View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6876A_low_207 (Length: 252)

Name: NF6876A_low_207
Description: NF6876A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6876A_low_207
NF6876A_low_207
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (18-252)||(18867859-18868093)
chr8 (18-252)||(10686453-10686687)
chr8 (11-252)||(26299037-26299278)
chr8 (18-252)||(35743053-35743287)
chr8 (18-186)||(28892997-28893165)
chr8 (36-186)||(25682563-25682713)
chr8 (36-200)||(15946914-15947078)
chr8 (36-186)||(16755040-16755190)
chr8 (18-186)||(4815006-4815174)
chr8 (18-186)||(28330128-28330296)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (18-252)||(14739761-14739995)
chr6 (18-252)||(33333265-33333499)
chr6 (26-252)||(24433517-24433743)
chr6 (18-186)||(35203843-35204011)
chr6 (36-186)||(13880990-13881140)
chr6 (36-186)||(25943920-25944070)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (18-252)||(9226590-9226824)
chr4 (18-252)||(18858240-18858474)
chr4 (18-252)||(16626182-16626416)
chr4 (18-252)||(5145572-5145806)
chr4 (36-186)||(4567590-4567740)
chr4 (38-138)||(16634744-16634844)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (18-252)||(16498-16732)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (18-252)||(24263512-24263746)
chr7 (18-252)||(16882591-16882825)
chr7 (18-252)||(18411321-18411555)
chr7 (18-252)||(9187334-9187568)
chr7 (18-252)||(21986584-21986818)
chr7 (110-252)||(24272181-24272323)
chr7 (18-159)||(21643794-21643935)
chr7 (154-252)||(21642351-21642449)
chr7 (18-186)||(3322568-3322736)
chr7 (18-186)||(7072284-7072452)
chr7 (18-186)||(25407647-25407815)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (18-252)||(43594785-43595019)
chr5 (18-252)||(43627579-43627813)
chr5 (18-252)||(27447487-27447721)
chr5 (18-252)||(31399181-31399415)
chr5 (18-252)||(33789020-33789254)
chr5 (18-252)||(37558791-37559025)
chr5 (18-252)||(24557773-24558007)
chr5 (18-252)||(24598805-24599039)
chr5 (18-252)||(28835966-28836199)
chr5 (177-252)||(28805070-28805145)
chr5 (33-68)||(29103928-29103963)
chr5 (33-68)||(29267743-29267778)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (18-252)||(1308535-1308769)
chr3 (18-252)||(8514758-8514992)
chr3 (18-252)||(32478004-32478238)
chr3 (18-252)||(3325727-3325961)
chr3 (19-252)||(2674410-2674643)
chr3 (50-252)||(22170529-22170731)
chr3 (153-252)||(18144960-18145059)
chr3 (18-186)||(6305544-6305712)
chr3 (36-186)||(10096586-10096736)
chr3 (36-186)||(10203472-10203622)
chr3 (18-186)||(16459697-16459865)
chr3 (36-186)||(10610553-10610703)
chr3 (86-186)||(22623759-22623859)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (18-252)||(19346942-19347176)
chr2 (18-252)||(25393550-25393784)
chr2 (76-239)||(39485468-39485631)
chr2 (174-252)||(31058622-31058700)
chr2 (84-215)||(31133832-31133963)
chr2 (185-252)||(39485401-39485468)
chr2 (36-186)||(45569641-45569791)
chr2 (18-186)||(39684480-39684648)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (18-252)||(172-406)
scaffold0006 (18-252)||(8328-8562)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (18-252)||(41395915-41396137)
chr1 (145-252)||(19369001-19369108)
chr1 (18-186)||(9523961-9524129)
chr1 (86-186)||(2397035-2397135)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-221)||(34705-34908)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (18-186)||(924-1092)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 18867859 - 18868093
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18867859 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaatgttttcggagctttggcatatgcgca 18867958  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18867959 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 18868058  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18868059 ggaggatcaagagtcttgattagtagggatgttac 18868093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 10686453 - 10686687
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686453 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 10686552  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686553 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 10686652  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10686653 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 10686687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26299278 - 26299037
Alignment:
Q  11 agatggacatcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcat 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299278 agatggccatcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttcggagctttggcat 26299179  T
Q  111 atgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattgga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299178 atgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattgga 26299079  T
Q  211 atctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26299078 atctagtggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 26299037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35743287 - 35743053
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35743287 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 35743188  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35743187 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtggaaattggaatctagt 35743088  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35743087 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 35743053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 28892997 - 28893165
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| |||||||||||||| || | ||| ||    
T  28892997 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 28893096  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28893097 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 28893165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 25682563 - 25682713
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  25682563 tcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 25682662  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||  |||||||||||    
T  25682663 tgatgctaaagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaa 25682713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Original strand, 15946914 - 15947078
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| |||| | || |||||    ||||| |||||||||||||| |||| ||| | | |||| || ||||| ||    
T  15946914 tcaagacacctatggatgtttggagtgggagactgccagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgcacgtgtcaaacatgacaaact 15947013  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgt 200  Q
    |||  ||| || | |||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  15947014 tgatgctagagttgtgaagtgtgtttttattggttatcttgaaggtgtgaaaggttacaagttgt 15947078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16755190 - 16755040
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  16755190 tcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 16755091  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16755090 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 16755040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4815174 - 4815006
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||| |||||||  | | ||| ||    
T  4815174 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcagagctttaacgtttgccca 4815075  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4815074 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 4815006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 28330128 - 28330296
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  28330128 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 28330227  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  28330228 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctaaaggtgtgaa 28330296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 14739761 - 14739995
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14739761 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 14739860  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14739861 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 14739960  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14739961 ggaggatcaagagtcttgattagtagggatgttac 14739995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 33333265 - 33333499
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33333265 catcaacgggaatagacttcaagatacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 33333364  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33333365 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatcaggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagt 33333464  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33333465 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 33333499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 252
Target Start/End: Original strand, 24433517 - 24433743
Alignment:
Q  26 ggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||   ||| || |||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  24433517 ggaatagacttcaagacgcctattgaaaaatggagcgggaaaccagcaatttactcatctttgaaggttttcggagttttgacatatgcgcatatcaatc 24433616  T
Q  126 aagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatt 225  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  24433617 aatacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatctggaaggtgtgaagggttacaagttgtgtaaatttgaatctagtggaggatc 24433716  T
