View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6875A_low_213 (Length: 245)

Name: NF6875A_low_213
Description: NF6875A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6875A_low_213
NF6875A_low_213
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-226)||(123369-123584)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (11-226)||(9582893-9583108)
chr7 (11-226)||(16119849-16120064)
chr7 (11-222)||(23515067-23515278)
chr7 (11-226)||(14551098-14551314)
chr7 (11-226)||(8717865-8718080)
chr7 (11-226)||(13673856-13674071)
chr7 (11-226)||(18593352-18593567)
chr7 (11-226)||(18618117-18618332)
chr7 (18-226)||(538755-538964)
chr7 (18-226)||(4312564-4312772)
chr7 (18-226)||(12567020-12567229)
chr7 (19-226)||(12548805-12549012)
chr7 (18-226)||(8780936-8781146)
chr7 (18-224)||(9003958-9004165)
chr7 (18-226)||(20108375-20108584)
chr7 (19-225)||(48801777-48801983)
chr7 (21-226)||(9264939-9265145)
chr7 (18-226)||(13657873-13658081)
chr7 (18-226)||(11921307-11921512)
chr7 (163-226)||(16465616-16465679)
chr7 (163-226)||(15206584-15206647)
chr7 (18-226)||(16532100-16532311)
chr7 (18-226)||(16633351-16633562)
chr7 (170-226)||(825783-825839)
chr7 (170-226)||(4461242-4461298)
chr7 (170-226)||(14221718-14221774)
chr7 (170-226)||(15916776-15916832)
chr7 (170-226)||(18287761-18287817)
chr7 (170-226)||(27291496-27291552)
chr7 (168-226)||(5397273-5397331)
chr7 (177-226)||(15065935-15065984)
chr7 (170-225)||(4791383-4791438)
chr7 (170-225)||(15348532-15348587)
chr7 (173-226)||(9194544-9194597)
chr7 (170-222)||(6713072-6713124)
chr7 (170-210)||(15522517-15522557)
chr7 (62-96)||(16465743-16465777)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (11-226)||(15699555-15699770)
chr6 (11-226)||(22165549-22165764)
chr6 (11-226)||(22243812-22244027)
chr6 (11-226)||(22061503-22061718)
chr6 (18-226)||(24855245-24855453)
chr6 (11-226)||(22767116-22767331)
chr6 (11-226)||(20170242-20170458)
chr6 (18-226)||(18448140-18448349)
chr6 (18-226)||(23023093-23023302)
chr6 (18-222)||(20107784-20107989)
chr6 (18-226)||(25625691-25625899)
chr6 (21-226)||(2181063-2181269)
chr6 (18-226)||(25631269-25631477)
chr6 (26-226)||(18854026-18854226)
chr6 (18-226)||(21560554-21560762)
chr6 (19-226)||(29595697-29595904)
chr6 (18-226)||(25963248-25963457)
chr6 (18-226)||(25967895-25968104)
chr6 (23-226)||(30671807-30672011)
chr6 (18-146)||(19585622-19585750)
chr6 (12-115)||(20016339-20016443)
chr6 (163-226)||(18184874-18184937)
chr6 (169-226)||(35270971-35271028)
chr6 (163-226)||(18731868-18731931)
chr6 (163-226)||(20218981-20219044)
chr6 (163-226)||(22113006-22113069)
chr6 (170-226)||(11204004-11204060)
chr6 (170-222)||(23517835-23517887)
chr6 (170-226)||(29686601-29686657)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (11-226)||(11496614-11496829)
chr4 (11-226)||(13822913-13823128)
chr4 (17-226)||(42709731-42709940)
chr4 (12-226)||(15254349-15254563)
chr4 (19-226)||(10630758-10630965)
chr4 (18-226)||(3354646-3354855)
chr4 (19-226)||(18291945-18292153)
chr4 (18-226)||(45234232-45234441)
chr4 (18-226)||(18081459-18081669)
chr4 (19-226)||(17484910-17485118)
chr4 (19-226)||(56580539-56580748)
chr4 (19-226)||(38426745-38426938)
chr4 (21-96)||(8092559-8092634)
chr4 (163-226)||(14653998-14654061)
chr4 (170-224)||(15865647-15865701)
chr4 (170-226)||(10650547-10650603)
chr4 (170-226)||(15260109-15260165)
chr4 (170-226)||(16682913-16682969)
chr4 (175-226)||(15409534-15409585)
chr4 (166-226)||(8092427-8092487)
chr4 (170-226)||(9488878-9488934)
chr4 (177-225)||(17296250-17296298)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (11-226)||(10602472-10602687)
chr3 (11-226)||(13504881-13505096)
chr3 (11-226)||(11947407-11947622)
chr3 (11-226)||(16448760-16448975)
chr3 (11-226)||(15556942-15557157)
chr3 (11-226)||(7600355-7600570)
chr3 (11-226)||(9360971-9361186)
chr3 (11-226)||(16373565-16373780)
chr3 (11-226)||(12187076-12187291)
chr3 (11-226)||(37942378-37942593)
chr3 (19-225)||(12193491-12193697)
chr3 (11-222)||(6814868-6815079)
chr3 (11-226)||(10147011-10147226)
chr3 (11-226)||(15645001-15645216)
chr3 (11-226)||(10160173-10160388)
chr3 (11-225)||(13187418-13187632)
chr3 (19-225)||(3245589-3245795)
chr3 (19-226)||(2721305-2721511)
chr3 (18-226)||(13097711-13097919)
chr3 (18-226)||(4382751-4382961)
chr3 (19-226)||(13001425-13001634)
chr3 (18-226)||(10546936-10547148)
chr3 (18-226)||(11398215-11398424)
chr3 (18-226)||(20156515-20156722)
chr3 (18-226)||(1992803-1993011)
chr3 (18-226)||(13690608-13690816)
chr3 (18-226)||(14348588-14348797)
chr3 (11-109)||(16655798-16655897)
chr3 (18-226)||(12160207-12160416)
chr3 (21-226)||(22637702-22637908)
chr3 (19-226)||(3279191-3279399)
chr3 (21-226)||(17387839-17388045)
chr3 (170-226)||(27356728-27356784)
chr3 (169-226)||(13601220-13601277)
chr3 (170-226)||(3339226-3339282)
chr3 (170-226)||(12776534-12776590)
chr3 (170-226)||(13136210-13136266)
chr3 (130-218)||(17045814-17045902)
chr3 (130-218)||(17047974-17048062)
chr3 (170-226)||(20584262-20584318)
chr3 (175-226)||(15946773-15946824)
chr3 (168-226)||(14445768-14445826)
chr3 (170-226)||(15619283-15619339)
chr3 (186-226)||(13195458-13195498)
chr3 (187-226)||(8686387-8686426)
chr3 (187-226)||(13068318-13068357)
chr3 (163-226)||(20225754-20225817)
chr3 (195-226)||(2005499-2005530)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (11-226)||(22665062-22665277)
chr2 (11-226)||(117543-117758)
chr2 (11-226)||(22044660-22044875)
chr2 (11-226)||(25357511-25357726)
chr2 (11-226)||(16775651-16775866)
chr2 (18-226)||(11615-11823)
chr2 (11-226)||(17590407-17590622)
chr2 (11-226)||(24795285-24795500)
chr2 (11-226)||(27627580-27627796)
chr2 (18-226)||(25144757-25144966)
chr2 (19-226)||(5500265-5500473)
chr2 (18-226)||(25804267-25804475)
chr2 (19-226)||(23798922-23799129)
chr2 (20-221)||(25370890-25371091)
chr2 (18-101)||(24502168-24502251)
chr2 (62-226)||(23643994-23644160)
chr2 (72-226)||(24178193-24178348)
chr2 (170-226)||(23159385-23159441)
chr2 (170-226)||(23570642-23570698)
chr2 (170-226)||(27631655-27631711)
chr2 (170-226)||(27768816-27768872)
chr2 (175-226)||(24171510-24171561)
chr2 (163-226)||(24506802-24506865)
chr2 (163-226)||(25337651-25337714)
chr2 (170-226)||(23257570-23257625)
chr2 (170-222)||(24321328-24321380)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (11-226)||(27046874-27047089)
chr1 (11-226)||(17094601-17094816)
chr1 (11-226)||(21798662-21798878)
chr1 (11-226)||(20237456-20237671)
chr1 (21-222)||(8653126-8653327)
chr1 (18-226)||(52938621-52938830)
chr1 (18-226)||(3989944-3990154)
chr1 (138-226)||(14070632-14070720)
chr1 (25-226)||(19364043-19364244)
chr1 (168-222)||(19875648-19875702)
chr1 (163-226)||(21784472-21784535)
chr1 (163-226)||(4027832-4027895)
chr1 (163-226)||(8947515-8947578)
chr1 (170-223)||(16382578-16382631)
chr1 (19-99)||(21784598-21784677)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (11-226)||(20595831-20596046)
chr5 (11-226)||(20602117-20602332)
chr5 (11-226)||(20608408-20608623)
chr5 (11-226)||(15735534-15735749)
chr5 (11-201)||(23710701-23710892)
chr5 (11-226)||(23748051-23748266)
chr5 (18-226)||(24940540-24940749)
chr5 (11-226)||(18072900-18073115)
chr5 (11-226)||(24953174-24953389)
chr5 (19-208)||(20622170-20622359)
chr5 (11-226)||(20790714-20790929)
chr5 (18-226)||(23600636-23600845)
chr5 (18-226)||(24219752-24219961)
chr5 (18-222)||(20444843-20445048)
chr5 (32-226)||(21387410-21387605)
chr5 (18-96)||(22948518-22948596)
chr5 (22-96)||(20916586-20916660)
chr5 (19-96)||(20575510-20575587)
chr5 (170-226)||(22317513-22317569)
chr5 (170-226)||(25006808-25006864)
chr5 (170-226)||(30759655-30759711)
chr5 (163-226)||(18484212-18484275)
chr5 (176-226)||(25116171-25116221)
chr5 (186-226)||(25175261-25175301)
chr5 (170-226)||(26847803-26847859)
chr5 (186-222)||(22855739-22855775)
chr5 (186-225)||(27270568-27270607)
chr5 (168-226)||(20916456-20916514)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (11-226)||(15678-15893)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (11-226)||(21382093-21382309)
