View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6876A_low_81 (Length: 359)

Name: NF6876A_low_81
Description: NF6876A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6876A_low_81
NF6876A_low_81
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (21-359)||(55551-55887)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (21-359)||(17086020-17086356)
chr8 (21-359)||(22963286-22963616)
chr8 (24-359)||(20501971-20502306)
chr8 (21-270)||(23667816-23668063)
chr8 (83-359)||(19154814-19155092)
chr8 (83-359)||(23943922-23944194)
chr8 (21-287)||(22253032-22253296)
chr8 (21-359)||(20533275-20533614)
chr8 (21-287)||(22995832-22996098)
chr8 (86-287)||(17438148-17438349)
chr8 (83-359)||(17439434-17439711)
chr8 (21-227)||(37515755-37515959)
chr8 (89-340)||(37116283-37116535)
chr8 (21-155)||(27941521-27941655)
chr8 (21-287)||(28397539-28397803)
chr8 (21-201)||(19808229-19808408)
chr8 (21-201)||(22237886-22238065)
chr8 (87-359)||(24352937-24353209)
chr8 (174-359)||(22525474-22525661)
chr8 (86-201)||(25363134-25363248)
chr8 (86-287)||(5083085-5083285)
chr8 (83-227)||(23659457-23659599)
chr8 (83-201)||(17460981-17461098)
chr8 (87-359)||(17266925-17267200)
chr8 (83-201)||(14397791-14397908)
chr8 (86-227)||(18833612-18833751)
chr8 (83-167)||(25484168-25484252)
chr8 (78-201)||(16799561-16799684)
chr8 (234-359)||(22419491-22419617)
chr8 (83-193)||(14103152-14103262)
chr8 (86-160)||(21346164-21346239)
chr8 (87-359)||(20498477-20498751)
chr8 (218-359)||(19929671-19929814)
chr8 (236-359)||(983486-983612)
chr8 (89-198)||(35026797-35026903)
chr8 (131-193)||(8728620-8728682)
chr8 (89-154)||(2418808-2418873)
chr8 (87-191)||(22364748-22364850)
chr8 (140-201)||(23409870-23409930)
chr8 (130-227)||(23914087-23914183)
chr8 (264-306)||(40492913-40492955)
chr8 (131-193)||(44476753-44476814)
chr8 (131-193)||(44480015-44480076)
chr8 (259-343)||(21580096-21580181)
chr8 (261-343)||(13665360-13665443)
chr8 (261-343)||(13724635-13724718)
chr8 (21-132)||(22525659-22525770)
chr8 (83-130)||(40492781-40492828)
chr8 (316-359)||(40493173-40493216)
chr8 (89-198)||(22419349-22419455)
chr8 (259-343)||(18302863-18302948)
chr8 (259-343)||(41681010-41681095)
chr8 (89-145)||(13508019-13508075)
chr8 (89-145)||(13597551-13597607)
chr8 (260-339)||(39936950-39937030)
chr8 (123-164)||(18024465-18024506)
chr8 (218-270)||(27941669-27941722)
chr8 (259-343)||(29763756-29763841)
chr8 (255-300)||(35026961-35027006)
chr8 (234-293)||(2418950-2419010)
chr8 (89-145)||(41598315-41598370)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (21-359)||(14852742-14853078)
chr4 (21-359)||(32306862-32307197)
chr4 (21-359)||(17333193-17333534)
chr4 (21-287)||(18212722-18212986)
chr4 (21-359)||(14825385-14825722)
chr4 (21-287)||(24047166-24047431)
chr4 (21-287)||(26050342-26050606)
chr4 (79-343)||(16042946-16043208)
chr4 (21-227)||(13591793-13591997)
chr4 (86-343)||(15041893-15042152)
chr4 (86-343)||(15112272-15112531)
chr4 (21-287)||(15791763-15792028)
chr4 (83-201)||(10056713-10056830)
chr4 (87-346)||(53082084-53082344)
chr4 (86-201)||(17048066-17048180)
chr4 (87-359)||(46640388-46640661)
chr4 (83-190)||(51463761-51463867)
chr4 (83-167)||(23803158-23803242)
chr4 (21-226)||(40907122-40907325)
chr4 (21-167)||(26789445-26789592)
chr4 (83-167)||(630597-630681)
chr4 (83-190)||(12611106-12611209)
chr4 (94-201)||(40906989-40907094)
chr4 (128-287)||(26045268-26045425)
chr4 (94-200)||(4831475-4831580)
chr4 (94-200)||(4834770-4834875)
chr4 (259-343)||(19738172-19738257)
chr4 (109-200)||(14047715-14047805)
chr4 (236-359)||(13931-14057)
chr4 (259-343)||(15364994-15365079)
chr4 (259-359)||(50160069-50160170)
chr4 (109-200)||(30146462-30146552)
chr4 (83-296)||(52243122-52243337)
chr4 (142-244)||(14185012-14185112)
chr4 (259-343)||(10357379-10357464)
chr4 (259-343)||(27995836-27995921)
chr4 (141-201)||(14746570-14746629)
chr4 (252-343)||(19435656-19435748)
chr4 (259-340)||(13036654-13036736)
chr4 (259-343)||(19609352-19609437)
chr4 (97-160)||(19738362-19738425)
chr4 (88-146)||(13784-13842)
chr4 (236-359)||(12288290-12288416)
chr4 (315-349)||(14650631-14650665)
chr4 (259-300)||(10357323-10357364)
chr4 (88-145)||(18215253-18215309)
chr4 (170-227)||(19857571-19857627)
chr4 (236-296)||(43198635-43198696)
chr4 (88-145)||(51463847-51463903)
chr4 (259-342)||(20635-20719)
chr4 (252-343)||(19734374-19734466)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (25-359)||(11768789-11769119)
chr7 (21-287)||(9033212-9033478)
chr7 (21-287)||(42461938-42462203)
chr7 (21-287)||(11661261-11661525)
chr7 (86-359)||(20619297-20619570)
chr7 (21-287)||(18607443-18607707)
chr7 (26-286)||(14421940-14422200)
chr7 (21-287)||(130682-130949)
chr7 (21-201)||(14566243-14566422)
chr7 (21-201)||(18872401-18872580)
chr7 (31-277)||(11525440-11525686)
chr7 (21-227)||(16008594-16008798)
chr7 (89-359)||(9177600-9177871)
chr7 (21-287)||(16996211-16996475)
chr7 (122-359)||(18203729-18203965)
chr7 (21-359)||(17017334-17017660)
chr7 (79-287)||(38519361-38519568)
chr7 (89-359)||(1867929-1868200)
chr7 (235-349)||(11772372-11772486)
chr7 (89-359)||(20220124-20220393)
chr7 (83-359)||(48991096-48991372)
chr7 (21-201)||(46580542-46580721)
chr7 (21-165)||(9725526-9725670)
chr7 (83-201)||(14273589-14273706)
chr7 (83-201)||(16998667-16998784)
chr7 (83-359)||(15008427-15008705)
chr7 (23-155)||(147704-147836)
chr7 (86-241)||(14157036-14157189)
chr7 (86-201)||(14258525-14258639)
chr7 (98-359)||(16091675-16091934)
chr7 (86-201)||(16460697-16460811)
chr7 (86-201)||(32301362-32301476)
chr7 (83-201)||(1858760-1858877)
chr7 (86-244)||(10501355-10501511)
chr7 (86-201)||(16579833-16579947)
chr7 (86-201)||(16585716-16585830)
chr7 (86-227)||(20487591-20487730)
chr7 (107-359)||(14044662-14044916)
chr7 (107-359)||(14354692-14354946)
chr7 (83-201)||(13918454-13918571)
chr7 (83-201)||(25927180-25927294)
chr7 (87-190)||(13647492-13647594)
chr7 (21-201)||(17060290-17060470)
chr7 (244-346)||(14323296-14323399)
chr7 (86-192)||(14929152-14929257)
chr7 (86-192)||(15352618-15352723)
chr7 (83-153)||(2529982-2530052)
chr7 (94-200)||(16109453-16109558)
chr7 (51-200)||(38828304-38828451)
chr7 (109-200)||(837311-837401)
chr7 (109-200)||(1202491-1202581)
chr7 (269-359)||(12901235-12901327)
chr7 (229-343)||(14183537-14183650)
chr7 (130-201)||(15720070-15720140)
chr7 (109-200)||(833315-833405)
chr7 (109-200)||(1198495-1198585)
chr7 (252-343)||(43277704-43277796)
chr7 (131-193)||(10896687-10896748)
chr7 (131-193)||(15167285-15167346)
chr7 (259-343)||(30821145-30821230)
chr7 (259-343)||(36686139-36686224)
chr7 (141-201)||(8940324-8940383)
chr7 (259-343)||(12128103-12128188)
chr7 (259-359)||(12371290-12371391)
chr7 (259-343)||(46387001-46387086)
chr7 (259-343)||(48811929-48812014)
chr7 (141-201)||(38898181-38898240)
chr7 (259-306)||(709431-709478)
chr7 (83-146)||(2280047-2280110)
chr7 (259-340)||(11066499-11066581)
chr7 (236-336)||(16056267-16056369)
chr7 (259-300)||(59331-59372)
chr7 (264-336)||(811242-811315)
chr7 (264-336)||(2280231-2280304)
chr7 (259-300)||(8852104-8852145)
chr7 (88-145)||(13647456-13647512)
chr7 (88-145)||(15081928-15081984)
chr7 (259-343)||(15281337-15281422)
chr7 (174-227)||(18279357-18279409)
chr7 (174-227)||(18283320-18283372)
chr7 (259-300)||(38480159-38480200)
chr7 (259-295)||(16462176-16462212)
chr7 (89-145)||(17061895-17061950)
chr7 (89-145)||(19486678-19486734)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (50-359)||(21237671-21237978)
chr2 (24-287)||(34136929-34137191)
chr2 (21-287)||(21073359-21073624)
chr2 (21-287)||(9241916-9242180)
chr2 (21-359)||(26392299-26392635)
chr2 (86-359)||(19201906-19202179)
chr2 (21-201)||(19662287-19662466)
chr2 (21-359)||(23287279-23287617)
chr2 (21-197)||(6261010-6261186)
chr2 (21-197)||(30643913-30644088)
chr2 (21-287)||(18546811-18547077)
chr2 (83-359)||(24697534-24697812)
chr2 (21-227)||(27472469-27472673)
chr2 (83-201)||(34874141-34874258)
chr2 (86-201)||(23069215-23069329)
chr2 (87-201)||(18358666-18358779)
chr2 (83-201)||(21081665-21081782)
chr2 (83-201)||(31345191-31345308)
chr2 (83-190)||(22173722-22173828)
chr2 (87-358)||(23791189-23791463)
chr2 (83-344)||(20520121-20520382)
chr2 (87-359)||(23207192-23207466)
chr2 (83-359)||(22413064-22413343)
chr2 (21-192)||(43947238-43947408)
chr2 (83-359)||(23004664-23004942)
chr2 (86-227)||(9784731-9784869)
chr2 (236-359)||(18786983-18787109)
chr2 (293-359)||(21115656-21115722)
chr2 (94-200)||(22703174-22703279)
chr2 (141-201)||(24671070-24671129)
chr2 (131-193)||(6482838-6482899)
chr2 (131-193)||(6486305-6486366)
chr2 (259-359)||(24781779-24781880)
chr2 (259-359)||(24815570-24815671)
chr2 (259-359)||(24834971-24835072)
chr2 (141-201)||(23707275-23707334)
chr2 (141-201)||(24918185-24918244)
chr2 (95-200)||(13101577-13101682)
chr2 (87-154)||(25109010-25109077)
chr2 (255-336)||(7833-7915)
chr2 (259-343)||(6576241-6576326)
chr2 (89-146)||(24529508-24529564)
chr2 (259-300)||(24865659-24865700)
chr2 (141-201)||(24681489-24681548)
chr2 (259-343)||(24436081-24436157)
chr2 (83-145)||(23708547-23708609)
chr2 (259-300)||(9974997-9975038)
chr2 (259-300)||(9975053-9975094)
chr2 (259-292)||(21367926-21367959)
chr2 (88-145)||(22173808-22173864)
chr2 (259-343)||(22500867-22500952)
chr2 (259-343)||(22508801-22508886)
chr2 (88-145)||(24642835-24642891)
chr2 (259-300)||(24883534-24883575)
chr2 (88-145)||(32039477-32039533)
chr2 (97-137)||(24834804-24834844)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (21-359)||(627-963)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (21-333)||(29290-29600)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (21-359)||(16493064-16493401)
chr6 (21-359)||(33442963-33443299)
chr6 (21-287)||(18453171-18453436)
chr6 (21-287)||(23838164-23838428)
chr6 (21-359)||(20223860-20224197)
chr6 (21-359)||(22117844-22118181)
chr6 (21-343)||(20136601-20136923)
chr6 (21-343)||(22195946-22196268)
chr6 (21-201)||(4476899-4477078)
chr6 (89-359)||(23076647-23076918)
chr6 (89-359)||(35008065-35008336)
chr6 (76-349)||(18204005-18204277)
chr6 (76-285)||(18199338-18199547)
chr6 (76-349)||(18177594-18177866)
chr6 (83-201)||(15817450-15817567)
chr6 (86-201)||(19773474-19773588)
chr6 (83-201)||(14979316-14979433)
chr6 (83-201)||(23414959-23415076)
chr6 (86-227)||(15705375-15705514)
chr6 (83-190)||(20556787-20556893)
chr6 (83-201)||(25619651-25619768)
chr6 (83-190)||(25754972-25755078)
chr6 (104-304)||(20182764-20182962)
chr6 (104-304)||(22153029-22153227)
chr6 (86-201)||(22806007-22806120)
chr6 (83-201)||(27556717-27556834)
chr6 (87-201)||(28103831-28103944)
chr6 (79-343)||(23528031-23528291)
chr6 (84-200)||(23539045-23539160)
chr6 (83-153)||(25752838-25752908)
chr6 (91-287)||(18896252-18896445)
chr6 (236-359)||(19668286-19668412)
chr6 (89-195)||(19362507-19362611)
chr6 (89-207)||(23538879-23538996)
chr6 (83-225)||(18706357-18706497)
chr6 (21-200)||(25738457-25738633)
chr6 (95-200)||(29416845-29416949)
chr6 (261-359)||(15895844-15895943)
chr6 (259-345)||(16245265-16245352)
chr6 (21-64)||(17229782-17229825)
chr6 (259-343)||(23083174-23083259)
chr6 (21-153)||(18696609-18696741)
chr6 (236-359)||(9098594-9098712)
chr6 (79-158)||(17105849-17105928)
chr6 (259-343)||(18708528-18708613)
chr6 (259-339)||(19829843-19829924)
chr6 (259-343)||(31733742-31733827)
chr6 (89-145)||(8227445-8227501)
chr6 (89-145)||(19847929-19847984)
chr6 (97-160)||(15896051-15896114)
chr6 (325-359)||(18453098-18453132)
chr6 (21-87)||(20078041-20078107)
chr6 (259-300)||(17319009-17319050)
chr6 (264-336)||(20109074-20109147)
chr6 (88-145)||(20556873-20556929)
chr6 (259-343)||(20734335-20734420)
chr6 (263-343)||(22376793-22376874)
chr6 (236-296)||(25644300-25644361)
chr6 (174-227)||(31477910-31477962)
chr6 (89-145)||(18456846-18456901)
chr6 (260-300)||(23151206-23151246)
chr6 (292-343)||(27573236-27573288)
chr6 (259-299)||(31733834-31733874)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (21-359)||(21809447-21809784)
chr5 (21-359)||(21731327-21731664)
chr5 (21-359)||(25575529-25575863)
chr5 (21-359)||(25574336-25574670)
chr5 (21-287)||(23469792-23470056)
chr5 (89-359)||(26740581-26740850)
chr5 (21-201)||(37598749-37598928)
chr5 (89-359)||(26732768-26733037)
chr5 (21-201)||(28370888-28371067)
chr5 (32-227)||(42960592-42960785)
chr5 (21-201)||(25576722-25576900)
chr5 (79-359)||(15796337-15796616)
chr5 (234-359)||(25578110-25578236)
chr5 (21-287)||(21328081-21328347)
chr5 (87-359)||(22178152-22178426)
chr5 (21-143)||(38145370-38145492)
chr5 (108-359)||(27988880-27989135)
chr5 (87-201)||(6765903-6766016)
chr5 (83-201)||(30138857-30138974)
chr5 (86-201)||(22107367-22107480)
chr5 (86-165)||(33895587-33895666)
chr5 (83-227)||(29448053-29448196)
chr5 (131-201)||(22336642-22336711)
chr5 (131-201)||(22340180-22340249)
chr5 (84-343)||(25743654-25743913)
chr5 (21-136)||(20572025-20572141)
chr5 (109-200)||(23538504-23538594)
chr5 (95-200)||(10816478-10816582)
chr5 (259-343)||(31454956-31455040)
chr5 (131-193)||(22750264-22750325)
chr5 (259-343)||(21555269-21555354)
chr5 (259-343)||(31455569-31455653)
chr5 (131-193)||(19511516-19511577)
chr5 (236-336)||(20027021-20027123)
chr5 (259-343)||(12122410-12122495)
chr5 (259-343)||(17875092-17875177)
chr5 (148-201)||(18356271-18356323)
chr5 (89-145)||(2154593-2154648)
chr5 (89-145)||(20901988-20902043)
chr5 (259-342)||(25250783-25250867)
chr5 (259-342)||(25314568-25314652)
chr5 (89-145)||(40725984-40726040)
chr5 (325-359)||(23202699-23202733)
chr5 (174-227)||(10753318-10753370)
chr5 (148-201)||(20910910-20910962)
chr5 (259-300)||(21557934-21557975)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (78-359)||(332234-332512)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (21-287)||(18034-18299)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (21-287)||(21043148-21043413)
chr1 (21-287)||(28312503-28312768)
chr1 (21-287)||(22124274-22124539)
chr1 (28-287)||(14800518-14800781)
chr1 (28-287)||(14809392-14809655)
chr1 (26-287)||(20437864-20438125)
chr1 (89-359)||(21533808-21534075)
chr1 (21-287)||(20958097-20958362)
chr1 (21-247)||(52940744-52940967)
chr1 (21-287)||(47190590-47190855)
chr1 (114-359)||(16381100-16381346)
chr1 (87-346)||(50614048-50614309)
chr1 (87-346)||(50621876-50622137)
chr1 (83-227)||(13881310-13881452)
chr1 (83-201)||(27653151-27653268)
chr1 (87-359)||(16368219-16368491)
chr1 (243-359)||(52954414-52954531)
chr1 (87-359)||(41049968-41050242)
chr1 (86-201)||(48603527-48603641)
chr1 (86-242)||(635914-636068)
chr1 (83-167)||(45574735-45574819)
chr1 (83-164)||(22130759-22130840)
chr1 (87-359)||(50686527-50686801)
chr1 (87-201)||(41781522-41781634)
chr1 (107-202)||(48520585-48520679)
chr1 (107-359)||(26064853-26065107)
chr1 (83-346)||(35261009-35261270)
chr1 (95-168)||(11945563-11945636)
chr1 (103-166)||(20329118-20329182)
chr1 (94-200)||(32649787-32649892)
chr1 (131-201)||(16372072-16372141)
chr1 (88-359)||(21896189-21896462)
chr1 (51-200)||(2332872-2333019)
chr1 (236-313)||(21861650-21861728)
chr1 (83-313)||(16758612-16758843)
chr1 (234-343)||(20634487-20634598)
chr1 (94-200)||(29534624-29534729)
chr1 (259-343)||(51274477-51274562)
chr1 (259-300)||(41227633-41227674)
chr1 (21-62)||(48520781-48520822)
chr1 (170-227)||(51326842-51326898)
chr1 (89-145)||(433137-433193)
chr1 (259-299)||(11809424-11809464)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (24-287)||(636-897)
scaffold0010 (83-307)||(60643-60868)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (21-287)||(10833971-10834235)
chr3 (85-359)||(316036-316309)
chr3 (21-359)||(13919245-13919583)
chr3 (21-201)||(23371339-23371518)
chr3 (21-201)||(51300636-51300815)
chr3 (21-201)||(14763593-14763772)
chr3 (21-287)||(9577614-9577876)
chr3 (21-287)||(15246007-15246273)
chr3 (33-277)||(32402839-32403081)
chr3 (21-287)||(15265128-15265394)
chr3 (21-154)||(9533416-9533549)
chr3 (21-201)||(324309-324488)
chr3 (83-359)||(12377837-12378114)
chr3 (21-287)||(15206925-15207191)
chr3 (21-343)||(37427638-37427968)
chr3 (112-359)||(43925874-43926123)
chr3 (83-201)||(52989651-52989768)
chr3 (89-225)||(28194743-28194878)
chr3 (86-201)||(12339780-12339894)
chr3 (86-201)||(14179445-14179559)
chr3 (86-201)||(43889558-43889672)
chr3 (83-201)||(14966243-14966360)
chr3 (86-227)||(14670972-14671111)
chr3 (86-227)||(14682471-14682610)
chr3 (86-202)||(12469974-12470089)
chr3 (86-201)||(16796560-16796674)
chr3 (83-201)||(5223378-5223495)
chr3 (21-145)||(29172494-29172618)
chr3 (89-201)||(54876322-54876433)
chr3 (86-201)||(10542364-10542478)
chr3 (83-190)||(50242985-50243091)
chr3 (83-201)||(16643246-16643363)
chr3 (87-346)||(37251100-37251360)
chr3 (94-201)||(18700247-18700353)
chr3 (83-190)||(43550371-43550477)
chr3 (83-201)||(15465149-15465266)
chr3 (21-200)||(8928297-8928474)
chr3 (86-201)||(21837499-21837612)
chr3 (89-201)||(17691644-17691754)
chr3 (92-188)||(44494893-44494988)
chr3 (88-359)||(22110285-22110558)
chr3 (89-287)||(23318650-23318845)
chr3 (136-285)||(36527734-36527882)
chr3 (94-200)||(34852596-34852701)
chr3 (131-193)||(20248741-20248803)
chr3 (176-359)||(606345-606531)
chr3 (94-201)||(14568899-14569007)
chr3 (136-235)||(3264997-3265094)
chr3 (131-193)||(38311759-38311820)
chr3 (259-359)||(22307522-22307623)
chr3 (259-343)||(31224843-31224928)
chr3 (259-343)||(31415282-31415367)
chr3 (141-201)||(11914003-11914062)
chr3 (24-64)||(18892967-18893007)
chr3 (321-359)||(323973-324011)
chr3 (259-343)||(5214946-5215031)
chr3 (259-343)||(15447886-15447971)
chr3 (259-343)||(40807024-40807109)
chr3 (259-343)||(40811839-40811924)
chr3 (259-343)||(41173258-41173343)
chr3 (252-332)||(13516434-13516514)
chr3 (89-145)||(17248221-17248276)
chr3 (89-145)||(24340657-24340713)
chr3 (89-145)||(37642199-37642255)
chr3 (259-306)||(6805837-6805884)
chr3 (170-201)||(11854715-11854746)
chr3 (253-300)||(52466427-52466474)
chr3 (259-300)||(5206542-5206583)
chr3 (88-145)||(8899221-8899277)
chr3 (259-300)||(17519788-17519829)
chr3 (259-300)||(17534650-17534691)
chr3 (259-300)||(30175453-30175494)
chr3 (236-296)||(52523809-52523870)
chr3 (94-146)||(2051138-2051190)
chr3 (259-299)||(15932393-15932433)
chr3 (24-64)||(18889741-18889781)
chr3 (252-343)||(50348982-50349074)
chr3 (94-146)||(52523666-52523718)
chr3 (89-145)||(53070633-53070688)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (21-359)||(22195-22532)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (21-359)||(13987-14324)
scaffold0005 (87-307)||(267629-267849)
scaffold0005 (315-349)||(166627-166661)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (86-345)||(7362-7619)
scaffold0111 (86-345)||(14481-14738)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (21-286)||(221074-221337)
scaffold0012 (79-146)||(225536-225603)
scaffold0012 (269-336)||(225388-225456)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (35-287)||(36169-36420)
scaffold0107 (21-201)||(9951-10130)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (21-268)||(17510-17756)
scaffold0293 (83-201)||(20139-20256)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (21-287)||(9588-9851)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (83-359)||(206453-206729)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (83-359)||(4625-4900)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-201)||(110728-110907)
scaffold0026 (259-343)||(145815-145900)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (89-312)||(30295-30518)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (21-287)||(132906-133170)
scaffold0019 (21-117)||(133796-133892)
scaffold0019 (86-151)||(29325-29390)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (68-287)||(1883-2101)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (30-287)||(19522-19777)
scaffold0106 (141-201)||(15225-15284)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (86-286)||(142571-142771)
scaffold0020 (83-201)||(169678-169795)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (89-359)||(96921-97193)
scaffold0006 (89-359)||(106199-106471)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (89-359)||(128904-129175)
scaffold0022 (87-359)||(78237-78510)
scaffold0022 (141-201)||(53825-53884)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (86-343)||(2602-2860)
scaffold0507 (87-196)||(7991-8100)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (86-287)||(927-1128)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (69-285)||(3858-4074)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (21-155)||(2359-2493)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (86-287)||(2945-3146)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (21-339)||(75695-76014)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (86-300)||(7420-7634)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (83-201)||(492-609)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (136-359)||(2578-2802)
scaffold0357 (83-359)||(16028-16306)
scaffold0357 (83-146)||(13259-13322)
scaffold0357 (83-120)||(2849-2886)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (86-201)||(126030-126144)
scaffold0011 (213-287)||(38208-38283)
scaffold0011 (315-359)||(125683-125727)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (21-227)||(209-413)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (174-346)||(2605-2779)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (83-201)||(24526-24643)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (83-201)||(105155-105272)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (86-227)||(6091-6230)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (86-227)||(902-1041)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (86-227)||(21216-21355)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (86-201)||(20825-20939)
scaffold0018 (259-359)||(7544-7645)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (86-244)||(8064-8220)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (83-201)||(1803-1920)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (83-201)||(39327-39444)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (97-201)||(15817-15920)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (91-359)||(25023-25290)
scaffold0123 (21-227)||(587-791)
scaffold0123 (28-138)||(6330-6438)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (87-359)||(19817-20091)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (241-359)||(2498-2617)
scaffold0708 (83-160)||(2355-2432)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (83-201)||(17648-17765)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (83-201)||(31198-31315)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (83-190)||(269-375)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (86-201)||(6686-6800)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (83-194)||(67342-67452)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (94-287)||(10152-10344)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (83-167)||(135-219)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (83-190)||(12221-12327)
scaffold0394 (88-145)||(12185-12241)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (21-192)||(1785-1958)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (28-359)||(11054-11392)
scaffold0040 (28-359)||(22154-22492)
scaffold0040 (236-359)||(103711-103837)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (86-227)||(120058-120197)
scaffold0034 (321-359)||(117095-117133)
scaffold0034 (264-336)||(32472-32545)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (83-167)||(3256-3340)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (21-167)||(3703-3849)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (89-198)||(101-209)
scaffold1419 (89-129)||(1-41)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (176-346)||(480-652)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (83-285)||(10464-10666)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (85-190)||(82235-82343)
scaffold0037 (174-227)||(80435-80487)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (119-201)||(15030-15111)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (97-226)||(29723-29851)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (147-287)||(3246-3385)
scaffold0108 (259-343)||(5490-5575)
scaffold0108 (21-64)||(3387-3430)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (97-287)||(16861-17048)
scaffold0046 (92-195)||(26016-26117)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (83-193)||(589-699)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (87-270)||(6215-6399)
scaffold0420 (308-359)||(13836-13888)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (87-254)||(38339-38506)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (82-201)||(85620-85739)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (86-160)||(13430-13502)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (109-227)||(7884-8000)
scaffold0278 (321-359)||(7572-7610)
[»] scaffold0737 (3 HSPs)
scaffold0737 (236-359)||(1878-2004)
scaffold0737 (87-153)||(1730-1796)
scaffold0737 (259-300)||(6566-6607)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (236-359)||(27829-27955)
scaffold0165 (83-133)||(27677-27727)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (92-287)||(57807-57999)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (107-195)||(6116-6203)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (94-200)||(146261-146366)
scaffold0021 (264-359)||(136493-136590)
scaffold0021 (264-359)||(145201-145298)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (252-359)||(11227-11335)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (109-200)||(48403-48493)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (259-359)||(4680-4781)
scaffold0379 (259-345)||(14726-14813)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (259-343)||(54945-55030)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (243-336)||(12507-12602)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (259-343)||(39190-39275)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (141-201)||(634-693)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (266-345)||(970-1050)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (141-201)||(1279-1338)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (141-201)||(15072-15131)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (252-343)||(20724-20816)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (87-167)||(18170-18250)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (141-227)||(4256-4340)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (321-359)||(7468-7506)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (315-357)||(15375-15417)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (255-359)||(53649-53755)
scaffold0075 (88-146)||(53482-53540)
scaffold0075 (259-342)||(60334-60418)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (236-296)||(1012-1073)
[»] scaffold1351 (2 HSPs)
scaffold1351 (89-154)||(127-192)
scaffold1351 (259-300)||(1488-1529)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (259-343)||(9697-9782)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (259-343)||(10773-10858)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (259-343)||(11700-11785)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (259-343)||(14218-14303)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (89-145)||(11595-11651)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (141-201)||(6889-6948)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (89-145)||(17961-18017)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (89-145)||(38190-38246)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (87-296)||(8006-8215)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (315-358)||(56792-56835)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (97-160)||(446608-446671)
scaffold0001 (259-300)||(76823-76864)
scaffold0001 (259-343)||(446417-446502)
scaffold0001 (58-158)||(163004-163103)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (91-145)||(9877-9930)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (88-145)||(1259-1315)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (260-343)||(19334-19419)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (174-227)||(58819-58871)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (145-201)||(6932-6987)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (259-299)||(8325-8365)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (89-145)||(79264-79319)


Alignment Details
Target: scaffold0077 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 55551 - 55887
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  55551 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 55650  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||  ||    
T  55651 tgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgatg 55748  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
     ||||||  ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||     
T  55749 gtgttgtaaattaattaagctgcatgaatcagtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagt 55848  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55849 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 55887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 17086020 - 17086356
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17086020 agttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagt 17086119  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  17086120 tgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttg-attattatttggtattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctattttg 17086217  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    || ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  17086218 cttttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagt 17086317  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17086318 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 17086356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 22963286 - 22963616
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||       |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  22963286 agttgacccttggggtaggaatggaagttgattatagtactgctaatgttcatagagtctaatat-------tttgatgttgttggtaatgtgatataat 22963378  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||| |||    
T  22963379 tgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtactgcctatgttg 22963477  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||     
