View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6876A_low_11 (Length: 490)

Name: NF6876A_low_11
Description: NF6876A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6876A_low_11
NF6876A_low_11
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (19-487)||(37705674-37706142)
chr5 (46-472)||(25904047-25904475)
chr5 (52-487)||(10474215-10474652)
chr5 (19-487)||(17818382-17818851)
chr5 (46-472)||(17072827-17073259)
chr5 (40-472)||(40221460-40221901)
chr5 (86-487)||(18511103-18511507)
chr5 (46-428)||(24126800-24127184)
chr5 (44-487)||(26097675-26098118)
chr5 (44-487)||(21947969-21948421)
chr5 (46-487)||(1189499-1189949)
chr5 (43-387)||(10529093-10529437)
chr5 (43-449)||(39854425-39854835)
chr5 (44-487)||(2818224-2818673)
chr5 (86-472)||(16092107-16092495)
chr5 (86-487)||(25804009-25804416)
chr5 (52-487)||(18509209-18509648)
chr5 (44-487)||(25921360-25921810)
chr5 (46-387)||(31472606-31472948)
chr5 (78-487)||(6756470-6756879)
chr5 (45-483)||(31465884-31466314)
chr5 (124-487)||(658250-658610)
chr5 (44-487)||(36402217-36402665)
chr5 (44-387)||(4236571-4236913)
chr5 (45-387)||(38882048-38882390)
chr5 (86-463)||(6745053-6745433)
chr5 (46-387)||(39397987-39398327)
chr5 (86-387)||(2174903-2175203)
chr5 (86-387)||(18466668-18466969)
chr5 (86-387)||(27912520-27912821)
chr5 (44-449)||(18596589-18596994)
chr5 (54-468)||(2954368-2954783)
chr5 (46-316)||(34530731-34531001)
chr5 (79-487)||(16776135-16776547)
chr5 (164-485)||(2723964-2724278)
chr5 (45-487)||(31179259-31179707)
chr5 (44-487)||(12555805-12556260)
chr5 (86-386)||(34477048-34477349)
chr5 (45-384)||(31545023-31545362)
chr5 (46-428)||(695833-696203)
chr5 (86-486)||(6747290-6747695)
chr5 (86-387)||(18468995-18469294)
chr5 (86-387)||(27910435-27910735)
chr5 (53-487)||(21288715-21289146)
chr5 (45-384)||(31542678-31543016)
chr5 (86-387)||(34479412-34479714)
chr5 (86-385)||(21684448-21684746)
chr5 (86-384)||(15552229-15552527)
chr5 (169-477)||(41585637-41585956)
chr5 (180-487)||(20505734-20506042)
chr5 (52-487)||(6661083-6661511)
chr5 (46-240)||(20042994-20043188)
chr5 (46-264)||(20044954-20045172)
chr5 (44-246)||(26098386-26098588)
chr5 (144-387)||(10586873-10587117)
chr5 (181-387)||(39798126-39798332)
chr5 (169-387)||(4410090-4410307)
chr5 (46-486)||(36208524-36208959)
chr5 (76-316)||(9020197-9020432)
chr5 (198-387)||(10749796-10749985)
chr5 (290-487)||(26098178-26098380)
chr5 (198-387)||(10757273-10757461)
chr5 (89-387)||(20053834-20054122)
chr5 (198-385)||(15354571-15354757)
chr5 (198-385)||(23665140-23665326)
chr5 (198-385)||(23793261-23793447)
chr5 (198-384)||(3373134-3373320)
chr5 (198-385)||(15356847-15357033)
chr5 (198-384)||(38960129-38960314)
chr5 (144-316)||(17413232-17413402)
chr5 (44-184)||(20507659-20507799)
chr5 (184-357)||(15143547-15143722)
chr5 (318-472)||(20043206-20043361)
chr5 (205-385)||(23741855-23742034)
chr5 (19-240)||(42770691-42770904)
chr5 (252-317)||(42770960-42771025)
chr5 (153-316)||(34033632-34033797)
chr5 (132-261)||(4754188-4754312)
chr5 (132-240)||(2144706-2144811)
chr5 (86-142)||(4410045-4410101)
chr5 (121-240)||(29748370-29748485)
chr5 (46-96)||(2723911-2723961)
chr5 (272-384)||(15445263-15445376)
chr5 (44-141)||(41585946-41586043)
chr5 (202-316)||(4897828-4897943)
chr5 (414-487)||(2175222-2175293)
chr5 (414-487)||(38882409-38882480)
chr5 (153-240)||(15224911-15224997)
chr5 (414-477)||(4236949-4237010)
chr5 (414-477)||(20045300-20045363)
chr5 (153-240)||(31782598-31782690)
chr5 (414-487)||(34476939-34477011)
chr5 (199-237)||(1170811-1170849)
chr5 (199-237)||(2298145-2298183)
chr5 (339-381)||(8565946-8565988)
chr5 (339-381)||(19806489-19806531)
chr5 (414-487)||(21684339-21684410)
chr5 (339-381)||(32636950-32636992)
chr5 (199-237)||(35385596-35385634)
chr5 (199-240)||(10627364-10627405)
chr5 (339-398)||(22672973-22673033)
chr5 (339-398)||(25445635-25445695)
[»] chr1 (119 HSPs)
chr1 (46-469)||(11457387-11457812)
chr1 (26-469)||(18307033-18307478)
chr1 (44-487)||(13215023-13215471)
chr1 (44-487)||(2949126-2949570)
chr1 (43-449)||(12302437-12302850)
chr1 (46-487)||(18839531-18839975)
chr1 (19-449)||(6756444-6756875)
chr1 (19-487)||(9240981-9241450)
chr1 (44-447)||(41646862-41647267)
chr1 (46-487)||(50076567-50077009)
chr1 (77-487)||(50307436-50307853)
chr1 (47-487)||(25251168-25251611)
chr1 (46-487)||(50248464-50248909)
chr1 (44-487)||(6995587-6996039)
chr1 (52-477)||(14097872-14098301)
chr1 (44-436)||(16428595-16428988)
chr1 (86-487)||(47906254-47906658)
chr1 (45-487)||(51749982-51750431)
chr1 (71-487)||(31424909-31425331)
chr1 (46-487)||(31489859-31490299)
chr1 (44-387)||(17324632-17324975)
chr1 (52-487)||(39462469-39462909)
chr1 (45-387)||(10399824-10400166)
chr1 (46-387)||(50078816-50079158)
chr1 (19-487)||(31422753-31423238)
chr1 (44-436)||(38925428-38925817)
chr1 (44-410)||(3579588-3579957)
chr1 (53-428)||(17186082-17186458)
chr1 (44-449)||(28998182-28998592)
chr1 (44-449)||(29003898-29004308)
chr1 (77-487)||(17318868-17319274)
chr1 (53-487)||(17324016-17324461)
chr1 (86-487)||(15294723-15295131)
chr1 (53-387)||(20302410-20302743)
chr1 (45-387)||(6822958-6823299)
chr1 (44-487)||(28206959-28207405)
chr1 (44-387)||(15823488-15823831)
chr1 (44-387)||(2510321-2510667)
chr1 (72-488)||(4131268-4131692)
chr1 (86-387)||(24325648-24325948)
chr1 (86-427)||(25127856-25128202)
chr1 (86-487)||(27336831-27337235)
chr1 (44-387)||(28840620-28840964)
chr1 (86-483)||(27339026-27339427)
chr1 (44-387)||(31735517-31735864)
chr1 (95-433)||(40133937-40134277)
chr1 (44-386)||(28842435-28842778)
chr1 (52-384)||(2617466-2617798)
chr1 (44-379)||(47451590-47451919)
chr1 (45-487)||(13761780-13762228)
chr1 (45-387)||(20291400-20291741)
chr1 (86-387)||(39932057-39932359)
chr1 (45-383)||(16226110-16226448)
chr1 (94-387)||(46431702-46431996)
chr1 (86-384)||(9463243-9463541)
chr1 (44-327)||(48665113-48665403)
chr1 (45-387)||(51752308-51752648)
chr1 (46-384)||(14183589-14183923)
chr1 (86-327)||(21948244-21948484)
chr1 (86-384)||(9459416-9459714)
chr1 (86-383)||(47179697-47179993)
chr1 (169-487)||(25248445-25248766)
chr1 (19-384)||(42922151-42922514)
chr1 (86-383)||(47177346-47177642)
chr1 (30-387)||(49495206-49495552)
chr1 (148-387)||(16432440-16432681)
chr1 (19-436)||(18800518-18800932)
chr1 (19-428)||(8347227-8347633)
chr1 (45-301)||(6823827-6824091)
chr1 (187-436)||(16429042-16429291)
chr1 (133-357)||(15669419-15669641)
chr1 (182-434)||(6115051-6115304)
chr1 (79-316)||(8349119-8349352)
chr1 (169-383)||(16231630-16231843)
chr1 (252-487)||(23816036-23816277)
chr1 (198-384)||(23785935-23786121)
chr1 (194-387)||(51757623-51757815)
chr1 (71-316)||(13125525-13125768)
chr1 (52-291)||(26520205-26520449)
chr1 (44-371)||(30790412-30790733)
chr1 (274-487)||(15916562-15916775)
chr1 (184-318)||(30738695-30738830)
chr1 (181-428)||(16561545-16561794)
chr1 (132-384)||(27916529-27916780)
chr1 (47-141)||(25248756-25248850)
chr1 (184-359)||(155788-155963)
chr1 (184-316)||(26613307-26613440)
chr1 (144-316)||(28279309-28279480)
chr1 (404-487)||(50078683-50078766)
chr1 (144-226)||(26332719-26332798)
chr1 (339-387)||(13358810-13358858)
chr1 (45-142)||(16231544-16231641)
chr1 (184-240)||(26332632-26332688)
chr1 (52-226)||(13127790-13127959)
chr1 (414-487)||(13447162-13447233)
chr1 (184-240)||(14353047-14353104)
chr1 (417-486)||(47451948-47452017)
chr1 (184-240)||(49959129-49959186)
chr1 (78-118)||(6115344-6115384)
chr1 (339-398)||(21353331-21353391)
chr1 (404-487)||(3579477-3579560)
chr1 (199-238)||(4144826-4144865)
chr1 (273-316)||(43104332-43104375)
chr1 (339-381)||(834167-834209)
chr1 (199-237)||(2232597-2232635)
chr1 (414-468)||(25860315-25860369)
chr1 (339-381)||(28220226-28220268)
chr1 (339-381)||(28265554-28265596)
chr1 (339-381)||(40122196-40122238)
chr1 (339-381)||(45644354-45644396)
chr1 (414-487)||(46431594-46431665)
chr1 (339-381)||(49918476-49918518)
chr1 (339-381)||(50167175-50167217)
chr1 (414-485)||(2617838-2617908)
chr1 (199-240)||(14997040-14997081)
chr1 (355-387)||(13447269-13447301)
chr1 (415-487)||(30780361-30780433)
chr1 (341-381)||(32889443-32889483)
chr1 (420-487)||(51757862-51757927)
[»] chr3 (143 HSPs)
chr3 (47-472)||(43421322-43421747)
chr3 (46-487)||(1626573-1627016)
chr3 (46-487)||(3314608-3315053)
chr3 (46-487)||(43423355-43423796)
chr3 (46-482)||(5926661-5927097)
chr3 (44-487)||(1313332-1313774)
chr3 (44-487)||(53917553-53917999)
chr3 (77-436)||(28101943-28102304)
chr3 (19-449)||(39715367-39715795)
chr3 (44-487)||(51943293-51943740)
chr3 (43-487)||(4308169-4308617)
chr3 (46-487)||(880343-880785)
chr3 (43-487)||(43226007-43226449)
chr3 (44-487)||(53915385-53915831)
chr3 (44-471)||(45882861-45883294)
chr3 (86-477)||(47148795-47149188)
chr3 (46-487)||(53468343-53468788)
chr3 (86-487)||(27101069-27101474)
chr3 (43-487)||(43228212-43228659)
chr3 (45-487)||(18096787-18097235)
chr3 (43-387)||(51726999-51727342)
chr3 (45-387)||(11170327-11170669)
chr3 (44-487)||(12267866-12268301)
chr3 (86-487)||(18099057-18099463)
chr3 (47-487)||(10955912-10956359)
chr3 (47-487)||(51674656-51675087)
chr3 (44-468)||(32263947-32264378)
chr3 (86-387)||(38890004-38890305)
chr3 (52-487)||(24979637-24980079)
chr3 (135-487)||(6484372-6484726)
chr3 (86-387)||(42990268-42990569)
chr3 (47-387)||(10958315-10958655)
chr3 (44-479)||(48361566-48362005)
chr3 (44-387)||(28761419-28761763)
chr3 (86-387)||(30005805-30006106)
chr3 (46-487)||(36011751-36012196)
chr3 (46-487)||(54691463-54691906)
chr3 (46-371)||(889781-890104)
chr3 (45-387)||(3859451-3859792)
chr3 (44-387)||(4103888-4104234)
chr3 (86-487)||(9604493-9604899)
chr3 (86-387)||(25533406-25533707)
chr3 (86-384)||(746721-747019)
chr3 (45-487)||(5191576-5192023)
chr3 (44-487)||(18162586-18163033)
chr3 (44-387)||(26720470-26720812)
chr3 (45-387)||(22114297-22114639)
chr3 (52-316)||(6561740-6562005)
chr3 (86-384)||(10084384-10084682)
chr3 (44-383)||(458202-458545)
chr3 (126-487)||(1321483-1321851)
chr3 (98-487)||(25388882-25389279)
chr3 (44-383)||(455825-456168)
chr3 (46-483)||(53591119-53591546)
chr3 (45-384)||(6065791-6066131)
chr3 (86-384)||(10621525-10621823)
chr3 (53-487)||(32219026-32219455)
chr3 (86-383)||(50493963-50494260)
chr3 (45-384)||(6063441-6063782)
chr3 (86-487)||(10191197-10191602)
chr3 (45-287)||(35777344-35777587)
chr3 (44-436)||(15780782-15781195)
chr3 (112-384)||(28413027-28413299)
chr3 (46-277)||(28100143-28100374)
chr3 (18-472)||(23633356-23633801)
chr3 (86-383)||(38210334-38210631)
chr3 (46-282)||(28180948-28181182)
chr3 (86-327)||(29956650-29956891)
chr3 (45-387)||(5522619-5522949)
chr3 (173-436)||(25688099-25688367)
chr3 (47-487)||(27635545-27635959)
chr3 (143-434)||(4666535-4666828)
chr3 (170-478)||(6231849-6232157)
chr3 (43-371)||(35917952-35918285)
chr3 (144-387)||(7606580-7606822)
chr3 (46-487)||(31151271-31151708)
chr3 (140-428)||(17795280-17795566)
chr3 (140-428)||(19103720-19104006)
chr3 (86-384)||(42992250-42992532)
chr3 (18-299)||(23636923-23637200)
chr3 (200-436)||(3306839-3307076)
chr3 (183-387)||(5886261-5886463)
chr3 (183-387)||(5899734-5899936)
chr3 (29-316)||(53597148-53597430)
chr3 (252-483)||(47701568-47701798)
chr3 (186-387)||(11168165-11168366)
chr3 (132-384)||(561769-562021)
chr3 (132-313)||(13420252-13420429)
chr3 (54-316)||(54884089-54884348)
chr3 (46-270)||(28137415-28137628)
chr3 (132-316)||(25635394-25635575)
chr3 (87-214)||(41849117-41849244)
chr3 (47-175)||(6231374-6231502)
chr3 (122-310)||(1673975-1674160)
chr3 (46-176)||(47701798-47701928)
chr3 (45-190)||(11163073-11163218)
chr3 (94-436)||(36871243-36871583)
chr3 (44-226)||(24177201-24177380)
chr3 (265-384)||(25634030-25634150)
chr3 (306-487)||(41849243-41849425)
chr3 (19-104)||(6484282-6484367)
chr3 (47-158)||(3306724-3306835)
chr3 (252-384)||(24181510-24181644)
chr3 (166-262)||(4560401-4560497)
chr3 (132-226)||(25633933-25634024)
chr3 (360-468)||(28181242-28181352)
chr3 (121-240)||(13419883-13419997)
chr3 (154-317)||(14634504-14634665)
chr3 (339-487)||(53893939-53894097)
chr3 (184-382)||(1620457-1620657)
chr3 (161-243)||(31021281-31021362)
chr3 (339-387)||(35919107-35919155)
chr3 (44-118)||(1321363-1321437)
chr3 (166-211)||(7606828-7606873)
chr3 (339-388)||(30236251-30236300)
chr3 (184-224)||(7768632-7768672)
chr3 (414-487)||(10084274-10084345)
chr3 (339-388)||(46173483-46173532)
chr3 (343-387)||(42992607-42992651)
chr3 (414-487)||(11168402-11168474)
chr3 (414-487)||(11170671-11170743)
chr3 (414-472)||(25533726-25533782)
chr3 (199-237)||(6303310-6303348)
chr3 (199-237)||(10094218-10094256)
chr3 (199-237)||(10100235-10100273)
chr3 (199-237)||(10201098-10201136)
chr3 (414-487)||(10958208-10958279)
chr3 (339-381)||(16264354-16264396)
chr3 (199-237)||(16462203-16462241)
chr3 (199-237)||(22626128-22626166)
chr3 (339-381)||(25795785-25795827)
chr3 (199-237)||(27544273-27544311)
chr3 (339-381)||(32143325-32143367)
chr3 (339-381)||(40913419-40913461)
chr3 (339-381)||(44331671-44331713)
chr3 (199-237)||(47883026-47883064)
chr3 (414-471)||(50494300-50494355)
chr3 (339-381)||(51398940-51398982)
chr3 (77-130)||(4560514-4560567)
chr3 (184-240)||(11066652-11066709)
chr3 (86-118)||(6719358-6719390)
chr3 (339-398)||(29913938-29913998)
chr3 (341-381)||(32744436-32744476)
[»] chr8 (88 HSPs)
chr8 (46-487)||(30480395-30480838)
chr8 (44-467)||(14419102-14419528)
chr8 (19-436)||(1225139-1225557)
chr8 (44-487)||(14807749-14808204)
chr8 (46-384)||(27106894-27107232)
chr8 (19-387)||(27910988-27911354)
chr8 (19-387)||(27957407-27957773)
chr8 (44-487)||(13858381-13858821)
chr8 (44-487)||(15072708-15073155)
chr8 (47-487)||(36865538-36865982)
chr8 (44-387)||(32339303-32339650)
chr8 (44-487)||(28251457-28251904)
chr8 (44-387)||(4424016-4424359)
chr8 (44-472)||(15067979-15068410)
chr8 (86-387)||(608774-609075)
chr8 (44-487)||(41382671-41383107)
chr8 (44-387)||(27829295-27829637)
chr8 (44-387)||(15809213-15809559)
chr8 (44-487)||(41384743-41385190)
chr8 (44-487)||(3874004-3874441)
chr8 (46-477)||(25952521-25952953)
chr8 (18-428)||(15185667-15186073)
chr8 (44-387)||(27826984-27827326)
chr8 (46-433)||(5372128-5372512)
chr8 (86-387)||(22684647-22684951)
chr8 (86-387)||(28283215-28283514)
chr8 (45-387)||(18810707-18811048)
chr8 (45-487)||(44720842-44721291)
chr8 (94-384)||(43079650-43079940)
chr8 (46-292)||(14477276-14477522)
chr8 (86-384)||(43082013-43082311)
chr8 (46-428)||(21482322-21482693)
chr8 (86-384)||(24873178-24873476)
chr8 (46-240)||(33541529-33541723)
chr8 (77-428)||(21480545-21480885)
chr8 (144-487)||(43530213-43530563)
chr8 (136-387)||(15956051-15956299)
chr8 (45-387)||(18812892-18813222)
chr8 (19-434)||(31162186-31162602)
chr8 (21-223)||(26775176-26775378)
chr8 (76-394)||(3005617-3005932)
chr8 (78-240)||(5622879-5623041)
chr8 (46-209)||(35872555-35872713)
chr8 (284-487)||(33541302-33541507)
chr8 (169-346)||(181622-181799)
chr8 (343-477)||(37214166-37214302)
chr8 (251-428)||(2468082-2468260)
chr8 (181-449)||(31035252-31035522)
chr8 (184-384)||(31578273-31578476)
chr8 (74-203)||(37214369-37214517)
chr8 (144-313)||(31573794-31573961)
chr8 (44-146)||(3886153-3886255)
chr8 (121-218)||(31035144-31035238)
chr8 (86-157)||(12517248-12517319)
chr8 (27-94)||(14419784-14419851)
chr8 (268-482)||(35872353-35872553)
chr8 (142-226)||(2468261-2468341)
chr8 (44-141)||(181535-181632)
chr8 (343-436)||(14477547-14477642)
chr8 (365-468)||(181798-181901)
chr8 (414-487)||(3883482-3883553)
chr8 (339-388)||(10930192-10930241)
chr8 (199-243)||(2267161-2267205)
chr8 (414-487)||(4424395-4424467)
chr8 (184-226)||(33839077-33839120)
chr8 (339-381)||(1345371-1345413)
chr8 (44-118)||(2468361-2468435)
chr8 (199-237)||(9021251-9021289)
chr8 (199-284)||(13985176-13985262)
chr8 (339-381)||(15212912-15212954)
chr8 (199-237)||(16752666-16752704)
chr8 (199-237)||(16757411-16757449)
chr8 (199-237)||(17799568-17799606)
chr8 (339-381)||(19175805-19175847)
chr8 (339-381)||(19752445-19752487)
chr8 (339-381)||(27811404-27811446)
chr8 (414-487)||(27827362-27827433)
chr8 (414-487)||(28283108-28283179)
chr8 (199-237)||(28327908-28327946)
chr8 (199-237)||(28332631-28332669)
chr8 (199-237)||(28895502-28895540)
chr8 (339-381)||(33352276-33352318)
chr8 (339-381)||(40321206-40321248)
chr8 (44-127)||(43530122-43530209)
chr8 (339-380)||(4733832-4733873)
chr8 (184-240)||(13985954-13986011)
chr8 (339-425)||(31566514-31566600)
chr8 (17-89)||(6375960-6376032)
[»] chr2 (92 HSPs)
chr2 (46-487)||(19007560-19008003)
chr2 (46-487)||(28196557-28196998)
chr2 (47-469)||(6264058-6264479)
chr2 (44-487)||(22287228-22287673)
chr2 (44-487)||(42923398-42923848)
chr2 (44-449)||(21520620-21521032)
chr2 (46-487)||(14837193-14837631)
chr2 (52-487)||(3022089-3022535)
chr2 (44-487)||(6258709-6259152)
chr2 (46-487)||(17849037-17849480)
chr2 (44-387)||(40032047-40032395)
chr2 (46-387)||(11739553-11739895)
chr2 (77-427)||(17848394-17848741)
chr2 (45-387)||(19504340-19504681)
chr2 (79-436)||(44289010-44289370)
chr2 (47-387)||(19502005-19502345)
chr2 (45-487)||(27104718-27105165)
chr2 (43-387)||(45279978-45280323)
chr2 (45-487)||(13909932-13910380)
chr2 (44-387)||(23452231-23452578)
chr2 (54-487)||(34979481-34979906)
chr2 (44-387)||(42064433-42064776)
chr2 (44-387)||(42452701-42453041)
chr2 (46-358)||(45239000-45239316)
chr2 (44-432)||(43623526-43623905)
chr2 (46-435)||(31732725-31733100)
chr2 (47-303)||(15539553-15539809)
chr2 (45-387)||(24162217-24162548)
chr2 (86-383)||(35215584-35215881)
chr2 (86-383)||(35217961-35218258)
chr2 (46-436)||(11578052-11578439)
chr2 (136-487)||(28459084-28459435)
chr2 (176-487)||(5375237-5375550)
chr2 (252-472)||(22407361-22407583)
chr2 (19-386)||(22874035-22874391)
chr2 (44-428)||(18800266-18800639)
chr2 (262-487)||(22707643-22707872)
chr2 (46-223)||(22163106-22163282)
chr2 (121-428)||(17897199-17897502)
chr2 (86-226)||(38020162-38020302)
chr2 (121-449)||(20146540-20146866)
chr2 (44-199)||(22407591-22407746)
chr2 (198-385)||(36558860-36559047)
chr2 (198-385)||(36561137-36561324)
chr2 (198-383)||(45332179-45332364)
chr2 (19-384)||(37962938-37963289)
chr2 (261-436)||(23870951-23871128)
chr2 (182-409)||(40699429-40699660)
chr2 (295-485)||(22162918-22163108)
chr2 (44-383)||(35107218-35107553)
chr2 (252-487)||(7462837-7463077)
chr2 (136-311)||(27136195-27136368)
chr2 (86-181)||(5377629-5377724)
chr2 (169-268)||(38414194-38414291)
chr2 (357-472)||(15539436-15539553)
chr2 (199-316)||(20589763-20589881)
chr2 (47-140)||(38020064-38020157)
chr2 (144-236)||(43139395-43139484)
chr2 (144-240)||(27583480-27583573)
chr2 (44-110)||(12342681-12342747)
chr2 (183-316)||(15693958-15694094)
chr2 (412-487)||(38020368-38020443)
chr2 (184-240)||(17921754-17921811)
chr2 (183-240)||(26345661-26345718)
chr2 (144-240)||(35028595-35028688)
chr2 (339-381)||(17057369-17057411)
chr2 (339-381)||(17085352-17085394)
chr2 (414-487)||(45279888-45279959)
chr2 (339-398)||(17943674-17943734)
chr2 (184-226)||(34575265-34575308)
chr2 (19-94)||(40699203-40699278)
chr2 (339-381)||(723744-723786)
chr2 (199-237)||(2736205-2736243)
chr2 (199-237)||(2740941-2740979)
chr2 (339-381)||(11067431-11067473)
chr2 (339-381)||(11151591-11151633)
chr2 (199-237)||(17462436-17462474)
chr2 (199-237)||(20054909-20054947)
chr2 (199-237)||(22712660-22712698)
chr2 (199-237)||(22717369-22717407)
chr2 (339-381)||(33162450-33162492)
chr2 (339-381)||(34139770-34139812)
chr2 (414-487)||(35215479-35215550)
chr2 (339-381)||(39284962-39285004)
chr2 (199-237)||(39680045-39680083)
chr2 (199-237)||(39686983-39687021)
chr2 (199-237)||(45567409-45567447)
chr2 (339-388)||(1345592-1345641)
chr2 (339-388)||(2838081-2838130)
chr2 (184-240)||(7502975-7503032)
chr2 (184-240)||(30720754-30720811)
chr2 (339-398)||(12781204-12781264)
[»] chr7 (120 HSPs)
chr7 (46-487)||(21678020-21678459)
chr7 (46-487)||(44724533-44724975)
chr7 (44-487)||(443547-443995)
chr7 (46-487)||(4295828-4296271)
chr7 (44-487)||(42330893-42331336)
chr7 (46-485)||(21679981-21680423)
chr7 (46-487)||(11355212-11355657)
chr7 (44-468)||(13099383-13099813)
chr7 (71-449)||(21592073-21592453)
chr7 (46-429)||(20137061-20137444)
chr7 (44-472)||(27306138-27306566)
chr7 (44-487)||(31434940-31435384)
chr7 (46-477)||(39145888-39146322)
chr7 (47-487)||(21990106-21990548)
chr7 (86-487)||(9679053-9679457)
chr7 (46-449)||(9680768-9681179)
chr7 (44-487)||(38393934-38394388)
chr7 (44-387)||(44516-44859)
chr7 (47-483)||(37412018-37412462)
chr7 (86-387)||(48457647-48457948)
chr7 (53-428)||(24748555-24748931)
chr7 (33-487)||(42223097-42223553)
chr7 (86-487)||(18345535-18345943)
chr7 (86-387)||(7471974-7472275)
chr7 (44-487)||(35581-36031)
chr7 (86-387)||(20297356-20297657)
chr7 (86-387)||(20626032-20626333)
chr7 (86-387)||(20629923-20630224)
chr7 (86-387)||(20642342-20642643)
chr7 (45-487)||(40836630-40837078)
chr7 (45-387)||(1049290-1049631)
chr7 (86-387)||(7470016-7470317)
chr7 (44-487)||(20299406-20299862)
chr7 (86-387)||(1849975-1850276)
chr7 (86-487)||(28487547-28487955)
chr7 (91-387)||(40946327-40946623)
chr7 (86-387)||(1046919-1047219)
chr7 (86-387)||(3878571-3878872)
chr7 (44-387)||(3035669-3036019)
chr7 (79-435)||(27832585-27832936)
chr7 (71-382)||(24258442-24258757)
chr7 (46-316)||(25276095-25276365)
chr7 (45-387)||(25542484-25542823)
chr7 (44-387)||(28485514-28485860)
chr7 (44-384)||(31155908-31156248)
chr7 (86-384)||(7351649-7351947)
chr7 (161-387)||(7092207-7092432)
chr7 (44-322)||(11757176-11757460)
chr7 (19-487)||(7188470-7188931)
chr7 (86-369)||(7349285-7349568)
chr7 (96-387)||(43253511-43253801)
chr7 (161-387)||(7094454-7094679)
chr7 (18-326)||(22828687-22828996)
chr7 (121-428)||(24813450-24813755)
chr7 (18-317)||(20091609-20091904)
chr7 (19-371)||(24817362-24817710)
chr7 (77-285)||(26804554-26804765)
chr7 (45-316)||(22251611-22251878)
chr7 (47-435)||(24465503-24465878)
chr7 (44-210)||(18567565-18567731)
chr7 (170-387)||(38396713-38396929)
chr7 (252-436)||(26295607-26295790)
chr7 (243-435)||(22393873-22394066)
chr7 (198-384)||(2935374-2935560)
chr7 (44-246)||(22392425-22392615)
chr7 (198-487)||(1606486-1606781)
chr7 (198-385)||(22137184-22137370)
chr7 (198-385)||(40552211-40552397)
chr7 (198-385)||(22108173-22108359)
chr7 (198-385)||(40549933-40550119)
chr7 (198-384)||(9027191-9027376)
chr7 (121-384)||(11081540-11081803)
chr7 (154-384)||(6332283-6332514)
chr7 (361-486)||(22251478-22251605)
chr7 (121-316)||(6048903-6049094)
chr7 (344-472)||(26804762-26804893)
chr7 (153-240)||(11084438-11084523)
chr7 (252-316)||(6348942-6349006)
chr7 (339-487)||(11759374-11759529)
chr7 (184-240)||(16297166-16297222)
chr7 (44-169)||(30906264-30906387)
chr7 (92-153)||(38396316-38396377)
chr7 (414-487)||(7471867-7471938)
chr7 (160-240)||(12310157-12310236)
chr7 (153-240)||(26210603-26210688)
chr7 (414-487)||(1850312-1850383)
chr7 (414-487)||(3036055-3036126)
chr7 (339-381)||(12097867-12097909)
chr7 (414-487)||(20297693-20297764)
chr7 (414-487)||(28485896-28485967)
chr7 (183-237)||(2120881-2120937)
chr7 (266-369)||(6046668-6046772)
chr7 (199-240)||(21369642-21369683)
chr7 (187-240)||(40281519-40281572)
chr7 (86-141)||(7094662-7094717)
chr7 (341-427)||(20091109-20091196)
chr7 (414-487)||(44895-44966)
chr7 (199-237)||(3320194-3320232)
chr7 (199-237)||(3324942-3324980)
chr7 (199-237)||(7069780-7069818)
chr7 (199-237)||(7074787-7074825)
chr7 (339-381)||(9190059-9190101)
chr7 (199-237)||(15541139-15541177)
chr7 (199-237)||(25351353-25351391)
chr7 (333-398)||(25351484-25351550)
chr7 (199-237)||(25357047-25357085)
chr7 (199-237)||(25405393-25405431)
chr7 (199-237)||(25410130-25410168)
chr7 (414-487)||(25542859-25542930)
chr7 (339-381)||(27347943-27347985)
chr7 (339-381)||(36146408-36146450)
chr7 (339-381)||(41317434-41317476)
chr7 (199-237)||(42006663-42006701)
chr7 (414-487)||(48457984-48458055)
chr7 (339-380)||(4253529-4253570)
chr7 (132-177)||(6348859-6348903)
chr7 (337-381)||(4796716-4796760)
chr7 (414-477)||(7469919-7469980)
chr7 (416-487)||(38396972-38397041)
chr7 (416-487)||(40946663-40946732)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (86-487)||(14276-14677)
scaffold0131 (44-400)||(14970-15326)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (46-428)||(13057173-13057557)
chr6 (46-487)||(3629758-3630199)
chr6 (52-469)||(3631849-3632267)
chr6 (45-487)||(11982918-11983365)
chr6 (33-387)||(3390345-3390700)
chr6 (44-468)||(9019903-9020332)
chr6 (44-434)||(32279974-32280366)
chr6 (46-428)||(13039733-13040117)
chr6 (46-387)||(25477253-25477602)
chr6 (53-387)||(14458761-14459093)
chr6 (46-472)||(24338357-24338783)
chr6 (44-487)||(30728716-30729165)
chr6 (43-387)||(1230243-1230587)
chr6 (43-387)||(28241315-28241659)
chr6 (44-487)||(14507063-14507512)
chr6 (45-387)||(15541134-15541476)
chr6 (86-387)||(4816225-4816526)
chr6 (46-436)||(3233666-3234065)
chr6 (44-387)||(15532676-15533018)
chr6 (46-436)||(12161501-12161889)
chr6 (86-386)||(20915351-20915651)
chr6 (44-327)||(15530177-15530459)
chr6 (86-387)||(30967220-30967521)
chr6 (86-384)||(19704564-19704864)
chr6 (44-387)||(30034597-30034944)
chr6 (86-387)||(2628880-2629179)
chr6 (44-381)||(12195515-12195852)
chr6 (86-384)||(26065005-26065298)
chr6 (86-384)||(26084974-26085267)
chr6 (187-487)||(1069610-1069913)
chr6 (54-316)||(22490626-22490889)
chr6 (86-384)||(26932559-26932857)
chr6 (144-428)||(14466399-14466688)
chr6 (44-434)||(3027799-3028187)
chr6 (78-428)||(15719665-15720005)
chr6 (133-477)||(15367101-15367441)
chr6 (45-275)||(19227514-19227744)
chr6 (166-384)||(5273213-5273431)
chr6 (52-436)||(17012029-17012407)
chr6 (255-477)||(15346535-15346756)
chr6 (46-194)||(32447502-32447651)
chr6 (132-384)||(16455421-16455672)
chr6 (183-449)||(12186003-12186271)
chr6 (198-384)||(26066121-26066307)
chr6 (198-384)||(33311257-33311442)
chr6 (53-195)||(13870608-13870749)
chr6 (44-191)||(1072067-1072214)
chr6 (198-384)||(33308988-33309173)
chr6 (79-428)||(19696453-19696803)
chr6 (198-385)||(29754705-29754892)
chr6 (198-384)||(26068392-26068578)
chr6 (182-436)||(26945258-26945515)
chr6 (44-175)||(17852519-17852650)
chr6 (44-212)||(15346368-15346524)
chr6 (153-428)||(22857906-22858181)
chr6 (44-158)||(8995456-8995570)
chr6 (46-159)||(10584105-10584213)
chr6 (299-417)||(10584227-10584348)
chr6 (78-424)||(25078514-25078856)
chr6 (262-428)||(25465544-25465710)
chr6 (144-241)||(20526885-20526979)
chr6 (185-384)||(28037722-28037927)
chr6 (396-477)||(3394698-3394780)
chr6 (184-312)||(7542452-7542581)
chr6 (184-239)||(11138423-11138479)
chr6 (266-357)||(30445723-30445815)
chr6 (416-487)||(4816117-4816186)
chr6 (44-103)||(15367013-15367079)
chr6 (199-237)||(3577658-3577696)
chr6 (120-177)||(4595048-4595102)
chr6 (199-237)||(13878727-13878765)
chr6 (199-237)||(13883475-13883513)
chr6 (199-237)||(16785919-16785957)
chr6 (199-237)||(26887368-26887406)
chr6 (339-381)||(26954286-26954328)
chr6 (266-316)||(28078261-28078310)
chr6 (414-487)||(28241208-28241279)
chr6 (199-237)||(31248858-31248896)
chr6 (339-381)||(31936591-31936633)
chr6 (339-381)||(33211185-33211227)
chr6 (199-237)||(35201470-35201508)
chr6 (155-226)||(6843217-6843287)
chr6 (153-213)||(30445602-30445661)
[»] chr4 (134 HSPs)
chr4 (46-487)||(38928071-38928513)
chr4 (44-487)||(22802624-22803071)
chr4 (46-487)||(12395737-12396180)
chr4 (44-477)||(40091317-40091752)
chr4 (43-487)||(40637069-40637519)
chr4 (46-487)||(12400699-12401142)
chr4 (71-487)||(33415381-33415797)
chr4 (44-477)||(48486315-48486752)
chr4 (44-479)||(24878985-24879425)
chr4 (21-435)||(16453282-16453697)
chr4 (44-487)||(22800752-22801199)
chr4 (44-487)||(24888792-24889239)
chr4 (46-387)||(19095880-19096222)
chr4 (44-487)||(36919476-36919924)
chr4 (44-487)||(36921385-36921832)
chr4 (19-487)||(36378263-36378731)
chr4 (44-487)||(14787321-14787770)
chr4 (44-479)||(24880447-24880889)
chr4 (43-387)||(14633315-14633657)
chr4 (44-448)||(47274723-47275126)
chr4 (44-384)||(619445-619784)
chr4 (86-387)||(8631413-8631714)
chr4 (44-387)||(5198416-5198759)
chr4 (45-387)||(11434952-11435293)
chr4 (44-487)||(51015242-51015691)
chr4 (77-387)||(37313059-37313370)
chr4 (44-487)||(22046573-22047022)
chr4 (86-487)||(37089259-37089666)
chr4 (44-487)||(22044278-22044727)
chr4 (86-387)||(24348256-24348557)
chr4 (43-387)||(47868396-47868740)
chr4 (44-387)||(9148247-9148591)
chr4 (86-387)||(11006231-11006532)
chr4 (86-387)||(11008562-11008861)
chr4 (43-387)||(6764834-6765183)
chr4 (86-387)||(38409243-38409543)
chr4 (47-377)||(56030443-56030770)
chr4 (43-487)||(2484760-2485211)
chr4 (52-428)||(41997496-41997872)
chr4 (86-387)||(7941359-7941662)
chr4 (86-361)||(13543997-13544272)
chr4 (44-487)||(17662137-17662575)
chr4 (44-383)||(44599836-44600175)
chr4 (45-387)||(18847150-18847491)
chr4 (121-387)||(26085971-26086236)
chr4 (86-384)||(18709161-18709458)
chr4 (45-384)||(9174143-9174482)
chr4 (45-384)||(16934140-16934479)
chr4 (132-487)||(27499129-27499489)
chr4 (52-387)||(19322701-19323034)
chr4 (86-387)||(31849593-31849894)
chr4 (190-487)||(2891433-2891733)
chr4 (52-384)||(9176471-9176803)
chr4 (162-394)||(16455355-16455588)
chr4 (86-322)||(5637524-5637760)
chr4 (45-487)||(16931677-16932125)
chr4 (86-384)||(22132389-22132684)
chr4 (86-383)||(22780371-22780668)
chr4 (86-383)||(22782736-22783033)
chr4 (124-436)||(36380425-36380738)
chr4 (86-322)||(3824629-3824863)
chr4 (46-409)||(18537444-18537806)
chr4 (46-384)||(18409344-18409681)
chr4 (86-384)||(22134615-22134909)
chr4 (72-487)||(18534729-18535138)
chr4 (46-276)||(3937314-3937543)
chr4 (52-303)||(52942537-52942776)
chr4 (196-449)||(13547302-13547557)
chr4 (86-371)||(47210762-47211035)
chr4 (46-266)||(6132871-6133090)
chr4 (252-485)||(4215510-4215742)
chr4 (44-409)||(8756221-8756587)
chr4 (44-387)||(53405123-53405472)
chr4 (46-209)||(38270158-38270321)
chr4 (132-436)||(38890169-38890472)
chr4 (46-209)||(24446756-24446914)
chr4 (19-374)||(15032554-15032898)
chr4 (136-436)||(30136640-30136939)
chr4 (296-487)||(47563009-47563200)
chr4 (252-487)||(5635363-5635605)
chr4 (145-428)||(28453782-28454067)
chr4 (44-184)||(5100993-5101133)
chr4 (183-384)||(12102221-12102425)
chr4 (252-387)||(11437567-11437701)
chr4 (339-487)||(14789320-14789470)
chr4 (252-387)||(5101133-5101267)
chr4 (46-158)||(2891314-2891427)
chr4 (142-409)||(47150863-47151131)
chr4 (316-487)||(6133105-6133278)
chr4 (53-260)||(10112876-10113080)
chr4 (184-449)||(25357772-25358042)
chr4 (42-314)||(40999017-40999286)
chr4 (268-482)||(24446554-24446754)
chr4 (153-381)||(3982175-3982411)
chr4 (132-428)||(9863795-9864092)
chr4 (199-384)||(16185831-16186018)
chr4 (154-240)||(10114435-10114519)
chr4 (270-472)||(49088791-49088982)
chr4 (183-316)||(31983593-31983727)
chr4 (342-449)||(52942416-52942527)
chr4 (338-428)||(3937227-3937317)
chr4 (416-487)||(9176360-9176429)
chr4 (19-117)||(16455258-16455356)
chr4 (416-487)||(9174032-9174101)
chr4 (19-91)||(36380345-36380417)
chr4 (153-240)||(38208825-38208911)
chr4 (121-240)||(9022380-9022495)
chr4 (416-487)||(5198781-5198850)
chr4 (416-487)||(8631305-8631374)
chr4 (414-477)||(9148610-9148671)
chr4 (416-487)||(11006140-11006209)
chr4 (416-487)||(11008454-11008523)
chr4 (416-487)||(31849485-31849554)
chr4 (339-381)||(5143263-5143305)
chr4 (339-381)||(5269242-5269284)
chr4 (199-237)||(7050401-7050439)
chr4 (199-237)||(11853549-11853587)
chr4 (339-381)||(12739550-12739592)
chr4 (19-140)||(16186079-16186199)
chr4 (414-487)||(24348576-24348647)
chr4 (339-381)||(26175636-26175678)
chr4 (339-381)||(36463389-36463431)
chr4 (414-487)||(38409579-38409650)
chr4 (414-471)||(47210699-47210754)
chr4 (339-381)||(48893638-48893680)
chr4 (199-237)||(55822265-55822303)
chr4 (403-472)||(5101273-5101342)
chr4 (199-240)||(5336923-5336964)
chr4 (184-240)||(54906722-54906779)
chr4 (339-398)||(8529406-8529466)
chr4 (339-409)||(10114608-10114680)
chr4 (202-238)||(16489352-16489388)
chr4 (339-398)||(18587105-18587165)
chr4 (202-238)||(25699752-25699788)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (44-487)||(51960-52409)
scaffold0005 (43-387)||(183635-183977)
scaffold0005 (339-487)||(50260-50410)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (44-448)||(3948-4351)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (52-487)||(79144-79584)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (46-487)||(79812-80258)
scaffold0004 (199-237)||(188386-188424)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (43-387)||(41477-41821)
scaffold0038 (414-487)||(41370-41441)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (44-387)||(69286-69632)
scaffold0025 (86-197)||(73207-73318)
scaffold0025 (165-208)||(73160-73203)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (44-435)||(11415-11810)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (45-384)||(6151-6490)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (45-382)||(2832-3168)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (86-384)||(34-332)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (46-487)||(85184-85626)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (86-385)||(29164-29462)
scaffold0068 (414-487)||(29500-29571)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (19-384)||(15817-16180)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (162-387)||(1447-1671)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (87-324)||(2036-2272)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (55-436)||(1586-1958)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (53-384)||(16646-16975)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (46-273)||(35593-35819)
scaffold0011 (347-487)||(35848-35992)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (52-369)||(4773-5089)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (198-385)||(22221-22407)
scaffold0140 (198-385)||(24496-24682)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (43-214)||(993-1169)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (339-385)||(4675-4721)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (347-387)||(1445-1485)
scaffold1674 (414-477)||(1348-1409)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (339-381)||(20415-20457)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (199-237)||(224819-224857)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 37706142 - 37705674
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706142 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 37706043  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706042 ggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 37705943  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37705942 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 37705843  T
Q  319 agtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttt 418  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37705842 agtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctctcgctgttt 37705743  T
Q  419 tctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705742 tctacttttggcttgtgtttttaattattccatatactttgttttggttgcttggttattccttgctcc 37705674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 46 - 472
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904475
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 25904346  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  25904347 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggtttgtgtttataat 25904446  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    | |||| || ||| ||||||  |||||||    
T  25904447 tgttccatacactttgttttcattgcttg 25904475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10474652 - 10474215
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474652 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 10474553  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||  | ||      
T  10474552 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgag 10474453  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||    
T  10474452 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatact 10474353  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  10474352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctaatttctacttttcgcttgtgtttataattgttcc 10474253  T
Q  450 ttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10474252 atacactttgttttggttacttgattattccttgctcc 10474215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17818851 - 17818382
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  17818851 agatttgttacaattttatgggagttacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaa 17818753  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  17818752 ggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagt 17818653  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 318  Q
    |||||||||||| |||||||||  || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  17818652 ctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatac 17818553  T
Q  319 agtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctt--tctctctggct 414  Q
    |||| |||  | | |  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | ||||||  ||||||| |||    
T  17818552 agtggaacagagggc--ttctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctcttttcctttctctctctcgct 17818455  T
Q  415 gttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17818454 gttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 17818382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 472
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073259
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||     
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | ||| | ||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17073126  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||| ||||||| |     
T  17073127 ccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctctttatttttctctcgctgttgttttctacttttgacttgtgttta 17073226  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    ||||| |||| || ||| |||||| ||||||||    
T  17073227 taattgttccatacactttgttttagttgcttg 17073259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 40 - 472
Target Start/End: Original strand, 40221460 - 40221901
Alignment:
Q  40 gagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  40221460 gagttacttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 40221559  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40221560 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagat 40221659  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
    | ||  | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |     
T  40221660 tgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctc 40221759  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctt------tctctctggctgttttctacttttggc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| | ||| ||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221760 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttcctttctctctctctctcgctgttttctacttttggc 40221859  T
Q  431 ttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  40221860 ttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttg 40221901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18511507 - 18511103
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18511507 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 18511408  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18511407 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccg 18511308  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511307 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 18511208  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattcctt 482  Q
      ||| ||||| ||||| ||||||||   | |||||||||||||| |||||||| | ||||| || | || ||| |||||| ||||||||  ||| ||||    
T  18511207 ttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctactttttgcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttagttgcttgactatccctt 18511108  T
Q  483 gctcc 487  Q
    |||||    
T  18511107 gctcc 18511103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127184
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24127099  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24127100 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctctcgttgttttctacttttg 24127184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 26097675 - 26098118
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |    
T  26097675 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgga 26097774  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |   | ||    
T  26097775 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||| | |||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaac-agaggctgctctctcc 26097972  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  26097973 tccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctatctcgctgttttctacttttggctagtgtttata 26098072  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26098073 attgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 26098118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 21947969 - 21948421
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21947969 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 21948067  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||    
T  21948068 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggg 21948167  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  21948168 actttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 21948267  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctt------tctctctggctgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21948268 cccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctccctctctctcgctattttctacttttggcttgtg 21948367  T
Q  436 tatttaattattccttatac--tatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | | ||||| |||| || ||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21948368 tttataattgttccatacactttattttttggttgcttgattatcccttgctcc 21948421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189499
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 140  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  141 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  241 agggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
      |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |  || | |    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  340 ctcc-cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgcagttttctacttttggcttgtgt 1189550  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | ||||| |||| || | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1189549 ttataattgttccatacattttgttttggtggcttgattattccttgctcc 1189499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10529437 - 10529093
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |    
T  10529437 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttt 10529338  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10529337 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 10529238  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||    
T  10529237 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctc 10529138  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10529137 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 10529093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 43 - 449
Target Start/End: Original strand, 39854425 - 39854835
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39854425 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 39854523  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |    
T  39854524 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgg 39854623  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
       | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||    
T  39854624 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 39854723  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||||||||     
T  39854724 ccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctctcgctgttgttttttacttttggcttgtgtt 39854823  T
Q  438 tttaattattcc 449  Q
    | ||||| ||||    
T  39854824 tataattgttcc 39854835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2818673 - 2818224
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  2818673 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgta 2818574  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt-gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  | |    
T  2818573 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgg 2818474  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||    
T  2818473 gactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctc 2818374  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||     
T  2818373 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtt 2818275  T
Q  438 tttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| |||| || ||| || |||||| ||| || |||| |||||||||    
T  2818274 tataattgttccatacactttgattttggatgcctgattatcccttgctcc 2818224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 86 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092107
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || | ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaatt 16092196  T
Q  385 c--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |  ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  16092195 cttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgcgtttacaattgttccatatactttg-tttggttgcttg 16092107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804416
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25804209 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattc 25804307  T
Q  386 --ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggtt 475  Q
      ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  25804308 ttttgtgttcttgtcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 25804404  T
Q  476 attccttgctcc 487  Q
    ||  ||||||||    
T  25804405 atctcttgctcc 25804416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18509648 - 18509209
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag-ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 150  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||| | || |||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18509648 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18509549  T
Q  151 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  | |||    
T  18509548 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgg 18509449  T
Q  251 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||||| ||||    
T  18509448 gtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagac 18509349  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 447  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  18509348 taggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 18509249  T
Q  448 ccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | || ||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  18509248 tcatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctcc 18509209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25921810 - 25921360
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25921810 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 25921711  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  25921710 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 25921611  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||| | |||||    
T  25921610 actctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcc 25921511  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||      
T  25921510 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct-- 25921414  T
Q  434 tgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25921413 tgtatttaattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctcc 25921360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472606
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||      
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | | | |||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  || | ||||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctccc 31472649  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472648 ccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 31472606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 487
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756879
Alignment:
Q  78 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 177  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6756470 taaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 6756569  T
Q  178 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattctt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756570 tgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 6756669  T
Q  278 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 376  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  6756670 gtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaacg-agggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtc 6756766  T
Q  377 aacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggt 474  Q
    |||||| ||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || ||| ||||||| |||| || |    
T  6756767 aacaaaatcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttgattgcctgat 6756866  T
Q  475 tattccttgctcc 487  Q
    |||  ||||||||    
T  6756867 tatcacttgctcc 6756879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 45 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31465884
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtat 31466215  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  31466214 agagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 31466115  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||          | ||| | || |||    
T  31466114 ctttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatatag----------ggctgctctcaccc 31466026  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31466025 ccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataa 31465926  T
Q  443 ttattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttg 483  Q
    || |||| || ||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  31465925 ttgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttg 31465884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658250
Alignment:
Q  124 caacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  224 ggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtga 323  Q
    ||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  324 aacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttct 421  Q
    |||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  || ||||| ||||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc--ttttctcttgctgttttct 658316  T
Q  422 acttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||| ||| | | ||| |||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  658315 acttttggcttatgtttattattgttccgtacactttgttttggttgcctgattattccttgctcc 658250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 36402665 - 36402217
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||  || || ||||||||||||    
T  36402665 tacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgta 36402566  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |     
T  36402565 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattgga 36402466  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||    
T  36402465 actttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcc 36402366  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||| |    
T  36402365 cccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttagcttgtgttt 36402267  T
Q  439 ttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||  || ||| || |||||||||| || |||| |||||||||    
T  36402266 ataattgttctatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctcc 36402217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 4236571 - 4236913
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4236571 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4236670  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  4236671 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 4236770  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  4236771 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 4236870  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4236871 cccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattctt 4236913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882390
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38882147  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  38882148 tagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 38882247  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  38882248 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 38882346  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38882347 tccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 38882390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 463
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745433
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 6745351  T
Q  386 --ttgcgttct-ttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgtttt 463  Q
      ||| ||||| || ||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||    
T  6745352 ttttgtgttctcttattcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttt 6745433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397987
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |      
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  || ||||||| ||||| ||| ||| | ||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccc 39398030  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39398029 acagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattctt 39397987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 2174903 - 2175203
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2174903 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 2175002  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175003 gattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 2175102  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2175103 ttgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 2175201  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  2175202 tt 2175203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 18466668 - 18466969
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18466668 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 18466767  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466768 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18466867  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| || |||| |   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18466868 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 18466967  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  18466968 tt 18466969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 27912520 - 27912821
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||    
T  27912520 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggtt 27912619  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912620 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27912719  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||  |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27912720 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27912819  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  27912820 tt 27912821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 449
Target Start/End: Original strand, 18596589 - 18596994
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  18596589 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaagac--aacaacaaaactagggtttgta 18596686  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18596687 tagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 18596886  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||   ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |     
T  18596887 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttcgactcttcttttctctc--gctgttttctacttttgacttgtgttta 18596984  T
Q  440 taattattcc 449  Q
    ||||| ||||    
T  18596985 taattgttcc 18596994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 468
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954783
Alignment:
Q  54 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 153  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||  || ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  154 ctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  | ||| |    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || | |  || | ||||||||| ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  353 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtg-tatttaattattcc 449  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgttacataattgttcc 2954764  T
