View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6875A_low_158 (Length: 263)

Name: NF6875A_low_158
Description: NF6875A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6875A_low_158
NF6875A_low_158
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (7-263)||(26877214-26877470)
chr2 (7-263)||(22320632-22320888)
chr2 (7-263)||(22326785-22327041)
chr2 (7-258)||(27216275-27216526)
chr2 (11-263)||(24913614-24913866)
chr2 (7-258)||(9340492-9340743)
chr2 (7-258)||(9489126-9489377)
chr2 (7-258)||(9608387-9608638)
chr2 (7-258)||(16986153-16986404)
chr2 (7-258)||(28431558-28431809)
chr2 (7-263)||(27617500-27617756)
chr2 (7-258)||(13306235-13306486)
chr2 (11-258)||(19489574-19489821)
chr2 (7-259)||(1843291-1843543)
chr2 (7-263)||(16997254-16997510)
chr2 (21-259)||(29233737-29233975)
chr2 (21-259)||(29347036-29347274)
chr2 (7-263)||(17003887-17004143)
chr2 (11-259)||(23171246-23171494)
chr2 (11-259)||(23582503-23582751)
chr2 (21-251)||(12829286-12829516)
chr2 (53-259)||(27599472-27599678)
chr2 (92-258)||(16922741-16922907)
chr2 (11-179)||(10101295-10101463)
chr2 (93-263)||(16928560-16928730)
chr2 (21-263)||(10866576-10866818)
chr2 (21-263)||(10873743-10873985)
chr2 (21-259)||(27197093-27197331)
chr2 (21-259)||(21138931-21139169)
chr2 (21-259)||(24503318-24503556)
chr2 (11-166)||(41604381-41604536)
chr2 (11-166)||(41610278-41610433)
chr2 (21-259)||(21146949-21147187)
chr2 (7-103)||(16980567-16980663)
chr2 (11-166)||(13970019-13970174)
chr2 (21-240)||(30970639-30970858)
chr2 (11-166)||(45057075-45057230)
chr2 (21-259)||(24640621-24640858)
chr2 (23-240)||(37318502-37318719)
chr2 (7-91)||(16928832-16928916)
chr2 (21-259)||(44387523-44387760)
chr2 (21-258)||(27369511-27369748)
chr2 (7-88)||(29282430-29282511)
chr2 (19-166)||(24715013-24715160)
chr2 (21-259)||(44380853-44381090)
chr2 (21-258)||(27376021-27376258)
chr2 (21-166)||(15477905-15478050)
chr2 (44-240)||(19645660-19645856)
chr2 (46-166)||(24872092-24872212)
chr2 (46-166)||(24879977-24880097)
chr2 (21-66)||(12901172-12901217)
chr2 (21-108)||(22737828-22737915)
chr2 (21-66)||(27602198-27602243)
chr2 (7-56)||(27603230-27603279)
chr2 (195-240)||(24880126-24880171)
chr2 (195-240)||(41604565-41604610)
chr2 (195-240)||(41610462-41610507)
chr2 (11-51)||(24649773-24649813)
chr2 (21-89)||(28291950-28292018)
chr2 (11-51)||(41530659-41530699)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (7-263)||(18164319-18164575)
chr7 (7-263)||(40523007-40523263)
chr7 (7-263)||(9510658-9510914)
chr7 (7-263)||(14330990-14331246)
chr7 (6-260)||(60321-60575)
chr7 (7-263)||(14337574-14337830)
chr7 (7-258)||(21891-22142)
chr7 (7-258)||(8201720-8201971)
chr7 (10-259)||(11366408-11366657)
chr7 (7-258)||(15022338-15022590)
chr7 (11-259)||(14655066-14655314)
chr7 (7-263)||(44786120-44786376)
chr7 (7-263)||(44792761-44793017)
chr7 (11-259)||(18176312-18176560)
chr7 (11-259)||(18182984-18183232)
chr7 (7-263)||(12703033-12703311)
chr7 (11-231)||(15155819-15156039)
chr7 (11-259)||(15162470-15162718)
chr7 (11-259)||(16406944-16407192)
chr7 (11-259)||(20702641-20702889)
chr7 (11-259)||(32767882-32768130)
chr7 (11-259)||(13684670-13684918)
chr7 (11-259)||(13691285-13691533)
chr7 (11-166)||(11238621-11238776)
chr7 (11-166)||(11231934-11232089)
chr7 (11-179)||(33395-33563)
chr7 (11-179)||(70415-70583)
chr7 (21-259)||(14953405-14953643)
chr7 (105-263)||(49051574-49051732)
chr7 (11-179)||(74523-74692)
chr7 (21-259)||(4318205-4318443)
chr7 (44-259)||(1347716-1347930)
chr7 (21-259)||(14148777-14149015)
chr7 (21-259)||(14959371-14959609)
chr7 (21-259)||(11262536-11262774)
chr7 (30-259)||(12692703-12692932)
chr7 (39-166)||(12704336-12704463)
chr7 (21-258)||(18584960-18585197)
chr7 (46-259)||(25038895-25039108)
chr7 (21-259)||(23519614-23519852)
chr7 (46-259)||(18531452-18531665)
chr7 (21-259)||(10875736-10875973)
chr7 (21-250)||(8706212-8706441)
chr7 (21-250)||(8719628-8719857)
chr7 (21-258)||(18553192-18553429)
chr7 (21-253)||(10869662-10869893)
chr7 (21-240)||(6016831-6017050)
chr7 (21-239)||(11547927-11548145)
chr7 (21-239)||(11554523-11554741)
chr7 (21-111)||(26420333-26420423)
chr7 (21-141)||(44408019-44408139)
chr7 (21-166)||(9410245-9410390)
chr7 (21-151)||(7536501-7536631)
chr7 (195-259)||(26420207-26420271)
chr7 (21-108)||(2831954-2832041)
chr7 (195-259)||(44408171-44408235)
chr7 (21-92)||(9751198-9751269)
chr7 (7-58)||(1245667-1245718)
chr7 (21-92)||(39267294-39267365)
chr7 (11-43)||(12702174-12702206)
chr7 (199-259)||(13570102-13570162)
chr7 (21-92)||(16385906-16385977)
chr7 (21-92)||(18302580-18302651)
chr7 (21-92)||(26212387-26212458)
chr7 (201-259)||(11232123-11232181)
chr7 (201-259)||(11238810-11238868)
chr7 (195-259)||(9410152-9410216)
chr7 (11-51)||(16114658-16114698)
chr7 (11-51)||(16117811-16117851)
chr7 (11-51)||(16906850-16906890)
chr7 (11-51)||(18279820-18279860)
chr7 (11-51)||(18283783-18283823)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (7-263)||(30731-30987)
scaffold0044 (7-263)||(72544-72800)
scaffold0044 (11-259)||(8267-8515)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (7-263)||(17669216-17669472)
chr8 (7-263)||(17675868-17676124)
chr8 (7-263)||(21915216-21915472)
chr8 (6-263)||(22084035-22084292)
chr8 (7-259)||(5534085-5534337)
chr8 (7-263)||(20019586-20019842)
chr8 (7-258)||(28454968-28455219)
chr8 (7-263)||(20013510-20013765)
chr8 (7-259)||(8354409-8354661)
chr8 (7-263)||(19111430-19111686)
chr8 (7-263)||(19117721-19117977)
chr8 (11-259)||(22123035-22123283)
chr8 (11-259)||(16882822-16883070)
chr8 (11-263)||(18865535-18865787)
chr8 (11-259)||(29123293-29123541)
chr8 (11-263)||(18855140-18855392)
chr8 (11-259)||(22115370-22115618)
chr8 (7-263)||(22048150-22048406)
chr8 (7-263)||(19496594-19496850)
chr8 (21-259)||(20527657-20527895)
chr8 (11-134)||(22122072-22122195)
chr8 (21-258)||(18065540-18065777)
chr8 (11-166)||(20023578-20023733)
chr8 (21-240)||(26934836-26935055)
chr8 (62-259)||(19905705-19905901)
chr8 (21-240)||(3216488-3216707)
chr8 (21-90)||(23845443-23845512)
chr8 (201-259)||(22124368-22124426)
chr8 (21-108)||(16199306-16199393)
chr8 (21-108)||(21491378-21491465)
chr8 (21-92)||(25362799-25362870)
chr8 (6-51)||(22112247-22112292)
chr8 (129-166)||(22124296-22124333)
chr8 (195-240)||(23845595-23845640)
chr8 (21-89)||(5865925-5865993)
chr8 (21-89)||(17141318-17141386)
chr8 (11-51)||(19277934-19277974)
chr8 (11-51)||(21972234-21972274)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (7-263)||(22062527-22062783)
chr5 (7-263)||(27663435-27663691)
chr5 (7-263)||(27670075-27670331)
chr5 (11-263)||(34294202-34294454)
chr5 (7-263)||(41097868-41098124)
chr5 (7-263)||(41776020-41776276)
chr5 (7-263)||(17706576-17706832)
chr5 (7-263)||(22265149-22265405)
chr5 (7-263)||(41769446-41769702)
chr5 (7-263)||(27615549-27615805)
chr5 (11-263)||(24471897-24472149)
chr5 (7-263)||(23584344-23584600)
chr5 (19-263)||(27608943-27609187)
chr5 (7-258)||(16355054-16355305)
chr5 (7-258)||(16361713-16361964)
chr5 (7-258)||(25106993-25107244)
chr5 (7-258)||(25166086-25166337)
chr5 (7-258)||(34565047-34565298)
chr5 (7-258)||(34571702-34571953)
chr5 (7-263)||(23610106-23610362)
chr5 (7-263)||(23841502-23841758)
chr5 (6-263)||(40707326-40707582)
chr5 (6-263)||(40713968-40714224)
chr5 (11-259)||(19992091-19992339)
chr5 (11-259)||(15001328-15001576)
chr5 (7-263)||(27516956-27517211)
chr5 (7-263)||(27523593-27523848)
chr5 (11-259)||(14994685-14994933)
chr5 (6-259)||(37293128-37293381)
chr5 (11-259)||(1692086-1692334)
chr5 (11-259)||(22327813-22328061)
chr5 (11-259)||(27686978-27687226)
chr5 (6-259)||(37286425-37286678)
chr5 (11-259)||(18038317-18038565)
chr5 (11-239)||(22334467-22334695)
chr5 (11-259)||(17284274-17284522)
chr5 (21-253)||(25406639-25406871)
chr5 (11-259)||(29477604-29477852)
chr5 (11-259)||(41294084-41294332)
chr5 (21-259)||(22133206-22133444)
chr5 (21-259)||(22139898-22140136)
chr5 (11-259)||(29471009-29471257)
chr5 (21-259)||(22588302-22588540)
chr5 (7-263)||(37544245-37544502)
chr5 (11-179)||(15236430-15236598)
chr5 (21-259)||(21294923-21295161)
chr5 (23-262)||(33726064-33726302)
chr5 (21-259)||(14359479-14359717)
chr5 (46-259)||(25535196-25535409)
chr5 (21-259)||(24554742-24554979)
chr5 (21-259)||(15441614-15441852)
chr5 (46-259)||(23336973-23337186)
chr5 (21-258)||(22410258-22410495)
chr5 (21-258)||(29316627-29316864)
chr5 (7-166)||(19775245-19775404)
chr5 (8-166)||(19768649-19768807)
chr5 (21-259)||(22258133-22258370)
chr5 (21-252)||(20776103-20776335)
chr5 (21-258)||(21667466-21667703)
chr5 (23-240)||(22325588-22325805)
chr5 (11-166)||(23250241-23250396)
chr5 (11-90)||(24020637-24020716)
chr5 (21-240)||(25808146-25808365)
chr5 (21-240)||(22343724-22343943)
chr5 (21-92)||(22119841-22119912)
chr5 (21-92)||(24766985-24767056)
chr5 (21-92)||(1096869-1096940)
chr5 (46-149)||(22353194-22353297)
chr5 (21-91)||(22107032-22107102)
chr5 (11-51)||(20296264-20296304)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (7-263)||(19779936-19780192)
chr4 (11-263)||(4772300-4772552)
chr4 (7-263)||(12475223-12475479)
chr4 (7-263)||(23954351-23954607)
chr4 (7-263)||(23961013-23961269)
chr4 (7-260)||(18024074-18024327)
chr4 (7-258)||(17961971-17962222)
chr4 (6-263)||(36884380-36884637)
chr4 (7-263)||(8048142-8048398)
chr4 (7-263)||(8054755-8055011)
chr4 (6-263)||(15362336-15362593)
chr4 (7-263)||(12481853-12482109)
chr4 (6-260)||(22194826-22195080)
chr4 (6-263)||(15383139-15383396)
chr4 (7-258)||(8385043-8385294)
chr4 (7-258)||(8391698-8391949)
chr4 (7-258)||(14074039-14074290)
chr4 (7-258)||(15256817-15257068)
chr4 (7-258)||(17808622-17808873)
chr4 (7-258)||(29040545-29040796)
chr4 (6-259)||(15148663-15148916)
chr4 (7-258)||(17089624-17089875)
chr4 (6-263)||(16231487-16231744)
chr4 (6-263)||(18295829-18296086)
chr4 (7-259)||(14298474-14298726)
chr4 (6-259)||(14305097-14305350)
chr4 (11-259)||(20115350-20115598)
chr4 (11-259)||(40471682-40471930)
chr4 (21-259)||(14268118-14268356)
chr4 (11-259)||(40478355-40478603)
chr4 (21-259)||(7900831-7901069)
chr4 (11-259)||(26284558-26284806)
chr4 (21-259)||(51493478-51493716)
chr4 (11-263)||(6873026-6873278)
chr4 (21-259)||(15321754-15321992)
chr4 (11-262)||(18071373-18071624)
chr4 (11-179)||(17810560-17810728)
chr4 (11-164)||(14757072-14757225)
chr4 (21-259)||(23838641-23838879)
chr4 (21-263)||(9271764-9272006)
chr4 (21-259)||(14679170-14679408)
chr4 (21-259)||(14685378-14685617)
chr4 (7-122)||(17991315-17991430)
chr4 (21-259)||(35170836-35171074)
chr4 (21-259)||(35614147-35614384)
chr4 (21-141)||(386014-386134)
chr4 (21-258)||(12349234-12349471)
chr4 (46-259)||(12522292-12522505)
chr4 (21-253)||(55795672-55795903)
chr4 (21-240)||(16956310-16956529)
chr4 (21-240)||(53433604-53433823)
chr4 (21-258)||(12299558-12299795)
chr4 (46-259)||(41385430-41385643)
chr4 (11-166)||(19941804-19941959)
chr4 (11-166)||(23081889-23082044)
chr4 (11-166)||(27710046-27710201)
chr4 (21-259)||(30234838-30235076)
chr4 (21-166)||(9556831-9556976)
chr4 (195-259)||(386166-386230)
chr4 (34-92)||(20156951-20157009)
chr4 (21-92)||(7089268-7089339)
chr4 (21-92)||(13812457-13812528)
chr4 (21-92)||(22633861-22633932)
chr4 (21-92)||(24029143-24029214)
chr4 (11-51)||(4560983-4561023)
chr4 (11-51)||(5756587-5756627)
chr4 (11-51)||(33742794-33742834)
[»] chr3 (105 HSPs)
chr3 (7-263)||(37615596-37615852)
chr3 (7-263)||(418205-418461)
chr3 (7-260)||(14672845-14673098)
chr3 (7-263)||(26788450-26788706)
chr3 (7-263)||(26794040-26794296)
chr3 (11-263)||(31422202-31422454)
chr3 (6-263)||(26889660-26889917)
chr3 (7-263)||(6598923-6599179)
chr3 (7-263)||(6605603-6605859)
chr3 (7-263)||(10845929-10846184)
chr3 (7-263)||(5106529-5106785)
chr3 (21-263)||(10153394-10153636)
chr3 (11-262)||(16623704-16623955)
chr3 (7-258)||(16634061-16634312)
chr3 (7-258)||(16640671-16640922)
chr3 (7-258)||(43161336-43161587)
chr3 (7-258)||(43167573-43167824)
chr3 (7-258)||(48423578-48423829)
chr3 (7-258)||(48430356-48430607)
chr3 (7-263)||(13250924-13251180)
chr3 (7-263)||(13257570-13257826)
chr3 (7-258)||(1332706-1332956)
chr3 (21-263)||(5221609-5221851)
chr3 (7-263)||(16747484-16747740)
chr3 (7-263)||(16758216-16758472)
chr3 (11-259)||(16489319-16489567)
chr3 (11-259)||(53380001-53380247)
chr3 (11-259)||(53386653-53386899)
chr3 (11-259)||(41201447-41201695)
chr3 (11-259)||(15726581-15726829)
chr3 (11-259)||(23704418-23704666)
chr3 (11-259)||(23722874-23723122)
chr3 (11-259)||(23741330-23741578)
chr3 (21-253)||(5149627-5149859)
chr3 (11-259)||(15691927-15692175)
chr3 (7-263)||(20057048-20057304)
chr3 (7-263)||(20063686-20063942)
chr3 (7-263)||(3690824-3691080)
chr3 (7-179)||(30066237-30066409)
chr3 (11-259)||(41091996-41092244)
chr3 (11-166)||(14499629-14499784)
chr3 (11-179)||(11070359-11070527)
chr3 (11-179)||(11165179-11165347)
chr3 (21-259)||(24187985-24188223)
chr3 (21-258)||(839455-839692)
chr3 (21-262)||(10911105-10911346)
chr3 (21-259)||(55149186-55149424)
chr3 (21-262)||(10003843-10004084)
chr3 (21-262)||(10010490-10010731)
chr3 (21-262)||(10904433-10904674)
chr3 (11-141)||(22642988-22643118)
chr3 (11-141)||(55023174-55023304)
chr3 (11-259)||(19809237-19809485)
chr3 (21-259)||(7985915-7986152)
chr3 (11-240)||(15825891-15826120)
chr3 (11-166)||(17710241-17710396)
chr3 (21-259)||(20723209-20723447)
chr3 (21-259)||(6608688-6608926)
chr3 (11-166)||(15991753-15991908)
chr3 (21-258)||(12482638-12482875)
chr3 (21-258)||(15584379-15584616)
chr3 (21-258)||(15591037-15591274)
chr3 (11-96)||(22670536-22670621)
chr3 (21-240)||(17252716-17252935)
chr3 (11-259)||(15404143-15404390)
chr3 (21-166)||(4291073-4291218)
chr3 (21-258)||(5201433-5201670)
chr3 (11-166)||(1145201-1145356)
chr3 (21-240)||(10236054-10236272)
chr3 (21-240)||(12891633-12891852)
chr3 (21-259)||(5426362-5426600)
chr3 (11-259)||(15397552-15397799)
chr3 (21-166)||(4710600-4710744)
chr3 (21-253)||(5419964-5420196)
chr3 (11-166)||(410400-410555)
chr3 (11-90)||(15337810-15337889)
chr3 (11-166)||(15343255-15343410)
chr3 (11-166)||(15349898-15350053)
chr3 (11-259)||(15360901-15361148)
chr3 (11-90)||(8720805-8720884)
chr3 (11-90)||(9072692-9072771)
chr3 (21-170)||(10326150-10326299)
chr3 (21-259)||(16333381-16333618)
chr3 (21-166)||(13321273-13321418)
chr3 (46-255)||(28350846-28351055)
chr3 (21-92)||(4588463-4588534)
chr3 (21-92)||(12340154-12340225)
chr3 (117-240)||(13315943-13316066)
chr3 (21-66)||(15617778-15617823)
chr3 (199-259)||(15337642-15337702)
chr3 (21-92)||(14666007-14666078)
chr3 (21-92)||(14735520-14735591)
chr3 (34-92)||(17488259-17488317)
chr3 (34-92)||(17499741-17499799)
chr3 (195-240)||(4290999-4291044)
chr3 (39-92)||(12852030-12852083)
chr3 (195-240)||(30777057-30777102)
chr3 (11-51)||(7110118-7110158)
chr3 (11-51)||(7114053-7114093)
chr3 (11-55)||(13315835-13315879)
chr3 (21-89)||(14179727-14179795)
chr3 (21-89)||(14572993-14573061)
chr3 (196-240)||(15991938-15991982)
chr3 (11-51)||(27409293-27409333)
chr3 (11-51)||(28950145-28950185)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (7-263)||(9462-9718)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (7-263)||(6980863-6981119)
chr6 (7-263)||(20649439-20649695)
chr6 (7-263)||(2869782-2870037)
chr6 (7-263)||(2876397-2876652)
chr6 (11-263)||(12762906-12763158)
chr6 (7-263)||(4233144-4233400)
chr6 (6-263)||(20060854-20061111)
chr6 (7-258)||(8229097-8229348)
chr6 (7-258)||(18931286-18931537)
chr6 (7-258)||(29593466-29593717)
chr6 (7-263)||(14059262-14059518)
chr6 (7-258)||(29587325-29587576)
chr6 (7-263)||(30597422-30597678)
chr6 (11-259)||(27327706-27327954)
chr6 (11-259)||(27388446-27388694)
chr6 (11-258)||(30637780-30638026)
chr6 (49-259)||(18194212-18194422)
chr6 (21-259)||(1538604-1538842)
chr6 (21-259)||(1544703-1544941)
chr6 (21-260)||(8797398-8797637)
chr6 (11-262)||(27429933-27430184)
chr6 (46-251)||(30694579-30694784)
chr6 (7-259)||(28258100-28258351)
chr6 (7-259)||(28264724-28264975)
chr6 (7-259)||(28336849-28337100)
chr6 (7-259)||(28343473-28343724)
chr6 (11-243)||(26130692-26130925)
chr6 (21-259)||(17031079-17031317)
chr6 (21-259)||(22331648-22331886)
chr6 (21-262)||(20801962-20802202)
chr6 (21-259)||(17036995-17037233)
chr6 (21-259)||(19808735-19808973)
chr6 (21-259)||(34369633-34369871)
chr6 (46-259)||(16372067-16372280)
chr6 (21-253)||(28314786-28315018)
chr6 (11-259)||(25117652-25117900)
chr6 (21-166)||(34832956-34833101)
chr6 (21-259)||(27185918-27186156)
chr6 (21-259)||(27207754-27207992)
chr6 (21-259)||(27241236-27241474)
chr6 (21-259)||(27263084-27263322)
chr6 (21-258)||(32564902-32565139)
chr6 (21-253)||(16551680-16551912)
chr6 (21-253)||(16577041-16577273)
chr6 (21-253)||(16618107-16618339)
chr6 (21-253)||(16628236-16628468)
chr6 (11-259)||(25111049-25111297)
chr6 (21-166)||(14098928-14099073)
chr6 (116-259)||(28287565-28287707)
chr6 (21-170)||(3708142-3708291)
chr6 (21-258)||(17016582-17016819)
chr6 (11-179)||(14472558-14472726)
chr6 (21-240)||(25595012-25595231)
chr6 (11-240)||(24314729-24314958)
chr6 (11-240)||(31316742-31316971)
chr6 (22-128)||(34295728-34295834)
chr6 (21-259)||(22759061-22759297)
chr6 (11-90)||(24290723-24290802)
chr6 (21-166)||(23276938-23277083)
chr6 (35-111)||(31164520-31164596)
chr6 (195-259)||(34298457-34298521)
chr6 (21-66)||(18916926-18916971)
chr6 (21-66)||(19870992-19871037)
chr6 (46-166)||(4168226-4168346)
chr6 (46-166)||(4208906-4209026)
chr6 (199-259)||(25928505-25928565)
chr6 (21-88)||(15894078-15894145)
chr6 (21-88)||(22334530-22334597)
chr6 (195-259)||(3708316-3708380)
chr6 (21-92)||(20637942-20638013)
chr6 (21-92)||(21939785-21939856)
chr6 (21-86)||(25611371-25611436)
chr6 (11-51)||(8244277-8244317)
chr6 (11-51)||(11567279-11567319)
chr6 (11-51)||(12618494-12618534)
chr6 (11-51)||(22863362-22863402)
chr6 (11-51)||(23395485-23395525)
chr6 (11-51)||(23990337-23990377)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (7-263)||(20215574-20215830)
chr1 (7-263)||(44844528-44844785)
chr1 (7-258)||(43078649-43078900)
chr1 (7-258)||(46156966-46157217)
chr1 (6-263)||(51334957-51335214)
chr1 (6-263)||(51328322-51328580)
chr1 (11-259)||(41478226-41478475)
chr1 (11-240)||(18599755-18599984)
chr1 (21-259)||(21828922-21829160)
chr1 (21-259)||(21844435-21844673)
chr1 (7-263)||(16345420-16345676)
chr1 (7-263)||(16352068-16352324)
chr1 (11-179)||(1011011-1011179)
chr1 (7-263)||(41355933-41356189)
chr1 (7-263)||(41348496-41348752)
chr1 (21-259)||(23763419-23763657)
chr1 (24-259)||(19063728-19063963)
chr1 (24-259)||(19111618-19111853)
chr1 (21-259)||(20524875-20525113)
chr1 (21-259)||(21438002-21438240)
chr1 (21-263)||(47659421-47659663)
chr1 (21-259)||(19104961-19105199)
chr1 (21-258)||(44756314-44756552)
chr1 (21-258)||(27898319-27898556)
chr1 (21-258)||(43062936-43063173)
chr1 (21-258)||(49334781-49335018)
chr1 (21-259)||(18625935-18626172)
chr1 (11-166)||(21835667-21835822)
chr1 (11-166)||(33385873-33386028)
chr1 (11-166)||(33392517-33392672)
chr1 (21-240)||(50887412-50887631)
chr1 (11-166)||(21806850-21807005)
chr1 (21-258)||(33394056-33394293)
chr1 (53-240)||(8305363-8305550)
chr1 (21-92)||(22355833-22355904)
chr1 (21-92)||(22357519-22357590)
chr1 (21-92)||(27250388-27250459)
chr1 (11-51)||(16375107-16375147)
chr1 (11-51)||(21407772-21407812)
chr1 (11-51)||(52639958-52639998)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (11-263)||(67712-67964)
scaffold0028 (21-259)||(41745-41983)
scaffold0028 (21-259)||(57252-57490)
scaffold0028 (11-166)||(7305-7460)
scaffold0028 (11-139)||(23363-23491)
scaffold0028 (195-240)||(13756-13801)
scaffold0028 (195-240)||(23284-23329)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (7-258)||(10568-10819)
scaffold0052 (7-258)||(56990-57241)
scaffold0052 (7-263)||(698-954)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-261)||(108970-109224)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (6-262)||(59105-59361)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-262)||(139272-139528)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (7-258)||(38913-39164)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (11-256)||(26853-27098)
scaffold0109 (21-91)||(43667-43737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (11-253)||(307310-307553)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (11-256)||(125763-126008)
scaffold0029 (46-256)||(105563-105773)
scaffold0029 (21-66)||(61272-61317)
scaffold0029 (21-66)||(65188-65233)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (11-262)||(57179-57430)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (7-263)||(38246-38502)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-263)||(76310-76566)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (11-166)||(12723-12878)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (21-259)||(14200-14438)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (21-259)||(242265-242503)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (21-259)||(29867-30105)
scaffold0138 (21-109)||(41863-41951)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (21-179)||(3536-3694)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (42-259)||(58099-58316)
scaffold0004 (11-166)||(78515-78671)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (22-259)||(5459-5696)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (11-166)||(12745-12900)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-171)||(3005-3155)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (21-259)||(36916-37153)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (21-259)||(9548-9786)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (21-259)||(10385-10623)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (21-258)||(8998-9235)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (21-166)||(3073-3218)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (21-258)||(3738-3975)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (21-259)||(31972-32209)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (21-243)||(24635-24857)
scaffold0256 (21-111)||(19792-19882)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (21-179)||(8537-8695)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (11-166)||(74297-74452)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (21-258)||(22413-22650)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (21-165)||(416-560)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (7-93)||(61180-61266)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (21-141)||(17392-17512)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (21-259)||(14653-14891)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (195-259)||(19411-19475)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (21-92)||(7942-8013)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (21-92)||(4790-4861)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (21-92)||(1305-1376)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (33-92)||(12469-12528)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (21-92)||(10312-10383)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (21-92)||(9482-9553)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (21-92)||(3872-3943)
scaffold0165 (21-92)||(7936-8007)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-92)||(207167-207238)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (21-92)||(2733-2804)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (21-92)||(13256-13327)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (21-92)||(327-398)
scaffold0358 (21-92)||(5103-5174)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (21-92)||(23284-23355)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (33-108)||(24311-24386)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (21-107)||(708-794)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (21-91)||(16671-16741)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (21-107)||(167638-167724)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (28-108)||(28935-29015)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (21-89)||(34525-34593)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (40-92)||(79999-80051)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 26877214 - 26877470
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26877214 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgtatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26877313  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26877314 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26877413  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877414 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26877470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 22320632 - 22320888
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22320632 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22320731  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22320732 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22320831  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22320832 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22320888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 22326785 - 22327041
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22326785 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22326884  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22326885 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22326984  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326985 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22327041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27216526 - 27216275
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27216526 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27216427  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27216426 aacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 27216327  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27216326 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 27216275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 24913614 - 24913866
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24913614 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 24913713  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24913714 acactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgaagttgcttgtgtgtttgtgcgatctg 24913813  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24913814 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 24913866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9340743 - 9340492
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340743 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9340644  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9340643 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9340544  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9340543 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9340492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9489377 - 9489126
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9489377 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9489278  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9489277 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9489178  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9489177 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9489126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9608638 - 9608387
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608638 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9608539  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9608538 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9608439  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9608438 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9608387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16986404 - 16986153
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16986404 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 16986305  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16986304 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16986205  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16986204 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16986153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 28431558 - 28431809
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28431558 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 28431657  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28431658 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 28431757  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28431758 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 28431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27617756 - 27617500
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27617756 tttcgtgtttcaacctttttagtcgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27617657  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||   |  ||||||||||||    
T  27617656 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgcga 27617557  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617556 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 27617500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 13306235 - 13306486
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13306235 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgccttcgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13306334  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13306335 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 13306434  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13306435 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 13306486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 19489574 - 19489821
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  19489574 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacctacctagtattgtttaggaacgaatttaggatcagagggaacccataaca 19489673  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19489674 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttttgcgatccg 19489773  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19489774 tgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 19489821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1843543 - 1843291
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1843543 tttcgtgattcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacctag 1843444  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  1843443 aacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcttcgcgagcacaaccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcga 1843344  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1843343 tctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 1843291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16997510 - 16997254
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16997510 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 16997411  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  16997410 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 16997311  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16997310 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 16997254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29233975 - 29233737
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29233975 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29233876  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29233875 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29233776  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29233775 gttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagaccta 29233737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29347274 - 29347036
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29347274 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29347175  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29347174 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29347075  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29347074 gttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagaccta 29347036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17004143 - 17003887
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17004143 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctaatattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 17004044  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  17004043 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 17003944  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17003943 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 17003887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23171494 - 23171246
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23171494 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23171395  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23171394 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23171295  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23171294 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 23171246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23582751 - 23582503
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23582751 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23582652  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23582651 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23582552  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23582551 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 23582503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12829516 - 12829286
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  12829516 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 12829417  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12829416 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 12829317  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaat 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12829316 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaat 12829286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27599678 - 27599472
Alignment:
Q  53 cctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599678 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 27599579  T
Q  153 gtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatg 252  Q
    | |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  27599578 gaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaata 27599479  T
Q  253 agaccta 259  Q
    |||||||    
T  27599478 agaccta 27599472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16922907 - 16922741
Alignment:
Q  92 tcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtt 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16922907 tcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgat 16922808  T