T  22963478 ctgttgtatattaattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatattggagttaaataagatgtcgatgtttctaagatgtaagt 22963577  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  22963578 tgttgagtccaagaatactcattcatgttgggggcttga 22963616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Original strand, 20501971 - 20502306
Alignment:
Q  24 tgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  20501971 tgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttagtaatatgacatatttgt 20502070  T
Q  124 atatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||| ||||||    
T  20502071 atatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttg-gttatcatttgatattgttatatcttgagatatt-tatgtgctgcctatgttgctg 20502168  T
Q  224 ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggt 321  Q
    |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |    
T  20502169 ttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgttccaaattattggagtcatataagatgtcgatgttttctaagatgtaagtt 20502268  T
Q  322 gttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20502269 gttgagtccatgcatactcatccatgttgggggcttga 20502306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23668063 - 23667816
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23668063 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 23667964  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || | || |||    
T  23667963 tgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatggt-tatgtgctg-ccatgttg 23667866  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttg 270  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23667865 ctgttgtaaattaattaagctgcatgagtcagtcaagatgtaagatgttg 23667816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 19154814 - 19155092
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  | |||||||    
T  19154814 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tagcacttgatat 19154912  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgtt-ccaaatt 279  Q
    | |||||||| || ||||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  19154913 tattatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaaagatgttgtttccaaatt 19155012  T
Q  280 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19155013 attggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 19155092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 23943922 - 23944194
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  23943922 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttg-attatcacttgatat 23944020  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 281  Q
    | |||||||| || |||||  || || ||  ||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||    
T  23944021 tattatatctggatatgtt-aatgtgctgcatatgttgctgctgtctattaattaaactgcatgagtcgatctaagatgaaaga---tgttccaaattat 23944116  T
Q  282 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  23944117 tggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgtatacgcattcatgttgggggcttga 23944194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 22253032 - 22253296
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  22253032 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttagtaatgtgataaagt 22253131  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    | ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || |  ||||  ||    
T  22253132 tatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgtt-aattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tatatgtgctacctat-gtg 22253228  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     |||||  | |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22253229 ttgttgaatgttgactaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 22253296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 20533275 - 20533614
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  | |  | | ||||  |||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| |    
T  20533275 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttgatagtaatgtaatataat 20533374  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |  ||| ||| |||    
T  20533375 tgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatc-atcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgtttatgttg 20533473  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taa 318  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  20533474 ctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtatatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaa 20533573  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  20533574 gttgttgagtccatgaatattcattcatgttgggggcttga 20533614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22996098 - 22995832
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatata-atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||     
T  22996098 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaataatgtgatatag 22995999  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  | ||||| | | || || |||| ||    
T  22995998 ttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatctgaatatgttat-tgtgctgcctatgtt 22995901  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22995900 gctgttgtctagtaattaagctgtatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattgttggagt 22995832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 287
Target Start/End: Original strand, 17438148 - 17438349
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  17438148 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 17438247  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  17438248 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgtttctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagaggtcgttccaaagtgttgg 17438346  T
Q  285 agt 287  Q
    |||    
T  17438347 agt 17438349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 17439434 - 17439711
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||    
T  17439434 tataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatat 17439532  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    ||||||||| |||  |||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  17439533 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatgaaaaatgttgttccaaatta 17439632  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17439633 ttggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaagttgttaagttcatgcatactcattcatgtttggggcttga 17439711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37515959 - 37515755
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||| |||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  37515959 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatataat 37515860  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || |||| |||    
T  37515859 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgatatgtt-tatgtgctgcctatgttg 37515762  T
Q  221 ctgttgt 227  Q
    |||||||    
T  37515761 ctgttgt 37515755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116283
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 37116437  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||     
T  37116436 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaaaatgttgttccaaattattggat 37116337  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactc 340  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37116336 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagttcatgcatactc 37116283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 27941521 - 27941655
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27941521 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 27941620  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27941621 tgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28397803 - 28397539
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgtt-cactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |  || ||  ||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  28397803 agttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatatat 28397705  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatct 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||   |||| | | ||||| |||| |    
T  28397704 t-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttg-attattcttggatattgttatat-ttggattgttat-tgtgttgcctatgt 28397609  T
Q  219 tgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  28397608 tgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgtcgttccaaagtattggagt 28397539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 19808229 - 19808408
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19808229 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 19808328  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19808329 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 19808408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 22237886 - 22238065
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  22237886 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtattatatt 22237985  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237986 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 22238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24353209 - 24352937
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||  | |   |||||||||||    
T  24353209 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttga--tttgcattgatattgtt 24353112  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24353111 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 24353012  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24353011 atttatataagaggtccatgtt-ctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 24352937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22525661 - 22525474
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||  ||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22525661 atttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgtt 22525562  T
Q  273 ccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22525561 ctaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagttcatgcatactcattcatgttgggggcttga 22525474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 25363134 - 25363248
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  25363134 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 25363232  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  25363233 tatatcttgagatgtt 25363248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 287
Target Start/End: Original strand, 5083085 - 5083285
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  5083085 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgt 5083184  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| || | | |||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  5083185 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttg-tatatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttgg 5083282  T
Q  285 agt 287  Q
    |||    
T  5083283 agt 5083285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23659599 - 23659457
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  23659599 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 23659501  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  23659500 tgttatatctcaagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgt 23659457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 17460981 - 17461098
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  17460981 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 17461079  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  17461080 tgttatatctctagatgtt 17461098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 17266925 - 17267200
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||    
T  17266925 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 17267023  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||   ||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17267024 atatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 17267123  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| |||| | || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17267124 atttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 17267200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 14397791 - 14397908
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  14397791 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttg-attatcaattgatat 14397889  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14397890 tgttatatcttgagatgtt 14397908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18833751 - 18833612
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18833751 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttg-tttattatttgatattg 18833653  T
Q  185 ttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  18833652 ttatatc-tgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 18833612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 25484168 - 25484252
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484168 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 25484252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16799684 - 16799561
Alignment:
Q  78 tctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatt 176  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||    
T  16799684 tctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatt 16799586  T
Q  177 tgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  16799585 tgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 359
Target Start/End: Original strand, 22419491 - 22419617
Alignment:
Q  234 attaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccat 332  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22419491 attaagctgcatgagtcggtctatgatgtatgaagttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaagttgttgagtccat 22419590  T
Q  333 gcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||    
T  22419591 gcatacacattcatgttgggggcttga 22419617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 14103152 - 14103262
Alignment:
Q  83 tataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  14103152 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatg 14103250  T
Q  182 ttgttatatctt 193  Q
    ||||||||||||    
T  14103251 ttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 160
Target Start/End: Original strand, 21346164 - 21346239
Alignment:
Q  86 aatatgatttgat-gttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 160  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21346164 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20498751 - 20498477
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| || || || |||  |   ||||||||||||    
T  20498751 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgc-atttgatattgt 20498653  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattg 283  Q
    |||||| ||  || ||  |||   || |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20498652 tatatcatgctattttacatac--tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattg 20498555  T
Q  284 gagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || |||||||||| |||| |||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  20498554 gatttatataagaggtcgttgtttctaagatgctgagttgttgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttga 20498477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 359
Target Start/End: Original strand, 19929671 - 19929814
Alignment:
Q  218 ttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaag 315  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| | || |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||  |||||  |    
T  19929671 ttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatattggaatcatataagttgtcgacgttgtctaagttg 19929770  T
Q  316 taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  19929771 taagttgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttga 19929814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 983486 - 983612
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  983486 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttttataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatg 983585  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||    
T  983586 cattcgcattcattgttgggggcttga 983612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 198
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026903
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgtttta--agatgttg-attatcgtttgatattgttat 35026893  T
Q  189 atcttgagat 198  Q
    ||||||||||    
T  35026894 atcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Original strand, 2418808 - 2418873
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 154  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2418808 atgatttgatgttgttaacaatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 2418873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22364850 - 22364748
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||  || || ||||||||||||    
T  22364850 atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttg--attttctttgatattgtt 22364753  T
Q  187 atatc 191  Q
    |||||    
T  22364752 atatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409870
Alignment:
Q  140 ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 23409870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914087
Alignment:
Q  130 attatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgt 23914087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 306
Target Start/End: Original strand, 40492913 - 40492955
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40492913 gatgttgttccaaattattggatttatataagatgtcgatgtt 40492955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 21580096 - 21580181
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21580096 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 21580181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 343
Target Start/End: Original strand, 13665360 - 13665443
Alignment:
Q  261 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13665360 taagatgttgttccaaagcattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 13665443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 343
Target Start/End: Original strand, 13724635 - 13724718
Alignment:
Q  261 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13724635 taagatgttgttccaaagcattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 13724718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22525770 - 22525659
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||  | | |||   ||| |||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  22525770 agttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgttgttggtaatgtcatatatt 22525671  T
Q  121 tgtatatgcatt 132  Q
    ||||||||||||    
T  22525670 tgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 130
Target Start/End: Original strand, 40492781 - 40492828
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgca 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40492781 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgca 40492828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 359
Target Start/End: Original strand, 40493173 - 40493216
Alignment:
Q  316 taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40493173 taagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 40493216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 198
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419455
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||||||| | |||  ||||| ||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttg-attatcgtttgaaattgttat 22419445  T
Q  189 atcttgagat 198  Q
    ||||||||||    
T  22419446 atcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 18302863 - 18302948
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  18302863 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaggttgctgagtccatgcatactcatt 18302948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 41681010 - 41681095
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41681010 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 41681095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508075
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597607
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13597607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 339
Target Start/End: Original strand, 39936950 - 39937030
Alignment:
Q  260 gtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatact 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  39936950 gtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatact 39937030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 164
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  123 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 164  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Original strand, 27941669 - 27941722
Alignment:
Q  218 ttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttg 270  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27941669 ttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgttg 27941722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 29763756 - 29763841
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29763756 tgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtttaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 29763841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Original strand, 35026961 - 35027006
Alignment:
Q  255 aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35026961 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcgtataagatgtc 35027006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 293
Target Start/End: Original strand, 2418950 - 2419010
Alignment:
Q  234 attaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatata 293  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2418950 attaagctgcatatgtcggtctaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatata 2419010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598315
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41598315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 14852742 - 14853078
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14852742 agttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 14852841  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||  ||    
T  14852842 tgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgatg 14852939  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
     ||||||  ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||     
T  14852940 gtgttgtaaattaattaagctgcatgaatcagtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagt 14853039  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14853040 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 14853078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 32306862 - 32307197
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32306862 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatagtaatgtgatatagt 32306961  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || | || ||     
T  32306962 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttaatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgtta 32307058  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    ||||||   | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  32307059 ctgttgaaaactaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgtttcaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagt 32307158  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32307159 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 32307197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17333534 - 17333193
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | ||||  |||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  17333534 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgttagtaatgtaatatatt 17333435  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga--aatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatct 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |    
T  17333434 tgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgt 17333336  T
Q  219 tgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-t 316  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |    
T  17333335 tgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgtt 17333236  T
Q  317 aaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17333235 aagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 17333193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18212986 - 18212722
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18212986 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 18212887  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  18212886 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 18212789  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||| |  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  18212788 ctgttctaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagtattggagt 18212722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14825722 - 14825385
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || |  | | ||||  ||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14825722 agttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 14825623  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||  |||| ||   | || || |||| ||    
T  14825622 tgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatattgttatatct--agatttttattgtgctgcctatgtt 14825526  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaa 318  Q
    | ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  14825525 gttgtcgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaa 14825426  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14825425 gttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 14825385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 24047166 - 24047431
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24047166 agttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 24047265  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || |||| |||    
T  24047266 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttaagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 24047363  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24047364 ctgttgtaaattgattaagctgcatgtatcggtctaagatgtaagatttcgttccaaagtattggagt 24047431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 26050342 - 26050606
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26050342 agttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 26050441  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||| |||    
T  26050442 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttg-attttcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tttgtgctgcctattttg 26050538  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26050539 ctgttgtatattaactaagctgcatgatccggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagt 26050606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16043208 - 16042946
Alignment:
Q  79 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 178  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  16043208 ctgaaataagatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 16043110  T
Q  179 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 277  Q
    || |||||||||||||||||||  | | || || | || ||||||||| |||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16043109 atgttgttatatcttgagatgt--tgtgtgctg-ccatgttgctgttgactattgattaagctgcatatgttggtctaagatgtaagatgttgatccaaa 16043013  T
Q  278 ttattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||  |||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16043012 ctattggagtcatataagatgttcatgttgtctaaggtataagatgttgagtccatgcatactcatt 16042946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Original strand, 13591793 - 13591997
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  13591793 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 13591892  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||| |||    
T  13591893 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatattttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 13591990  T
Q  221 ctgttgt 227  Q
    |||||||    
T  13591991 ctgttgt 13591997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 343
Target Start/End: Original strand, 15041893 - 15042152
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||     
T  15041893 aatatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15041992  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15041993 tatatcttaagatgtt-tatgtgctgcatatgttgttgttgtatattaattaagttgcatgtgtcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 15042091  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgt--tcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||| |||| ||||||| | ||  |  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15042092 agtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 15042152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15112531 - 15112272
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||     
T  15112531 aatatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15112432  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15112431 tatatcttaagatgtt-tatgtgctgcatatgttgttgttgtatattaattaagttgcatgtgtcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 15112333  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgt--tcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||| |||| ||||||| | ||  |  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15112332 agtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 15112272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15792028 - 15791763
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgtt-cactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||     
T  15792028 agttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatatag 15791930  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||| |||| ||    
T  15791929 ttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatctgga-ttgttat-tgtgttgcctatgtt 15791832  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    | |||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  15791831 gttgttgtcttttaattaaactacatgagtcggtctaagatgaaagatgttgtttcaaagtattggagt 15791763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10056830 - 10056713
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  10056830 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 10056732  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10056731 tgttatatcttgagatgtt 10056713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 346
