View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6875A_low_183 (Length: 251)

Name: NF6875A_low_183
Description: NF6875A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6875A_low_183
NF6875A_low_183
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (13-232)||(44241355-44241575)
chr1 (14-231)||(29001730-29001948)
chr1 (10-232)||(9869100-9869323)
chr1 (13-232)||(31072316-31072536)
chr1 (14-238)||(4599527-4599753)
chr1 (14-232)||(1174604-1174824)
chr1 (14-232)||(6238654-6238873)
chr1 (14-232)||(39053342-39053561)
chr1 (14-232)||(39059714-39059933)
chr1 (14-232)||(42091895-42092114)
chr1 (14-232)||(45015780-45015999)
chr1 (14-232)||(26621468-26621688)
chr1 (14-232)||(41305518-41305738)
chr1 (14-232)||(44916329-44916556)
chr1 (14-205)||(27240161-27240354)
chr1 (14-232)||(41297515-41297735)
chr1 (19-232)||(11913266-11913479)
chr1 (14-232)||(43686626-43686847)
chr1 (14-232)||(32797735-32797941)
chr1 (14-232)||(41299192-41299412)
chr1 (15-217)||(1116004-1116206)
chr1 (14-147)||(23764521-23764655)
chr1 (14-172)||(5445028-5445186)
chr1 (14-231)||(28413678-28413897)
chr1 (15-231)||(39806057-39806274)
chr1 (157-232)||(23762340-23762415)
chr1 (14-214)||(38672788-38672991)
chr1 (14-231)||(2824824-2825042)
chr1 (101-236)||(47646755-47646892)
chr1 (14-230)||(23251342-23251568)
chr1 (124-231)||(5357752-5357861)
chr1 (188-235)||(9316137-9316184)
chr1 (124-231)||(45620149-45620258)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (7-232)||(2637-2863)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (13-232)||(37026046-37026266)
chr7 (14-232)||(26601911-26602130)
chr7 (14-232)||(15914637-15914856)
chr7 (14-232)||(39432907-39433125)
chr7 (14-232)||(15949158-15949377)
chr7 (14-232)||(3924097-3924316)
chr7 (14-232)||(36875544-36875763)
chr7 (14-232)||(5049916-5050135)
chr7 (14-232)||(14287714-14287933)
chr7 (15-232)||(14298900-14299118)
chr7 (14-232)||(6795437-6795656)
chr7 (14-232)||(23612388-23612607)
chr7 (14-232)||(9642920-9643141)
chr7 (13-232)||(45433583-45433804)
chr7 (14-232)||(1948637-1948857)
chr7 (14-232)||(6020868-6021088)
chr7 (14-232)||(8185396-8185616)
chr7 (14-232)||(8192956-8193176)
chr7 (14-232)||(48353484-48353704)
chr7 (14-232)||(2446645-2446864)
chr7 (32-232)||(21642535-21642736)
chr7 (14-232)||(19089806-19090026)
chr7 (14-232)||(48347100-48347320)
chr7 (15-232)||(33850647-33850865)
chr7 (14-232)||(5056311-5056531)
chr7 (14-232)||(1378946-1379165)
chr7 (14-232)||(8142450-8142669)
chr7 (14-231)||(10831130-10831349)
chr7 (14-231)||(11024922-11025141)
chr7 (14-231)||(21901193-21901413)
chr7 (162-232)||(13774134-13774204)
chr7 (13-65)||(1942043-1942095)
chr7 (170-231)||(27954243-27954303)
chr7 (188-231)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (14-232)||(13671821-13672040)
chr6 (17-232)||(27670096-27670312)
chr6 (14-232)||(31547894-31548113)
chr6 (14-232)||(32328497-32328716)
chr6 (14-232)||(1428427-1428646)
chr6 (14-232)||(34711561-34711780)
chr6 (14-232)||(9864764-9864984)
chr6 (14-232)||(4186684-4186903)
chr6 (14-232)||(11058154-11058373)
chr6 (17-232)||(21262578-21262795)
chr6 (14-232)||(4020239-4020459)
chr6 (14-232)||(4026665-4026885)
chr6 (14-232)||(34655249-34655469)
chr6 (14-232)||(34648798-34649018)
chr6 (14-232)||(4738327-4738547)
chr6 (24-232)||(7069706-7069916)
chr6 (13-169)||(29906888-29907045)
chr6 (13-169)||(30117335-30117492)
chr6 (14-141)||(7062578-7062707)
chr6 (93-231)||(1167485-1167630)
chr6 (38-231)||(10081567-10081762)
chr6 (174-232)||(7062520-7062578)
chr6 (95-231)||(9846601-9846738)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (14-232)||(22359963-22360182)
chr5 (15-232)||(4973563-4973781)
chr5 (14-232)||(22313829-22314048)
chr5 (15-232)||(5876218-5876436)
chr5 (14-232)||(34357292-34357511)
chr5 (14-232)||(34359083-34359302)
chr5 (14-232)||(2957857-2958077)
chr5 (14-232)||(2966326-2966546)
chr5 (14-232)||(29980458-29980677)
chr5 (14-232)||(30041248-30041467)
chr5 (14-232)||(40958621-40958840)
chr5 (14-232)||(25894653-25894873)
chr5 (13-232)||(2438799-2439018)
chr5 (14-232)||(42150817-42151037)
chr5 (14-232)||(12505769-12505996)
chr5 (14-232)||(29414673-29414892)
chr5 (14-231)||(33794091-33794309)
chr5 (14-231)||(9843348-9843566)
chr5 (14-231)||(2156125-2156341)
chr5 (125-236)||(19853475-19853588)
chr5 (124-231)||(12918955-12919064)
chr5 (124-231)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (14-232)||(21341886-21342105)
chr2 (17-232)||(2021452-2021668)
chr2 (14-232)||(21331998-21332217)
chr2 (14-232)||(42931376-42931595)
chr2 (14-232)||(16856491-16856709)
chr2 (14-232)||(12950795-12951014)
chr2 (14-232)||(16817334-16817552)
chr2 (14-232)||(36782188-36782408)
chr2 (14-232)||(34834816-34835035)
chr2 (14-232)||(34841260-34841479)
chr2 (14-232)||(29484925-29485145)
chr2 (14-232)||(45011981-45012201)
chr2 (13-232)||(2164026-2164246)
chr2 (14-232)||(15852548-15852768)
chr2 (14-232)||(43267857-43268077)
chr2 (14-232)||(2157611-2157830)
chr2 (14-232)||(13901961-13902180)
chr2 (14-232)||(21067962-21068181)
chr2 (87-232)||(45700648-45700793)
chr2 (13-231)||(41455604-41455823)
chr2 (72-231)||(11909955-11910116)
chr2 (72-231)||(17784443-17784604)
chr2 (89-236)||(13162892-13163041)
chr2 (72-231)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (13-232)||(16405340-16405564)
chr4 (14-232)||(55462776-55462995)
chr4 (14-232)||(16838363-16838581)
chr4 (14-232)||(27590304-27590523)
chr4 (13-232)||(41372984-41373205)
chr4 (14-232)||(37368318-37368538)
chr4 (14-232)||(13594105-13594326)
chr4 (14-232)||(7780406-7780625)
chr4 (14-232)||(8103880-8104100)
chr4 (14-232)||(30238259-30238478)
chr4 (14-232)||(17456853-17457073)
chr4 (42-231)||(30211541-30211731)
chr4 (19-232)||(36754795-36755017)
chr4 (89-231)||(5660554-5660696)
chr4 (13-213)||(13003809-13004011)
chr4 (14-231)||(2947844-2948062)
chr4 (14-110)||(48914898-48914996)
chr4 (14-46)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (14-232)||(12768743-12768962)
chr8 (14-232)||(11358197-11358417)
chr8 (14-232)||(7311348-7311567)
chr8 (14-232)||(8013324-8013543)
chr8 (14-232)||(36005486-36005705)
chr8 (13-232)||(36075965-36076185)
chr8 (14-232)||(36425734-36425954)
chr8 (14-232)||(6464580-6464799)
chr8 (20-232)||(15012393-15012606)
chr8 (14-232)||(36021803-36022023)
chr8 (14-232)||(41242120-41242339)
chr8 (14-232)||(1238212-1238432)
chr8 (14-232)||(16710672-16710892)
chr8 (10-231)||(31017394-31017603)
chr8 (93-232)||(26250595-26250734)
chr8 (44-228)||(45068424-45068609)
chr8 (14-231)||(7933931-7934150)
chr8 (14-67)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (14-232)||(4311490-4311709)
chr3 (13-232)||(10941308-10941528)
chr3 (14-232)||(32746369-32746588)
chr3 (14-232)||(6036265-6036484)
chr3 (14-232)||(24179072-24179292)
chr3 (13-232)||(9570552-9570774)
chr3 (14-232)||(27501971-27502191)
chr3 (14-232)||(13014985-13015204)
chr3 (13-232)||(9577054-9577276)
chr3 (14-232)||(43995068-43995296)
chr3 (14-232)||(25893229-25893454)
chr3 (14-232)||(43931581-43931795)
chr3 (13-232)||(23068462-23068682)
chr3 (14-140)||(41353860-41353987)
chr3 (89-226)||(20651135-20651272)
chr3 (14-164)||(41354142-41354293)
chr3 (13-231)||(4590792-4591012)
chr3 (13-80)||(3577095-3577162)
chr3 (13-231)||(20952759-20952987)
chr3 (124-231)||(4644354-4644463)
chr3 (174-231)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-232)||(49689-49908)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (13-232)||(15169-15389)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (14-232)||(5009-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (14-232)||(3268-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (14-232)||(8885-9105)
scaffold0510 (14-232)||(2564-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (95-232)||(12014-12151)
scaffold0513 (14-78)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (14-120)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (13-213)||(24268-24470)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 44241355 - 44241575
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44241355 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggcgtg 44241454  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44241455 aaacttgttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 44241554  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44241555 caacaccattcgtgtccaaac 44241575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 29001730 - 29001948
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29001730 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaa 29001829  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29001830 aacttgttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29001929  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  29001930 aacactattcatgtccaaa 29001948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 9869100 - 9869323
Alignment:
Q  10 catagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  9869100 cataaaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggt 9869199  T
Q  109 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9869200 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccct 9869299  T
Q  209 caacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    | |||||| | |||||||||||||    
T  9869300 cgacaacatctttcgtgtccaaac 9869323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 31072316 - 31072536
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  31072316 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatg 31072415  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31072416 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 31072515  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31072516 caacaccattcgtgtccaaac 31072536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 4599527 - 4599753
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  4599527 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 4599626  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4599627 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4599726  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacgatact 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4599727 caacaccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 1174604 - 1174824
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1174604 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 1174703  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1174704 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1174803  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1174804 caacaccattcgtgtccaaac 1174824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 6238654 - 6238873
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6238654 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6238753  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238754 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6238853  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6238854 aacaccattcgtgtccaaac 6238873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39053561 - 39053342
