View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6876A_low_199 (Length: 256)

Name: NF6876A_low_199
Description: NF6876A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6876A_low_199
NF6876A_low_199
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (17-256)||(2576-2815)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (17-256)||(20340253-20340492)
chr1 (19-256)||(16207951-16208188)
chr1 (17-256)||(28151960-28152199)
chr1 (19-256)||(20461179-20461416)
chr1 (17-254)||(51638318-51638555)
chr1 (17-254)||(10962770-10963007)
chr1 (17-256)||(41793226-41793465)
chr1 (17-254)||(28585081-28585318)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (19-256)||(22888578-22888815)
chr5 (19-256)||(25199137-25199374)
chr5 (17-256)||(29888897-29889136)
chr5 (17-256)||(23892314-23892553)
chr5 (22-256)||(33877355-33877589)
chr5 (27-256)||(11325902-11326131)
chr5 (27-256)||(13184473-13184702)
chr5 (27-256)||(13440319-13440548)
chr5 (17-254)||(9548358-9548595)
chr5 (17-254)||(24687972-24688209)
chr5 (17-254)||(23752265-23752502)
chr5 (17-254)||(22998929-22999166)
chr5 (17-254)||(30934743-30934980)
chr5 (17-254)||(33777597-33777834)
chr5 (17-254)||(11549464-11549701)
chr5 (17-254)||(15658575-15658812)
chr5 (17-254)||(23717803-23718040)
chr5 (17-254)||(24970128-24970365)
chr5 (17-254)||(28649345-28649582)
chr5 (17-254)||(37671298-37671535)
chr5 (17-254)||(31431550-31431787)
chr5 (17-254)||(31826222-31826459)
chr5 (16-254)||(32599286-32599524)
chr5 (17-254)||(9317561-9317798)
chr5 (17-254)||(12132265-12132502)
chr5 (25-254)||(18500553-18500782)
chr5 (17-254)||(30152128-30152365)
chr5 (17-254)||(33516466-33516703)
chr5 (17-254)||(37358458-37358695)
chr5 (17-254)||(37770802-37771039)
chr5 (17-254)||(43078362-43078599)
chr5 (17-254)||(18375227-18375464)
chr5 (17-256)||(8665290-8665529)
chr5 (17-256)||(13324644-13324883)
chr5 (17-256)||(15758672-15758911)
chr5 (17-254)||(3789651-3789888)
chr5 (17-254)||(26480502-26480739)
chr5 (17-254)||(29966881-29967118)
chr5 (17-254)||(30029525-30029762)
chr5 (17-254)||(30168579-30168816)
chr5 (17-254)||(37755090-37755327)
chr5 (17-256)||(2511159-2511398)
chr5 (17-256)||(6874413-6874652)
chr5 (17-256)||(24681548-24681787)
chr5 (17-256)||(24724075-24724314)
chr5 (17-256)||(40473364-40473603)
chr5 (17-254)||(34616628-34616865)
chr5 (17-254)||(5638020-5638257)
chr5 (16-254)||(28959600-28959838)
chr5 (48-254)||(41674819-41675025)
chr5 (48-256)||(33292633-33292841)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (19-256)||(16041423-16041660)
chr7 (25-256)||(16449810-16450041)
chr7 (17-256)||(26484794-26485033)
chr7 (25-256)||(2108817-2109048)
chr7 (17-256)||(2775459-2775698)
chr7 (17-255)||(39210827-39211065)
chr7 (17-221)||(4200682-4200886)
chr7 (27-256)||(31088278-31088507)
chr7 (27-256)||(45733560-45733789)
chr7 (15-254)||(5128094-5128333)
chr7 (17-254)||(2154675-2154912)
chr7 (17-254)||(10916672-10916909)
chr7 (17-254)||(11424580-11424817)
chr7 (18-254)||(16503185-16503421)
chr7 (17-221)||(26682804-26683008)
chr7 (18-254)||(16518221-16518457)
chr7 (17-254)||(3445408-3445645)
chr7 (17-254)||(26274898-26275135)
chr7 (17-254)||(26435359-26435596)
chr7 (17-254)||(5147144-5147381)
chr7 (17-254)||(31564194-31564431)
chr7 (17-254)||(4144927-4145164)
chr7 (17-254)||(11441674-11441911)
chr7 (17-254)||(24592345-24592582)
chr7 (17-254)||(26537674-26537911)
chr7 (17-254)||(26319673-26319910)
chr7 (17-254)||(9618753-9618990)
chr7 (17-254)||(26669718-26669955)
chr7 (17-254)||(45387445-45387682)
chr7 (17-254)||(16736264-16736501)
chr7 (17-254)||(16751318-16751555)
chr7 (17-254)||(17523634-17523871)
chr7 (17-254)||(17529344-17529581)
chr7 (17-254)||(31125022-31125259)
chr7 (48-256)||(18540899-18541107)
chr7 (48-256)||(5159619-5159827)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (19-256)||(21703073-21703310)
chr2 (22-256)||(19456333-19456567)
chr2 (22-256)||(27393064-27393298)
chr2 (26-256)||(27118783-27119013)
chr2 (17-256)||(34303210-34303449)
chr2 (27-256)||(3784749-3784978)
chr2 (27-256)||(16163694-16163923)
chr2 (27-256)||(34157106-34157334)
chr2 (17-254)||(40233608-40233845)
chr2 (17-254)||(27434351-27434588)
chr2 (17-254)||(23128473-23128710)
chr2 (17-254)||(28882311-28882548)
chr2 (17-254)||(12655639-12655876)
chr2 (17-254)||(20838015-20838252)
chr2 (17-256)||(9349889-9350128)
chr2 (17-254)||(22925935-22926172)
chr2 (27-256)||(31891245-31891474)
chr2 (17-254)||(37375258-37375495)
chr2 (17-256)||(12586905-12587144)
chr2 (17-254)||(16829245-16829482)
chr2 (17-254)||(16891999-16892236)
chr2 (17-256)||(13936451-13936690)
chr2 (17-256)||(39051729-39051968)
chr2 (17-254)||(260660-260897)
chr2 (20-256)||(27803802-27804038)
chr2 (17-256)||(21677089-21677328)
chr2 (17-256)||(27777317-27777556)
chr2 (17-256)||(27817075-27817314)
chr2 (52-254)||(34286451-34286653)
chr2 (52-254)||(34291511-34291713)
chr2 (17-254)||(11635093-11635330)
chr2 (17-254)||(11641282-11641519)
chr2 (17-254)||(31876378-31876615)
chr2 (17-254)||(32049895-32050132)
chr2 (17-254)||(34861777-34862014)
chr2 (17-254)||(37685816-37686053)
chr2 (17-254)||(37701081-37701318)
chr2 (17-256)||(12716509-12716748)
chr2 (17-254)||(37925590-37925827)
chr2 (17-254)||(39890171-39890408)
chr2 (17-254)||(19416406-19416643)
chr2 (102-254)||(34279546-34279698)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (17-256)||(22456795-22457034)
chr6 (17-256)||(14143146-14143385)
chr6 (17-256)||(26788040-26788279)
chr6 (17-256)||(27196413-27196652)
chr6 (17-256)||(27252588-27252827)
chr6 (17-256)||(27290231-27290470)
chr6 (22-256)||(13521939-13522173)
chr6 (27-256)||(33374127-33374356)
chr6 (27-256)||(8892182-8892410)
chr6 (27-256)||(8903417-8903645)
chr6 (17-254)||(22934741-22934978)
chr6 (17-254)||(23857186-23857423)
chr6 (27-256)||(28162753-28162982)
chr6 (20-254)||(16749952-16750186)
chr6 (17-254)||(13298812-13299049)
chr6 (17-254)||(24304479-24304716)
chr6 (17-254)||(24863815-24864052)
chr6 (17-254)||(26918478-26918715)
chr6 (17-254)||(26989099-26989336)
chr6 (17-254)||(29549573-29549810)
chr6 (123-256)||(22477240-22477373)
chr6 (17-254)||(27272441-27272678)
chr6 (22-256)||(20160797-20161031)
chr6 (22-256)||(22171800-22172034)
chr6 (31-254)||(27000171-27000394)
chr6 (16-254)||(27359852-27360090)
chr6 (16-254)||(27450195-27450433)
chr6 (17-254)||(4757862-4758099)
chr6 (17-254)||(4773104-4773341)
chr6 (17-254)||(15424178-15424415)
chr6 (17-254)||(16674237-16674474)
chr6 (17-254)||(27007825-27008062)
chr6 (17-254)||(4545636-4545873)
chr6 (17-254)||(28207552-28207789)
chr6 (17-254)||(29573111-29573348)
chr6 (17-254)||(30557877-30558114)
chr6 (17-254)||(34463207-34463444)
chr6 (17-254)||(3696179-3696416)
chr6 (17-254)||(4525384-4525621)
chr6 (17-254)||(4723995-4724232)
chr6 (17-254)||(26116271-26116508)
chr6 (17-254)||(29501513-29501750)
chr6 (17-256)||(17025373-17025612)
chr6 (16-254)||(26777475-26777713)
chr6 (17-254)||(16943888-16944125)
chr6 (17-254)||(27044485-27044723)
chr6 (17-254)||(27485227-27485464)
chr6 (17-146)||(17092301-17092430)
chr6 (17-133)||(27629561-27629677)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (19-256)||(1838-2074)
scaffold0415 (25-254)||(6113-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (19-256)||(20487-20723)
scaffold0124 (17-254)||(30553-30790)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (17-256)||(32292812-32293051)
chr3 (17-256)||(31034076-31034315)
chr3 (22-256)||(16626470-16626704)
chr3 (19-256)||(18530448-18530685)
chr3 (26-253)||(5652450-5652677)
chr3 (27-256)||(4626004-4626233)
chr3 (27-256)||(17993753-17993982)
chr3 (27-254)||(5713289-5713516)
chr3 (27-254)||(5724199-5724426)
chr3 (27-254)||(5757051-5757278)
chr3 (27-254)||(5767942-5768169)
chr3 (17-254)||(18051324-18051561)
chr3 (17-254)||(18330731-18330968)
chr3 (17-254)||(22387537-22387774)
chr3 (17-254)||(8301226-8301463)
chr3 (17-254)||(15741053-15741290)
chr3 (17-254)||(15892665-15892902)
chr3 (17-254)||(29148714-29148951)
chr3 (17-251)||(7073277-7073511)
chr3 (17-252)||(8296036-8296271)
chr3 (17-254)||(4416981-4417218)
chr3 (17-254)||(4796612-4796849)
chr3 (17-254)||(6192378-6192615)
chr3 (17-256)||(11110308-11110547)
chr3 (17-254)||(8211800-8212037)
chr3 (17-254)||(10396195-10396432)
chr3 (17-254)||(28115913-28116150)
chr3 (17-254)||(48465989-48466226)
chr3 (17-254)||(4346646-4346883)
chr3 (17-254)||(4721693-4721930)
chr3 (17-254)||(35880828-35881065)
chr3 (17-256)||(29664929-29665168)
chr3 (17-254)||(5467047-5467284)
chr3 (17-254)||(18277011-18277248)
chr3 (17-254)||(18292312-18292549)
chr3 (17-254)||(18307613-18307850)
chr3 (17-254)||(21674755-21674992)
chr3 (17-254)||(22870815-22871052)
chr3 (17-254)||(22885874-22886111)
chr3 (17-254)||(28021337-28021574)
chr3 (17-254)||(36997036-36997273)
chr3 (17-254)||(51782085-51782322)
chr3 (17-256)||(20576806-20577045)
chr3 (17-254)||(5596316-5596553)
chr3 (17-254)||(6542421-6542658)
chr3 (17-254)||(18242801-18243038)
chr3 (17-254)||(31964432-31964669)
chr3 (17-254)||(50134030-50134267)
chr3 (17-254)||(51797174-51797412)
chr3 (17-254)||(5609281-5609518)
chr3 (17-254)||(17984915-17985152)
chr3 (17-254)||(28339364-28339601)
chr3 (17-254)||(5013774-5014011)
chr3 (17-254)||(47023515-47023752)
chr3 (17-254)||(18225253-18225490)
chr3 (17-254)||(24328221-24328458)
chr3 (17-254)||(7996624-7996861)
chr3 (17-254)||(10643132-10643369)