Target Start/End: Original strand, 53082084 - 53082344
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | ||||  | |  ||||||||||||    
T  53082084 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattga--tttgctttgatattgtt 53082181  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  ||  ||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53082182 atatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 53082281  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53082282 atttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgtgtccatgcatactcattcat 53082344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 17048066 - 17048180
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  17048066 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 17048164  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  17048165 tatatcttgagatgtt 17048180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 46640388 - 46640661
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | || | ||||  | | |||||||||||||    
T  46640388 atatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttga-gatgttattgattt-tcatttgatattgtt 46640485  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| |||||  ||||||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  46640486 atatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaaaatgttgtttcaaattattgg 46640585  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46640586 atttatataagaggtcgatggt-ctaagatgttaagatgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 46640661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Original strand, 51463761 - 51463867
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  51463761 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 51463859  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  51463860 tgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 23803158 - 23803242
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803158 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 23803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40907325 - 40907122
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||| | |||||||| | ||  |||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||| |||||    
T  40907325 agttgatccttgtgctaggaatgaaagtttattataatactgttgatgttcgatgagtctgatataagatgttttgatgttgttaatgatgtgaaatatt 40907226  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||    
T  40907225 tgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttg-attatcatttgatatttttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctgtgttg 40907128  T
Q  221 ctgttg 226  Q
    ||||||    
T  40907127 ctgttg 40907122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26789592 - 26789445
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgtt-cactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||  | ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  26789592 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgttgttaataatgtgatatat 26789494  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26789493 ttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttga 26789445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 630597 - 630681
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  630597 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttga 630681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12611209 - 12611106
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  12611209 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 12611114  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  12611113 tgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906989
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatctt 40906997  T
Q  194 gagatgtt 201  Q
    ||||||||    
T  40906996 gagatgtt 40906989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 287
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045425
Alignment:
Q  128 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||| ||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattt-tcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tttgtgctgcctattttgctgttgt 26045364  T
Q  228 ctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     |||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26045365 atattaactaagctgcatgatccggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagt 26045425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 4831475 - 4831580
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  4831475 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 4831572  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  4831573 tgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 4834770 - 4834875
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  4834770 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 4834867  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  4834868 tgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19738257 - 19738172
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19738257 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 19738172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14047805 - 14047715
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14047805 atgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14057
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||    
T  13931 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttttaagatgttgagttgttgagtccatg 14030  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||    
T  14031 cattcacattcattgttgggggcttga 14057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15365079 - 15364994
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15365079 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 15364994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50160170 - 50160069
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcct-aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  50160170 tgtaagaagttgttccaaagtattggattcatataagctgtcgatgttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 50160071  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  50160070 ga 50160069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30146552 - 30146462
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30146552 atgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 30146462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 296
Target Start/End: Original strand, 52243122 - 52243337
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||| ||| | ||||||||    
T  52243122 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttg-aatttcatttgata 52243220  T
Q  182 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 279  Q
    |||||||||| |||  || | |  ||  || |||| |||||| ||||   || | |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||    
T  52243221 ttgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaatt 52243320  T
Q  280 attggagttatataaga 296  Q
    |||||| ||||||||||    
T  52243321 attggatttatataaga 52243337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185012
Alignment:
Q  142 atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagtt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgatgttatatcttgagacgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattgatcaaatt 14185015  T
Q  242 gca 244  Q
    |||    
T  14185014 gca 14185012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 10357379 - 10357464
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10357379 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatt 10357464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27995921 - 27995836
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27995921 tgtaagatgttattccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 27995836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746629
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 14746629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Original strand, 19435656 - 19435748
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19435656 gtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 19435748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Original strand, 13036654 - 13036736
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactc 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13036654 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataatttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactc 13036736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19609437 - 19609352
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19609437 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagctgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 19609352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19738425 - 19738362
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  19738425 atgttgatagtaatgttatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 19738362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Original strand, 13784 - 13842
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  13784 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 13842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 12288290 - 12288416
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg-tgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  |||| |||||| || ||| ||||||||||  |    
T  12288290 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttacataagagatcattgtttctaagatgttaggttgttgagtcccag 12288389  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||    
T  12288390 cattcgcattcattgttgggggcttga 12288416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14650665 - 14650631
Alignment:
Q  315 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14650665 gtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgtt 14650631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 10357323 - 10357364
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10357323 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 10357364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215309
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18215253 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19857627 - 19857571
Alignment:
Q  170 tattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  19857627 tattatttgatgttgttatatcttgaggtgtt-taagtgttgtctatgttgctgttgt 19857571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 43198635 - 43198696
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 296  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43198635 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataaga 43198696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51463903
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  51463847 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 51463903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20719 - 20635
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 342  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20719 tgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 20635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19734466 - 19734374
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| || |||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19734466 gtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatt 19734374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 359
Target Start/End: Original strand, 11768789 - 11769119
Alignment:
Q  25 gacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11768789 gacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgta 11768888  T
Q  125 tatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-aaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||   ||  | || ||    
T  11768889 tatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatgat---tatgt--gctgccatgttg 11768983  T
Q  224 ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgt 323  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  11768984 ttgtaaattaattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgtttcaaattattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgt 11769083  T
Q  324 tgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11769084 tgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 11769119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 9033212 - 9033478
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  9033212 agttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaataatgtgatatagt 9033311  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| |||    
T  9033312 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatt-tatgtgttgcctatgttg 9033410  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     |||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  9033411 ttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgaaagatgtcgttccaaagtattggagt 9033478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42462203 - 42461938
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  42462203 agttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatagt 42462104  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  42462103 tgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttg 42462006  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  42462005 ctgttgtatattaattaagatgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaatgtattggagt 42461938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11661525 - 11661261
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11661525 agttgaccct-ggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 11661427  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  11661426 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 11661329  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt-caagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11661328 ctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtataagatgtaagatgttgttccaaagtattggagt 11661261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20619570 - 20619297
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  20619570 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 20619471  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20619470 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattag 20619372  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20619371 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttga 20619297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18607707 - 18607443
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18607707 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 18607608  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || || |||| |||    
T  18607607 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatatttttatatattgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 18607510  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  18607509 ctgttgtaaattgattaagctgaatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagtattggagt 18607443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14422200 - 14421940
Alignment:
Q  26 acccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14422200 acccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtat 14422101  T
Q  126 atgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgt 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||| || ||||    
T  14422100 atgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgaggtgtt-tatgtgctgcctatgttactgt 14422003  T
Q  225 tgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    |||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14422002 tgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggag 14421940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 130682 - 130949
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctg-atataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  130682 agttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatag 130781  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||| ||    
T  130782 ttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgtt-tctgtgctgcctatgtt 130880  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  130881 gatgttgtatattaattaagttgcatgtgtcagtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagt 130949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14566422 - 14566243
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14566422 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 14566323  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566322 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 14566243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18872580 - 18872401
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18872580 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 18872481  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872480 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 18872401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525686
Alignment:
Q  31 tggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgca 130  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgca 11525539  T
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtcta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| ||    
T  11525540 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtata 11525638  T
Q  231 ttgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaa 277  Q
    || |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11525639 ttaattaagatgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgttgttccaaa 11525686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16008798 - 16008594
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16008798 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatt 16008699  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  16008698 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttg 16008601  T
Q  221 ctgttgt 227  Q
    | |||||    
T  16008600 ccgttgt 16008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177871
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcatttgatattattat 9177698  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattga-ttaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    || | || |||||  || || ||  ||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  9177699 atttggatatgtta-atgtgctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggat 9177797  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9177798 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 9177871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16996475 - 16996211
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16996475 agttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatt 16996376  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||    
T  16996375 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttg-attttcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctacgttg 16996279  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  16996278 ctgttgtataatgaataagatgcatgtgtcggtctaagatgcaagatgtcgttccaaagtgttggagt 16996211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203729
Alignment:
Q  122 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgc 221  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||     
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgt 18203868  T
Q  222 tgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||     
T  18203867 tgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagt 18203768  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203767 tgttgagtccacgcatactcattcatgttgggggcttga 18203729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 17017334 - 17017660
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |  ||| ||||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17017334 agttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 17017433  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||| || |||||||| || |||||    |||          ||    
T  17017434 tgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttg-attatcacttgatgttattatatctggatatgtt---aatg----------tg 17017519  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taa 318  Q
    ||| || ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | |||    
T  17017520 ctgctgcctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggagtagtataaaatgtcgatgtttctaagatgttaa 17017619  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17017620 gttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 17017660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38519568 - 38519361
Alignment:
Q  79 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  38519568 ctgatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttg 38519470  T
Q  179 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38519469 atattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctgagatgtaagatgtcgttccaaa 38519371  T
Q  278 ttattggagt 287  Q
     |||||||||    
T  38519370 gtattggagt 38519361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868200
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |  | |   |||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttca--tttgcattgatattgttat 1868026  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    ||| |||| |||| |||||  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  1868027 atcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattgaat 1868126  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1868127 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 1868200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 349
Target Start/End: Original strand, 11772372 - 11772486
Alignment:
Q  235 ttaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgc 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11772372 ttaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagatgttgagtccatgc 11772471  T
Q  335 atactcattcatgtt 349  Q
    |||||||||||||||    
T  11772472 atactcattcatgtt 11772486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220393
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||   |||||||  |   |||||||||||||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgag---atgttgatttgc-atttgatattgttat 20220219  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20220220 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggat 20220319  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20220320 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 20220393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48991372 - 48991096
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  48991372 tataatatgatttaatgttgatagtaat-tgatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttg-attatcacttgatat 48991276  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggt-caagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    | ||||||||  | ||||| |||||  || |||| ||| || |||| |||| | |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |    
T  48991275 tattatatctgaatatgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatgaaagatgttgttctaaatga 48991176  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  48991175 ttggatttatatgagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgtggagtccatgcatactcgttcatgttgggggcttga 48991096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 46580542 - 46580721
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46580542 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 46580641  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46580642 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 46580721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 9725526 - 9725670
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  9725526 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 9725625  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9725626 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14273706 - 14273589
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  14273706 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 14273608  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14273607 tgttatatcttgagatgtt 14273589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16998784 - 16998667
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  16998784 tataatatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 16998686  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16998685 tgttatatcttgagatgtt 16998667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 15008427 - 15008705
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  | |   |||||||    
T  15008427 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttga--tttgcattgatat 15008524  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||  |  |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  15008525 tgttatatcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaagaatgatgttccaaatta 15008624  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15008625 ttggatttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 15008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 147836 - 147704
Alignment:
Q  23 ttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  147836 ttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttg 147737  T
Q  123 tatatgcattatgtgaattatataagatgttta 155  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  147736 tataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 14157036 - 14157189
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  14157036 aatatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 14157134  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagtt 241  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  14157135 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgtctatgttgctgttgcatattgatcaagtt 14157189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14258639 - 14258525
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  14258639 aatatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 14258541  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  14258540 tatatcttgagatgtt 14258525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16091934 - 16091675
Alignment:
Q  98 tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgaga 197  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||||| | || |    
T  16091934 tgttgttaataatgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgat-tatcatttgatattattatatttggata 16091837  T
Q  198 tgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 296  Q
    ||||  || ||  || ||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16091836 tgtta-atgtgcggtatatgttgctgctgtctattaattaaactgcatgagtcagtctaagatggaagatgttgttccaaattattggatatatataaga 16091738  T
Q  297 tgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16091737 ggtcgatgtt-ctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 16091675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 16460697 - 16460811
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  16460697 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 16460795  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  16460796 tatatcttgagatgtt 16460811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301362
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 32301378  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  32301377 tatatcttgagatgtt 32301362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 1858760 - 1858877
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  1858760 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 1858858  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1858859 tgttatatcttgagatgtt 1858877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 10501355 - 10501511
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  10501355 aatatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 10501453  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgca 244  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  10501454 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgcatattgatcaagttgca 10501511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16579947 - 16579833
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||    
T  16579947 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttg-attatcatttgatgttgt 16579849  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  16579848 tatatcttgagatgtt 16579833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 16585716 - 16585830
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||    
T  16585716 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttg-attatcatttgatgttgt 16585814  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  16585815 tatatcttgagatgtt 16585830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20487730 - 20487591
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  20487730 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 20487632  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||| ||||||||| || ||| || || |||| ||||||||||    
T  20487631 tatgtcttgagatatt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 20487591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14044916 - 14044662
Alignment:
Q  107 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctata 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || || |  | |  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||     
T  14044916 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcaggagctgttttatg 14044818  T
Q  207 tgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg 304  Q
    |  || |||| ||||| || || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatg 14044718  T
Q  305 ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14044717 tttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 14044662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14354946 - 14354692
Alignment:
Q  107 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctata 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || || |  | |  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||     
T  14354946 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcaggagctgttttatg 14354848  T
Q  207 tgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg 304  Q
    |  || |||| ||||| || || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatg 14354748  T
