View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6876A_low_445 (Length: 209)

Name: NF6876A_low_445
Description: NF6876A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6876A_low_445
NF6876A_low_445
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (15-190)||(45360076-45360251)
chr7 (15-190)||(6604264-6604439)
chr7 (15-190)||(23905462-23905637)
chr7 (15-190)||(34776171-34776346)
chr7 (15-190)||(39858452-39858627)
chr7 (15-190)||(27665256-27665431)
chr7 (15-190)||(29995726-29995901)
chr7 (15-190)||(37114738-37114913)
chr7 (15-190)||(38473334-38473508)
chr7 (15-190)||(13168822-13168997)
chr7 (20-190)||(38550480-38550650)
chr7 (15-190)||(22154639-22154814)
chr7 (15-190)||(22210554-22210729)
chr7 (15-190)||(24227631-24227806)
chr7 (15-190)||(35692560-35692735)
chr7 (15-190)||(46438720-46438895)
chr7 (15-190)||(37792244-37792419)
chr7 (15-190)||(47385425-47385595)
chr7 (63-178)||(48851545-48851660)
chr7 (61-187)||(35402573-35402699)
chr7 (107-187)||(69032-69112)
chr7 (63-188)||(48310750-48310877)
chr7 (61-111)||(66865-66915)
chr7 (116-187)||(20478921-20478992)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (15-187)||(39663994-39664166)
chr2 (10-190)||(40560978-40561158)
chr2 (15-190)||(14388312-14388487)
chr2 (15-190)||(19907489-19907664)
chr2 (15-188)||(6798264-6798437)
chr2 (15-187)||(16763704-16763876)
chr2 (26-190)||(2767683-2767847)
chr2 (15-190)||(17696965-17697140)
chr2 (15-179)||(39455918-39456081)
chr2 (15-161)||(44708996-44709142)
chr2 (15-109)||(42518524-42518618)
chr2 (61-110)||(6784579-6784628)
chr2 (61-110)||(24206831-24206880)
chr2 (79-137)||(37646238-37646296)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (15-190)||(7050498-7050673)
chr6 (15-190)||(20524126-20524301)
chr6 (15-190)||(11355948-11356123)
chr6 (15-187)||(32438293-32438465)
chr6 (15-190)||(7372193-7372367)
chr6 (61-179)||(18644058-18644176)
chr6 (15-190)||(10569141-10569314)
chr6 (77-186)||(32517672-32517781)
chr6 (15-132)||(6900225-6900342)
chr6 (116-190)||(33268081-33268155)
chr6 (125-190)||(6901999-6902064)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (15-190)||(27898324-27898499)
chr3 (15-186)||(2377755-2377926)
chr3 (15-190)||(30599417-30599592)
chr3 (15-187)||(41978487-41978659)
chr3 (15-190)||(43765880-43766055)
chr3 (15-190)||(2660973-2661148)
chr3 (15-190)||(21349453-21349628)
chr3 (15-190)||(23292379-23292554)
chr3 (15-190)||(44794958-44795133)
chr3 (15-190)||(44275426-44275601)
chr3 (15-187)||(2225385-2225555)
chr3 (61-187)||(35904938-35905064)
chr3 (15-190)||(51685350-51685525)
chr3 (15-188)||(610353-610526)
chr3 (15-184)||(7884109-7884278)
chr3 (15-190)||(42280246-42280422)
chr3 (15-190)||(17516069-17516244)
chr3 (15-190)||(48830034-48830209)
chr3 (73-187)||(54899250-54899364)
chr3 (15-184)||(46113226-46113395)
chr3 (15-190)||(46198479-46198653)
chr3 (61-187)||(38192486-38192612)
chr3 (61-187)||(46609751-46609877)
chr3 (61-187)||(46309796-46309922)
chr3 (61-187)||(53093226-53093352)
chr3 (63-169)||(24845668-24845776)
chr3 (15-141)||(53190118-53190247)
chr3 (137-187)||(53188913-53188963)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (15-190)||(41760937-41761112)
chr4 (15-190)||(49523871-49524046)
chr4 (15-190)||(42981359-42981534)
chr4 (15-190)||(35402878-35403053)
chr4 (15-190)||(48645957-48646130)
chr4 (16-190)||(43520178-43520352)
chr4 (15-184)||(51012666-51012835)
chr4 (15-190)||(11255140-11255315)
chr4 (15-190)||(54386880-54387055)
chr4 (15-190)||(2692496-2692671)
chr4 (64-190)||(11640838-11640964)
chr4 (15-190)||(41782261-41782436)
chr4 (61-187)||(319875-320001)
chr4 (61-187)||(4172715-4172841)
chr4 (61-187)||(33265370-33265496)
chr4 (15-168)||(11602416-11602569)
chr4 (61-187)||(43508013-43508139)
chr4 (65-154)||(52867414-52867503)
chr4 (65-187)||(834268-834389)
chr4 (65-110)||(5438574-5438618)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (15-187)||(7268584-7268756)
chr5 (15-190)||(2180514-2180688)
chr5 (15-190)||(12737844-12738019)
chr5 (15-190)||(12800667-12800842)
chr5 (15-190)||(8540410-8540585)
chr5 (11-190)||(32135044-32135223)
chr5 (15-190)||(2853478-2853653)
chr5 (15-166)||(24540425-24540576)
chr5 (15-190)||(28821119-28821294)
chr5 (15-190)||(30464847-30465022)
chr5 (15-187)||(21841740-21841912)
chr5 (101-190)||(41494652-41494741)
chr5 (61-187)||(42472696-42472821)
chr5 (116-187)||(40781430-40781501)
chr5 (116-185)||(29620955-29621024)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (15-190)||(27691905-27692080)
chr8 (15-185)||(38547966-38548136)
chr8 (15-187)||(8609020-8609192)
chr8 (15-190)||(41041794-41041969)
chr8 (15-190)||(42942533-42942708)
chr8 (15-189)||(40338891-40339065)
chr8 (15-179)||(13107594-13107758)
chr8 (63-190)||(26239652-26239779)
chr8 (63-189)||(9672386-9672512)
chr8 (15-190)||(33708020-33708195)
chr8 (15-189)||(22272998-22273172)
chr8 (15-190)||(7744341-7744516)
chr8 (26-190)||(41824881-41825045)
chr8 (15-187)||(13283135-13283302)
chr8 (75-190)||(5037235-5037350)
chr8 (61-187)||(33761672-33761798)
chr8 (61-187)||(35510201-35510327)
chr8 (15-162)||(13485351-13485493)
chr8 (61-187)||(29237979-29238105)
chr8 (61-187)||(600838-600964)
chr8 (76-184)||(3152755-3152863)
chr8 (61-187)||(15307078-15307203)
chr8 (61-187)||(15487447-15487572)
chr8 (61-187)||(27405356-27405481)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (15-187)||(34777350-34777522)
chr1 (15-190)||(50555312-50555488)
chr1 (15-190)||(3012663-3012838)
chr1 (15-190)||(6817926-6818101)
chr1 (15-187)||(4855179-4855351)
chr1 (15-187)||(26224766-26224938)
chr1 (15-190)||(31237716-31237891)
chr1 (15-190)||(51895375-51895550)
chr1 (15-190)||(2870338-2870513)
chr1 (15-190)||(46582798-46582973)
chr1 (15-190)||(15105185-15105360)
chr1 (61-187)||(27088073-27088199)
chr1 (63-190)||(52642846-52642971)
chr1 (77-190)||(25277585-25277698)
chr1 (63-187)||(33600365-33600489)
chr1 (77-186)||(37345137-37345246)
chr1 (61-187)||(8168544-8168670)
chr1 (77-190)||(45045713-45045826)
chr1 (116-187)||(9120855-9120926)
chr1 (116-187)||(47012255-47012326)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (15-190)||(107795-107970)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (15-190)||(9008-9183)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (15-190)||(301-476)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (15-190)||(4043-4218)
scaffold0058 (15-190)||(5215-5390)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 45360076 - 45360251
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45360076 acatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttatcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 45360175  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45360176 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaagacctatttgatggtattttcactaattttaggatcgatat 45360251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 6604264 - 6604439
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6604264 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagtaaatgtatgcacc 6604363  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6604364 aatgatcacagtgatatatgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 6604439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23905637 - 23905462
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23905637 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 23905538  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23905537 aaagatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 23905462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34776346 - 34776171
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34776346 acatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatctgagtgtctgtcttttagtttttactttgtttagcaaatgtatgcacc 34776247  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34776246 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagatctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 34776171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39858627 - 39858452
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39858627 acatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 39858528  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39858527 aatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtattttcactcatttgaggatcgatat 39858452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27665431 - 27665256
