View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6876A_low_270 (Length: 246)

Name: NF6876A_low_270
Description: NF6876A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6876A_low_270
NF6876A_low_270
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (24-246)||(821196-821416)
chr4 (25-246)||(44054776-44054997)
chr4 (25-246)||(45460040-45460260)
chr4 (25-246)||(33739119-33739339)
chr4 (95-246)||(5683906-5684057)
chr4 (35-245)||(25120215-25120425)
chr4 (25-239)||(15273736-15273949)
chr4 (25-246)||(16521642-16521863)
chr4 (25-246)||(44345682-44345902)
chr4 (95-239)||(18247155-18247299)
chr4 (30-246)||(21960657-21960872)
chr4 (25-246)||(30233626-30233847)
chr4 (80-231)||(7133479-7133631)
chr4 (93-240)||(9294491-9294638)
chr4 (25-246)||(12900853-12901076)
chr4 (25-238)||(19698447-19698657)
chr4 (25-238)||(19709032-19709242)
chr4 (91-239)||(26679002-26679152)
chr4 (130-240)||(15212413-15212523)
chr4 (30-246)||(23271015-23271228)
chr4 (25-246)||(54119356-54119576)
chr4 (95-231)||(18167766-18167903)
chr4 (91-239)||(22355604-22355754)
chr4 (142-246)||(10643041-10643145)
chr4 (25-246)||(18294100-18294323)
chr4 (95-246)||(14995049-14995202)
chr4 (30-230)||(55377673-55377873)
chr4 (103-246)||(13245304-13245447)
chr4 (99-226)||(18251103-18251232)
chr4 (80-246)||(19999379-19999547)
chr4 (130-239)||(15212311-15212419)
chr4 (147-239)||(15288106-15288198)
chr4 (147-239)||(15295216-15295308)
chr4 (33-171)||(53705902-53706039)
chr4 (25-169)||(8873631-8873774)
chr4 (46-159)||(19019506-19019617)
chr4 (103-171)||(53908963-53909031)
chr4 (142-246)||(18495604-18495710)
chr4 (34-193)||(13810709-13810870)
chr4 (91-246)||(10487523-10487682)
chr4 (91-246)||(16329069-16329228)
chr4 (130-189)||(15212552-15212611)
chr4 (204-246)||(7133711-7133753)
chr4 (204-246)||(8373207-8373249)
chr4 (204-246)||(14950872-14950914)
chr4 (204-246)||(18167644-18167686)
chr4 (142-246)||(34394051-34394156)
chr4 (146-240)||(8373321-8373415)
chr4 (204-246)||(9294377-9294419)
chr4 (209-246)||(110334-110371)
chr4 (103-168)||(110391-110456)
chr4 (194-246)||(5684153-5684206)
chr4 (194-246)||(18294418-18294471)
chr4 (206-246)||(8044113-8044153)
chr4 (142-246)||(15273958-15274064)
chr4 (206-246)||(34393908-34393948)
chr4 (206-246)||(53706054-53706094)
chr4 (203-246)||(15212196-15212239)
chr4 (203-246)||(15288271-15288314)
chr4 (203-246)||(15295381-15295424)
chr4 (80-246)||(18109838-18110007)
chr4 (203-246)||(18247040-18247083)
chr4 (204-246)||(22355826-22355868)
chr4 (204-246)||(26678887-26678929)
chr4 (212-246)||(47356180-47356214)
chr4 (218-246)||(8873770-8873798)
chr4 (212-240)||(15212605-15212633)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (27-246)||(22407286-22407505)
chr1 (30-246)||(49966502-49966717)
chr1 (32-246)||(18506209-18506422)
chr1 (25-239)||(20826206-20826419)
chr1 (59-246)||(44036024-44036210)
chr1 (30-246)||(21717056-21717271)
chr1 (32-246)||(35053693-35053909)
chr1 (95-246)||(15862592-15862743)
chr1 (95-246)||(22353128-22353279)
chr1 (30-246)||(2422065-2422281)
chr1 (25-246)||(5675690-5675911)
chr1 (25-246)||(27330861-27331080)
chr1 (25-246)||(41210899-41211119)
chr1 (25-246)||(35523508-35523731)
chr1 (95-246)||(22250113-22250263)
chr1 (25-246)||(51657400-51657624)
chr1 (80-246)||(17147633-17147801)
chr1 (112-238)||(41218316-41218442)
chr1 (93-240)||(20956127-20956278)
chr1 (140-246)||(21858409-21858515)
chr1 (139-245)||(45050536-45050642)
chr1 (25-246)||(9785340-9785551)
chr1 (129-246)||(20894886-20895003)
chr1 (99-246)||(22365608-22365757)
chr1 (103-171)||(37845654-37845722)
chr1 (91-168)||(51451544-51451623)
chr1 (207-246)||(20526971-20527010)
chr1 (144-246)||(7641803-7641905)
chr1 (142-246)||(20826428-20826534)
chr1 (207-246)||(20444599-20444638)
chr1 (207-246)||(20530364-20530403)
chr1 (207-246)||(37845737-37845776)
chr1 (203-246)||(41393303-41393346)
chr1 (103-173)||(20930380-20930450)
chr1 (103-171)||(20444653-20444721)
chr1 (103-171)||(20527025-20527092)
chr1 (103-171)||(20530418-20530486)
chr1 (172-246)||(17003673-17003747)
chr1 (212-246)||(18060885-18060919)
chr1 (212-246)||(22352981-22353015)
chr1 (204-246)||(51451464-51451506)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (30-246)||(25121398-25121614)
chr8 (33-244)||(22322525-22322736)
chr8 (35-245)||(29759148-29759358)
chr8 (25-246)||(19994234-19994454)
chr8 (103-246)||(41245519-41245662)
chr8 (25-246)||(20480525-20480748)
chr8 (25-246)||(37610223-37610443)
chr8 (93-239)||(24107629-24107775)
chr8 (99-239)||(28836562-28836704)
chr8 (98-246)||(21680059-21680209)
chr8 (25-238)||(18611377-18611587)
chr8 (100-239)||(22908532-22908673)
chr8 (47-246)||(20648541-20648742)
chr8 (95-246)||(22007638-22007788)
chr8 (99-238)||(24930160-24930302)
chr8 (80-246)||(20655158-20655327)
chr8 (25-246)||(21696418-21696639)
chr8 (142-246)||(43374782-43374886)
chr8 (91-246)||(13663635-13663792)
chr8 (80-246)||(24386843-24387012)
chr8 (91-246)||(24718564-24718720)
chr8 (95-246)||(13722174-13722327)
chr8 (80-246)||(16874074-16874242)
chr8 (98-246)||(16417117-16417266)
chr8 (33-246)||(20568356-20568569)
chr8 (33-246)||(20574549-20574762)
chr8 (25-246)||(3432661-3432879)
chr8 (80-246)||(38532515-38532685)
chr8 (95-246)||(17730612-17730767)
chr8 (146-239)||(6775326-6775420)
chr8 (30-246)||(16042123-16042339)
chr8 (93-215)||(28556874-28556998)
chr8 (25-239)||(16040335-16040549)
chr8 (139-245)||(24548075-24548181)
chr8 (25-172)||(16406149-16406295)
chr8 (91-246)||(5237048-5237207)
chr8 (91-246)||(24662391-24662550)
chr8 (204-246)||(13722433-13722475)
chr8 (204-246)||(13722581-13722623)
chr8 (204-246)||(13722729-13722771)
chr8 (204-246)||(13722877-13722919)
chr8 (204-246)||(13723025-13723067)
chr8 (194-240)||(17151399-17151445)
chr8 (204-246)||(24107848-24107890)
chr8 (204-246)||(24930375-24930417)
chr8 (145-246)||(270585-270687)
chr8 (145-246)||(645233-645335)
chr8 (145-246)||(830968-831070)
chr8 (204-246)||(16040621-16040663)
chr8 (208-246)||(17151521-17151559)
chr8 (102-171)||(16194917-16194986)
chr8 (207-244)||(16195001-16195038)
chr8 (203-246)||(6775492-6775535)
chr8 (203-246)||(22908745-22908788)
chr8 (203-246)||(28836447-28836490)
chr8 (204-238)||(18618028-18618062)
chr8 (63-179)||(22144136-22144250)
chr8 (172-246)||(272435-272509)
chr8 (172-246)||(643340-643414)
chr8 (172-246)||(829146-829220)
chr8 (212-246)||(224430-224464)
chr8 (212-246)||(700843-700877)
chr8 (212-246)||(738053-738087)
chr8 (212-246)||(861948-861982)
chr8 (212-246)||(13663905-13663939)
chr8 (212-246)||(13723180-13723214)
chr8 (91-246)||(43684507-43684666)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (27-246)||(32897583-32897802)
chr6 (35-245)||(19984298-19984508)
chr6 (32-244)||(25645918-25646129)
chr6 (25-239)||(16230555-16230768)
chr6 (30-240)||(18824637-18824847)
chr6 (29-246)||(18431493-18431708)
chr6 (25-246)||(18776068-18776291)
chr6 (95-239)||(25174527-25174671)
chr6 (30-240)||(4989869-4990079)
chr6 (95-235)||(27655147-27655287)
chr6 (93-240)||(18840555-18840702)
chr6 (95-234)||(33315628-33315767)
chr6 (25-246)||(16105419-16105638)
chr6 (33-246)||(18569446-18569660)
chr6 (80-231)||(18004002-18004154)
chr6 (30-231)||(15736160-15736362)
chr6 (99-239)||(13622160-13622302)
chr6 (30-246)||(35016770-35016985)
chr6 (48-246)||(16084941-16085136)
chr6 (130-240)||(18824841-18824951)
chr6 (130-240)||(18840696-18840806)
chr6 (47-239)||(16826872-16827065)
chr6 (25-239)||(18582151-18582367)
chr6 (32-246)||(25745422-25745636)
chr6 (99-231)||(14627658-14627791)
chr6 (33-246)||(22431108-22431320)
chr6 (47-238)||(19628302-19628490)
chr6 (47-246)||(23152119-23152318)
chr6 (80-246)||(18087846-18088016)
chr6 (146-246)||(1658915-1659015)
chr6 (147-239)||(19609350-19609442)
chr6 (80-246)||(23976427-23976595)
chr6 (25-246)||(25368428-25368652)
chr6 (80-189)||(26088782-26088893)
chr6 (139-245)||(1651148-1651254)
chr6 (98-236)||(22867026-22867166)
chr6 (146-224)||(21776791-21776870)
chr6 (53-191)||(18397842-18397982)
chr6 (47-145)||(13015910-13016006)
chr6 (95-153)||(25903975-25904033)
chr6 (160-230)||(16301107-16301178)
chr6 (204-246)||(16827138-16827180)
chr6 (204-246)||(4989755-4989797)
chr6 (204-246)||(18825023-18825065)
chr6 (201-246)||(15736440-15736485)
chr6 (142-246)||(16230440-16230546)
chr6 (93-238)||(28195924-28196074)
chr6 (203-246)||(14627871-14627914)
chr6 (209-244)||(16239227-16239262)
chr6 (203-246)||(18004234-18004277)
chr6 (203-246)||(25174412-25174455)
chr6 (203-246)||(27655348-27655391)
chr6 (204-238)||(18843083-18843117)
chr6 (194-238)||(15861597-15861642)
chr6 (165-244)||(13016008-13016088)
chr6 (172-246)||(10487735-10487809)
chr6 (172-246)||(16377518-16377592)
chr6 (172-246)||(16384842-16384916)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (28-246)||(71539-71757)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (33-244)||(256001-256211)
scaffold0011 (33-244)||(262607-262817)
scaffold0011 (103-240)||(124454-124591)
scaffold0011 (103-246)||(75855-75998)
scaffold0011 (103-170)||(193515-193582)
scaffold0011 (206-246)||(193468-193508)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (33-246)||(6453-6665)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (29-246)||(44864100-44864316)
chr7 (25-244)||(12753740-12753958)
chr7 (37-245)||(125684-125892)
chr7 (25-246)||(47288632-47288852)
chr7 (95-246)||(15851183-15851334)
chr7 (25-239)||(14252277-14252491)
chr7 (25-246)||(3893950-3894173)
chr7 (27-246)||(12544801-12545019)
chr7 (25-246)||(369744-369965)
chr7 (70-246)||(11286070-11286247)
chr7 (47-246)||(15823514-15823713)
chr7 (27-246)||(45453346-45453563)
chr7 (95-239)||(16417436-16417580)
chr7 (70-246)||(26071396-26071573)
chr7 (70-246)||(26095183-26095360)
chr7 (25-242)||(112381-112600)
chr7 (25-239)||(32495532-32495747)
chr7 (30-246)||(13867163-13867381)
chr7 (95-231)||(15952144-15952280)
chr7 (91-239)||(13912155-13912305)
chr7 (100-239)||(7291825-7291966)
chr7 (25-246)||(142485-142708)
chr7 (95-240)||(11515198-11515345)
chr7 (25-239)||(2027529-2027742)
chr7 (93-240)||(7285361-7285510)
chr7 (142-246)||(36051520-36051624)
chr7 (33-246)||(39047785-39047998)
chr7 (80-246)||(13757435-13757603)
chr7 (93-246)||(12249263-12249419)
chr7 (25-246)||(13273610-13273833)
chr7 (80-246)||(18981044-18981214)
chr7 (93-246)||(49048942-49049099)
chr7 (25-246)||(15629638-15629860)
chr7 (98-246)||(16571246-16571396)
chr7 (98-246)||(16594266-16594416)
chr7 (140-246)||(1937973-1938078)
chr7 (25-246)||(10861927-10862150)
chr7 (146-231)||(16480034-16480120)
chr7 (130-229)||(7285504-7285603)
chr7 (103-171)||(11582027-11582095)
chr7 (91-246)||(15442707-15442866)
chr7 (91-168)||(30263272-30263351)
chr7 (194-240)||(11515092-11515138)
chr7 (204-246)||(32495819-32495861)
chr7 (206-246)||(11582109-11582149)
chr7 (206-246)||(13038373-13038413)
chr7 (103-171)||(16210691-16210759)
chr7 (80-143)||(3048688-3048751)
chr7 (112-163)||(13038299-13038350)
chr7 (206-246)||(16210636-16210676)
chr7 (80-246)||(2191684-2191853)
chr7 (203-246)||(7291710-7291753)
chr7 (203-246)||(15952360-15952403)
chr7 (203-246)||(16417321-16417364)
chr7 (203-246)||(16480200-16480243)
chr7 (203-246)||(26010455-26010498)
chr7 (103-163)||(3058966-3059026)
chr7 (206-246)||(15926221-15926261)
chr7 (25-133)||(35093783-35093890)
chr7 (203-246)||(2027414-2027457)
chr7 (209-240)||(3058910-3058941)
chr7 (172-246)||(7821777-7821851)
chr7 (172-246)||(7829088-7829162)
chr7 (172-246)||(27102783-27102857)
chr7 (172-246)||(27110131-27110205)
chr7 (172-246)||(27175469-27175543)
chr7 (172-246)||(38784875-38784949)
chr7 (204-246)||(13912378-13912420)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (25-246)||(25809-26030)
scaffold0037 (30-246)||(70486-70702)
scaffold0037 (98-238)||(93560-93701)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (25-246)||(21393045-21393265)
chr5 (25-239)||(9731762-9731975)
chr5 (30-246)||(1169602-1169817)
chr5 (47-232)||(23510859-23511044)
chr5 (95-240)||(10779344-10779489)
chr5 (95-239)||(11318-11462)
chr5 (95-246)||(16535162-16535313)
chr5 (25-246)||(20710993-20711214)
chr5 (33-244)||(28258460-28258669)
chr5 (95-239)||(29191785-29191929)
chr5 (30-239)||(11582846-11583055)
chr5 (25-246)||(17472823-17473044)
chr5 (25-246)||(24184295-24184517)
chr5 (93-240)||(110145-110292)
chr5 (25-246)||(4864124-4864343)
chr5 (98-246)||(19404438-19404588)
chr5 (91-239)||(1220890-1221040)
chr5 (91-239)||(4201124-4201274)
chr5 (47-239)||(27184830-27185023)
chr5 (30-239)||(23513767-23513977)
chr5 (95-239)||(18779155-18779301)
chr5 (99-239)||(25425589-25425732)
chr5 (27-246)||(21652485-21652706)
chr5 (80-243)||(21649689-21649855)
chr5 (100-246)||(11338021-11338170)
chr5 (95-239)||(22367647-22367793)
chr5 (95-240)||(11341605-11341749)
chr5 (95-246)||(22884454-22884604)
chr5 (95-240)||(25901488-25901635)
chr5 (25-246)||(23453808-23454032)
chr5 (25-246)||(23465313-23465537)
chr5 (147-239)||(7424648-7424740)
chr5 (146-236)||(19498764-19498855)
chr5 (25-246)||(24474443-24474654)
chr5 (91-246)||(21234670-21234829)
chr5 (142-246)||(11341491-11341597)
chr5 (30-168)||(23505663-23505802)
chr5 (91-168)||(20615547-20615626)
chr5 (204-246)||(110364-110406)
chr5 (204-246)||(1169923-1169965)
chr5 (142-246)||(25425474-25425580)
chr5 (204-246)||(27185095-27185137)
chr5 (142-246)||(9731984-9732090)
chr5 (99-246)||(35792275-35792425)
chr5 (91-168)||(37051919-37051998)
chr5 (203-246)||(11203-11246)
chr5 (203-246)||(1221112-1221155)
chr5 (203-246)||(7424532-7424575)
chr5 (203-246)||(10779560-10779603)
chr5 (203-246)||(11582731-11582774)
chr5 (203-246)||(18779374-18779417)
chr5 (203-246)||(22367865-22367908)
chr5 (206-246)||(11212986-11213026)
chr5 (206-246)||(23513653-23513693)
chr5 (206-246)||(29192004-29192044)
chr5 (203-246)||(21074870-21074913)
chr5 (172-246)||(21933512-21933586)
chr5 (172-246)||(21939682-21939756)
chr5 (172-246)||(35581106-35581180)
chr5 (172-246)||(37010516-37010590)
chr5 (204-246)||(4201347-4201389)
chr5 (216-246)||(25192390-25192420)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (26-246)||(16183094-16183313)
chr3 (25-239)||(18909656-18909869)
chr3 (25-239)||(53769627-53769840)
chr3 (25-246)||(50113218-50113436)
chr3 (25-246)||(6147927-6148145)
chr3 (95-239)||(22274011-22274155)
chr3 (95-239)||(2450374-2450518)
chr3 (25-232)||(13837733-13837938)
chr3 (25-246)||(17099569-17099789)
chr3 (30-246)||(22145362-22145578)
chr3 (91-235)||(17957375-17957520)
chr3 (25-246)||(318695-318917)
chr3 (102-242)||(47786041-47786183)
chr3 (33-246)||(12350934-12351148)
chr3 (95-240)||(49231180-49231326)
chr3 (25-245)||(15469552-15469771)
chr3 (95-231)||(16819882-16820019)
chr3 (25-246)||(35122541-35122763)
chr3 (103-246)||(13816367-13816511)
chr3 (27-246)||(53899605-53899826)
chr3 (25-239)||(7852777-7852993)
chr3 (26-246)||(11198653-11198875)
chr3 (30-246)||(12562563-12562781)
chr3 (47-240)||(51159475-51159669)
chr3 (93-246)||(11062184-11062340)
chr3 (103-246)||(19571932-19572075)
chr3 (80-243)||(23491363-23491530)
chr3 (25-246)||(14297353-14297574)
chr3 (25-246)||(14302980-14303201)
chr3 (30-175)||(54423001-54423145)
chr3 (25-246)||(8630701-8630920)
chr3 (103-246)||(15860308-15860451)
chr3 (98-246)||(40938586-40938736)
chr3 (98-246)||(14294284-14294434)
chr3 (98-246)||(14299911-14300061)
chr3 (106-246)||(17937351-17937492)
chr3 (103-239)||(33340812-33340949)
chr3 (95-246)||(25057701-25057856)
chr3 (25-234)||(17138342-17138553)
chr3 (25-163)||(17523552-17523690)
chr3 (139-245)||(15574896-15575002)
chr3 (139-245)||(15613915-15614021)
chr3 (30-246)||(19945481-19945700)
chr3 (93-246)||(39654768-39654925)
chr3 (203-246)||(33340697-33340740)
chr3 (80-143)||(38167007-38167070)
chr3 (204-246)||(16819760-16819802)
chr3 (102-171)||(12031164-12031233)
chr3 (206-246)||(51159742-51159782)
chr3 (142-193)||(14522487-14522538)
chr3 (208-246)||(2048915-2048953)
chr3 (102-171)||(2048969-2049038)
chr3 (142-230)||(10737388-10737476)
chr3 (25-138)||(16260149-16260261)
chr3 (142-246)||(18909541-18909647)
chr3 (103-171)||(19230968-19231036)
chr3 (142-246)||(53769512-53769618)
chr3 (203-246)||(2450590-2450633)
chr3 (207-246)||(19230914-19230953)
chr3 (203-246)||(22273896-22273939)
chr3 (208-244)||(12031249-12031285)
chr3 (142-246)||(17957533-17957639)
chr3 (172-246)||(1468885-1468959)
chr3 (203-246)||(7852662-7852705)
chr3 (172-246)||(44228281-44228354)
chr3 (212-246)||(8269673-8269707)
chr3 (212-246)||(8276784-8276818)
chr3 (204-246)||(11883518-11883560)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (35-245)||(22273741-22273951)
chr2 (35-245)||(22282974-22283184)
chr2 (25-239)||(21275503-21275716)
chr2 (25-239)||(12643001-12643214)
chr2 (25-239)||(42179342-42179555)
chr2 (95-239)||(19887825-19887969)
chr2 (25-246)||(36891794-36892015)
chr2 (95-239)||(21140843-21140987)
chr2 (70-246)||(27260416-27260592)
chr2 (80-239)||(3800036-3800195)
chr2 (106-242)||(16900224-16900361)
chr2 (106-242)||(16993615-16993752)
chr2 (33-246)||(6878298-6878513)
chr2 (25-246)||(4449312-4449535)
chr2 (93-215)||(25211866-25211988)
chr2 (33-246)||(8942501-8942715)
chr2 (33-246)||(12637255-12637469)
chr2 (106-246)||(22581094-22581237)
chr2 (30-220)||(270035-270226)
chr2 (95-240)||(34823165-34823309)
chr2 (95-240)||(12727126-12727270)
chr2 (142-246)||(8886995-8887099)
chr2 (80-246)||(24572526-24572695)
chr2 (25-246)||(28972895-28973118)
chr2 (80-246)||(9653983-9654140)
chr2 (142-246)||(7320344-7320450)
chr2 (142-246)||(22862342-22862446)
chr2 (91-246)||(20013975-20014131)
chr2 (103-170)||(20628580-20628647)
chr2 (91-246)||(14907583-14907742)
chr2 (91-246)||(23819032-23819191)
chr2 (204-246)||(25600816-25600858)
chr2 (202-244)||(25877210-25877252)
chr2 (144-246)||(12726906-12727010)
chr2 (165-246)||(22691175-22691257)
chr2 (165-246)||(22695822-22695904)
chr2 (25-246)||(22787108-22787331)
chr2 (204-246)||(24827831-24827873)
chr2 (103-171)||(461646-461714)
chr2 (142-246)||(12643223-12643329)
chr2 (206-246)||(20628662-20628702)
chr2 (203-246)||(19888041-19888084)
chr2 (203-246)||(21140728-21140771)
chr2 (203-246)||(21275788-21275831)
chr2 (177-246)||(721337-721407)
chr2 (204-246)||(34823051-34823093)
chr2 (194-239)||(3800257-3800302)
chr2 (209-242)||(43644243-43644276)
chr2 (142-240)||(12727020-12727118)
chr2 (103-171)||(43644158-43644226)
chr2 (172-246)||(11232484-11232558)
chr2 (172-246)||(22514331-22514405)
chr2 (172-246)||(28776932-28777006)
chr2 (204-246)||(5889559-5889601)
chr2 (142-246)||(24088566-24088672)
chr2 (206-246)||(461591-461631)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (70-246)||(7650-7827)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (35-245)||(32287-32496)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (35-245)||(40348-40557)
scaffold0078 (91-239)||(38372-38522)
scaffold0078 (203-246)||(38594-38637)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (25-239)||(14842-15055)
scaffold0251 (142-246)||(15064-15170)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (25-246)||(137897-138117)
scaffold0021 (25-246)||(87295-87504)
scaffold0021 (30-246)||(10522-10740)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (25-246)||(1925-2145)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (25-246)||(12826-13046)
scaffold0359 (25-246)||(181-400)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (95-246)||(1367-1518)
scaffold0383 (32-246)||(6087-6303)
scaffold0383 (204-246)||(1220-1262)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (74-246)||(2925-3098)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (54-246)||(6403-6594)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (25-246)||(44655-44875)
scaffold0034 (25-240)||(39178-39392)
scaffold0034 (130-246)||(39068-39184)
scaffold0034 (99-246)||(78408-78558)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (91-246)||(20446-20601)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (32-246)||(3479-3695)
scaffold0447 (32-86)||(8256-8309)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (25-246)||(95325-95545)
scaffold0044 (204-246)||(95177-95219)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (25-240)||(129353-129568)
scaffold0028 (103-239)||(89938-90075)
scaffold0028 (204-246)||(129239-129281)
scaffold0028 (203-246)||(90147-90190)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (95-239)||(6148-6292)
scaffold0003 (103-171)||(216932-217000)
scaffold0003 (203-246)||(6033-6076)
scaffold0003 (208-246)||(217016-217054)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (27-246)||(46982-47201)
scaffold0068 (27-246)||(60430-60649)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (95-239)||(155402-155546)
scaffold0023 (203-246)||(155618-155661)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (80-239)||(1507-1666)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (70-246)||(3516-3692)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (30-246)||(13283-13499)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (30-246)||(28888-29104)
scaffold0116 (206-246)||(28740-28780)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (33-246)||(43051-43263)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (25-246)||(237038-237261)
scaffold0009 (204-246)||(270978-271020)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (80-235)||(2162-2319)
scaffold0597 (204-246)||(2395-2437)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (34-246)||(113652-113863)
scaffold0022 (25-246)||(108517-108739)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (69-246)||(7781-7959)
scaffold0195 (69-246)||(13170-13348)
scaffold0195 (142-246)||(20247-20351)
scaffold0195 (142-246)||(18163-18267)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (25-246)||(13055-13275)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (25-246)||(145533-145757)
scaffold0025 (194-246)||(145386-145438)
scaffold0025 (102-173)||(147698-147769)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (26-238)||(17485-17697)
scaffold0244 (25-238)||(23903-24116)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (25-246)||(52361-52580)
scaffold0018 (25-246)||(56313-56532)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (25-246)||(18510-18736)
scaffold0234 (194-246)||(18831-18883)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (99-246)||(195-345)
scaffold1734 (206-246)||(46-86)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (99-239)||(935-1077)
scaffold0269 (99-239)||(15191-15333)
scaffold0269 (25-134)||(12021-12129)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (28-246)||(765-984)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (95-239)||(17618-17764)
scaffold0315 (204-246)||(17503-17545)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (80-246)||(54486-54653)
scaffold0032 (203-246)||(109344-109387)
scaffold0032 (99-152)||(14590-14645)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (95-246)||(27878-28028)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (99-239)||(2740-2882)
scaffold0761 (208-246)||(2958-2996)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (46-246)||(23929-24128)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (25-246)||(145782-146005)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (103-246)||(5770-5915)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (80-246)||(11062-11231)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (44-246)||(21515-21696)
scaffold0008 (112-173)||(129390-129451)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (25-173)||(18263-18410)
scaffold0120 (164-246)||(30044-30127)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (112-246)||(8289-8424)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (142-239)||(1575-1672)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (25-246)||(2540-2763)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (25-232)||(14350-14556)
scaffold0138 (206-246)||(28354-28394)
scaffold0138 (206-246)||(40350-40390)
scaffold0138 (204-246)||(28503-28545)
scaffold0138 (204-246)||(40499-40541)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (142-246)||(248741-248845)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (93-246)||(6749-6906)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (25-159)||(53462-53593)
scaffold0066 (204-246)||(53161-53203)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (93-246)||(2285-2442)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (151-246)||(59579-59675)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (146-246)||(32439-32541)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (170-246)||(14536-14613)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (99-246)||(317-467)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (179-239)||(41677-41737)
scaffold0132 (204-246)||(41563-41605)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (103-170)||(2085-2152)
scaffold1140 (206-246)||(2038-2078)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (69-136)||(1817-1884)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (91-246)||(2723-2882)
scaffold0124 (177-246)||(22940-23009)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (31-191)||(5515-5676)
scaffold0750 (177-246)||(6577-6646)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (33-246)||(505-700)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (206-246)||(6415-6455)
scaffold0218 (103-171)||(6332-6400)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (103-173)||(7890-7960)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (91-246)||(21501-21660)
scaffold0141 (91-246)||(25756-25915)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (209-246)||(4697-4734)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (114-171)||(40502-40559)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (203-246)||(17353-17396)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (99-154)||(330964-331021)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (211-244)||(413-446)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (112-173)||(4788-4849)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (209-246)||(27781-27818)
scaffold0162 (103-171)||(27696-27763)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (206-246)||(34426-34466)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (172-246)||(38139-38213)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Original strand, 821196 - 821416
Alignment:
Q  24 cgccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  821196 cgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttg 821293  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  821294 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtga 821393  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  821394 tagttgatgttgaatgacattgt 821416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44054997 - 44054776
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44054997 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttat 44054898  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  44054897 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaagctaaatgtaat 44054798  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44054797 agttgatgttgaatgacattgt 44054776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 45460040 - 45460260
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45460040 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 45460138  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45460139 atgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgagat 45460238  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  45460239 agttaatgttgaatgacattgt 45460260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33739339 - 33739119
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  33739339 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatattt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 33739241  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33739240 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaagctatatgtgat 33739141  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33739140 agttgatgttgaatgacattgt 33739119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 5683906 - 5684057
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5683906 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 5684005  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684006 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 5684057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 25120215 - 25120425