Q  226 aagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  24433717 aaaagtcttgattagtagggatgttac 24433743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35204011 - 35203843
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  35204011 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 35203912  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35203911 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 35203843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 13880990 - 13881140
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  13880990 tcaagacacctatggaggtttggagtgggacaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 13881089  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13881090 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 13881140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 25943920 - 25944070
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| | |  | |||||| ||    
T  25943920 tcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgctcatgtgagactagacaaact 25944019  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25944020 tgatgctagagctgtgaaatgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 25944070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 9226590 - 9226824
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226590 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 9226689  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226690 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 9226789  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9226790 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 9226824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18858474 - 18858240
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858474 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 18858375  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858374 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 18858275  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18858274 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 18858240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 16626182 - 16626416
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16626182 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttctgagctttgacatatgcgca 16626281  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16626282 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtatcttcattggttatccggaaggtctgaagggttacgagttgtggaaattggaatctagt 16626381  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16626382 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 16626416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5145806 - 5145572
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145806 catcaacgacaatagacttcaagacacctatggaagtatggaatgggaaaccggcagactactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 5145707  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5145706 tatcaagaaagacaagcttgagactagagctttgaaatgtgtctttattcgttatccagaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 5145607  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  5145606 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatattac 5145572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 4567590 - 4567740
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||| || |||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||  || ||||| ||    
T  4567590 tcaagacacctatggaggtttggagtgggagatcggcagactactctaatttgaaagttttcggagctttagcatttgctcatgtcagacaggacaaact 4567689  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| || | |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4567690 tgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 4567740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 16634744 - 16634844
Alignment:
Q  38 aagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttg 137  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || |||  | |||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  16634744 aagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcaaactactctaatttgaaagttttcggagctttagcatttgctcatgtcaaacaggacaaacttg 16634843  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  16634844 a 16634844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 16498 - 16732
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16498 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 16597  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16598 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 16697  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16698 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 16732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 24263512 - 24263746
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263512 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 24263611  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263612 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 24263711  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24263712 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 24263746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16882825 - 16882591
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16882825 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 16882726  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16882725 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagt 16882626  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16882625 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 16882591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18411555 - 18411321
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18411555 catcaactgggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggtttttggagctttgacatatgcgca 18411456  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18411455 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcatttgttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 18411356  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18411355 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 18411321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 9187334 - 9187568
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9187334 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcaaactactcatctttgaaggtttttggagctttggcatatgcgca 9187433  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9187434 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagctgtggaaattggaatctagt 9187533  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  9187534 ggaggatcaaaagtcttgattagtatggatgttac 9187568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21986818 - 21986584
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21986818 catcaacggcaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaatcggcagactactcatctttgaaggttttcgaagctttggcatatgcaca 21986719  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986718 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatctggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 21986619  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21986618 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 21986584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 252
Target Start/End: Original strand, 24272181 - 24272323
Alignment:
Q  110 tatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattgg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24272181 tatgcgcatatcaagcaagacaagattgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattgg 24272280  T
Q  210 aatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24272281 aatctagttgaggattaaaagtcttgattagtagggatgttac 24272323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21643935 - 21643794
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21643935 catcaacgggtatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggctgattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 21643836  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21643835 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgt 21643794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21642449 - 21642351
Alignment:
Q  154 atgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21642449 atgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctattggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 21642351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3322736 - 3322568
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  3322736 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 3322637  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    ||||| ||||||||| |||||  ||| |||  |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3322636 tatcaggcaagacaaacttgatgctagagcggtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 3322568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 7072284 - 7072452
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||    
T  7072284 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcatttgccca 7072383  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| || | |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7072384 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 7072452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 25407647 - 25407815
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| |||||||||||||| || | ||| ||    