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27665431 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgcctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 27665332  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27665331 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 27665256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29995901 - 29995726
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29995901 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 29995802  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29995801 aaggatcacagtgatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 29995726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37114913 - 37114738
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37114913 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 37114814  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37114813 aaggattacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 37114738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38473508 - 38473334
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38473508 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgt-ttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcacc 38473410  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38473409 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 38473334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 13168822 - 13168997
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  13168822 acatcaaatatatgatttataatgatatgcaaatgtctgtatttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttattttgttcagcgaatgtatgcacc 13168921  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13168922 aaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatgttcactaatttgaggatcgatat 13168997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38550650 - 38550480
Alignment:
Q  20 aaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaagga 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38550650 aaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttattttgttcagcaaatgtatgcaccaagga 38550551  T
Q  120 tcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550550 tcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 38550480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 22154639 - 22154814
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22154639 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcacc 22154738  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22154739 atggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 22154814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 22210554 - 22210729
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22210554 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcacc 22210653  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22210654 atggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 22210729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24227806 - 24227631
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  24227806 acatcaaatatatgatttatgatggtatacaaatgtctgtctttttgtaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtacc 24227707  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24227706 aatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattaaatgtcctatttgatggtattttcactaatttgaggattgatat 24227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35692735 - 35692560
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  35692735 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttgctttttacttcgttcggcaaatatatgcacc 35692636  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35692635 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 35692560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46438895 - 46438720
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |       |||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  46438895 acattaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtccgtctttctataatcaaagtgtttgtcttctactttttactctattcagcaaatgtatccacc 46438796  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  46438795 aaggatcaaagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcacttatttgaggatcgatat 46438720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37792419 - 37792244
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||       | ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  37792419 acatcaaatgtatgacatatgatggtaagcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtctttgacttttactttttactttgtacaacaaatgtatgcacc 37792320  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37792319 aatgatcacagtgatatatggtgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcaatat 37792244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47385595 - 47385425
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||       | |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  47385595 acatcaaatgtatcagttatgatggtatgtaaatgtctgtctttttacaatcaatgtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcat- 47385497  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
       ||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47385496 ---gatcaca-tgatgtatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtaatttcactaatttggggatcgatat 47385425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48851660 - 48851545
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  48851660 aatcaaagtgtctgtcttttactttttactttggtcagcaaatgtatgccccaaggatcacaatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatg 48851561  T
Q  163 gtattttcactaattt 178  Q
      ||||||||||||||    
T  48851560 agattttcactaattt 48851545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35402699 - 35402573
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  35402699 ataatcaaagtgtttatcttttacattttactttgttcagcaaatatatgctcaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 35402600  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  35402599 tgatattttcactaatttgaggatcga 35402573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Original strand, 69032 - 69112
Alignment:
Q  107 tatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  69032 tatgcaccaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 69112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Original strand, 48310750 - 48310877
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtcttttagtttt-taccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgat 161  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  48310750 aatcaaagtgtctgtctttttattttctactttgttcagcaaatatatgtagcaaagatcatattgatatatgttgtgataattcaatgacttatttgat 48310849  T
Q  162 ggta-ttttcactaatttggggatcgat 188  Q
    | || ||||||||||||| || ||||||    
T  48310850 gatatttttcactaatttaggaatcgat 48310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 111
Target Start/End: Original strand, 66865 - 66915
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgc 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  66865 ataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgc 66915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Original strand, 20478921 - 20478992
Alignment:
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20478921 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcga 20478992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39664166 - 39663994
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39664166 acatcaaatatatgatttatgatggtatgcagatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 39664067  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39664066 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 39663994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 40560978 - 40561158
Alignment:
Q  10 gatggacatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtat 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||       ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40560978 gatgaacatcaaatatatgatttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatggcttttactttttactttgttcagcaaatgtat 40561077  T
Q  110 gcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40561078 gcaccaaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 40561158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14388487 - 14388312
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14388487 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 14388388  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14388387 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatagtattttcactaatttgaggatcgatat 14388312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19907664 - 19907489