Q  305 ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14354747 tttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 14354692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 13918454 - 13918571
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  13918454 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatat 13918552  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13918553 cgttatatcttgagatgtt 13918571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 25927180 - 25927294
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    ||| |||||||||    
T  25927180 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgat----tatcatttgatat 25927275  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25927276 tgttatatcttgagatgtt 25927294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13647594 - 13647492
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  13647594 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttg-attatgatttgatgttgtt 13647496  T
Q  187 atat 190  Q
    ||||    
T  13647495 atat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 17060290 - 17060470
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| || |||| || |  | | ||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17060290 agttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtcaaatatt 17060389  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17060390 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttg-attatcgtttgatattgttatattttgagatgtt 17060470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14323399 - 14323296
Alignment:
Q  244 atgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 342  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14323399 atgagtcggtctaagttgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcat 14323300  T
Q  343 tcat 346  Q
    ||||    
T  14323299 tcat 14323296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 192
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgt 14929250  T
Q  186 tatatct 192  Q
    | |||||    
T  14929251 tgtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 192
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgt 15352716  T
Q  186 tatatct 192  Q
    | |||||    
T  15352717 tgtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 2529982 - 2530052
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2529982 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109558
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgctatatct 16109550  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  16109551 tgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38828451 - 38828304
Alignment:
Q  51 attatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataaga 149  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || | | ||| || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||    
T  38828451 attataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatatagga 38828353  T
Q  150 tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38828352 tgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Original strand, 837311 - 837401
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  837311 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Original strand, 1202491 - 1202581
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1202491 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12901327 - 12901235
Alignment:
Q  269 tgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagt-aaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12901327 tgttccaaattataggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 12901235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 343
Target Start/End: Original strand, 14183537 - 14183650
Alignment:
Q  229 tattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgag 327  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||  |||||  ||||||    
T  14183537 tattaattaagctgcatgtgtcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctttgtt--taagttgtaagacgttgag 14183634  T
Q  328 tccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  14183635 tccatgcatactcatt 14183650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720070
Alignment:
Q  130 attatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Original strand, 833315 - 833405
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  833315 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Original strand, 1198495 - 1198585
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1198495 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Original strand, 43277704 - 43277796
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43277704 gtcaagttgtaagttgttgttccaaaatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 43277796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 30821145 - 30821230
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30821145 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 30821230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 36686139 - 36686224
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36686139 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 36686224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940324
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 8940324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 12128103 - 12128188
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12128103 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 12128188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12371391 - 12371290
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||   ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  12371391 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacattgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 12371292  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  12371291 ga 12371290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 46387001 - 46387086
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46387001 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 46387086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48812014 - 48811929
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48812014 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 48811929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898240
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctagagatgtt 38898240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 709431 - 709478
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  709431 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgtt 709478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 146
Target Start/End: Original strand, 2280047 - 2280110
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2280047 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatata 2280110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11066581 - 11066499
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactc 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  11066581 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactc 11066499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16056369 - 16056267
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||| | | || |||||||||||||    
T  16056369 taaggtgcatcagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatg 16056270  T
Q  334 cat 336  Q
    |||    
T  16056269 cat 16056267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 59331 - 59372
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  59331 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 59372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Original strand, 811242 - 811315
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  811242 gatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgcat 811315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Original strand, 2280231 - 2280304
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  2280231 gatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcat 2280304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 8852104 - 8852145
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8852104 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 8852145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647456
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13647512 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13647456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 15081928 - 15081984
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15081928 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15081984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15281422 - 15281337
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15281422 tgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagtcgtaagttgctgagtccatgcatactcatt 15281337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18279409 - 18279357
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  18279409 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 18279357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18283372 - 18283320
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  18283372 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 18283320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38480200 - 38480159
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38480200 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 38480159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16462212 - 16462176
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataag 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16462212 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataag 16462176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17061950
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17061950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486734
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatat 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21237978 - 21237671
Alignment:
Q  50 gattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21237978 gattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatatactataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataaga 21237879  T
Q  150 tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagt 249  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  21237878 tgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgtc-atgttgctgttgtaaattaattaagctgcatgagt 21237781  T
Q  250 cggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21237780 cggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagttcatgcatactcattcatgtt 21237681  T
Q  350 cggggcttga 359  Q
     |||||||||    
T  21237680 gggggcttga 21237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34137191 - 34136929
Alignment:
Q  24 tgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  34137191 tgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgttactagtaatgtgatataattgt 34137092  T
Q  124 atatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  34137091 atatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatctcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctg 34136994  T
Q  224 ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34136993 ttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaaaatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 34136929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 21073359 - 21073624
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21073359 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 21073458  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||| |||    
T  21073459 tgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcatatgttg 21073556  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21073557 ctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 21073624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9242180 - 9241916
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9242180 agttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttgaatgagtaagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 9242081  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  9242080 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 9241983  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9241982 ctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagtattggagt 9241916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26392635 - 26392299
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | ||||  ||| | || ||| | ||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  26392635 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaaggtgatatatt 26392536  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    || |||| |||    
T  26392535 tgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaagtat-tgttgat-tattatttgatattgttatatcctgagatgtt-tatgcactgcctatgttg 26392439  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaag 319  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26392438 ctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaag 26392339  T
Q  320 gtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26392338 ttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 26392299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 359
Target Start/End: Original strand, 19201906 - 19202179
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  19201906 aatatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 19202005  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19202006 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaaattgcacgagtcggtctaagatgaaagatgttcttccaaattattgg 19202104  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  |||||   |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  19202105 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagacattgagttcatgcatactcattcaagttgagggcttga 19202179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 19662287 - 19662466
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19662287 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 19662386  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662387 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 19662466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23287617 - 23287279
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || |  | | ||||  ||  |||| ||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  23287617 agttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatgatagtaatgtgatatatt 23287518  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||| |||    
T  23287517 tgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttg 23287420  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taa 318  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||    
T  23287419 ctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagttgttaa 23287320  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  23287319 gttgttgagttcatgcatacttattcatgtcgggggcttga 23287279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 6261010 - 6261186
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6261010 agttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatt 6261109  T
Q  121 tgtata-tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgaga 197  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6261110 tgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgaga 6261186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 30643913 - 30644088
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30643913 agttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatacaatttgatgttgttagtaatgagatatatt 30644012  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgaga 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30644013 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattg-attatcatttgatattgttatatcttgaga 30644088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 18546811 - 18547077
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18546811 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttagtaatgtgatacatt 18546910  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||| || ||||| | | || || | || ||    
T  18546911 tgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttg-attatcctttgatattgttatgtctggatatgttat-tgtgatgcccatgtt 18547008  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  18547009 gctgttgtctactgattaaactgcatgagtcggtctatgatgtaagatgtcaatccaaagtattggagt 18547077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 24697534 - 24697812
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||| || |||| || || ||||||| |   |||||||||    
T  24697534 tataatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgc-atttgatat 24697632  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    ||||||||| |||  ||||  || |  || |||  ||| |||| || |||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  24697633 tgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattg 24697732  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24697733 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 24697812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27472673 - 27472469
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| || |  ||| | ||  |||  ||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  27472673 agttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttgatagtaatataatatatt 27472574  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||    
T  27472573 tgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt-tacgtgctgtctatgttg 27472476  T
Q  221 ctgttgt 227  Q
    |||||||    
T  27472475 ctgttgt 27472469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 34874141 - 34874258
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  34874141 tataatatgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 34874239  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34874240 tgttatatcttgagatgtt 34874258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069329
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 23069313  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  23069314 tatatcttgagatgtt 23069329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 18358666 - 18358779
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18358666 atatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttg-attattatttgatgttgtt 18358764  T
Q  187 atatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||    
T  18358765 atatcttgagatgtt 18358779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 21081665 - 21081782
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  21081665 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 21081763  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  21081764 ttttatatctttagatgtt 21081782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31345308 - 31345191
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  31345308 tataatatgaattagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 31345210  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31345209 tgttatatcttgagatgtt 31345191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Original strand, 22173722 - 22173828
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  22173722 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 22173820  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  22173821 tgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23791463 - 23791189
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || ||||||  |   |||||||||| ||    
T  23791463 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattttt 23791365  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtct-attgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| ||| ||||  || ||| | |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23791364 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 23791265  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttg 358  Q
    | |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23791264 atttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttg 23791189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Original strand, 20520121 - 20520382
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  | |   |||||||    
T  20520121 tataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttga--tttgcattgatat 20520218  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    ||||||||| |||  |||| ||| |  ||  ||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  20520219 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagataatgttccaaatta 20520318  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaaga-agtaaggtgttgagtccatgcatactcattc 344  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20520319 ttggatttatataagaggtcaatgtt-ctaagatattaagttgttgagtccatgcatagtcattc 20520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23207466 - 23207192
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||  ||||| | | ||  |||||  |   |||||||||||||    
T  23207466 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatgttga-gatgtcgttgatttgc-atttgatattgtt 23207369  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23207368 atatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaattattgg 23207269  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||| ||||| ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23207268 atttatataagaggtcaatgtttctatgatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 23207192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 22413064 - 22413343
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || |||||| | | || ||||||  |   |||||||||    
T  22413064 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgttga-gatgttgttgatttgc-atttgatat 22413161  T
Q  183 --tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaat 278  Q
      ||||||||| |||| |||| |||||  || |||| ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  22413162 attgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaat 22413261  T
Q  279 tattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22413262 tattggatttatataagaggtcaatgtt-ttaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 22413343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 43947238 - 43947408
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacg-ttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||     
T  43947238 agttgacccttagggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtttgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatata- 43947335  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt-taagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||    
T  43947336 ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttg-attattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23004942 - 23004664
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||| |||||||| | |||| || | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||    
T  23004942 tatactatgatttaacgttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatat 23004844  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    | ||||||| |||  | || ||| |  |  |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||     
T  23004843 tattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaaagatgatgttccaaattg 23004744  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23004743 ttggatttatataagaggtcgatgtttctaaaatgtaagttgttgagtccatgcatactccttcattgttgggggcttga 23004664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9784869 - 9784731
Alignment:
Q  86 aatatgatttgat-gttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattg 184  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| ||| ||| |||    
T  9784869 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttg-attatcattggatgttg 9784773  T
Q  185 ttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  9784772 ttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 9784731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 18786983 - 18787109
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  18786983 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatg 18787082  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||    
T  18787083 cattcgcattcattgttgggggcttga 18787109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21115722 - 21115656
Alignment:
Q  293 aagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21115722 aagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 21115656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22703279 - 22703174
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  22703279 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 22703182  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  22703181 tgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671070
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 24671070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-aattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-aattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 24781779 - 24781880
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  24781779 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatttatgttgagggctt 24781878  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  24781879 ga 24781880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 24815570 - 24815671
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  24815570 tgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataagttttcgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 24815669  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  24815670 ga 24815671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 24834971 - 24835072
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  24834971 tgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataaaatgtcgatattgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 24835070  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  24835071 ga 24835072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707334
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 23707334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918185
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 24918185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 200
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101682
Alignment:
Q  95 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat-attgttatatct 192  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgataatttttatatct 13101674  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  13101675 tgagatgt 13101682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25109077 - 25109010
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 154  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25109077 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 25109010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 7833 - 7915
Alignment:
Q  255 aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  7833 aagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcat 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6576326 - 6576241
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6576326 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 6576241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 146
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 24865659 - 24865700
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24865659 tgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtc 24865700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681489
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatc-atcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 24681489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24436157 - 24436081
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||        |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24436157 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt--------ctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatt 24436081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 23708547 - 23708609
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708547 tataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9975038 - 9974997
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9975038 tgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatataagatgtc 9974997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9975094 - 9975053
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9975094 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 9975053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21367959 - 21367926
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21367959 tgtaagatgttgttccaaattattggagtcatat 21367926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 22173808 - 22173864
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173808 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22500952 - 22500867
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  22500952 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtctattgcatactcatt 22500867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22508886 - 22508801
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  22508886 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtctattgcatactcatt 22508801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 24642835 - 24642891
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24642835 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24642891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24883575 - 24883534
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24883575 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 24883534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039533
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32039477 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32039533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 137
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834844
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 137  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 24834844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 627 - 963
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | || | ||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  627 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatatatt 726  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||    
T  727 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgat-tatcttttgatattgttatatcttgagatgtt-tatatgctgcctatgttg 824  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||     