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25120215 acttgatatgggttttgatcggcgatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaat 25120314  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25120315 gattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 25120413  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  25120414 tgaatgacattg 25120425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 15273736 - 15273949
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15273736 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 15273834  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15273835 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15273934  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  15273935 agttgatgttgaatg 15273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16521863 - 16521642
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16521863 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16521765  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16521764 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 16521665  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16521664 tagttgatgttgaatgacattgt 16521642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44345902 - 44345682
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  44345902 gccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 44345804  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44345803 atgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgttgaaactatatgtgat 44345704  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44345703 agttgatgttgaatgacattgt 44345682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18247299 - 18247155
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18247299 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 18247200  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247199 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 18247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 21960657 - 21960872
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21960657 ttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaa 21960755  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21960756 tgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaatgtatggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 21960855  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21960856 atgttaaatgacattgt 21960872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 30233626 - 30233847
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  30233626 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatatgactaagtaaatttg 30233723  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  30233724 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggcgaaactatatgag 30233823  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  30233824 atagttaatgttgaatgacattgt 30233847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 7133479 - 7133631
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7133479 cttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 7133578  T
Q  179 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133579 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 7133631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9294638 - 9294491
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  9294638 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 9294539  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9294538 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatga 9294491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 12900853 - 12901076
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| | |||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12900853 gccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatgactaattgaagttgt 12900951  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 221  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12900952 ataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 12901051  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  12901052 gatagttgatgtttaatgatattgt 12901076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 19698447 - 19698657
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19698447 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19698544  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 222  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698545 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19698641  T
Q  223 atagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  19698642 atagttgatgttgaat 19698657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 19709032 - 19709242
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19709032 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19709129  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 222  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709130 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19709226  T
Q  223 atagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  19709227 atagttgatgttgaat 19709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26679152 - 26679002
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26679152 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 26679053  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679052 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 26679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212413
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 15212424  T
Q  230 atgttgaatga 240  Q
    |||||||||||    
T  15212423 atgttgaatga 15212413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 23271015 - 23271228
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23271015 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaa 23271111  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23271112 tggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttacttggaatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagtt 23271210  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||| || |||||||    
T  23271211 gatgttggataacattgt 23271228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 54119356 - 54119576
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| |  | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54119356 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatattt-cttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 54119454  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  54119455 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtga 54119553  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  54119554 tagttgatgtggaatgacattgt 54119576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18167903 - 18167766
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaa 193  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18167903 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 18167804  T
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167803 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18167766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Original strand, 22355604 - 22355754
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22355604 ttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22355703  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22355704 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 22355754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10643145 - 10643041
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10643145 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataac 10643046  T
Q  242 attgt 246  Q
    |||||    
T  10643045 attgt 10643041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 18294100 - 18294323
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  18294100 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgt 18294198  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattg--gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18294199 atgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatcgtgaaactatatgt 18294298  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18294299 gatatttgatgttgaatgacattgt 18294323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14995202 - 14995049
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  |||||||| |||| |    
T  14995202 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat 14995103  T
Q  192 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14995102 -gagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 14995049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 55377673 - 55377873
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  55377673 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaat 55377771  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  55377772 tgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatacgtgatagtt 55377871  T
Q  229 ga 230  Q
    ||    
T  55377872 ga 55377873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13245447 - 13245304
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||    
T  13245447 ttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 13245349  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13245348 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgt 13245304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 226
Target Start/End: Original strand, 18251103 - 18251232
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18251103 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaagga 18251202  T
Q  197 atacttgaatggtgaaactatatgtgatag 226  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18251203 atgtttgaatagtgaaattatatgtgatag 18251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19999547 - 19999379
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  19999547 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 19999448  T
Q  179 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  19999447 ttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgt 19999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15212419 - 15212311
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212419 tgaatgattgtaatagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctaaga-acttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttg 15212321  T
Q  230 atgttgaatg 239  Q
    ||||||||||    
T  15212320 atgttgaatg 15212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288198
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatttgatagttgatgtttaatg 15288198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295308
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 15295308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Original strand, 53705902 - 53706039
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53705902 ccacttgatatggtttttagtcggaaatgttt-ctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 53706000  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53706001 atgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53706039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 8873631 - 8873774
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| || ||| |||| |||  |||||| | ||||||||||| |    
T  8873631 gccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagtgaagttat 8873729  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8873730 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtg 8873774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19019617 - 19019506
Alignment:
Q  46 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19019617 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 19019520  T
Q  146 atatgatgtttatc 159  Q
    || |||||||||||    
T  19019519 atgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909031
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 18495604 - 18495710
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18495604 ttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaatg 18495703  T
Q  240 acattgt 246  Q
    |||||||    
T  18495704 acattgt 18495710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 193
Target Start/End: Original strand, 13810709 - 13810870
Alignment:
Q  34 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13810709 cacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatga 13810806  T
Q  133 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 193  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  13810807 atgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttcttttacttagaatgtaa 13810870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10487682 - 10487523
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  10487682 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 10487583  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  10487582 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 10487523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 16329069 - 16329228
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  16329069 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 16329168  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16329169 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 16329228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212552
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaat 15212552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 7133711 - 7133753
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133711 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 7133753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8373249 - 8373207
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373249 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 8373207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14950914 - 14950872
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950914 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 14950872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18167686 - 18167644
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167686 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 18167644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34394156 - 34394051
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34394156 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 34394058  T
Q  240 acattgt 246  Q
    |||||||    
T  34394057 acattgt 34394051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8373415 - 8373321
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | || |||||||| |||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373415 atatgatatttatcatgagatgttgttttctctcttacttggaatatga-gaatgctggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9294419 - 9294377
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9294419 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 9294377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 110371 - 110334
Alignment:
Q  209 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110371 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 110334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110391
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Original strand, 5684153 - 5684206
Alignment:
Q  194 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5684153 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 5684206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Original strand, 18294418 - 18294471
Alignment:
Q  194 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18294418 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 18294471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8044153 - 8044113
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8044153 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 8044113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 15273958 - 15274064
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15273958 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15274056  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  15274057 gacattgt 15274064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34393948 - 34393908
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34393948 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 34393908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 53706054 - 53706094
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53706054 tggtgaaactatatgtgatagttggtgttgaatgacattgt 53706094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15212239 - 15212196
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15212239 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15212196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 15288271 - 15288314
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15288271 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15288314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 15295381 - 15295424
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15295381 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15295424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 18109838 - 18110007
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaat-gtgtatgcta 176  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||| | |      
T  18109838 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatgagatattgttttccc 18109937  T
Q  177 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18109938 tattacttggaatat-gataatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgt 18110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18247083 - 18247040
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18247083 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 18247040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 22355826 - 22355868
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22355826 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22355868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26678929 - 26678887
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  26678929 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 26678887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47356214 - 47356180
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47356214 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 47356180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 246
Target Start/End: Original strand, 8873770 - 8873798
Alignment:
Q  218 atgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873770 atgtgatagttgatgttgaatgacattgt 8873798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15212633 - 15212605
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212633 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 15212605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Original strand, 22407286 - 22407505
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22407286 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttatat 22407385  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22407386 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatag 22407485  T
Q  227 ttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22407486 ttgatgttgaatgacattgt 22407505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49966717 - 49966502
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966717 ttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 49966618  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49966617 tga-tgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 49966519  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||    
T  49966518 atgttgaatgacattgt 49966502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18506422 - 18506209
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18506422 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatg 18506324  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18506323 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18506224  T
Q  232 gttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||    
T  18506223 gttgaatgacattgt 18506209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 20826206 - 20826419
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826206 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 20826304  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20826305 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 20826404  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  20826405 agttgatgttgaatg 20826419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 246
Target Start/End: Original strand, 44036024 - 44036210
Alignment:
Q  59 atgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036024 atgttttcttgagtcaattaccttagaaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 44036123  T
Q  159 catgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036124 catgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaat-gttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 44036210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21717271 - 21717056
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21717271 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttt-ttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacgaagtgaagttgtatgaa 21717174  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  21717173 tgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatgttgaaactatatgatatagtt 21717074  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21717073 gatgttgaatgacattgt 21717056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35053909 - 35053693
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35053909 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatg 35053811  T
Q  132 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35053810 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaattatatgtgatagtt 35053711  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| |||||||    
T  35053710 gatgttgaataacattgt 35053693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862743
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15862592 gattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15862691  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862692 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 15862743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22353279 - 22353128
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22353279 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22353180  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22353179 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgt 22353128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 2422065 - 2422281
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2422065 ttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgac 2422163  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2422164 tgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttactcaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 2422263  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2422264 gatgttgaatgacattgt 2422281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 5675690 - 5675911
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5675690 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 5675788  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5675789 atgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 5675888  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5675889 tagttgatgttgaataacattgt 5675911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331080
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27330861 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 27330958  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27330959 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgcta--ttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 27331056  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  27331057 atagttaatgttgaatgacattgt 27331080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41211119 - 41210899
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || |||| || ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  41211119 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttt-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaagtgaagttgt 41211021  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41211020 atgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttgggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtga 41210922  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  41210921 tagttggcgttgaatgacattgt 41210899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 35523508 - 35523731
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35523508 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 35523606  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||     
T  35523607 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaaccatatga 35523706  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||    
T  35523707 gataaatgatgttgggtgacattgt 35523731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 22250113 - 22250263
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  22250113 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 22250211  T
Q  195 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22250212 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgt 22250263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 51657400 - 51657624
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaat-gttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||   || ||||||||  ||||||| |  | |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51657400 gccggttgccacttggtacggtatt--gtcggaaatagttcatttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttg 51657497  T
Q  124 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatat 219  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||    
T  51657498 tatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaatgtaaccaatgcttgaaatggtgaaaatatat 51657597  T
Q  220 gtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | | | |||||||||||||||||||||    
T  51657598 gaggtggttgatgttgaatgacattgt 51657624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17147801 - 17147633
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17147801 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 17147702  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147701 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 17147633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41218442 - 41218316
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtga 41218343  T
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218342 aactatatgtgattgttgatgtagaat 41218316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 20956127 - 20956278
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  20956127 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaat 20956226  T
Q  190 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20956227 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatga 20956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21858515 - 21858409
Alignment:
Q  140 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858515 tattggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgttagaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 21858417  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  21858416 gacattgt 21858409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45050642 - 45050536
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45050642 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 45050544  T
Q  238 tgacattg 245  Q
    ||||||||    
T  45050543 tgacattg 45050536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 9785340 - 9785551
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  9785340 gccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgtagttgt 9785438  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9785439 atgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 9785528  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  9785529 tagttgatgttgaataacattgt 9785551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 246
Target Start/End: Original strand, 20894886 - 20895003
Alignment:
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagt 227  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||  |||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20894886 atgaatgattgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttacttaaaatgtaagaaatgtttgaattcgtgaaactatatgtgatagt 20894985  T