chr3 (48-256)||(32439214-32439422)
chr3 (48-239)||(20066120-20066311)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (19-256)||(1900371-1900608)
chr4 (19-256)||(15227984-15228221)
chr4 (22-256)||(15284851-15285085)
chr4 (52-256)||(15391291-15391495)
chr4 (22-256)||(14235448-14235682)
chr4 (27-256)||(24460533-24460762)
chr4 (17-254)||(17014116-17014353)
chr4 (17-254)||(24592232-24592469)
chr4 (17-254)||(14665134-14665371)
chr4 (17-254)||(36344433-36344670)
chr4 (17-254)||(6569969-6570206)
chr4 (17-254)||(14763222-14763459)
chr4 (17-254)||(18800531-18800768)
chr4 (17-254)||(5005989-5006226)
chr4 (17-254)||(31126436-31126673)
chr4 (17-254)||(40105556-40105793)
chr4 (17-254)||(14098657-14098894)
chr4 (17-256)||(33673716-33673955)
chr4 (17-254)||(27163235-27163472)
chr4 (17-254)||(30753870-30754107)
chr4 (17-254)||(54833503-54833740)
chr4 (17-256)||(21969815-21970054)
chr4 (17-256)||(39850752-39850991)
chr4 (48-256)||(34188909-34189117)
chr4 (48-256)||(24112776-24112984)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (52-256)||(22080790-22080994)
chr8 (27-256)||(44563200-44563427)
chr8 (26-256)||(19658926-19659155)
chr8 (17-254)||(16283550-16283787)
chr8 (17-253)||(18710688-18710924)
chr8 (26-256)||(33244764-33244994)
chr8 (17-254)||(27608782-27609019)
chr8 (17-254)||(16277655-16277892)
chr8 (17-254)||(19688199-19688436)
chr8 (17-251)||(14557728-14557962)
chr8 (17-254)||(12092601-12092838)
chr8 (17-254)||(29829423-29829660)
chr8 (17-256)||(9354721-9354961)
chr8 (17-254)||(2137136-2137373)
chr8 (17-254)||(3329384-3329621)
chr8 (17-254)||(19674542-19674779)
chr8 (17-254)||(31489627-31489864)
chr8 (17-256)||(31354623-31354862)
chr8 (17-254)||(19208237-19208474)
chr8 (17-254)||(19286563-19286800)
chr8 (17-254)||(28361832-28362069)
chr8 (17-254)||(33258824-33259061)
chr8 (17-193)||(189256-189432)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (72-256)||(1-185)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (52-256)||(21660-21864)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (17-254)||(46903-47140)
scaffold0089 (17-254)||(39987-40224)
scaffold0089 (17-254)||(29864-30101)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (17-209)||(536-728)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-254)||(47-284)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (18-254)||(27393-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (17-254)||(9667-9904)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (17-254)||(8050-8287)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (17-254)||(7157-7394)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (17-254)||(14848-15085)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (17-254)||(8984-9221)
scaffold0159 (17-254)||(20116-20353)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (17-254)||(26119-26357)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (61-254)||(46764-46964)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (17-133)||(311-427)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2815
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggag 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340492
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggag 20340492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208188
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 16208188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151960
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggag 28151960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461179
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||| |    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    | |  ||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 20461179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638318
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgg 51638318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962770
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 10962770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793465
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  | |||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 41793465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28585081
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||||||||| || || || |||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 28585081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888578
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888615 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 22888578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199137
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 25199137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889136
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 29889136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892314
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 23892314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877355
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 33877355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325902
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  11325931 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 11325902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184702
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  13184673 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 13184702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440548
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  13440519 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 13440548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548595
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 9548595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688209
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 24688209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752502
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 23752502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999166
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 22999166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934743
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 30934743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777597
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 33777597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549464
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11549464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658812
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 15658812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718040
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 23718040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970128
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 24970128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649345
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 28649345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671535
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37671535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431550
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31431550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826459
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31826459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599524
Alignment:
Q  16 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  116 aagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 32599524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317561
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 9317561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132265
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 12132265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500782
Alignment:
Q  25 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagct 124  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  125 ttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 224  Q
    |||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  225 acggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 18500782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152128
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 30152128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516466
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 33516466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358695
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37358695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771039
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078362
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | || |||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 43078362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375464
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 18375464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665529
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 8665529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324883
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 13324883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15758911
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 15758911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789651