Q  450 ttatactatgttttggttg 468  Q
     || ||| |||||||||||    
T  2954765 atacactttgttttggttg 2954783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530731
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 79 - 487
Target Start/End: Original strand, 16776135 - 16776547
Alignment:
Q  79 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16776135 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggttt 16776234  T
Q  179 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttg 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16776235 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 16776334  T
Q  279 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 378  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  16776335 taa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaa 16776433  T
Q  379 caaattc--ttgcgttctttct-tcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |||||||  ||| |||||  || | |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| | | ||||| || | || ||| ||||||| |||| ||    
T  16776434 caaattcttttgtgttctcgctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtat-tataattgtttcatacactttgttttgattgcctg 16776532  T
Q  473 gttattccttgctcc 487  Q
     ||||||||||||||    
T  16776533 attattccttgctcc 16776547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 164 - 485
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724278
Alignment:
Q  164 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  264 ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgg 363  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  364 accgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgtt 461  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctttcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtt 2724254  T
Q  462 ttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
T  2724255 ttggttgcttgattatcccttgct 2724278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179259
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  31179507 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31179409  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggctgtt----ttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||| |    |||| ||| || |||    |||||||||||||||||    
T  31179408 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttcttctacttttggcttgt 31179310  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31179309 g--tttaattattccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctcc 31179259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12556260 - 12555805
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  12556260 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 12556161  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |     
T  12556160 tagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattgga 12556061  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    ||| ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||| || || |||||| | | ||| | ||||    
T  12556060 gttttgg-tagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctc 12555962  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc----------tttcttcctttctctctggctgttttctacttttggc 430  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||          | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12555961 ccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttctcttctcttcttttctctctcgttgttttctacttttggc 12555862  T
Q  431 ttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||  | ||||| || | || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12555861 ttgtgattataattgtttcatacactttattttggttgcttgattattccttgctcc 12555805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477048
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  284 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34477149 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34477051  T
Q  384 tct 386  Q
    |||    
T  34477050 tct 34477048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545362
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31545122  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  31545123 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattggg 31545222  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  31545223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31545321  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31545322 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31545362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696203
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
              ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 696120  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||   | |||||||||||||||    
T  696121 ccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctttctttctct---gttgttttctacttttg 696203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 486
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747695
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggtt 6747388  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 6747488  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||| | || | | ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6747489 ttgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 6747587  T
Q  386 tt--gcgttct-ttcttcctttctctctg-gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg---ttttggttgcttggttatt 478  Q
    ||  | ||||| |||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||   ||||||||||||| ||||     
T  6747588 ttttgtgttctcttcttcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtgtttttggttgcttgattatc 6747687  T
Q  479 ccttgctc 486  Q
     |||||||    
T  6747688 tcttgctc 6747695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 18468995 - 18469294
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaaccca 18469194  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||   |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  18469195 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctg--ctctctcccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattc 18469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 27910435 - 27910735
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaa-ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27910633  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| || |||| |   ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27910634 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27910733  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  27910734 tt 27910735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 487
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289146
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  153 tctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     |||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||        ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21289005  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||   ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||| |    
T  21289006 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttttgttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttattattct 21289105  T
Q  447 tccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  21289106 tccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 21289146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31543016
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31542777  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31542778 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31542877  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  31542878 actttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31542975  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31542976 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31543016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479412
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  |  | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  284 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34479514 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34479416  T
Q  384 tctt 387  Q
    ||||    
T  34479415 tctt 34479412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684448
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21684546 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 21684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552527
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15552429 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15552527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 169 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585637
Alignment:
Q  169 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  269 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccga 368  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  369 actaggtcaacaaattct-----------tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacta 457  Q
    ||| ||||||||||||||           |  ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||     
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctgttctatcttcttttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactt 41585657  T
Q  458 tgttttggttgcttggttat 477  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  41585656 tgttttggttgcttgattat 41585637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 180 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505734
Alignment:
Q  180 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  280 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 379  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  380 aaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatact---atgttttggttgcttggt 474  Q
    ||||||  ||| ||||| ||||  ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || |||   || |||||||||| || |    
T  20505844 aaattcttttgtgttctctcttattttctctc--gttgttttctagttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttttggttgcctgat 20505747  T
Q  475 tattccttgctcc 487  Q
    |||| ||||||||    
T  20505746 tattacttgctcc 20505734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6661511 - 6661083
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||   |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  6661511 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagttt 6661413  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  | || |||     
T  6661412 gt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttggg 6661316  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| | |||||| |||||    
T  6661315 tacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagac 6661216  T
Q  351 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 448  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| || ||||  |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| | |||   |||    
T  6661215 taggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttc--tctttcttt-tctctcgttgttttctactttt-gcttgtgtttataa--cttc 6661122  T
Q  449 cttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | || ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6661121 catacactttattttggttgcttgattattacttgctcc 6661083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043188
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 20043188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||      
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgg 264  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26098588 - 26098386
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||    
T  26098588 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgta 26098489  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  26098488 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggg 26098389  T
Q  244 gtt 246  Q
    |||    
T  26098388 gtt 26098386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 387
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587117
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||      
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct- 341  Q
    |  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||     
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10587071  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10587072 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 10587117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 387
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798332
Alignment:
Q  181 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  281 acccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 380  Q
    |||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  381 aattctt 387  Q
    |||||||    
T  39798326 aattctt 39798332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 169 - 387
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410307
Alignment:
Q  169 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggaga 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  269 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccga 368  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | |   ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  369 actaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattctt 4410307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 486
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208959
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||  |     
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcggg-agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
     | ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||   | ||| | | ||    
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttc 36208817  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcg-ttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36208818 ccc-atactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtttctctctttctttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgattata 36208914  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctc 486  Q
    ||| |||  || ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  36208915 attgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctc 36208959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 316
Target Start/End: Original strand, 9020197 - 9020432
Alignment:
Q  76 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 175  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||| || |  | |||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9020197 tgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggaggcaaca-caaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactaggg 9020293  T
Q  176 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattc 275  Q
    ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | | ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9020294 ttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattc 9020391  T
Q  276 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9020392 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 9020432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 198 - 387
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749985
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattctt 10749985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 290 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098178
Alignment:
Q  290 tatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 388  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  389 c--gttctttcttcctttctctctg--gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgc 484  Q
       ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26098280 tatgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgc 26098181  T
Q  485 tcc 487  Q
    |||    
T  26098180 tcc 26098178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 387
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757461
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  10757371 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattctt 10757461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 387
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054122
Alignment:
Q  89 atagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 188  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||  ||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  189 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||| ||  | |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt---tg--gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  289 atatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct 386  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | | ||| | ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354571
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||| | |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15354658 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 15354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665326
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  23665239 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23665326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793261
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  23793348 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23793261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373134
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | |  || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 3373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356847
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||| | |||||| | || | | ||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15356934 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 15356847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960129
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  38960215 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 38960129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413232
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  244 gttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
      | | | ||||||||||   | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17413232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20507799 - 20507659
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  || ||||||||    
T  20507799 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgta 20507700  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 184  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507699 tagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 357
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 282  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca 357  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 472
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043361
Alignment:
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctg 415  Q
    ||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctcgctg 20043304  T
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||| ||||||    
T  20043305 ttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggctgcttg 20043361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741855
Alignment:
Q  205 tattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 303  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaa 23741937  T
Q  304 ggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
     ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23741855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 42770691 - 42770904
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || | ||    
T  42770691 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa 42770789  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     ||||| |||||  || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  42770790 ggcaac-acaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttcattcaccatgggaa--actattaggactgagt 42770882  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  42770883 ctcttggtcacgggaagagatt 42770904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Original strand, 42770960 - 42771025
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcata 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42770960 tagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033632
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttgtgg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| || |||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  251 atagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccatt-gatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
     ||||||| ||   | |||||| || | ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34033699 gtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcat 34033632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Original strand, 4754188 - 4754312
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||      
T  4754188 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactg 4754282  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattagg 261  Q
    |||||||||  |  | ||||||||||||||    
T  4754283 gaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2144811 - 2144706
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttac 229  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  2144811 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgc 2144717  T
Q  230 gtgaagagatt 240  Q
    | |||||||||    
T  2144716 gggaagagatt 2144706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Original strand, 4410045 - 4410101
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4410045 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 240
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748485
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 219  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtc 29748464  T
Q  220 tcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||| ||| ||| |||||    
T  29748465 tcttggtcacgggaatagatt 29748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggg 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445263
Alignment:
Q  272 attcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | |||  |||||||||||||| | |||||| |||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaa 15445278  T
Q  370 ctaggtcaacaaatt 384  Q
    || ||| ||||||||    
T  15445277 ctgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41586043 - 41585946
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||   ||| |||||| ||||||||||    
T  41586043 tacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  202 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatcccttttg 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||  |||||||| || |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  301 taaggttactcatcat 316  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 2175222 - 2175293
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2175222 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 2175293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 38882409 - 38882480
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  38882409 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 38882480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224911
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | | |||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagatt 15224911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 477
Target Start/End: Original strand, 4236949 - 4237010
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  4236949 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 4237010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 477
Target Start/End: Original strand, 20045300 - 20045363
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20045300 tgttttttacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 20045363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31782690 - 31782598
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31782690 tctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 31782598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 34477011 - 34476939
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34477011 tgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctcc 34476939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170849
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 1170849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298145
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8565988 - 8565946
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8565988 tctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 8565946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 19806489 - 19806531
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19806489 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21684410 - 21684339
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  21684410 tgttttctacttttggct--tttatttaattgttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctcc 21684339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 32636950 - 32636992
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32636950 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385596
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35385596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627405
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 10627405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 22672973 - 22673033
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  22672973 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 22673033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 25445635 - 25445695
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  25445635 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 25445695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 119)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 46 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457387
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccc 11457513  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  11457512 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttaaaat 11457413  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgc 469  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||    
T  11457412 tgttccatatactttgttttggttgc 11457387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 469
Target Start/End: Original strand, 18307033 - 18307478
Alignment:
Q  26 ttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  18307033 ttacaattttatgggagctatttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaca 18307132  T
Q  126 acaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 225  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307133 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18307232  T
Q  226 ttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaa 324  Q
    ||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18307233 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaa 18307332  T
Q  325 acgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttcta 422  Q
    ||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18307333 acggatggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttcta 18307431  T
Q  423 cttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgc 469  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  18307432 cttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgc 18307478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 13215023 - 13215471
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13215023 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 13215122  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13215123 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13215222  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |     
T  13215223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctc 13215322  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13215323 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgttt 13215422  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  13215423 ataattgttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctcc 13215471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2949570 - 2949126
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  2949570 tacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 2949471  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||    
T  2949470 tagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 2949271  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2949270 ccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttata 2949172  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2949171 attgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctcc 2949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 43 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12302850 - 12302437
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctaggg 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12302850 ttacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactaggg 12302751  T
Q  138 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12302750 tttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 12302651  T
Q  238 attagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtt 337  Q
    ||| ||  | | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| |    
T  12302650 attgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 12302551  T
Q  338 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtg 435  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12302550 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttgacttgtg 12302451  T
Q  436 tatttaattattcc 449  Q
    | | ||||| ||||    
T  12302450 tttataattgttcc 12302437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839975
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |      
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||| | | ||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttccc 18839830  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  18839831 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctagttttggcttgtgtttataa 18839930  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| ||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  18839931 ttgttccatacactttgtttcgattacttgattattccttgctcc 18839975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 6756444 - 6756875
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||    
T  6756444 agatttgttacaattttatgagagttacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaa 6756543  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756544 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6756643  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat- 316  Q
    |||  || ||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  6756644 tct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 6756741  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttctccccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgc--gttctttcttcctttctctctggc 413  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    ||||| ||||| || |||||  ||    
T  6756742 atagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttctttcctctc--gc 6756839  T
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  6756840 tgttttctacttttgacttgtgtttataattgttcc 6756875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9241450 - 9240981
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  9241450 agatttgttccaattttatgggggttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaa-ggtttagaa 9241352  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9241351 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgag 9241252  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9241251 tctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 9241152  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggct 414  Q
    |||||| |||| | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||  |||    
T  9241151 atagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctttctttctctc--gct 9241054  T
Q  415 gttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||| |||| | | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  9241053 gttttctacttttggtttgtatttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctcc 9240981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 44 - 447
Target Start/End: Original strand, 41646862 - 41647267
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41646862 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41646961  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  41646962 tagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcg 41647061  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  41647062 actttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 41647161  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
      ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  41647162 atcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttgacttgtgtttata 41647261  T
Q  442 attatt 447  Q
    ||||||    
T  41647262 attatt 41647267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076567
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| ||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-cc 50076711  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  50076710 ccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgttgttttctacttttaacttgtgtttataa 50076612  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  50076611 ttgttccatacactttgttttagttgctttattattcattgctcc 50076567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 77 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 50307853 - 50307436
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 175  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307853 gtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 50307754  T
Q  176 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50307753 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 50307654  T
Q  276 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 375  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50307653 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 50307554  T
Q  376 caacaaattc---ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttg 468  Q
    ||||||||||   ||| ||||| ||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || |||||||||    
T  50307553 caacaaattctttttgtgttctctctt-atttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttg 50307455  T
Q  469 cttggttattccttgctcc 487  Q
    | || |||| |||||||||    
T  50307454 cctgattatcccttgctcc 50307436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251168
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
     ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |  || | |||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgattataat 25251212  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | || | || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25251211 tgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 25251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248464
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |      
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgt--tttctcc 343  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||  | |||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcc 50248610  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  50248609 cctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttcaacttttggcttgtggttata 50248510  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  50248509 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactcc 50248464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6996039 - 6995587
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6996039 tacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6995940  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6995939 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 6995740  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttc----ctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  6995739 tccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgt 6995640  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || | || || |||| || ||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  6995639 gtttatagttgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctcc 6995587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14098301 - 14097872
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||   ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098301 ctataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagttt 14098202  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||     
T  14098201 gtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttggg 14098102  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||| || ||    
T  14098101 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaac 14098002  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  14098001 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttc 14097902  T
Q  449 cttatactatg-ttttggttgcttggttat 477  Q
    | || ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14097901 catacactttgattttggttgcttgattat 14097872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 44 - 436
Target Start/End: Original strand, 16428595 - 16428988
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16428595 tacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 16428694  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16428695 tagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 16428794  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||| | ||||    
T  16428795 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctc 16428894  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  16428895 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gatgttttctacttttggtttgtgt 16428988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Original strand, 47906254 - 47906658
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  47906254 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 47906353  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906354 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47906453  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47906454 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 47906553  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattcctt 482  Q
      ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| || ||| || |||||||||||| ||||  |||    
T  47906554 ttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttggtttggttgcttgattatctctt 47906653  T
Q  483 gctcc 487  Q
    |||||    
T  47906654 gctcc 47906658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750431
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51750081  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  51750082 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 51750181  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  51750182 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 51750281  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |    
T  51750282 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--t 51750378  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51750379 gtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 51750431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 71 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 31425331 - 31424909
Alignment:
Q  71 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctc-ttggcaacaaaca 169  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31425331 atcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaaca 31425232  T
Q  170 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag---tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||| ||  | ||| |||||||||||||||    
T  31425231 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 31425132  T
Q  267 gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggac 365  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31425131 ggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggac 31425033  T
Q  366 cgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgtttt 463  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | || || | | |||| |    
T  31425032 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtcccatacattttgttat 31424933  T
Q  464 ggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  31424932 ggttgcttgagtattccttgctcc 31424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490299
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |      
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| | || ||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccc 31490155  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  31490156 cagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttattttctctctccctgttttctacttttgacttgtgtttataat 31490255  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | || | || ||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  31490256 tgtttcatacactttattttggttgcttgattatctcttgctcc 31490299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17324975 - 17324632
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  17324975 tacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgta 17324876  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17324875 tagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 17324676  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324675 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17324632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Original strand, 39462469 - 39462909
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39462469 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 39462568  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||     
T  39462569 gtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 39462668  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||    
T  39462669 tagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagact 39462768  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 446  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |    
T  39462769 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctaattttggcttgtgtttataattgt 39462867  T
Q  447 tccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| || ||| || ||||| |||| || |||| |||||||||    
T  39462868 tccatacactttgattttgattgcctgattatcccttgctcc 39462909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10400166 - 10399824
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  10400166 actttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 10400067  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  10400066 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 10399967  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  10399966 ctttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 10399867  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10399866 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 10399824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078816
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctccc 50078859  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  50078858 ccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattctt 50078816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 31423238 - 31422753
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31423238 agatttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 31423139  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31423138 ggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgag 31423039  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31423038 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatt 31422939  T
Q  317 ata------------gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcct 402  Q
    |||            |||||||  | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||| | | | ||||| |    
T  31422938 atagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtgatatctcttctt 31422839  T
Q  403 ttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatt-taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31422838 ttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgttttataattattccgtacactttattttagttgattgattattccttgctcc 31422753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 44 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 38925817 - 38925428
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38925817 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38925718  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  38925717 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 38925618  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | | ||| | ||| |    
T  38925617 actttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctct-c 38925521  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  38925520 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--attgttttctacttttggcttgtgt 38925428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3579957 - 3579588
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg--ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  3579957 tacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttg 3579858  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  3579857 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattg 3579758  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || | |||    
T  3579757 gggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctct 3579659  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctct 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3579658 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttctctct 3579588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17186458 - 17186082
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17186458 tataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 17186359  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   | ||| |    
T  17186358 tctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggt 17186259  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |   ||| | |||||||||||||    
T  17186258 agaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagact 17186159  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  17186158 aggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctacttttg 17186082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 44 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28998592 - 28998182
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  28998592 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 28998493  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  28998492 tagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||  | |  |||| |||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 28998293  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-----tttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||     ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  28998292 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttttcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgt 28998195  T
Q  437 atttaattattcc 449  Q
     | ||||| ||||    
T  28998194 ttataattgttcc 28998182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 44 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29004308 - 29003898
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  29004308 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 29004209  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  29004208 tagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||  | |  |||| |||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 29004009  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-----tttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||     ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  29004008 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttttcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgt 29003911  T
Q  437 atttaattattcc 449  Q
     | ||||| ||||    
T  29003910 ttataattgttcc 29003898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 77 - 487
Target Start/End: Original strand, 17318868 - 17319274
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318868 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 17318967  T
Q  177 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattct 276  Q
    | || ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17318968 tggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattct 17319061  T
Q  277 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 375  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| | | ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17319062 tgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 17319160  T
Q  376 caacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttgg 473  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||||||||| |||     
T  17319161 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctattttctacttttggcttgtgtttataactattccatacactttgttttggttgtttga 17319260  T
Q  474 ttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||| ||||    
T  17319261 ttattccttactcc 17319274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 487
Target Start/End: Original strand, 17324016 - 17324461
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| || |||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  17324016 tataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttg 17324113  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |   | ||| |    
T  17324114 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggt 17324213  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||| | |||||||  ||||    
T  17324214 aaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgact 17324313  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctt------------tctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||            |||||||  |||||||||||||||||||||||| |     
T  17324314 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgtgttctctcttcctttctctctctctctctctctcactgttttctacttttggcttgtgttta 17324413  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| || | || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17324414 taattttttcatacactttgttatggttgcttgattattccttgctcc 17324461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294723
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294931 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 15294832  T
Q  386 --ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggtt 475  Q
      ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  15294831 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 15294735  T
Q  476 attccttgctcc 487  Q
    ||  ||||||||    
T  15294734 atctcttgctcc 15294723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 387
Target Start/End: Original strand, 20302410 - 20302743
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20302410 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 20302509  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  | ||| |    
T  20302510 tctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggt 20302609  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||| |||||| | || | ||||  | ||||||||||||||    
T  20302610 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagacta 20302708  T
Q  353 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20302709 ggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 20302743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823299
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6823057  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  6823058 agagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 6823156  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  6823157 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 6823256  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6823257 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6823299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28207405 - 28206959
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  28207405 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtg 28207306  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  28207305 taaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggg 28207206  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | || ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | | ||| | |||||    
T  28207205 gctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctcc 28207108  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |    
T  28207107 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgttt 28207009  T
Q  439 ttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| || |||||||||| || ||||  ||||||||    
T  28207008 ataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcacttgctcc 28206959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 15823488 - 15823831
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15823488 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 15823587  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  15823588 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 15823687  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | |||||    
T  15823688 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcc 15823787  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15823788 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 15823831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2510667 - 2510321
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2510667 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtt 2510568  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2510567 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2510368 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2510321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131268
Alignment:
Q  72 tcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaaca 169  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  170 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagac 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  | ||| |||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  270 ttattcttgtaacccattgata----tcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgga 364  Q
    ||||||||||||||||||||||    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  365 ccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttt 462  Q
    | |||||| ||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttgtgttctctgttcttttctctctcgttgttttctatttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttt 4131294  T
Q  463 tggttgcttggttattccttgctccg 488  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||    
T  4131293 tggttgcttgattatctcttgctccg 4131268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 24325648 - 24325948
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24325648 gagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 24325746  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325747 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 24325846  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24325847 ttgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattc 24325946  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  24325947 tt 24325948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 427
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128202
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttgg-tagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  384 tc--ttgcgttctttcttcctttc--tctctggctgttttctactttt 427  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  25128155 tcttttgtgttctctcttcctttctttctctcgctgttttctactttt 25128202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27337235 - 27336831
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27337037  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337036 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27336938  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattc 479  Q