Q  228 tgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  20894986 tgatg-tgaatgatattgt 20895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22365757 - 22365608
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  |||||||| |||| |  ||    
T  22365757 attcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat-gag 22365659  T
Q  196 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22365658 aatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 22365608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 37845654 - 37845722
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37845654 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 51451623 - 51451544
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51451623 ttgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 51451544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20527010 - 20526971
Alignment:
Q  207 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527010 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 20526971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Original strand, 7641803 - 7641905
Alignment:
Q  144 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat-gctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 241  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7641803 ggatgtgatgattatcatgagatgtattttgctatcttacttggaatgtga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 7641900  T
Q  242 attgt 246  Q
    |||||    
T  7641901 attgt 7641905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 20826428 - 20826534
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20826428 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 20826526  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  20826527 gacattgt 20826534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20444638 - 20444599
Alignment:
Q  207 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20444638 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgt 20444599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20530403 - 20530364
Alignment:
Q  207 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20530403 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgt 20530364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 246
Target Start/End: Original strand, 37845737 - 37845776
Alignment:
Q  207 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37845737 ggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 37845776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41393346 - 41393303
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41393346 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 41393303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20930450 - 20930380
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20930450 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20444721 - 20444653
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20444721 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20527092 - 20527025
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20527092 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20530486 - 20530418
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20530486 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17003747 - 17003673
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  17003747 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 17003673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 18060885 - 18060919
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18060885 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 18060919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22353015 - 22352981
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22353015 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 22352981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51451506 - 51451464
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  51451506 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 51451464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25121614 - 25121398
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25121614 ttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtataaa 25121515  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25121514 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagttg 25121415  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||| ||||    
T  25121414 atgttgaatgaccttgt 25121398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 244
Target Start/End: Original strand, 22322525 - 22322736
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322525 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 22322624  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22322625 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccacatgtgatagttgatg 22322724  T
Q  233 ttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||    
T  22322725 ttgaatgacatt 22322736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29759358 - 29759148
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759358 acttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 29759259  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29759258 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 29759160  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  29759159 tgaatgacattg 29759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 19994234 - 19994454
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  19994234 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 19994332  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19994333 atgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 19994432  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19994433 agttgatgttgaatgacattgt 19994454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41245662 - 41245519
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41245662 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgctt 41245563  T
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245562 gaatggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 41245519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20480748 - 20480525
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20480748 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 20480650  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 221  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | |||||| |||||||    
T  20480649 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatttgtgaaattatatgt 20480550  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  20480549 gatagttgatgttgaataacattgt 20480525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37610443 - 37610223
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610443 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcgtatatgactaagtgaagttgt 37610346  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37610345 atgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatcggtgaatctatatgtga 37610246  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  37610245 tagttgatgttgaataacattgt 37610223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107775
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 24107728  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107729 aggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 24107775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28836704 - 28836562
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28836704 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 28836605  T
Q  197 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836604 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 28836562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21680209 - 21680059
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  21680209 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 21680111  T
Q  196 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680110 aatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 21680059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18611587 - 18611377
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  18611587 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 18611490  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 222  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611489 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 18611393  T
Q  223 atagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  18611392 atagttgatgttgaat 18611377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908673
Alignment:
Q  100 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 197  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 22908631  T
Q  198 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22908632 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatggtgaatg 22908673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648742
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttg 144  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  20648541 ttttggccggaaatgttt-cttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattttt 20648639  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20648640 gatatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacat 20648739  T
Q  244 tgt 246  Q
    |||    
T  20648740 tgt 20648742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 22007638 - 22007788
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  22007638 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttacttggaatat-ga 22007736  T
Q  195 gaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22007737 gaatgcttgaataggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 22007788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 238
Target Start/End: Original strand, 24930160 - 24930302
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24930160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 24930259  T
Q  197 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930260 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 24930302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 20655158 - 20655327
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20655158 cttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtat 20655257  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20655258 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattgt 20655327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21696639 - 21696418
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || ||||||||  ||||||  |  | |||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  21696639 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggctaagtgaagttgt 21696543  T
Q  125 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||      
T  21696542 atgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatataa 21696443  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21696442 ggtagttgatgttgaatgacattgt 21696418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 43374782 - 43374886
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374782 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 43374881  T
Q  242 attgt 246  Q
    |||||    
T  43374882 attgt 43374886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 13663635 - 13663792
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13663635 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaa 13663734  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663735 tgtgagaaatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13663792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 24386843 - 24387012
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  24386843 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtatgctat 24386942  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24386943 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24387012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 24718564 - 24718720
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | |||||||| ||||    
T  24718564 ttgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaat 24718663  T
Q  190 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24718664 at-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 13722174 - 13722327
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  13722174 gattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtg 13722273  T
Q  193 aagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |  ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722274 agaaatgcttgaattagtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 16874074 - 16874242
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16874074 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 16874173  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874174 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16874242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16417266 - 16417117
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 197  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  16417266 tattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcatgctaccttacttaggatgtaagaaa 16417167  T
Q  198 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16417166 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgt 16417117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 20568356 - 20568569
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20568356 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20568454  T
Q  133 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 230  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20568455 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20568553  T
Q  231 tgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||    
T  20568554 tgttgaatgacattgt 20568569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 20574549 - 20574762
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20574549 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20574647  T
Q  133 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 230  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20574648 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20574746  T
Q  231 tgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||    
T  20574747 tgttgaatgacattgt 20574762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 3432661 - 3432879
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||  |||    
T  3432661 gccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaa--tgt 3432757  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  | |||||| |||| |  ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  3432758 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctattacttggaatat-gagaatgcttgaattggtg-aactatatgtg 3432855  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3432856 atagttgatgttgaatgacattgt 3432879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532515
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgcta 176  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |     
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttc 38532586  T
Q  177 tcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38532585 tcttacttataatgtaataaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 38532515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 17730612 - 17730767
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 191  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  17730612 gattattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgt 17730711  T
Q  192 aaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||  |||  ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17730712 aagaaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattgt 17730767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Original strand, 6775326 - 6775420
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6775326 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 6775420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 16042123 - 16042339
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16042123 ttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 16042220  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 225  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16042221 tgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatgtgata 16042318  T
Q  226 gttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  16042319 gttgatgttgaataacattgt 16042339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556874
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaatg 28556900  T
Q  191 taaagaatacttg-aatggtgaaact 215  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  28556899 taagaaatgcttgaaatggtgaaact 28556874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 16040335 - 16040549
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16040335 gccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 16040432  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 220  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16040433 atgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatg 16040530  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16040531 tgatagttgatgttgaatg 16040549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24548181 - 24548075
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24548181 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 24548083  T
Q  238 tgacattg 245  Q
    ||||||||    
T  24548082 tgacattg 24548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Original strand, 16406149 - 16406295
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  | || |||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  16406149 gccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaagtgaagttgt 16406247  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16406248 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5237207 - 5237048
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  5237207 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 5237108  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  5237107 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 5237048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 24662391 - 24662550
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  24662391 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 24662490  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  24662491 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 24662550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 13722433 - 13722475
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722433 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 13722581 - 13722623
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722581 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 13722729 - 13722771
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722729 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 13722877 - 13722919
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722877 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 13723025 - 13723067
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723025 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13723067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 17151399 - 17151445
Alignment:
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151399 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 17151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 24107848 - 24107890
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107848 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24107890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 24930375 - 24930417
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930375 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24930417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 270687 - 270585
Alignment:
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  270687 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 270588  T
Q  244 tgt 246  Q
    |||    
T  270587 tgt 270585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 246
Target Start/End: Original strand, 645233 - 645335
Alignment:
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  645233 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 645332  T
Q  244 tgt 246  Q
    |||    
T  645333 tgt 645335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 246
Target Start/End: Original strand, 830968 - 831070
Alignment:
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830968 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 831067  T
Q  244 tgt 246  Q
    |||    
T  831068 tgt 831070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 16040621 - 16040663
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16040621 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 16040663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 246
Target Start/End: Original strand, 17151521 - 17151559
Alignment:
Q  208 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151521 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 17151559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194986
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 16195001 - 16195038
Alignment:
Q  207 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195001 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 16195038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 6775492 - 6775535
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6775492 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 6775535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 22908745 - 22908788
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22908745 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22908788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28836490 - 28836447
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28836490 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 28836447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18618062 - 18618028
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618062 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22144250 - 22144136
Alignment:
Q  63 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatca 160  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22144250 tttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatca 22144155  T
Q  161 tgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  22144154 tgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 272435 - 272509
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  272435 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 272509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 643414 - 643340
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  643414 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 643340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 829220 - 829146
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  829220 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 829146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 224430 - 224464
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  224430 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 224464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 700843 - 700877
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  700843 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 700877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 738053 - 738087
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  738053 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 738087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 861948 - 861982
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  861948 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 861982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 13663905 - 13663939
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13663905 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 13663939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 13723180 - 13723214
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13723180 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 13723214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43684666 - 43684507
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  43684666 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 43684567  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43684566 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 43684507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32897802 - 32897583
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32897802 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttatat 32897703  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| |||     
T  32897702 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaatggtgaaactaaatgtaataa 32897603  T
Q  227 ttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattgt 32897583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 19984298 - 19984508
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19984298 acttgatatgggttttgatcggagatgttttcttgagtaaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 19984397  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19984398 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 19984496  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  19984497 tgaatgacattg 19984508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 25645918 - 25646129
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  25645918 gccacttgatatggtgtttggtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagtgaagttgtatgaatg 25646016  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25646017 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgat 25646116  T
Q  232 gttgaatgacatt 244  Q
    |||||||||||||    
T  25646117 gttgaatgacatt 25646129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16230768 - 16230555
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16230768 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16230670  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16230669 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 16230570  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  16230569 agttgatgttgaatg 16230555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 18824637 - 18824847
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18824637 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 18824735  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824736 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18824835  T
Q  229 gatgttgaatga 240  Q
    ||||||||||||    
T  18824836 gatgttgaatga 18824847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18431708 - 18431493
Alignment:
Q  29 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18431708 gttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatga 18431610  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431609 aagaatgattgcattaaatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18431511  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18431510 gatgttgaatgacattgt 18431493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18776291 - 18776068
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18776291 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaagttgt 18776193  T
Q  125 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18776192 atgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 18776093  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  18776092 gatagttgatgttgaataacattgt 18776068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25174671 - 25174527
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25174671 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 25174572  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174571 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25174527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4990079 - 4989869
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4990079 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttga 4989981  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989980 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 4989881  T
Q  229 gatgttgaatga 240  Q
    ||||||||||||    