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 3789651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480502
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26480502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967118
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29967118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029525
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 30029525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168579
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 30168579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755090
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37755090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511159
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 2511159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874413
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  || ||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 6874413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681548
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 24681548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24724075
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 24724075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473603
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 40473603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616628
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 34616628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5638020
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5638020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959838
Alignment:
Q  16 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  116 aagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 28959838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674819
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  248 caggtgg 254  Q
    |||||||    
T  41674825 caggtgg 41674819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292633
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  248 caggtggag 256  Q
    | |||||||    
T  33292641 ccggtggag 33292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041423
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 16041423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450041
Alignment:
Q  25 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  125 ttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 224  Q
    |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  225 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggag 16450041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484794
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 26484794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109048
Alignment:
Q  25 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagct 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  125 ttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  225 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 2109048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775459
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 2775459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211065
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgga 255  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgga 39211065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  217 aggtc 221  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088507
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  31088478 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 31088507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733560
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  45733589 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 45733560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5128094
Alignment:
Q  15 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctca 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  115 aaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacact 214  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  215 tgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgg 5128094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154675
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 2154675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10916909
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 10916909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424817
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11424817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503421
Alignment:
Q  18 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  118 gttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttga 217  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  218 ggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    | || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16503421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
     || |  ||||||||||  ||||| || || | |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  217 aggtc 221  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518457
Alignment:
Q  18 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  118 gttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttga 217  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  218 ggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    | || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16518457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445408
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 3445408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275135
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26275135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435359
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26435359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147381
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5147381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564431
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31564431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145164
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4145164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441674
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11441674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592582
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 24592582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26537911
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26537911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26319910
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26319910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618753
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 9618753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26669955
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgg 26669955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387445
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 45387445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736501
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgg 16736501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751555
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgg 16751555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523634
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgg 17523634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529581
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgg 17529581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125022
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31125022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540899
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  248 caggtggag 256  Q
    | |||||||    
T  18540907 ccggtggag 18540899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159619
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || |  |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  248 caggtggag 256  Q
    | |||||||    
T  5159627 ccggtggag 5159619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703310
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 21703310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456567
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
      ||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 19456567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27393064
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
     |||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggag 27393064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118783
Alignment:
Q  26 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  126 tccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 225  Q
    ||||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  226 cggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggag 27118783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303449
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
     || |  ||||||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggag 34303449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784749