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19907664 acatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 19907565  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19907564 aatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtattttcactcatttgaggatcgatat 19907489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 6798264 - 6798437
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6798264 acatcaaatatataacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcatcaaatgtatgcacc 6798363  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgat 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6798364 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggtattttcactaatttgaggatcgat 6798437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 16763704 - 16763876
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||       ||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16763704 acatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactctgttcagcaaatgtatgcacc 16763803  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16763804 aaggatcacagtgatatctgttgtgtaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 16763876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Original strand, 2767683 - 2767847
Alignment:
Q  26 atgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacag 125  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||       |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2767683 atgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagagtttgtcttttactttttactttgttcagaaaatgtatgcaccaaggatcacag 2767782  T
Q  126 tgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2767783 tgatatctattgtgaaaattcaaggaccaatttgatggtattttcactaaattgaggatcgatat 2767847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 17696965 - 17697140
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||       ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  17696965 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttctactttttactttgttcaacaaatgtatccacc 17697064  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  17697065 aaggatcatagtgatgtatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaccaattttaggatcgatat 17697140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 39455918 - 39456081
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||       ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39455918 acatcaagtatatgacttatgatggtatacaaatgtctgtctttttataatcaaagt-tctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 39456016  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttg 179  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39456017 aaggatcatagtgatatctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatgatattttcactcatttg 39456081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44709142 - 44708996
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44709142 acatcaaatatatgtcttatgatggtatgcaaatgtctgcatttttataatcaaagtgtctgtctttgactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 44709043  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgat 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||    
T  44709042 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggaccaatttgat 44708996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 42518618 - 42518524
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtat 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42518618 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtat 42518524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6784628 - 6784579
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6784628 ataatcaaagtgtttgtcttttacttttgactttgttcagcaaatgtatg 6784579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24206880 - 24206831
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatg 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24206880 ataatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatg 24206831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 37646238 - 37646296
Alignment:
Q  79 ttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttg 137  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||    
T  37646238 ttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaagatcacattaagatatgttg 37646296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 7050498 - 7050673
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7050498 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 7050597  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050598 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 7050673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 20524126 - 20524301
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20524126 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 20524225  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20524226 aaggatcatagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 20524301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 11355948 - 11356123
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11355948 acatcaaatatatgactaatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 11356047  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11356048 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaatttgaggatcgatat 11356123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32438465 - 32438293
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32438465 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatggacc 32438366  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32438365 aaggatcatagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 32438293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7372367 - 7372193
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7372367 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcacc 7372268  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7372267 aaggatcacagtgat-tcgattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 7372193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Original strand, 18644058 - 18644176
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  18644058 ataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttga 18644157  T
Q  161 tggtattttcactaatttg 179  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18644158 tggtattttcactaatttg 18644176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 10569141 - 10569314
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||        | ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10569141 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctatctttttacaatcaaagtgtctgttttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcacc 10569240  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569241 aaggatcacaatgatatatgt--tgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 10569314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 32517672 - 32517781
Alignment:
Q  77 tcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaat 176  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  32517672 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggaactatttgatggtattttcactaat 32517771  T
Q  177 ttggggatcg 186  Q
    ||| ||||||    
T  32517772 ttgaggatcg 32517781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 6900225 - 6900342
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6900225 acatcaaatgtatgacttataatggtatgcaaatgtctgtccttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgaacc 6900324  T
Q  115 aaggatcacagtgatata 132  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6900325 aaggatcacagtgatata 6900342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33268155 - 33268081
Alignment:
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33268155 aggatcacattgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcaataatttagggatcgatat 33268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Original strand, 6901999 - 6902064
Alignment:
Q  125 gtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6901999 gtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatat 6902064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27898499 - 27898324