T  4989880 gatgttgaatga 4989869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 27655147 - 27655287
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27655147 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 27655246  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655247 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 27655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 18840555 - 18840702
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840555 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 18840654  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840655 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18840702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 234
Target Start/End: Original strand, 33315628 - 33315767
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33315628 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 33315727  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 234  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33315728 gaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 33315767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16105638 - 16105419
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16105638 gccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 16105541  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16105540 acgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaat 16105441  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16105440 agttgatgttgaatgacattgt 16105419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18569660 - 18569446
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569660 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatcttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 18569563  T
Q  133 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18569562 atgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttg 18569463  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18569462 atgttgaataacattgt 18569446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 18004002 - 18004154
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18004002 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 18004101  T
Q  179 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004102 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18004154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Original strand, 15736160 - 15736362
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15736160 ttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtaaagttgtatgaa 15736259  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15736260 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagtt 15736359  T
Q  229 gat 231  Q
    |||    
T  15736360 gat 15736362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 13622160 - 13622302
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13622160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 13622259  T
Q  197 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622260 atgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 13622302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 35016770 - 35016985
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016770 ttgccacatgatttggatttttgttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 35016868  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35016869 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttacttggaatat-gagaatgcttgaaatggttaaactatatgtgatagtt 35016967  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35016968 gatgttgaatgacattgt 35016985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16085136 - 16084941
Alignment:
Q  48 tttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 147  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16085136 tttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggat 16085040  T
Q  148 atgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16085039 atgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaagggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgt 16084941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824951
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18824940  T
Q  230 atgttgaatga 240  Q
    |||||||||||    
T  18824941 atgttgaatga 18824951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840806
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18840795  T
Q  230 atgttgaatga 240  Q
    |||||||||||    
T  18840796 atgttgaatga 18840806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 239
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827065
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16826872 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 16826970  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826971 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 16827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18582367 - 18582151
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18582367 gccgtttgccacttgatatggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 18582269  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 221  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18582268 tgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 18582169  T
Q  222 gatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18582168 gatagttgatgttgaatg 18582151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 25745422 - 25745636
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||   |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25745422 gccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaagtgaagttgtatgaacg 25745520  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  25745521 aatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaattagtaaaactatatgtgatagttga 25745620  T
Q  231 tgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||    
T  25745621 tgttgaatgacattgt 25745636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 14627658 - 14627791
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 197  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  14627658 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagaaa 14627757  T
Q  198 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627758 tgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 14627791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22431320 - 22431108
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22431320 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattga 22431223  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22431222 atgattgtatggggtatgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgat 22431123  T
Q  232 gttgaatgacattgt 246  Q
    || |||| |||||||    
T  22431122 gtagaataacattgt 22431108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628302
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |    
T  19628490 tttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttg 19628396  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628395 aatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 19628302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23152119
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 146  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttgga 23152220  T
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 245  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152219 taagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacctaggatgtaagaaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 23152120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 18087846 - 18088016
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18087846 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18087945  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18087946 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgt 18088016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Original strand, 1658915 - 1659015
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1658915 atatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaatgcaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 1659014  T
Q  246 t 246  Q
    |    
T  1659015 t 1659015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609350
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 19609350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23976595 - 23976427
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  23976595 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 23976496  T
Q  179 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  23976495 ttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgt 23976427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 25368428 - 25368652
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||   ||||||| |  | |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25368428 gccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgt 25368526  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || || |  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  25368527 atgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttacttaaaaggtgagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 25368626  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||    
T  25368627 aggtagtttatgttgaatgatattgt 25368652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26088893 - 26088782
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26088893 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 26088794  T
Q  178 cttacttagaat 189  Q
    ||||||| ||||    
T  26088793 cttacttggaat 26088782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 1651148 - 1651254
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1651148 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 1651246  T
Q  238 tgacattg 245  Q
    ||||||||    
T  1651247 tgacattg 1651254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22867166 - 22867026
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22867166 tatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaacgtaaag 22867067  T
Q  196 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 236  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22867066 aatgtttgaatgatgaaactatatgagatagtaaatgttga 22867026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 224
Target Start/End: Original strand, 21776791 - 21776870
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21776791 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18397982 - 18397842
Alignment:
Q  53 tcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatat 149  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  18397982 tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatat 18397883  T
Q  150 gatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgt 191  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18397882 gatg-atatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgt 18397842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016006
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015910 ttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttatgaattgttatgat-attcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 13016006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25904033 - 25903975
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 153  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904033 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 230
Target Start/End: Original strand, 16301107 - 16301178
Alignment:
Q  160 atgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 230  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16301107 atgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttga 16301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 16827138 - 16827180
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827138 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16827180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4989797 - 4989755
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4989797 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 4989755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 18825023 - 18825065
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18825023 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 18825065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 246
Target Start/End: Original strand, 15736440 - 15736485
Alignment:
Q  201 ttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15736440 ttgaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15736485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16230546 - 16230440
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16230546 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 16230448  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  16230447 gacattgt 16230440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 238
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28196074
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||||   || |||||| | |||||||||| ||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctcttacttaggat 28196023  T
Q  190 gtaaagaatacttg--aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||   ||||||| |||||||    
T  28196024 gtaagaaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaat 28196074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 14627871 - 14627914
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14627871 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 14627914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16239262 - 16239227
Alignment:
Q  209 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239262 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 16239227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 18004234 - 18004277
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18004234 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 18004277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25174455 - 25174412
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25174455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 25174412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 27655348 - 27655391
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27655348 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 27655391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 18843083 - 18843117
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18843083 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18843117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15861642 - 15861597
Alignment:
Q  194 agaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861642 agaatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15861597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 13016008 - 13016088
Alignment:
Q  165 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||    
T  13016008 atgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaaccacatgtggtaattgatgttgagtgacatt 13016088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10487809 - 10487735
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  10487809 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 10487735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 16377518 - 16377592
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16377518 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 16377592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 16384842 - 16384916
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16384842 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 16384916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Original strand, 71539 - 71757
Alignment:
Q  28 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 127  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  71539 ggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatg 71638  T
Q  128 aatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  71639 aatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatagt 71738  T
Q  228 tgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||||||||||||||||    
T  71739 tcatgttgaatgacattgt 71757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 244
Target Start/End: Original strand, 256001 - 256211
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  256001 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 256099  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256100 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 256199  T
Q  233 ttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||    
T  256200 ttgaatgacatt 256211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 244
Target Start/End: Original strand, 262607 - 262817
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  262607 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 262705  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  262706 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 262805  T
Q  233 ttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||    
T  262806 ttgaatgacatt 262817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Original strand, 124454 - 124591
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  124454 ttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagattggtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 124552  T
Q  203 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124553 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 124591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Original strand, 75855 - 75998
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||   ||    
T  75855 ttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 75953  T
Q  203 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  75954 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 75998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 193582 - 193515
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 170  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193582 ttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 193508 - 193468
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  193508 tggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattgt 193468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6665
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6453 ccacttgatatggtttttggtcggaaatggtt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatga 6551  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 atgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 6651  T
Q  233 ttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||    
T  6652 ttgaatgacattgt 6665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44864316 - 44864100
Alignment:
Q  29 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44864316 gttgccacttggtatgatttttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatga 44864218  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44864217 aagaatgattgtatgcgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatacttgaatggtgaaagtatatgtgatagtt 44864118  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44864117 gatgttgaatgacattgt 44864100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12753958 - 12753740
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12753958 gccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 12753861  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12753860 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaatgtaaataatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 12753761  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12753760 tagttgatgttgaatgacatt 12753740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 125892 - 125684
Alignment:
Q  37 ttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 136  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  125892 ttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 125793  T
Q  137 ttgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 235  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  125792 ttgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttg 125694  T
Q  236 aatgacattg 245  Q
    ||||||||||    
T  125693 aatgacattg 125684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47288852 - 47288632
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  47288852 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataagtgaagttgt 47288754  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47288753 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccatatgtgat 47288654  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47288653 agttgatgttgaatgacattgt 47288632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15851334 - 15851183
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15851334 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15851235  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851234 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 15851183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 14252277 - 14252491
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||    
T  14252277 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgt 14252376  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14252377 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 14252476  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  14252477 agttgatgttgaatg 14252491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3894173 - 3893950
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3894173 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 3894075  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 221  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3894074 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaagtggtgaaactatatgt 3893975  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  3893974 gatagttgatgttgaataacattgt 3893950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Original strand, 12544801 - 12545019
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12544801 cggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaggtgaagttgtat 12544899  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgata 225  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  12544900 tattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatttgata 12544998  T
Q  226 gttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12544999 gttgatgttgaatgacattgt 12545019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 369965 - 369744
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  369965 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 369867  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  369866 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 369767  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||| || ||||||||    
T  369766 tagttgatgttaaaggacattgt 369744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11286247 - 11286070
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11286247 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 11286148  T
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11286147 tatgttatcttacttagaatataaggaatgattgaaatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgt 11286070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Original strand, 15823514 - 15823713
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  15823514 ttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataaga 15823613  T
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15823614 tatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 15823713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Original strand, 45453346 - 45453563
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453346 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaa---tgttcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgactaagtaaagttgtat 45453442  T
Q  127 gaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 225  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  45453443 gaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatgggaaaattatatgtaata 45453542  T
Q  226 gttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45453543 gttgatgttgaatgacattgt 45453563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16417580 - 16417436
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16417580 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 16417481  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417480 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 16417436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 26071396 - 26071573
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26071396 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26071495  T
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26071496 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 26071573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 26095183 - 26095360
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26095183 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26095282  T
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26095283 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 26095360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Original strand, 112381 - 112600
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  112381 gccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 112479  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgt 221  Q
    | ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  112480 acgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgatttggtgaaactatatgt 112579  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgaca 242  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  112580 gatagttgatgttgaatgaca 112600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 32495532 - 32495747
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32495532 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgt 32495630  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32495631 atgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtg 32495730  T
Q  223 atagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  32495731 atagttgatgttgaatg 32495747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 13867163 - 13867381
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| || | || || |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13867163 ttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatgaccaa-tgaagttgtatga 13867261  T
Q  129 atgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 226  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13867262 atgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaatgtaaggaattcttgaatgatgaaactatatgtgatag 13867361  T
Q  227 ttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  13867362 ttgatgttggataacattgt 13867381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Original strand, 15952144 - 15952280
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15952144 gattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 15952243  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952244 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 15952280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Original strand, 13912155 - 13912305
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13912155 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 13912254  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13912255 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 13912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291825
Alignment:
Q  100 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 197  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 7291867  T
Q  198 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7291866 tgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 7291825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 142708 - 142485
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  142708 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatgactaagtgaagttgt 142610  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 221  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  142609 atgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgt 142510  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  142509 gatagttgatgttgaataacattgt 142485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11515345 - 11515198