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  3784778 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 3784749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163694
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16163723 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 16163694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34157106
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  34157135 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 34157106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233608
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgg 40233608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434588
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgg 27434588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128710
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 23128710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882311
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 28882311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655639
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 12655639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20838015
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgg 20838015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350128
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 9350088  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  9350089 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 9350128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926172
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 22926172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891474
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| ||| || |  |||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacc 31891444  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31891445 tgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 31891474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375258
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | || |||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37375258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586905
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 12586905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829482
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16829482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891999
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16891999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936690
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 13936690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39051968
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 39051968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260897
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgg 260897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803802
Alignment:
Q  20 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  120 tagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 219  Q
     |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  220 tcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 27803802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677328
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 21677328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777317
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 27777317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27817075
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 27817075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286451
Alignment:
Q  52 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataa 151  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  152 tgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  252 tgg 254  Q
    |||    
T  34286453 tgg 34286451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291511
Alignment:
Q  52 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataa 151  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  152 tgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  252 tgg 254  Q
    |||    
T  34291513 tgg 34291511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635330
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11635330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641519
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11641519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876378
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31876378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049895
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgg 32049895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861777
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 34861777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686053
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37686053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701318
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 37701318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716748
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 12716748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925590
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgg 37925590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890171
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||| ||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 39890171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416643
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||  || || |||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 19416643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279546
Alignment:
Q  102 gacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttga 201  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || |||||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  202 tggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 34279546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457034
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 22457034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143385
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 14143385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26788040
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 26788040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196413
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 27196413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252827
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 27252827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290470
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggag 27290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522173
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 13522173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374356
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  33374327 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 33374356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892410
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  8892381 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 8892410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903645
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  8903616 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 8903645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22934978
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 22934978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857423
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 23857423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162753
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  28162782 ggaacttgggaggcgatggatcaagtggag 28162753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749952
Alignment:
Q  20 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  120 tagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 219  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  220 tcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16749952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299049
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 13299049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304716
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 24304716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863815
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 24863815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918478
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26918478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989099
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26989099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549573
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29549573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477373
Alignment:
Q  123 ctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtca 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtta 22477339  T
Q  223 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477340 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 22477373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272678
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