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27898499 acatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 27898400  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27898399 agggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 27898324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 2377755 - 2377926
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2377755 acatcaaatatatgatttatgatgatatgcaaatatttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 2377854  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcg 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2377855 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcg 2377926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30599592 - 30599417
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30599592 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttctgcaaatgtatgcacc 30599493  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30599492 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatat 30599417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 41978487 - 41978659
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41978487 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 41978586  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41978587 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 41978659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 43765880 - 43766055
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43765880 acatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 43765979  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  43765980 aaggatcatagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatagtattttcactaatttgatgatcgatat 43766055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 2660973 - 2661148
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2660973 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 2661072  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  2661073 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaaccaatttgaggatcgatat 2661148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 21349453 - 21349628
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21349453 acatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtctatctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 21349552  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21349553 aaggaccacagtgataattgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 21349628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23292554 - 23292379
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23292554 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcacc 23292455  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23292454 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatat 23292379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 44794958 - 44795133
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44794958 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtccgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 44795057  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  44795058 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 44795133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44275601 - 44275426
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  44275601 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgactgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttaatttttactttgttcagcaaatgtatgcatc 44275502  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44275501 aaggatcacaatgatatctattgtgaaaattcaagaacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 44275426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2225555 - 2225385
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2225555 acatcaaatatatgactt--gatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 2225458  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2225457 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 2225385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35905064 - 35904938
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  35905064 ataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttga 35904965  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35904964 tggtattttcactaatttgaggatcga 35904938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 51685350 - 51685525
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |       | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51685350 acatcaaatgtatgacttatgatggtttgcaaatgtccgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcacc 51685449  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51685450 aacgatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggattgatat 51685525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 610353 - 610526
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  610353 acatcaaatgtatgacttatgattatatgcaaatgtctgcttttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 610452  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgat 188  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  610453 aaggatcatagtgatttatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgat 610526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7884278 - 7884109
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||       ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7884278 acattaaatatatgacttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 7884179  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggat 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7884178 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggat 7884109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 42280246 - 42280422
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagttttt-accttgttcagcaaatgtatgcac 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42280246 acatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttttactttgttcagcaaatgtatgcac 42280345  T
Q  114 caaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42280346 caaggatcacaatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatat 42280422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 17516069 - 17516244
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||       ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17516069 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtatctgtcttttactttttactttgttaagcaaatgtatgcacc 17516168  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  17516169 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttttactaatttgagtatcgatat 17516244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48830209 - 48830034
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||       | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  48830209 acatcaaatatatgacttatgatgatatacaaatgtctgtctttttacaatcaaagtatatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcact 48830110  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48830109 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtattttcactaatttggagatcgatat 48830034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Original strand, 54899250 - 54899364
Alignment:
Q  73 tttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcac 172  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54899250 tttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcac 54899349  T
Q  173 taatttggggatcga 187  Q
    ||||||| |||||||    
T  54899350 taatttgaggatcga 54899364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 46113226 - 46113395
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46113226 acatcaaatgtatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 46113325  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggat 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  46113326 aaggatcacagtgatttatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtatcttcactaatttagggat 46113395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 46198479 - 46198653
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  46198479 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatc 46198578  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || ||||||| |||||| |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46198579 aaagatcacaatgatatctgttgt-aaaaatccaggacctatttgatggtatttttactaatttgaggatcgatat 46198653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38192612 - 38192486