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39053561 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39053462  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39053461 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39053362  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  39053361 aacactattcgtgtccaaac 39053342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39059933 - 39059714
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39059933 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39059834  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39059833 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39059734  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  39059733 aacactattcgtgtccaaac 39059714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 42091895 - 42092114
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  42091895 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 42091994  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42091995 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42092094  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42092095 aacaccattcgtgtccaaac 42092114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 45015780 - 45015999
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  45015780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 45015879  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45015880 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 45015979  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45015980 aacaccattcgtgtccaaac 45015999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 26621468 - 26621688
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  26621468 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 26621567  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26621568 aaacttgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 26621667  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26621668 caacaccattcgtgtccaaac 26621688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41305738 - 41305518
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41305738 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41305639  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41305638 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 41305539  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  41305538 caacaccattcatgtccaaac 41305518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 44916329 - 44916556
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaata 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  44916329 gaccattcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaata 44916428  T
Q  105 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916429 aggcgtgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtat 44916528  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44916529 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaac 44916556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27240354 - 27240161
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  27240354 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtg 27240255  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240254 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 41297515 - 41297735
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  41297515 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41297614  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41297615 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 41297714  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41297715 caacaccattcgtgtccaaac 41297735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913266
Alignment:
Q  19 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  116 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  216 accattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaac 11913266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 43686626 - 43686847
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  43686626 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 43686725  T
Q  111 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43686726 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcg 43686825  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43686826 acaacaccattcgtgtccaaac 43686847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 32797735 - 32797941
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||    
T  32797735 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaa 32797821  T
Q  114 a-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32797822 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32797921  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  32797922 aacacaattcgtgtccaaac 32797941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41299412 - 41299192
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41299412 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41299313  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41299312 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 41299213  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  41299212 caacaccattcttttccaaac 41299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1116206 - 1116004
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1116206 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaa 1116108  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1116107 acttcttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 1116008  T
Q  214 acac 217  Q
    ||||    
T  1116007 acac 1116004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23764655 - 23764521
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23764655 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 23764556  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtc 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23764555 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5445186 - 5445028
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5445186 gaccgttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtga 5445088  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445087 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28413897 - 28413678
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  28413897 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 28413799  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||    
T  28413798 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctca 28413699  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  28413698 acaagattattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 39806057 - 39806274
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  39806057 accgtttgacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgt-aa 39806154  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  39806155 aaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 39806254  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  39806255 caagattattcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762340
Alignment:
Q  157 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaac 23762340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38672991 - 38672788
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  38672991 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 38672893  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||    || | |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  38672892 aaaaacattggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 38672793  T
Q  210 aacaa 214  Q
    |||||    
T  38672792 aacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2825042 - 2824824
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  2825042 gaccattcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aa 2824944  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| ||  |||| ||| |||||||| |||     ||||||||||||||| |||||    
T  2824943 aaacgttggaattagagttccttgattatgcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttacccatattatcacgtatcgctcaa 2824844  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||| |  |||| ||||||||    
T  2824843 caagattattcatgtccaaa 2824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646892
Alignment:
Q  101 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  199 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacgata 236  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaacatcattcatgtctaaatgata 47646892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 23251342 - 23251568
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||     |||  ||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  23251342 gaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaaagagtagttgtttgtttgtttgtaactaagttaactaattcgcaagaataaaagttgagagtaata 23251441  T
Q  105 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttctttgatattatcacgt 202  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  23251442 aggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgt 23251540  T
Q  203 atccctcaacaacaccattcgtgtccaa 230  Q
    ||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23251541 atcgctcaacaagattattcgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  124 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 9316137 - 9316184
Alignment:
Q  188 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacgat 235  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9316137 ttgatattatcacatattgctcaacaacatcattcgtgtccaaacgat 9316184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45620149
Alignment:
Q  124 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  |||    
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  45620158 cgtgtccaaa 45620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Original strand, 2637 - 2863
Alignment:
Q  7 taccatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2637 taccacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataa 2736  T
Q  106 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2737 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatc 2836  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||    
T  2837 cctcgacaacaccattcgtatccaaac 2863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 37026046 - 37026266
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37026046 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 37026145  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37026146 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 37026245  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37026246 caacaccattcgtgtccaaac 37026266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 26601911 - 26602130