T  25407647 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagacgggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctca 25407746  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | |||  |||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25407747 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 25407815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43595019 - 43594785
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43595019 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 43594920  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594919 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 43594820  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43594819 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 43594785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43627813 - 43627579
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43627813 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 43627714  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43627713 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 43627614  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43627613 ggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 43627579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27447721 - 27447487
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27447721 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 27447622  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27447621 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 27447522  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27447521 ggaggatcaagagccttgataagtagggatgttac 27447487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 31399181 - 31399415
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31399181 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcgaattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 31399280  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31399281 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagt 31399380  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31399381 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 31399415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33789254 - 33789020
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33789254 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggtggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 33789155  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33789154 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtggaaattggaatctagt 33789055  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33789054 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 33789020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 37558791 - 37559025
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37558791 catcaacggggatagacttcaagacacttatggaggtatggagtgggaaaccggtggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 37558890  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37558891 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 37558990  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37558991 ggaggatcaagagtcgtgataagtagggatgttac 37559025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 24557773 - 24558007
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24557773 catcaacgggaataaacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggcagattactcatcattgaaggtttttggagctttggcatatgcgca 24557872  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24557873 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 24557972  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  24557973 ggaggatcaaaagtcttgattagcagggacgttac 24558007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 24598805 - 24599039
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24598805 catcaacgggaataaacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggcagattactcatcattgaaggtttttggagctttggcatatgcgca 24598904  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24598905 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 24599004  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  24599005 ggaggatcaaaagtcttgattagcagggacgttac 24599039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28836199 - 28835966
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  28836199 catcaacatgaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggtagattactcatctttgatggttttcggagctttg-catatgcgta 28836101  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28836100 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgagaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 28836001  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28836000 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 28835966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 252
Target Start/End: Original strand, 28805070 - 28805145
Alignment:
Q  177 aaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28805070 aaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattgaaatctagtggaggatcaagagtcttgataagtagggatgttac 28805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 68
Target Start/End: Original strand, 29103928 - 29103963
Alignment:
Q  33 acttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaac 68  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29103928 acttcaagagacctatggaggtatgaagtgggaaac 29103963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29267778 - 29267743
Alignment:
Q  33 acttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaac 68  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29267778 acttcaagagacctatggaggtatgaagtgggaaac 29267743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1308769 - 1308535
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308769 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 1308670  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308669 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 1308570  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1308569 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 1308535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8514992 - 8514758
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514992 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 8514893  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8514892 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagt 8514793  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8514792 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 8514758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32478238 - 32478004
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32478238 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 32478139  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32478138 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagt 32478039  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32478038 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 32478004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Original strand, 3325727 - 3325961
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3325727 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaactagaagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 3325826  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3325827 tatcaagcaagacatgcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtgaaaattggaatctagt 3325926  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3325927 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 3325961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 2674410 - 2674643
Alignment:
Q  19 atcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2674410 atcaacgagaataaacttctagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcat 2674509  T
Q  119 atcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2674510 atcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggataagagttgtggaaattggaatctagtg 2674609  T
Q  219 gaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2674610 gaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 2674643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 252
Target Start/End: Original strand, 22170529 - 22170731
Alignment:
Q  50 gaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctt 149  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22170529 gaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctt 22170628  T
Q  150 tgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22170629 tgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttgataagtagggatgt 22170728  T
Q  250 tac 252  Q
    |||    
T  22170729 tac 22170731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18145059 - 18144960
Alignment:
Q  153 aatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||    
T  18145059 aatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctggtggaggatcaaatgtcttgataagtagggacgttac 18144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 6305544 - 6305712
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  6305544 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 6305643  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6305644 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 6305712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10096736 - 10096586