     || ||||| ||||| |  |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgg 27272678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160797
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
    |||| | |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggag 20160797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172034
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
    |||| | |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggag 22172034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000171
Alignment:
Q  31 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttcctt 130  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  131 ggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 230  Q
    | | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || | |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  231 cctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgg 27000171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360090
Alignment:
Q  16 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaa 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  116 aagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27360090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450433
Alignment:
Q  16 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaa 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  116 aagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27450433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757862
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4757862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773104
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4773104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424415
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 15424415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674237
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16674237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007825
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27007825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545873
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4545873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207552
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 28207552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573111
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29573111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558114
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 30558114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463444
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 34463444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696179
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 3696179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525384
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
     | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4525384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724232
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4724232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116508
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26116508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501513
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29501513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025373
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 17025373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777713
Alignment:
Q  16 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaa 115  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  116 aagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 26777713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944125
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 16944125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044485
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgt-agcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| | | || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgg 27044485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485227
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27485227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092430
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttctt 146  Q
    ||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagcttctt 17092430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 27629561 - 27629677
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||   | ||||||||||    
T  27629561 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 27629660  T
Q  117 agttagctttccttggt 133  Q
    ||| |||||||||||||    
T  27629661 agtcagctttccttggt 27629677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2074
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    |||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 2074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6113
Alignment:
Q  25 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagct 124  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  125 ttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttc-aaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtca 222  Q
    |||| || | ||||||||||||||  || |||||| ||||| || || || || |||||||| || |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  223 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 6113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20487
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    |||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 20487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30553
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 30553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292812
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggag 32292812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034315
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggag 31034315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626704
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
      ||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 16626704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530448
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    | |  ||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 18530448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652450
Alignment:
Q  26 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctt 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  ||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  126 tccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 225  Q
    ||||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  226 cggaacctgggaggcaacggatcaggtg 253  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtg 5652450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4626004
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  4626033 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 4626004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17993982
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  17993953 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 17993982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713289
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5713317  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5713316 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5713289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724199
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5724227  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5724226 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5724199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757278
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5757250  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5757251 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5757278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768169
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5768141  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5768142 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5768169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051324
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgg 18051324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330731
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 18330731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387774
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 22387774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301463
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 8301463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741290
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgg 15741290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892902
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgg 15892902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148951
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29148951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073277
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    || ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 7073277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8296036