Q  192 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16922807 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16922741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 10101295 - 10101463
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  10101295 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 10101394  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  10101395 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 10101463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16928730 - 16928560
Alignment:
Q  93 cagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgttt 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |    
T  16928730 cagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcct 16928631  T
Q  193 atgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16928630 gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 16928560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10866818 - 10866576
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  10866818 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10866719  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10866718 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10866619  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10866618 gttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 10866576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10873985 - 10873743
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  10873985 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10873886  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10873885 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10873786  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10873785 gttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 10873743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27197331 - 27197093
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||   |||||||    
T  27197331 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagttt 27197232  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  27197231 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 27197132  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  27197131 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 27197093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 21138931 - 21139169
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||| ||||||   |||||||    
T  21138931 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgacaagattgaacccagaacagctttagttt 21139030  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21139031 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21139130  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21139131 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21139169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24503556 - 24503318
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  24503556 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24503457  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |  |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||   ||   || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24503456 gaaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactttcatattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24503357  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     ||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24503356 tttgatcaggagcgaacccctaattggtaatgaaaccta 24503318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 41604381 - 41604536
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  41604381 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41604480  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41604481 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcg 41604536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 41610278 - 41610433
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  41610278 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41610377  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41610378 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcg 41610433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 21146949 - 21147187
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||  ||||| |||| |   |||||||    
T  21146949 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtaggacaagattgaacccagaatagctttagttt 21147048  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21147049 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21147148  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21147149 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21147187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16980663 - 16980567
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16980663 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacc 16980567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 13970019 - 13970174
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  13970019 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 13970118  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  13970119 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 13970174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 30970639 - 30970858
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  30970639 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 30970738  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  30970739 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30970838  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  30970839 ttggatcaagagagaacccc 30970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 45057075 - 45057230
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  45057075 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 45057174  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  45057175 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 45057230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 24640621 - 24640858
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  24640621 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgccagaacaaacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 24640720  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
     ||  |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24640721 -ggttttgtctggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacctccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24640819  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  24640820 tttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 24640858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37318719 - 37318502
Alignment:
Q  23 ttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgg 122  Q
    ||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||    ||| |||||||  |||||||||    
T  37318719 ttttagttggaccttgagcgcttatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaacaactttagtttgg 37318620  T
Q  123 gagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgt 222  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  | |    
T  37318619 gaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagcttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgttt 37318520  T
Q  223 tgatcaagaatgaacccc 240  Q
     |||||||| ||||||||    
T  37318519 ggatcaagagtgaacccc 37318502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16928916 - 16928832
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16928916 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 16928832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 44387523 - 44387760
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  44387523 ctttttagttggaccttaagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 44387622  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  44387623 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcacct 44387721  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44387722 tttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgaaaccta 44387760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27369748 - 27369511
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  27369748 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27369649  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   | || | | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27369648 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 27369549  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27369548 tttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 27369511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 88
Target Start/End: Original strand, 29282430 - 29282511
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgta 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29282430 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgta 29282511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24715160 - 24715013
Alignment:
Q  19 acctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagt 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| |||||||  |||||    
T  24715160 acctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagt 24715061  T
Q  119 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  24715060 ttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 24715013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 44380853 - 44381090
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||   ||||||||||||| | || ||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  44380853 ctttttaggtggaccttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttatgacaggattgaacccaaaacaacattagttg 44380952  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  44380953 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcacct 44381051  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44381052 tttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaaccta 44381090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27376258 - 27376021
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  27376258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27376159  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   | || | | |  |||||  ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27376158 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgagtggttgtgagatctgtgtcgcacct 27376059  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27376058 tttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 27376021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15478050 - 15477905
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||   |||  ||||||||||||| |||||||     
T  15478050 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagttatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaatcttagttg 15477951  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  15477950 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcg 15477905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Original strand, 19645660 - 19645856
Alignment:
Q  44 ctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  19645660 ctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagtattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 19645759  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||    
T  19645760 ggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccc 19645856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 166
Target Start/End: Original strand, 24872092 - 24872212
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  24872092 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccatgg 24872191  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  24872192 cgagtaagaactctcgcctcg 24872212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 166
Target Start/End: Original strand, 24879977 - 24880097
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  24879977 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccatgg 24880076  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  24880077 cgagtaagaactctcgcctcg 24880097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Original strand, 12901172 - 12901217
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12901172 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacataccta 12901217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 22737828 - 22737915
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaa 108  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22737828 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaa 22737915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27602243 - 27602198
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  27602243 ctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacataccta 27602198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27603279 - 27603230
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctg 56  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27603279 tttcgtgattcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgcctg 27603230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 24880126 - 24880171
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  24880126 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 24880171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 41604565 - 41604610
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41604565 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 41604610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 41610462 - 41610507
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41610462 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 41610507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 24649813 - 24649773
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24649813 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24649773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 28291950 - 28292018
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtag 89  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  28291950 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtag 28292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 41530659 - 41530699
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  41530659 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41530699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 18164319 - 18164575
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18164319 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 18164418  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18164419 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 18164518  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164519 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 18164575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 40523007 - 40523263
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40523007 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 40523106  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40523107 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 40523206  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 40523263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 9510658 - 9510914
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9510658 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 9510757  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9510758 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttatgcga 9510857  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510858 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 9510914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14331246 - 14330990
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14331246 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14331147  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14331146 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 14331047  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14331046 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 14330990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Original strand, 60321 - 60575
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  60321 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 60420  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60421 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcg 60520  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  60521 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctag 60575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14337830 - 14337574
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14337830 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttttatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14337731  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14337730 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 14337631  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14337630 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 14337574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22142 - 21891
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22142 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22043  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22042 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 21943  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21942 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 21891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 8201720 - 8201971
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8201720 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8201819  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8201820 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8201919  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8201920 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8201971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11366657 - 11366408
Alignment:
Q  10 cgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaac 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11366657 cgtgattcgacctttttagttggaccttgtgtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaac 11366558  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11366557 aagtttatgttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgaagttgtttatgtgtttgtgcgatct 11366458  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  11366457 gtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaataagaccta 11366408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15022590 - 15022338
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15022590 tttcttgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 15022491  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtg-tttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15022490 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgttttgtgcg 15022391  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15022390 atctgtgtcgcactttttgatccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 15022338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 14655066 - 14655314
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14655066 gtgttttgacctgtttagttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14655165  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  14655166 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcatagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14655265  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14655266 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 14655314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 44786120 - 44786376
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44786120 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 44786219  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  44786220 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 44786319  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44786320 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 44786376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 44792761 - 44793017
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44792761 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 44792860  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  44792861 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 44792960  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44792961 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 44793017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18176560 - 18176312
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18176560 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18176461  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18176460 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18176361  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18176360 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 18176312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18183232 - 18182984
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18183232 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18183133  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18183132 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18183033  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18183032 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 18182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 12703033 - 12703311
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12703033 tttcatgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12703132  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggta----------------------ctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatga 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12703133 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggaaga 12703232  T
Q  185 acttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703233 gcttgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 12703311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 15155819 - 15156039
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15155819 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15155918  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15155919 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15156018  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaaga 231  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15156019 tgtcgcacgtgttgatcaaga 15156039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15162470 - 15162718
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15162470 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaggaca 15162569  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15162570 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15162669  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  15162670 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 15162718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 16406944 - 16407192
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16406944 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgtcatagggtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16407043  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16407044 acgttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16407143  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  16407144 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 16407192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 20702641 - 20702889
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  20702641 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 20702740  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  20702741 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 20702840  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20702841 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 20702889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32768130 - 32767882
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  32768130 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 32768031  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  32768030 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 32767931  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32767930 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 32767882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13684918 - 13684670
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13684918 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13684819  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13684818 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13684719  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  13684718 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 13684670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13691533 - 13691285
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13691533 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13691434  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13691433 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13691334  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  13691333 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 13691285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 11238621 - 11238776
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11238621 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11238720  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11238721 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcg 11238776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 11231934 - 11232089
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11231934 gtgtttcgacctttttagttggacctcgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaataaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11232033  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11232034 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcg 11232089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33563 - 33395
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  33563 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 33464  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  33463 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 70415 - 70583
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  70415 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 70514  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  70515 atactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 70583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14953643 - 14953405
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  14953643 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14953544  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | | ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  14953543 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtggtttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgtacgt 14953444  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14953443 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14953405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49051732 - 49051574
Alignment:
Q  105 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||   |  ||||||||||    
T  49051732 agaaaaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgc 49051633  T
Q  205 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051632 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 49051574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 74523 - 74692
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaa-cctagaac 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||    
T  74523 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccccagaac 74622  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  74623 aatactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 74692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 4318205 - 4318443
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||  ||||| |||||||   ||||||    
T  4318205 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtaggacaagattgaacccagaacaacactagttt 4318304  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  |||| ||| | |   ||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  4318305 gggaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaatggagtgtcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcacgt 4318404  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  4318405 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 4318443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1347930 - 1347716
Alignment:
Q  44 ctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1347930 ctttgagtgcctgaacatgcctagtatttattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccat 1347831  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||    |||| ||| | ||  ||  ||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  1347830 ggcgagtgagaactctcgcctcgcgagttagcccagaatgtagtttgttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaa 1347732  T
Q  244 ctggtaatgagaccta 259  Q
     |||||| || |||||    
T  1347731 ttggtaacgaaaccta 1347716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14149015 - 14148777
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||||    
T  14149015 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttt 14148916  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14148915 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactcccgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14148816  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  14148815 tttgatcaagagtggatccctaattggtaatgagaccta 14148777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14959609 - 14959371
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  14959609 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14959510  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||  || | |  |||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14959509 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcagattggagtgttttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 14959410  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14959409 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14959371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11262774 - 11262536
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  11262774 ctttttagttggaccttgagtgccattgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 11262675  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  11262674 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 11262575  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11262574 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 11262536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12692932 - 12692703
Alignment:
Q  30 tggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttga 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||  |||||| || |||||     
T  12692932 tggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttgg 12692833  T
Q  130 gtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaa 229  Q
     | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12692832 cttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaa 12692733  T
Q  230 gaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    || |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  12692732 gagtgaatccctaattggtaatgaaaccta 12692703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Original strand, 12704336 - 12704463
Alignment:
Q  39 gatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactc 138  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  12704336 gatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactc 12704435  T
Q  139 gccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12704436 gccatggcgagtaagaactctcgcctcg 12704463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 18584960 - 18585197
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  18584960 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18585059  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18585060 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18585159  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18585160 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18585197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Original strand, 25038895 - 25039108
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  25038895 ttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatgg 25038994  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
     |||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  25038995 tgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaatt 25039094  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||    
T  25039095 ggtaatgaaaccta 25039108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 23519614 - 23519852
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  23519614 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgccttaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 23519713  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  23519714 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 23519813  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23519814 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 23519852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18531665 - 18531452
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||||  | |||| | |||||||||||||    
T  18531665 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgaaacttgacttgtactcgccatgg 18531566  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |    
T  18531565 cgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcatgagtgaacccctaatt 18531466  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||    
T  18531465 ggtaatgaaaccta 18531452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10875973 - 10875736
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  10875973 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaccatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggaatgaacccaaaacaacattagttg 10875874  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10875873 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 10875775  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10875774 tttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaaccta 10875736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8706441 - 8706212