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  10096736 tcaagacacctatggaggtttggagtgggacaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 10096637  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10096636 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 10096586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10203622 - 10203472
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  10203622 tcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 10203523  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10203522 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 10203472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 16459697 - 16459865
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  16459697 catcaacagggatagatctcaacacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgcgca 16459796  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||  |||||||||||    
T  16459797 tgtcatgcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaa 16459865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10610703 - 10610553
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| |||||||||||||| || | ||| ||| |||  |||||||| ||    
T  10610703 tcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctcatgtcagacaagacaaact 10610604  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10610603 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 10610553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22623859 - 22623759
Alignment:
Q  86 ttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtga 185  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22623859 ttgaaagttttcggagctttagcgtttgctcatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctatgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtga 22623760  T
Q  186 a 186  Q
    |    
T  22623759 a 22623759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19347176 - 19346942
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347176 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 19347077  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  19347076 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtgaaaattggaatctagt 19346977  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19346976 ggaagatcaagagtcttgataagtagggatgttac 19346942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25393784 - 25393550
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25393784 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcatctttgaaggtttacggagctttggcatatgcaca 25393685  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25393684 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 25393585  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25393584 ggaggatcaagagtcttgattagtagggatgttac 25393550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 39485468 - 39485631
Alignment:
Q  76 ttactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39485468 ttactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccg 39485567  T
Q  176 gaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgatta 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39485568 gaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttgatta 39485631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31058700 - 31058622
Alignment:
Q  174 cggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  31058700 cggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggagggtcaaaagtcttgattagtaggtatgttac 31058622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 215
Target Start/End: Original strand, 31133832 - 31133963
Alignment:
Q  84 ctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgt 183  Q
    |||||||| ||||||  ||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||  ||  || | |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||    
T  31133832 ctttgaagattttcgaggctttagcgtatctgcatatcaagtaagacaagcttgatgctggagttgtgaaatgtttcttcattggttatccagagcgtgt 31133931  T
Q  184 gaaggggtacaagttgtggaaattggaatcta 215  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  31133932 gcacagttacaagttgtggaaattggaatcta 31133963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39485468 - 39485401
Alignment:
Q  185 aaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||    
T  39485468 aagggttacaagttgtggaaattggaatctagtgaaggatcaaaaatcttgattagtagagatgttac 39485401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 45569641 - 45569791
Alignment:
Q  36 tcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 135  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  45569641 tcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatatcaggcaagacaaact 45569740  T
Q  136 tgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    |||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45569741 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 45569791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 39684480 - 39684648
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||  || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  39684480 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggaagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 39684579  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  39684580 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 39684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 172
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  406 catcaacaggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaagcggcagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 307  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  306 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 207  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  206 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttac 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8562 - 8328
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8562 catcaacaggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaagcggcagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 8463  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8462 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 8363  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  8362 ggaggatcaaaagtcttaattagtagggatgttac 8328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41396137 - 41395915
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41396137 catcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaacccgcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 41396038  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    ||||||||||||||||||             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41396037 tatcaagcaagacaagct------------gtggaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 41395950  T
Q  218 ggaggattaagagtcttgattagtagggatgttac 252  Q
     |||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  41395949 tgaggatcaagagtcttagttagtagggatgttac 41395915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 252
Target Start/End: Original strand, 19369001 - 19369108
Alignment:
Q  145 agctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggattaagagtcttgattagtagg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19369001 agctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattagaatctagtggaggatcaaaagtcttgattagtagg 19369100  T
Q  245 gatgttac 252  Q
    ||||||||    
T  19369101 gatgttac 19369108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 9523961 - 9524129
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  9523961 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 9524060  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | ||| ||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9524061 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 9524129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2397135 - 2397035
Alignment:
Q  86 ttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtga 185  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  2397135 ttgaaagttttcggagctttagcatttgctcatgtcaagcaggacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaagtgtga 2397036  T
Q  186 a 186  Q
    |    
T  2397035 a 2397035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34908 - 34705
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||   |   ||||| ||| |||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  34908 catcaacgggaataaacttcaggatacctatggaagtatggagtgggaaactaatgttctactcatctatgaaggttctctaagatttggcatatgcgca 34809  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagt 217  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34808 tatcaagcaagacaagcttaaggctagagctgtgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctggt 34709  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  34708 ggag 34705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 924
Alignment:
Q  18 catcaacgggaatagacttcaagacacctatggaggtatgaagtgggaaactggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 117  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||    ||||| |||||||||||||| || | ||| ||    
T  1092 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 993  T
Q  118 tatcaagcaagacaagcttgagcctaaagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 186  Q
    | | | ||||||||| |||||  ||| |||| | |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  992 tgttaggcaagacaaacttgatgctagagctgtaaaatgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University