaaccagcatgacataataatatc 4308  T
Q  315 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  4309 aaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 4371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 11960 - 12214
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11960 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 12059  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12060 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta------aacagcaacac-agcagtatactaaaacagcatgacataataatatc 12152  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12153 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18345 - 17932
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  18345 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgttaattgagctaaacctccaacgtggtgagtacaaagctc 18247  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 217  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18246 cagggcatcaaccccccaacactgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 18147  T
Q  218 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 316  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  18146 atcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgc-acaacatcatgatataataatatcga 18048  T
Q  317 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagctt 413  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  18047 acgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagctt 17948  T
Q  414 cacagattataattaa 429  Q
    ||||||| || |||||    
T  17947 cacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2394 - 2088
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2394 ctccagggcataaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaaccgacaacctcttatataatccaataatttaga 2295  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2294 acttcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 2196  T
Q  316 aatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 411  Q
    |||||||| |||  ||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  2195 aatgcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 2097  T
Q  412 ttcacagat 420  Q
    |||||||||    
T  2096 ttcacagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2456 - 2406
Alignment:
Q  35 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2456 ctatttgagtattaatatact-ccagggcatcaagcccctatcgctatttga 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 194 - 435
Target Start/End: Original strand, 22861 - 23103
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22861 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-accagtatacaaaa 22959  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaac 391  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  22960 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaac 23059  T
Q  392 atcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23060 atcaacacatcttaaacagcttcacagattataaataacatcat 23103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 429
Target Start/End: Original strand, 16710 - 16995
Alignment:
Q  145 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16710 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaccaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 16809  T
Q  245 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||      
T  16810 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattt 16908  T
Q  345 attcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 429  Q
    |   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  16909 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 1090 - 1507
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  1090 catcaagccccgaccgctatttgagttttaatatacttccaggacatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 1189  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1190 tccagggcatgaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 1288  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 412  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  413 tcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcat 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 115 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15460 - 15298
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttgg 15361  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15360 aacttcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaaca 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 435
Target Start/End: Original strand, 7193 - 7484
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  7193 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 7292  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||    
T  7293 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgta 7389  T
Q  342 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7390 tacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcatagattatagttaacctcat 7484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 116 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 85845 - 85539
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85845 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgga 85746  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85745 acttcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 85647  T
Q  316 aatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 411  Q
    |||||||| ||| |||| ||| || ||| ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  85646 aatgcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 85548  T
Q  412 ttcacagat 420  Q
    |||||||||    
T  85547 ttcacagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 501003 - 501240
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca------tcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||| ||||||||    
T  501003 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaactt 501102  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  501103 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 501201  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  501202 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 501240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 342
Target Start/End: Original strand, 160594 - 160809
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataat-ccaataatttggaacttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||    
T  160594 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacgcaacctcttaa-caacttaaagcaacaacctcttaaataattccaataatttgggacatc 160691  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  160692 atcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  320 caagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |||  ||||||||| ||||||||    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 85915 - 85857
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  85915 ccccatcgctatttgagtattaatatact-ccagggcatcaagcccctatcgctatttga 85857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 500912 - 500963
Alignment:
Q  35 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  500912 ctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 500963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 85880 - 85820
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  85880 catcaagcccctatcgctatttgagcattaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 85820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5448 - 5132
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  5448 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 5349  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5348 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 5250  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | | |||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  5249 acgtcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatc 5153  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatct 335  Q
    |||| |||  || ||||||||    
T  5152 aaattcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 424
Target Start/End: Original strand, 46796 - 47202
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||   |||||||||||    
T  46796 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggggagtacaaagc 46895  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 215  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46896 tctagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttgaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 46994  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 314  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||    || |||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag---cagcatgacataataatatc 47091  T
Q  315 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 413  Q
    || | |||  || |||||||| |  ||||||   ||    |||||||||| || | | | ||||||||||||| || || ||| | |||||| |||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcataaacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagctt 47191  T
Q  414 cacagattata 424  Q
    |||||||||||    
T  47192 cacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Original strand, 31961 - 32188
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || |||  ||  ||||||||||||    
T  31961 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgccccaatgtggtgagtacaaagc 32060  T
Q  117 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32061 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 32160  T
Q  217 c-ttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32161 caatcatcatcttcatcaacttagaccg 32188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 12 - 262
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgccaatacatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataattgggaacttcat 109  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 208  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  209 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 376