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11515345 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 11515246  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515245 aggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2027742 - 2027529
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2027742 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 2027644  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  2027643 atgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaatgt-aagaaatgttgagttggtgaaactatatgtga 2027545  T
Q  224 tagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  2027544 tagttgatgttgaatg 2027529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 7285361 - 7285510
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 190  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7285361 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaatg 7285460  T
Q  191 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285461 taaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 7285510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36051624 - 36051520
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051624 ttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 36051525  T
Q  242 attgt 246  Q
    |||||    
T  36051524 attgt 36051520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 39047785 - 39047998
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| |  |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39047785 ccacttgatacaatttttagtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 39047883  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39047884 atgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctattatacttataaagtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 39047983  T
Q  232 gttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||| ||||||    
T  39047984 gttgaatggcattgt 39047998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13757603 - 13757435
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13757603 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 13757504  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757503 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13757435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249419
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 190  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttaggatg 12249362  T
Q  191 taaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12249363 taagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 12249419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13273833 - 13273610
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||   ||| ||||||   |||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13273833 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgt 13273736  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  13273735 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 13273636  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     | ||||||||||||||| |||||||    
T  13273635 agttagttgatgttgaattacattgt 13273610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 18981044 - 18981214
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18981044 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18981143  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18981144 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgt 18981214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49049099
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaat 49049041  T
Q  190 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  ||| |||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49049042 gtaagaaatgcttgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 49049099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15629860 - 15629638
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15629860 gccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagtggt 15629763  T
Q  125 atgaatgaatgat-tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||     
T  15629762 atgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaactatatga 15629663  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15629662 gatagttgatgttgaatgacattgt 15629638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 16571246 - 16571396
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16571246 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 16571344  T
Q  196 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16571345 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 16571396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16594416 - 16594266
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16594416 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 16594318  T
Q  196 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16594317 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 16594266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Original strand, 1937973 - 1938078
Alignment:
Q  140 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937973 tattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1938070  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  1938071 gacattgt 1938078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 10861927 - 10862150
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  10861927 gccgtttgccacttgatacggtacttg-tcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgt 10862025  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
     |||||||||| || ||||  | ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  10862026 gtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatg 10862125  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  10862126 -aatagttgatgttgaatgatattgt 10862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Original strand, 16480034 - 16480120
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16480034 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctcgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285603
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 7285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 11582027 - 11582095
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582027 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatataatgtttatcatgaaatgtgta 11582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 15442707 - 15442866
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  15442707 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 15442806  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15442807 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 15442866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 30263272 - 30263351
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30263272 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 30263351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11515138 - 11515092
Alignment:
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515138 agaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 32495819 - 32495861
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495819 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 32495861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 11582109 - 11582149
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582109 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11582149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 13038373 - 13038413
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038373 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13038413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16210759 - 16210691
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16210759 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatttatcatgagatgtgta 16210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3048751 - 3048688
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 143  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3048751 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatt 3048688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 163
Target Start/End: Original strand, 13038299 - 13038350
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  13038299 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtttatcatga 13038350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16210676 - 16210636
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16210676 tggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16210636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 2191684 - 2191853
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaat-gtgtatgcta 176  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||| | |      
T  2191684 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatgagatattgttttccc 2191783  T
Q  177 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  2191784 tattacttggaatat-gataatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgt 2191853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7291753 - 7291710
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7291753 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 7291710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 15952360 - 15952403
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15952360 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15952403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16417364 - 16417321
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16417364 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 16417321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 16480200 - 16480243
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16480200 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 16480243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 26010455 - 26010498
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26010455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 26010498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058966
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 163  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatga 3058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15926261 - 15926221
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15926261 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15926221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35093890 - 35093783
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  35093890 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 35093792  T
Q  125 atgaatgaa 133  Q
    |||||||||    
T  35093791 atgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2027457 - 2027414
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2027457 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttcaatgacattgt 2027414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3058941 - 3058910
Alignment:
Q  209 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058941 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 3058910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7821851 - 7821777
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7821851 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 7821777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7829162 - 7829088
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7829162 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 7829088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 27102783 - 27102857
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27102783 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 27102857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 27110131 - 27110205
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27110131 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 27110205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27175543 - 27175469
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27175543 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 27175469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 38784875 - 38784949
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38784875 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 38784949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 13912378 - 13912420
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  13912378 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 13912420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26030
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25809 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgatgttgt 25907  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25908 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 26007  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26008 tagttaatgttgaatgacattgt 26030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 70486 - 70702
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  70486 ttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtat-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 70584  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  70585 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 70684  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  70685 gatgttgaatgacattgt 70702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 93701 - 93560
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 197  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  93701 tattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaa 93602  T
Q  198 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  93601 tgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaat 93560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21393265 - 21393045
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  21393265 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgttgt 21393167  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21393166 atgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaatgtaaggagtacttgaatggtgaaactatatgtgat 21393067  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21393066 agttgatgttgaatgacattgt 21393045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 9731762 - 9731975
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9731762 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 9731860  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9731861 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 9731960  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  9731961 agttgatgttgaatg 9731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 1169602 - 1169817
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1169602 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 1169700  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169701 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 1169800  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||    
T  1169801 atgttgaatgacattgt 1169817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23511044 - 23510859
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 146  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23511044 ttttgatcggagaggttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattgga 23510945  T
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23510944 tatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatattac-tagaatgtaaggaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatg 23510859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Original strand, 10779344 - 10779489
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10779344 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 10779443  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779444 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 10779489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11318
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11462 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 11363  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 11318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16535313 - 16535162
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16535313 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 16535214  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16535213 aaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16535162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20711214 - 20710993
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  20711214 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgactaagtgaagttgt 20711116  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20711115 atgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 20711017  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  20711016 ataattgatgttgaatgacattgt 20710993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28258669 - 28258460
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258669 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 28258572  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258571 atgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttgagatgtaaggaatgattgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 28258472  T
Q  233 ttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||    
T  28258471 ttgaatgacatt 28258460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 29191785 - 29191929
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29191785 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 29191884  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191885 gaacgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 29191929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11583055 - 11582846
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  11583055 ttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 11582957  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582956 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 11582857  T
Q  229 gatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||    
T  11582856 gatgttgaatg 11582846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 17472823 - 17473044
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17472823 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 17472921  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17472922 atgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 17473021  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17473022 tagttgatgttgaatgacattgt 17473044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 24184295 - 24184517
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24184295 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgctt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 24184392  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||     
T  24184393 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 24184492  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  24184493 gataaatgatgttgaatgacattgt 24184517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110292
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110145 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 110244  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110245 aggaatgcttgaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatga 110292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4864343 - 4864124
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  4864343 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt--cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataactaagtgaagttgt 4864247  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  4864246 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 4864147  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4864146 tagttgatgttgaatgacattgt 4864124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19404588 - 19404438
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  19404588 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 19404490  T
Q  196 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19404489 aatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 19404438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Original strand, 1220890 - 1221040
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1220890 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 1220989  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220990 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1221040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Original strand, 4201124 - 4201274
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4201124 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 4201223  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4201224 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 4201274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 239
Target Start/End: Original strand, 27184830 - 27185023
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27184830 tttttgtcggaaatgttt-ctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 27184928  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184929 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 27185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23513977 - 23513767
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23513977 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23513879  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 227  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513878 tgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagt 23513779  T
Q  228 tgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||    
T  23513778 tgatgttgaatg 23513767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 18779155 - 18779301
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18779155 gattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgta 18779254  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18779255 aggaatggttgaatggtgaaactatatgtggaagttgatgttgaatg 18779301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25425732 - 25425589
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25425732 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagg 25425633  T
Q  196 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425632 aatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25425589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Original strand, 21652485 - 21652706
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||| |||| || |||  |||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  21652485 cggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttc-cttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaaagaagttgtat 21652583  T
Q  127 gaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  21652584 gaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatacgtga 21652683  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  21652684 tagttaatgttgaatgacattgt 21652706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21649855 - 21649689
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  21649855 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 21649756  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21649755 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21649689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338170
Alignment:
Q  100 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaaggtaagaaa 11338120  T
Q  198 tacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11338121 tgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgaccttgt 11338170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 22367647 - 22367793
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22367647 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 22367746  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367747 aggaatgtttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22367793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11341749 - 11341605
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  11341749 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 11341651  T
Q  195 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11341650 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 11341605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 22884454 - 22884604
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  |    
T  22884454 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttggaatat-ga 22884552  T
Q  195 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22884553 gaatgcttgaattggtg-aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgt 22884604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Original strand, 25901488 - 25901635
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| |    
T  25901488 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatat 25901587  T
Q  192 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901588 ga-gaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 25901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23454032 - 23453808
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23454032 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23453936  T
Q  123 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactata 218  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  23453935 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23453836  T
Q  219 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||    
T  23453835 tgaggtagttgattttgaatgacattgt 23453808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23465537 - 23465313
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23465537 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23465441  T
Q  123 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactata 218  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  23465440 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23465341  T
Q  219 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||    
T  23465340 tgaggtagttgattttgaatgacattgt 23465313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424648
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 7424648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19498855 - 19498764
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 236  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498855 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgacagttgatgttga 19498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24474654 - 24474443
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||   ||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  24474654 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 24474556  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24474555 atgaatgaatgat----------atgatatttatcattagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 24474466  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
T  24474465 tagttgttgttgaataacattgt 24474443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 21234670 - 21234829
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21234670 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 21234769  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21234770 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 21234829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11341597 - 11341491
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11341597 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 11341498  T
Q  240 acattgt 246  Q
    |||||||    
T  11341497 acattgt 11341491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23505802 - 23505663
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23505802 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23505704  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    ||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23505703 tgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 23505663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20615626 - 20615547
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20615626 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgt 20615547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 110364 - 110406
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  110364 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 1169923 - 1169965