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26601911 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 26602010  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602011 aacttgttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 26602110  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  26602111 aacactattcgtgtccaaac 26602130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 15914637 - 15914856
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15914637 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15914736  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15914737 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15914836  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  15914837 aacactattcgtgtccaaac 15914856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 39432907 - 39433125
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39432907 gaccgttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaa 39433006  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39433007 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 39433106  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaac 232  Q
    || ||||||||||||||||    
T  39433107 acgccattcgtgtccaaac 39433125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 15949158 - 15949377
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15949158 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15949257  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15949258 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15949357  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  15949358 aacactattcgtgtccaaac 15949377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3924316 - 3924097
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  3924316 gaccgttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 3924217  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3924216 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3924117  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3924116 aacaccattcgtgtccaaac 3924097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 36875544 - 36875763
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36875544 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36875643  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36875644 aacttgttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36875743  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36875744 aacaccattcgtgtccaaac 36875763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5050135 - 5049916
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5050135 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5050036  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5050035 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5049936  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5049935 aacaccattcgtgtccaaac 5049916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 14287714 - 14287933
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14287714 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 14287813  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14287814 atcttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 14287913  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14287914 aacaccattcgtgtccaaac 14287933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 14298900 - 14299118
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14298900 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaa 14298999  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299000 acttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 14299099  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14299100 acaccattcgtgtccaaac 14299118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 6795437 - 6795656
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6795437 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6795536  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795537 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6795636  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6795637 aacaccattcgtgtccaaac 6795656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 23612388 - 23612607
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  23612388 gaccgttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 23612487  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23612488 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 23612587  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  23612588 aacactattcgtgtccaaac 23612607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9643141 - 9642920
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  9643141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 9643042  T
Q  111 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9643041 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 9642942  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9642941 acaacaccattcgtgtccaaac 9642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 45433583 - 45433804
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| |||||||||||     
T  45433583 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgta 45433682  T
Q  112 aaa-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  45433683 aaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcg 45433782  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45433783 acaacaccattcgtgtccaaac 45433804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1948857 - 1948637
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948857 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtg 1948758  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1948757 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcga 1948658  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  1948657 caacactattcgtgtccaaac 1948637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6021088 - 6020868
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6021088 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 6020989  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6020988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 6020889  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  6020888 caacactattcgtgtccaaac 6020868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8185616 - 8185396
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8185616 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8185517  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8185516 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8185417  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  8185416 caacactattcgtgtccaaac 8185396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8193176 - 8192956
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8193176 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8193077  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8192977  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  8192976 caacactattcgtgtccaaac 8192956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48353704 - 48353484
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  48353704 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 48353605  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353604 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48353505  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  48353504 caacactattcgtgtccaaac 48353484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 2446645 - 2446864
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2446645 gaccattcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 2446744  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446745 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2446844  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2446845 aacaccattcgtgtccaaac 2446864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642736
Alignment:
Q  32 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  131 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 230  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  231 ac 232  Q
    ||    
T  21642735 ac 21642736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 19089806 - 19090026
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  19089806 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 19089905  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089906 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 19090005  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  19090006 caacactattcgtgtccaaac 19090026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48347320 - 48347100
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  48347320 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatg 48347221  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48347220 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48347121  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  48347120 caacactattcgtgtccaaac 48347100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33850865 - 33850647
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||    
T  33850865 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaa 33850766  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33850765 acttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 33850666  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33850665 acaccattcgtgtccaaac 33850647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5056531 - 5056311
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  5056531 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 5056432  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5056431 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 5056332  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5056331 caacaccattcgtgtccaaac 5056311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 1378946 - 1379165
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  1378946 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 1379045  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1379046 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 1379145  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1379146 aacaccattcgtgtccaaac 1379165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8142669 - 8142450
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  8142669 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 8142570  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8142569 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 8142470  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8142469 aacaccattcgtgtccaaac 8142450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10831349 - 10831130