T  825 ttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatattggagttatataagatgccgatgtctctaagatgtaagt 924  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  925 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 333
Target Start/End: Original strand, 29290 - 29600
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29290 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 29389  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || | || |||    
T  29390 tgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagtt-tatgtgctg-ccatgttg 29487  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  29488 ctgttgtaaattaattaagttgcatgagtcagtcaaggcttaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagt 29587  T
Q  321 tgttgagtccatg 333  Q
    |||||||||||||    
T  29588 tgttgagtccatg 29600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16493401 - 16493064
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataat-atgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| | | ||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  16493401 agttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatgtgatatat 16493302  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |  || |||| ||    
T  16493301 t-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtt-tatgttctgcctatgtt 16493204  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaag 319  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16493203 gctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgatgttccaaattattggagttacataagatgtcgatgtttctaagatgtaag 16493104  T
Q  320 gtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16493103 ttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 16493064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33443299 - 33442963
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || |||| || | || | | ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33443299 agttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 33443200  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||    
T  33443199 tgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgat----tattatttgatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttg 33443104  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taa 318  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  33443103 ctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaaggagttgttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaa 33443004  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33443003 gttgttgagtccatgcatactcatttatgttgggggcttga 33442963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18453436 - 18453171
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18453436 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagt 18453337  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  18453336 tgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgattttgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 18453239  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  18453238 ctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaagatgtaagatgtcgtttcaaagtattggagt 18453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23838428 - 23838164
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23838428 agttgacccttgaggtaggaatggaggttgattatagtactgttgaggttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 23838329  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  23838328 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 23838231  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  23838230 ctgttgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagtattggagt 23838164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20224197 - 20223860
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || || | | ||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20224197 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 20224098  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||| || ||||| | | || |   ||| |||    
T  20224097 tgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatattattatatctggatatgttat-tgtgcttcatatgttg 20224000  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaag 319  Q
    ||| ||| |||| |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  20223999 ctgctgtttattaattaaactgcataagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaag 20223900  T
Q  320 gtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20223899 ttgttgagtccatgcatactcattcatgtttggggcttga 20223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22118181 - 22117844
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || || | | ||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22118181 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 22118082  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||| || ||||| | | || |   ||| |||    
T  22118081 tgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatattattatatctggatatgttat-tgtgcttcatatgttg 22117984  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaag 319  Q
    ||| ||| |||| |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  22117983 ctgctgtttattaattaaactgcataagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttttaagatgtaag 22117884  T
Q  320 gtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22117883 ttgttgagtccatgcatactcattcatgtttggggcttga 22117844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20136923 - 20136601
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  20136923 agttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgtgatataat 20136824  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||| |||    
T  20136823 tgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tacgtgctgcctatgttg 20136727  T
Q  221 ctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagta 317  Q
    |||||    |||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  20136726 ctgttaaaatattaatcaagttgcatgtgttggtctaagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgta 20136627  T
Q  318 aggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  20136626 agatgttgagtccatgcatactcatt 20136601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 22195946 - 22196268
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  22195946 agttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgtgatataat 22196045  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||| |||    
T  22196046 tgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tacgtgctgcctatgttg 22196142  T
Q  221 ctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagta 317  Q
    |||||    |||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  22196143 ctgttaaaatattaatcaagttgcatgtgttggtctaagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgta 22196242  T
Q  318 aggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  22196243 agatgttgagtccatgcatactcatt 22196268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4477078 - 4476899
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| | |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4477078 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttgatgttgagtgagtcagttataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatt 4476979  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4476978 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 4476899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076647
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| ||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatattattat 23076820  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    |||| || ||||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  23076819 atctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagaagaaagaggttgttccaaattattggat 23076720  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076719 atatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 23076647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008065
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||| | |||||||| ||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgat-tatcacttgatattattat 35008238  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    |||| || ||||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  35008237 atctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagaagaaagaggttgttccaaattattggat 35008138  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35008137 atatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 35008065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18204277 - 18204005
Alignment:
Q  76 agtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatatta 174  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18204277 agtctgatgtaa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttg-attatca 18204180  T
Q  175 tttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 273  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |  |||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18204179 tttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatc 18204080  T
Q  274 caaattattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 349  Q
    |||||| ||||| |   ||||||||| || | || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18204079 caaatttttggaat--cataagatgttgaggttttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttatgtt 18204005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 285
Target Start/End: Original strand, 18199338 - 18199547
Alignment:
Q  76 agtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatatta 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18199338 agtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttg-attatca 18199435  T
Q  175 tttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 273  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |  |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18199436 tttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatc 18199535  T
Q  274 caaattattgga 285  Q
    |||||| |||||    
T  18199536 caaatttttgga 18199547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 349
Target Start/End: Original strand, 18177594 - 18177866
Alignment:
Q  76 agtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatatta 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18177594 agtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttg-attatca 18177691  T
Q  175 tttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 273  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |  |||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18177692 tttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatc 18177791  T
Q  274 caaattattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 349  Q
    |||||| ||||| |   ||||||||| || | || ||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18177792 caaatttttggaat--cataagatgttgaggttttctacgttgtaagatgttgagtgcatgcatactcatttatgtt 18177866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 15817450 - 15817567
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  15817450 tataatatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgtt-aattatcatttgatat 15817548  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15817549 tgttatatcttgagatgtt 15817567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 19773474 - 19773588
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||    
T  19773474 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttg-attatcatttgatattgt 19773572  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  19773573 tatatcttgagatgtt 19773588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 14979316 - 14979433
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  14979316 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 14979414  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  14979415 tgttatatctcaagatgtt 14979433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23415076 - 23414959
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  23415076 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 23414978  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23414977 tgttatatcttgagatgtt 23414959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Original strand, 15705375 - 15705514
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  15705375 aatatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 15705473  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||    
T  15705474 tatatcttgagatgtt-tacttgttttctatgttgctgttgt 15705514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Original strand, 20556787 - 20556893
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  20556787 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 20556885  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  20556886 tgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 25619651 - 25619768
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  25619651 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 25619749  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  25619750 tgttatatctcaagatgtt 25619768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25755078 - 25754972
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  25755078 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 25754980  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  25754979 tgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182764
Alignment:
Q  104 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttct 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-t 20182867  T
Q  204 atatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt--caagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcg 301  Q
    || || || |||| ||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||  ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20182866 atgtgctgcctatattgctattgaatattaattaagttgtatgtgttcgttataagatgtaagatgttgtttcaaaatattggagtcgtataagatgtcg 20182767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 304
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153227
Alignment:
Q  104 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttct 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-t 22153124  T
Q  204 atatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggt--caagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcg 301  Q
    || || || |||| ||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||  ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22153125 atgtgctgcctatattgctattgaatattaattaagttgtatgtgttcgttataagatgtaagatgttgtttcaaaatattggagtcgtataagatgtcg 22153224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22806007
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttg-attatcatttgatattgt 22806023  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||| ||||||    
T  22806022 tatatcttgtgatgtt 22806007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27556834 - 27556717
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || ||||||| |    
T  27556834 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-atcatcatttgatgt 27556736  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27556735 tgttatatattgagatgtt 27556717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 28103831 - 28103944
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  28103831 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgtt 28103929  T
Q  187 atatcttgagatgtt 201  Q
    ||| |||||||||||    
T  28103930 ataccttgagatgtt 28103944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Original strand, 23528031 - 23528291
Alignment:
Q  79 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttg 178  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||    
T  23528031 ctgaaataagatgatttgatgttgatagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcg-tcctttg 23528129  T
Q  179 atattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 277  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| | |  | || | || ||| |||||  |||||| |||| |||||  || |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  23528130 at--tgttacatcttgagatgttgtgt--gctgcc-atgttgttgttgattattgaataagctgcatatgttggtataagatgtaagatgttgatccaaa 23528224  T
Q  278 ttattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
     ||||||||| |||||||||||  ||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23528225 ctattggagtcatataagatgttcatgatgtctaagttgtaagatgttgagttcatgcatactcatt 23528291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23539160 - 23539045
Alignment:
Q  84 ataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatatt 183  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23539160 ataagatgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgtt-aattatcatttgatatt 23539062  T
Q  184 gttatatcttgagatgt 200  Q
    |||||||||||||||||    
T  23539061 gttatatcttgagatgt 23539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25752908 - 25752838
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752908 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 287
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896445
Alignment:
Q  91 gatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatat 190  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |  |||||||||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg--attgtcattgatattgttatat 18896349  T
Q  191 cttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||  || | | | || || |||| |||||| ||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  18896350 cttgaagtgatat-tttgctgcctatgttgctgatgtatatt-aataagctgtatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaaatattggagt 18896445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19668412 - 19668286
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||| | |||| |||||||||||||    
T  19668412 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgattctaagatgttaagttgttgagtccatg 19668313  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||    
T  19668312 catactcattcattgttgggggcttga 19668286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362507
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||  |  |||||||||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttat 19362514  T
Q  189 atcttga 195  Q
    |||||||    
T  19362513 atcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538879
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttg-attgtcatttgatattgttat 23538898  T
Q  189 atcttgagatgttctatat 207  Q
    ||| |||| |||| |||||    
T  23538897 atcatgagctgttttatat 23538879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18706497 - 18706357
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |||  || |  ||||||||    
T  18706497 tataatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattg--atttgctttgatat 18706400  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt 225  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  18706399 tgttatatcatgaactgttttatatattgcctatgttgctgtt 18706357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25738633 - 25738457
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |  |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |  | || ||||||    
T  25738633 agttgatccttgggttaggaatgaagatttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgctatggtatatt 25738535  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    || | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25738534 tgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttg-attattaattgatattgtcatatcttgagatgt 25738457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 200
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416949
Alignment:
Q  95 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgtt-aattatcatttgatattgttatatctt 29416942  T
Q  194 gagatgt 200  Q
    |||||||    
T  29416943 gagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15895943 - 15895844
Alignment:
Q  261 taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  15895943 taagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttga 15895844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16245352 - 16245265
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16245352 tgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataagttgtccatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattca 16245265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 17229782 - 17229825
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgtt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17229782 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtt 17229825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 23083174 - 23083259
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083174 tgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 23083259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18696741 - 18696609
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||      
T  18696741 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttgttaataatgtgatataaa 18696642  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 153  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18696641 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 9098594 - 9098712
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgc 334  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||       ||||||||||||||    
T  9098594 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga-------tgttgagtccatgc 9098686  T
Q  335 atactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || | |||||| |||| |||||||||    
T  9098687 attcgcattcattgttgggggcttga 9098712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17105928 - 17105849
Alignment:
Q  79 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagt 158  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  17105928 ctgacataaaatgaattgatgttgttaataacgtgatatagttgtatatgaattatgtgaattatgtatgatgttaaagt 17105849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18708613 - 18708528
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18708613 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 18708528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 339
Target Start/End: Original strand, 19829843 - 19829924
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatact 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  19829843 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtctatgcatact 19829924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31733827 - 31733742
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31733827 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 31733742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227501
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896051
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaaaatgtaagatgttcaagttg 15896051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18453132 - 18453098
Alignment:
Q  325 gagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18453132 gagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 18453098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 20078041 - 20078107
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataa 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||| ||||||||| ||||    
T  20078041 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactatcgatgttcagtgagtctgacataa 20078107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 17319009 - 17319050
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17319009 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 17319050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20109147 - 20109074
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  20109147 gatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcat 20109074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20556929
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20556929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 20734335 - 20734420
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20734335 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcataagatgttgagtccattgcatactcatt 20734420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 343
Target Start/End: Original strand, 22376793 - 22376874
Alignment:
Q  263 agatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22376793 agatgttgttccaaagttttggagtcatataacttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 22376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25644361 - 25644300
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 296  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25644361 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaagatgttccaaattattggatttatataaga 25644300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Original strand, 31477910 - 31477962
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||    
T  31477910 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tacgtgtcgtctatgttgctgttgt 31477962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456846
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Original strand, 23151206 - 23151246
Alignment:
Q  260 gtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23151206 gtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 23151246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 343
Target Start/End: Original strand, 27573236 - 27573288
Alignment:
Q  292 taagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27573236 taagatgtcgatgttgtccaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 27573288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31733874 - 31733834
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31733874 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 31733834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 21809447 - 21809784
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataat-atgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| | | ||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  21809447 agttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatgtgatatat 21809546  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |  || |||| ||    
T  21809547 t-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtt-tatgttctgcctatgtt 21809644  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaag 319  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21809645 gctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgatgttccaaattattggagttacataagatgtcgatgtttctaagatgtaag 21809744  T
Q  320 gtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21809745 ttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 21809784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 21731327 - 21731664
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataat-atgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| | | ||| | |||| |||| |||| |||||||| |||||||    
T  21731327 agttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatgagatatat 21731426  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |  || |||| ||    
T  21731427 t-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtt-tatgttctgcctatgtt 21731524  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaag 319  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21731525 gctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgatgttccaaattattggagttacataagatgtcgatgtttctaagatgtaag 21731624  T
Q  320 gtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21731625 ttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 21731664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 25575529 - 25575863
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25575529 agttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagt 25575628  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| || || | || |      
T  25575629 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatta-ttgaaatagttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgtca 25575724  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  25575725 ctgttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatttaagt 25575824  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  25575825 tgttgagtccatgcatactcattcaaattgggggcttga 25575863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 25574336 - 25574670
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25574336 agttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagt 25574435  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| || || | || |      
T  25574436 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatta-ttgaaatagttatatcttgagatgtt-tatgtgctg-ccatgtca 25574531  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaagg 320  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  25574532 ctgttgtaaattaattaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatttaagt 25574631  T
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  25574632 tgttgaatccatgcatactcattcaaattgggggcttga 25574670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23470056 - 23469792
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23470056 agttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagt 23469957  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  23469956 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgata-tggtatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 23469860  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  23469859 ctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagt 23469792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 26740581 - 26740850
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26740581 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttat 26740678  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||| | ||||||| |||    ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740679 atccttagatgtt-tatgcactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggagt 26740777  T
Q  288 tatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26740778 tatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcataatcattcatgttgggggcttga 26740850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 37598749 - 37598928
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37598749 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 37598848  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598849 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 37598928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 26732768 - 26733037
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    