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  38192612 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 38192513  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38192512 tggtattttcactaatttgaggatcga 38192486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46609877 - 46609751
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  46609877 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 46609778  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46609777 tggtattttcactaatttgaggatcga 46609751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 46309796 - 46309922
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  46309796 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 46309895  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46309896 tggtattttcactaatttgaggatcga 46309922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 53093352 - 53093226
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  53093352 ataatcaaagtatttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 53093253  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  53093252 tggtattttcactaatttgaggatcga 53093226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Original strand, 24845668 - 24845776
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtctttt--agtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  24845668 aatcaaagtgtatgtcttttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacattgatatatgttgtgataattcaaagacttatttga 24845767  T
Q  161 tggtatttt 169  Q
    |||||||||    
T  24845768 tggtatttt 24845776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 53190247 - 53190118
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttacc---ttgttcagcaaatgtatgc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||    
T  53190247 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatatgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttaataatttgttcagcaaatgtatgc 53190148  T
Q  112 accaaggatcacagtgatatatgttgtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53190147 accaaggatcacagtgatatctgttgtgaa 53190118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 53188963 - 53188913
Alignment:
Q  137 gtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  53188963 gtgaaaattcaatgacctatttgatgacattttcactaatttgaggatcga 53188913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41761112 - 41760937
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41761112 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 41761013  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41761012 aaggatcacagtgatatctggtatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 41760937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 49523871 - 49524046
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49523871 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtgtttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 49523970  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49523971 aaggatcacagttatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 49524046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 42981359 - 42981534
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42981359 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 42981458  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42981459 aaggatcacagtgatacctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttaaggatcgatat 42981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35403053 - 35402878
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35403053 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcgtttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 35402954  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35402953 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatat 35402878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48646130 - 48645957
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48646130 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtct--ctttttacaatcaaagtatttgtcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcacc 48646033  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48646032 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 48645957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 43520178 - 43520352
Alignment:
Q  16 catcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacca 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43520178 catcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacca 43520277  T
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  43520278 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggatctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 43520352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 51012666 - 51012835
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51012666 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 51012765  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggat 184  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51012766 aaggatcgcagtaatatctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggat 51012835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11255315 - 11255140
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  11255315 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgctcagcaaatgtatgcact 11255216  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11255215 aatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 11255140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 54386880 - 54387055
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54386880 acatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 54386979  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54386980 aagaattgcagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 54387055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2692671 - 2692496
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  2692671 acatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgaacc 2692572  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2692571 aaggatcacaatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggatcgatat 2692496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Original strand, 11640838 - 11640964
Alignment:
Q  64 atcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatgg 163  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  11640838 atcaaagtgtatgttttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattgaacgacttatttgattg 11640937  T
Q  164 tattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11640938 tattttcactaatttggagatcgatat 11640964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 41782261 - 41782436
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || | |||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41782261 acatcaaatatatgacttatgatagtgtgcatatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcacc 41782360  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  41782361 aaggatcacggtgatatctgttgtgaaaaatcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggattgatat 41782436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 320001 - 319875
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  320001 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 319902  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  319901 tggtattttcactaatttgaggatcga 319875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4172841 - 4172715
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  4172841 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 4172742  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4172741 tggtattttcactaatttgaggatcga 4172715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 33265370 - 33265496
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  33265370 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 33265469  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33265470 tggtattttcactaatttgaggatcga 33265496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 11602416 - 11602569
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  11602416 acatcaaatgtgtgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtttagcagatgtatgcacc 11602515  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  11602516 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattgaacgacttatttgattgtattt 11602569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 43508013 - 43508139