      ||| ||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || |||||||||| || |||| |    
T  27336937 ttttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcc 27336839  T
Q  480 cttgctcc 487  Q
    ||||||||    
T  27336838 cttgctcc 27336831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 28840620 - 28840964
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||  || |||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  28840620 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttg 28840719  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  28840720 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 28840819  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||    
T  28840820 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 28840918  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28840919 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28840964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27339427 - 27339026
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27339427 gagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27339328  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |  |  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27339327 gattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaaccca 27339228  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339227 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 27339129  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattc 479  Q
      ||| ||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || |||||||||| || |||| |    
T  27339128 ttttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcc 27339030  T
Q  480 cttg 483  Q
    ||||    
T  27339029 cttg 27339026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31735864 - 31735517
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacct----tgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31735864 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 31735765  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||      
T  31735764 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31735564 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 31735517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 95 - 433
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134277
Alignment:
Q  95 ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 194  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  195 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc 294  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  295 cttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgt 391  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||    
T  40134137 cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgt 40134236  T
Q  392 tctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttg 433  Q
    ||| | || |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40134237 tctctatt-ctttttctctcgttgttttctacttttggcttg 40134277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 386
Target Start/End: Original strand, 28842435 - 28842778
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28842435 tacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 28842534  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |     
T  28842535 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctg 28842634  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
     |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||  | |||    
T  28842635 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctct 28842733  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28842734 cccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattct 28842778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 384
Target Start/End: Original strand, 2617466 - 2617798
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2617466 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 2617565  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | |||     
T  2617566 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 2617665  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||| ||||||    
T  2617666 tagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagact 2617765  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2617766 aggtcaatttggaccgaactgagtcaataaatt 2617798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 44 - 379
Target Start/End: Original strand, 47451590 - 47451919
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  47451590 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgta 47451689  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  47451690 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 47451783  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  47451784 gctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcc 47451883  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47451884 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762228
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtat 13761879  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  13761880 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtga 13761979  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||  | ||||||    
T  13761980 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctccc 13762078  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |    
T  13762079 ccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--t 13762175  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  13762176 gtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccctttctcc 13762228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291741
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  || || | |||  ||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | | |||||||||||||| | || | |  |||| ||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctccc 20291698  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20291699 ccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20291741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 39932057 - 39932359
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  39932057 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 39932156  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932157 gattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 39932256  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttc-tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | | ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39932257 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 39932356  T
Q  385 ctt 387  Q
    |||    
T  39932357 ctt 39932359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 383
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226448
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16226209  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16226210 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 16226309  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  16226310 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 16226408  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16226409 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431702
Alignment:
Q  94 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  194 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 46431797  T
Q  294 ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct--cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46431796 tc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 46431702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9463541 - 9463243
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||    
T  9463541 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9463442  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463441 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9463342  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9463341 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9463243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 327
Target Start/End: Original strand, 48665113 - 48665403
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggc------tgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctaggg 137  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||       ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48665113 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 48665212  T
Q  138 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgtgaaga 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48665213 tttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  237 gattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 327  Q
    |  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 48665403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752648
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||    
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtat 51752407  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  51752408 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 51752506  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||| |  | | | ||| | ||||||    
T  51752507 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctccc 51752605  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51752606 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 51752648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183589
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaat-gcaaca-caaa-ctagggtttgtata 14183827  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 14183630  T
Q  345 ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14183629 ccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21948484 - 21948244
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21948484 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 21948385  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948384 gattcacctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 21948286  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 327  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21948285 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 21948244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9459714 - 9459416
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||    
T  9459714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9459615  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459614 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9459515  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9459514 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9459416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Original strand, 47179697 - 47179993
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  47179697 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47179796  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179797 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47179896  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  47179897 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248445
Alignment:
Q  169 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttgtggatagaattaggcgggag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttgg-tagaattaggcgggag 25248668  T
Q  268 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggacc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  367 gaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttg 464  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||| | ||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| || | || ||| |||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttttatcttccggtgtctctcgctgttttctacttttgacttttgtttataattgtttcatacactttgttttg 25248468  T
Q  465 gttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||  |||||||| ||||    
T  25248467 gttgcttgactattccttactcc 25248445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Original strand, 42922151 - 42922514
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || ||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  42922151 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaag 42922250  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
      |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42922251 t-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 42922346  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  42922347 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 42922446  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
     |||| |||| | ||||| | ||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  42922447 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Original strand, 47177346 - 47177642
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  47177346 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47177445  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47177446 gattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 47177545  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  47177546 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 49495552 - 49495206
Alignment:
Q  30 aattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaa 129  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||        |||    
T  49495552 aattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaat-------caa 49495460  T
Q  130 atctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 229  Q
    | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||    
T  49495459 a-ctagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcac 49495365  T
Q  230 gtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacga 328  Q
    |  |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49495364 ggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacga 49495265  T
Q  329 atgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    | | ||  | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  49495264 agggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 387
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432681
Alignment:
Q  148 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttg 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||     |     
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactt 16432539  T
Q  248 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
    ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||    
T  16432540 tgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctccccc 16432639  T
Q  347 -agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16432640 aagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 16432681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18800932 - 18800518
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||     
T  18800932 agattttttccaattttatgag-gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaag 18800834  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
      |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18800833 t-caacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagt 18800738  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    |||| ||| ||| | ||||||| |   | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18800737 ctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 18800638  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctg 415  Q
    ||||||| || |  |||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||| |||  ||| |||||| ||| || ||||| | ||  ||| ||||| | ||    
T  18800637 tagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttgttt-tctctcgttg 18800539  T
Q  416 ttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18800538 ttttctacttttggcttgtgt 18800518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8347633 - 8347227
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  8347633 agatttgttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa 8347535  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
       |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8347534 gt-caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgag 8347439  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||| | ||| |||||||||  |  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |    
T  8347438 tctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatt 8347339  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggct 414  Q
    |||||| |||| | |  || | | ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||  |||    
T  8347338 atagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctatc--gct 8347241  T
Q  415 gttttctacttttg 428  Q
    ||||||||||||||    
T  8347240 gttttctacttttg 8347227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 301
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824091
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6823926  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgtgaaga 236  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||| |||||    
T  6823927 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaaga 6824026  T
Q  237 gattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt 301  Q
    |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6824027 gattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 436
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429291
Alignment:
Q  187 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  287 tgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
      ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  16429242 ttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttc-acttttggtttgtgt 16429291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 133 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15669641 - 15669419
Alignment:
Q  133 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 232  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15669641 tagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 15669545  T
Q  233 aagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatg 331  Q
    ||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||||| |||| |||    
T  15669544 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatg 15669445  T
Q  332 actgttttctcccccagactaggtca 357  Q
     ||| | ||||||| |||||||||||    
T  15669444 gctgctctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115051
Alignment:
Q  182 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 281  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  282 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaac-gaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 379  Q
    || ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatg-ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 6115106  T
Q  380 aaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||  | ||| ||||||||||| |||||    
T  6115105 aaattattttgtgttctctcttcttttctctc--gttgtcttctacttttgacttgt 6115051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8349352 - 8349119
Alignment:
Q  79 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8349352 aaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg 8349255  T
Q  179 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttg 278  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||  | | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8349254 g--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttg 8349157  T
Q  279 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  8349156 taactcattggtatctcttttgttaagttactcatcat 8349119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 383
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231843
Alignment:
Q  169 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggag 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  268 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  368 aactaggtcaacaaat 383  Q
    |||| |||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 487
Target Start/End: Original strand, 23816036 - 23816277
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || | || | |  || | ||||||||| |||    
T  23816036 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctcccccatact 23816135  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct---ttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 445  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||   || ||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||  | |||||     
T  23816136 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttttcttttctctcgctgttgttttctacttttgacttgtgattataattg 23816235  T
Q  446 ttccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23816236 ttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 23816277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 387
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757815
Alignment:
Q  194 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  294 ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     |||| |||| | |||||| ||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757723 tcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 51757815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13125768 - 13125525
Alignment:
Q  71 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg-tatagagtttgtctcttggcaacaaaca 169  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| |||| | ||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13125768 atcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaaca 13125671  T
Q  170 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga-ga 268  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||  | ||| ||||||||||   || ||    
T  13125670 ctagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaga 13125573  T
Q  269 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13125572 cttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 13125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520205
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaa-ggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 149  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  150 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||| ||||||||| ||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  244 gttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 291  Q
      | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30790733 - 30790412
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||      
T  30790733 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt-- 30790638  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
     ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||       
T  30790637 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 30790543  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttc 340  Q
    |  | ||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||| | ||    
T  30790542 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 30790443  T
Q  341 tcccccagactaggtca-atttggaccgaact 371  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30790442 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 30790412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 487
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916775
Alignment:
Q  274 tcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaact 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  372 aggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctctggctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgc 469  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||   |||| || ||| ||||||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttttctc--gctgtttttctacttttggcttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgc 15916757  T
Q  470 ttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| || || ||||||||    
T  15916758 ttgattgttacttgctcc 15916775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738695
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| || || ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 318  Q
    || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatat 30738695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 428
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561794
Alignment:
Q  181 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  || |||||  |  | ||| ||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  280 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 377  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || |  || | ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  378 acaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  16561745 acaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gccgttttctacttttg 16561794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 384
Target Start/End: Original strand, 27916529 - 27916780
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  27916529 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacat 27916623  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacg 327  Q
    |||||||||  |  | ||| | ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  27916624 gaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacg 27916722  T
Q  328 aatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
     | | ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||    
T  27916723 gagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 359
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat 359  Q
    |  ||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613307
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||  || | ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    || |||||||| |||||| || |||||| |||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcat 26613307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 28279309 - 28279480
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |    
T  28279309 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgg 28279405  T
Q  243 ggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |  | | | ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28279406 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 50078766 - 50078683
Alignment:
Q  404 tctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50078766 tctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 50078683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332719
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Original strand, 13358810 - 13358858
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13358810 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 13358858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231641
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332632
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagatt 26332632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127790
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    ||||||||||| || ||  ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
      || ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127861 c-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13447233 - 13447162
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13447233 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 13447162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353104
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagatt 14353104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 486
Target Start/End: Original strand, 47451948 - 47452017
Alignment:
Q  417 tttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctc 486  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  47451948 tttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctc 47452017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959186
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagatt 49959186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  78 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21353391 - 21353331
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21353391 tctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 21353331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3579560 - 3579477
Alignment:
Q  404 tctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||||||||| || ||||  ||||||||    
T  3579560 tctctctctctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcctgattatcacttgctcc 3579477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144826
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 4144826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 316
Target Start/End: Original strand, 43104332 - 43104375
Alignment:
Q  273 ttcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43104332 ttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 43104375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 834209 - 834167
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  834209 tctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232635
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25860369 - 25860315
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttg 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  25860369 tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttg 25860315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28220268 - 28220226
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28220268 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28265596 - 28265554
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28265596 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40122238 - 40122196
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40122238 tctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 40122196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 46431665 - 46431594
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||  || ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  46431665 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 46431594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 49918476 - 49918518
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49918476 tctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 49918518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50167217 - 50167175
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50167217 tctcccccagattagctcaagttggaccgaactaggtcaacaa 50167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 485
Target Start/End: Original strand, 2617838 - 2617908
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||||||    
T  2617838 tgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgct 2617908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997081
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagatt 14997081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447269
Alignment:
Q  355 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 13447269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 487
Target Start/End: Original strand, 30780361 - 30780433
Alignment:
Q  415 gttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30780361 gttttctacttttgatttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattattccttactcc 30780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32889483 - 32889443
Alignment:
Q  341 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  32889483 tcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 487
Target Start/End: Original strand, 51757862 - 51757927
Alignment:
Q  420 ctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51757862 ctacttttggcttgt--attcaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 51757927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 143)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 47 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421322
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccc 43421448  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaatt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  43421447 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttatacttttggcttgtgtttataatt 43421350  T
Q  445 attccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
     |||| || ||| |||||||||||||||    
T  43421349 gttccatacactttgttttggttgcttg 43421322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626573
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||      
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||| ||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcc 1626717  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||| | ||||    
T  1626716 cagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgtttttcacttttgacttgtgtttataat 1626617  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1626616 tgttccatacactttgtttttgttgcttgattattccttgctcc 1626573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3315053
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||     
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 3314907  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  3314908 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacgtttggcttgtgtttataa 3315007  T
Q  443 ttattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3315008 ttgttccatacactttgcttttggttgcttgattatcccttgctcc 3315053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423355
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||| | ||||||     
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccct 43423497  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43423496 gagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataat 43423399  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  43423398 tgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 43423355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 46 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926661
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||     
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccg 5926798  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc-ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaatt 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  5926797 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgttctcttttcctttctctctcgttgttttctactttt-gcttgtgtttataatt 5926699  T
Q  445 attccttatactatgttttggttgcttggttattcctt 482  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5926698 gttccttacactttgttttggttacttgattattcctt 5926661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 1313332 - 1313774
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  1313332 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgta 1313430  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  1313431 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 1313630  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  1313631 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttgacttgtgtttata 1313728  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1313729 attgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 1313774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 53917999 - 53917553
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  53917999 tacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 53917900  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  53917899 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 53917700  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  53917699 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttat 53917600  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| || | || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  53917599 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 53917553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 77 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28102304 - 28101943
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28102304 gtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 28102205  T
Q  177 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28102204 ttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 28102105  T
Q  277 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28102104 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtc 28102005  T
Q  377 aacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28102004 aacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgggttgtgt 28101943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 39715367 - 39715795
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  39715367 agatttgttacaatttcatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaga 39715465  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39715466 ggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt 39715565  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  39715566 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--at 39715663  T
Q  319 agtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttc-ttcctttctctctggctg 415  Q
    ||||||||  |||  ||   ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  39715664 agtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcctttctctctcgctg 39715761  T
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  39715762 ttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 39715795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 51943293 - 51943740
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51943293 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51943392  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51943393 tagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | | | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcc 51943591  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct--tgcgttctttcttcctttct---ctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  51943592 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgttt 51943691  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| ||||  | ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  51943692 ataattgttccaaacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 51943740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 43 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4308617 - 4308169
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4308617 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4308518  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  4308517 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 4308418  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||    
T  4308417 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 4308318  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||      
T  4308317 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgat 4308219  T
Q  438 tttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| |||| || ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  4308218 tataattgttccatacactttgttttggttgttggattattccttgctcc 4308169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880343
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||| | ||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctccc 880486  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||  | |||    
T  880485 ctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggtttgtgattataa 880388  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | |||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  880387 ctgttccatacactttgttttggttgcttgattaatccttgctcc 880343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 487
Target Start/End: Original strand, 43226007 - 43226449
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  43226007 ttactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgt 43226105  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  43226106 atagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43226205  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||    
T  43226206 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 43226305  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgt--tttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  43226306 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgtttctacttttggcttgtat-ttt 43226403  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  43226404 aattgttccatacact-tgttttggttgcttgattatctcttgctcc 43226449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 53915831 - 53915385
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |   |||||||||| ||||||||||||    
T  53915831 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgta 53915732  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  53915731 tagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||| | |||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcc 53915532  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  53915531 cccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttat 53915432  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| || | || |||  ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  53915431 aattgtttcatacacttggttttggttgcttgactatcccttgctcc 53915385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 471
Target Start/End: Original strand, 45882861 - 45883294
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45882861 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 45882960  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  45882961 tagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 45883060  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||    
T  45883061 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 45883160  T
Q  344 ccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttc---tctctggctgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  |||   ||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  45883161 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctcttgctgttttctacttctggcttgtgat 45883260  T
Q  438 tttaattattccttatactatgttttggttgctt 471  Q
    | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  45883261 tataattgttccatacactttgttttggttgctt 45883294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 86 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148795
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 184  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  185 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149088 tgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47148990  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47148989 attgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T
Q  385 ct--tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
     |  || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  47148889 attctgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgattat 47148795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468343
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||      
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |  |||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccc 53468490  T
Q  345 ccag--actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |    
T  53468489 ccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctattttctacttttgacttgtgtttat 53468390  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| |||| || ||| |||||||| ||||   |||||| |||||||    
T  53468389 aattgttccatacactttgttttggctgctccattattcattgctcc 53468343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101069
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 27101175  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattcc 480  Q
      ||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| || ||| |||||||||||| || ||||||     
T  27101174 ttttgtgttctctcttccttt-tctcttgctgttgttttctactttttgcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcctgattattca 27101076  T
Q  481 ttgctcc 487  Q
    |||||||    
T  27101075 ttgctcc 27101069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 487
Target Start/End: Original strand, 43228212 - 43228659
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  43228212 ttactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgt 43228311  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  43228312 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43228411  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||    
T  43228412 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 43228511  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttccttt-ctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||   | ||||||||| ||||||||||| | |    
T  43228512 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttactctcgctgttgttttctaattttggcttgtat-t 43228610  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  43228611 ttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 43228659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18097235 - 18096787
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt-gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| |  ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18097235 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 18097136  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  18097135 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 18097036  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||| | |||||    
T  18097035 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcc 18096936  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |    
T  18096935 cctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctctt-ctttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgttt 18096837  T
Q  439 ttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| || |||||||||| || |||| |||||||||    
T  18096836 ataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctcc 18096787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 51727342 - 51726999
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  51727342 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgt 51727243  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |      
T  51727242 atagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctga 51727144  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||    
T  51727143 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 51727044  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727043 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 51726999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170669
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11170426  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||     
T  11170427 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctggga 11170526  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||    
T  11170527 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 11170626  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11170627 ccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattctt 11170669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12268301 - 12267866
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaat-ctagggtttgt 142  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  12268301 tacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgt 12268202  T
Q  143 atagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12268201 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 12268102  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||    
T  12268101 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct 12268013  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |     
T  12268012 cccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgttta 12267914  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  12267913 taattgttccatacactttgttttggttgcttgactattccctgctcc 12267866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18099463 - 18099057
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18099463 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18099364  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099363 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18099264  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18099263 ttgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattc 18099164  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattc 479  Q
      ||| ||||| | || |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| || ||| || |||| |||||||| |||| |    
T  18099163 ttttgtgttctct-tttctttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttacaattgttccatacactttgatttttgttgcttgattatcc 18099065  T
Q  480 cttgctcc 487  Q
    ||||||||    
T  18099064 cttgctcc 18099057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10955912
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||| ||    
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccacc 10956060  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |||    
T  10956059 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgt 10955963  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10955962 atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 10955912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674656
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
           | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | | ||| | ||||||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccc 51674799  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaatt 444  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  51674798 ataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttatattt 51674699  T
Q  445 attccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     |||| ||  |  |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51674698 gttccatacccacttgtttggttgcttgattattccttgctcc 51674656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32264378 - 32263947
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaa----ccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||    | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  32264378 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtt 32264279  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  32264278 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 32264179  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtt 337  Q
    | |   | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| |    
T  32264178 tggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 32264079  T
Q  338 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32264078 ctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgt 32263979  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttg 468  Q
     | ||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  32263978 ttataattgttccatacactttgttttggttg 32263947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890305
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38890204 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 38890303  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  38890304 tt 38890305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Original strand, 24979637 - 24980079
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24979637 ctataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24979736  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  | |||     
T  24979737 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttggg 24979836  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||    
T  24979837 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaac 24979936  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaatt 444  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| | ||    ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24979937 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgttgttgtttttctacttttggcttgtgtttataatt 24980035  T
Q  445 attccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     |||| || ||| || |||||||||| || |||| |||||||||    
T  24980036 gttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctcc 24980079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 487
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484726
Alignment:
Q  135 gggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  234 agagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgac 333  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  334 tgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggct 431  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctta--ttctctctcgctgttttctacttttgact 6484669  T
Q  432 tgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| | ||||| |||| || ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6484670 tgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttgctcc 6484726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990569
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 42990567  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  42990568 tt 42990569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958315
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |     |    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | ||| | ||||||||    
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 10958356  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10958355 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 10958315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 48362005 - 48361566
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  48362005 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 48361907  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  48361906 tagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 48361807  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | | | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |   ||| | |||||    
T  48361806 gcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcc 48361707  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttc---tctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  |||   ||||| | ||||||||||||||| ||||||  |    
T  48361706 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgttgttttctacttttgacttgtgatt 48361607  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattc 479  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48361606 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattc 48361566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28761763 - 28761419
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  28761763 tacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 28761664  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |    
T  28761663 tatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgag 28761565  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||    
T  28761564 actttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctc 28761465  T
Q  343 ccccagactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  28761464 ccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattctt 28761419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006106
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30006104  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  30006105 tt 30006106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012196
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |      
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | ||| |      
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttctt 36012050  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||| | |    
T  36012051 cagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttcgcttgtgtttat 36012149  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  36012150 aattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctcc 36012196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691463
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||     
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | ||| | |||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgc--gttctttcttcctttctctct-ggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
     |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||    ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  54691607 tagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttcctttctctctcggttgttttctacttttggcttgtgtttataa 54691508  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || || | || | | |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  54691507 ttgtttcatacattttgttttggttgcctgattatcacttgctcc 54691463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889781