Target Start/End: Original strand, 81978 - 82228
Alignment:
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac-ttcat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  81978 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaccttcat 82075  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  82076 catcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 82174  T
Q  323 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  82175 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 82228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22880 - 22665
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 220  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  22880 ggcatcaagcccccaa-aatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttggaacatc 22784  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22783 atcaccttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22688  T
Q  320 caagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  22687 caagtcatcaacatctcaaatat 22665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 16082 - 16500
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaag 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | || |||||| |||  |||||||||||    
T  16082 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaag 16181  T
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttgg 214  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||| | || || ||||||||||    
T  16182 ctccagggtatcaagcgcccaactatg-aatgctattgcatggactcgatctcttagacaacttaattcgacaacctcttacattagtctaataatttgg 16280  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||    
T  16281 aacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatat 16377  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 411  Q
    ||||| |||  || |||||| | |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||    
T  16378 caaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagc 16476  T
Q  412 ttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  16477 ttcacagattatagttaacctcat 16500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 27681 - 27913
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  27681 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgctatttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaggctc 27777  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-- 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27778 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaac 27877  T
Q  217 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgca 252  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 298 - 435
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28051
Alignment:
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  396 aaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    | | |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  28012 acaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcat 28051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 161355 - 161095
Alignment:
Q  116 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 215  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  161355 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgttaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaa 161256  T
Q  216 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  161255 acttcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacac-agcagtatacaaaaacataatgacataataatatca 161157  T
Q  316 aatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  161156 aatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattat 161095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  299 atgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  396 aaacatcttaaa-cagcttcacagat 420  Q
    || |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 161433 - 161367
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| || | ||||||||||||    
T  161433 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt-taggccatcaagcctctatcgctatttga 161367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 952
Alignment:
Q  55 ttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaat 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1333 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaat 1235  T
Q  153 gcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgc 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1234 gcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgc 1135  T
Q  252 agcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcat 350  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| | |||  || |||||||| |  ||||||   ||    
T  1134 agcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatcaatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatat 1038  T
Q  351 aactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
       ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1037 tcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagcttcacagattatagttaacctcat 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2722 - 2494
Alignment:
Q  17 gacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  2722 gacatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgttaattttgagctaatgctccaacgttgtgagtacaaa 2623  T
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttg 213  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2622 gctctagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 2524  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2523 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccg 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Original strand, 51397 - 51699
Alignment:
Q  34 gctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaag 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | || |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  51397 gctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcattaag 51496  T
Q  131 cccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttc 229  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  51497 cccccaactaagaa-tgctcatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattttc 51595  T
Q  230 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 328  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||||| |||  || |    
T  51596 aacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataacaaattcaattcatc 51692  T
Q  329 aacatct 335  Q
    |||||||    
T  51693 aacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38916 - 38663
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38916 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 38817  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38816 catcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 38718  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    || || ||| |||||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  38717 agtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattat 38663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39002 - 38936
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  39002 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccgtatcgctatttga 38936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 10692 - 10929
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt------catcatcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||| ||||||||    
T  10692 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 10791  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10792 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 10890  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  10891 attattcacatataatttaagtaatgcatatataattat 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 10455 - 10520
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10455 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 10520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 10585 - 10652
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10585 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 10652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 10629 - 10690
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  10629 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 10690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 4669 - 4850
Alignment:
Q  194 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4669 ttatataatccaataatttggaacctcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 4767  T
Q  294 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4768 acaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 9161 - 9398
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |      |||||| ||||||||    
T  9161 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacatcgttatcaacatcttaatcaactt 9260  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9261 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 9359  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  9360 attattcacatataatttaagtaatgcatatataattat 9398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 8924 - 8989
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 85  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8924 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 9054 - 9121
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||    
T  9054 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcattaagccccaatcgctatttga 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Original strand, 29856 - 30050
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca-tcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  29856 aatgctaatgcatggaatcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattgaacttagacc 29955  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  29956 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 3546 - 3703