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggt 252  Q
    || || || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggt 8296036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416981
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4416981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796849
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4796849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192378
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgg 6192378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110547
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggag 11110547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211800
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 8211800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396195
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
     || ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 10396195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116150
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
     || ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgg 28116150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465989
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 48465989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346883
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 4346883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721693
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| || ||||  || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgg 4721693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880828
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgg 35880828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665168
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 29665168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5467047
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| || || ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277248
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgg 18277248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292549
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgg 18292549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307850
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgg 18307850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674755
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 21674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871052
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 22871052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886111
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 22886111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021337
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||  || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtgg 28021337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997273
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 36997273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782085
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 51782085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577045
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 20577045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596553
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5596553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542658
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 6542658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242801
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 18242801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964669
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31964669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134267
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 50134267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797174
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  217 aggtcagaacggaacc-tgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtgg 51797174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609518
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || ||||| || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5609518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985152
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 17985152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339364
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 28339364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013774
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5013774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023515
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 47023515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225253
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 18225253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328221
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || || |||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 24328221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996624
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || || |||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 7996624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10643132
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || || |||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 10643132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439214
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  248 caggtggag 256  Q
    | |||||||    
T  32439222 ccggtggag 32439214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066120
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggagg 239  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 20066120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900371
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1900408 gtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggag 1900371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227984
Alignment:
Q  19 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  119 ttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 218  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  219 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggag 15227984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285085
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
      ||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 15285085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391495
Alignment:
Q  52 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| | ||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  152 tgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  252 tggag 256  Q
    |||||    
T  15391491 tggag 15391495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235682
Alignment:
Q  22 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 121  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  122 gctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 221  Q
     |||||| ||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  222 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
      || |||||||||||||||| || | ||||||||    
T  14235648 gaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggag 14235682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460762
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |  |||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  24460733 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 24460762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014116
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 17014116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592469
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 24592469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665134
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 14665134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344670
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | || |||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgg 36344670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569969
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 6569969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763459
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 14763459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800768
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 18800768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005989
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5005989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126673
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgg 31126673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105793
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 40105793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098657
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 14098657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33673955
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggag 33673955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163472
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || || |||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27163472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753870