chr8 (11-226)||(21098794-21099009)
chr8 (11-226)||(21104115-21104330)
chr8 (11-226)||(23911441-23911655)
chr8 (11-226)||(8314467-8314683)
chr8 (11-226)||(8322846-8323062)
chr8 (18-226)||(21843524-21843733)
chr8 (18-226)||(20038981-20039189)
chr8 (18-226)||(21939996-21940206)
chr8 (19-226)||(23454945-23455154)
chr8 (19-226)||(17620755-17620961)
chr8 (18-226)||(16418620-16418830)
chr8 (46-226)||(24034048-24034230)
chr8 (119-226)||(20712541-20712649)
chr8 (19-215)||(14352181-14352378)
chr8 (37-226)||(21538573-21538765)
chr8 (170-226)||(11346953-11347009)
chr8 (170-226)||(19767684-19767740)
chr8 (170-226)||(22370102-22370158)
chr8 (175-226)||(20002279-20002330)
chr8 (186-226)||(21831192-21831232)
chr8 (186-226)||(22033555-22033595)
chr8 (186-226)||(22099655-22099695)
chr8 (170-226)||(22102552-22102608)
chr8 (18-87)||(20712470-20712539)
chr8 (186-226)||(22817766-22817806)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (11-226)||(615-831)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (11-226)||(1038-1253)
scaffold0404 (153-226)||(3451-3524)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (18-226)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (21-226)||(2852-3058)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (26-226)||(11064-11264)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (18-226)||(251870-252079)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (19-226)||(14662-14869)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (18-226)||(2287-2496)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (18-226)||(7941-8149)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (18-226)||(831-1041)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (21-226)||(482-687)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (19-226)||(120954-121162)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (68-226)||(164403-164562)
scaffold0011 (163-225)||(172254-172316)
scaffold0011 (163-226)||(161995-162058)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (18-226)||(58628-58838)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (21-226)||(13002-13207)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (18-226)||(1108-1318)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (18-226)||(97726-97936)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-226)||(10206-10322)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (18-226)||(510-718)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (114-226)||(8756-8869)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (163-224)||(12548-12609)
scaffold0059 (65-95)||(12450-12480)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (65-224)||(232789-232948)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (71-226)||(35104-35251)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (125-226)||(38508-38610)
scaffold0096 (63-96)||(38625-38658)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (163-226)||(5232-5295)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (163-226)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (163-226)||(50506-50569)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (168-226)||(912-970)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (170-226)||(2762-2818)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (18-85)||(2859-2926)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (175-226)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (163-222)||(22159-22218)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (163-226)||(22756-22818)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (170-226)||(10720-10776)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (186-226)||(18223-18263)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (170-226)||(54849-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (163-226)||(1839-1902)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (163-226)||(37743-37806)
scaffold0116 (19-99)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (170-225)||(1193-1248)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (163-226)||(45228-45291)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (168-222)||(37868-37922)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (176-226)||(72572-72622)
scaffold0037 (176-226)||(84762-84812)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (170-210)||(83174-83214)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123584
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  123569 gtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583108
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  9583093 gtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119849
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  16119864 gtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515278
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  211 gtgggggagttt 222  Q
    ||||||||||||    
T  23515267 gtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551314
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  14551298 tgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718080
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  8718065 gtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674071
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  13674056 atgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593352
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  18593367 atgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618332
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  18618317 atgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 538765  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  538764 gagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 4312763  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  4312764 agtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  | || || || |||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggg 12567219  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  12567220 gagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| || |||||||     
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548912 gagacatgt-atttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgggg 12548814  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  12548813 agtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  || || ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  118 agagacat--gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
     |||||||  ||  ||||||||||||||||| || ||    ||||  |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8780947  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  8780946 ggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  || || ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  || ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 9004157  T
Q  217 gagtttga 224  Q
    ||||||||    
T  9004158 gagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  || || ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||  | |||||||||||| |||| |||||    || ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  20108575 gagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801777
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || || ||||     
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 48801787  T
Q  216 ggagtttgat 225  Q
    ||||||||||    
T  48801786 ggagtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||  | |||| ||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  121 gacatgtg-ctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 219  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||| || ||    || |  |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T
Q  220 tttgatg 226  Q
    |||||||    
T  9264945 tttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658081