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  3546 agcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 3644  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  3645 gcat-gagcccctaacatatg-tatactaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 3703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 7977 - 8134
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  7977 agcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 8075  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  8076 gcat-gagcccctaacatatg-tatactaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 29749 - 29816
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  29749 catcaagcccctatcggtatttgagtattattacacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 29816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 29793 - 29854
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  29793 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 29854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1537 - 1340
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  1537 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 1440  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1439 -catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9275 - 9123
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9275 agcccccatcgttaattgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 9177  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 177  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9176 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaacatc 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 430
Target Start/End: Original strand, 4343 - 4739
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagta--caaag-ctccaaggcatcaagcccccaac 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  4343 agtattaatatacttccagggcat-aagccctcatcgcaatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcaaacaaaggctccggggcatcaatcccccaac 4440  T
Q  139 aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaac--- 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||       
T  4441 aatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaa-caacaacctcgtatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacctc 4539  T
Q  236 ----ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaac 331  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||| ||| | || || || || ||||||||||||  ||  |||||||    
T  4540 ttatatagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaac 4639  T
Q  332 atctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataatta 428  Q
    |||| |||||| |||| |||  ||||||||||| ||  | ||  ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4640 atcttaaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatc--aacatcttaaaacagcctcacaaattataatta 4737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12492 - 12255
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||      || ||||||||    
T  12492 aatgctaatgcatgtactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggtacatcatcatcaacatcttaatcaactt 12393  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12392 agaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 12294  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||    ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12293 attattcacatttaattcaagtaatgcatatataattat 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12599 - 12532
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  12599 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagcctcaatcgctatttga 12532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 11207 - 11444
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      || ||||| ||    
T  11207 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaaatt 11306  T
Q  238 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11307 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 11405  T
Q  338 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  11406 attattcacatatgattcaagtaatgcatatataattat 11444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 12578 - 12723
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  12578 tatttgagtattagtatacttccagagcgt-aagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 12675  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  12676 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 12723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 11144 - 11205
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  11144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 319
Target Start/End: Original strand, 15570 - 15764
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15570 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatccatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 15667  T
Q  223 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  15668 catcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1292
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  1144 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcat-atgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaga 1242  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
     |||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1243 acat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatatcttaaa 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 276 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3591 - 3429
Alignment:
Q  276 cacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-- 373  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||      
T  3591 cacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacatta 3492  T
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3491 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcat 3429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 402
Target Start/End: Original strand, 11370 - 11652
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  11370 gcatcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 11469  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 320  Q
     |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | |     
T  11470 acatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgt 11568  T
Q  321 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 402  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11569 aagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 11652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 11240 - 11307
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  11240 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagctccaatcgctatttga 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38471 - 38189
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  38471 gcatcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 38372  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 320  Q
     |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | |     
T  38371 acatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgt 38273  T
Q  321 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 402  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38272 aagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 38189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38601 - 38534
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  38601 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagctccaatcgctatttga 38534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24206
Alignment:
Q  234 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataa-tcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 429  Q
    ||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  430 c 430  Q
    |    
T  24206 c 24206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35218 - 35074
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  35218 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagccccc 35121  T
Q  136 aaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  35120 aacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 35074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24440 - 24403
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttactt 56  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24440 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt 24403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 269
Target Start/End: Original strand, 36260 - 36503
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  36260 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctatttgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccaggg 36358  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  36359 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 36454  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36455 atcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Original strand, 3337 - 3539
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  3337 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatga-gcccccaa 3434  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 236  Q
    |||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3435 caaatgtatgctaatgcatggacttgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 3534  T
Q  237 tagac 241  Q
    |||||    
T  3535 tagac 3539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Original strand, 7401 - 7603
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  7401 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatga-gcccccaa 7498  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 236  Q
    |||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7499 caaatgtatgctaatgcatggactagacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 7598  T
Q  237 tagac 241  Q
    |||||    
T  7599 tagac 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27969 - 27663
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataa 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||    