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  8706441 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8706342  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8706341 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8706242  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaa 250  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8706241 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaa 8706212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8719857 - 8719628
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  8719857 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8719758  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8719757 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8719658  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaa 250  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8719657 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaa 8719628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 18553192 - 18553429
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||  | |||||  ||||||     
T  18553192 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaactcaaaacaacattagttg 18553291  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18553292 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18553391  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18553392 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18553429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10869893 - 10869662
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  10869893 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaccatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggaatgaacccaaaacaacattagttg 10869794  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10869793 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtacagaatgtagatgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 10869695  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869694 tttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 10869662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 6016831 - 6017050
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  6016831 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 6016930  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  6016931 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 6017030  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  6017031 ttggatcaagagagaacccc 6017050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 11547927 - 11548145
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||| |||||  || |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  11547927 ctttttagttgggccttgagtgtcactgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttg 11548026  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  11548027 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 11548126  T
Q  221 gttgatcaagaatgaaccc 239  Q
     ||||| |||| |||||||    
T  11548127 tttgattaagagtgaaccc 11548145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 11554523 - 11554741
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||| |||||  || |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  11554523 ctttttagttgggccttgagtgtcactgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttg 11554622  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  11554623 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 11554722  T
Q  221 gttgatcaagaatgaaccc 239  Q
     ||||| |||| |||||||    
T  11554723 tttgattaagagtgaaccc 11554741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 26420423 - 26420333
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaa 111  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  26420423 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaa 26420333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 44408019 - 44408139
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  44408019 ctttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 44408118  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    || |||||  | |||||||||    
T  44408119 ggaagttggcttgtactcgcc 44408139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9410390 - 9410245
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||   |||    ||| | |||||  |||||||    
T  9410390 ctttttagttggaccttgagcgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaagaatgaatgtagggcaagattagacccaaaacaactttagttt 9410291  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9410290 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcg 9410245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7536631 - 7536501
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  7536631 ctttttagttggaccttgagtgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 7536532  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagta 151  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  7536531 ggtttttgtctggtactcgccatggcgagta 7536501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26420271 - 26420207
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26420271 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 26420207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 2831954 - 2832041
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaa 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2831954 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaa 2832041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 44408171 - 44408235
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44408171 gtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 44408235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 9751198 - 9751269
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  9751198 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 9751269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Original strand, 1245667 - 1245718
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  1245667 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaa 1245718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 39267294 - 39267365
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39267294 cttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 39267365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 43
Target Start/End: Original strand, 12702174 - 12702206
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgc 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702174 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgc 12702206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13570162 - 13570102
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||    
T  13570162 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattgataataagaccta 13570102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 16385906 - 16385977
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  16385906 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 16385977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18302651 - 18302580
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  18302651 cttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggat 18302580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 26212458 - 26212387
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||| | |||||||||||    
T  26212458 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtaggat 26212387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 259
Target Start/End: Original strand, 11232123 - 11232181
Alignment:
Q  201 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  11232123 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaaccta 11232181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 259
Target Start/End: Original strand, 11238810 - 11238868
Alignment:
Q  201 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  11238810 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaaccta 11238868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9410216 - 9410152
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  9410216 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggaccaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 9410152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16114698 - 16114658
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16114698 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16114658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16117851 - 16117811
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16117851 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16117811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 16906850 - 16906890
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16906850 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16906890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 18279860 - 18279820
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18279860 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18279820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 18283823 - 18283783
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18283823 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18283783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30987 - 30731
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30987 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 30888  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30887 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 30788  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 30731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 72544 - 72800
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  72544 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 72643  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72644 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 72743  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72744 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 72800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8515 - 8267
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  8515 gtgtttcgacttttttagttggaccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 8416  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||  |  || ||  |||||||||| |||||    
T  8415 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcaatctg 8316  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8315 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 17669216 - 17669472
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17669216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17669315  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17669316 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17669415  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669416 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 17669472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 17675868 - 17676124
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17675868 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17675967  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17675968 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17676067  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676068 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 17676124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 21915216 - 21915472
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21915216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 21915315  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21915316 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 21915415  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21915416 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactgataatgagacctagtga 21915472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22084292 - 22084035
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22084292 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22084193  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22084192 gaacaaccttagtttgggagttgaggggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 22084093  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22084092 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 5534085 - 5534337
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5534085 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 5534184  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5534185 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 5534284  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5534285 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagaccta 5534337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 20019586 - 20019842
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20019586 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20019685  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20019686 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 20019785  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20019786 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 20019842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28455219 - 28454968
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28455219 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 28455120  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28455119 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgggagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 28455020  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28455019 tctgtgtcgcactttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 28454968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 20013510 - 20013765
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20013510 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20013609  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20013610 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcga 20013708  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20013709 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 20013765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 8354409 - 8354661
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8354409 tttcgtgattcgaccttttcagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8354508  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||||    
T  8354509 aacaagcttagtttgggagttgagtggtattcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcga 8354608  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8354609 tctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 8354661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19111686 - 19111430
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19111686 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19111587  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  19111586 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 19111487  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19111486 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 19111430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19117977 - 19117721
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19117977 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19117878  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  19117877 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 19117778  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19117777 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 19117721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 22123035 - 22123283
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22123035 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaaca 22123134  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  22123135 acattagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgtttgagtgtttgtgcgatctg 22123234  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  22123235 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 22123283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 16882822 - 16883070
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  16882822 gtgtttagacctttttagttggaccttggatgccttagagtgtctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaaca 16882921  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16882922 acactagtttgggagatgagcggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16883021  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16883022 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 16883070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18865787 - 18865535
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18865787 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18865688  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  18865687 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 18865588  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||| | || ||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18865587 tgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtga 18865535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29123541 - 29123293
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  29123541 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 29123442  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29123441 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29123342  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29123341 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 29123293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18855392 - 18855140
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18855392 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18855293  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18855292 acactagtgtgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18855193  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||| | || ||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18855192 tgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtga 18855140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 22115370 - 22115618
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22115370 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22115469  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     |||| ||| |  ||||||  ||| | |||||||||    
T  22115470 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagtttgtttgagtg-tagtgcgatct 22115568  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22115569 gtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 22115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22048406 - 22048150
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  22048406 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 22048307  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  22048306 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtataaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 22048207  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  22048206 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgaggcctagtga 22048150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19496850 - 19496594
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  19496850 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 19496751  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  19496750 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 19496651  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19496650 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 19496594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20527895 - 20527657
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  20527895 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20527796  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20527795 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20527696  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20527695 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 20527657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 22122072 - 22122195
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22122072 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgaattggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22122171  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggt 134  Q
    |  |||||||||||| ||||||||    
T  22122172 acattagtttgggagatgagtggt 22122195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18065777 - 18065540
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  18065777 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18065678  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18065677 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagttcagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18065578  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18065577 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18065540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 20023578 - 20023733
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||    ||| ||||||    
T  20023578 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaaca 20023677  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  20023678 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaagaaccctcgcctcg 20023733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 26934836 - 26935055
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  26934836 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 26934935  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  26934936 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 26935035  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  26935036 ttggatcaagagagaacccc 26935055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19905901 - 19905705
Alignment:
Q  62 acctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcg 161  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19905901 acctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcg 19905802  T
Q  162 cctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19905801 cctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcaatctgtgtcgcacat-ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19905705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3216707 - 3216488
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||   || | ||||||   |||||||    
T  3216707 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaatccagaacagcattagttt 3216608  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  3216607 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgtctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 3216508  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  3216507 ttggatcaagagagaacccc 3216488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 23845443 - 23845512
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23845443 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 259
Target Start/End: Original strand, 22124368 - 22124426
Alignment:
Q  201 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22124368 gtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 22124426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 16199306 - 16199393
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaa 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||   | |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16199306 cttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaa 16199393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21491465 - 21491378
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaa 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||    
T  21491465 cttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaa 21491378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 25362799 - 25362870
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  25362799 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggat 25362870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 22112292 - 22112247
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22112292 gttttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 166
Target Start/End: Original strand, 22124296 - 22124333
Alignment:
Q  129 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22124296 agtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcg 22124333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 23845595 - 23845640
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  23845595 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 23845640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 5865925 - 5865993
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtag 89  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  5865925 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 5865993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17141386 - 17141318
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtag 89  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  17141386 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17141318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 19277934 - 19277974
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19277934 gtgtttcgaccttttaagttgaaccttagatgcctttgagt 19277974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 21972234 - 21972274
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21972234 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21972274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 22062527 - 22062783
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22062527 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22062626  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22062627 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22062726  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062727 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22062783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 27663435 - 27663691
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27663435 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27663534  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27663535 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 27663634  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663635 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 27663691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 27670075 - 27670331
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27670075 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27670174  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670175 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 27670274  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670275 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 27670331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 34294202 - 34294454
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34294202 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcacagggaacccagaaca 34294301  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294302 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 34294401  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 34294454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 41097868 - 41098124
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41097868 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccag 41097967  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41097968 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41098067  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098068 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 41098124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41776276 - 41776020
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41776276 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacctag 41776177  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41776176 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41776077  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41776076 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtga 41776020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 17706576 - 17706832
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17706576 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagcacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17706675  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17706676 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17706775  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17706776 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 17706832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22265405 - 22265149
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22265405 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgagcattcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22265306  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22265305 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22265206  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22265205 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22265149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41769702 - 41769446
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41769702 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccag 41769603  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41769602 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41769503  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41769502 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtga 41769446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27615805 - 27615549
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27615805 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27615706  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27615705 aacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtaaaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 27615606  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27615605 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 27615549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 24471897 - 24472149
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24471897 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 24471996  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24471997 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 24472096  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472097 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 24472149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23584600 - 23584344
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23584600 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23584501  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  23584500 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaacgaaattgtttttgtgtttgtgcga 23584401  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23584400 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgatcccctaactggtaatgagacctagtga 23584344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27609187 - 27608943
Alignment:
Q  19 acctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagt 118  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  27609187 acctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaaccttaat 27609088  T
Q  119 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27609087 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 27608988  T
Q  219 ttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27608987 ttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 27608943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16355305 - 16355054
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355305 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16355206  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16355205 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16355106  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16355105 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16355054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16361964 - 16361713
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361964 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16361865  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16361864 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16361765  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16361764 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16361713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25107244 - 25106993
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25107244 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 25107145  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25107144 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 25107045  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25107044 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 25106993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25166337 - 25166086
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25166337 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 25166238  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25166237 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 25166138  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25166137 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 25166086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34565298 - 34565047
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34565298 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 34565199  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34565198 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 34565099  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34565098 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 34565047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34571953 - 34571702
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571953 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 34571854  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34571853 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 34571754  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34571753 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 34571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23610362 - 23610106