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || || ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||| ||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||   ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 13658072  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  13658073 agtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921307
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||  ||||||| || ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || | | | ||| |||| |    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 11921317  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  11921316 gagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16465679 - 16465616
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465679 tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532311
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatc-attgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt- 115  Q
    |||||||||||||| || | |||||||  |||||||| || |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | ||  ||||     
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  116 gaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 214  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16532299  T
Q  215 gggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||    
T  16532300 gggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633351
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatc-attgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt- 115  Q
    |||||||||||||| || | |||||||  |||||||| || |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | ||  ||||     
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  116 gaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 214  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16633363  T
Q  215 gggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||    
T  16633362 gggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461242
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  168 ctatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  177 tgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4791438 - 4791383
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791438 atgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  173 tttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16465777 - 16465743
Alignment:
Q  62 attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465777 attataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 16465743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699770
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  15699755 gtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165549
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  22165564 gtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244027
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  22244012 gtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061503
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  22061518 atgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaaacccttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24855255  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  24855254 gagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767116
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  22767132 tatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170458
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatat-aactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaa 208  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  209 gtgtgggggagtttgatg 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  20170441 gtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18448339  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  18448340 gagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23023292  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  23023293 gagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  118 agagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
     |||||||  | ||| |||||||||||||| || | || | ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattgaattgtcatatg-tttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20107791  T
Q  216 ggagttt 222  Q
    |||||||    
T  20107790 ggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || ||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggggg 25625890  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  25625891 agtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||| ||||||| ||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T
Q  220 tttgatg 226  Q
    |||||||    
T  2181263 tttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || || ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 214  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||| |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 25631281  T
Q  215 gggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||    
T  25631280 gggagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  26 cactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacat 125  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| || ||||||| |||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  126 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgat 18854225  T
Q  226 g 226  Q
    |    
T  18854226 g 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || || ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 21560563  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  21560562 agtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595904
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| || ||||||      
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||  |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29595797 gagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggga 29595896  T
Q  219 gtttgatg 226  Q
    ||||||||    
T  29595897 gtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  || || ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     ||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25963447  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  25963448 gagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  || || ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     ||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25968094  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  25968095 gagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671807
Alignment:
Q  23 acacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagaga 122  Q
    ||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || |||  || |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  123 catgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 221  Q
    ||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 30671812  T
Q  222 tgatg 226  Q
    |||||    
T  30671811 tgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585622
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  || || || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcat 146  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattgtattgtcat 19585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  12 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  111 ccctt 115  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184874
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  169 tatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496614
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  11496629 gtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823128
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  13823113 gtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  17 tcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 42709741  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  42709740 gagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254563
Alignment:
Q  12 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaac 111  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  112 ccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtg 211  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  212 tgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||    
T  15254549 tgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||     
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  10630957 agtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggg 3354845  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  3354846 gagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||     
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggggg 18292144  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  18292145 agtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  || || ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggg 45234242  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  45234241 gagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| |    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18081470  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  18081469 ggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || ||| |||     
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 17484919  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  17484918 agtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580539
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-ga 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||||   |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| ||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||  |||||    | ||   |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 56580549  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  56580548 gagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||     
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||             || ||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 38426930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 96  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 224  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  175 tatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092427
Alignment:
Q  166 tactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  177 tgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602472
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  10602487 gtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504881
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  13504896 gtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947622
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  11947607 gtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448760
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  16448775 atgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556942
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  15556957 gtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600570
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  7600555 atgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360971
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  9360986 atgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373565
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  16373581 tatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187076
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  12187092 tatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942593
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  37942577 tatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggggg 12193499  T
Q  218 agtttgat 225  Q
    ||||||||    
T  12193498 agtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815079
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  210 tgtgggggagttt 222  Q
    | || ||||||||    
T  6815067 tatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147226
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  10147210 tatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645216
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  15645200 tatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160173
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  10160189 tatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187418
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  210 tgtgggggagtttgat 225  Q
    | ||||||||||||||    
T  13187433 tatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||     
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 3245596  T
Q  219 gtttgat 225  Q
    |||||||    
T  3245595 gtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa-cccttga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||| || ||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctt-gaattaaaagcctttga 2721403  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||  | ||||||||||||||||| | |||    ||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2721404 ggagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 2721502  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  2721503 agtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || || ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggggg 13097910  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  13097911 agtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| |    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4382950  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  4382951 ggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-ga 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| ||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13001435  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  13001434 gagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| ||||    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  116 -gaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 213  Q
     || |||||||||||||  | | ||||||||| ||||| || |  ||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  214 ggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||    
T  10546948 ggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  || || ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  118 agagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||| | || ||    ||||  |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggg 11398414  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  11398415 gagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  || || ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || | ||||  |||||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggg 20156525  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  20156524 gagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| | | |    
T  1992903 ggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagag 1993002  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  1993003 agtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| || || ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggggg 13690807  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  13690808 agtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     ||||||   | ||||||||||||||||| || ||   | || |  || ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 14348598  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  14348597 gagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaaacccttg 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||   ||| || |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 12160218  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  12160217 ggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||  | |||| ||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 219  Q
    | |||  | ||||||||||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T
Q  220 tttgatg 226  Q
    |||||||    
T  22637902 tttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||  | ||||     