T  27969 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataa 27872  T
Q  210 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 308  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | | ||||| | |||||| ||||| ||||     
T  27871 tttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataac 27778  T
Q  309 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta- 405  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||   |||| || |||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  27777 aatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttat 27678  T
Q  406 aacagcttcacagat 420  Q
    |||||||||||||||    
T  27677 aacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 3641 - 3695
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3641 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 7705 - 7759
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7705 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 7759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 376
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4453
Alignment:
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  322 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |  ||||||| |||||| ||  ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattat 4453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16320 - 16014
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataa 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || || ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16320 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataa 16223  T
Q  210 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 308  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  16222 tttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataac 16129  T
Q  309 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta- 405  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || | |  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  16128 aatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttat 16029  T
Q  406 aacagcttcacagat 420  Q
    |||||||||||||||    
T  16028 aacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 420
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  334 ctcaaa-tatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagat 420  Q
    || |||  || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 2650 - 2707
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 262  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2650 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1087
Alignment:
Q  144 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 242  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  1263 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 1164  T
Q  243 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  1163 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1347
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1414 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1303
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1370 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1265
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  1326 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Original strand, 116718 - 116835
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  116718 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 116817  T
Q  119 caaggcatcaagccccca 136  Q
    || |||||||||||||||    
T  116818 cagggcatcaagccccca 116835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 339
Target Start/End: Original strand, 32437 - 32658
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  32437 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 32534  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  32535 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaat 32631  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  32632 atcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 116823 - 116938
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  116823 catcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctt 116922  T
Q  119 caaggcatcaagcccc 134  Q
    || |||||||||||||    
T  116923 cagggcatcaagcccc 116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 116935 - 117044
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  116935 ccccatcgctatttaagtattaatatacttccagggcaacaagcccctatcgctaattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 117034  T
Q  127 caagccccca 136  Q
    ||||||||||    
T  117035 caagccccca 117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 139
Target Start/End: Original strand, 117025 - 117108
Alignment:
Q  56 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  117025 tccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaaca 117108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51833
Alignment:
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | |||| || |||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  333 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataa 386  Q
    |||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa 51833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 19166 - 19390
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19166 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataattt 19263  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19264 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 19359  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  19360 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48746 - 48661
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48746 tatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcccccatctttattttgagctaaagctccattgtggtgagtacaaagctccaa 48661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 69599 - 69848
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  69599 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 69697  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  69698 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 69793  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 69848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10762 - 10536
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  10762 aaagctccaaggcatcaagcccccaacgatgaa-tgcaaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataat 10665  T
Q  211 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 309  Q
    ||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |    
T  10664 ttggaacatcaccatcttca---acttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataaca 10569  T
Q  310 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10568 atatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6661
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  6436 gctccagggcatcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaaaaacaacctcttata-agtccaataatttg 6532  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  6533 gaacatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 6631  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  6632 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Original strand, 8370 - 8613
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataat-ccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8370 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaactactcaacc-tcttagaaacaacaacctcttatataaaaccaataattt 8467  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||    
T  8468 ggaat---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaat 8561  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 363  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  8562 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 10101 - 10247
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  10101 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcacta-ttgtgctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 10198  T
Q  119 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacct 167  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10199 cagggcatcaaggcccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10384
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcat 10384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 269
Target Start/End: Original strand, 19786 - 20029
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19786 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaaactccaggg 19884  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  19885 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-attatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 19980  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19981 atcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14916 - 14692
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaat-cgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14916 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttatattcaacaacctcttaaatatatccaataattt 14819  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||| ||||    
T  14818 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaat 14723  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  14722 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 23658 - 23897
Alignment:
Q  32 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  23658 tcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcactatt-gagctaaagctctatcgtgttgagtacaaagctccatggcat-gagc 23754  T
Q  132 ccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatctt 228  Q
    |||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |||||||||    
T  23755 ccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaacatcatctt 23851  T
Q  229 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23852 gatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3022 - 2801