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23610362 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 23610263  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23610262 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcga 23610163  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610162 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23610106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23841758 - 23841502
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23841758 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 23841659  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23841658 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcga 23841559  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841558 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23841502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40707582 - 40707326
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40707582 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40707483  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40707482 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40707384  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707383 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 40707326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40714224 - 40713968
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40714224 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40714125  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40714124 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40714026  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40714025 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 40713968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19992339 - 19992091
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19992339 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19992240  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||    
T  19992239 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcgatctg 19992140  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19992139 tgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 19992091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15001328 - 15001576
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15001328 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15001427  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  15001428 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtatttgtgcgatctg 15001527  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  15001528 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagaccta 15001576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27517211 - 27516956
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27517211 tttcgtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 27517112  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  27517111 aacaagcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 27517013  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27517012 tctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtga 27516956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27523848 - 27523593
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27523848 tttcgtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 27523749  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  27523748 aacaagcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 27523650  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27523649 tctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtga 27523593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 14994685 - 14994933
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14994685 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14994784  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14994785 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14994884  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  14994885 tgtcccacgtgttgatcaaaagtgaacccctagttggtattaagaccta 14994933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 37293128 - 37293381
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  37293128 gttttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37293227  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37293228 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37293327  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37293328 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggccta 37293381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 1692086 - 1692334
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1692086 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 1692185  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1692186 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 1692285  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  1692286 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 1692334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 22327813 - 22328061
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327813 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 22327912  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22327913 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22328012  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  22328013 agtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactactaataagaccta 22328061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 27686978 - 27687226
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27686978 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 27687077  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27687078 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27687177  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  27687178 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 27687226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 37286425 - 37286678
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  37286425 gttttgtgttttgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37286524  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37286525 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37286624  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37286625 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggccta 37286678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 18038317 - 18038565
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18038317 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgctctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaaca 18038416  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18038417 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18038516  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  18038517 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 18038565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 22334467 - 22334695
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22334467 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22334566  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22334567 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactatcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22334666  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaaccc 239  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22334667 agtcgcacgtgttgatctagagtgaaccc 22334695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17284522 - 17284274
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17284522 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17284423  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  17284422 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccataatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 17284323  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17284322 tgtcccacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 17284274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25406871 - 25406639
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  25406871 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 25406772  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  25406771 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25406672  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25406671 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 25406639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 29477604 - 29477852
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||    
T  29477604 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29477703  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29477704 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29477803  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29477804 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 29477852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 41294084 - 41294332
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  41294084 gtgtttcgacccttttagttggactttggatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41294183  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  41294184 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacttgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 41294283  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  41294284 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 41294332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22133444 - 22133206
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  22133444 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagttt 22133345  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22133344 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22133245  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22133244 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 22133206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22140136 - 22139898
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  22140136 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagttt 22140037  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22140036 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22139937  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22139936 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 22139898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 29471009 - 29471257
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||    
T  29471009 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29471108  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29471109 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29471208  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29471209 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 29471257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22588540 - 22588302
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||   ||||||    
T  22588540 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaactcagaacaacactagttt 22588441  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22588440 gggagatgagtggtactcgccaaggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22588341  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22588340 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 22588302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37544502 - 37544245
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  37544502 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 37544403  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagt-tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||||  | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37544402 aacaacatcagtttgggagaatcagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37544303  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37544302 atctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 37544245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 15236430 - 15236598
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15236430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15236529  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15236530 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 15236598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 21294923 - 21295161
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  21294923 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21295022  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21295023 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21295122  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21295123 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21295161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33726302 - 33726064
Alignment:
Q  23 ttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgg 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||||    
T  33726302 ttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgatt-taggacaggattgaacccagaacaacatcagtttgg 33726204  T
Q  123 gagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgt 222  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  33726203 gagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcatgtgt 33726104  T
Q  223 tgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  33726103 tgatcaagagtgaacccctaagcggtgttgagacctagtg 33726064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14359479 - 14359717
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||  || ||||    
T  14359479 cttttgagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacctagaacaacattggttt 14359578  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14359579 ggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14359678  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  14359679 tttgatcaagagtgaatccctatttggtaatgagaccta 14359717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25535409 - 25535196
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  25535409 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatgg 25535310  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  25535309 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaatt 25535210  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||    
T  25535209 ggtaatgaaaccta 25535196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24554979 - 24554742
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  24554979 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24554880  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||| ||||||||||  |||||||||||   ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24554879 ggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24554780  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24554779 -ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 24554742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 15441614 - 15441852
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||||  ||||||     
T  15441614 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttg 15441713  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  15441714 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 15441813  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  15441814 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagaccta 15441852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Original strand, 23336973 - 23337186
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  23336973 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaactttagtttggaaattgaatggtactcgccatgg 23337072  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   |   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |    
T  23337073 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggattgcctggagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctagtt 23337172  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||    
T  23337173 ggtaatgagaccta 23337186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 22410258 - 22410495
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  22410258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22410357  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  | |||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22410358 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22410457  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22410458 tttgatcaagagtgaacccgtaattggtaatgagacct 22410495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29316864 - 29316627
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  29316864 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 29316765  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  29316764 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 29316665  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29316664 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29316627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19775404 - 19775245
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||    
T  19775404 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccag 19775305  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  19775304 aacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 19775245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19768807 - 19768649
Alignment:
Q  8 ttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctaga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| |||    
T  19768807 ttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaga 19768708  T
Q  108 acaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  19768707 acaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 19768649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 22258133 - 22258370
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  22258133 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22258232  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22258233 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22258331  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22258332 tttgatcaagagtgaatccctaactggtaatgaaaccta 22258370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20776335 - 20776103
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcct-gaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtt 119  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||  |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | || |    
T  20776335 ctttttagttggaccttgagtgtctttaagtgcctaaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcag-t 20776237  T
Q  120 tgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20776236 tgggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 20776137  T
Q  219 ttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatg 252  Q
     | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20776136 cttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatg 20776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 21667466 - 21667703
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  21667466 ctttttagttagaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 21667565  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  21667566 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgattgtgcgatctgtgtcgcacct 21667665  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21667666 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 21667703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Original strand, 22325588 - 22325805
Alignment:
Q  23 ttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgg 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||  ||||| ||||||   |||||||||    
T  22325588 ttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggaaaagattgaacccagaacagcattagtttgg 22325687  T
Q  123 gagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgt 222  Q
     | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  22325688 aacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttt 22325787  T
Q  223 tgatcaagaatgaacccc 240  Q
     |||||||| ||||||||    
T  22325788 ggatcaagagtgaacccc 22325805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23250396 - 23250241
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  23250396 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 23250297  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  23250296 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 23250241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24020716 - 24020637
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24020716 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagg 24020637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 25808146 - 25808365
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| |||||||  || ||||    
T  25808146 ctttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaacttttgttt 25808245  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |  | |  |||||||||||||||||||||||| |    
T  25808246 gggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25808345  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     ||||||||||  |||||||    
T  25808346 tttgatcaagagcgaacccc 25808365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22343943 - 22343724
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||  |||   |||| | |||||  |||||||    
T  22343943 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatataggacaagattaaacccaaaacaacattagttt 22343844  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | | ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22343843 ggaacttgtcttgaactcgccatggcgagtaagaattctcgcatcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22343744  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  22343743 ttggatcaagagagaacccc 22343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 22119841 - 22119912
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22119841 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 22119912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 24766985 - 24767056
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  24766985 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggat 24767056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1096940 - 1096869
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  1096940 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 1096869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22353297 - 22353194
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  22353297 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatgg 22353198  T
Q  146 cgag 149  Q
    ||||    
T  22353197 cgag 22353194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 22107032 - 22107102
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22107032 cttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagga 22107102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 20296304 - 20296264
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20296304 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20296264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 19779936 - 19780192
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19779936 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19780035  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19780036 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 19780135  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780136 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 19780192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4772552 - 4772300
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4772552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcctttgagtacctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 4772453  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4772452 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttggctatgtgtttgtgcgatctg 4772353  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772352 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 4772300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12475479 - 12475223
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12475479 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12475380  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12475379 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 12475280  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475279 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 12475223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23954607 - 23954351
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23954607 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23954508  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23954507 aacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 23954408  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954407 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23954351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23961269 - 23961013
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23961269 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23961170  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23961169 aacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 23961070  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961069 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23961013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Original strand, 18024074 - 18024327
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18024074 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccag 18024173  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18024174 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 18024273  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024274 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctag 18024327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 17961971 - 17962222
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17961971 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17962070  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17962071 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaactcgtttatgtgtttatgcga 17962170  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17962171 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacct 17962222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Original strand, 36884380 - 36884637
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36884380 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 36884479  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36884480 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 36884579  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884580 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 36884637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 8048142 - 8048398
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8048142 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8048241  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8048242 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 8048341  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8048342 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 8048398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 8054755 - 8055011
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8054755 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8054854  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8054855 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 8054954  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8054955 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 8055011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15362593 - 15362336
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15362593 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccga 15362494  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15362493 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgcttgtgcg 15362394  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15362393 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 15362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12482109 - 12481853
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12482109 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12482010  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12482009 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 12481910  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgat--caagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481909 tctgtgtcgcact--gtgatnncaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 12481853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22195080 - 22194826
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22195080 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22194981  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22194980 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattttgtgtttgtgcg 22194881  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22194880 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctag 22194826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Original strand, 15383139 - 15383396
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15383139 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15383238  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15383239 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15383338  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15383339 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtgaacccctatctggtaatgagacctagtga 15383396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8385294 - 8385043
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8385294 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8385195  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8385194 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8385095  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8385094 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8385043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8391949 - 8391698
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8391949 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8391850  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8391849 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8391750  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8391749 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8391698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14074290 - 14074039
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14074290 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14074191  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14074190 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 14074091  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14074090 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 14074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15257068 - 15256817
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15257068 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 15256969  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15256968 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 15256869  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15256868 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 15256817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17808873 - 17808622
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17808873 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17808774  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17808773 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 17808674  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17808673 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17808622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 29040545 - 29040796
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29040545 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 29040644  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29040645 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29040744  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29040745 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29040796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15148916 - 15148663
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15148916 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15148817  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15148816 aaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15148717  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15148716 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 15148663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 17089624 - 17089875
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17089624 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17089723  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17089724 aacaagcttagtttgtgagtggagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 17089823  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17089824 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17089875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Original strand, 16231487 - 16231744
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16231487 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 16231586  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231587 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtatagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 16231686  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16231687 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtaaacccctatctggtaatgagacctagtga 16231744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18296086 - 18295829
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18296086 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 18295987  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  18295986 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 18295887  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295886 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 18295829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 14298474 - 14298726
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14298474 tttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccag 14298573  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  14298574 aacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcga 14298673  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14298674 tctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 14298726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 14305097 - 14305350