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||| || | |  | ||||  || | |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggggg 3279390  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  3279391 agtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  || || |||| ||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 219  Q
    || ||  | ||||||||||||||||  |||||    || ||  |||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T
Q  220 tttgatg 226  Q
    |||||||    
T  17388039 tttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  169 tatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Original strand, 17045814 - 17045902
Alignment:
Q  130 tttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045814 tttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Original strand, 17047974 - 17048062
Alignment:
Q  130 tttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047974 tttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  175 tatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  168 ctatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13195498 - 13195458
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195498 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8686426 - 8686387
Alignment:
Q  187 ttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686426 ttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 13068318 - 13068357
Alignment:
Q  187 ttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068318 ttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225754
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  195 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665277
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  22665262 gtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117758
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  117743 gtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044660
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  22044675 atgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357726
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  25357711 atgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775866
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  16775851 atgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggggg 11624  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  11623 agtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590622
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17590606  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  17590607 atgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795285
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  24795300 atgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627796
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  27627780 tatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25144767  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  25144766 gagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||     
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 5500274  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  5500273 agtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| ||| |||| |    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttga-attaaaagcctttg 25804377  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    | || ||||  | ||||||||||||||||| || ||    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804376 aggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25804277  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  25804276 gagtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||     
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggga 23798930  T
Q  219 gtttgatg 226  Q
    ||||||||    
T  23798929 gtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  20 cacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaag 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| || || |||| |    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  120 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||  ||| ||  || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25370895  T
Q  217 gagtt 221  Q
    |||||    
T  25370894 gagtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502251
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttg 24502251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 23643994 - 23644160
Alignment:
Q  62 attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-gaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | | | | ||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    | ||    
T  23643994 attacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttgaggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttatt 23644093  T
Q  161 gg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
       |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644094 ttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  72 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  || |  |||| |||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  171 tgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  175 tatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506865
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337651
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321380
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047089
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  27047074 gtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094601
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  17094616 gtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798662
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  21798678 tatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237671
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  20237656 gtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    |||||||| |||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || || |||| ||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 8653322  T
Q  218 agttt 222  Q
    |||||    
T  8653323 agttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 52938631  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  52938630 gagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaaacccttg 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  || || |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggg 3990143  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  3990144 ggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 226
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  138 aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364244
Alignment:
Q  25 acactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagaca 124  Q
    ||||||||||  |||| |||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || |||| ||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  125 tgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 224  Q
    || | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 19364242  T
Q  225 tg 226  Q
    ||    
T  19364243 tg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  168 ctatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 223  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttgttg-ttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595831
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  20595846 gtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602117
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  20602132 gtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608408
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  20608423 gtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735749
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  15735734 gtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748266