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  10831349 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 10831251  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  10831250 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 10831151  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  10831150 acaagattattcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11025141 - 11024922
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  11025141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 11025043  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  11025042 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 11024943  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  11024942 acaagattattcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21901413 - 21901193
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  21901413 gaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt- 21901315  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||   ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  21901314 aaaaacgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 21901215  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  21901214 aacaagattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774134
Alignment:
Q  162 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaac 13774134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1942043 - 1942095
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942043 agaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  170 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  188 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13672040 - 13671821
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13672040 gaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtga 13671941  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13671940 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13671841  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  13671840 aacactattagtgtccaaac 13671821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 27670096 - 27670312
Alignment:
Q  17 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27670096 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaac 27670195  T
Q  116 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670196 ttgttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 27670295  T
Q  216 accattcgtgtccaaac 232  Q
    | |||||||||||||||    
T  27670296 atcattcgtgtccaaac 27670312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 31547894 - 31548113
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31547894 gaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 31547993  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31547994 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 31548093  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  31548094 aacactattcgtgtccaaac 31548113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32328716 - 32328497
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32328716 gaccgttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32328617  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328616 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32328517  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32328516 aacaccattcgtgtccaaac 32328497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1428646 - 1428427
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1428646 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 1428547  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1428546 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 1428447  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1428446 aacaccattcgtgtccaaac 1428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34711780 - 34711561
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34711780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34711681  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34711680 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34711581  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34711580 aacaccattcgtgtccaaac 34711561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9864984 - 9864764
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9864984 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 9864885  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864884 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 9864785  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  9864784 caatactattcgtgtccaaac 9864764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 4186684 - 4186903
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||      
T  4186684 gaccgttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtag 4186783  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4186784 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgac 4186883  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4186884 aacaccattcgtgtccaaac 4186903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11058373 - 11058154
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  11058373 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 11058274  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11058273 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 11058174  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11058173 aacaccattcgtgtccaaac 11058154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21262795 - 21262578
Alignment:
Q  17 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21262795 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa 21262696  T
Q  115 cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262695 cttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaa 21262596  T
Q  215 caccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21262595 caccattcgtgtccaaac 21262578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4020459 - 4020239
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4020459 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4020360  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4020359 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4020260  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  4020259 caacactattcgtgtccaaac 4020239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4026885 - 4026665
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4026885 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4026786  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026785 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4026686  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  4026685 caacactattcgtgtccaaac 4026665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 34655249 - 34655469
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34655249 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34655348  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34655349 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34655448  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  34655449 caacactattcgtgtccaaac 34655469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 34648798 - 34649018
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34648798 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34648897  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34648898 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34648997  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  34648998 caacactattcgtgtccaaac 34649018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4738547 - 4738327
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4738547 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4738448  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4738447 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 4738348  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  4738347 caacactattcgagtccaaac 4738327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069706
Alignment:
Q  24 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 121  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  122 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  222 cgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaac 7069706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 29906888 - 29907045
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29906888 agaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtg 29906987  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30117492 - 30117335
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30117492 agaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtg 30117393  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117392 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7062707 - 7062578
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7062707 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 7062608  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatca 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062607 aaacttgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167485
Alignment:
Q  93 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------t 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       |    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttat 1167531  T
Q  186 ctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  1167530 tttttatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaa 1167485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  38 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagtt-gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  137 gatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062520
Alignment:
Q  174 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaac 7062520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Original strand, 9846601 - 9846738
Alignment:
Q  95 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgat 192  Q
    |||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || || |||| | ||  |||||||||| |||  | |||    
T  9846601 gagattaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatacggattctagcattttatcgat 9846699  T
Q  193 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9846700 attatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaa 9846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 22359963 - 22360182
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22359963 gaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22360062  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22360063 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22360162  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  22360163 aacactattcgtgtccaaac 22360182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 4973563 - 4973781
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4973563 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaa 4973662  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4973663 acttgttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgaca 4973762  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  4973763 acatcattcgtgtccaaac 4973781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 22313829 - 22314048