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||  |||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttgggg 889908  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctccc 889808  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaact 371  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  889807 gcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859792
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3859550  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  3859551 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  3859651 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctccc 3859749  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3859750 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3859792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4104234 - 4103888
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4104234 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4104135  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  4104134 tgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctat 4103936  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4103935 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 4103888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604493
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9604700 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattc 9604601  T
Q  386 --ttgcgttct---ttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattc 479  Q
      ||| |||||   |||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||| ||||  | ||||| || | || ||| || ||||||| |||| ||||||    
T  9604600 ttttgtgttctctcttcttcttttctctcgctgttgttttctatttttggcctgtgattataattgtttcatacactttggtttggttacttgattattc 9604501  T
Q  480 cttgctcc 487  Q
    ||||||||    
T  9604500 cttgctcc 9604493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533707
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25533605  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25533606 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattc 25533705  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  25533706 tt 25533707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 746721 - 747019
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  746721 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 746820  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746821 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 746920  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  746921 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 747019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5192023
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||   | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 5191675  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  5191676 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5191775  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | |  | | ||||| ||| ||    
T  5191776 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-cc 5191873  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |    
T  5191874 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttggct--t 5191970  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5191971 gtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 5192023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 18162586 - 18163033
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatca-gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||| | |||||| | |||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18162586 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 18162683  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18162684 atagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18162783  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||    
T  18162784 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 18162883  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttctttcttcctttctctctggct---gttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  || ||| ||||| |||| |||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  18162884 cccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgcagttttctacttttggcttgtgt 18162981  T
Q  437 atttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | ||||| |||| || ||| || |||||||||| || |||| |||| ||||    
T  18162982 ttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttactcc 18163033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 26720470 - 26720812
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26720470 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 26720569  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||    
T  26720570 tagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctggg 26720668  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||    
T  26720669 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcc 26720768  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26720769 cctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattctt 26720812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114297
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 22114540  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  22114539 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 22114440  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |  || | ||||||    
T  22114439 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctccc 22114340  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22114339 ccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 22114297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 316
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562005
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||     
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcat 6562005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10084682 - 10084384
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10084682 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10084583  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10084582 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10084483  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10084482 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 383
Target Start/End: Original strand, 458202 - 458545
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  458202 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 458301  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaga 238  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  458302 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 458401  T
Q  239 ttagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
    || ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| |     
T  458402 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 458500  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  458501 tctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 126 - 487
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321851
Alignment:
Q  126 acaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 225  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  226 ttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaa 325  Q
    ||||  ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  326 cgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tg 415  Q
    || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttg 1321781  T
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  1321782 ttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcctgattatcccttgctcc 1321851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 98 - 487
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389279
Alignment:
Q  98 gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 197  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-g 25388980  T
Q  198 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  25388981 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc- 25389079  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 394  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  25389080 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T
Q  395 t-tcttcctttct----ctctggc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    | ||||| ||| |     ||| ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25389180 tctcttcttttgtattcttctcgccgttgttttctactttttggct--tgtatttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 25389277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 383
Target Start/End: Original strand, 455825 - 456168
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  455825 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 455924  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaga 238  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  455925 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 456024  T
Q  239 ttagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
    || ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| |     
T  456025 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 456123  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  456124 tctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 483
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591546
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccc 53591406  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa----attcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     || |||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||| | ||    
T  53591407 cagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaattttttttttgtattctctcttcttttctctc--gctgttttctgcttttgacttatgtttata 53591504  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttg 483  Q
    ||| |||| || | | ||||||||||||||| |||| |||||    
T  53591505 attgttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttg 53591546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065791
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6066032  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6066031 tagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 6065932  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | ||| ||| | ||||    
T  6065931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctc 6065833  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  6065832 ccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatt 6065791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621525
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10621623 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 10621525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 487
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219455
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||           ||||||    
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttg 32219114  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  | |||      
T  32219115 tctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagact 32219314  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 446  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  32219315 atgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 32219413  T
Q  447 tccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32219414 tccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctcc 32219455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Original strand, 50493963 - 50494260
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  50493963 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 50494062  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50494063 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 50494162  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50494163 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063441
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6063683  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  6063682 atagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6063583  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||    
T  6063582 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 6063484  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  6063483 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatt 6063441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10191602 - 10191197
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10191602 gagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10191503  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10191502 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10191404  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || || || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10191403 ttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 10191304  T
Q  386 ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  10191303 ttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgtcccatacactttgttttggttgcttgattat 10191207  T
Q  478 tccttgctcc 487  Q
     |||||||||    
T  10191206 cccttgctcc 10191197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 287
Target Start/End: Original strand, 35777344 - 35777587
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35777344 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 35777443  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35777444 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 35777543  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 287  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777544 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 436
Target Start/End: Original strand, 15780782 - 15781195
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15780782 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 15780881  T
Q  144 tagagtt-----------tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 232  Q
    |||||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15780882 tagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacggg 15780981  T
Q  233 aagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacg 327  Q
    |||||  |  |  | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||    
T  15780982 aagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacg 15781081  T
Q  328 aa---tgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttcta 422  Q
    ||    | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  15781082 aagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttctctctcgttgttttcta 15781181  T
Q  423 cttttggcttgtgt 436  Q
    |||||| |||||||    
T  15781182 cttttgacttgtgt 15781195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 112 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413027
Alignment:
Q  112 ttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 211  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  212 attg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttact 310  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  311 catcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatt 28413027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattctt 277  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 472
Target Start/End: Original strand, 23633356 - 23633801
Alignment:
Q  18 tagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    ||||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||    
T  23633356 tagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa 23633455  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  23633456 gc-caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgatttacc--gggaaacactattaggattgag 23633549  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  23633550 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcatt 23633648  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggct 414  Q
    ||||||||| | | | ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||  | |    
T  23633649 atagtgaaaaggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--gat 23633745  T
Q  415 gttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  23633746 gttttctacttgtggcttgtgtttataa--attccatacactttgttttggttgcttg 23633801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210631
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | |   ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  38210534 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||      
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 282  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956891
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 327  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 29956891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522619
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-- 5522852  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
             ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  5522851 ---------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5522761  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  5522760 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 5522662  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5522661 gcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 5522619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 173 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688099
Alignment:
Q  173 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagactta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  273 ttcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  372 aggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcc-tttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
     |||||| || |||  ||| ||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttccttttctctcgttgatgttttctacttttggcttgtgt 25688099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635545
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||                   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||            || |    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacg------------ggct 27635791  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||    
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 27635691  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttc---tctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27635690 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttata 27635591  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27635590 attgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 27635545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 143 - 434
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666828
Alignment:
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||      
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgt 434  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  4666735 ---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttatacttttggtttgt 4666828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 170 - 478
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232157
Alignment:
Q  170 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagac 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagatt-gggatttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  270 ttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccga 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| |||| | | ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  369 actaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggt 466  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| | |||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttctctctcgctgttttttatttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggt 6232145  T
Q  467 tgcttggttatt 478  Q
    |||||| |||||    
T  6232146 tgcttgattatt 6232157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35918285 - 35917952
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||  | |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35918285 ttactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 35918186  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 236  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35918185 atagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaaga 35918086  T
Q  237 gattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgt 336  Q
    || | ||  | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |   |||     
T  35918085 gactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgc 35917986  T
Q  337 tttctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 371  Q
    | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  35917985 tctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaact 35917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 144 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606580
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||| ||||||| |||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgat-ttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 7606580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151708
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactca-tcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||| |||| | | ||| | ||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctc 31151564  T
Q  343 ccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct--tgcgttctttcttcctttctctctggctg-ttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||| |    
T  31151565 ccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttcttttctctc--gctgtttttctactctt-acttgtgttt 31151661  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     |||   |||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31151662 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctcc 31151708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 140 - 428
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795566
Alignment:
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  17795280 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
    |  || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | ||| |     
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 17795475  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  17795476 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctacttttg 17795566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 140 - 428
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19104006
Alignment:
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  19103720 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
    |  || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | ||| |     
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 19103915  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  19103916 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctacttttg 19104006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 42992250 - 42992532
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||  | ||| |||               ||||||||||||| ||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactca 42992433  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42992434 ttgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42992532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 299
Target Start/End: Original strand, 23636923 - 23637200
Alignment:
Q  18 tagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    ||||||| || |||||||||| | | || ||||  |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  23636923 tagatttgtttcaattttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa 23637022  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
     | |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23637023 gc-caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgag 23637118  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 299  Q
    ||||||| | | | ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23637119 tctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307076
Alignment:
Q  200 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  300 gtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttcttt 396  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| | |||  ||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctct 3307036  T
Q  397 cttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3307037 cttcctttctctttcgctgttttctacttttggcttgtgt 3307076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 387
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886463
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 382  Q
    |||||||| |  | |||| || |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  383 ttctt 387  Q
    |||||    
T  5886459 ttctt 5886463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 387
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899936
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 382  Q
    |||||||| || | |||| || |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  383 ttctt 387  Q
    |||||    
T  5899932 ttctt 5899936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Original strand, 53597148 - 53597430
Alignment:
Q  29 caattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaaca 128  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||   |||||| |    
T  53597148 caattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaaga 53597245  T
Q  129 aatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 228  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53597246 aaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 53597342  T
Q  229 cgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
     | ||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  53597343 tgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcat 53597430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 47701798 - 47701568
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| |    
T  47701798 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagatt 47701699  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  47701698 aggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct-ttcctttctctc--attgttttctacttttggcttgtgttcataattgttcc 47701602  T
Q  450 ttatactatgttttggttgcttggttattccttg 483  Q
     || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  47701601 atacactttgttttcgttgcttgattattacttg 47701568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 186 - 387
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168366
Alignment:
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||||||| || |||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  11168365 tt 11168366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 562021 - 561769
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  562021 ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgt 561925  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 330  Q
    |||||||||  |  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||     
T  561924 gaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaag 561825  T
Q  331 gactgttttctccc-ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  561824 ggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13420429 - 13420252
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13420429 ctagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 13420334  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcat 313  Q
    |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13420333 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcat 13420252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 316
Target Start/End: Original strand, 54884089 - 54884348
Alignment:
Q  54 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 153  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||    
T  54884089 ataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgt 54884186  T
Q  154 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggata 253  Q
     |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     | || |||    
T  54884187 ttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaata 54884286  T
Q  254 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54884287 gaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagact 270  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 316
Target Start/End: Original strand, 25635394 - 25635575
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  25635394 ctagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgg 25635490  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||||||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  25635491 gaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 25635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  87 agatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  187 attcaccttgggaaacactattaggatt 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  122 aacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 221  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  222 ttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttact 310  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||  | ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 176  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| | |||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11163172  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 190  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163173 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871243
Alignment:
Q  94 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 193  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacc 36871488  T
Q  194 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatat 292  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||  | ||| ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  293 cccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgc 389  Q
    | | ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| || ||| ||     
T  36871387 ctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgt 36871289  T
Q  390 gttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  36871288 gttctctctttattt-tctctcgctgttttctatcttttgcttgtgt 36871243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Original strand, 24177201 - 24177380
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    |||||| ||| |||||||||||    
T  24177201 tacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgt-caacaagaaaactagggtttgt 24177299  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177300 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  265 gagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgg 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  364 accgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 306 - 487
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849425
Alignment:
Q  306 ttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttc-ct 402  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  |    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttt 41849342  T
Q  403 ttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41849343 ttctctctcgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 41849425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Original strand, 6484282 - 6484367
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484282 agatttgttacatttttatgggagttacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 6484367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306835
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  147 agtttgtctctt 158  Q
    ||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 384
Target Start/End: Original strand, 24181510 - 24181644
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||| ||    
T  24181510 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcctccaaac 24181609  T
Q  351 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  24181610 taggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  166 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| | | | ||| |||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 25633933 - 25634024
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633933 ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 468
Target Start/End: Original strand, 28181242 - 28181352
Alignment:
Q  360 ttggaccgaactaggtcaacaaattct--tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacta 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||     
T  28181242 ttggaccgaactaggtcaacaaattctcctgtgttctctcttcttttctctgtcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactt 28181341  T
Q  458 tgttttggttg 468  Q
    |||||||||||    
T  28181342 tgttttggttg 28181352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 240
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419997
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  221 cttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||| |||  ||||||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagagatt 13419997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634504
Alignment:
Q  154 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggata 253  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||  |  | ||| ||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  254 gaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcata 317  Q
    | ||||||   | ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 53894097 - 53893939
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt--tcttcctt----tctctctggctgtt----ttctacttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  ||||| ||    ||| ||| || |||    |||||||||    
T  53894097 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttt 53893999  T
Q  427 tggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  53893998 tggctt-tgtatttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 53893939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 380  Q
    || |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  381 aa 382  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31021362 - 31021281
Alignment:
Q  161 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31021362 caacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttgatcacatgaagagattagg 31021281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35919155 - 35919107
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35919155 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 35919107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 1321363 - 1321437
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1321363 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  166 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 211  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Original strand, 30236251 - 30236300
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 388  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30236251 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttg 30236300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10084345 - 10084274
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10084345 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgtcccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 10084274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Original strand, 46173483 - 46173532
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 388  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46173483 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaacaatttcttg 46173532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 387
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992651
Alignment:
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattctt 42992651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 11168402 - 11168474
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11168402 tgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctcc 11168474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 11170671 - 11170743
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  11170671 tgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacactttgattttggttgcttgattatcccttactcc 11170743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Original strand, 25533726 - 25533782
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  25533726 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttg 25533782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094218
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10094218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100235
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201098
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10958279 - 10958208
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10958279 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttctatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 10958208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16264396 - 16264354
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16264396 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462241
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626128
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22626128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25795827 - 25795785
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25795827 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544311
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32143367 - 32143325
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32143367 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 40913419 - 40913461
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40913419 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 44331671 - 44331713
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44331671 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883026
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 471
Target Start/End: Original strand, 50494300 - 50494355
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgctt 471  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  50494300 tgttttctacttttggcttgt--atttaattattccatacgctttgttttggttgctt 50494355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 51398940 - 51398982
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51398940 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4560567 - 4560514
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaa 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||    
T  4560567 gtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaa 4560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066709
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagatt 11066709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6719390 - 6719358
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6719390 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 6719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29913998 - 29913938
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  29913998 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 29913938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744436
Alignment:
Q  341 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 88)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480395
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||     
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccc 30480539  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  30480538 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtatttataat 30480439  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30480438 tgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttactcc 30480395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14419528 - 14419102
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14419528 tacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgta 14419429  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14419428 tagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 14419329  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | ||||    
T  14419328 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctc 14419229  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  14419228 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttat 14419129  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggtt 467  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||    
T  14419128 aattgttccatacactttgttttggtt 14419102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Original strand, 1225139 - 1225557
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1225139 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1225238  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
      |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225239 gacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 1225338  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatcata 317  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  1225339 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcata 1225438  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctg 415  Q
    |||||||||| ||| | | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||    
T  1225439 tagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctg 1225536  T
Q  416 ttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  1225537 ttttctacttttgacttgtgt 1225557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 14807749 - 14808204
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14807749 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 14807848  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  14807849 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 14807948  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactg-------- 335  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||            
T  14807949 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 14808048  T
Q  336 --ttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggct 431  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14808049 ccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttggct 14808148  T
Q  432 tgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  14808149 tgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccgttgctcc 14808204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106894
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||| |    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctc 27106933  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27106932 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 27106894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 387
Target Start/End: Original strand, 27910988 - 27911354
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27910988 agatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag 27911087  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911088 -gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27911186  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27911187 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatat 27911286  T
Q  319 agtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||| | |  || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27911287 agtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattctt 27911354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 387
Target Start/End: Original strand, 27957407 - 27957773
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27957407 agatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag 27957506  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957507 -gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27957605  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27957606 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatat 27957705  T
Q  319 agtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||| | |  || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27957706 agtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattctt 27957773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13858821 - 13858381
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13858821 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 13858722  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  13858721 tagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggg 13858622  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    | | ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | ||| | ||||    
T  13858621 gctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctc 13858523  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc-ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13858522 ccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattctttgtgttctccctttctttctctc--actgttttctacttttggcttgtgtttata 13858425  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |   |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13858424 a--cttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctcc 13858381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 15072708 - 15073155
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15072708 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgta 15072807  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga-gattag 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |    
T  15072808 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgg 15072907  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | | ||| | ||||    
T  15072908 gactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctc 15073007  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |     
T  15073008 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgttta 15073107  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  15073108 taattgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctcc 15073155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865982
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |       
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaac-gaatgactgttttctcc 343  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatg-ctgctctctcc 36865833  T
Q  344 ccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttc--tctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |    
T  36865834 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctttttttctttctctcgttgttttctacttttggcttttgttt 36865933  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  36865934 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctcc 36865982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 32339303 - 32339650
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32339303 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 32339402  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32339403 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32339603 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattctt 32339650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28251904 - 28251457
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28251904 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 28251805  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  28251804 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28251705  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  28251704 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 28251605  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   |||||||||||| |||||||||  |    
T  28251604 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttgtggcttgtgatt 28251506  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28251505 ataattgttccatacactttgttttggttgcctgattattccttgctcc 28251457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 4424016 - 4424359
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4424016 tacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4424115  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  4424116 tagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 4424215  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| | |  | | ||| | |||||    
T  4424216 gctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 4424315  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4424316 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 4424359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 472
Target Start/End: Original strand, 15067979 - 15068410
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  15067979 tacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgta 15068078  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  |    
T  15068079 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgag 15068178  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| | | ||| | |||||    
T  15068179 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcc 15068278  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||| ||||   |||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  15068279 cccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttcacccttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttgt 15068378  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  15068379 aattgttccatacactttgttttggttgcttg 15068410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 608774 - 609075
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 608973  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  608974 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 609073  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  609074 tt 609075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 41382671 - 41383107
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  41382671 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgta 41382770  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41382771 tagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41382959  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||||||||| |    
T  41382960 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttctggcttgtgttt 41383058  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  41383059 ataattgttccataaactttgttttgattgcttgattatctcttgctcc 41383107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 27829295 - 27829637
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27829295 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 27829394  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  27829395 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 27829494  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  27829495 accttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 27829593  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27829594 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 27829637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 15809213 - 15809559
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15809213 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 15809312  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  15809313 tgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |  | | ||| | |    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15809512 cttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 15809559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 41384743 - 41385190
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  41384743 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgta 41384841  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  41384842 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | | | |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41385041  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcc-tttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |     
T  41385042 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctcttccatttctctcgctgttgttttatacttttggcttgtgttta 41385141  T
Q  440 taattattccttatac-tatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || || | ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  41385142 taattgttccatacacttttgttttggttgtttgattatcccttgctcc 41385190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 3874004 - 3874441
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||  |||    
T  3874004 tacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtt 3874103  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  3874104 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||   || |    | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  3874304 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt--gttcttc---tcgc---cgttgttttctacttttggct--tgtatt 3874393  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3874394 taattgttccatacactttgttttggttgcttggttatctcttgctcc 3874441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 477
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952953
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |      
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
      ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 25952819  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| | |||    
T  25952820 ccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctcgccgttttctacttttggattgtgtttataa 25952918  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    ||  | | || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  25952919 ttgcttcatacactttattttggttgcttgattat 25952953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15186073 - 15185667
Alignment:
Q  18 tagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    ||||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||    
T  15186073 tagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaa 15185974  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
    |   || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  15185973 agaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgag 15185874  T
Q  218 t--ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca 315  Q
    |  |||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15185873 tctctcttggttacgggaagagatt-------tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatca 15185781  T
Q  316 -tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctgg 412  Q
     |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||  |    
T  15185780 ttatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctttctttctctc--g 15185683  T
Q  413 ctgttttctacttttg 428  Q
     |||||||||||||||    
T  15185682 ttgttttctacttttg 15185667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 27826984 - 27827326
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27826984 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 27827083  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||    
T  27827084 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctggg 27827183  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  27827184 accttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 27827282  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27827283 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 27827326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372128
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||      
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct-cc 343  Q
    | ||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |  | ||| ||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccc 5372214  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttct-ttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||   |||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  5372213 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattatt---ttctgttctttctttctctc--attgttttctacttttggcttg 5372128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684647
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc- 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  285 --attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 382  Q
      |||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22684652  T
Q  383 ttctt 387  Q
    |||||    
T  22684651 ttctt 22684647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28283514 - 28283215