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  23748251 atgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaaacccttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24940739  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  24940740 gagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073115
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  18073099 tatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953174
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  24953190 tatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790714
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  20790730 tatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23600646  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    || |||||||    
T  23600645 gaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggg 24219951  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  24219952 gagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggg 20444849  T
Q  217 gagttt 222  Q
    ||||||    
T  20444848 gagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  32 cttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacatgtgctt 131  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||  | |||| |||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  132 t-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||  ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916586
Alignment:
Q  22 cacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtac 20916586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575587
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 20575587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  176 atgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25175301 - 25175261
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175301 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 222
Target Start/End: Original strand, 22855739 - 22855775
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855739 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 225
Target Start/End: Original strand, 27270568 - 27270607
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270568 cttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20916514 - 20916456
Alignment:
Q  168 ctatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20916514 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagtttgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15893
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  15878 gtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382309
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  21382293 tatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098794
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  21098809 gtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104115
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  21104130 gtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911655
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  23911640 atgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314683
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  8314667 tatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322846
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | || ||||||||||||    
T  8322862 tatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||| |||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 21843534  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  21843533 gagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || || ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    ||||||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  20038989 agtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| |    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 21940007  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  21940006 ggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  || || ||||     
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  119 gagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 216  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23455045 gagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  23455145 gagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| || || ||||     
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttggttgaaa-aaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggga 17620953  T
Q  219 gtttgatg 226  Q
    ||||||||    
T  17620954 gtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| |    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 16418631  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  16418630 ggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Original strand, 24034048 - 24034230
Alignment:
Q  46 attgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacatgtgcttt-aattgaattgtc 144  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| || || |||| |||||||  | ||| ||||||||||||    
T  24034048 attgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtc 24034147  T
Q  145 atttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    || |  || |  |  ||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034148 atatattaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Original strand, 20712541 - 20712649
Alignment:
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20712541 gagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgtagggg 20712640  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  20712641 agtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  || ||   ||     
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  119 gagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||| | || || | ||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538765
Alignment:
Q  37 aacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatta--gtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacatgtgctttaa 134  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||  |||  ||| ||  | |||| |||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  135 ttgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538673 ttgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  175 tatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 21831192 - 21831232
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831192 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22033595 - 22033555
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033595 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22099695 - 22099655
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099695 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 87  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 22817766 - 22817806
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817766 cttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 615
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  110 acccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  631 tgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1253
Alignment:
Q  11 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaa 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  211 gtgggggagtttgatg 226  Q
     |||||||||||||||    
T  1238 atgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3524
Alignment:
Q  153 taactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3451 taactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| || |||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||||||||  ||||||| |||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  320 ggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 419  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  420 agtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || ||||| | ||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T
Q  220 tttgatg 226  Q
    |||||||    
T  2858 tttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11264
Alignment:
Q  26 cactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacat 125  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| || ||||||| |||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  126 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11164 gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 11263  T
Q  226 g 226  Q
    |    
T  11264 g 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| || |||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | || || ||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggg 251880  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  251879 gagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| || |||||||     
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 14670  T
Q  219 gtttgatg 226  Q
    ||||||||    
T  14669 gtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 216  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 2297  T
Q  217 gagtttgatg 226  Q
    ||||||||||    
T  2296 gagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  8141 agtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| |||| |    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  ||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1030  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  1031 ggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  || |  |||| ||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 220  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 681  T
Q  221 ttgatg 226  Q
    ||||||    
T  682 ttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaa 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |  ||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||     
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  119 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| | | |  | | ||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 121153  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  121154 agtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  68 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgct 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  167 actatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    || ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172316
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || | | | ||| | || |    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 58639  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  58638 ggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13002
Alignment:
Q  21 acacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaaga 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||  ||  || || ||||  |    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaa 13108  T
Q  121 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 220  Q
    |||||  | |||||||||||| | || |||||    || |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13107 gacataagttttaattgaattattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagt 13008  T
Q  221 ttgatg 226  Q
    ||||||    
T  13007 ttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || | | | ||| |||| |    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | | ||||||||| |||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1307  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  1308 ggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97726
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaaccctt-g 116  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | | | ||| | || |    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  117 aagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 215  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtggg 97737  T
Q  216 ggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||    
T  97736 ggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10322 - 10206
Alignment:
Q  111 cccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaag 209  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10322 cccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10223  T
Q  210 tgtgggggagtttgatg 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  10222 tttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttga 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  || || ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  118 agagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 217  Q
     |||| ||  | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggggg 519  T
Q  218 agtttgatg 226  Q
    |||||||||    
T  518 agtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Original strand, 8756 - 8869
Alignment:
Q  114 ttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgt 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8756 ttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 8855  T
Q  213 gggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||||    
T  8856 gggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 224
Target Start/End: Original strand, 12548 - 12609
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 224  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548 tgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 95
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12480
Alignment:
Q  65 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgta 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgta 12480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  65 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaagagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctg-ttg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||  | |||| ||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  ||| ||     
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 232852  T
Q  162 gtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 224  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232851 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35251 - 35104
Alignment:
Q  71 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaaacccttgaag-agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctact 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||  ||||||     
T  35251 aatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaatt-aaagccttaaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctacc 35161  T
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35160 atgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  125 tgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  224 atg 226  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 38658 - 38625
Alignment:
Q  63 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38658 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5295
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  168 ctatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  18 cacacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  175 tatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgcctt-tgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 18223 - 18263
Alignment:
Q  186 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18223 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1902
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  19 acacacacactcacttgaaacttgatcattgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgatg-ttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 225  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  163 tgctactatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    |||| |||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Original strand, 37868 - 37922
Alignment:
Q  168 ctatgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 222  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37868 ctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  176 atgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  176 atgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 226  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  170 atgtttatgccttctacttgaggacaagcaaagattcaagt 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University