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  3022 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 2926  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  2925 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 2830  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2829 caaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3283
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3324 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatg 3283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 1102
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1256 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataattt 1159  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6664
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6510 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 6607  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Original strand, 13890 - 14044
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  13890 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 13987  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Original strand, 7386 - 7482
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7386 agtattaatttacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 5547 - 5769
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||  ||||| | || || || | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5547 gctccagggcatcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcatataaacaacaacctcttata-aatccaataatttg 5643  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||| |||| ||||    
T  5644 gaacatgattatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaata 5739  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5740 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 139
Target Start/End: Original strand, 7486 - 7585
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7486 ttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgataattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46010 - 45791
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  46010 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 45913  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  45912 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 45817  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    || |||| ||| || |||||||||||    
T  45816 tcgaatgtaagtcatcaacatctcaa 45791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24101 - 23898
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24101 gctccagggcatcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttg 24004  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  24003 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 23908  T
Q  313 tcaaatgcaa 322  Q
    || |||||||    
T  23907 tcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2861 - 2640
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2861 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttaaaacaacaacctcttata-agtccaataatttgg 2765  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||   ||| || ||||  |||| |||||    
T  2764 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgttataacaatat 2669  T
Q  314 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
      |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2668 tgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 31 - 255
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||||    
T  31 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataatcaacaacctcttaagtatatccaataattt 128  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  129 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 224  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  225 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8129 - 7880
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8129 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 8031  T
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 219  Q
    ||||  ||||||||||||    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  8030 gcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 7935  T
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    ||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  7934 catcatcttgatcatctcatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 7880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15999 - 15845
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 212  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15999 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatagacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 15902  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15901 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 178705 - 178952
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  178705 agcccccatcgctaattgagtgttaatataccgccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcatgttaagtacaaagctccaggg 178802  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 220  Q
     || | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  178803 tatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 178898  T
Q  221 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  178899 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 178952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6259 - 6137
Alignment:
Q  201 atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||    
T  6259 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatca 6161  T
Q  300 tgacataataatatcaaatgcaag 323  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||    
T  6160 tgatataacaatatcgaatgcaag 6137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 339
Target Start/End: Original strand, 10426 - 10650
Alignment:
Q  112 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataa 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10426 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatccatggacacaacaacttaacc-tcttataaacaacaacctcttatatatatccaataa 10523  T
Q  210 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 308  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||     
T  10524 tttggaacat-atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataac 10619  T
Q  309 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  10620 aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 129808 - 130031
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||  | | ||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  129808 gctccagggcatcaagcctgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttggaacaacaacctcttaaataagtccattaatttg 129905  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  129906 gaacatcttcatc---atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 130001  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  130002 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 130031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 60848 - 60620
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| |       
T  60848 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagct 60754  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 395  Q
    ||||| |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  60753 catgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatca 60655  T
Q  396 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 429  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  60654 aatcattttataacagcttcacagattatcattaa 60620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 193277 - 192997
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  193277 tatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 193180  T
Q  135 caaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttca- 230  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  193179 caacatatg-tatgctaatgcatggactctaactgttaaagcatctt-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcttaat 193083  T
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatca 315  Q
    ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  193082 tcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatca 192997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Original strand, 945 - 1158
Alignment:
Q  123 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || || | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |    
T  945 gcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaa-caacatagatcaacaacctcttatataagtccaataatttggaac---a 1039  T
Q  222 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 320  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| |    
T  1040 tcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatac 1136  T
Q  321 aagacaacaacatctcaaatat 342  Q
     |  || |||||||||||||||    
T  1137 gaatcatcaacatctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 53681 - 53487
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  53681 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caac 53588  T
Q  299 atgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 396  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  53587 atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 319
Target Start/End: Original strand, 32003 - 32202
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  32003 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 32099  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 313  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  32100 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatat 32196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Original strand, 12665 - 12884
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa-atcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | |||||  | | ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  12665 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgataatgcatggacacaacaacttaa-cttcttattaacaacaacctcttatataagtccaatcattt 12762  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  12763 ggaacatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaat 12861  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||| |||||||| || |||||||    