T  26732768 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt-gtcgttgat-tattatttgatattgttat 26732865  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||| ||||||||| |||    || |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732866 atcctgagatgtt-tatgcactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttgcaagatgttgttccaaattattagagt 26732964  T
Q  288 tatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26732965 tatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgcgggcttga 26733037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 28370888 - 28371067
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28370888 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatctgatgttgttagtaatgagatatatt 28370987  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370988 tgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 28371067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42960785 - 42960592
Alignment:
Q  32 ggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcat 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42960785 ggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcat 42960686  T
Q  132 tatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||    
T  42960685 tatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgccgttgt 42960592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 25576722 - 25576900
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |    | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25576722 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatagtaatgtgatatagt 25576821  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25576822 tgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatta-ttgatattgttatatcttgagatgtt 25576900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15796616 - 15796337
Alignment:
Q  79 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgaaatattattt 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  15796616 ctgatataa-atgatttgatgttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttg-attatcattt 15796519  T
Q  178 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaa 276  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||| || || |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15796518 gatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaa 15796419  T
Q  277 attattggagttatataagatgtcgatg-ttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  15796418 attattggaat--cataagatgtcgatgttttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttatgtttagggcttga 15796337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 359
Target Start/End: Original strand, 25578110 - 25578236
Alignment:
Q  234 attaagttgcatgagtcggtcaagatgtaagatgtt-gttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccat 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  25578110 attaagctgcatgagtcggtcaagatgtaagatgtttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccat 25578209  T
Q  333 gcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25578210 gcatactcattcacgttgggggcttga 25578236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 21328081 - 21328347
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatata-atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||  ||||| || |||| | |||||||||||||   | ||||||||||||     
T  21328081 agttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgttataaataatgtgatatag 21328180  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||  | ||||| | | || || |||| ||    
T  21328181 ttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgctatatctgaatatgtt-tttgtgctgcctatgtt 21328278  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21328279 gctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgtcgttccaaattgttggagt 21328347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 22178152 - 22178426
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   ||||||||||||     
T  22178152 atatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtc 22178250  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||| |||| |||||  || |||| ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22178251 atatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 22178350  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | | |||||||| ||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22178351 attgatataagaggtcgatgtttc-aagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 22178426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 38145370 - 38145492
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38145370 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgactgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatt 38145469  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattat 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  38145470 tgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 359
Target Start/End: Original strand, 27988880 - 27989135
Alignment:
Q  108 aatgtgatata--tttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttc 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||     
T  27988880 aatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgat-tatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T
Q  203 tatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcg 301  Q
    ||   ||||||||  ||  ||||   |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27988979 taagagttgtctacgttcttgtt---tattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcg 27989075  T
Q  302 atgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27989076 atgtttctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 27989135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6766016 - 6765903
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  6766016 atatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttg-attattatttgatgttgtt 6765918  T
Q  187 atatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||    
T  6765917 atatcttgagatgtt 6765903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 30138857 - 30138974
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |    
T  30138857 tataatatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgt 30138955  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30138956 tgttatatcttgagatgtt 30138974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 22107367 - 22107480
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  22107367 aatatgatatgat-ttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 22107464  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  22107465 tatatcttgagatgtt 22107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 165
Target Start/End: Original strand, 33895587 - 33895666
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33895587 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt 33895666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29448196 - 29448053
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||  || ||||||| || || ||||| | |   |||||||||    
T  29448196 tataatatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttg-atttgcatttgatat 29448098  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||  || |||| ||||||||||    
T  29448097 tgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgt 29448053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336642
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 22336642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340180
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 22340180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25743913 - 25743654
Alignment:
Q  84 ataatatgatttgatgttgatagtaatgtga--tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgat 180  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| || |    || || |||||    
T  25743913 ataagatgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattatttgtgatgttttaagttgttgat----tactacttgat 25743818  T
Q  181 attgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 279  Q
    ||||||||||| | || |||| ||| || |||| ||  |||||||   |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  25743817 attgttatatcataagttgttttatgtgctgtc-atgctgctgtttattattgattgaactgcatgagtcggtctaagatgtaagatgtcaatccaaatt 25743719  T
Q  280 attggagttatataagatgt---cgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||| |||| ||||||   || ||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25743718 attggagtcatatgagatgttcacgttgtt--taagttgtaagaagttgagtccatgcatactcatt 25743654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20572141 - 20572025
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatata-atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || || |||| | ||||  |||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  20572141 agttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgttgttagtaatgtaatatag 20572042  T
Q  120 ttgtatatgcattatgt 136  Q
    |||||||||||||||||    
T  20572041 ttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23538594 - 23538504
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23538594 atgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816478
Alignment:
Q  95 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatctt 10816485  T
Q  194 gagatgt 200  Q
    |||||||    
T  10816484 gagatgt 10816478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31455040 - 31454956
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31455040 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagttcatgcatactcatt 31454956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 21555269 - 21555354
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21555269 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 21555354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31455653 - 31455569
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31455653 tgtaagatgttgatacaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagttcatgcatactcatt 31455569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 336
Target Start/End: Original strand, 20027021 - 20027123
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||    
T  20027021 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgtttcaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagaggttgagttgttgagtccatg 20027120  T
Q  334 cat 336  Q
    |||    
T  20027121 cat 20027123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 12122410 - 12122495
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12122410 tgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 12122495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17875177 - 17875092
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  17875177 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatataagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgctgagtccattgcatactcatt 17875092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356271
Alignment:
Q  148 gatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 18356271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Original strand, 25250783 - 25250867
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 342  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25250783 tgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 25250867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Original strand, 25314568 - 25314652
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 342  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25314568 tgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 25314652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725984
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 40725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 359
Target Start/End: Original strand, 23202699 - 23202733
Alignment:
Q  325 gagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23202699 gagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 23202733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10753370 - 10753318
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||    
T  10753370 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tacatgttgcctatgttgctattgt 10753318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910962
Alignment:
Q  148 gatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 20910962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 21557934 - 21557975
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21557934 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 21557975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 332512 - 332234
Alignment:
Q  78 tctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattattt 177  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  332512 tctgttatattatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatgttgaaatattatt- 332414  T
Q  178 gatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaa 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || || || | || | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  332413 gatattgt-atatcttgagatgttg-atgtgctgcc-atgtcgctgttgtaaattgattaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaa 332317  T
Q  277 attattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  332316 attattggagttatataagatgtcggtgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 332234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 18034 - 18299
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  18034 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatattgttagtaatgtgatatagt 18133  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||| |||    
T  18134 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-tattatcatttgatattgttatatcttgagatatt-tatgtgctgcctatgttg 18231  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  18232 ttgttgtatattaattaagttgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagt 18299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 21043148 - 21043413
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21043148 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 21043247  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  21043248 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-ttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 21043345  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcg-gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     |||||| |||| |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21043346 ttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcgttttaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 21043413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28312768 - 28312503
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  28312768 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagccagatataatatgatttgatgtttttagtaatgagatatatt 28312669  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||    
T  28312668 tgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgtctatgttg 28312571  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     ||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28312570 atgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 28312503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22124539 - 22124274
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22124539 agttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagt 22124440  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  22124439 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 22124342  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||| || |||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  22124341 ctgtcgtatattaattaagatgcatgagtcagtctatgatgtaagaagtcgttccaaagtgttggagt 22124274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14800781 - 14800518
Alignment:
Q  28 ccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgat-agtaatgtgatatat----ttg 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    |||    
T  14800781 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14800682  T
Q  123 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgct 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| |||||    
T  14800681 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttgatattgttatatcttgatatgtt-tatgtgctgcatatgttgct 14800584  T
Q  223 gttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14800583 gatgtatattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 14800518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14809655 - 14809392
Alignment:
Q  28 ccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgat-agtaatgtgatatat----ttg 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    |||    
T  14809655 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14809556  T
Q  123 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgct 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| |||||    
T  14809555 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttgatattgttatatcttgatatgtt-tatgtgctgcatatgttgct 14809458  T
Q  223 gttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14809457 gatgtatattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 14809392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Original strand, 20437864 - 20438125
Alignment:
Q  26 acccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  20437864 acccttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtat 20437963  T
Q  126 atgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgt 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||| |||||||    
T  20437964 atgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgaggtgtt-tatgtgctgcctatgttgctgt 20438061  T
Q  225 tgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  20438062 tgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagt 20438125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 21533808 - 21534075
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21533808 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgat-tattatttgatattgttat 21533905  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||| | ||| ||| ||| |  ||  ||| ||| |||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21533906 atcctaagaagtt-tatgtactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaaattattggagt 21534004  T
Q  288 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21534005 tatataagatgtcgatgtt-ctaagatgtaagttgtcgagttcatgcatactcattcatgttgggggcttga 21534075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20958362 - 20958097
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20958362 agttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttagtaatgtgatatagt 20958263  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  20958262 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgtcatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttg 20958165  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| |||| |||||  || ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  20958164 ctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttgtaagatttcgttccaaagtattggagt 20958097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 52940744 - 52940967
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |  | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  52940744 agttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatgtagt 52940843  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || || |||| |||    
T  52940844 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttggtattgttatatcttgagatgt--tatgtgctgcctatgttg 52940940  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatga 247  Q
     |||||| |||| |||||| |||||||    
T  52940941 ttgttgtatattaattaagctgcatga 52940967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47190855 - 47190590
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgtt-cactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  47190855 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttagtaatgtgatatag 47190757  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| ||  |||| | | || || |||| ||    
T  47190756 ttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatttcctctttgatattgttatatctgga-ttgttat-tgtgctgcctatgtt 47190659  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    | ||||||||||| |||||  | |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  47190658 gatgttgtctattaattaaactacatgagccggtctaagatgaaagatgttgttccaaagtattggagt 47190590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381100
Alignment:
Q  114 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgat-tatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgat 16381248  T
Q  211 gtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcct 309  Q
    ||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||    
T  16381247 gtctatgctgctgtttattattgattaagttgcatgagtcggtctaagatgtaagatgttgatccaaattattggaatcata--agatgtcgatgtttct 16381150  T
Q  310 aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16381149 aagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatttatgttgagggcttga 16381100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 346
Target Start/End: Original strand, 50614048 - 50614309
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||    
T  50614048 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 50614146  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50614147 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgttgttccaaattattgg 50614246  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    | |||||| ||| || | |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50614247 atttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 50614309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 346
Target Start/End: Original strand, 50621876 - 50622137
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||    
T  50621876 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 50621974  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50621975 atatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgttgttccaaattattgg 50622074  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    | |||||| ||| || | |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50622075 atttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 50622137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Original strand, 13881310 - 13881452
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  13881310 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 13881408  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  13881409 tgttatatctcaagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgt 13881452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 27653151 - 27653268
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  27653151 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 27653249  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27653250 tgttatatcttgagatgtt 27653268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 16368219 - 16368491
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||||| | | || ||||||  | |   |||||||||||    
T  16368219 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatgttga-gatgttgttga--tttgcattgatattgtt 16368315  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| |||||| || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  16368316 atatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatgttccaaattattgg 16368415  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16368416 atttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 16368491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 359
Target Start/End: Original strand, 52954414 - 52954531
Alignment:
Q  243 catgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactca 341  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  52954414 catgagtcggtctaagaagtaagatgttgttccaaaatattggagttatataagatgtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactca 52954513  T
Q  342 ttcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||| | |||||||    
T  52954514 ttcatgttggaggcttga 52954531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 41049968 - 41050242
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | || ||||||  |   |||||||||||||    
T  41049968 atatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgttga-gatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 41050065  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  | || |||||  || |||| |||||||| || || | | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  41050066 atatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgatgttccaaattattgg 41050165  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41050166 atttatataagaggtcgttgtttctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttaggggcttga 41050242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48603641 - 48603527
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  48603641 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 48603543  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    || |||||||||||||    
T  48603542 tagatcttgagatgtt 48603527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 242
Target Start/End: Original strand, 635914 - 636068
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  635914 aatatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgt 636012  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttg 242  Q
    |||||||||| || || ||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  636013 tatatcttgaaatatt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattgatcaagttg 636068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 45574735 - 45574819
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45574735 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttga 45574819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 22130759 - 22130840
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22130759 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgt 22130840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50686801 - 50686527
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||| ||||||    
T  50686801 atatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgacattgtt 50686703  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  | || |||    || |||| |||| ||| || |||| | |||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50686702 atatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattgg 50686603  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  50686602 atttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 50686527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 41781522 - 41781634
Alignment:
Q  87 atatgatttgat-gttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  41781522 atatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttg-attatcatttgatgttgt 41781618  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||| |||||    
T  41781619 tatatcttgaaatgtt 41781634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48520679 - 48520585
Alignment:
Q  107 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttc 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48520679 taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttg-tttattatttgatattgttatatc-tgagatgttc 48520585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064853
Alignment:
Q  107 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctata 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||  | |   ||| |||||||||||| |||  | || |||     
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttga--tttgcattggtattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  207 tgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtcaa-gatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatg 304  Q
    |  || |||| |||||||| || |||  | |||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcaatg 26064910  T
Q  305 ttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26064909 tttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 26064853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 346
Target Start/End: Original strand, 35261009 - 35261270
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| || || ||||| ||   |||||||  |   ||||||||    
T  35261009 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgag---atgttgatttgc-atttgata 35261104  T
Q  182 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 279  Q
    |||||||||| ||   |||| |  ||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |  ||  |||||||||||    
T  35261105 ttgttatatcatgc--tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaagaattatgttccaaatt 35261202  T
Q  280 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35261203 attggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 35261270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11945636 - 11945563
Alignment:
Q  95 tgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaa 168  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11945636 tgatgatgaaagtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttgaa 11945563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20329182 - 20329118
Alignment:
Q  103 atagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttg 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329182 atagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649787
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 32649795  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  32649794 tgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372072
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 16372072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 359
Target Start/End: Original strand, 21896189 - 21896462
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| || || || |||  |   |||||||||||||    
T  21896189 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgc-atttgatattgtt 21896287  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| ||   |||| | |||  || |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||    
T  21896288 atatcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaggaagatgttccaaattattgg 21896385  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| | |  |||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  21896386 atttatataagaggccattgtttctaagatgttgagttgttgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttga 21896462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Original strand, 2332872 - 2333019
Alignment:
Q  51 attatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataaga 149  Q