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22313829 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22313928  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22313929 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22314028  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  22314029 aacactattcgtgtccaaac 22314048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 5876218 - 5876436
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5876218 accgttcaacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaa 5876317  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5876318 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgaca 5876417  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5876418 acactattcgtgtccaaac 5876436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34357511 - 34357292
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34357511 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34357412  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357411 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34357312  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34357311 aacaccattcgtgtccaaac 34357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34359302 - 34359083
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34359302 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34359203  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359202 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34359103  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34359102 aacaccattcgtgtccaaac 34359083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 2957857 - 2958077
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2957857 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2957956  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2957957 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2958056  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  2958057 caacactattcgtgtccaaac 2958077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 2966326 - 2966546
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2966326 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2966425  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2966426 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2966525  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  2966526 caacactattcgtgtccaaac 2966546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 29980458 - 29980677
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  29980458 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 29980557  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29980558 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29980657  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29980658 aacaccattcgtgtccaaac 29980677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30041467 - 30041248
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  30041467 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 30041368  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30041367 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 30041268  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30041267 aacaccattcgtgtccaaac 30041248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40958840 - 40958621
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  40958840 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 40958741  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40958740 cacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgac 40958641  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  40958640 aacactattcgtgtccaaac 40958621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25894873 - 25894653
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25894873 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25894774  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894773 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 25894674  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  25894673 caacactattcgtgtccaaac 25894653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 2438799 - 2439018
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2438799 agaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggcgtg 2438898  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2438899 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2438997  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  2438998 caacatcatttgtgtccaaac 2439018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 42150817 - 42151037
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  42150817 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 42150916  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42150917 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 42151016  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  42151017 caacactattcgtgtccaaac 42151037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12505996 - 12505769
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaata 104  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12505996 gacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaata 12505897  T
Q  105 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505896 aggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtat 12505797  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12505796 ccctcgacaacatcattcgtgtccaaac 12505769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29414892 - 29414673
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |    
T  29414892 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaa 29414793  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29414792 aacttattaggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29414693  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||| ||||| ||| |||||    
T  29414692 aacatcattcatgttcaaac 29414673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 33794091 - 33794309
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  33794091 gaccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 33794188  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||  |||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  33794189 aaaatgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctca 33794288  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||| ||||||    
T  33794289 acaagattattcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 9843348 - 9843566
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9843348 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 9843446  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  9843447 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 9843546  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  9843547 caagattattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2156341 - 2156125
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  2156341 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaa 2156245  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  2156244 aaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctca 2156146  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  2156145 acaagattattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853475
Alignment:
Q  125 ttagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 222  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  223 gtgtccaaacgata 236  Q
     |||| ||| ||||    
T  19853488 atgtctaaatgata 19853475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12919064 - 12918955
Alignment:
Q  124 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||| | ||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12919064 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacctaataaccacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactatt 12918965  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  12918964 cgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  124 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21342105 - 21341886
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21342105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21342006  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342005 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21341906  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21341905 aacaccattcatgtccaaac 21341886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2021668 - 2021452
Alignment:
Q  17 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  2021668 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaac 2021569  T
Q  116 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2021568 ttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 2021469  T
Q  216 accattcgtgtccaaac 232  Q
    || ||||||||||||||    
T  2021468 actattcgtgtccaaac 2021452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21332217 - 21331998
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21332217 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21332118  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21332117 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21332018  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21332017 aacaccattcatgtccaaac 21331998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42931595 - 42931376
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42931595 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 42931496  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42931495 aacttgttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42931396  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  42931395 aacactattcgtgtccaaac 42931376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16856709 - 16856491
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16856709 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16856611  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16856610 nacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16856511  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16856510 aacaccattcgtgtccaaac 16856491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 12950795 - 12951014
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12950795 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 12950894  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12950895 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 12950994  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12950995 aacaccattcgtgtccaaac 12951014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16817552 - 16817334