T  12862 atcgaatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 5898 - 6056
Alignment:
Q  23 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 121  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  5898 aagcccccaacgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagctcccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccag 5996  T
Q  122 ggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5997 ggcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 341
Target Start/End: Original strand, 12472 - 12693
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||   || |||| |||||||| |||||||||||    
T  12472 gctccagggcatcaagcccccaacgat-aaatgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataattt 12569  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 311  Q
    |||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  12570 ggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaat 12663  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 341  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12664 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaata 12693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 20881 - 20957
Alignment:
Q  89 taaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgac 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20881 taaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaaggccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac 20957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16661 - 16513
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16661 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 16563  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 173  Q
    ||||  | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16562 gcat-gatcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 292
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6889
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6721 gctccatggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacctctt-aacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 6818  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||| |||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  6819 gaacatcatcat---------cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8138
Alignment:
Q  291 aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 339  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 8138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Original strand, 12842 - 13057
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12842 gctccagggcatgaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggaaacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttt 12939  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 312  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  12940 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaata 13035  T
Q  313 tcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  13036 tcgaatgcaagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 18056 - 18193
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || | ||||||||    
T  18056 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttcagtactaagctccagggtatga-gcccccaa 18153  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 177  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18154 caaatgtatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatc 18193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28986 - 28813
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | || || | |||||||||||||    
T  28986 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatctttta-agtccaataatttgg 28890  T
Q  215 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  28889 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 11952 - 12044
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11952 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtataccaaaacaac 12044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15976 - 15742
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||    
T  15976 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagttaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccgcaa 15879  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatcaa 234  Q
    |||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   ||||||||| ||||     
T  15878 caaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcat 15782  T
Q  235 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15781 cttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 15742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10830 - 10681
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  10830 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatta--atttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctaggg 10734  T
Q  124 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 177  Q
    |||  ||||||||||||    || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10733 cat-gagcccccaacaaatgtatcctaatgcatggactcgatctcttaaacatc 10681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18610
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  18767 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagg 18669  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18668 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 18610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 269
Target Start/End: Original strand, 984 - 1135
Alignment:
Q  111 caaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataa 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||  || || | ||||| |   |||| || |||||||| ||||||||    
T  984 caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggacacaacaactcaacc-tcttaga---acaatctcttatataaatccaataa 1078  T
Q  210 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 269  Q
    ||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1079 tttggaac---atcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 430
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6826
Alignment:
Q  281 gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatca 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||| || ||  |  |||||    
T  6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgttatatca 6774  T
Q  379 catcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6775 catcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataac 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 10299 - 10456
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  10299 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctcaagg 10397  T
Q  123 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    ||||  ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10398 gcat-gagcacccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 10456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8277 - 7997
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||   | || || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8277 gctccagggcatcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaagtcaa-caacttagatcaacaacctcttatataaatccaataatttg 8180  T
Q  214 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataat 311  Q
    |||| || || |  ||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||||||| ||||  |   ||||| ||||||||    
T  8179 gaacatcttctt--tcatca---tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataat 8085  T
Q  312 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 397  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||  |||| ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  8084 atcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaa 7997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8233 - 8118
Alignment:
Q  174 catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aaca 271  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  8233 catcttaaatcatcaacctcttaaataaatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaaca 8139  T
Q  272 gcaacacaagcagtatacaaa 292  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  8138 gcaacataggcagtatacaaa 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 103848 - 103632
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa-atcgacaacctattatataa-tccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| |||||||  | | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  103848 gctccatggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagcaacaacgacctcttatataaatccaataattt 103751  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataata 309  Q
    |||||   ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||| |||| |    
T  103750 ggaac---atcctctt--tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtata-aaaaacaattcatgatataaca 103657  T
Q  310 atatcaaatgcaagacaacaacatc 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  103656 atatcaaatgcaaaacaacaacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5104 - 4875
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  5104 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcatgttgagtactaagctttagggcat-aagcccccaa 5007  T
Q  138 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttggaactt---catcatcttcatc 232  Q
    ||     |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  5006 catatctatgctattgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 4909  T
Q  233 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 266  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  4908 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataa 4875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4952 - 4894
Alignment:
Q  42 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4952 agtattaatatacttccaggccatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatc 4894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 120