    |||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || | | ||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||| ||    
T  2332872 attataatactgtcgatgttcagtgagtctgatataagataatt-gatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatatagga 2332970  T
Q  150 tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2332971 tgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Original strand, 21861650 - 21861728
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaaga 313  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  21861650 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga 21861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16758843 - 16758612
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||  | || |||||  ||  ||||||||||    
T  16758843 tataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttg-tattgtatttgatat 16758745  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    ||||||||| |||  || | |  ||  || |||| |||||| ||||   || | ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  16758744 tgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaatta 16758645  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaaga 313  Q
    ||||| || |||| || |||| |||| ||||||    
T  16758644 ttggatttttatacgaggtcgttgtttctaaga 16758612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 20634487 - 20634598
Alignment:
Q  234 attaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtcca 331  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  ||||| |||||||| ||    
T  20634487 attaagttgcatatgttggtctaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtaca 20634586  T
Q  332 tgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||    
T  20634587 tgcatactcatt 20634598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534624
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatatcgttatatct 29534632  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  29534631 tgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 51274477 - 51274562
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  51274477 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtctattgcatactcatt 51274562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 41227633 - 41227674
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41227633 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 41227674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48520822 - 48520781
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactg 62  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48520822 agttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactg 48520781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51326898 - 51326842
Alignment:
Q  170 tattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||    
T  51326898 tattatttgatgttgttatatcttgagatgtt-taggtgctgtctatgttgctgttgt 51326842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433137
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 433137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 11809424 - 11809464
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11809424 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 11809464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 897 - 636
Alignment:
Q  24 tgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgt 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  897 tgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgt 799  T
Q  124 atatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  798 atatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attattatttcatgatgtgatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctg 701  T
Q  224 ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  700 ttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Original strand, 60643 - 60868
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||  | |   ||||||    
T  60643 tataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga--tttgcattgata 60740  T
Q  182 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 279  Q
    ||| |||||| |||| |||| | |||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  60741 ttggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaaagatgatgttccaaatt 60840  T
Q  280 attggagttatataagatgtcgatgttc 307  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  60841 attggatttatataagaggtcgatgttc 60868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 10833971 - 10834235
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  10833971 agttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata-t 10834069  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | || |||    
T  10834070 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatttgctgccaatattg 10834167  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10834168 ctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagt 10834235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 316309 - 316036
Alignment:
Q  85 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatatt 183  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||    
T  316309 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatatt 316211  T
Q  184 gttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattatt 282  Q
    ||||||||| ||  |||| | | || || |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  316210 gttatatctggat-tgttat-tgtgctgcctatgttgttgctgtctattaattaaattgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattatt 316113  T
Q  283 ggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  316112 ggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 316036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13919583 - 13919245
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || |  ||| |||   |||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||    
T  13919583 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagcgatgtaatatatt 13919484  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |  |  |||| |||    
T  13919483 tgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttg-attattatgtgataatgttatatcttgagatattttatgtactccctatgttg 13919386  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taa 318  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  13919385 ctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagttgttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaa 13919286  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13919285 gttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 13919245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 23371339 - 23371518
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23371339 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 23371438  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371439 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 23371518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51300815 - 51300636
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  51300815 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 51300716  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300715 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 51300636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 14763593 - 14763772
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14763593 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatt 14763692  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763693 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 14763772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9577876 - 9577614
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||| || |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9577876 agttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatt 9577777  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||| |||    
T  9577776 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttg-attatcatttgatattgttatatcttgaga---tttatgtgttgcctatgttg 9577681  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||| || | | |||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  9577680 ctgttgtata-taaataagctgcatgagtcggtctatgatgtaagaagtcgttccaaagtgttggagt 9577614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15246273 - 15246007
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15246273 agttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataat 15246174  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||| || ||||| | | || || |||| ||    
T  15246173 tgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttg-attatcctttgatattgttatgtctggatatgttat-tgtgctgcctatgtt 15246076  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  15246075 gctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagttgtcgttccaaagtattggagt 15246007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Original strand, 32402839 - 32403081
Alignment:
Q  33 gggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcatt 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  32402839 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatata-tatgatttgttgttgcgagtaatgtgatatagttttatatgcatt 32402937  T
Q  133 atgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctat 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||| |||||||||| |||    
T  32402938 atgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattg-attattatttgatattgttatatcttgagacgt--tatgtgctgtctatgttgctgttgtatat 32403034  T
Q  232 tgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaa 277  Q
    |||||| | |||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  32403035 tgattaggctgcatgtgtcagtcaaagttgtaagatgtcgttccaaa 32403081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15265394 - 15265128
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15265394 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataat 15265295  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||| || ||||| | | || || |||| ||    
T  15265294 tgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttg-attatcctttgatattgttatgtctggatatgttat-tgtgctgcctatgtt 15265197  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||||||| |||||| ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  15265196 gctgttgtctattaattaaactacacgagtcggtctaagatgaaagttgtcattccaaagtattggagt 15265128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9533549 - 9533416
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9533549 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 9533450  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9533449 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 324488 - 324309
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||| | ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  324488 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 324389  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  324388 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 324309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12378114 - 12377837
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |   |||||||||    
T  12378114 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatatatt-gtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgc-atttgatat 12378017  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    ||||||||| |||| | || |||||  || |||| |||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  12378016 tgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagataaaatatgttgttccaaatta 12377917  T
Q  281 ttggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12377916 ttgaatttatataagaggtcgatgtttttaagatgttaagttgttgagtctatgcatacttattcatgttgggggcttga 12377837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15207191 - 15206925
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15207191 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataat 15207092  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||  ||| ||| || ||||| | | |  || |||| ||    
T  15207091 tgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttg-attatcctttgatatttatatgtctggatatgttat-tgtactgcctatgtt 15206994  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  15206993 gttgttgtctattaattaaactgcatgagttggtctaagatgaaagttgtcgttccaaagtattggagt 15206925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37427968 - 37427638
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgata-taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||   |||||  |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  37427968 agttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttgttcagagagtctgaaaataagatgatt-gatgttgttagtaatgtgatatag 37427870  T
Q  120 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || |  |    
T  37427869 ttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatg-attatcatttgatactgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctgtgct 37427772  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatg--------taagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cct 309  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |   ||||||| ||| ||        ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  37427771 gctgttgtatatctattaagttgaaaatgtcggtctaagttgtgaagtgttaagatgttgttccaaaatattggagtcatataagatgtcgatgttgtct 37427672  T
Q  310 aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37427671 aagctgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 37427638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925874
Alignment:
Q  112 tgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttg 211  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |  ||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactg 43926025  T
Q  212 tctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcct 309  Q
     |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  43926024 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttct 43925925  T
Q  310 aagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43925924 aagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 43925874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 52989651 - 52989768
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  52989651 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 52989749  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52989750 tgttatatcttgagatgtt 52989768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194743
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 28194779  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt 225  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  28194778 atcttgagatgtt-tatgtgctgtctatgttgctgtt 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12339894 - 12339780
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  12339894 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 12339796  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  12339795 tatatcttgagatgtt 12339780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14179559 - 14179445
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  14179559 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 14179461  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  14179460 tatatcttgagatgtt 14179445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 43889558 - 43889672
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  43889558 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 43889656  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  43889657 tatatcttgagatgtt 43889672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14966360 - 14966243
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |    
T  14966360 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttg-attatcatttgatgt 14966262  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14966261 tgttatatcttgagatgtt 14966243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14671111 - 14670972
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  14671111 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 14671013  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  14671012 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 14670972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14682610 - 14682471
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  14682610 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatcttgt 14682512  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  14682511 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 14682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12470089 - 12469974
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  12470089 aatatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 12469991  T
Q  186 tatatcttgagatgttc 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  12469990 tatatcttgagatgttc 12469974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16796674 - 16796560
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  16796674 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 16796576  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||| |||||    
T  16796575 tatatcttgaaatgtt 16796560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5223495 - 5223378
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  5223495 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 5223397  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5223396 tgttatatcttgagatgtt 5223378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 29172494 - 29172618
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29172494 agttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttgatagtattgtgatataat 29172593  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  29172594 tgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 201
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876433
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttat 54876420  T
Q  189 atcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||    
T  54876421 atcttgagatgtt 54876433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 10542364 - 10542478
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  10542364 aatatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 10542462  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  10542463 tatatcttgagatgtt 10542478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50243091 - 50242985
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  50243091 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgatgt 50242993  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  50242992 tgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16643363 - 16643246
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  16643363 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 16643265  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  16643264 tgttatatctcaagatgtt 16643246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 346
Target Start/End: Original strand, 37251100 - 37251360
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || |||||| | | || ||||||  |   |||||||||||||    
T  37251100 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgttga-gatgttgttgatttgc-atttgatattgtt 37251197  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37251198 atatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatggaagatgatgttccaaattattgg 37251297  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    | |||||||||| |||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37251298 atttatataagaggtcgatttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcat 37251360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Original strand, 18700247 - 18700353
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18700247 ttgatgttgatggtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt-aattatcatttgatattgttatatctt 18700345  T
Q  194 gagatgtt 201  Q
    ||||||||    
T  18700346 gagatgtt 18700353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Original strand, 43550371 - 43550477
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  43550371 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttg-attatgatttgatgt 43550469  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  43550470 tgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15465266 - 15465149
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  15465266 tataatataatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttg-attatcatttgatat 15465168  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15465167 tgttatatcttgagatgtt 15465149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Original strand, 8928297 - 8928474
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  8928297 agttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgatgtggtatatt 8928395  T
Q  121 tgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8928396 tgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21837612 - 21837499
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  21837612 aatatgatttaatgatgatagtaatgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 21837515  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  21837514 tatatcttgagatgtt 21837499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 201
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691754
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgata-atcatttgatgttattat 17691742  T
Q  189 atcttgagatgtt 201  Q
    ||| |||||||||    
T  17691743 atc-tgagatgtt 17691754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  92 atttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 359
Target Start/End: Original strand, 22110285 - 22110558
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 187  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| |||| |||||| | | || ||||||  |   ||||||||||||||    
T  22110285 tatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgatgttga-gatgctgttgatttgc-atttgatattgtta 22110382  T
Q  188 tatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgga 285  Q
    |||| |||  |||| ||| |  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  22110383 tatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgatgttccaaattattgga 22110482  T
Q  286 gttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
     |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22110483 tttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 22110558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 287
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318845
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||  |  |||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttat 23318747  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||  || |   | || ||||||  |||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  23318748 atcttgaagtgat-actttgatgtctacgttgctgatgtatatt-aataagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaagtattggagt 23318845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527734
Alignment:
Q  136 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgat 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatatt-tatgtgttgcctatgttgctgttgcatattgat 36527785  T
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgga 285  Q
     |||||||| | || |||| ||| |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  36527784 caagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtattgga 36527734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 34852596 - 34852701
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  34852596 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 34852693  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  34852694 tgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 359
Target Start/End: Original strand, 606345 - 606531
Alignment:
Q  176 ttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 273  Q
    |||||||||||||||| |||  || | ||| || || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||  |||||| | |||| |||||    
T  606345 ttgatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatgaatgatgatgttc 606444  T
Q  274 caaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||  ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  606445 caaattgttggatttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgctaatttgtagagtccatgcatactcatacattgttgggggcttga 606531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14569007
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatat--ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatc 191  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | | | ||||||||||||||||    
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgac-tgtcacttgatattgttatatc 14568997  T
Q  192 ttgagatgtt 201  Q
     |||| ||||    
T  14568998 atgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265094
Alignment:
Q  136 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgat 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||  |||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcatgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgcatattgat 3265094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  131 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 22307522 - 22307623
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  22307522 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 22307621  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  22307622 ga 22307623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 31224843 - 31224928
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31224843 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 31224928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31415367 - 31415282
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31415367 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 31415282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914062
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 11914062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18893007 - 18892967
Alignment:
Q  24 tgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgtt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18893007 tgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtt 18892967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 324011 - 323973
Alignment:
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  324011 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 323973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5215031 - 5214946
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5215031 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagtcgttgagtccatgcatactcatt 5214946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 15447886 - 15447971
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15447886 tgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 15447971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40807109 - 40807024
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40807109 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 40807024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40811924 - 40811839
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40811924 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 40811839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 41173258 - 41173343
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41173258 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 41173343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13516514 - 13516434
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccat 332  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||||    
T  13516514 gtcaagttgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccat 13516434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340713
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24340713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642255
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37642255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 6805837 - 6805884
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  6805837 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgtt 6805884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11854746 - 11854715
Alignment:
Q  170 tattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11854746 tattatttgatattgttatatcttgagatgtt 11854715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 300
Target Start/End: Original strand, 52466427 - 52466474
Alignment:
Q  253 tcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52466427 tcaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 52466474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 5206542 - 5206583
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5206542 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 5206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899221
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8899277 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8899221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 17519788 - 17519829
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17519788 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 17519829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 17534650 - 17534691
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17534650 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 17534691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 30175453 - 30175494
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30175453 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 30175494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 52523809 - 52523870
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 296  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52523809 taagctgcatgagtcggtctaagatgacagaagatgttccaaattattggatttatataaga 52523870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051190
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 2051190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 15932393 - 15932433
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15932393 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 15932433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18889781 - 18889741
Alignment:
Q  24 tgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgtt 64  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18889781 tgacccttgggacaggaatggaggttgattatagtactgtt 18889741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Original strand, 50348982 - 50349074
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50348982 gtcaagttttaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatattcatt 50349074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523718