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  43508013 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatttgttatgataattcaaggaccaatttga 43508112  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  43508113 tggtatcttcactaatttgaggatcga 43508139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52867503 - 52867414
Alignment:
Q  65 tcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacct 154  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  52867503 tcaaagtgtctgtcttctactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacct 52867414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 834389 - 834268
Alignment:
Q  65 tcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| |||||||| |    
T  834389 tcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgtt 834291  T
Q  165 attttcactaatttggggatcga 187  Q
     |||| ||||||||  |||||||    
T  834290 ttttttactaatttaaggatcga 834268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Original strand, 5438574 - 5438618
Alignment:
Q  65 tcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  5438574 tcaaagtgtttgtctttta-ttttttctttgttcagcaaatgtatg 5438618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 7268584 - 7268756
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7268584 acatcaaatatatgacttatgatggtatgtaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 7268683  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7268684 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgttattttcactaatttgaggatcga 7268756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 2180514 - 2180688
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2180514 acatcaaagatatgatttatgatggtatgcaaa-gtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcatc 2180612  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2180613 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 2180688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 12737844 - 12738019
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||       ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12737844 acatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 12737943  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12737944 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttggtggtattttcactaatttgatgatcgatat 12738019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 12800667 - 12800842
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||       ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12800667 acatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 12800766  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12800767 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttggtggtattttcactaatttgatgatcgatat 12800842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 8540410 - 8540585
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8540410 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcacc 8540509  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8540510 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatat 8540585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32135223 - 32135044
Alignment:
Q  11 atggacatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32135223 atggacatcaaatatatgacttaggatgttatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatg 32135124  T
Q  111 caccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32135123 caccaaggatcacagtgatctccgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 32135044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2853653 - 2853478
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2853653 acatcaaatatatgacttatgataatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 2853554  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  2853553 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatat 2853478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24540576 - 24540425
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24540576 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 24540477  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24540476 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtat 24540425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 28821119 - 28821294
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||       ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28821119 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatatctgtctttttataatcaaaatgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatc 28821218  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28821219 aaagatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgttattttcactaatttgaggatcgatat 28821294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30465022 - 30464847
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30465022 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcacc 30464923  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30464922 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaattttaggatcgatat 30464847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 21841740 - 21841912
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  21841740 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttcttcagcaaatgtatgcact 21841839  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21841840 aagaatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 21841912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41494741 - 41494652
Alignment:
Q  101 caaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41494741 caaatatatgcactaaggattacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggaattatttgatggtattttcacaaatttggggatcaatat 41494652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42472821 - 42472696
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  42472821 ataatcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttga 42472723  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    || | |||| ||||||||  |||||||    
T  42472722 tgttttttttactaatttaaggatcga 42472696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Original strand, 40781430 - 40781501
Alignment:
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40781430 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcga 40781501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29621024 - 29620955
Alignment:
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatc 185  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29621024 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatc 29620955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 27691905 - 27692080
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27691905 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 27692004  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27692005 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 27692080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Original strand, 38547966 - 38548136
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38547966 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 38548065  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatc 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38548066 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatc 38548136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8609192 - 8609020
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8609192 acatcaaatagatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 8609093  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8609092 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 8609020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41041969 - 41041794
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41041969 acatcagatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 41041870  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41041869 aaggatcacaatggtatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 41041794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 42942533 - 42942708
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42942533 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcacc 42942632  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42942633 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaataatttgaggatcgatat 42942708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40339065 - 40338891