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14305097 gtttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaaccca 14305196  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  14305197 gaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcg 14305296  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14305297 atatgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 14305350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20115598 - 20115350
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20115598 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20115499  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20115498 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 20115399  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  20115398 tgtcggacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 20115350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40471930 - 40471682
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40471930 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 40471831  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40471830 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40471731  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40471730 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 40471682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14268118 - 14268356
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14268118 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 14268217  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| | |    
T  14268218 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcgcat 14268317  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14268318 gttgattaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 14268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40478603 - 40478355
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  40478603 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 40478504  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40478503 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40478404  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40478403 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 40478355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 7900831 - 7901069
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  7900831 ctttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 7900930  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7900931 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7901030  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7901031 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 7901069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 26284558 - 26284806
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  26284558 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgtcttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 26284657  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  26284658 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 26284757  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26284758 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 26284806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 51493478 - 51493716
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  51493478 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 51493577  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  51493578 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 51493677  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51493678 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 51493716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 6873026 - 6873278
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  6873026 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 6873125  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  6873126 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 6873225  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||| | || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6873226 tgtcgcccgtgctgatcaagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtga 6873278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 15321754 - 15321992
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  15321754 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 15321853  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  15321854 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtaattgcttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 15321953  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15321954 gttgatcaatagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15321992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18071624 - 18071373
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||||||    
T  18071624 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 18071525  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18071524 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18071425  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18071424 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 18071373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17810728 - 17810560
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17810728 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17810629  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  17810628 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 17810560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 14757072 - 14757225
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  14757072 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14757171  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcct 164  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14757172 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcct 14757225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23838879 - 23838641
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  23838879 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23838780  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23838779 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23838680  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23838679 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 23838641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 9271764 - 9272006
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  ||   ||||| |||||||  |||||||    
T  9271764 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagcctgaacccagaacaactttagttt 9271863  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||| ||| |  ||||||  ||| | ||||||||||||||||||     
T  9271864 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagtatgaccagaatgtaggttgtttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacg 9271962  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    | |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  9271963 tattgatcaagagtgaacctctaattggtaatgaaacctagtga 9272006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14679408 - 14679170
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||      
T  14679408 ctttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtag 14679309  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14679308 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14679209  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14679208 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14679170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14685617 - 14685378
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||     
T  14685617 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggataagattgaacctagaacaacattatttg 14685518  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag-gatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||   || | |  |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  14685517 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacg 14685418  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14685417 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14685378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 17991315 - 17991430
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17991315 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17991414  T
Q  107 aacaagcttagtttgg 122  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17991415 aacaaccttagtttgg 17991430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35171074 - 35170836
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||    || | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||||    
T  35171074 ctttttagttggacctctagtgtcattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttt 35170975  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  35170974 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgtctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 35170875  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  35170874 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 35170836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35614384 - 35614147
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||  |||||||    
T  35614384 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtaggactagattaaacctagaacaactttagttt 35614285  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  35614284 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 35614186  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35614185 tttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagaccta 35614147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 386014 - 386134
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  386014 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 386113  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  386114 gggagatgagtggtactcgcc 386134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 12349234 - 12349471
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  12349234 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12349333  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12349334 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12349433  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12349434 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 12349471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12522505 - 12522292
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  12522505 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacctagaacaacattagttggggagttggcttgtactcgccatgg 12522406  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
      ||||  ||||||| ||||| ||| ||  | ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |    
T  12522405 aaagtagatactctcacctcgcgagcacttctagtttggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctagtt 12522306  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||    
T  12522305 ggtaatgagaccta 12522292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55795903 - 55795672
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  55795903 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 55795804  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |   ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  55795803 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagcagttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 55795705  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  55795704 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 55795672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 16956310 - 16956529
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| |||||||  |||||||    
T  16956310 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggctagattagacccagaacaactttagttt 16956409  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |  | |  |||||||||||||||||||||||| |    
T  16956410 gggaattgtttcgtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 16956509  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     ||||||||||  |||||||    
T  16956510 tttgatcaagagcgaacccc 16956529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53433823 - 53433604
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  53433823 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 53433724  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  53433723 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 53433624  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  53433623 ttggatcaagagagaacccc 53433604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 12299558 - 12299795
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  12299558 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacacacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12299657  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12299658 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12299757  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12299758 tttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 12299795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Original strand, 41385430 - 41385643
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||| || ||||   | |||||||||||||    
T  41385430 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccatgg 41385529  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |    
T  41385530 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctgatt 41385629  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||    
T  41385630 ggtaatgaaaccta 41385643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 19941804 - 19941959
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  19941804 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 19941903  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  19941904 actttagtttggaaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 19941959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23082044 - 23081889
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| | ||||    
T  23082044 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaaaaca 23081945  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  23081944 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 23081889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27710201 - 27710046
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| | ||||    
T  27710201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgagcatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 27710102  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  27710101 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 27710046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 30234838 - 30235076
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  |||  | ||| |||||||  |||||||    
T  30234838 ctttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattatggattaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 30234937  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||  ||||| || | |       |||||||||||||||||||||||| |    
T  30234938 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaatcctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtataaggagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30235037  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
       |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  30235038 tcagatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 30235076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9556976 - 9556831
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||   |||  ||||||||||||| |||||||     
T  9556976 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaaccttagttg 9556877  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  9556876 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcg 9556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 386166 - 386230
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  386166 gtgtttgtgcgatatgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 386230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 20156951 - 20157009
Alignment:
Q  34 ccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  20156951 ccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 20157009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7089339 - 7089268
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  7089339 cttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 7089268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 13812457 - 13812528
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  13812457 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtaggat 13812528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 22633861 - 22633932
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22633861 cttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 22633932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24029214 - 24029143
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  24029214 cttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggat 24029143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 4560983 - 4561023
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  4560983 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4561023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 5756587 - 5756627
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5756587 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5756627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 33742834 - 33742794
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  33742834 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37615852 - 37615596
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37615852 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 37615753  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37615752 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 37615653  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615652 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 37615596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 418461 - 418205
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  418461 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 418362  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  418361 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 418262  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  418261 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 418205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Original strand, 14672845 - 14673098
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14672845 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccag 14672944  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14672945 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 14673044  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673045 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctag 14673098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 26788450 - 26788706
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26788450 tttcgtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26788549  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26788550 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26788649  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788650 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26788706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 26794040 - 26794296
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26794040 tttcgtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26794139  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26794140 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26794239  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794240 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26794296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 31422202 - 31422454
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422202 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 31422301  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31422302 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 31422401  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 31422454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26889917 - 26889660
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26889917 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 26889818  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26889817 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 26889718  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889717 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26889660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6599179 - 6598923
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6599179 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6599080  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6599079 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaa 6598980  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598979 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 6598923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6605859 - 6605603
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6605859 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6605760  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6605759 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaa 6605660  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605659 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 6605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 10845929 - 10846184
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10845929 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 10846028  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10846029 aacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcga 10846127  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10846128 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtga 10846184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 5106529 - 5106785
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5106529 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggagcccag 5106628  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5106629 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 5106728  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5106729 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtagtgagacctagtga 5106785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 10153394 - 10153636
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10153394 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 10153493  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10153494 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 10153593  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10153594 gttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 10153636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 16623704 - 16623955
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16623704 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16623803  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16623804 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16623903  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16623904 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 16623955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16634312 - 16634061
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16634312 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16634213  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16634212 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16634113  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16634112 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16634061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16640922 - 16640671
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640922 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16640823  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16640822 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16640723  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16640722 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16640671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43161587 - 43161336
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43161587 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43161488  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43161487 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43161388  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43161387 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43161336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43167824 - 43167573
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43167824 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43167725  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43167724 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43167625  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43167624 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43167573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48423829 - 48423578
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48423829 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 48423730  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48423729 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 48423630  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48423629 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 48423578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48430607 - 48430356
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48430607 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 48430508  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48430507 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 48430408  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48430407 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 48430356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13251180 - 13250924
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13251180 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13251081  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  13251080 aacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 13250981  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250980 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 13250924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13257826 - 13257570
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13257826 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13257727  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  13257726 aacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 13257627  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257626 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 13257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 1332706 - 1332956
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1332706 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 1332805  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1332806 aacaagcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 1332904  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1332905 tctgtgtcgcgctttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 1332956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5221851 - 5221609
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5221851 ctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 5221752  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  5221751 gggagttgagtggtactcgacacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatatagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 5221652  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221651 gttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 5221609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 16747484 - 16747740
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||    
T  16747484 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagaaagcccag 16747583  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16747584 aacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcga 16747683  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747684 tctgtgtcgcacttgtagattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 16747740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 16758216 - 16758472
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | || ||    
T  16758216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagataaagcccag 16758315  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16758316 aacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcga 16758415  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758416 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 16758472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 16489319 - 16489567
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16489319 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16489418  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16489419 actttagtttgggagatgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16489518  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  16489519 tgtcgcacgtgctgatcaagagtgaacccctagttggtattaagaccta 16489567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 53380001 - 53380247
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  53380001 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53380100  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53380101 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53380199  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53380200 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagaccta 53380247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 53386653 - 53386899
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  53386653 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53386752  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53386753 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53386851  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53386852 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagaccta 53386899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 41201447 - 41201695
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  41201447 gtgtttcaacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41201546  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  41201547 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 41201646  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41201647 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 41201695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15726581 - 15726829
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  15726581 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacccagaaca 15726680  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15726681 acactagtttgggagataagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15726780  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15726781 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15726829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 23704418 - 23704666
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23704418 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23704517  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23704518 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23704617  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23704618 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaaccta 23704666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 23722874 - 23723122
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23722874 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23722973  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23722974 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23723073  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23723074 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaaccta 23723122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 23741330 - 23741578
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23741330 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23741429  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23741430 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23741529  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23741530 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaaccta 23741578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 5149627 - 5149859
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  5149627 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgggatcagattgaacccagaacaacactagttt 5149726  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  5149727 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 5149826  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5149827 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 5149859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15691927 - 15692175
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15691927 gtgtttcgacctttttagtttgaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15692026  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || | |||| | ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15692027 acactagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcataacctgaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15692126  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15692127 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15692175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 20057048 - 20057304
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  20057048 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 20057147  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  20057148 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 20057247  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20057248 tctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 20057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 20063686 - 20063942
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  20063686 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 20063785  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  20063786 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 20063885  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20063886 tctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 20063942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3691080 - 3690824