Target Start/End: Original strand, 466 - 547
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  466 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcca 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 1074 - 1128
Alignment:
Q  374 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1074 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataatta 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Original strand, 539 - 688
Alignment:
Q  90 aaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaa 189  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  |    
T  539 aaagctccattgtggtgagtacaaagctccagggcctga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atca 635  T
Q  190 cctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 241  Q
     || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  636 tctcttatattagtccaataatttggaacatcattatcttcaacaactaagac 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 20471 - 20529
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatc 77  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20471 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatc 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 14482 - 14624
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  14482 ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcccccttcgctaatttgagctaatgctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 14579  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14580 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 38922 - 39064
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  38922 ttgagtattaatatacttccagggtat-aagcccccttcgctaatttgagctaatgctgcatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 39019  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  39020 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 39064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 23498 - 23640
Alignment:
Q  39 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| || |||||   |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23498 ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcccccatcgataatttgagaaaaagctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23595  T
Q  138 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23596 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 23640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 277
Target Start/End: Original strand, 30235 - 30392
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatat-aatccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| || |  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  30235 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggacttgacgtctt--acaacttagaaacatcgacctcttatataaatccaataattt 30332  T
Q  213 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 277  Q
    ||||   || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  30333 ggaa---caacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaaca 30392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 418
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225611
Alignment:
Q  291 aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatc 388  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaat-caacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
Q  389 aacatcaaaacatctta-aacagcttcacag 418  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  225581 aacatcaaatcatcatatatcagcttcacag 225611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 225353 - 225455
Alignment:
Q  115 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatat-aatccaataattt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  | | ||| ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  225353 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcaacaac-tcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataattt 225450  T
Q  213 ggaac 217  Q
    |||||    
T  225451 ggaac 225455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 18
Alignment:
Q  27 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta 81  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  72 ccccatcgctatttgagttttaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcta 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22105 - 21866
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22105 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 22008  T
Q  135 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttc 229  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||     
T  22007 caacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatctta 21911  T
Q  230 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  21910 atcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 21866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29997 - 29758
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  29997 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 29900  T
Q  135 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttc 229  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||     
T  29899 caacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatctta 29803  T
Q  230 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 274  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  29802 atcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 29758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1842
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 133  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  1696 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-ctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 1793  T
Q  134 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 181  Q
    |||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  1794 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Original strand, 6506 - 6546
Alignment:
Q  122 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6506 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 6546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Original strand, 32251 - 32334
Alignment:
Q  24 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattga 107  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  32251 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttga 32334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 293
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25184
Alignment:
Q  231 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa 25184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 281196 - 281071
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  281196 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 281099  T
Q  135 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 162  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  281098 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 281071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 267649 - 267784
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 297  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |       
T  267649 aatcaaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagtt 267743  T
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  267744 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctcaa 267784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 322
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29660
Alignment:
Q  220 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 319  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  320 caa 322  Q
    |||    
T  29658 caa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1242
Alignment:
Q  19 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 68  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1193 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaa 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17892
Alignment:
Q  393 tcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 430  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1930 - 1874
Alignment:
Q  200 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1930 aatccaataatttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagtta 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Original strand, 6361 - 6418
Alignment:
Q  82 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6361 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 6418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 140
Target Start/End: Original strand, 2649 - 2752
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  2649 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcaagggcat-gagcccc 2746  T
Q  135 caacaa 140  Q
    ||||||    
T  2747 caacaa 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  237 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2257 - 2213
Alignment:
Q  298 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 342  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2257 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 4906 - 4870
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccc 72  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4906 tatttgagcattaatatacttccagggcatcaaaccc 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 14401 - 14433
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 68  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14401 tatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 14433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 12396 - 12428
Alignment:
Q  36 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 68  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12396 tatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 12428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13164
Alignment:
Q  304 ataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattat 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University