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28283514 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggtt 28283415  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28283414 gattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccca 28283315  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28283314 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 28283217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 18810707 - 18811048
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18810707 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18810806  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||     
T  18810807 agagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctggga 18810906  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||    
T  18810907 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 18811005  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18811006 ccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattctt 18811048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721291
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtat 44720941  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  44720942 agagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 44721041  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||| |  | |   ||| | |||||    
T  44721042 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcc 44721140  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcctt----tctctctggc---tgttttctacttttggcttg 433  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||    ||| ||| ||   ||||||||||||||| ||||    
T  44721141 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgacttg 44721239  T
Q  434 tgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  44721240 t--atttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactcc 44721291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 94 - 384
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079940
Alignment:
Q  94 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  194 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  293 cccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    | | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43079850 ctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43079940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 292
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 292  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082311
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43082213 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43082311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482693
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtata 21482413  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||     
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | | ||| | ||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccc 21482609  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21482610 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctacttttg 21482693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24873476 - 24873178
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  24873476 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggtt 24873377  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24873376 gattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccg 24873277  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  24873276 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541529
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagatt 33541529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 428
Target Start/End: Original strand, 21480545 - 21480885
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21480545 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggtt 21480635  T
Q  177 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattct 276  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21480636 t---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattct 21480732  T
Q  277 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21480733 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T
Q  376 -caacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
      || |||||| || ||||| |||| |||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  21480833 aaaaaaaattcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttcttcttttg 21480885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 487
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530563
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||     
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctct 43530412  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||      
T  43530413 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tcttgccattgttttctacttttggct-- 43530509  T
Q  434 tgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  43530510 tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 43530563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 387
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956299
Alignment:
Q  136 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  236 agattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact 334  Q
    ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  335 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
      | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattctt 15956299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 18812892 - 18813222
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||             
T  18812892 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag--------- 18812982  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
      |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  |     
T  18812983 --agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtga 18813080  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||    
T  18813081 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 18813179  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813180 ccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 18813222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 434
Target Start/End: Original strand, 31162186 - 31162602
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aaaggtttagaa 117  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  31162186 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa 31162285  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
    ||  | |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162286 aca-agcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 31162380  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  31162381 tctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcatt 31162480  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttct--cccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttct-ttcttcctttctctctg 411  Q
    |||||| |||  | | ||| | |||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| || || |||| |||||     
T  31162481 atagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctcttttttcttt-tctctc 31162579  T
Q  412 gctgttttctacttttggcttgt 434  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  31162580 gttgttttctacttttggcttgt 31162602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 26775176 - 26775378
Alignment:
Q  21 attttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacg 120  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  26775176 atttgttacaattttatgagggttacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 26775275  T
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26775276 caacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtct 26775375  T
Q  221 ctt 223  Q
    |||    
T  26775376 ctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005617
Alignment:
Q  76 tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaaca-aataacaaa-ctagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  175 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttatt 274  Q
    ||| ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  275 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaacta 372  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| | |  || | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  3005738 cttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactg 3005639  T
Q  373 ggtcaacaaattcttgcgttct 394  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  3005638 ggtaaacaaattcttgtgttct 3005617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5623041 - 5622879
Alignment:
Q  78 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5623041 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtt 5622942  T
Q  178 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5622941 tgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagatt 5622879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 284 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541302
Alignment:
Q  284 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatt 33541408  T
Q  384 tc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattcct 481  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| | ||||| ||||||| |||| |||    
T  33541407 tcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgatttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttgattgcttgattatccct 33541308  T
Q  482 tgctcc 487  Q
    | ||||    
T  33541307 tactcc 33541302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 346
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181799
Alignment:
Q  169 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacgtg--aagagattagggttgtggatagaattaggcggg 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |  |||||| | ||  | ||| |||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  266 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctccccc 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 343 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 37214302 - 37214166
Alignment:
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  37214302 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttat 37214203  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||| |||  || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  37214202 aattgttctatacactttgttttggttgcttgcttat 37214166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2468260 - 2468082
Alignment:
Q  251 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   | | ||| | |||| ||||||    
T  2468260 atagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccaga 2468161  T
Q  350 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  2468160 ttaggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctaattttg 2468082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 449
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035522
Alignment:
Q  181 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga-gacttattcttgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  | | | ||||||||||   || |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  280 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac--taggtcaat-ttggaccgaactaggt 375  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  376 caacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
     |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  31035451 aaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctagtttt-gcttgtgtttttaattgttcc 31035522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||  | ||| ||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  283 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 380  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||| | ||||||| ||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  381 aatt 384  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37214517 - 37214369
Alignment:
Q  74 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatct-------------------agggtttgtatagagtttgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||                   |||||||||||||||||||||    
T  37214517 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtc 37214418  T
Q  155 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 203  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214417 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 37214369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573794
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  244 gttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcat 313  Q
      | ||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3886255 - 3886153
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3886255 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 3886156  T
Q  144 tag 146  Q
    |||    
T  3886155 tag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12517319 - 12517248
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctct 157  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12517319 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14419851 - 14419784
Alignment:
Q  27 tacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  14419851 tacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872353
Alignment:
Q  268 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccg 367  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||             ||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 35872467  T
Q  368 aactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttgg 465  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| | ||||||    
T  35872466 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctct---tgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttattttgg 35872370  T
Q  466 ttgcttggttattcctt 482  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  35872369 ttgcttgattatccctt 35872353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 141
Target Start/End: Original strand, 181535 - 181632
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  181535 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 436
Target Start/End: Original strand, 14477547 - 14477642
Alignment:
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaact-aggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||    
T  14477547 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttcttttctctctcgct-ttttttttttttggcttgtgt 14477642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 468
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181901
Alignment:
Q  365 ccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttt 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || ||| |||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttt 181895  T
Q  463 tggttg 468  Q
    ||||||    
T  181896 tggttg 181901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3883553 - 3883482
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  3883553 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctcc 3883482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10930241 - 10930192
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 388  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10930241 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttg 10930192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267161
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattagg 2267161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 4424395 - 4424467
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4424395 tgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctcc 4424467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1345413 - 1345371
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1345413 tctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaacaa 1345371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2468435 - 2468361
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  2468435 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021251
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 9021251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  | ||| ||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 15212912 - 15212954
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15212912 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752666
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757411
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16757411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 19175805 - 19175847
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19175805 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 19752445 - 19752487
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19752445 tctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 27811404 - 27811446
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27811404 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 27827362 - 27827433
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  27827362 tgttttctacttttgacttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 27827433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28283179 - 28283108
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28283179 tgttttctacttttggcttgt--atttatttttttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 28283108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327946
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28327946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332669
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 28332669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895540
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 33352276 - 33352318
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33352276 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 40321206 - 40321248
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40321206 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Original strand, 43530122 - 43530209
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaac 127  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  43530122 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac 43530209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 380
Target Start/End: Original strand, 4733832 - 4733873
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 380  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4733832 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985954
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagatt 13985954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31566600 - 31566514
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctactt 425  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  31566600 tctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctctttctttctctc--gctgttttctactt 31566514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 6375960 - 6376032
Alignment:
Q  17 ttagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga 89  Q
    |||||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  6375960 ttagatttattccaattttatgcgggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 92)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19008003
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||     
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 19007859  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19007860 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctattcatttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataat 19007959  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19007960 tgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 19008003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196998
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||     
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccc 28196856  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28196857 cagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataat 28196954  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | || | || ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  28196955 tgtttcatacactttgttttggttgctggactatcccttgctcc 28196998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264058
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||| |    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |||||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactttcggcttgtgttaataat 6264084  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgc 469  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||    
T  6264083 tgttccatacactttgttttggttgc 6264058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22287673 - 22287228
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22287673 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22287574  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||       
T  22287573 tagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgac 22287474  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| | |||||    
T  22287473 acttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcc 22287374  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | | ||    
T  22287373 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacgtttgacttgtttttata 22287274  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  22287273 attgttccatacactatgttttggttgcttgactatcccttgctcc 22287228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 42923848 - 42923398
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  42923848 tacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttg 42923749  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  42923748 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| | |||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctct 42923549  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctt--tctctctggctgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  42923548 cccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtt 42923449  T
Q  438 tttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| || | || ||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  42923448 tataattgtttcatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctcc 42923398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21521032 - 21520620
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  21521032 tacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttg 21520933  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||    
T  21520932 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggcta 21520833  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  21520832 ggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctct 21520733  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21520732 cccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttcgtttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgt 21520633  T
Q  437 atttaattattcc 449  Q
     | ||||| ||||    
T  21520632 ttataattgttcc 21520620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837631
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | |||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||  |      
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagac 14837386  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | |   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || | ||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttatacttttggcttgtgtttataa 14837586  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||  || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  14837587 ttgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctcc 14837631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Original strand, 3022089 - 3022535
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3022089 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 3022188  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| | |     
T  3022189 gtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttagg 3022288  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca----------tatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||          |||| ||||||  ||| ||| | |||    
T  3022289 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctct 3022387  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |     
T  3022388 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctctcgttgttttctgcttttggcttgtgttta 3022487  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  3022488 taattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctcc 3022535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6259152 - 6258709
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || ||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  6259152 tacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgta 6259053  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  6259052 tagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggg 6258955  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | | ||| | |||     
T  6258954 gctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct- 6258856  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |    
T  6258855 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttagcttgtgtttat 6258756  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| ||||  | ||| |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  6258755 aattgttccagacactttgttttggttgcctgattatcacttgctcc 6258709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849480
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||| |||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |      
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| | ||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg-ggggctgctctctccc 17849335  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
     || |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  17849336 acatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctcccgttgttttctacttttggcttgtgtttaaaa 17849435  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  17849436 ttgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 17849480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 40032395 - 40032047
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40032395 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40032296  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  40032295 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttagg 40032196  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc----cttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttt 338  Q
      | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||||||||| ||||||||||| | | | | |     
T  40032195 actttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctc 40032096  T
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40032095 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 40032047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739553
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||      
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11739553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 77 - 427
Target Start/End: Original strand, 17848394 - 17848741
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17848394 gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttggg 17848493  T
Q  176 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattc 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||| ||||   |||||||||||||||||    
T  17848494 tttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattc 17848590  T
Q  276 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 375  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17848591 ttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggt 17848689  T
Q  376 caacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctactttt 427  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  17848690 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctactttt 17848741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504340
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19504582  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  19504581 agagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctggga 19504483  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  19504482 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctccc 19504383  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19504382 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 19504340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 79 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 44289370 - 44289010
Alignment:
Q  79 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 178  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289370 aaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggttt 44289271  T
Q  179 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  || |||||||| | || | |||||||||||    
T  44289270 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttg 44289171  T
Q  279 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 377  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||  || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44289170 taacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtca 44289071  T
Q  378 acaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44289070 acaaattcttttgtgttctctcttcatttctctctcgctgttttctactgttggcttgtgt 44289010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19502005
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctccccc 19502046  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19502045 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 19502005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27105165
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 27104817  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  27104818 agagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 27104916  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  27104917 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 27105015  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |    
T  27105016 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--t 27105112  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27105113 gcatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 27105165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45280323 - 45279978
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaac-gcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  45280323 ttactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttg 45280224  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  45280223 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 45280124  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||    
T  45280123 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 45280024  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45280023 cccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 45279978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13909932
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13910281  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |      
T  13910280 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaa 13910181  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | |  ||| ||| | ||||||    
T  13910180 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctccc 13910082  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |    
T  13910081 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--t 13909985  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  13909984 gtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactcc 13909932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23452578 - 23452231
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23452578 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 23452479  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  23452478 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23452278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 23452231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979481
Alignment:
Q  54 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 153  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  154 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggata 253  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | ||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  254 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact-gttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||  | | | |||||| |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 451  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||          ||   |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||| |    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt----------ttgtgttctctctcgctgttttctacttttgacttatgtttataattgttccat 34979517  T
Q  452 atactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  34979516 acactttattttggttgctttattattccttactcc 34979481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 42064433 - 42064776
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42064433 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 42064532  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  42064533 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42064632  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  42064633 actttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 42064731  T
Q  344 cccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42064732 cccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 42064776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 42452701 - 42453041
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  42452701 tacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 42452800  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  42452801 taaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||| |    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-c 42452997  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452998 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 42453041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45239316 - 45239000
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 140  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| || | ||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  45239316 cttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 45239217  T
Q  141 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45239216 gtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 45239118  T
Q  241 agggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttc 340  Q
     ||||| | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||    
T  45239117 ggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 45239018  T
Q  341 tcccccagactaggtcaa 358  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45239017 tcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43623905 - 43623526
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43623905 tacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 43623806  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  43623805 tagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43623718  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||    
T  43623717 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 43623618  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggctt 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  43623617 cccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggctt 43623526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732725
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||            || ||      
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggac 31732913  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccc 31732813  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||  |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31732812 ccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattcgtgtgttc--tctatcttt-tctctcgctgttttctacttttggtttgtg 31732725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539553
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 303  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162217
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 24162449  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          | ||     
T  24162448 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tggga 24162359  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||| | ||||||    
T  24162358 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctccc 24162260  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24162259 ccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattctt 24162217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215584
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  35215781 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactc 35215682  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35215681 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217961
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
     ||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35218058 gttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578052
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||      
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | | ||| | | ||||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttccc 11578145  T
Q  345 ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttc-ttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||| | || || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11578144 ccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctcttttctttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgt 11578052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 136 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459084
Alignment:
Q  136 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  236 agattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact 334  Q
    || || ||| |   | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  335 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggctt 432  Q
      | |||  || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--cctgttttctacttttggttt 28459139  T
Q  433 gtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28459138 gtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctcc 28459084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375237
Alignment:
Q  176 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  276 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  376 caacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | ||||| |||| || ||| ||||||| |||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctgtttttttacttttgacttgtatttataattgttccatacactttgttttgattgcttg 5375252  T
Q  473 gttattccttgctcc 487  Q
     |||| |||| ||||    
T  5375251 attatcccttactcc 5375237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 252 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22407583 - 22407361
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  22407583 tagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 22407484  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22407483 aggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgatgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 22407384  T
Q  450 ttatactatgttttggttgcttg 472  Q
     || ||| |||||||||||||||    
T  22407383 atacactttgttttggttgcttg 22407361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Original strand, 22874035 - 22874391
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| || | ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22874035 agatttgtttcaattttatgagggttacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 22874134  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
            |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22874135 t-------caaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagt 22874222  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    ||||| || ||| |||||||||  || | | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22874223 ctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 22874322  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 386  Q
    |||||||||  |   ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22874323 tagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattct 22874391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18800639 - 18800266
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||          || ||||||||||||    
T  18800639 tacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgta 18800548  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  18800547 tagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggg 18800452  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | | ||  | |||     
T  18800451 gctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct- 18800353  T
Q  343 ccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18800352 ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct-tct-gctgttttctacttttg 18800266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707643
Alignment:
Q  262 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc--cagactaggtcaat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||| ||  ||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  360 ttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacta 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||| || |||     
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttctgccttgtgtttataattgttccatacactt 22707673  T
Q  458 tgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  22707672 tgttttggttgcttgattgttccttactcc 22707643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 223  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897199
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 17897407  T
Q  221 cttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 319  Q
    |||||| | | ||| |||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17897406 cttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattata 17897307  T
Q  320 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgtt 417  Q
    ||  |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  | ||||    
T  17897306 gtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gttgtt 17897210  T
Q  418 ttctacttttg 428  Q
    |||||||||||    
T  17897209 ttctacttttg 17897199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146540
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtct 20146770  T
Q  221 cttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 319  Q
    |||||| ||| ||| |||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20146769 cttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20146670  T
Q  320 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgtt 417  Q
    ||| |||| | | ||| | |||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| || ||| || | ||| |||| |||| ||||| | ||||    
T  20146669 gtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctctttcttt-tctctcgttgtt 20146571  T
Q  418 ttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  20146570 ttctactttt-gcttgtgtttataattgttcc 20146540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22407746 - 22407591
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22407746 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22407647  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407646 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558860
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 36558860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561137
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 36561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37963289 - 37962938
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || ||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37963289 agatttgttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 37963190  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
            |||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  ||||||||    
T  37963189 t-------caaa-ctagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagt 37963102  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    |||||||| || ||||||||||  || | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||| |||| |||||| ||    
T  37963101 ctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttattcatcatta 37963005  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||||    ||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37963004 tagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 436
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871128
Alignment:
Q  261 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 360  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  || | ||||||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  361 tggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttcatttctctcccgctgttttctacttttgccttgtgt 23871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 409
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699660
Alignment:
Q  182 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  281 acccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 378  Q
    | || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  | |  || | | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  379 caaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctc 409  Q
    |||| ||| || ||||| |||| |||||||||    
T  40699629 caaatttcgtgtgttctctctttctttctctc 40699660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22163108 - 22162918
Alignment:
Q  295 cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgtt 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||    
T  22163108 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 22163009  T
Q  393 ctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||| | |||| || | | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22163008 ctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgcttataactgttccatacaatttgttttggttgcttgattatcccttgct 22162918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 383
Target Start/End: Original strand, 35107218 - 35107553
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||| |  || |||  ||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||||    
T  35107218 tacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgt 35107315  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  35107316 atagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgt 35107409  T
Q  243 ggttgtggatagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    |  | ||| |||||||||     | |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  |||| |    
T  35107410 gactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttct 35107508  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  35107509 ctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462837
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  352 aggtcaa-tttggaccgaactaggtc--aacaaattcttgcgttctttcttc-ctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 446  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  || |||   ||| ||||| ||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaaaaaaaaaaattgtgttctctcttctctttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgt 7462878  T
Q  447 tccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | | || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  7462877 ttcatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctcc 7462837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  136 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 235  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  236 agattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactc 311  Q
    | ||| ||  | ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5377724 - 5377629
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 181  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377724 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  169 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggaga 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  | | | |||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 357 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539436
Alignment:
Q  357 aatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttata 454  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||  || |    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactttttgcttgtgtttataattgttcaataca 15539454  T
Q  455 ctatgttttggttgcttg 472  Q
    || ||||||| |||||||    
T  15539453 ctttgttttgattgcttg 15539436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 316
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatccctt 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  298 ttgtaaggttactcatcat 316  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 140  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139484
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 43139484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583480
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 27583480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12342747 - 12342681
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12342747 tacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagg 12342681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 316
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tgtggatagaattaggcggga-gacttattcttgt 279  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| |||  | ||| ||||||||||   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  280 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 487
Target Start/End: Original strand, 38020368 - 38020443
Alignment:
Q  412 gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38020368 gctgttttctacttttagcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 38020443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921811
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 17921811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345718
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatt 26345718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028688
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagatt 35028688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17057411 - 17057369
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057411 tctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17085394 - 17085352
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085394 tctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 45279959 - 45279888
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  45279959 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 45279888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 17943674 - 17943734
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17943674 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattcttgtgttctttct 17943734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575265
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggt 34575265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 40699203 - 40699278
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag 94  Q
    |||||| || ||||||| || | | ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  40699203 agatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 723786 - 723744
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  723786 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736243
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2736243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2740979
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2740979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 11067431 - 11067473
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067431 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11151633 - 11151591
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11151633 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462474
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17462474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054909
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20054909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712660
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717369
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33162492 - 33162450
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33162492 tctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34139812 - 34139770
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34139812 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 35215550 - 35215479
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  35215550 tgttttctacttttgacttgt--atttaattatttcatatgctttgttttggttgcttaattatcccttgctcc 35215479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 39284962 - 39285004
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39284962 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680083
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 39680083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687021
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 39687021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567447
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Original strand, 1345592 - 1345641
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 388  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1345592 tctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttg 1345641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Original strand, 2838081 - 2838130
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 388  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2838081 tctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttg 2838130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503032
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatt 7503032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720754
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagatt 30720754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12781264 - 12781204
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12781264 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattattgtgttctttct 12781204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 120)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678459
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||      
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||| | |||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccc 21678319  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 445  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21678320 tagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattcttgtgttctctcttcttttctccc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattg 21678417  T
Q  446 ttccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21678418 ttccttacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 21678459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724975
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||      
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 44724832  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44724833 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcatttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttataat 44724930  T
Q  444 -tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | |||| || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  44724931 atgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 44724975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 443547 - 443995
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  443547 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 443646  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  443647 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct-c 342  Q
      | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcc 443846  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctt--tctctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  443847 cccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgatt 443946  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||  || ||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  443947 ataattgttcaatacactttgttttggttgcttgactattccttgctcc 443995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295828