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169923 aatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 1169965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25425580 - 25425474
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |  | || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25425580 ttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 25425481  T
Q  240 acattgt 246  Q
    |||||||    
T  25425480 acattgt 25425474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 27185095 - 27185137
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27185095 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 27185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 9731984 - 9732090
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9731984 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 9732082  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  9732083 gacattgt 9732090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 35792275 - 35792425
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaat-gtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||| | |  | |||||| |||| |  |     
T  35792275 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatat-gat 35792373  T
Q  196 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  35792374 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgt 35792425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37051998 - 37051919
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37051998 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgt 37051919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 11203
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11246 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 11203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 1221112 - 1221155
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1221112 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 1221155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7424575 - 7424532
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7424575 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 7424532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 10779560 - 10779603
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10779560 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 10779603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11582774 - 11582731
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11582774 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 11582731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 18779374 - 18779417
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18779374 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 18779417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 22367865 - 22367908
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22367865 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22367908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 11212986 - 11213026
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11212986 tggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattgt 11213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23513693 - 23513653
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513693 tggtaaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 23513653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 29192004 - 29192044
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29192004 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 29192044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 21074870 - 21074913
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  21074870 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaacgacattgt 21074913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 21933512 - 21933586
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21933512 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 21933586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 21939682 - 21939756
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21939682 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 21939756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35581180 - 35581106
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  35581180 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 35581106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 37010516 - 37010590
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  37010516 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 37010590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 4201347 - 4201389
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  4201347 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 4201389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 246
Target Start/End: Original strand, 25192390 - 25192420
Alignment:
Q  216 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25192390 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 25192420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 16183094 - 16183313
Alignment:
Q  26 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | ||||||||||||||    
T  16183094 ccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgta 16183192  T
Q  126 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16183193 tgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgatgaaactatatgtgata 16183292  T
Q  226 gttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16183293 gttgatgttgaatgacattgt 16183313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18909869 - 18909656
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18909869 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 18909771  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909770 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 18909671  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  18909670 agttgatgttgaatg 18909656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53769840 - 53769627
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  53769840 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 53769742  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53769741 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 53769642  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  53769641 agttgatgttgaatg 53769627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 50113218 - 50113436
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  50113218 gccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgt 50113314  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50113315 atgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 50113414  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50113415 agttgatgttgaatgacattgt 50113436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 6147927 - 6148145
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |   |||||||| |||||||||| ||    
T  6147927 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataagtgaagtggt 6148023  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6148024 atgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatacttgaatggtgaaactatatatgat 6148123  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6148124 agttgatgttgaatgacattgt 6148145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22274155 - 22274011
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22274155 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22274056  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274055 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 2450374 - 2450518
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2450374 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaatgtaag 2450473  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450474 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2450518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13837938 - 13837733
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13837938 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 13837841  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13837840 atgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13837741  T
Q  225 agttgatg 232  Q
    ||||||||    
T  13837740 agttgatg 13837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17099789 - 17099569
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17099789 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 17099692  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  17099691 tatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 17099593  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  17099592 atagttaatgttgaatgacattgt 17099569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 22145362 - 22145578
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattctt-atatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  22145362 ttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatgactaagttaagttgtatga 22145460  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22145461 atgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaagatgtaaggaatgcttggatgatgaaactatatgtgatagtt 22145560  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| |||||||    
T  22145561 gatgttgaataacattgt 22145578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 17957375 - 17957520
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17957375 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatg 17957474  T
Q  191 taaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 235  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957475 taaggaatgcttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 17957520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 318695 - 318917
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  318695 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 318793  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg- 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  318794 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttacttaaggtgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 318893  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  318894 atagttgatgttgaatgacattgt 318917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 242
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786183
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa-agaatac 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaatgtaagagaatgc 47786140  T
Q  201 ttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786141 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 47786183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 12350934 - 12351148
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12350934 ccactcgatatggtttttgggtcggatatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg 12351032  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 230  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12351033 aatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 12351132  T
Q  231 tgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||||    
T  12351133 tgtggaataacattgt 12351148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49231326 - 49231180
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  49231326 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaatgtaa 49231227  T
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49231226 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgattatgaatga 49231180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 15469552 - 15469771
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |  ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  15469552 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgt 15469650  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15469651 atgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtga 15469749  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15469750 tagttgatgttgaatgacattg 15469771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16820019 - 16819882
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 193  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16820019 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 16819920  T
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819919 ggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16819882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35122763 - 35122541
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35122763 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaaattgt 35122666  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||     
T  35122665 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 35122566  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  35122565 gataaatgatgttgaatgacattgt 35122541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13816511 - 13816367
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13816511 ttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 13816412  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816411 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13816367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Original strand, 53899605 - 53899826
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53899605 cggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtat 53899703  T
Q  127 gaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt-gaatggtgaaactatatgtga 223  Q
     |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  53899704 aaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggaatggtgaaaccatatgaga 53899803  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||  ||||||||||||| |||||    
T  53899804 taaatgatgttgaatgatattgt 53899826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7852993 - 7852777
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | | || ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7852993 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatg 7852895  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 221  Q
    | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7852894 tgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 7852795  T
Q  222 gatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7852794 gatagttgatgttgaatg 7852777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 11198653 - 11198875
Alignment:
Q  26 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  |||| || |  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11198653 ccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttc-cttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaggttgta 11198751  T
Q  126 tgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||| |||||| |||||||||| |    
T  11198752 tgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgag 11198851  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  11198852 atagttaatgttgaatgacattgt 11198875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 12562563 - 12562781
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |     | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12562563 ttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 12562661  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatag 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| | |||    
T  12562662 tgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaaggaatgcttgaattggtaaaactatatgaggtag 12562761  T
Q  227 ttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12562762 ttgatgttgaatgacattgt 12562781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159669
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||  |    
T  51159475 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttg 51159573  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51159574 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatga 51159669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 11062184 - 11062340
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 190  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11062184 gtgactattctcatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatg 11062283  T
Q  191 taaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062284 taagaaatgcttgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11062340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Original strand, 19571932 - 19572075
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  19571932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 19572031  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19572032 gaattggtgaaactatatgtg-tagttgatgttgaatgacattgt 19572075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23491530 - 23491363
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  23491530 cttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 23491431  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacat 243  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23491430 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacat 23491363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14297574 - 14297353
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14297574 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14297477  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  14297476 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14297377  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  14297376 ataaatgatgttgaatgacattgt 14297353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14303201 - 14302980
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14303201 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14303104  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  14303103 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14303004  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  14303003 ataaatgatgttgaatgacattgt 14302980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 54423145 - 54423001
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54423145 ttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatga 54423048  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54423047 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8630920 - 8630701
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||  |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630920 gccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 8630822  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8630821 atgaatgaatgattgtttgaggcatgat-attatcatgagatgtgtatgctatcttgttcggaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgat 8630723  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |||| |||||||||| ||||    
T  8630722 aattgacgttgaatgactttgt 8630701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Original strand, 15860308 - 15860451
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  15860308 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 15860406  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15860407 gaattggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 15860451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40938736 - 40938586
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40938736 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttataatgtaaag 40938637  T
Q  196 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  40938636 aatgcttgaatggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattgt 40938586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14294434 - 14294284
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14294434 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 14294336  T
Q  196 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14294335 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 14294284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14300061 - 14299911
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14300061 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 14299963  T
Q  196 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14299962 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 14299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17937492 - 17937351
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 204  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || | |    
T  17937492 tatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttacataggatgtaagaaatgctagta 17937393  T
Q  205 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937392 ttggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 17937351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33340949 - 33340812
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  33340949 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 33340850  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  33340849 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 33340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25057856 - 25057701
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  25057856 gattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttacttaagatgta 25057757  T
Q  193 aagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25057756 aagaatgtttgaatttgcgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattgt 25057701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17138553 - 17138342
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17138553 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttat 17138456  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |  ||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17138455 atgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttgcatgttctcttacttaggatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 17138356  T
Q  221 tgatagttgatgtt 234  Q
     | |||||| ||||    
T  17138355 aggtagttgttgtt 17138342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 17523552 - 17523690
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  17523552 gccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatg-cttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaa-tgacgttgc 17523649  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17523650 atgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatga 17523690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15575002 - 15574896
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15575002 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15574904  T
Q  238 tgacattg 245  Q
    ||||||||    
T  15574903 tgacattg 15574896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15614021 - 15613915
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15614021 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15613923  T
Q  238 tgacattg 245  Q
    ||||||||    
T  15613922 tgacattg 15613915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19945700 - 19945481
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  19945700 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 19945602  T
Q  129 atgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||| || |||  | ||||||||||||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19945601 atgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgat 19945503  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  19945502 agttgatgttgaataacattgt 19945481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39654925 - 39654768
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||   |||||||||||||    
T  39654925 gtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaat 39654826  T
Q  190 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  39654825 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattgt 39654768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33340740 - 33340697
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33340740 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 33340697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38167070 - 38167007
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 143  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167070 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 38167007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16819802 - 16819760
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819802 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16819760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031233
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 51159742 - 51159782
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159742 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 51159782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Original strand, 14522487 - 14522538
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14522487 ttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaa 14522538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2048953 - 2048915
Alignment:
Q  208 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048953 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 2048915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2049038 - 2048969
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2049038 cttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737388
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 230  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggagtat-gagaatgcctgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 10737388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16260261 - 16260149
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||  |||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16260261 gccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgttt-cttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatgactaagtgaagttgt 16260163  T
Q  125 atgaatgaatgatt 138  Q
    |||||||| |||||    
T  16260162 atgaatgagtgatt 16260149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18909647 - 18909541
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18909647 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 18909549  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  18909548 gacattgt 18909541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19231036 - 19230968
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19231036 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53769618 - 53769512
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53769618 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 53769520  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  53769519 gacattgt 53769512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 2450590 - 2450633
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2450590 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 2450633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19230953 - 19230914
Alignment:
Q  207 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19230953 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacgttgt 19230914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22273939 - 22273896
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22273939 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22273896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031285
Alignment:
Q  208 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 12031285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 17957533 - 17957639
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17957533 ttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 17957631  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    | ||||||    
T  17957632 gtcattgt 17957639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 1468885 - 1468959
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1468885 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 1468959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7852705 - 7852662
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7852705 gaatagtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 7852662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44228354 - 44228281
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44228354 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 44228281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 8269673 - 8269707
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8269673 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 8269707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 8276784 - 8276818
Alignment:
Q  212 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8276784 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 8276818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 11883518 - 11883560
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11883518 aatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattgt 11883560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22273951 - 22273741
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273951 acttgatatgggttttgataggagatgttttattgagtcaattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22273852  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22273851 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22273753  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  22273752 tgaatgacattg 22273741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22283184 - 22282974
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22283184 acttgatatgggttttgattggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22283085  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22283084 gattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22282986  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  22282985 tgaatgacattg 22282974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 21275503 - 21275716
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21275503 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 21275601  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275602 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21275701  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  21275702 agttgatgttgaatg 21275716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 12643001 - 12643214
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12643001 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 12643099  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12643100 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 12643199  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  12643200 agttgatgttgaatg 12643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 42179342 - 42179555
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  42179342 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtggagttgt 42179440  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42179441 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 42179540  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  42179541 agttgatgttgaatg 42179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 19887825 - 19887969
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19887825 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 19887924  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887925 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 19887969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 36891794 - 36892015
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36891794 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 36891892  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 222  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36891893 atgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 36891991  T
Q  223 atagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  36891992 atagtcgatgttgaatgacattgt 36892015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21140987 - 21140843
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21140987 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 21140888  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140887 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 21140843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27260592 - 27260416
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27260592 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtg 27260493  T
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260492 tatgctatcatac-tagaatgcaagggatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 27260416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 3800036 - 3800195
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800036 cttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatct 3800135  T
Q  180 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800136 tacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16900361 - 16900224
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16900361 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16900262  T
Q  205 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16900261 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgaca 16900224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16993752 - 16993615
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16993752 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16993653  T
Q  205 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16993652 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgaca 16993615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6878513 - 6878298
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  6878513 ccacttgatatggtttttggtcggaaatattt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgtgtgaacga 6878415  T
Q  133 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    || ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6878414 ataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgttgaaactatatgtgatagttg 6878315  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| |||||||    
T  6878314 atgttgaataacattgt 6878298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 4449312 - 4449535
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4449312 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 4449410  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 221  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||| |     
T  4449411 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaaccatagga 4449510  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  4449511 gataaatgatgttgaatgacattgt 4449535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25211988 - 25211866
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211988 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 25211889  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaact 215  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  25211888 aggaatgcttgaatggtgaaact 25211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8942715 - 8942501
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8942715 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatga 8942617  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8942616 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttg 8942518  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8942517 atgttgaataacattgt 8942501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 12637255 - 12637469
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12637255 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatga 12637353  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12637354 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttg 12637452  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||    
T  12637453 atgttgaatgacattgt 12637469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581237
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttg 22581193  T
Q  204 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22581194 aattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 22581237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 270226 - 270035
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  270226 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaa 270129  T
Q  130 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  270128 tgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagagtgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatg 270035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34823309 - 34823165
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  34823309 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 34823211  T
Q  195 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34823210 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 34823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727126
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  12727270 gattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 12727172  T
Q  195 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727171 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 12727126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8887099 - 8886995
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8887099 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaaaatgtaagaaata-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8887001  T
Q  241 cattgt 246  Q
    ||||||    
T  8887000 cattgt 8886995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 24572526 - 24572695
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| || |||||| ||||||||| | |    
T  24572526 cttatgattgattgagaatattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttct 24572625  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  24572626 cttacttagaatgtgaggaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattgt 24572695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28973118 - 28972895
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||  |  |  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28973118 gccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 28973020  T
Q  125 atgaatgaatg----attgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatat 219  Q
    ||||| |||||    | |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||| |    
T  28973019 atgaacgaatggccaaatgt--tggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtgatcttacctaggatgtaaggaatgcttaaatggtaaaactatgt 28972922  T
Q  220 gtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||    
T  28972921 gaggtgtttgatgttgaatgacattgt 28972895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 9653983 - 9654140
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9653983 cttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatct 9654072  T
Q  180 tacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9654073 tacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 9654140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7320450 - 7320344
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7320450 ttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatg 7320351  T
Q  240 acattgt 246  Q
    |||||||    
T  7320350 acattgt 7320344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22862446 - 22862342
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22862446 ttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatga 22862348  T
Q  241 cattgt 246  Q
     |||||    
T  22862347 aattgt 22862342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20014131 - 20013975
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| | | |  | |||||| |||    
T  20014131 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt-ttttccctattacttggaa 20014033  T
Q  189 tgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20014032 tat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 20013975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Original strand, 20628580 - 20628647
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628580 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 20628647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 14907583 - 14907742
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  14907583 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 14907682  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14907683 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 14907742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23819191 - 23819032
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  23819191 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 23819092  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23819091 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 23819032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25600858 - 25600816
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600858 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 25600816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 244
Target Start/End: Original strand, 25877210 - 25877252
Alignment:
Q  202 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877210 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 25877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12727010 - 12726906
Alignment:
Q  144 ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 241  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12727010 ggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgac 12726911  T
Q  242 attgt 246  Q
    |||||    
T  12726910 attgt 12726906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Original strand, 22691175 - 22691257
Alignment:
Q  165 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22691175 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgt 22691257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Original strand, 22695822 - 22695904
Alignment:
Q  165 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22695822 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgt 22695904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 22787108 - 22787331
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    | |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  22787108 gccgtttgccagttgatacggtaattg-tcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttatatgactaaatgaagatgt 22787205  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
     |||||||||  || ||  ||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| || |||| |||||    
T  22787206 gtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttaattagaatgtgagaaatacttgaaattgtaaaaccatatg 22787305  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     | ||||||||||||||||| |||||    
T  22787306 aggtagttgatgttgaatgatattgt 22787331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 24827831 - 24827873
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24827831 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 24827873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 461714 - 461646
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  461714 ttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 12643223 - 12643329
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12643223 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 12643321  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  12643322 gacattgt 12643329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 20628662 - 20628702
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628662 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgt 20628702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 19888041 - 19888084
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19888041 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 19888084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21140771 - 21140728
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21140771 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 21140728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 21275788 - 21275831
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21275788 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 21275831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 721407 - 721337
Alignment:
Q  177 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  721407 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgt 721337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34823093 - 34823051
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34823093 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 34823051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 3800257 - 3800302
Alignment:
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800257 agaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 242
Target Start/End: Original strand, 43644243 - 43644276
Alignment:
Q  209 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644243 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 43644276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12727118 - 12727020
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12727118 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgag-ctatatgtgatagttgatgttgaatg 12727021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 43644158 - 43644226
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43644158 ttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 11232484 - 11232558
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11232484 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 11232558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 22514331 - 22514405
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22514331 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 22514405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 28776932 - 28777006
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  28776932 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 28777006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 5889559 - 5889601
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5889559 aatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattgt 5889601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 24088566 - 24088672
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24088566 ttggatatgatatttatcataagatgtggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgatgttaaatg 24088665  T
Q  240 acattgt 246  Q
    | |||||    
T  24088666 atattgt 24088672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 461631 - 461591
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  461631 tggtgaaactatatctgatagctgatgttgaatgaaattgt 461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7650
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7827 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 7728  T
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7727 tatgctatcttacttagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattgt 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 32287 - 32496
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32287 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 32386  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32387 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 32484  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  32485 tgaatgacattg 32496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40557 - 40348
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40557 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 40458  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40457 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 40360  T
Q  234 tgaatgacattg 245  Q
    ||||||||||||    
T  40359 tgaatgacattg 40348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38522
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38372 ttgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 38471  T
Q  189 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38472 tgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 38522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 38594 - 38637
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38594 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 38637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 14842 - 15055
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 14940  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14941 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15040  T
Q  225 agttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  15041 agttgatgttgaatg 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15170
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15064 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15162  T
Q  239 gacattgt 246  Q
    ||||||||    
T  15163 gacattgt 15170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 137897 - 138117
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  137897 gccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgactaagtgaagttgt 137995  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  137996 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttac-taaaatgtaatgaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 138094  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  138095 tagttgatgttgaatgacattgt 138117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 87504 - 87295
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||            |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87504 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatg-tttcttgagccaatt------------gttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 87418  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  87417 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 87318  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  87317 tagttaatgttgaatgacattgt 87295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10522
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10740 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgactaagtgaagttgtataaa 10642  T
Q  130 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 226  Q
     ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  10641 cgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcatagaatgtggtatgtgctcttacttagaatgtaaggaatgattgaatggtaaaactatgtgaggtag 10542  T
Q  227 ttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  10541 ttgatattgaatgacattgt 10522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2145
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  1925 gccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 2023  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2024 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgataaaactatatgtgat 2123  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2124 agttgatgttgaatgacattgt 2145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13046
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12826 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 12924  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925 atgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13024  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13025 agttgatgttgaatgacattgt 13046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 181
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  400 gccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgtttt-ttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgactaagtgaatttgt 302  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  301 atgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttac-tagaatgtaatgaatgttgaaatggtgaaactatatgtgat 203  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  202 agttgatgttgaatgacattgt 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1367
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1518 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 1419  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 1367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 6087
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6303 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 6205  T
Q  132 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6204 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 6105  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| |||||||    
T  6104 gatgttgaataacattgt 6087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1220
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 1220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 246
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3098
Alignment:
Q  74 aattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatg 3024  T
Q  174 ctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3025 ctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6403
Alignment:
Q  54 cggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 153  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 cggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 6496  T
Q  154 tttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495 tttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44655
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44875 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaagtgaagttgt 44778  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777 atgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 44678  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44677 tagttgatgttgaatgatattgt 44655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39392 - 39178
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39392 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgt 39295  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39294 atgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 39195  T
Q  224 tagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  39194 tagttgatgttgaatga 39178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 39068
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 39085  T
Q  230 atgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||    
T  39084 atgttgaatgacattgt 39068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 78558 - 78408
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |    
T  78558 attcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-g 78460  T
Q  196 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  78459 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 78408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 20446 - 20601
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 190  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20446 ttgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatg 20545  T
Q  191 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20546 taagaaaaaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 20601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3479
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3695 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 3597  T
Q  132 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3596 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 3497  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| |||||||    
T  3496 gatgttgaataacattgt 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8309 - 8256
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatga 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  8309 gccacttgatatggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttatga 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 95545 - 95325
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  95545 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 95447  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  95446 atgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 95347  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  95346 agttgatgttgaatgacattgt 95325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 95219 - 95177
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  95219 aatggtgaaactatatgtgaaagttgatgttaaatgacattgt 95177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 129568 - 129353
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  129568 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 129470  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129469 tgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 129370  T
Q  224 tagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  129369 tagttgatgttgaatga 129353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 239
Target Start/End: Original strand, 89938 - 90075
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  89938 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 90037  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  90038 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 90075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 129281 - 129239
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129281 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 129239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 90147 - 90190