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  40339065 acatcaaatatatgagttatgatggtatgcaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaac 40338966  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgata 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40338965 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgattgtattttcactaatttgaggatcgata 40338891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13107758 - 13107594
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13107758 acatcaaatatatgacttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 13107659  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttg 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107658 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttg 13107594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26239779 - 26239652
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  26239779 aatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatg 26239680  T
Q  163 gtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239679 gtattttcactaatttggggatcgatat 26239652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9672512 - 9672386
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  9672512 aatcaaagtgtctgtcttttactttttagtttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatg 9672413  T
Q  163 gtattttcactaatttggggatcgata 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9672412 gtattttcactaatttggggatcgata 9672386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33708195 - 33708020
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||       ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33708195 acatcaaatatatgacttatgatgatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 33708096  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  33708095 aaggaacacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 33708020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 22272998 - 22273172
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22272998 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaattgcctgtctctttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 22273097  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgata 189  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22273098 aaagatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgata 22273172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7744516 - 7744341
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7744516 acatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 7744417  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||| || | ||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7744416 aagaataaaagtgaaatatgatgtgaaaattcaaggacttatttgatggtgttttcactaatttggggatcgatat 7744341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41825045 - 41824881
Alignment:
Q  26 atgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacag 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||       | ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41825045 atgatttatgatggtatgcaaatgtctggctttttacaatcacagtgtatatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagcatcacgg 41824946  T
Q  126 tgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41824945 tgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggatcaatat 41824881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 13283135 - 13283302
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13283135 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcacc 13283234  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13283235 aaggatcacagtgata-----tgtgaaaattcaaggacctatttgatcgtattttcactaatttgaggatcga 13283302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 5037235 - 5037350
Alignment:
Q  75 tgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcacta 174  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  5037235 tgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcacta 5037334  T
Q  175 atttggggatcgatat 190  Q
    ||||| ||||||||||    
T  5037335 atttgaggatcgatat 5037350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33761798 - 33761672
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  33761798 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttga 33761699  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33761698 tggtattttcactaatttgaggatcga 33761672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 35510201 - 35510327
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  35510201 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggaccacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttga 35510300  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35510301 tggtattttcactaatttgaggatcga 35510327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13485493 - 13485351
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||  |    
T  13485493 acatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgtttttt-ataatcaaagtgtttgtcttctactttttac----ttcagcaaatgtatgcctc 13485399  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatg 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13485398 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattgaaggacctatttgatg 13485351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 29237979 - 29238105
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  29237979 ataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttga 29238078  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29238079 tggtattttcactaatttgaggatcga 29238105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 600964 - 600838
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  600964 ataatcaaagtgtttctcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcacaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttga 600865  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  600864 tggtattttcactaatttgaggatcga 600838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3152863 - 3152755
Alignment:
Q  76 gtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaa 175  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||    
T  3152863 gtcttttactttttactttgttcagtagatgtatgcaccaaggatcacattgatttatgttgtgaaaattcaagaactgatttgatggtaatttcactaa 3152764  T
Q  176 tttggggat 184  Q
    |||||||||    
T  3152763 tttggggat 3152755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 15307078 - 15307203
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| || || ||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  15307078 ataatcaaagtgtttgtcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttga 15307176  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  15307177 tggtttttttactaatttaaggatcga 15307203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 15487447 - 15487572
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| || || ||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  15487447 ataatcaaagtgtttgtcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttga 15487545  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  15487546 tggtttttttactaatttaaggatcga 15487572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27405481 - 27405356
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  27405481 ataatcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttga 27405383  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    || | |||| ||||||||  |||||||    
T  27405382 tgttttttttactaatttaaggatcga 27405356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34777522 - 34777350
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34777522 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 34777423  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34777422 aaggatcacagtgatatctgttatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 34777350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50555488 - 50555312
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagttttt-accttgttcagcaaatgtatgcac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50555488 acatcaaatatatgatttatgatggcatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagttttttaccttgttcagtaaatgtatgcac 50555389  T
Q  114 caaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  50555388 caaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatat 50555312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3012838 - 3012663