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  3691080 tttcgtgtttcgacctttttagttaaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 3690981  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  3690980 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 3690881  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  3690880 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattgggattgagacctagtga 3690824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30066409 - 30066237
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||    
T  30066409 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccag 30066310  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  30066309 aacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 30066237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 41091996 - 41092244
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41091996 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggagcagagggaacccagaaca 41092095  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     |||| ||| |  ||||||  ||| | |||||||||    
T  41092096 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagtttgtttgagtg-tagtgcgatct 41092194  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||| |||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41092195 gtgttgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 41092244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14499784 - 14499629
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  14499784 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14499685  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14499684 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcg 14499629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11070527 - 11070359
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  11070527 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 11070428  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  11070427 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 11070359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 11165179 - 11165347
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||    
T  11165179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 11165278  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  11165279 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 11165347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24188223 - 24187985
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  24188223 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24188124  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24188123 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24188024  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24188023 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 24187985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 839692 - 839455
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  839692 cttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 839593  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  839592 gggagttgacttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 839493  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  839492 tttgatcaagagtgaacccctaagtggtaatgagacct 839455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10911346 - 10911105
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  10911346 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10911247  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10911246 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10911147  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10911146 gttgatcaagagtgaacccctaattggtgttgagacctagtg 10911105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55149424 - 55149186
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  55149424 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 55149325  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  55149324 ggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 55149225  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55149224 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 55149186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10004084 - 10003843
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  10004084 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacttcagttt 10003985  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |    
T  10003984 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10003885  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10003884 gttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtg 10003843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10010731 - 10010490
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  10010731 ctttttagttggaccttgagtgtctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacttcagttt 10010632  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |    
T  10010631 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10010532  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10010531 gttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtg 10010490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10904674 - 10904433
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  10904674 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtacctagacatacctagatatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10904575  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10904574 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10904475  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10904474 gttgatcatgagtgaacccctaattggtgttgagacctagtg 10904433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 22642988 - 22643118
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  22642988 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagacttaacccagaaca 22643087  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22643088 acactagtttgggagttgagttgtactcgcc 22643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 55023304 - 55023174
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  55023304 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 55023205  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    |   |||||||| || |||||||||||||||    
T  55023204 acactagtttggaagatgagtggtactcgcc 55023174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19809485 - 19809237
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||   | ||| ||||||    
T  19809485 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaggttggacccagaaca 19809386  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  19809385 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 19809286  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| | | |||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  19809285 tgtcgcacatttggatcaagagtgaacccctttatgataatgagaccta 19809237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7986152 - 7985915
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||||  |||||||    
T  7986152 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacttagtaatgattaggaaggaatgtaagacaagattgaacctagaacaacattagttt 7986053  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7986052 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagcattttcagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7985953  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  7985952 tttgatcaagagtgaacccctta-tggtaatgagaccta 7985915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15826120 - 15825891
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| ||||||    
T  15826120 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 15826021  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  15826020 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagttttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 15825921  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  15825920 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 15825891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 17710241 - 17710396
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  17710241 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 17710340  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  17710341 actttagtttgggaattgaatggtactcgccaaggcaagtaagaactctcgcctcg 17710396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20723447 - 20723209
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  20723447 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20723348  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || || ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  20723347 ggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 20723248  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20723247 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 20723209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6608926 - 6608688
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  ||||||     
T  6608926 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 6608828  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  6608827 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatccgtgtcgcacc 6608728  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6608727 tttcgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 6608688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 15991753 - 15991908
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| | ||||    
T  15991753 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcgtttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccaaaaca 15991852  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15991853 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcg 15991908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12482875 - 12482638
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  12482875 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12482776  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12482775 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12482676  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12482675 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 12482638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 15584379 - 15584616
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  15584379 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15584478  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15584479 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15584578  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15584579 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacct 15584616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 15591037 - 15591274
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  15591037 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15591136  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15591137 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15591236  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15591237 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacct 15591274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 22670536 - 22670621
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcaga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670536 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcaga 22670621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 17252716 - 17252935
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  17252716 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 17252815  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  17252816 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 17252915  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | |||||||| ||||||||    
T  17252916 ttggatcaagagtgaacccc 17252935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15404143 - 15404390
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||      
T  15404143 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15404242  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 209  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||||| || |||||||||||    
T  15404243 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatct 15404340  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15404341 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15404390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4291218 - 4291073
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    |||||||||||  || ||||    
T  4291218 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacctagaacaacttttgttt 4291119  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4291118 gggaattgtttggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcg 4291073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5201670 - 5201433
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  5201670 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5201571  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5201570 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcacctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5201471  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5201470 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 5201433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 1145201 - 1145356
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  1145201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 1145300  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  1145301 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 1145356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 10236054 - 10236272
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| |||||||  |||||||    
T  10236054 ctttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattagg-atgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 10236152  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  10236153 gggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 10236252  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | |||||||| ||||||||    
T  10236253 ttggatcaagagtgaacccc 10236272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12891852 - 12891633
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  12891852 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 12891753  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12891752 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 12891653  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  12891652 ttggatcaagagagaacccc 12891633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 5426362 - 5426600
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  5426362 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5426461  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   | || | | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5426462 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5426561  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5426562 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 5426600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15397552 - 15397799
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||      
T  15397552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15397651  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 209  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||||| || ||||| |||||    
T  15397652 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgggatct 15397749  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15397750 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15397799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4710744 - 4710600
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||   |||    ||| |||||||  |||||||    
T  4710744 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtagggcaagattagacc-agaacaactttagttt 4710646  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4710645 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcg 4710600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 5419964 - 5420196
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  5419964 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5420063  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   | || | | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5420064 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5420163  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5420164 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 5420196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 410400 - 410555
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||  ||||||    
T  410400 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacgcagaaca 410499  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  410500 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 410555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15337889 - 15337810
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15337889 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 15343255 - 15343410
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| | ||||    
T  15343255 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 15343354  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  15343355 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 15343410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 15349898 - 15350053
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  15349898 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 15349997  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  15349998 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcacctcg 15350053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15361148 - 15360901
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||   |||    ||| ||||      
T  15361148 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaattaatgtagggcaagattagacccagaatg 15361049  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 209  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||||| || |||||||||||    
T  15361048 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggtgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatct 15360951  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15360950 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15360901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 8720805 - 8720884
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8720805 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 8720884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 9072692 - 9072771
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9072692 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 9072771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10326299 - 10326150
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  10326299 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 10326200  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgag 170  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10326199 ggtttttgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgtgag 10326150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16333618 - 16333381
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| | |||||  |||||||    
T  16333618 ctttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccataacaactttagttt 16333519  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
      |   ||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  16333518 -tgttctgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 16333420  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  16333419 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagaccta 16333381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13321418 - 13321273
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   ||   |||||||  |||||||    
T  13321418 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaattcagaacaacattagttt 13321319  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    || | | |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13321318 ggaactagtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcg 13321273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 255
Target Start/End: Original strand, 28350846 - 28351055
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  |||||| ||||||||  |   |||||||||||    
T  28350846 ttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttggggagttggcttcaactcgccatgg 28350945  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||   |    
T  28350946 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttaatcaagagtgaatccctttat 28351045  T
Q  246 ggtaatgaga 255  Q
    ||||||||||    
T  28351046 ggtaatgaga 28351055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 4588463 - 4588534
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4588463 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 4588534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12340225 - 12340154
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  12340225 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12340154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Original strand, 13315943 - 13316066
Alignment:
Q  117 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgc 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  13315943 gtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaataactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgc 13316042  T
Q  217 acttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    || | | |||||||| ||||||||    
T  13316043 acgtttggatcaagagtgaacccc 13316066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15617823 - 15617778
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15617823 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacataccta 15617778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15337702 - 15337642
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15337702 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttcatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15337642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14666078 - 14666007
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  14666078 cttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggat 14666007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14735591 - 14735520
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  14735591 cttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggat 14735520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17488317 - 17488259
Alignment:
Q  34 ccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  17488317 ccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17488259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17499799 - 17499741
Alignment:
Q  34 ccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  17499799 ccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17499741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4291044 - 4290999
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  4291044 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 4290999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 92
Target Start/End: Original strand, 12852030 - 12852083
Alignment:
Q  39 gatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  12852030 gatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12852083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 30777057 - 30777102
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  30777057 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 30777102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 7110158 - 7110118
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7110158 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7110118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 7114093 - 7114053
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7114093 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7114053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Original strand, 13315835 - 13315879
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcct 55  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13315835 gtgtttcgaccctttcagttggaccttgagtgcctttgagtgcct 13315879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14179795 - 14179727
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtag 89  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  14179795 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 14179727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14573061 - 14572993
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtag 89  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  14573061 cttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 14572993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Original strand, 15991938 - 15991982
Alignment:
Q  196 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  15991938 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 15991982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 27409293 - 27409333
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  27409293 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 27409333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 28950185 - 28950145
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28950185 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28950145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 9462 - 9718
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9462 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 9561  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9562 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcacctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 9661  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6981119 - 6980863
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6981119 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6981020  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6981019 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 6980920  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980919 tctgtgtcgcacttgttgatcgagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 6980863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 20649439 - 20649695
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20649439 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20649538  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20649539 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaatttgtttatgtgtttatgcga 20649638  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649639 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 20649695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 2869782 - 2870037
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2869782 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctt-gagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 2869880  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2869881 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 2869980  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2869981 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtga 2870037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 2876397 - 2876652
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2876397 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctt-gagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 2876495  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2876496 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 2876595  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2876596 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtga 2876652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12763158 - 12762906
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12763158 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccagaaca 12763059  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12763058 agcttagtttgggagttgagaggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 12762959  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12762958 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctagctggtaatgagacctggtga 12762906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 4233144 - 4233400
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4233144 tttcatgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgtctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 4233243  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4233244 aacaaccttattttgggagttgagtggtactcgtcatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 4233343  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233344 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 4233400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20061111 - 20060854
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20061111 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 20061012  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20061011 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccaaggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 20060912  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060911 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 20060854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8229348 - 8229097
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8229348 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8229249  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8229248 aacaagcttagtttgtgagttgagtggttctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8229149  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8229148 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8229097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18931537 - 18931286
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18931537 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 18931438  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18931437 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 18931338  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18931337 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18931286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 29593466 - 29593717
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29593466 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 29593565  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29593566 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29593665  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29593666 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29593717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 14059262 - 14059518
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14059262 tttcgtgtttcgaccctttttgttgaaccttgtatacctttgagtgcccgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14059361  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14059362 aacaagcttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcga 14059461  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14059462 tctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaaccgctaactggtattgagacctagtga 14059518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 29587325 - 29587576
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29587325 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 29587424  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29587425 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29587524  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29587525 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattcgtaatgaaacct 29587576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30597678 - 30597422
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30597678 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctgaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaaggaacccag 30597579  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30597578 aacaaccttggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaatatggaattgtttatgtgtttgtgcga 30597479  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597478 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 30597422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 27327706 - 27327954
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27327706 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27327805  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27327806 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27327905  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27327906 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 27327954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 27388446 - 27388694
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27388446 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27388545  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27388546 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27388645  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27388646 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 27388694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 30637780 - 30638026
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30637780 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 30637879  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30637880 agcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgagtatgtgtttgtgcgatctg 30637978  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30637979 tgtcgcactttttggcccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 30638026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 259
Target Start/End: Original strand, 18194212 - 18194422
Alignment:
Q  49 agtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcga 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18194212 agtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcga 18194311  T
Q  149 gtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggt 248  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  18194312 gtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggt 18194411  T
Q  249 aatgagaccta 259  Q
    | |||||||||    
T  18194412 attgagaccta 18194422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 1538604 - 1538842