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16817552 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16817454  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16817453 cacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16817354  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16817353 aacaccattcgtgtccaaac 16817334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36782408 - 36782188
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36782408 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36782309  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36782308 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36782209  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36782208 caacaccattcgtgtccaaac 36782188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34835035 - 34834816
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34835035 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34834936  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834935 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34834836  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34834835 aacaccattcgtgtccaaac 34834816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34841479 - 34841260
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34841479 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34841380  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841379 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34841280  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34841279 aacaccattcgtgtccaaac 34841260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 29484925 - 29485145
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  29484925 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 29485024  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29485025 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 29485124  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  29485125 caacactattcgtgtccaaac 29485145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 45011981 - 45012201
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  45011981 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 45012080  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45012081 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 45012180  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  45012181 caacactattcgtgtccaaac 45012201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 2164026 - 2164246
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||     
T  2164026 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgta 2164125  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2164126 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2164225  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2164226 caacaccattcgtgtccaaac 2164246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 15852548 - 15852768
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15852548 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 15852647  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852648 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 15852747  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  15852748 caacactattcgtgtccaaac 15852768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 43267857 - 43268077
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  43267857 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 43267956  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43267957 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 43268056  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43268057 caacaccattcgtgtccaaac 43268077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 2157611 - 2157830
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  2157611 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 2157710  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157711 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2157810  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2157811 aacaccattcgtgtccaaac 2157830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13902180 - 13901961
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  13902180 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 13902081  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13902080 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 13901981  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13901980 aacaccattcgtgtccaaac 13901961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21068181 - 21067962
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || |||    
T  21068181 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtg 21068082  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068081 aaactt-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 21067983  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21067982 caacaccattcgtgtccaaac 21067962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700648
Alignment:
Q  87 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  187 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaac 45700648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 41455604 - 41455823
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  41455604 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 41455702  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| ||||    
T  41455703 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcactca 41455802  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  41455803 acaagattattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909955
Alignment:
Q  72 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatac 169  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  170 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  || |||| |  |||||||||||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaa 11909955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  72 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 168  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  ||    
T  17784604 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacata 17784506  T
Q  169 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
     ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17784505 tatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163041
Alignment:
Q  89 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  187 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacgata 236  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtctaaatgata 13163041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17789096
Alignment:
Q  72 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 168  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  ||    
T  17789257 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacata 17789159  T
Q  169 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
     |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17789158 tatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 16405340 - 16405564
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16405340 agaccgttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgta 16405439  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacgtatccc 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||    
T  16405440 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtatccc 16405539  T
Q  208 tcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  16405540 tcgacaacaccattcgtgtccaaac 16405564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55462995 - 55462776
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55462995 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 55462896  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55462895 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 55462796  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  55462795 aacactattcgtgtccaaac 55462776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16838581 - 16838363
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  16838581 gaccgttagacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 16838483  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16838482 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgac 16838383  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16838382 aacaccattcgtgtccaaac 16838363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 27590304 - 27590523
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27590304 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 27590403  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27590404 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 27590503  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27590504 aacactattcgtgtccaaac 27590523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 41372984 - 41373205
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  41372984 agaccgttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 41373083  T
Q  111 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41373084 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 41373183  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  41373184 acaacatcattcgtgtccaaac 41373205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37368538 - 37368318
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37368538 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 37368439  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37368438 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 37368339  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  37368338 caacactattcgtgtccaaac 37368318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 13594105 - 13594326
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  13594105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 13594204  T
Q  111 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594205 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 13594304  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13594305 acaacaccattcgtgtccaaac 13594326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 7780406 - 7780625
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  7780406 gaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgta 7780504  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7780505 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 7780604  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  7780605 caacatcattcgtgtccaaac 7780625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 8103880 - 8104100
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8103880 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8103979  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103980 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8104079  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  8104080 caacactattcgtgtccaaac 8104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 30238259 - 30238478