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3012838 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 3012739  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3012738 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaatccaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatat 3012663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6818101 - 6817926
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6818101 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcacatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtctttcactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 6818002  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6818001 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaaaccaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 6817926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4855351 - 4855179
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4855351 acatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaattgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 4855252  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4855251 aaggattacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 4855179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26224938 - 26224766
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26224938 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 26224839  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26224838 aaggatcacagtgatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtcttttcactaatttgaggatcga 26224766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31237891 - 31237716
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||       ||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31237891 acatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgaatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 31237792  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31237791 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaatttgaggatcgatat 31237716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51895550 - 51895375
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51895550 acataaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 51895451  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51895450 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatat 51895375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 2870338 - 2870513
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2870338 acatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 2870437  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  2870438 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatat 2870513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46582973 - 46582798
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46582973 acatcaaatatattacttatgatggtatgaaaatatcagtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcagatgtatgcacc 46582874  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  46582873 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatat 46582798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 15105185 - 15105360
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||         ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15105185 acatcaaatatatgactcatgatggtatgcgaatgtctgtctttttgcaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 15105284  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105285 aaagatcacaatgatttatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 15105360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 27088073 - 27088199
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||    
T  27088073 ataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaagtcaaggacctatttga 27088172  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27088173 tggtattttcactaatttgaggatcga 27088199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52642971 - 52642846
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatg 162  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  52642971 aatcaaagtgt--gtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatg 52642874  T
Q  163 gtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52642873 gtattttcactaatttagggatcgatat 52642846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25277698 - 25277585
Alignment:
Q  77 tcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaat 176  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25277698 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 25277599  T
Q  177 ttggggatcgatat 190  Q
    ||| ||||||||||    
T  25277598 ttgaggatcgatat 25277585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33600489 - 33600365
Alignment:
Q  63 aatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||     
T  33600489 aatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgata 33600390  T
Q  163 gtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  33600389 gtattttcactaatttgaggatcga 33600365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 37345137 - 37345246
Alignment:
Q  77 tcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaat 176  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  37345137 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggaactatttgatggtattttcactaat 37345236  T
Q  177 ttggggatcg 186  Q
    ||| ||||||    
T  37345237 ttgaggatcg 37345246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8168670 - 8168544
Alignment:
Q  61 ataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||    
T  8168670 ataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttga 8168571  T
Q  161 tggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8168570 tggtattttcactaatttgaggatcga 8168544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45045826 - 45045713
Alignment:
Q  77 tcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaat 176  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45045826 tcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 45045727  T
Q  177 ttggggatcgatat 190  Q
    |||  |||||||||    
T  45045726 ttgaagatcgatat 45045713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9120926 - 9120855
Alignment:
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9120926 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcga 9120855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47012326 - 47012255
Alignment:
Q  116 aggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcga 187  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47012326 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcga 47012255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 107970 - 107795
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  107970 acatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 107871  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  107870 aatgatcacagtgatttatattgtgaaaatttaaggacttatttgatggtattttcactaatttagggatcgatat 107795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 9008 - 9183
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  9008 acatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcggcagatgtatgcacc 9107  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9108 aaggatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatat 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 301 - 476
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  301 acatcaaatatatgactcctgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcggcaaatgtatgcacc 400  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  401 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaatttgaggatcgatat 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 4043 - 4218
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4043 acatcaaatatatgacttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 4142  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  4143 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatat 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 5215 - 5390
Alignment:
Q  15 acatcaaatatatgatttatgatggtatgtaaatgtctgnnnnnnnataatcaaagtgtttgtcttttagtttttaccttgttcagcaaatgtatgcacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5215 acatcaaatatatgacttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacc 5314  T
Q  115 aaggatcacagtgatatatgttgtgaaaatttaaagacctatttgatggtattttcactaatttggggatcgatat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5315 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatat 5390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University