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 30753870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833503
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgg 54833503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969815
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 21969815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850752
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | || |||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggag 39850752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189117
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  248 caggtggag 256  Q
    | |||||||    
T  34189109 ccggtggag 34189117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112776
Alignment:
Q  48 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttc 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  || ||||||||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  148 ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggat 247  Q
    |  |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  248 caggtggag 256  Q
    | |||||||    
T  24112784 ccggtggag 24112776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22080994
Alignment:
Q  52 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  152 tgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  252 tggag 256  Q
    |||||    
T  22080990 tggag 22080994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563200
Alignment:
Q  27 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagcttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  127 ccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac 226  Q
    |||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44563328 ccttggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  227 ggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  44563229 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 44563200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659155
Alignment:
Q  26 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  126 tccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 225  Q
    ||||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  226 cggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggag 19659155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283550
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 16283550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710688
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtg 253  Q
    || ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtg 18710688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244764
Alignment:
Q  26 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  126 tccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 225  Q
    ||||||||  ||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  226 cggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  33244794 cggaacttaggaggcgacgggtcaggtggag 33244764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609019
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27609019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277655
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgg 16277655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688199
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 19688199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557728
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    || || || | |||||| |||||||||||||||||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 14557728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092838
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 12092838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829423
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29829423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354721
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttc-ataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacactt 215  Q
     || |  ||||||||||  ||||| || ||  | ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  216 gaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggag 9354721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137373
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 2137373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329621
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | || |||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 3329621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674542
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |  || |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 19674542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489864
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354623
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggag 31354623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208474
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 19208474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286563
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgg 19286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362069
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 28362069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258824
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 33258824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagag 193  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 256
Target Start/End: Original strand, 1 - 185
Alignment:
Q  72 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  172 ccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggag 256  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggag 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21660
Alignment:
Q  52 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttagctttccttggttaatgagcttcttcataa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  152 tgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 251  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  252 tggag 256  Q
    |||||    
T  21664 tggag 21660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47140
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 47140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40224
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgg 40224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29864
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 29864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatc 209  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 47 - 284
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || || || | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgg 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27393
Alignment:
Q  18 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  118 gttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttga 217  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  218 ggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    | || || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 27393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9667
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 9667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 8050
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 8050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7394
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 7394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15085
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 15085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9221
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 9221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20116
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  217 aggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 20116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26357
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  117 agttagctttccttggttaatgagcttcttcataatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacacttg 216  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  217 aggtcagaacggaacc-tgggaggcaacggatcaggtgg 254  Q
    || ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgg 26357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46964
Alignment:
Q  61 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctc-aaaagttagc-tttccttggttaatgagcttcttcataatgtactt 158  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||||  || |||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatactt 46863  T
Q  159 caaagcgta-gcatccttctacat-cat--ggcccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaac-ggaacctgggaggcaacggatcaggtg 253  Q
    |||||| || ||| || || |||| |||  | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  46864 caaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtg 46963  T
Q  254 g 254  Q
    |    
T  46964 g 46964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 311
Alignment:
Q  17 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||   | ||||||||||    
T  427 ggacatctagtttgggtgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 328  T
Q  117 agttagctttccttggt 133  Q
    ||| |||||||||||||    
T  327 agtcagctttccttggt 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University