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  90147 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 90190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6148
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6292 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 6193  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 6033
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6076 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 6033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 246
Target Start/End: Original strand, 217016 - 217054
Alignment:
Q  208 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  217016 gtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgt 217054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47201 - 46982
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47201 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 47103  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47102 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 47003  T
Q  226 gttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  47002 gttgatgttgaatgacattgt 46982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 60649 - 60430
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60649 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 60551  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  60550 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 60451  T
Q  226 gttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  60450 gttgatgttgaatgacattgt 60430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 155402 - 155546
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  155402 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaatgtaag 155501  T
Q  195 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155502 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 155546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 155618 - 155661
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  155618 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 155661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1666
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  1507 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaact 1606  T
Q  180 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1607 tacttataatgtaaggaatggttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3516
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692 agtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtg 3593  T
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3592 tatgatatcttac-tataatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattgt 3516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13499
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13283 ttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 13381  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13382 tgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactaaatgtgatagtt 13481  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  13482 gatgtggaataacattgt 13499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29104 - 28888
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29104 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 29006  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29005 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatctgtgatagtt 28906  T
Q  229 gatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28905 gatgttgaatgacattgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28780 - 28740
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 28740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 43051 - 43263
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43051 ccacttgatatgatttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 43149  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43150 atgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaatcatatgtgatagttgatg 43249  T
Q  233 ttgaatgacattgt 246  Q
    || |||||||||||    
T  43250 tttaatgacattgt 43263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 237261 - 237038
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| ||| || | |||||||||||||    
T  237261 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataactaagtgaagttgt 237163  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  237162 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 237063  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  237062 gatagttgatgttgaataacattgt 237038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 271020 - 270978
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  271020 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 270978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2319
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2162 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtatgctat 2261  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 235  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 2319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2437
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2395 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 2437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 113652 - 113863
Alignment:
Q  34 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113652 cacttgataaggtttttggtcggaagtgttc-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaa 113750  T
Q  134 tgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatg 232  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  113751 tgattgtattgaatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatg 113849  T
Q  233 ttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||    
T  113850 ttgaatgacattgt 113863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 108739 - 108517
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  108739 gccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttgt 108642  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 221  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| || | |||||||||      
T  108641 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaagtgataaaactatataa 108542  T
Q  222 gatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  108541 ggtagttgatgttgaagaacattgt 108517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Original strand, 7781 - 7959
Alignment:
Q  69 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7781 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 7880  T
Q  169 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7881 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgt 7959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Original strand, 13170 - 13348
Alignment:
Q  69 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13170 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 13269  T
Q  169 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13270 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgt 13348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20351 - 20247
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 20253  T
Q  241 cattgt 246  Q
    ||||||    
T  20252 cattgt 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18267 - 18163
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18267 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18169  T
Q  241 cattgt 246  Q
    ||||||    
T  18168 cattgt 18163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13275 - 13055
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13275 gccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgttt-ctcgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatggctaagtgaatttgt 13178  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13177 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacctaggatgtaggaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 13078  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  13077 taattgatgttgaatgacattgt 13055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 145757 - 145533
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||    
T  145757 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaagttgt 145659  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata-tg 220  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| ||||||||||||| ||    
T  145658 atgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatattg 145559  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  145558 tgatagttgatgttaaatgaccttgt 145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 145438 - 145386
Alignment:
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  145438 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 145386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 147769 - 147698
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  147769 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 17485 - 17697
Alignment:
Q  26 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 125  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17485 ccggtagcaacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgta 17583  T
Q  126 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17584 tgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgat 17683  T
Q  225 agttgatgttgaat 238  Q
    ||||||||||||||    
T  17684 agttgatgttgaat 17697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 23903 - 24116
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  23903 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaagttgt 24001  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24002 atgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 24101  T
Q  224 tagttgatgttgaat 238  Q
    || ||||| ||||||    
T  24102 taattgatattgaat 24116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 52361 - 52580
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  52361 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 52458  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  52459 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 52557  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52558 tagttgatgttgaatgacattgt 52580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 56313 - 56532
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  56313 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 56410  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 223  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  56411 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 56509  T
Q  224 tagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  56510 tagttgatgttgaatgacattgt 56532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 18510 - 18736
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgatta-ttcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18510 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtgaagttg 18608  T
Q  124 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatc-ttacttagaatgtaaagaatacttgaatgg-tgaaactata- 218  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||     
T  18609 tatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctttacttaggatgtaagaaatgtttgaatggatgaaactatat 18708  T
Q  219 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 18736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Original strand, 18831 - 18883
Alignment:
Q  194 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18831 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 18883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 195
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  345 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 246  T
Q  197 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 46
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  86 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 935
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 978  T
Q  197 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15333 - 15191
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  15333 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaatgtaagga 15234  T
Q  197 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 15191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 12021
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12129 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 12031  T
Q  125 atgaatgaat 134  Q
    ||||||||||    
T  12030 atgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 765
Alignment:
Q  28 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  984 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacgactaagtgaagttgtatg 887  T
Q  128 aatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgat 224  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  | ||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| |||    
T  886 aatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttagactgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgagat 787  T
Q  225 agttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  786 agttaatgttgaatgacattgt 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17618
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17764 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagactgta 17665  T
Q  193 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17664 aggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17545 - 17503
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17545 aatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattgt 17503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54486
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54653 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtatgctat 54554  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54553 cttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 54486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 109344 - 109387
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  109344 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 109387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Original strand, 14590 - 14645
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgat 152  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14590 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgat 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28028 - 27878
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |  |    
T  28028 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttacttggaatat-ga 27930  T
Q  195 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27929 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgt 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 2740 - 2882
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2740 attcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 2839  T
Q  197 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2840 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 246
Target Start/End: Original strand, 2958 - 2996
Alignment:
Q  208 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2958 gtgaaactaaatgtgatagtttatgttgaatgacattgt 2996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23929
Alignment:
Q  46 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 145  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||| || || | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24128 tttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattga 24031  T
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24030 atatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacatt 23931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 146005 - 145782
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||||||| ||||||     | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  146005 gccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttc-ctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttg 145907  T
Q  124 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 220  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  145906 tataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaattcttgaattggtaaaactatatg 145807  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     |||||| |||| |||||||||||||    
T  145806 agatagtggatg-tgaatgacattgt 145782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Original strand, 5770 - 5915
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||    
T  5770 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaaggttt 5869  T
Q  203 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5870 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgt 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 11062 - 11231
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  11062 cttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtatgctat 11161  T
Q  178 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||   |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11162 cttacttgagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21515
Alignment:
Q  44 ggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 21598  T
Q  144 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21597 ggatatgatg--------------------ctatcttacttagaatgtaaggaatgctttaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Original strand, 129390 - 129451
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  129390 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18410 - 18263
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18410 gccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgt 18312  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18311 atgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30127 - 30044
Alignment:
Q  164 aatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30127 aatgtgtatgctatcttacttaggatgcaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 30044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8424 - 8289
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  ||||| |||||    
T  8424 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacctaggatgtaagatatgtttgaattggtg 8325  T
Q  211 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8324 aaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 8289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1672
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttgcatagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 2540 - 2763
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||||   |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2540 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatgactaagtgaagttgt 2637  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 220  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  ||| |||||  | ||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||    
T  2638 atgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctctaacttagaatgtaaaaaatgtttgaaatggtaaaactatatg 2737  T
Q  221 tgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  2738 aggtagttgatgttgaatgacattgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 14350 - 14556
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  | || |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||| ||    
T  14350 gccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggt 14448  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 223  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  14449 atgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtga 14547  T
Q  224 tagttgatg 232  Q
    |||||||||    
T  14548 tagttgatg 14556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28354
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28394 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 28354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40350
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40390 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 40350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28503
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28545 aatggtgaaattatatgtgataattgatgttgaatgacattgt 28503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40541 - 40499
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40541 aatggtgaaattatatgtgatatttgattttgaatgacattgt 40499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Original strand, 248741 - 248845
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248741 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatga 248839  T
Q  241 cattgt 246  Q
    ||||||    
T  248840 cattgt 248845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6749
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||     
T  6906 gtgactattcatatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 6807  T
Q  190 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  ||| |||| |||| | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6806 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 6749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 53593 - 53462
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53593 gccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 53496  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 159  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53495 atgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53203 - 53161
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  53203 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 53161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2285
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 189  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||     
T  2442 gtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 2343  T
Q  190 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||  ||| |||| |||| | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2342 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59579
Alignment:
Q  151 atgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattgt 59579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32541 - 32439
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 243  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32541 atatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacat 32442  T
Q  244 tgt 246  Q
    |||    
T  32441 tgt 32439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14613 - 14536
Alignment:
Q  170 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14613 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 14536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 317
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 195  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| || |    | |||||| |||| |   |    
T  467 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttcctattacttggaatatgg-g 369  T
Q  196 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  368 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41737 - 41677
Alignment:
Q  179 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41737 ttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 41677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41605 - 41563
Alignment:
Q  204 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41605 aatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgt 41563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2085
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatcatgagatgtgt 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 2038
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2078 tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1884
Alignment:
Q  69 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1817 gagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgtatga 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 2723 - 2882
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttaga 187  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |     
T  2723 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggg 2822  T
Q  188 atgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    || | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2823 atatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Original strand, 22940 - 23009
Alignment:
Q  177 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  22940 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattgt 23009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 5515 - 5676
Alignment:
Q  31 tgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaat 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5515 tgccacttgatacagtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaac 5613  T
Q  131 gaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 191  Q
    |||||| | ||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  5614 gaatgactatatgttggatgtgatg-ttatcatggaatgttgtatgtgctcttacttagaatgt 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6646
Alignment:
Q  177 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  6577 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattgt 6646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Original strand, 505 - 700
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  505 ccacttgatatcgttttaggtcggaaatgctt-cttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatga 603  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 231  Q
    ||||||||||||                  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  604 atgattgtattg------------------agatgagtatactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaac 685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6455
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6415 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 6455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt-tatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgttctatcatgagatgtgta 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7890
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7960 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21660 - 21501
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21660 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgttgtttttccctattacttgg 21561  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21560 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 21501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25915 - 25756
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  25915 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 25816  T
Q  187 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  25815 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 25756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4697
Alignment:
Q  209 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 4697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40502
Alignment:
Q  114 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40559 agtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatgaaatgtgta 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 17353 - 17396
Alignment:
Q  203 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17353 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 17396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Original strand, 330964 - 331021
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgt 154  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  330964 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgatgt 331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 413
Alignment:
Q  211 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Original strand, 4788 - 4849
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4788 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27818
Alignment:
Q  209 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27781 tgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattgt 27818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34466 - 34426
Alignment:
Q  206 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34466 tggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattgt 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38213 - 38139
Alignment:
Q  172 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 246  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38213 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 38139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University