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattac-atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  145 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcc 4295972  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |     
T  4295971 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gccattttctacttttggcttgtgtttatt 4295874  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||  || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4295873 attgttctatacactttgttttggttgcttgatgattccttgctcc 4295828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 42331336 - 42330893
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||    
T  42331336 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgta 42331237  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||     
T  42331236 tagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
     |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || || |||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctct 42331037  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  42331036 cccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt--gttctctctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttata 42330939  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  42330938 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctcc 42330893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 46 - 485
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680423
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||      
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||| | |||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccc 21680280  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaa---ctaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||  | ||  ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  21680281 cagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttat 21680378  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    |||| |||| || ||| |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21680379 aattgttccatacactttgtttttgttgcatgattattccttgct 21680423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355657
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |      
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||  |   ||| | |||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccc 11355511  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctt-tctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11355512 tagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctcttacttctctctcttgttgttttctacttttggcttgtgtttataa 11355611  T
Q  443 ttattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11355612 ttgttccatacactttgtttttggttgcctgattattccttgctcc 11355657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13099813 - 13099383
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13099813 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 13099714  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13099713 tagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 13099514  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  13099513 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgt 13099415  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttg 468  Q
     | ||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  13099414 ttataattgttccatacactttgttttggttg 13099383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 71 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21592453 - 21592073
Alignment:
Q  71 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21592453 atcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 21592354  T
Q  171 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagact 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||||||    
T  21592353 tagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 21592254  T
Q  271 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 370  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21592253 tattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 21592154  T
Q  371 taggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21592153 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 21592073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 46 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137061
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||| | | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||      
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||| ||    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-cc 20137146  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttgg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20137145 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttgg 20137061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 44 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 27306566 - 27306138
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27306566 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-ta 27306468  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  27306467 tagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 27306368  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||    
T  27306367 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 27306268  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||   | |||||||| |||||||||||||  | |||    
T  27306267 cctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttcttcttttggcttgtgattataa 27306168  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    || |||| || ||| |||||||||||||||    
T  27306167 ttgttccatacactttgttttggttgcttg 27306138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 31435384 - 31434940
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31435384 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31435285  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |     
T  31435284 tagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 31435185  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||    
T  31435184 actttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 31435085  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  31435084 ccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttat 31434987  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31434986 aattgttccttacactttattttgattgcttgattattccttgctcc 31434940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145888
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |       
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| | | | ||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttcc 39146023  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||    
T  39146022 ctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggtttgtgtttataa 39145923  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    || ||   || | | ||||||||||||||| ||||    
T  39145922 ttgtttaatacaatttgttttggttgcttgattat 39145888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990548
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | |||||||     
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccca 21990404  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaatt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21990405 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgtttgctacttttggcttgtgtttataatt 21990504  T
Q  445 attccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     |||| || ||| || |||||||||| || |||| |||||||||    
T  21990505 gttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctcc 21990548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Original strand, 9679053 - 9679457
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 184  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  9679053 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 9679151  T
Q  185 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679152 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9679251  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  9679252 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaatt 9679351  T
Q  385 c--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattcct 481  Q
    |  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| || |||||||||| || ||||  ||    
T  9679352 cttttgtgttatctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcact 9679451  T
Q  482 tgctcc 487  Q
    ||||||    
T  9679452 tgctcc 9679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 449
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681179
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 140  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  141 gtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    |  |  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| | |    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||     
T  9681068 ctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttcctttctctctcgatcttttctacttttggcttgtgtt 9681167  T
Q  438 tttaattattcc 449  Q
    | ||||| ||||    
T  9681168 tataattgttcc 9681179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 38393934 - 38394388
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38393934 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38394033  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  38394034 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttgg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||    
T  38394234 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgg 38394332  T
Q  430 cttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||  ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38394333 ct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 38394388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 44516 - 44859
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  44516 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtg 44615  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||    
T  44616 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttggg 44715  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||    
T  44716 actttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcc 44815  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44816 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 44859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412018
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  147 agtttgtctcttg-gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||      
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | |||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttc---tctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||  ||||  |||   ||||| | ||||||||| ||||||||||||  |    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctcccttctcttcttttctctcgttgttttctagttttggcttgtgatt 37412063  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttg 483  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37412062 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttg 37412018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 48457647 - 48457948
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48457647 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 48457746  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457747 cattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 48457846  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48457847 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 48457946  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  48457947 tt 48457948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 428
Target Start/End: Original strand, 24748555 - 24748931
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24748555 tataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttg 24748654  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  | ||| |    
T  24748655 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggt 24748754  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||| ||||| |    
T  24748755 agaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagatt 24748854  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||||||    
T  24748855 aggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctttatttctctc--gttgttttctacttttg 24748931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 33 - 487
Target Start/End: Original strand, 42223097 - 42223553
Alignment:
Q  33 tttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagg-gggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaat 131  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||  |||||||||||     
T  42223097 tttatgagggtttcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaa 42223196  T
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223197 ctagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 42223296  T
Q  231 tgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaat 330  Q
     ||||||||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  42223297 ggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggat 42223396  T
Q  331 gactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    | ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||  |||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  42223397 ggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttctctc--attgttttctacttttg 42223494  T
Q  429 gcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||||| | ||||| ||   || ||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  42223495 ccttgtgtttataattgttttatacactttattttggttgcttgattatcccttactcc 42223553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Original strand, 18345535 - 18345943
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  18345535 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggtt 18345634  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345635 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18345734  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18345735 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattc 18345834  T
Q  386 --ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggtt 475  Q
      ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||  |    
T  18345835 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgact 18345931  T
Q  476 attccttgctcc 487  Q
    || |||||||||    
T  18345932 atcccttgctcc 18345943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7472275 - 7471974
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7472275 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7472176  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |   | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7472175 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaaccca 7472076  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7472075 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 7471976  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  7471975 tt 7471974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 35581 - 36031
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||| |||||||||||     
T  35581 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtg 35680  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  35681 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 35780  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||| |||||||    
T  35781 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcc 35880  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctt-tcttcctt----tctctctggc---tgttttctacttttggcttg 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  | |||||| ||||| ||    ||| ||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  35881 cctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttggtttg 35979  T
Q  434 tgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35980 t--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 36031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 20297356 - 20297657
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20297356 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggtt 20297455  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297456 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaaccca 20297555  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20297556 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattc 20297655  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  20297656 tt 20297657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 20626032 - 20626333
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20626032 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20626131  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20626132 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20626231  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20626232 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 20626331  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  20626332 tt 20626333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 20629923 - 20630224
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20629923 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20630022  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20630023 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20630122  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20630123 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 20630222  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  20630223 tt 20630224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 20642342 - 20642643
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20642342 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20642441  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20642442 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20642541  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20642542 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 20642641  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  20642642 tt 20642643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836630
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||  | ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40836979  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  40836978 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 40836879  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  40836878 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 40836780  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttccttt--ctc-tctggc---tgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||   || ||| ||   ||||||||||||||||||  ||    
T  40836779 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tg 40836682  T
Q  436 tatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  40836681 tatttaattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctcc 40836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049290
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  || || | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1049532  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  1049531 agagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 1049432  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||    
T  1049431 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 1049333  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1049332 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1049290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7470317 - 7470016
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7470317 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7470218  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470217 gattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7470118  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7470117 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 7470018  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  7470017 tt 7470016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 20299406 - 20299862
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggt 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||    ||||||||||||||| || || |||||||   |||||||||| |||||||    
T  20299406 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 20299505  T
Q  139 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20299506 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  238 attagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtt 337  Q
      | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | |  || |    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgct 20299705  T
Q  338 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctct----ctggc---tgttttctacttttg 428  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||   |||||| | |    || ||   |||||||||||||||    
T  20299706 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctcgcagttgttttctacttttg 20299805  T
Q  429 gcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20299806 gcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 20299862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850276
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1850274  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  1850275 tt 1850276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487955
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28487747 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 28487846  T
Q  386 tt--gcgttctttcttcctttctct----ctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggtta 476  Q
    ||  | ||||||  || |||| | |    || ||   ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||    
T  28487847 ttttgtgttcttcttttctttgtgttcttctagccgttgttttctacttttgacttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatta 28487944  T
Q  477 ttccttgctcc 487  Q
    | |||||||||    
T  28487945 tcccttgctcc 28487955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 387
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946623
Alignment:
Q  91 agagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  191 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 290  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  291 atcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 40946623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046919
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1047019 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1046921  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  1046920 tt 1046919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 3878571 - 3878872
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||    
T  3878571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggtt 3878670  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878671 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3878770  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878771 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3878870  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  3878871 tt 3878872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 3035669 - 3036019
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3035669 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 3035768  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg---tgaaga 236  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  3035769 tttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  237 gattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgt 336  Q
    |  | ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||| |  | | | |||     
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 3035968  T
Q  337 tttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3036019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27832936 - 27832585
Alignment:
Q  79 aaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 177  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832936 aaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtt 27832837  T
Q  178 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27832836 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattctt 27832737  T
Q  278 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 376  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | | | ||  | |||||||||||||||||||||||     ||||| |||     
T  27832736 gtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggta 27832642  T
Q  377 aacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    |||||||||||| ||| | |||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  27832641 aacaaattcttgtgttatctctttctttctctc--actgttttctacttttggtttgtg 27832585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 71 - 382
Target Start/End: Original strand, 24258442 - 24258757
Alignment:
Q  71 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 170  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258442 atcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 24258541  T
Q  171 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagact 270  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |  | ||||||||||||||||| | |||    
T  24258542 tatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaact 24258641  T
Q  271 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca----tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggacc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||| |||| | | ||| | ||||   |||||||||||||||||||||    
T  24258642 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggacc 24258741  T
Q  367 gaactaggtcaacaaa 382  Q
    ||| ||| | ||||||    
T  24258742 gaattagatgaacaaa 24258757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 316
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276365
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25276365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542823
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 25542582  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||     
T  25542583 agagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 25542681  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || |   ||| | ||||||    
T  25542682 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccc 25542780  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542781 ctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 25542823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 28485514 - 28485860
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28485514 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 28485613  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28485614 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||| | ||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |  | |  || | |    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctct 28485813  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28485814 ct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28485860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31156248 - 31155908
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31156248 tacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31156149  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  31156148 tagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgg 31156049  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||| ||||||| |  | | | ||| | ||||    
T  31156048 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctc 31155950  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31155949 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351649
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7351748  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  7351747 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 7351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 161 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092207
Alignment:
Q  161 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  261 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  361 tggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattctt 7092207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 322
Target Start/End: Original strand, 11757176 - 11757460
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataa-aggtttagaaacgcaacaacaaatctagggt 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  11757176 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 11757275  T
Q  139 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11757276 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  238 attagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtg 322  Q
      | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 7188470 - 7188931
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  7188470 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aa 7188568  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
      |||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7188569 gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 7188665  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    |||||||| ||| ||| |||||  |  | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||    
T  7188666 ctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcatta 7188765  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgt 416  Q
    ||||| |||| | | ||| | ||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | |||| |||| ||||| |||||    
T  7188766 tagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt-ttgcgtgttctctttcttt-tctctcgctgt 7188863  T
Q  417 tttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||   |||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7188864 tttctactttt-gcttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctcc 7188931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 86 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7349568 - 7349285
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  7349568 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7349469  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349468 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7349369  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 369  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349368 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43253801 - 43253511
Alignment:
Q  96 gggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 195  Q
    ||||||||| || | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43253801 gggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcacctt 43253703  T
Q  196 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  43253702 gggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 43253603  T
Q  296 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |  | | ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  43253602 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattctt 43253511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 161 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094454
Alignment:
Q  161 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattag 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  261 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  361 tggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattctt 7094454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22828996 - 22828687
Alignment:
Q  18 tagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    ||||||| || || ||||||| | | ||||||| |||||||||||| | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  22828996 tagatttgttccagttttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaa 22828897  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  22828896 aggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgag 22828797  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |    
T  22828796 tctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattatt 22828697  T
Q  317 atagtgaaac 326  Q
    ||||||||||    
T  22828696 atagtgaaac 22828687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813450
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  221 cttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 319  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  320 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctctggctgtt 417  Q
    ||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctcttccttt-tctctcgttgtt 24813461  T
Q  418 ttctacttttg 428  Q
    |||||||||||    
T  24813460 ttctacttttg 24813450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20091904 - 20091609
Alignment:
Q  18 tagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    ||||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||        
T  20091904 tagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgg 20091805  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20091804 aggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa 20091709  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcata 317  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20091708 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 20091609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24817710 - 24817362
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||||||   ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  24817710 agatttgttacaattttatgagggatactttaa-tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa 24817613  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 217  Q
       |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  24817612 gt-caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgag 24817518  T
Q  218 tctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-t 316  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  24817517 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcatt 24817418  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 371  Q
    |||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  24817417 atagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 285
Target Start/End: Original strand, 26804554 - 26804765
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac---tag 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  26804554 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtag 26804653  T
Q  174 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26804654 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 26804753  T
Q  274 tcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||    
T  26804754 tcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251611
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 435
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465878
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    |||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtata 24465594  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||      
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||  || |||||||| | | ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt-tcgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctacttttggtttgtg 24465878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 18567565 - 18567731
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18567565 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 18567664  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567665 tagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396929
Alignment:
Q  170 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagac 269  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  270 ttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 369  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||| | || | | ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  370 ctaggtcaacaaattctt 387  Q
    || |||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattctt 38396929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 26295607 - 26295790
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||    
T  26295607 tagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcctccagac 26295706  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||| | |||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  26295707 taggtcaatttggactgaactggataaacaaattcttgtgttatctctttctttctttc--gttgttttctacttttggcttgtgt 26295790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 435
Target Start/End: Original strand, 22393873 - 22394066
Alignment:
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  |||| |||    
T  22393873 ggttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctct 22393972  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  22393973 cccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--gttgttttctacttttggtttgtg 22394066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 22392425 - 22392615
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||        |||| ||||||||||||    
T  22392425 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaat-------caaa-ctagggtttgta 22392516  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  22392517 tagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatgagg 22392612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 487
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606781
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 394  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 1606683  T
Q  395 --ttcttcctttct--ctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
      |||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1606684 tcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctcc 1606781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137370
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22137283 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22137370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552397
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40552310 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40552397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108359
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22108272 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22108359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550119
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40550032 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40550119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 384
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081803
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtct 11081634  T
Q  221 cttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatcccttttgtaaggttactcatc-at 316  Q
    |||| | ||| |||||||||||| || ||  || |||||||   | ||||| |||||||||||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||  |    
T  11081635 cttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatcttt 11081734  T
Q  317 atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    | | || |||| |||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11081735 aaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Original strand, 6332283 - 6332514
Alignment:
Q  154 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggata 253  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  | | | ||    
T  6332283 ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggta 6332380  T
Q  254 gaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  6332381 gaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagact 6332480  T
Q  352 aggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  6332481 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251478
Alignment:
Q  361 tggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactat 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || ||| |    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacacttt 22251506  T
Q  459 gttttggttgcttggttattccttgctc 486  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  22251505 gttttggttgtttgattatcccttgctc 22251478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 316
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049094
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 219  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatc 6048997  T
Q  220 tcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    ||||||| ||| ||||| |||  |  | ||||||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6048998 tcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccc-tttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 472
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804893
Alignment:
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||| | |    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgatgttgttttctacttttgacttgtgtttat 26804861  T
Q  441 aattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  26804862 aattgttccatacactttgttttggttgcttg 26804893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Original strand, 11084438 - 11084523
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11084438 tctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagatt 11084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Original strand, 6348942 - 6349006
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6348942 tagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 487
Target Start/End: Original strand, 11759374 - 11759529
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctct----ctggc---tgttttctacttttgg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||   |||||| | |    || ||   ||||||||||||||||    
T  11759374 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttgg 11759473  T
Q  430 cttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  11759474 cttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 11759529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297166
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 16297166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30906387 - 30906264
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||  || |||||| |||| ||||||    
T  30906387 tacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaac-aaataacaaa-ctagagtttgt 30906290  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaaca 169  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30906289 atagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  92 gagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 7471938 - 7471867
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7471938 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 7471867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310157
Alignment:
Q  160 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Original strand, 26210603 - 26210688
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26210603 tctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagatt 26210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 1850312 - 1850383
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1850312 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 1850383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 3036055 - 3036126
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  3036055 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 3036126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12097909 - 12097867
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097909 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 20297693 - 20297764
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20297693 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 20297764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 28485896 - 28485967
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28485896 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 28485967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120937
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 6046668 - 6046772
Alignment:
Q  266 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttgg 363  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||   ||| | ||||||||||||||||||| | ||||    
T  6046668 agacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattgg 6046766  T
Q  364 accgaa 369  Q
    ||||||    
T  6046767 accgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369683
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagatt 21369683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281519
Alignment:
Q  187 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagatt 40281519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7094717 - 7094662
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20091196 - 20091109
Alignment:
Q  341 tcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctactttt 427  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| | | || |||||| || ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  20091196 tcccccagactaggtcagtattggaccgaactggataaataaattcgtgtgttctctctttctttttctctcgttgttttctactttt 20091109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 44895 - 44966
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  44895 tgttttctactttttgcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctcc 44966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320194
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3320194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324942
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3324942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069818
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7069818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074825
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7074825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 9190059 - 9190101
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9190059 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351391
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25351391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 398
Target Start/End: Original strand, 25351484 - 25351550
Alignment:
Q  333 ctgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  25351484 ctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 25351550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357085
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25357085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405431
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25405431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410168
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25410168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 25542859 - 25542930
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  25542859 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacattttgttttgattgcttgattatcccttgctcc 25542930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 27347943 - 27347985
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27347943 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36146450 - 36146408
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36146450 tctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 36146408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41317476 - 41317434
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41317476 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006701
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 42006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 48457984 - 48458055
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  48457984 tgttttctacttttgacttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 48458055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4253570 - 4253529
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 380  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4253570 tctcccacagagtaggtcaatttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 6348859 - 6348903
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 177  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6348859 ctagggtttgtatcgagtttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 381
Target Start/End: Original strand, 4796716 - 4796760
Alignment:
Q  337 tttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4796716 tttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 7469980 - 7469919
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||| ||||    
T  7469980 tgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttagttgcttgattat 7469919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Original strand, 38396972 - 38397041
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  38396972 ttttctacttttggcttgt--atttaattgttctatacactttgttttggttgctttattatcccttgctcc 38397041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Original strand, 40946663 - 40946732
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40946663 ttttctatttttggcttgt--atttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 40946732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14276
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14477 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 14378  T
Q  386 ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14377 ttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 14278  T
Q  486 cc 487  Q
    ||    
T  14277 cc 14276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 400
Target Start/End: Original strand, 14970 - 15326
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  14970 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggttttta 15069  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  15070 taaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcag 15169  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||    
T  15170 actttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcc 15269  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttc 400  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15270 cccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattcttgtgttctctcttc 15326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057557
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||  | ||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccc 13057472  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13057473 ccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctatctgttttctacttttg 13057557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629758
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||  | | ||| | ||| |||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccc 3629901  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctac-ttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  3629900 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctactttttggcttgtgtttataa 3629803  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  3629802 ttgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctcc 3629758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 52 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3632267 - 3631849
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3632267 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3632168  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  | |||     
T  3632167 gtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttggg 3632068  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||   |||  |||||||    
T  3632067 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctgtcccagac 3631970  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  3631969 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttttctctcgatgttttctacttttggcttgtgtttataattgttc 3631870  T
Q  449 cttatactatgttttggttgc 469  Q
    | || ||| ||||||||||||    
T  3631869 catacactttgttttggttgc 3631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11982918
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11983266  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  11983265 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 11983166  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  11983165 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 11983066  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |     
T  11983065 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattg 11982966  T
Q  440 taattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11982965 taattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 11982918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 387
Target Start/End: Original strand, 3390345 - 3390700
Alignment:
Q  33 tttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatc 132  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |    
T  3390345 tttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac 3390444  T
Q  133 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3390445 tagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaga 3390544  T
Q  233 aagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatg 331  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |    
T  3390545 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagg 3390644  T
Q  332 actgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  3390645 gctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattctt 3390700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 9019903 - 9020332
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9019903 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9020002  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  9020003 tagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattggg 9020102  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||    
T  9020103 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcc 9020202  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||| || ||||| ||   ||||||||||||||||||||| | |    
T  9020203 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtattt 9020302  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttg 468  Q
     ||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  9020303 ataattgttccatacactttgttttggttg 9020332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 44 - 434
Target Start/End: Original strand, 32279974 - 32280366
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||||| | |||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32279974 tacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgta 32280072  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32280073 tagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 32280172  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| | | ||| | ||||    
T  32280173 acttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctc 32280272  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  32280273 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctcttcctttctctcatgttattttctacttttggcttgt 32280366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040117
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |      
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 13040032  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  13040033 ctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctacttttg 13040117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477602
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||     
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa-------ggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtt 337  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||| |||||||||||  | | ||| |    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgct 25477552  T
Q  338 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25477553 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattctt 25477602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458761
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |  | | ||| | ||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  353 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14458761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338357
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacacta-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||| |     
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
     | ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||   |||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcc 24338486  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa--attcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  24338485 cccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggtttgtgtttata 24338388  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  24338387 attgttccatacactttgttttggttgcttg 24338357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728716
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  |||||||||| || |||||||||    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgta 30729066  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||    
T  30729065 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggg 30728966  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc----cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||| |||||||||  ||||||| |||| | | ||| | |    
T  30728965 gctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctct 30728866  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |     
T  30728865 ctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtatt 30728766  T
Q  438 tttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| |||| || ||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  30728765 tataattgttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctcc 30728716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1230587 - 1230243
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1230587 ttactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 1230488  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  | |    
T  1230487 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgg 1230388  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||    
T  1230387 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 1230288  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1230287 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1230243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28241659 - 28241315
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28241659 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 28241560  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  28241559 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28241460  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||    
T  28241459 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 28241360  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28241359 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14507512 - 14507063
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || || | |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14507512 tacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 14507413  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  14507412 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 14507313  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||| ||||||||||||| || | | ||| | |||||    
T  14507312 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 14507214  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||      
T  14507213 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct-- 14507117  T
Q  434 tgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14507116 tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 14507063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15541476 - 15541134
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  15541476 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 15541377  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  15541376 agagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattggga 15541277  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaac-gaatgactgttttctcc 343  Q
     | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||    
T  15541276 ctttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaag-ctgctctctcc 15541178  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15541177 tccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattctt 15541134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816225
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4816326 ttgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 4816227  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  4816226 tt 4816225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233666
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctccc 3233767  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaacta-----ggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgtt---ttctacttttggcttgt 434  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  3233766 ccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggtttgt 3233668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15533018 - 15532676
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15533018 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgta 15532919  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  15532918 taaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattggg 15532819  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | | | |    
T  15532818 acttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-c 15532720  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15532719 cctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctt 15532676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161501
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||  |      
T  12161790 gagtttgtctctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | | | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||| |||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccc 12161594  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
     | ||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12161593 taaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgtcttgtgt 12161501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915351
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20915452  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20915451 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20915353  T
Q  385 ct 386  Q
    ||    
T  20915352 ct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15530459 - 15530177
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15530459 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 15530360  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  15530359 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 15530260  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 327  Q
    | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15530259 gctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 15530177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 30967220 - 30967521
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  30967220 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 30967319  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30967320 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 30967419  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || |   ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30967420 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30967519  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  30967520 tt 30967521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19704864 - 19704564
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| |||||    
T  19704864 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggtt 19704765  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704764 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 19704665  T
Q  285 attgatatccct-tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19704664 attgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 19704565  T
Q  384 t 384  Q
    |    
T  19704564 t 19704564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30034944 - 30034597
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||  ||| |||    
T  30034944 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtt 30034845  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||      
T  30034844 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | | || | | ||| | |    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30034644 ctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 30034597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2629179 - 2628880
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  2629179 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggtt 2629081  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  2629080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaaccca 2628981  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2628980 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 2628882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12195852 - 12195515
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12195852 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 12195753  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12195752 tagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 12195653  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||    
T  12195652 gactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 12195554  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12195553 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065298
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||  || | ||||||| ||||||| | |||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26065202 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085267
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||  || | ||||||| ||||||| | |||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26085171 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 187 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069610
Alignment:
Q  187 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  287 tgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  386 --ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttg 483  Q
      ||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  1069713 ttttatgttctctcttcttttctctctcgctgttttctactttttgcttgtgtttataattgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttg 1069614  T
Q  484 ctcc 487  Q
    ||||    
T  1069613 ctcc 1069610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 316
Target Start/End: Original strand, 22490626 - 22490889
Alignment:
Q  54 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggttta-gaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22490626 ataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg 22490725  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  | ||| |    
T  22490726 cctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggt 22490825  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22490826 agaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26932857 - 26932559
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  26932857 gagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggtt 26932758  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932757 gattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26932658  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | |  || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932657 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 26932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 428
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466688
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    |  | ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| | | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctttctttctctcgctgctgttttctacttttg 14466688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3028187 - 3027799
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||  |||| || | || |||||| |||| ||||||||||||    
T  3028187 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaaggcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgag 3027992  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactg-ttttct 341  Q
      | ||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||      
T  3027991 actttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttc 3027892  T
Q  342 cccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgt 434  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| | | |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  3027891 cccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gttgttttctacttttgacttgt 3027799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 428
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15720005
Alignment:
Q  78 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  178 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattctt 277  Q
       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  278 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaac---gaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactag 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||   || |  || |||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctcttt--ccccccatactaggtcaatttggaccgaacttg 15719950  T
Q  374 gtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    || |||||| ||| || ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15719951 gtaaacaaatttcatgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctatttttg 15720005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 477
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367441
Alignment:
Q  133 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 232  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  233 aagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatga 332  Q
    ||||||||     | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| | |     
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  333 ctgttttctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggc 430  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||| |||| |||||||||  |   |||||||||||||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctc--gtatttttctacttttggc 15367394  T
Q  431 ttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15367395 ttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 15367441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19227645  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  19227644 agagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 19227545  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattc 275  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19227544 ctttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  166 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgg 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  265 gagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgga 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||| ||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  365 ccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 436
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012407
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 150  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  151 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttgtg 249  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || ||    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  250 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 348  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||   |  || |  | ||||||||||    
T  17012224 g-tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagggaacatagaga-tcatctctcccccag 17012321  T
Q  349 actaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |    |||| |||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  17012322 actaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt-tcatattctctctttctttctctc--actattttctacttttggcttgtgt 17012407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 477
Target Start/End: Original strand, 15346535 - 15346756
Alignment:
Q  255 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactagg 354  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |   ||| | ||||||||||||||||    
T  15346535 aattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactagg 15346634  T
Q  355 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttat 453  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  15346635 tcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctt--tctcttgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatat 15346732  T
Q  454 actatgttttggttgcttggttat 477  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15346733 actttgttttggttgcttgattat 15346756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16455672 - 16455421
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||     
T  16455672 ctagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacgg 16455576  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 330  Q
     |||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |     
T  16455575 aaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggag 16455476  T
Q  331 gactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    | ||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  16455475 ggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186003
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |  | ||| || |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  282 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 380  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  381 aat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    |||  | ||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctactttttccttgtgtttataattgttcc 12186003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066121
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26066121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311442
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  33311356 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33311442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1072214 - 1072067
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  1072214 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgta 1072115  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 191  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072114 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309173
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  33309087 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33309173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 428
Target Start/End: Original strand, 19696453 - 19696803
Alignment:
Q  79 aaaccttgagatagaggg--ggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 175  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19696453 aaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactaggg 19696549  T
Q  176 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga-gacttatt 274  Q
    ||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||  |  | ||| ||||||||||   || ||||||||    
T  19696550 ttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttatt 19696647  T
Q  275 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacta 372  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  ||  ||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||     
T  19696648 cttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactg 19696747  T
Q  373 ggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctg-ttttctacttttg 428  Q
    ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19696748 ggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctgtttttctacttttg 19696803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754705
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  29754792 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 29754705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068392
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26068478 tt-gtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 436
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945515
Alignment:
Q  182 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggg-agacttattcttgta 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  281 acccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaa 378  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| | | | | || |||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  379 caaatt-cttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||| | ||  |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26945458 caaatttcgtgtcttctctctttcttt-tctctcgctgttttctacttttggcttgtgt 26945515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Original strand, 17852519 - 17852650
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  17852519 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 17852618  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 175  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852619 tagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 212
Target Start/End: Original strand, 15346368 - 15346524
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||         |||| ||||||||||||    
T  15346368 tacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaa-------ttcaaa-ctagggtttgta 15346459  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 212  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346460 taaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22857906
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  | | | |    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  253 agaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-attgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 349  Q
    ||| |||||   | ||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||    
T  22858083 agatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccaga 22857985  T
Q  350 ctaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  22857984 ctaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctgttttgtacttttg 22857906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 158
Target Start/End: Original strand, 8995456 - 8995570
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8995456 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 8995555  T
Q  144 tagagtttgtctctt 158  Q
    |||||||||||||||    
T  8995556 tagagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584213
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  146 gagtttgtctcttg 159  Q
    ||||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 417
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584348
Alignment:
Q  299 tgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttctt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || ||| |||||     
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  396 tcttcctttctctctggctgtt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  10584327 tcttcctttctctctcgctgtt 10584348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25078856 - 25078514
Alignment:
Q  78 taaaccttgagatagag-ggggctgaaat-aaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 175  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  25078856 taaaccttgagagagagaggggccgaaaacaaaggtttagaaacata-caacaa-tctagggtttgta--gagttta-ctcttggcaacaaacattaggg 25078762  T
Q  176 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga-gacttatt 274  Q
    ||  |   |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||  | ||   | ||||||||||   || ||||||||    
T  25078761 ttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-tagaattaggtttgaagacttatt 25078665  T
Q  275 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacta 372  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| | ||||| |||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||     
T  25078664 cttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactg 25078566  T
Q  373 ggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctact 424  Q
    ||| |||||||| | || ||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25078565 ggtaaacaaattttgtgtgttctctctt-ctttttctctaactgttttctact 25078514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465544
Alignment:
Q  262 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat- 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| | |||| |||| |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  360 ttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | || ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctacttttg 25465544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20526979
Alignment:
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20526885 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagatta 20526979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  185 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  || |||||  |  | ||| ||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  284 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaa---acgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 378  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||||| | ||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||| || ||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  379 caaatt 384  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 477
Target Start/End: Original strand, 3394698 - 3394780
Alignment:
Q  396 tcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggttgcttggttat 477  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || ||||||||||||| ||||    
T  3394698 tcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttggttgcttgattat 3394780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 281  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  282 cccattgatatcccttttgtaaggttactca 312  Q
    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctc-tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138479
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagat 11138479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445815
Alignment:
Q  266 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca 357  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4816186 - 4816117
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4816186 ttttctacttttgacttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 4816117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 103
Target Start/End: Original strand, 15367013 - 15367079
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacatt-------acatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367013 tacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 15367079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577658
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 4595048 - 4595102
Alignment:
Q  120 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4595048 gcaacaacaaaactagggtttgta--gagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878765
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883513
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13883513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785957
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16785957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887368
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26954328 - 26954286
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26954328 tctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 26954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078261
Alignment:
Q  266 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 28078261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28241279 - 28241208
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  28241279 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctcc 28241208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248858
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31248858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 31936633 - 31936591
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31936633 tctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33211227 - 33211185
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33211227 tctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201470
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 6843217 - 6843287
Alignment:
Q  155 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6843217 tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtctcttggt 6843287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Original strand, 30445602 - 30445661
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggat 213  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30445602 tctcttggcaacaaacactacgg-ttga-gattgattcaccttggagaaacactattaggat 30445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 134)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928071
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||| | ||||||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctccc 38928214  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  38928213 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttatctc--gttgttttctacttttggcttgtgattataa 38928116  T
Q  443 ttattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38928115 ctgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 38928071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22803071 - 22802624
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22803071 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 22802972  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22802971 tagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22802872  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  |  | |||||    
T  22802871 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcc 22802772  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgt---tttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |    
T  22802771 cccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatctt-ctttttctctcgctgttgctttctacttttggcttgtgttt 22802673  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22802672 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 22802624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395737
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12395881  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||| | ||||    
T  12395880 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtcttctacttttggcatgtgtttataat 12395781  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||  ||  || |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  12395780 ttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctcc 12395737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 44 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 40091752 - 40091317
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||     
T  40091752 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtt 40091653  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  40091652 tagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 40091553  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||    
T  40091552 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 40091453  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  40091452 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctattttctacttttggcttgtgtttata 40091353  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  40091352 attattccatacactttattttggttgcttgattat 40091317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 43 - 487
Target Start/End: Original strand, 40637069 - 40637519
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40637069 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 40637168  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||      
T  40637169 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattga 40637268  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||    
T  40637269 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 40637368  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||      
T  40637369 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgat 40637467  T
Q  438 tttaattattccttatactatg--ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| |||| || ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40637468 tataattgttccatacactttgttttttggttgcttgattattccttgctcc 40637519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400699
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12400843  T
Q  346 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||| | ||||    
T  12400842 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtcttctacttttggcatgtgtttataat 12400743  T
Q  444 tattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | |||  ||  || |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  12400742 ttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctcc 12400699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 71 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 33415797 - 33415381
Alignment:
Q  71 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33415797 atcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacac 33415699  T
Q  171 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagact 270  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||    
T  33415698 taaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagact 33415599  T
Q  271 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33415598 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaac 33415499  T
Q  371 taggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatg-ttttggtt 467  Q
    | |||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||| || ||||||||    
T  33415498 tgggtcaataaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtcccatacactttgattttggtt 33415401  T
Q  468 gcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||  ||| |||||||||    
T  33415400 gcttgactatcccttgctcc 33415381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 477
Target Start/End: Original strand, 48486315 - 48486752
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  48486315 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 48486414  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48486415 tagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 48486514  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||    
T  48486515 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcc 48486614  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctct---ggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||| ||| | ||||||||| |||||    | ||||||||||||||||||||||| |    
T  48486615 cccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctcttccttt-tctcttgatgttgttttctacttttggcttgtgttt 48486713  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
     ||||| |||| |  ||| |||||| |||||||| ||||    
T  48486714 ataattgttccattcactttgttttagttgcttgattat 48486752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 479
Target Start/End: Original strand, 24878985 - 24879425
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24878985 tacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 24879084  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24879085 tagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 24879184  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||| | | ||| | ||||    
T  24879185 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 24879284  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||     
T  24879285 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtt 24879383  T
Q  438 tttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattc 479  Q
    | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24879384 tataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattc 24879425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 435
Target Start/End: Original strand, 16453282 - 16453697
Alignment:
Q  21 attttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  16453282 atttgttacaattttatgggagttacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaagg 16453381  T
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453382 caacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 16453481  T
Q  221 cttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 319  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453482 cttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 16453581  T
Q  320 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgtt 417  Q
    |||||||  |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||   |||||    
T  16453582 gtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--actgtt 16453679  T
Q  418 ttctacttttggcttgtg 435  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16453680 ttctacttttggcttgtg 16453697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22801199 - 22800752
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  22801199 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 22801100  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |    
T  22801099 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgag 22801000  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | |||||    
T  22800999 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcc 22800900  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgt---tttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |    
T  22800899 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgctttctacttttggcttgtgttt 22800801  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  22800800 ataattgttccatatactttgttttggttgcttgactatcccttgctcc 22800752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 24888792 - 24889239
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  24888792 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgta 24888891  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24888892 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactagg 24888991  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | | ||| | |||||    
T  24888992 actttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 24889091  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |    
T  24889092 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgatt 24889190  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  24889191 ataattgttccatacactttgttttggttgttagattattccttgctcc 24889239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096222
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   ||| | ||||||    
T  19096080 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctccc 19096179  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19096180 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 19096222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 36919924 - 36919476
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttga--gatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36919924 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 36919825  T
Q  142 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  36919824 gataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 36919725  T
Q  241 agggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttc 340  Q
     ||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||   ||| ||| | ||    
T  36919724 gggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctc 36919625  T
Q  341 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36919624 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgttt 36919525  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| |||| || ||| | |||||||||| || |||| |||||||||    
T  36919524 ataattgttccatacactttattttggttgcctgattatcccttgctcc 36919476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 36921832 - 36921385
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36921832 tacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 36921734  T
Q  142 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  36921733 tatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 36921634  T
Q  241 agggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttc 340  Q
     ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||    
T  36921633 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctc 36921534  T
Q  341 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtat 438  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  36921533 tcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgttt 36921434  T
Q  439 ttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     ||||| || | || ||| | |||||||||| || |||| |||||||||    
T  36921433 ataattgtttcatacactttattttggttgcctgattatcccttgctcc 36921385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 36378263 - 36378731
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  36378263 agatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaa 36378362  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  36378363 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagt 36378462  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||| ||    
T  36378463 ctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcatta 36378562  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggctg 415  Q
    ||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||| ||||| |||||| || ||||    
T  36378563 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttcttttctc-ct-gctg 36378660  T
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||| || | || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36378661 ttttctacttttcgtttgtgtttataattgtttcatacactttg-tttggttgcttgattattacttgctcc 36378731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14787770 - 14787321
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14787770 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 14787671  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14787670 tatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactg--tttt 339  Q
     |  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   | |    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 14787471  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctt-tcttc-ctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  14787470 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtt 14787371  T
Q  438 tttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14787370 tataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 14787321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 479
Target Start/End: Original strand, 24880447 - 24880889
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24880447 tacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 24880546  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24880547 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 24880646  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||| | ||||    
T  24880647 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 24880746  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||     
T  24880747 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtt 24880845  T
Q  438 tttaattattccttatac--tatgttttggttgcttggttattc 479  Q
    | ||||| |||| || ||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  24880846 tataattgttccgtacactttgtgttttggttgcttgattattc 24880889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Original strand, 14633315 - 14633657
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14633315 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 14633413  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14633414 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgg 14633512  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||    
T  14633513 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 14633612  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14633613 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14633657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 44 - 448
Target Start/End: Original strand, 47274723 - 47275126
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47274723 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47274822  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||    
T  47274823 ta-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctggg 47274921  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||| |    
T  47274922 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-c 47275020  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47275021 cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttgatttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttat 47275118  T
Q  441 aattattc 448  Q
    ||||||||    
T  47275119 aattattc 47275126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 619784 - 619445
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| |||||||||| |    
T  619784 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgca 619685  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||    
T  619684 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattggg 619585  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  619584 tctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcc 619485  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  619484 ccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8631714 - 8631413
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  8631714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 8631615  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631614 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8631515  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8631514 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 8631415  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  8631414 tt 8631413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 5198416 - 5198759
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5198416 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgta 5198515  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  5198516 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggg 5198615  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  5198616 gctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 5198715  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5198716 cccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattctt 5198759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435293
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11435051  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||     
T  11435052 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctagga 11435151  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||    
T  11435152 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 11435250  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11435251 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11435293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 51015242 - 51015691
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51015242 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51015341  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  51015342 tagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 51015441  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  51015442 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctcc 51015540  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttg 433  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||      
T  51015541 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct-- 51015637  T
Q  434 tgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51015638 tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 51015691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 77 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37313370 - 37313059
Alignment:
Q  77 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313370 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 37313271  T
Q  177 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattct 276  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37313270 ttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattct 37313171  T
Q  277 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 375  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | | |||||||||||| ||||||||||||| || | | |    
T  37313170 tgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggat 37313071  T
Q  376 caacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||    
T  37313070 caacaaattctt 37313059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22047022 - 22046573
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||| | | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22047022 tacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22046923  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22046922 tagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22046823  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  22046822 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 22046724  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttccttt-----ctctc-tggctgttttctacttttggcttgt 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||      |||| | | ||||||||||||||| ||  |    
T  22046723 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgtcgttgttttctacttttgact--t 22046626  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22046625 gtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 22046573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 37089666 - 37089259
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  37089666 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 37089567  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089566 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 37089467  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37089466 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 37089368  T
Q  386 --ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggtt 475  Q
      ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  37089367 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 37089271  T
Q  476 attccttgctcc 487  Q
    || | |||||||    
T  37089270 atccattgctcc 37089259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22044727 - 22044278
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22044727 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22044628  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22044627 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22044528  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  22044527 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 22044429  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttccttt--ctc-tctggc---tgttttctacttttggcttgt 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||   || ||| ||   ||||||||||||||||||  |    
T  22044428 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--t 22044331  T
Q  435 gtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22044330 gtatttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 22044278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 24348256 - 24348557
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24348256 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggtt 24348355  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24348356 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaaccca 24348455  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24348456 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 24348555  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  24348556 tt 24348557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Original strand, 47868396 - 47868740
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47868396 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 47868495  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |      
T  47868496 atagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 47868595  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||    
T  47868596 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 47868695  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47868696 ccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 47868740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 9148247 - 9148591
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  9148247 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttg 9148346  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  9148347 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 9148446  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||    
T  9148447 ggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 9148545  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9148546 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattctt 9148591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006231
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11006333  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11006332 attgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaatt 11006234  T
Q  385 ctt 387  Q
    |||    
T  11006233 ctt 11006231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008562
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| ||   ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008661 attgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 11008565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Original strand, 6764834 - 6765183
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6764834 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6764933  T
Q  143 atagagtttgtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    ||||||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6764934 atagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagag 6765033  T
Q  238 attagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtt 337  Q
      | ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |  | | | ||| |    
T  6765034 gctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgct 6765133  T
Q  338 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6765134 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6765183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 38409243 - 38409543
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38409243 gagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38409342  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38409343 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaaccca 38409442  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38409443 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 38409541  T
Q  386 tt 387  Q
    ||    
T  38409542 tt 38409543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 377
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030770
Alignment:
Q  47 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 146  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  147 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  247 gtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||   ||||||| | | ||| | |||||||     
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccct 56030739  T
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtca 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56030740 agactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2485211 - 2484760
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagataga-gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2485211 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 2485112  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  2485111 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 2485012  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct 341  Q
    ||  | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||    
T  2485011 ggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 2484913  T
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggct 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||    
T  2484912 cccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct 2484814  T
Q  432 tgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
      ||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2484813 --tgtatttaattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctcc 2484760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 428
Target Start/End: Original strand, 41997496 - 41997872
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41997496 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 41997595  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  | || |||     