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  1538604 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 1538703  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1538704 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgt 1538803  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1538804 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 1538842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 1544703 - 1544941
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  1544703 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 1544802  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1544803 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgt 1544902  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1544903 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 1544941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8797637 - 8797398
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  8797637 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 8797538  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8797537 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgcgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 8797438  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 260  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8797437 gttgatcaagagtgaacctctaattggtaatgagacctag 8797398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 27429933 - 27430184
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||||||    
T  27429933 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 27430032  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27430033 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27430132  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27430133 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 27430184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30694784 - 30694579
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694784 ttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatgg 30694685  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  30694684 cgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagggtgaacccctaact 30694585  T
Q  246 ggtaat 251  Q
     |||||    
T  30694584 agtaat 30694579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28258100 - 28258351
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  28258100 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28258199  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28258200 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28258298  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28258299 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28258351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28264724 - 28264975
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  28264724 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28264823  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28264824 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28264922  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28264923 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28264975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28336849 - 28337100
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  28336849 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28336948  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28336949 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28337047  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28337048 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28337100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28343473 - 28343724
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  28343473 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28343572  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28343573 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28343671  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28343672 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26130925 - 26130692
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26130925 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26130826  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||     |||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||    
T  26130825 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactttcgtctcgcgagctagcccaggatgtagtttgtttgagtgtttgtacgatct 26130726  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  26130725 gtgtcgcacgtgtggatcaagagcgaacccctaa 26130692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17031317 - 17031079
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || || | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||  ||||| | |||||  |||||||    
T  17031317 ctttttagttggaccttgagtgtctataactgcttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggatagaacccaaaacaacattagttt 17031218  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  17031217 gggaattgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaacagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 17031118  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17031117 attgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 17031079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22331886 - 22331648
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||||    
T  22331886 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacgttagttt 22331787  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22331786 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22331687  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22331686 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 22331648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20802202 - 20801962
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  |||||||    
T  20802202 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 20802103  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||      
T  20802102 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacga 20802004  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20802003 gttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 20801962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 17036995 - 17037233
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||  |||||||    
T  17036995 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 17037094  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    |||| || ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| ||| |  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  17037095 gggaattaagtggtacttgccatgacgagtgagaactctcgcctcgcgagcacatccagaatgtaggttgtttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacg 17037193  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17037194 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 17037233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19808973 - 19808735
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||  || ||||    
T  19808973 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctggacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagtttgaacctagaacaacattggttt 19808874  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||  ||||  || | |   ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19808873 ggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcacgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 19808774  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19808773 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19808735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 34369633 - 34369871
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||||||  |||||||    
T  34369633 ctttttagttggaccttgagtgtcattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttt 34369732  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |  | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  34369733 gtaatttgacttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcacacgt 34369832  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  34369833 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 34369871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16372280 - 16372067
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  16372280 ttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatgg 16372181  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  16372180 cgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaatt 16372081  T
Q  246 ggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||    
T  16372080 ggtaatgagaccta 16372067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28315018 - 28314786
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  ||||||     
T  28315018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 28314920  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28314919 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacc 28314820  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    | |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28314819 ttttgatcaagagtgaacccctagttggtaatga 28314786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25117900 - 25117652
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||  | ||| ||||||    
T  25117900 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagtgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25117801  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  25117800 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 25117701  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  25117700 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagaccta 25117652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34833101 - 34832956
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| |||||||  |||||||    
T  34833101 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 34833002  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34833001 gggaattgtgtggtactcgctatggcgagtaagaactctcgcctcg 34832956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27186156 - 27185918
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  ||||||     
T  27186156 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27186058  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27186057 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27185958  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27185957 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27185918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27207992 - 27207754
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  ||||||     
T  27207992 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27207894  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27207893 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27207794  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27207793 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27207754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 27241236 - 27241474
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  ||||||     
T  27241236 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27241334  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27241335 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27241434  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27241435 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27241474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 27263084 - 27263322
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||||  ||||||     
T  27263084 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27263182  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27263183 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27263282  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27263283 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27263322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 32564902 - 32565139
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  32564902 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 32565001  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  32565002 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 32565101  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32565102 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 32565139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 16551680 - 16551912
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  16551680 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16551779  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16551780 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16551879  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16551880 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16551912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16577273 - 16577041
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  16577273 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16577174  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16577173 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16577074  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16577073 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16577041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 16618107 - 16618339
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  16618107 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16618206  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16618207 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16618306  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16618307 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16618339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 16628236 - 16628468
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  16628236 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16628335  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16628336 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16628435  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16628436 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16628468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25111297 - 25111049
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||   |||  | ||| ||||||    
T  25111297 gtgtttggacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagcgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25111198  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  25111197 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 25111098  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  25111097 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagaccta 25111049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14099073 - 14098928
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| |||||||  |||||||    
T  14099073 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagttt 14098974  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14098973 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcg 14098928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28287707 - 28287565
Alignment:
Q  116 agtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcg 215  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28287707 agttggggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcg 28287609  T
Q  216 cacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28287608 catgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28287565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 3708142 - 3708291
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| |||||||  |||||||    
T  3708142 ctttttagttggaccttgagcgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagttt 3708241  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgag 170  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3708242 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgtgag 3708291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 17016582 - 17016819
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  17016582 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacacacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 17016681  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17016682 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 17016781  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17016782 tttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 17016819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14472726 - 14472558
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  14472726 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 14472627  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    | ||||||| || | |||  | ||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  14472626 accttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacatccag 14472558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 25595012 - 25595231
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||  |||  | ||| |||||||  |||||||    
T  25595012 ctttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtaggacgagattggacccagaacaactttagttt 25595111  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| || | |    |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  25595112 gggaattgttgggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25595211  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  25595212 tttgatcaagagtgaacccc 25595231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 24314729 - 24314958
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||     ||| ||||||    
T  24314729 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgctttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 24314828  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||  ||||  |  | |  |||  ||||||||||||| ||    
T  24314829 actttagtttgggaattgtttagtactcaccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttttgagtgtttgtgcgatttg 24314928  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  24314929 tgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 24314958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 31316742 - 31316971
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||   ||     ||| ||||||    
T  31316742 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtatgcctgaacatgcctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 31316841  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||  ||||  |  | |  |||  ||||||||||||| ||    
T  31316842 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttttgagtgtttgtgcgatttg 31316941  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  31316942 tgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 31316971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 34295728 - 34295834
Alignment:
Q  22 tttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttg 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||| |    
T  34295728 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgg 34295827  T
Q  122 ggagttg 128  Q
    | |||||    
T  34295828 gaagttg 34295834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22759297 - 22759061
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  22759297 ctttttagtttgaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtattgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 22759198  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatga-acttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
     ||  |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||| ||| | | |   ||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  22759197 -ggttttgtctggtacttgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttcca-gataagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtatcgcacg 22759100  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22759099 t-ttgatcaagagtgaaaccctaattggtaatgaaaccta 22759061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 24290723 - 24290802
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24290723 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcttcagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 24290802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 23276938 - 23277083
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  23276938 ctttttagttggaccttgagctcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacatcattagttt 23277037  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    || | | |    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23277038 ggaactagtcccgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcg 23277083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 111
Target Start/End: Original strand, 31164520 - 31164596
Alignment:
Q  35 cttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaa 111  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  31164520 cttggatgtccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggatgagattggacctagaacaa 31164596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 34298457 - 34298521
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34298457 gtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 34298521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Original strand, 18916926 - 18916971
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18916926 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacataccta 18916971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19871037 - 19870992
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19871037 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacataccta 19870992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4168346 - 4168226
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| | |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  4168346 ttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatgg 4168247  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||| |||| | ||||||||||    
T  4168246 cgattaaggattctcgcctcg 4168226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4209026 - 4208906
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| | |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  4209026 ttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatgg 4208927  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||| |||| | ||||||||||    
T  4208926 cgattaaggattctcgcctcg 4208906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25928565 - 25928505
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  25928565 ttgtgcgatatgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaaaccctaaatggtaatgagaccta 25928505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 15894078 - 15894145
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgta 88  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||    
T  15894078 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgta 15894145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 22334530 - 22334597
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgta 88  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||    
T  22334530 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgta 22334597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 3708316 - 3708380
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  3708316 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 3708380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 20637942 - 20638013
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  20637942 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 20638013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21939856 - 21939785
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  21939856 cttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggat 21939785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Original strand, 25611371 - 25611436
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatg 86  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||| ||||||    
T  25611371 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatg 25611436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8244317 - 8244277
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  8244317 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 8244277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 11567319 - 11567279
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  11567319 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11567279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 12618494 - 12618534
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12618494 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12618534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 22863402 - 22863362
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22863402 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22863362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23395525 - 23395485
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  23395525 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23395485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23990377 - 23990337
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  23990377 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23990337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 20215574 - 20215830
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20215574 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20215673  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20215674 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 20215773  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20215774 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaatgagacctagtga 20215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 44844528 - 44844785
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44844528 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatataggatcagagggaacccag 44844627  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaa-ccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44844628 aacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaacccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 44844727  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44844728 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 44844785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43078900 - 43078649
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078900 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43078801  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43078800 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43078701  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43078700 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43078649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 46156966 - 46157217
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46156966 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 46157065  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46157066 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 46157165  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46157166 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 46157217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Original strand, 51334957 - 51335214
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51334957 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 51335056  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  51335057 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 51335156  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335157 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 51335214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Original strand, 51328322 - 51328580
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcc-tgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51328322 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtaccctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccc 51328421  T
Q  105 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||    
T  51328422 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgc 51328521  T
Q  205 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328522 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 51328580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 41478226 - 41478475
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41478226 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 41478325  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaacc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  41478326 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccaagaatgtaattgcttgagtgtttgtgcgatct 41478425  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  41478426 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagaccta 41478475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 18599755 - 18599984
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18599755 gtgttttgacatttttagttggatcttggatgccctagagtgccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 18599854  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||   |||||||||||||||    
T  18599855 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgaatgtttgtgcgatctg 18599954  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  18599955 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 18599984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21829160 - 21828922
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  21829160 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 21829061  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21829060 gggagttgagtggtactcgccttggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacga 21828961  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21828960 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21828922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21844673 - 21844435
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  21844673 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 21844574  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21844573 gggagatgagtggtactcgccttggtgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacga 21844474  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21844473 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21844435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 16345420 - 16345676
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  16345420 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 16345519  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  16345520 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 16345619  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16345620 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 16345676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 16352068 - 16352324
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  16352068 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 16352167  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  16352168 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 16352267  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16352268 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 16352324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1011179 - 1011011
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  1011179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 1011080  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  1011079 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 1011011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 41355933 - 41356189
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  41355933 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 41356032  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  41356033 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 41356132  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41356133 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 41356189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 41348496 - 41348752
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  41348496 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 41348595  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  41348596 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 41348695  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41348696 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 41348752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23763657 - 23763419
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  23763657 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23763558  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23763557 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23763458  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23763457 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 23763419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19063963 - 19063728
Alignment:
Q  24 tttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttggg 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  |||||||||     
T  19063963 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19063864  T
Q  124 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 223  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19063863 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19063764  T
Q  224 gatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19063763 gatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19063728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19111853 - 19111618
Alignment:
Q  24 tttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttggg 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  |||||||||     
T  19111853 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19111754  T
Q  124 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 223  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19111753 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19111654  T
Q  224 gatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19111653 gatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19111618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 20524875 - 20525113
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||  |||||||    