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  30238259 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 30238358  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  30238359 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgac 30238458  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  30238459 aacactattcgtgtccaaac 30238478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 17456853 - 17457073
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||    
T  17456853 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtg 17456952  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17456953 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 17457052  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  17457053 caacactattcatgtccaaac 17457073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30211731 - 30211541
Alignment:
Q  42 gttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30211731 gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatc 30211632  T
Q  141 aagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30211631 aagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaa 30211541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754795
Alignment:
Q  19 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  110 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaac 36754795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660554
Alignment:
Q  89 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  189 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaa 5660554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13004011 - 13003809
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  13004011 agactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 13003913  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  13003912 aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactc 13003813  T
Q  210 aaca 213  Q
    ||||    
T  13003812 aaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 2947844 - 2948062
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2947844 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 2947942  T
Q  114 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  2947943 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 2948042  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  2948043 caagattattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Original strand, 48914898 - 48914996
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914898 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5660775 - 5660743
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5660775 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaa 5660743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 12768743 - 12768962
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768743 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtga 12768842  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12768843 aacttgttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgac 12768942  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    || |||||||||||||||||    
T  12768943 aagaccattcgtgtccaaac 12768962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11358417 - 11358197
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  11358417 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 11358318  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11358317 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 11358218  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  11358217 caacactattcgtgtccaaac 11358197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 7311348 - 7311567
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  7311348 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 7311447  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311448 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 7311547  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7311548 aacaccattcgtgtccaaac 7311567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8013543 - 8013324
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8013543 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 8013444  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013443 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 8013344  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8013343 aacaccattcgtgtccaaac 8013324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36005705 - 36005486
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36005705 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36005606  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36005605 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36005506  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36005505 aacaccattcgtgtccaaac 36005486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 36075965 - 36076185
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36075965 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36076064  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36076065 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36076164  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36076165 caacaccattcgtgtccaaac 36076185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36425954 - 36425734
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  36425954 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 36425855  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36425854 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36425755  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  36425754 caacactattcgtgtccaaac 36425734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6464799 - 6464580
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6464799 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6464700  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6464699 aactcgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6464600  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6464599 aacaccattcgtgtccaaac 6464580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012606
Alignment:
Q  20 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  119 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 218  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  219 attcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaac 15012606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36022023 - 36021803
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36022023 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36021924  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36021923 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36021824  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36021823 caacaccattcgtgtccaaac 36021803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41242339 - 41242120
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  41242339 gaccgtttgacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 41242240  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41242239 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 41242140  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41242139 aacaccattcgtgtccaaac 41242120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 1238212 - 1238432
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  ||||     
T  1238212 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgta 1238311  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238312 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1238411  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  1238412 caacactattcgtgtccaaac 1238432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16710892 - 16710672
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| |     
T  16710892 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcata 16710793  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710792 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 16710693  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16710692 caacaccattcgtgtccaaac 16710672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 31017394 - 31017603
Alignment:
Q  10 catagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || ||||||||||    
T  31017394 catagaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataaggcg 31017479  T
Q  110 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccc 207  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31017480 tgaaactagttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccc 31017579  T
Q  208 tcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  31017580 tcgacaacaccattcgtgtccaaa 31017603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250595
Alignment:
Q  93 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  193 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaac 26250595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068424
Alignment:
Q  44 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  143 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtcc 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtcc 45068424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7934150 - 7933931
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  7934150 gaccgttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaa 7934051  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  7934050 aaaca-ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 7933952  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  7933951 acaagattattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 14393733 - 14393786
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393733 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4311709 - 4311490
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4311709 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 4311610  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4311609 aacttgttaggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 4311510  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  4311509 aacactattcgtgtccaaac 4311490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10941528 - 10941308
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10941528 agaccgtttgacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtg 10941429  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10941428 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 10941329  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10941328 caacaccattcgtgtccaaac 10941308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 32746369 - 32746588
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32746369 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32746468  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32746469 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32746568  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  32746569 aacactattcgtgtccaaac 32746588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 6036265 - 6036484