T  41997596 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttggg 41997695  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | | | | ||| ||||||||    
T  41997696 tagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccagac 41997794  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||| |  ||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  41997795 taggttaatttggaccgaactggataaacaaatttcataagttctctctttcttt-gctctcgctgttttctacttttg 41997872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 7941359 - 7941662
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgaggg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| |||    
T  7941359 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtggg 7941458  T
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941459 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7941558  T
Q  284 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7941559 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 7941658  T
Q  384 tctt 387  Q
    ||||    
T  7941659 tctt 7941662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 361
Target Start/End: Original strand, 13543997 - 13544272
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 184  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  13543997 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 13544095  T
Q  185 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544096 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 13544195  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaattt 361  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  13544196 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17662575 - 17662137
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17662575 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 17662476  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    |||           ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  17662475 tgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttc-ctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||     
T  17662286 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctcgct-gttgttttctacttttggcatgtga 17662188  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | ||||| |||| || ||| || |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  17662187 ttataattgttccatacactttggtttgattgcttgattatcccttgctcc 17662137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 44600175 - 44599836
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44600175 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 44600076  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44600075 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 44599976  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||    
T  44599975 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 44599877  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  44599876 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 387
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847491
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||    |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18847249  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18847250 agagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggg 18847349  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| |    
T  18847350 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-c 18847447  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18847448 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 18847491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 121 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085971
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  221 cttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatag 320  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  321 tgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || | || | | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattctt 26085971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709161
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18709258 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 18709161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9174482 - 9174143
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9174482 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 9174383  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  9174382 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgag 9174283  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||||| ||| |    
T  9174282 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgc 9174184  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9174183 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 9174143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934140
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16934380  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16934379 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16934280  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  16934279 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 16934181  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  16934180 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16934140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 487
Target Start/End: Original strand, 27499129 - 27499489
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27499129 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacga 27499228  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 330  Q
     ||||||||  || | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  27499229 taagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaag 27499325  T
Q  331 gactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctt------tctctctggctgttttcta 422  Q
    | ||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||      ||||||| | |||||||||    
T  27499326 ggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctctctcgttgttttcta 27499424  T
Q  423 cttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27499425 cttttgacttgtgtttataattgttccataaactttgttttggttgcttggttattcattgctcc 27499489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 387
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323034
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | |||     
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |  || | ||||||||||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  351 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctt 19323034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31849894 - 31849593
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacact-agggtttgagggt 184  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||    
T  31849894 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggt 31849795  T
Q  185 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31849794 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaaccc 31849695  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31849694 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 31849596  T
Q  385 ctt 387  Q
    |||    
T  31849595 ctt 31849593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 487
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891733
Alignment:
Q  190 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  290 tatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--t 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  387 tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctc 486  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2891633 tgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgattattctttgctc 2891732  T
Q  487 c 487  Q
    |    
T  2891733 c 2891733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9176803 - 9176471
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9176803 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 9176704  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgg 250  Q
    ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  | |||    
T  9176703 gtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 9176604  T
Q  251 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  9176603 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 9176505  T
Q  351 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  9176504 taggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatt 9176471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 162 - 394
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455588
Alignment:
Q  162 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  | ||| ||||||||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  262 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatt 16455554  T
Q  361 tggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttct 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16455555 tggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttct 16455588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5637760 - 5637524
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5637760 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 5637661  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5637660 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 5637561  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtg 322  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5637560 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931677
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16932026  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    ||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16932025 agagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16931926  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||    
T  16931925 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 16931827  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttctt-tcttcctttct--ctctggc---tgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  ||    
T  16931826 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tg 16931729  T
Q  436 tatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  16931728 tatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctcc 16931677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22132684 - 22132389
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  22132684 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggtt 22132587  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132586 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22132487  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132486 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780371
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22780468 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782736
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 383  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  22782833 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 124 - 436
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380738
Alignment:
Q  124 caacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  224 ggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtg 322  Q
    ||||||  |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  323 aaac-gaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgtttt 419  Q
     ||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  |  |||||||    
T  36380625 gaactgagtg-ctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctcctt--ctgtttt 36380721  T
Q  420 ctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||    
T  36380722 ctacttttggcttgtgt 36380738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824629
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3824666  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtg 322  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3824665 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537444
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agg 243  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||    
T  18537611 cttttgg-tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 18537513  T
Q  343 ccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctc 409  Q
    ||||| | |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  18537512 ccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttctctc 18537444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-aggg 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||      
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |    || | |||||    
T  18409482 ttttgg-tagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctcc 18409385  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  18409384 ctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134615
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | ||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134711 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18535138 - 18534729
Alignment:
Q  72 tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18535138 tcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacac 18535042  T
Q  171 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagact 270  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||    
T  18535041 tagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 18534944  T
Q  271 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||| |||| | |  || | || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  18534943 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccga 18534844  T
Q  369 actaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggtt 467  Q
    ||  ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| | |||   |||| || ||| ||||||||||    
T  18534843 acagggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctattttctactttt-gtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggtt 18534749  T
Q  468 gcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  18534748 gcttgattattacttgctcc 18534729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagactttt-atcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||     
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattct 276  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52942776 - 52942537
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacatt--acatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 149  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52942776 ctataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 52942678  T
Q  150 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtg 249  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| ||    
T  52942677 ttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac------------gggtt-tg 52942591  T
Q  250 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52942590 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 196 - 449
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547557
Alignment:
Q  196 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  296 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttc 393  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| ||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttc 13547501  T
Q  394 tttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  13547502 tctcttcctttctctctcgatcttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 13547557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47211035 - 47210762
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |        
T  47211035 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg---- 47210940  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210939 --------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47210848  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 371  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47210847 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 266
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  || |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaac-aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  246 tgtggatagaattaggcggga 266  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 252 - 485
Target Start/End: Original strand, 4215510 - 4215742
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  4215510 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagact 4215609  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 451  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  | |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||| || | |    
T  4215610 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctttcttt-tctctcgcagttttctacttttggcttgtgattataattgtttcat 4215708  T
Q  452 atactatgttttggttgcttggttattccttgct 485  Q
    | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4215709 acactttgtttttgttgcttgattattccttgct 4215742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8756587 - 8756221
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||   |||||| |||  |||| |||||    
T  8756587 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgt 8756489  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc-ttggttacgtgaagagatta 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  8756488 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattg 8756392  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttc 340  Q
     |  | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||  || | ||    
T  8756391 agactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctc 8756292  T
Q  341 tcccccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctttcttcctttctctc 409  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| |||| |||||||||    
T  8756291 tcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctc 8756221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Original strand, 53405123 - 53405472
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag---ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||| |||    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53405123 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 53405222  T
Q  141 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  53405223 gtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  241 agggttgtggatagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgact 334  Q
      |  | | | |||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||| |||  |   ||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagct 53405421  T
Q  335 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  53405422 g--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 53405472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 38890472 - 38890169
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  38890472 ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgg 38890376  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 330  Q
    |||||||||  |  | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |     
T  38890375 gaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagag 38890276  T
Q  331 gactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    | ||| | ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  38890275 ggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctaattttg 38890177  T
Q  429 gcttgtgt 436  Q
     |||||||    
T  38890176 ccttgtgt 38890169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15032898 - 15032554
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |   | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||     
T  15032898 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaag 15032799  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
      |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||          ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  15032798 t-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagt 15032712  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||  | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  15032711 ctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15032612  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactagg 374  Q
     |||| ||||||   ||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15032611 cagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagg 15032554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 436
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136939
Alignment:
Q  136 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 235  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  236 agattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact 334  Q
    | |||  |  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||| ||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  335 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggctt 432  Q
    | | ||||| | | ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctcttgttgttttctacttttggttt 30136935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 296 - 487
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563200
Alignment:
Q  296 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  394 tttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47563109 tctcttcctttctctc--gctgttttctacttttggcttatgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 47563200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5635605 - 5635363
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  5635605 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 5635506  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcct----ttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5635505 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 5635409  T
Q  442 attattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  5635408 attgttccatacactttgttttggttgattgattatcccttgctcc 5635363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 428
Target Start/End: Original strand, 28453782 - 28454067
Alignment:
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  28453782 agagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
       ||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||  | |||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  344 cccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttc--tctctggctgttttctacttttg 428  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||  |||| || |||||||||||||||    
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctttctccggttgttttctacttttg 28454067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Original strand, 5100993 - 5101133
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  5100993 tacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 5101092  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 184  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101093 tagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 384
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| |   | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  282 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaac 379  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  380 aaatt 384  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 252 - 387
Target Start/End: Original strand, 11437567 - 11437701
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| |||||    
T  11437567 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagact 11437665  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11437666 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11437701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 339 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14789470 - 14789320
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctt-tcttc-ctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14789470 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgt 14789371  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14789370 ttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 14789320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 387
Target Start/End: Original strand, 5101133 - 5101267
Alignment:
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| | | ||| | ||| |||||||||    
T  5101133 tagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccagact 5101231  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5101232 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 5101267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891427
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattaca-tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  145 agagtttgtctctt 158  Q
    ||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47151131 - 47150863
Alignment:
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  47151131 tatagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattg 47151035  T
Q  242 gggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
     |  | ||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||  ||   |||| |    
T  47151034 agaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttat 47150935  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgcgttctttcttcctttctctc 409  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  47150934 ctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctctttctttctctc 47150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 487
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133278
Alignment:
Q  316 tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggc 413  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| |     
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgt 6133204  T
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| || | || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6133205 tgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttgtttcggttgcttgattattccttgctcc 6133278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113080
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||  |||| ||||||| | |||||  ||| ||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  151 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gtgaagagattagggttgtg 249  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||  | ||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  250 gatagaattag 260  Q
    | |||||||||    
T  10113070 ggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 449
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25358042
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggata----gaattaggcggga-gacttattcttg 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  | ||||||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  279 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtc 376  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||  ||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  377 aacaaattct--tgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 449  Q
    |||||||| |  || ||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctctt-ctttctctc--gttgttttctactttt-gcttgtgtttataattgttcc 25358042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40999286 - 40999017
Alignment:
Q  42 gttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacg-caacaacaaatctagggtt 139  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||  |||| ||||||  || |||||| ||| |||||| |    
T  40999286 gttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttaga--cgtcaacaagaaaactaggggt 40999190  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40999189 tgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 40999093  T
Q  240 tagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatc 314  Q
       |  | ||| ||||||||||   |||||||   | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40999092 cgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446554
Alignment:
Q  268 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccg 367  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||             ||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 24446668  T
Q  368 aactaggtcaacaaattctt--gcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttgg 465  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| | ||||||    
T  24446667 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctct---tgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttattttgg 24446571  T
Q  466 ttgcttggttattcctt 482  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  24446570 ttgcttgattatccctt 24446554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982175
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  |     
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  248 tggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 345  Q
    ||| |||||||| |   || |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||     
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccct 3982212  T
Q  346 cagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||    
T  3982211 catactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaa 3982175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Original strand, 9863795 - 9864092
Alignment:
Q  132 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 231  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||     
T  9863795 ctagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgg 9863889  T
Q  232 gaagagattagggttgtggatagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca----tatagtgaaac 326  Q
    |||||||||  |  | ||| ||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||    ||||||| |||    
T  9863890 gaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaac 9863988  T
Q  327 gaatgactgttttct--cccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttcta 422  Q
    | |   ||| | |||  ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  | |||||||||    
T  9863989 ggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gttgttttcta 9864086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatccctt 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   | ||| ||||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  298 ttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||  | | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16185918 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Original strand, 10114435 - 10114519
Alignment:
Q  154 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  10114435 ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagatt 10114519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 472
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088982
Alignment:
Q  270 ttattcttgtaacccattgatatcc-cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc-agactaggtcaatttggaccg 367  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  |||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  368 aactaggtcaacaaattcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggtt 467  Q
    |||| |||||||||||||||           | | |||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattctt-----------tgcgttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggtt 49088977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983593
Alignment:
Q  183 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||  |  | ||| ||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  282 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 316  Q
    ||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcat 31983593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942416
Alignment:
Q  342 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttc-ctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgt 52942429  T
Q  437 atttaattattcc 449  Q
     | ||||| ||||    
T  52942428 ttataattgttcc 52942416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3937317 - 3937227
Alignment:
Q  338 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttg 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  3937317 ttctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctttctttctctc--gttgttttctacttttg 3937227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9176429 - 9176360
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9176429 ttttctacttttggcttgt--atttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 9176360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Original strand, 16455258 - 16455356
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 117  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| | |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16455258 agatttgttacaatttaatggtagttacttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9174101 - 9174032
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9174101 ttttctacttttggcttgt--atttaattatttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 9174032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 36380345 - 36380417
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagata 91  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  36380345 agatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 240
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022495
Alignment:
Q  121 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 219  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |     
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  220 tcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  9022475 tcttggtcacgggaagagatt 9022495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Original strand, 5198781 - 5198850
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  5198781 ttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctcc 5198850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 8631374 - 8631305
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8631374 ttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttagttgcttgattatcccttgctcc 8631305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 477
Target Start/End: Original strand, 9148610 - 9148671
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  9148610 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 9148671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11006209 - 11006140
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11006209 ttttctactttttgcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 11006140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11008523 - 11008454
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11008523 ttttctactttttgcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 11008454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 31849554 - 31849485
Alignment:
Q  416 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  31849554 ttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 31849485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5143305 - 5143263
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5143305 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 5269242 - 5269284
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5269242 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050401
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7050401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853587
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 11853587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12739592 - 12739550
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12739592 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16186199 - 16186079
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggct-gaaataaaggtttagaa 117  Q
    |||||| || |||||||| | | | ||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||    
T  16186199 agatttgttccaattttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaa 16186100  T
Q  118 acgcaacaacaaatctagggttt 140  Q
    ||  ||||||||| |||||||||    
T  16186099 ac-aaacaacaaa-ctagggttt 16186079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 24348576 - 24348647
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24348576 tgttttctatttttggcttgt--atttagttgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 24348647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26175678 - 26175636
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26175678 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36463431 - 36463389
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36463431 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 38409579 - 38409650
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || | | |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38409579 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacaatttgttttagttgcttgattatcccttgctcc 38409650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 47210754 - 47210699
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgctt 471  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  47210754 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgctt 47210699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 48893680 - 48893638
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48893680 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822303
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 472
Target Start/End: Original strand, 5101273 - 5101342
Alignment:
Q  403 ttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttg 472  Q
    |||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  5101273 ttctctctcggtgttttctccctttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttg 5101342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336923
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 5336923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906779
Alignment:
Q  184 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagatt 54906779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 8529406 - 8529466
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  8529406 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 8529466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 409
Target Start/End: Original strand, 10114608 - 10114680
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctc 409  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||    
T  10114608 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttcatgtgttctctctttctttctctc 10114680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 238
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489388
Alignment:
Q  202 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 16489388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 18587105 - 18587165
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctttct 398  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  18587105 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctttct 18587165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 238
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699788
Alignment:
Q  202 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 25699788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 487
Target Start/End: Original strand, 51960 - 52409
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  51960 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 52059  T
Q  142 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 241  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  52060 tatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  242 gggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactg--tttt 339  Q
     |  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   | |    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 52259  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctt-tcttc-ctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  52260 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtt 52359  T
Q  438 tttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52360 tataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 52409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 183977 - 183635
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  183977 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 183879  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  183878 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgg 183780  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||    
T  183779 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 183680  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  183679 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 183635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 339 - 487
Target Start/End: Original strand, 50260 - 50410
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctt-tcttc-ctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  50260 tctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgt 50359  T
Q  437 atttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
     | ||||| || | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  50360 ttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 50410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 44 - 448
Target Start/End: Original strand, 3948 - 4351
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3948 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4047  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||    
T  4048 ta-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctggg 4146  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||| |    
T  4147 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-c 4245  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctt-tcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtattt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4246 cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttgatttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttat 4343  T
Q  441 aattattc 448  Q
    ||||||||    
T  4344 aattattc 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 487
Target Start/End: Original strand, 79144 - 79584
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79144 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 79243  T
Q  152 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtgga 251  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  | |||     
T  79244 gtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttggg 79343  T
Q  252 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||    
T  79344 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagact 79443  T
Q  352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 446  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  79444 aggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt-ctttttctcttgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgt 79542  T
Q  447 tccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||| || ||| || |||||||||| |  |||| |||||||||    
T  79543 tccatacactttgattttggttgcctaattatcccttgctcc 79584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80258
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  146 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  80012 ctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 80110  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtgtatt 439  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||| | ||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |     
T  80111 ccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctcttccttt-tctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgttta 80209  T
Q  440 taattattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||| |||| || ||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  80210 taatttttccatacactttgattttcgttgcctgattattacttgctcc 80258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188386
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41821 - 41477
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41821 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 41722  T
Q  143 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 242  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  41721 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 41622  T
Q  243 ggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctc 342  Q
    |  | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||    
T  41621 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 41522  T
Q  343 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41521 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 41477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 41441 - 41370
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  41441 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctcc 41370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 44 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 69632 - 69286
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 139  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  69632 tacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 69533  T
Q  140 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  69532 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggt 69433  T
Q  240 tagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgtttt 339  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || |   ||| | |    
T  69432 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 69334  T
Q  340 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  69333 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 69286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 73318 - 73207
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  73318 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 73219  T
Q  186 gattcaccttgg 197  Q
    ||||||||||||    
T  73218 gattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  165 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11415
Alignment:
Q  44 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  11810 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 11711  T
Q  144 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11710 tagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |  | |   ||| | |||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcc 11511  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggc---tgttttctacttttggcttgtg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  11510 cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtg 11415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6490
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtat 6250  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagg 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6251 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  244 gttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 343  Q
      | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||    
T  6351 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcc 6449  T
Q  344 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  6450 cccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatt 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 382
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3168
Alignment:
Q  45 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 144  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2931  T
Q  145 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||     
T  2932 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttgga 3031  T
Q  245 ttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||    
T  3032 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccc 3130  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 382  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3131 cgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 34 - 332
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  285 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  234 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 487
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85626
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||  ||||||||||||||||| | ||  |||| || | |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |      
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 344  Q
    | ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 85482  T
Q  345 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 442  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  85483 ccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttgacttgtgtttataa 85580  T
Q  443 ttattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    || |||| || ||| || ||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  85581 ttgttccatacactttgattttggttgtttgattatctcttgctcc 85626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 385
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29462
Alignment:
Q  86 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  186 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  286 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29364 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 29462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 487
Target Start/End: Original strand, 29500 - 29571
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  29500 tgttttctacttttggct--tttatttaattgttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctcc 29571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 15817
Alignment:
Q  19 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 118  Q
    |||||| || ||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  16180 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaag 16081  T
Q  119 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 218  Q
      |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16080 t-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 15985  T
Q  219 ctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 317  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  15984 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15885  T
Q  318 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
     |||| |||| | ||||| | ||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  15884 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 162 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1447
Alignment:
Q  162 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattagg 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | ||| ||||||||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  262 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaattt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 1473  T
Q  362 ggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  1472 ggaccgaactgggtcaacaaattctt 1447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 2036 - 2272
Alignment:
Q  87 agatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 186  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  2036 agatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttg 2134  T
Q  187 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2135 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccat 2234  T
Q  287 tgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaa 324  Q
    | || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2235 taatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaa 2272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1586
Alignment:
Q  55 taaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 153  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  154 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggata 253  Q
           |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  | ||| ||    
T  1861 -------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  254 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  353 ggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctttcttcctttctctctggctgttttctacttttggcttgtgt 436  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||| |||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcattgttttctacttttggcttgtgt 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16975 - 16646
Alignment:
Q  53 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 152  Q
    |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16975 tataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggtttgaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg 16877  T
Q  153 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggat 252  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |  | ||| |    
T  16876 -ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggt 16780  T
Q  253 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 351  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || || |  |  | ||||||||||||     
T  16779 agaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagacc 16680  T
Q  352 aggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 384  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16679 aggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 273
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  46 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||  | |||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  146 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 245  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||      
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  246 tgtggatagaattaggcgggagacttat 273  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 487
Target Start/End: Original strand, 35848 - 35992
Alignment:
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctttcttcctttctctc-tggctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||   | ||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  35848 agactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttcgagttttggcttgtgtttataat 35947  T
Q  444 tattccttatactatg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 487  Q
    | || | || ||| || |||||||||||||  ||| |||||||||    
T  35948 tgtttcatacactttgtttttggttgcttgactatcccttgctcc 35992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5089
Alignment:
Q  52 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaa-caacaaatctagggtttgtatagagt 149  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | || ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa--gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgt 4869  T
Q  150 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttgt 248  Q
    || |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | | || |    
T  4870 tt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagctttt 4966  T
Q  249 ggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 346  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||| |||  |  |||| | ||| ||||    
T  4967 gg-tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgcccc 5065  T
Q  347 agactaggtcaat-ttggaccgaa 369  Q
    ||||||||||| | ||||||||||    
T  5066 agactaggtcagtattggaccgaa 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22407
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22320 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24682
Alignment:
Q  198 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttgtggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  297 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  24595 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 993
Alignment:
Q  43 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1169 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 1070  T
Q  143 atagagtttgtctc-----ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 214  Q
    ||||||||||||||     || | ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1069 atagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4721 - 4675
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4721 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1445
Alignment:
Q  347 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1409 - 1348
Alignment:
Q  414 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactatgttttggttgcttggttat 477  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1409 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20457 - 20415
Alignment:
Q  339 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20457 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224857
Alignment:
Q  199 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University