T  20524875 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctataacaacattagttt 20524974  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  |||   || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20524975 ggaagttgattggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaaattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20525074  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20525075 tttgatcaaaagtgaatccctaattggtaatgagaccta 20525113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21438240 - 21438002
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||     
T  21438240 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21438141  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21438140 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21438041  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  21438040 tttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccta 21438002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47659663 - 47659421
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||| | |||||   ||  ||||| |||||||  | |||||    
T  47659663 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 47659564  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  47659563 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 47659464  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||    
T  47659463 gttgatcaagagtgaacccctaattagcattgagacctagtga 47659421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19105199 - 19104961
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||||  |||||||    
T  19105199 ctttttagttggaccttgagtgactttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttt 19105100  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  19105099 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 19105000  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19104999 tttgatcaaaagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19104961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44756552 - 44756314
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagc-attgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtt 119  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||    
T  44756552 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagtt 44756453  T
Q  120 tgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  44756452 gggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 44756353  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44756352 ttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 44756314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 27898319 - 27898556
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  27898319 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27898418  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27898419 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 27898518  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27898519 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 27898556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 43062936 - 43063173
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  43062936 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 43063035  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  43063036 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 43063135  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43063136 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43063173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49335018 - 49334781
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  49335018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 49334919  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  49334918 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 49334819  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49334818 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 49334781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 18625935 - 18626172
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  18625935 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18626034  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18626035 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18626133  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18626134 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 18626172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21835822 - 21835667
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||||||||||    
T  21835822 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacctagaaca 21835723  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  21835722 actttagtatgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 21835667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 33385873 - 33386028
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  33385873 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33385972  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  33385973 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 33386028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 33392517 - 33392672
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  33392517 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33392616  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  33392617 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 33392672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 50887412 - 50887631
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  50887412 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 50887511  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  50887512 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 50887611  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  50887612 ttggatcaagagagaacccc 50887631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 21806850 - 21807005
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  21806850 gtgtttcgacctttttagttggacattgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacccagaaca 21806949  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  21806950 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 21807005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33394293 - 33394056
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||    |  ||||| | |||||  ||||||     
T  33394293 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacataattgaacccaaaacaacattagttg 33394194  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  33394193 ggaatttaagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 33394094  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  33394093 tttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 33394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8305550 - 8305363
Alignment:
Q  53 cctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 152  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||    
T  8305550 cctgaatatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtctcgtactcgccatggcgagtaa 8305451  T
Q  153 gtactctcgcctcgtgagtacaaccaggat-gaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    | | ||| |||||| ||| ||  ||||| | ||   |||| | ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  8305450 gaattcttgcctcgcgagcacttccaggttagagtgtgttga-gtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 8305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 22355833 - 22355904
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  22355833 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 22355904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 22357519 - 22357590
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  22357519 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 22357590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 27250388 - 27250459
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  27250388 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 27250459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 16375107 - 16375147
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16375107 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16375147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 21407812 - 21407772
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21407812 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21407772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 52639998 - 52639958
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagt 51  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  52639998 gtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 52639958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 67964 - 67712
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67964 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 67865  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  67864 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 67765  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67764 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 67712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41983 - 41745
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||   ||||||    
T  41983 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacccagaacaacactagttt 41884  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  41883 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 41784  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41783 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 41745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 57490 - 57252
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||   ||||||    
T  57490 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaacaacactagttt 57391  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  57390 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 57291  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  57290 ggtgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 57252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7460 - 7305
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| ||||||    
T  7460 gtgtttcgacctttttagttagaccttaagtgccattgagtgcctgaacgtacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 7361  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7360 actttagtttgggaattgtttggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcg 7305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23491 - 23363
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| ||||||    
T  23491 gtgtttcgacctttttagttataccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 23392  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcg 139  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  23391 actttagtttgggaattgtttggtactcg 23363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13801 - 13756
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  13801 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 13756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23329 - 23284
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  23329 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 23284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10819 - 10568
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10819 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 10720  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10719 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 10620  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10619 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 10568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 57241 - 56990
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  57241 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 57142  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  57141 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 57042  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  57041 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 56990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 698 - 954
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  698 tttcgtgattcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 797  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  798 aacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaagttgcttgagtgtttgtgcga 897  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  898 tctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctggtga 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 261
Target Start/End: Original strand, 108970 - 109224
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  108970 tttcgtgtttcgaccttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 109069  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  109070 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcacctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcga 109169  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagt 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  109170 tctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagt 109224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 59105 - 59361
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  59105 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 59204  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59205 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 59304  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59305 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtg 59361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 139528 - 139272
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  139528 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 139429  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139428 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 139329  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139328 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtg 139272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39164 - 38913
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39164 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 39065  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39064 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 38965  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38964 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 38913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27098 - 26853
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||    
T  27098 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 26999  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  26998 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacctgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 26899  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagac 256  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  26898 tgtcgcacgtgttgatccagagtgaacccctatttggtaatgagac 26853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43737 - 43667
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43737 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 43667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 307553 - 307310
Alignment:
Q  11 gtgtttcgaccttttt-agttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaac 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  307553 gtgtttcgaccttttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaac 307454  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |  || ||  |||||||||||||||    
T  307453 aacactaatttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatct 307354  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  307353 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 307310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 125763 - 126008
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  125763 gtgtttcaacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 125862  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||| | |   ||  ||||||||||||||||    
T  125863 gcactggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctg 125962  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagac 256  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  125963 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagac 126008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Original strand, 105563 - 105773
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  105563 ttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataacagcactggtttgggagttgagtggtactcgccatgg 105662  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  105663 cgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaatt 105762  T
Q  246 ggtaatgagac 256  Q
    |||||||||||    
T  105763 ggtaatgagac 105773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Original strand, 61272 - 61317
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  61272 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacataccta 61317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Original strand, 65188 - 65233
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacataccta 66  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  65188 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacataccta 65233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 57430 - 57179
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| ||||||    
T  57430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 57331  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  57330 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 57231  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  57230 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 57179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38502 - 38246
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  38502 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 38403  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  38402 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 38303  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  38302 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 76310 - 76566
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||   ||  ||||| ||    
T  76310 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 76409  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  76410 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 76509  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  76510 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 76566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12878 - 12723
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12878 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 12779  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12778 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcg 12723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14438
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||     
T  14200 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 14299  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14300 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14399  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14400 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 14438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 242503 - 242265
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||  ||||||     
T  242503 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaacattagttg 242404  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  242403 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 242304  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  242303 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 242265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 29867 - 30105
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||| ||     
T  29867 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattatttg 29966  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  29967 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30066  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30067 tttgatcaagagtgaacccctaaatggtaatgagaccta 30105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 41863 - 41951
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaac 109  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  41863 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaac 41951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 3536 - 3694
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||||     
T  3536 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtta 3635  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  3636 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 58099 - 58316
Alignment:
Q  42 gcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||| || |||||  | |||||||||    
T  58099 gcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgcc 58198  T
Q  142 atggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccct 241  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  58199 atggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccct 58298  T
Q  242 aactggtaatgagaccta 259  Q
    || ||||||||| |||||    
T  58299 aattggtaatgaaaccta 58316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 78671 - 78515
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgta-ggatcagagggaacctagaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||   |||  | ||| |||||    
T  78671 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaagattggacccagaac 78572  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  78571 aactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcg 78515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 5459 - 5696
Alignment:
Q  22 tttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagtttg 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||  |||| |||    
T  5459 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacctaaaacaacattaggttg 5558  T
Q  122 ggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttg 221  Q
    | | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||  || | |   ||  |||||||||||||||| ||||||| |     
T  5559 gaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcactaccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtt 5658  T
Q  222 ttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5659 ttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 5696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12900 - 12745
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||  | ||| ||||||    
T  12900 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 12801  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12800 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcg 12745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3155 - 3005
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  |||||||    
T  3155 ctttttagttggaccttgagtgtttatgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacgttagttt 3056  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagt 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3055 gggaattgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagt 3005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37153 - 36916
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||   |||  ||||| ||||||   |||| ||    
T  37153 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacccagaacagcattagctt 37054  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  37053 ggaacttgacttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 36954  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36953 tttgatcaagagtgaacccctaa-tggtaatgagaccta 36916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9786 - 9548
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||     
T  9786 ctttttagttttaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 9687  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  9686 gggagttggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 9587  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  9586 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagaccta 9548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10385
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||     
T  10623 ctttttagatggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 10524  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  10523 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcacacgt 10424  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||    
T  10423 tttgatcaagagtgagtccctttatggtaatgagaccta 10385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9235 - 8998
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  9235 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 9136  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  9135 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 9036  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9035 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3218 - 3073
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||    ||| ||||||| ||||||||    
T  3218 ctttttagttggaccttgagtgcccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattagacccagaacaaccttagttt 3119  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3118 gggaattgtttggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcg 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 3738 - 3975
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  3738 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 3837  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  3838 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 3937  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3938 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 31972 - 32209
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||| | ||| |   ||  ||||| ||||||| |||||||     
T  31972 ctttttagttggatcttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttagaacaggattgaacccagaacaaccttagtt- 32070  T
Q  121 gggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32071 gggagattgagtggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtt-tttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacc 32169  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
      |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  32170 atttgatcaagagtggacccctaattggtaatgaaaccta 32209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 24635 - 24857
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||| ||  ||||||     
T  24635 ctttttagttggaccttgagtaccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaataacattagttg 24734  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||  | ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  24735 gggagttggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttctagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 24834  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  24835 gttgatcaagagtgaacccctaa 24857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19882
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaa 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  19792 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaa 19882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 8537 - 8695
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||  |||| ||    
T  8537 ctttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacccagaacaacattaggtt 8636  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccag 179  Q
    || | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  8637 ggaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcactaccag 8695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 74452 - 74297
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||    ||| ||||||    
T  74452 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 74353  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  74352 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcg 74297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22413
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||| | |||||  ||||||     
T  22650 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacacacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22551  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22550 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22451  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22450 tttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 22413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 560 - 416
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||   |||| ||||||   |||||||    
T  560 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtaggattagattaaacccagaacatcattagttt 461  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctc 165  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  460 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctc 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 61266 - 61180
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  61266 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatc 61180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 17392 - 17512
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||   |||||||    
T  17392 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagttt 17491  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    || | |||| |||||||||||    
T  17492 ggaaattgactggtactcgcc 17512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14653 - 14891
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |  ||| |||||  |||   |||| ||||||   |||||||    
T  14653 cttttcagttggactttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggaaaaatataggacaagattaaacccagaacagcattagttt 14752  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgtgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||  ||||| || | |    |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  14753 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagagctctcgccttgtgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14852  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  14853 ttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 14891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 19411 - 19475
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19411 gtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 19475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8013
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  7942 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 4790 - 4861
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  4790 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 4861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1376 - 1305
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  1376 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggat 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Original strand, 12469 - 12528
Alignment:
Q  33 accttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  12469 accttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 10383 - 10312
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  10383 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtaggat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 9482 - 9553
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  9482 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggat 9553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3943 - 3872
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  3943 cttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggat 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8007 - 7936
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  8007 cttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggat 7936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 207167 - 207238
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||  |||||||||||    
T  207167 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggat 207238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 2733 - 2804
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  2733 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 2804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13327
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  13256 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 13327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 398 - 327
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  398 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5174 - 5103
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  5174 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 5103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23355 - 23284
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  23355 cttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 23284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 24311 - 24386
Alignment:
Q  33 accttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaa 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  24311 accttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctagaa 24386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Original strand, 708 - 794
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctaga 107  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||    
T  708 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctaga 794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16741 - 16671
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||||    
T  16741 cttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 16671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Original strand, 167638 - 167724
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctaga 107  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||    
T  167638 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctaga 167724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 28935 - 29015
Alignment:
Q  28 gttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaa 108  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||    
T  28935 gttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaa 29015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34593 - 34525
Alignment:
Q  21 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtag 89  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  34593 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 34525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 92
Target Start/End: Original strand, 79999 - 80051
Alignment:
Q  40 atgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  79999 atgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 80051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University