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6036265 gaccgtttgacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 6036364  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6036365 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6036464  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  6036465 aacactattcgtgtccaaac 6036484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 24179072 - 24179292
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24179072 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 24179171  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24179172 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 24179271  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  24179272 caacactattcgtgtccaaac 24179292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9570774 - 9570552
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9570774 agaccgttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9570675  T
Q  110 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570674 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9570575  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9570574 aacaataccattcgtgtccaaac 9570552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27501971
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27502191 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 27502092  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502091 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 27501992  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  27501991 caacactattcgtgtccaaac 27501971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 13014985 - 13015204
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |    
T  13014985 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaa 13015084  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015085 aacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13015184  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13015185 aacactattcgtgtccaaac 13015204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9577276 - 9577054
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9577276 agaccgttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9577177  T
Q  110 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9577176 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9577077  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9577076 aacaataccattcgtgtccaaac 9577054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 43995068 - 43995296
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaata 104  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  43995068 gaccattcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaata 43995167  T
Q  105 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgta 203  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43995168 aggcgtgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgta 43995267  T
Q  204 tccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43995268 tccctcgacaacaccattcgtgtccaaac 43995296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 25893229 - 25893454
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25893229 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25893328  T
Q  112 aaacttgttagtattagagtt-----ccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893329 aaacttgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 25893428  T
Q  207 ctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  25893429 ctcaacaatactattcgtgtccaaac 25893454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 43931581 - 43931795
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43931581 gaccgtccgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtga 43931680  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  43931681 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcg 43931773  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  43931774 acaacaccattcgtgttcaaac 43931795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 23068462 - 23068682
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcg 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| ||||    
T  23068462 agaccgttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg 23068561  T
Q  110 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068562 -gaaacttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctc 23068659  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  23068660 gacaacaccattcgtgtccaaac 23068682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 41353860 - 41353987
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41353860 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaa 41353959  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatc 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41353960 aacttgttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20651272 - 20651135
Alignment:
Q  89 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20651272 aaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctt 20651173  T
Q  189 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651172 tgatattatcacgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41354293 - 41354142
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41354293 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 41354195  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354194 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 4590792 - 4591012
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| |||||     
T  4590792 agaccgttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgt- 4590890  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||   ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  4590891 aaaaacgttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 4590990  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  4590991 aacaagattattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3577162 - 3577095
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577162 agaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20952987 - 20952759
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacga-taatttgttgtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgat-aaagttgagattaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||     |||  ||||||| ||||||  || |||||||||| ||||    
T  20952987 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagagtaattgtttgtttctttgcaactaagttaactaatttgcaagaataaaagttgagagtaat 20952888  T
Q  104 aaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacg 201  Q
    ||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    ||||||||||||    
T  20952887 aaggcgt-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgctttaccgatattatcacg 20952789  T
Q  202 tatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |||||||| |  |||| ||||||||    
T  20952788 tatcgctcaacaagattattcatgtccaaa 20952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4644463 - 4644354
Alignment:
Q  124 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  4644463 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactatt 4644364  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  4644363 cgtgtccaaa 4644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 2785865 - 2785922
Alignment:
Q  174 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785865 attctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 49689 - 49908
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  49689 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgta 49787  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49788 aaacttgttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 49887  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  49888 caacactattcgtgtccaaac 49908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 15169 - 15389
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15169 agacctttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggcgtg 15268  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15269 aaacttgttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 15368  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15369 caacaccgttcgtgtccaaac 15389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5009
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5228 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5129  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5029  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5028 aacaccattcgtgtccaaac 5009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3486 - 3268
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  3486 gaccattcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 3388  T
Q  113 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3387 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3288  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  3287 aacatcattcgtgtccaaac 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9105 - 8885
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  9105 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 9006  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9005 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 8906  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8905 caacaccattcgtgtccaaac 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2564
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  2784 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 2685  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2684 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2585  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  2584 caacaccattcatgtccaaac 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 232
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12151
Alignment:
Q  95 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 194  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  195 tatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaac 12151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12014
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11949 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 99913 - 100020
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  99913 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtga 100012  T
Q  113 aacttgtt 120  Q
    ||||||||    
T  100013 aacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24470 - 24268
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  24470 agactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 24372  T
Q  112 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  24371 aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactc 24272  T
Q  210 aaca 213  Q
    ||||    
T  24271 aaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University