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 52523718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070688
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  53070633 atgatttgatgttgttag-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 53070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22532 - 22195
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || |  | | ||||  ||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22532 agttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 22433  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||  |||| ||   | || || |||| ||    
T  22432 tgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatattgttatatct--agatttttattgtgctgcctatgtt 22336  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaa 318  Q
    | ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  22335 gttgtcgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaa 22236  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22235 gttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 22195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 13987 - 14324
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || |  | | ||||  ||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13987 agttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 14086  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||  |||| ||   | || || |||| ||    
T  14087 tgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgat-tattcttggatattgttatatct--agatttttattgtgctgcctatgtt 14183  T
Q  220 gctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaa 318  Q
    | ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  14184 gttgtcgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttctaagatgtaa 14283  T
Q  319 ggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14284 gttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 14324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 267849 - 267629
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |  ||||||  |   |||||||||||||    
T  267849 atatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttga-gatattgttgatttgc-atttgatattgtt 267752  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| |||||  ||  ||| ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  267751 atatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaattatttg 267652  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttc 307  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  267651 atttatataagaggtcgatgttc 267629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 349
Target Start/End: Original strand, 166627 - 166661
Alignment:
Q  315 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgtt 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166627 gtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgtt 166661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 7362
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  7619 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 7520  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||||||  |||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  7519 tatatctt--gatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttttaaattattgg 7423  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 345  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7422 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattca 7362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14738 - 14481
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  14738 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 14639  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||||||  |||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14638 tatatctt--gatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttttaaattattgg 14542  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 345  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14541 atttatataagaggtcgatgtttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattca 14481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 221074 - 221337
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  221074 agttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttagtaatgtgatatagt 221173  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| | |    
T  221174 tgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgtag 221270  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    ||||| | |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  221271 ctgttatatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggag 221337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 225603 - 225536
Alignment:
Q  79 ctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  225603 ctgatatatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 225536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 225456 - 225388
Alignment:
Q  269 tgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  225456 tgttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcat 225388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36169
Alignment:
Q  35 gtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattat 134  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattat 36321  T
Q  135 gtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattga 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| |||| |    
T  36320 gtggattatataagatgtttaagttgtcgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgttgttgtatattaa 36223  T
Q  235 ttaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  36222 ttaagctgcatgagtcggtctaagatgtaagatgtctttccaaagtattggagt 36169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 9951 - 10130
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9951 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 10050  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10051 tgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 10130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17756 - 17510
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |    
T  17756 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttggtaatgtgatatagt 17657  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||  |||    
T  17656 tgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtactgcctaagttg 17559  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgt 268  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17558 ctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgtaagatgt 17510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 20139 - 20256
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | ||  |||||||||    
T  20139 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttg-attagcatttgatat 20237  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  20238 tgttaaatcttgagatgtt 20256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 9588 - 9851
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9588 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 9687  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||    
T  9688 tgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatg-tctatgtgctgcctatgttg 9784  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     ||||||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9785 ttgttgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagtattggagt 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 206453 - 206729
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  206453 tataacatgatttaatattgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttg-attattatttgatat 206550  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  || |||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| || | || ||| || |||||||||||||||    
T  206551 tgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctatgaagtaggaagttgttccaaattat 206650  T
Q  282 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  206651 tggagttgtataagatgtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 206729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 4625 - 4900
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||  ||| || ||||||    
T  4625 tataatatgatttaatgatgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgat-tatcatatgatat 4723  T
Q  183 tgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattat 281  Q
    | |||||||| || |||||  || |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4724 tattatatctggatatgtta-atgtgttgtatatgttgttgttgtctattaattcaactgcatgagtcggtccaagatgaaagatgttgttccaaattat 4822  T
Q  282 tggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4823 tggatttatctaagaggtcgatgtttctaagatgtaagttattgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 4900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 110907 - 110728
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  110907 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 110808  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110807 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 110728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 145900 - 145815
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  145900 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaaattgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 145815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30295
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |  | |||||||||| ||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttat 30419  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     |||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30418 gtcttgagatgtt-tatgtgatgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatt 30320  T
Q  288 tatataagatgtcgatgttcctaag 312  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  30319 tatataagaggtcgatgtttctaag 30295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 133170 - 132906
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  133170 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaataagatatatt 133071  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  ||| |||    
T  133070 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgaaatgtt-tatgtgctgcatatgttg 132973  T
Q  221 ctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     || |||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  132972 atgatgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgtaagatgtcg-tccaaagtattggagt 132906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 133796 - 133892
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  133796 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 133892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29325
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 151  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29390 aatatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg 29325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2101 - 1883
Alignment:
Q  68 gttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  2101 gttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg- 2003  T
Q  168 aatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagat 266  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||| || || ||||||| |    
T  2002 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcgttctaatatgtaaggt 1904  T
Q  267 gttgttccaaattattggagt 287  Q
    || || ||||| |||||||||    
T  1903 gtcgtcccaaagtattggagt 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 19522 - 19777
Alignment:
Q  30 ttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgc 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19522 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataataatgtgatatatttgtatatgc 19621  T
Q  130 attatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtc 228  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||||| | | || |||| || |||| | |||     
T  19622 attatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttg-attattgtttgacattgttatat-ttgagatgtt-tctgtgctgtc-atgttgcaggtgta 19717  T
Q  229 tattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  19718 tattaaataagatgcatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaagtattggagt 19777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15284
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 142771 - 142571
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  142771 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 142672  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  142671 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagaggtcgttccaaagtgttgg 142573  T
Q  285 ag 286  Q
    ||    
T  142572 ag 142571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 169678 - 169795
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  169678 tataatatgatttaatatttataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 169776  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  169777 tgttatatcttgagatgtt 169795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 96921
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 97095  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg-tctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||||||||  | |||| | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  97094 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggat 96995  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  96994 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 96921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106199
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 106373  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg-tctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggag 286  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||||||||  | |||| | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  106372 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggat 106273  T
Q  287 ttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  106272 ttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 106199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 128904 - 129175
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |   |||||||||||||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgc-atttgatattgttat 129002  T
Q  189 atcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||| |||  |||| ||| |  || |||| ||||||||   |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  129003 atcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatt 129102  T
Q  288 tatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  129103 tatataagaattcgatgtttctaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 129175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78237
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||||| | | || ||||||  | |   |||||||||||    
T  78510 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatgttga-gatgttgttga--tttgcattgatattgtt 78414  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgtt-ccaaattattg 283  Q
    ||||| |||  |||| |||||| || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | || | |||| |||||| ||||    
T  78413 atatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaatgaagatgtttccaaatgattg 78314  T
Q  284 gagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  78313 gatttatataagaggtcgatgttc-taagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 78237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53884
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 53884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 343
Target Start/End: Original strand, 2602 - 2860
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| || |     
T  2602 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatgga 2701  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcg-gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| | |||| |||| |||||| |||||| ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2702 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgactatgttgttcttgtatattaattaagctgcatgtgtcgatttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 2800  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2801 agtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 2860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Original strand, 7991 - 8100
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||| | |||||||||| |    
T  7991 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttg-aatttcatttgatattat 8089  T
Q  186 tatatcttgag 196  Q
    |||||| ||||    
T  8090 tatatcatgag 8100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 927
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |    
T  1128 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattct 1029  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || |||||||| | ||||    
T  1028 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatctaagaggtcgttccaaagtgttgg 930  T
Q  285 agt 287  Q
    |||    
T  929 agt 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4074 - 3858
Alignment:
Q  69 ttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttga 167  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4074 ttcagtgagtcatatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttg- 3976  T
Q  168 aatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagat 266  Q
    | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  3975 attatcatttggtaatgttatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagat 3877  T
Q  267 gttgttccaaattattgga 285  Q
    || |||||||| |||||||    
T  3876 gtcgttccaaagtattgga 3858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 2359 - 2493
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2359 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 2458  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2459 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3146 - 2945
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| |||||    
T  3146 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 3047  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| || |  |||| ||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||    
T  3046 tatatcttgagatgtt-tatgtgctacctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgtaagaggtcgttccaaagtgttgg 2948  T
Q  285 agt 287  Q
    |||    
T  2947 agt 2945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Original strand, 75695 - 76014
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    || |  |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  75695 agttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttatttagagagtctaatacaagatgatttgatgttgttagtaatgtgataaaat 75794  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||  |||    
T  75795 tgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtt-tacgtgctgcctacgttg 75892  T
Q  221 ctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagta 317  Q
    |||||    |||| || ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||   ||    
T  75893 ctgttaaaatattaatcaagctgcatgtgttggtctaagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttata 75992  T
Q  318 aggtgttgagtccatgcatact 339  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  75993 agatgttgagtccatgcatact 76014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 300
Target Start/End: Original strand, 7420 - 7634
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||     
T  7420 aatatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattga 7519  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcgg-tcaagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7520 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtctcggtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgg 7618  T
Q  285 agttatataagatgtc 300  Q
    ||| |||| |||||||    
T  7619 agtcatatgagatgtc 7634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 492
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  609 tataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgtt-aattatcatttgatat 511  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  510 tgttatatcttgagatgtt 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2578
Alignment:
Q  136 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |  || |||| ||| || |||| |||| |    
T  2802 tgaattatttaagatgtttaagttgttgttgat-tatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgcttgtttattaa 2704  T
Q  235 ttaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatg 333  Q
     |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  2703 ctaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatg 2604  T
Q  334 catactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  2603 catactcattcatgttggggacttga 2578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16306
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||||  ||  ||||||||    
T  16028 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttac-atttgata 16126  T
Q  182 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatt 279  Q
    |||||||||| ||   |||| |  ||  |  |||| ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  16127 ttgttatatcatgt--tgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaatt 16224  T
Q  280 attggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  16225 attggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttgagttgttgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttga 16306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13259
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13322 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 13259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2886 - 2849
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2886 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 126144 - 126030
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  126144 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 126046  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  126045 tatatcttgagatgtt 126030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Original strand, 38208 - 38283
Alignment:
Q  213 ctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38208 ctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaagtattggagt 38283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 125727 - 125683
Alignment:
Q  315 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  125727 gtaagttgttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttga 125683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 413 - 209
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  413 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 314  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||    
T  313 tgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgatatgtt-tacgtgttgcctatgttg 216  T
Q  221 ctgttgt 227  Q
    |||||||    
T  215 ctgttgt 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2779 - 2605
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgt 271  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  || |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2779 atttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgt 2680  T
Q  272 tccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2679 tccaaaatattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgcaagttgttgagcccatgcatactcattcat 2605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 24526 - 24643
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  24526 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 24624  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  24625 tgttatatcttgaaatgtt 24643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 105272 - 105155
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  105272 tataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgtt-aattatcatttgatat 105174  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  105173 tgttatatcttgagatgtt 105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Original strand, 6091 - 6230
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    
T  6091 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgt 6189  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  6190 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 902
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  1041 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 943  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  942 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgtctatgttgctgttgt 902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21355 - 21216
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  21355 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 21257  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  21256 tatatcttgagatgtt-tatgtgctgcctatgttgctgttgt 21216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20939 - 20825
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  20939 aatatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 20841  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  20840 tatatcttgagatgtt 20825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 7544 - 7645
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  7544 tgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataagttttcgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 7643  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  7644 ga 7645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8220 - 8064
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  8220 aatatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgt 8122  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgca 244  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8121 tatatcttgagatgtt-tatgtgttgcatatgttgctgttgcatattgataaagttgca 8064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Original strand, 1803 - 1920
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||      
T  1803 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatga 1901  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1902 tgttatatcttgagatgtt 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39444 - 39327
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  39444 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 39346  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39345 tgttatatcttgagatgtt 39327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15920 - 15817
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgag 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15920 atgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgag 15822  T
Q  197 atgtt 201  Q
    |||||    
T  15821 atgtt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25023
Alignment:
Q  91 gatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatat 190  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||  | |   ||||||| |||||||    
T  25290 gatttgatgttg-taataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttga--tttgcattgatatcgttatat 25194  T
Q  191 cttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagtt 288  Q
    | |||| |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||| ||    
T  25193 catgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagaggttgttccaatttattggattt 25094  T
Q  289 atataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25093 ataatagaggtcgatgttc-taagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 25023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 791 - 587
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |  | | | ||  |||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  791 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaa 692  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttg 220  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||  || |  ||||||||||||||||| |||  |||| ||| | |||||||| |||    
T  691 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattg--atttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgttg 594  T
Q  221 ctgttgt 227  Q
     ||||||    
T  593 ttgttgt 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6438 - 6330
Alignment:
Q  28 ccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatat 127  Q
    |||| |||||| |||| | || ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  6438 ccttagggtagaaatgcaagttgattataatactgttgatgttcggtgagtctgatata-tatgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatat 6341  T
Q  128 gcattatgtga 138  Q
    |||||||||||    
T  6340 gcattatgtga 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 19817 - 20091
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| || |||| | | | || ||||||| |   |||||||||||||    
T  19817 atatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgatgctga-gatgttgttgaattgc-atttgatattgtt 19914  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  |||| |||||  || |||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19915 atatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaaagatgatgttccaaattattgg 20014  T
Q  285 agttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  20015 atttatataagaggtcgatgtttctaagaggttaagttgttgagtccatgcatacttattcattgttgggggcttga 20091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 359
Target Start/End: Original strand, 2498 - 2617
Alignment:
Q  241 tgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatact 339  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2498 tgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgtaagttgttgagtccatgcatact 2597  T
Q  340 cattcatgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  2598 cattcatgttgggggcttga 2617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Original strand, 2355 - 2432
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2355 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17648
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  17765 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatat 17667  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17666 tgttatatcttgagatgtt 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31315 - 31198
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||    
T  31315 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtt-tattatcatttgatat 31217  T
Q  183 tgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31216 tgttatatcttgagatgtt 31198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 375 - 269
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |    
T  375 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttg-attatgatttgatgt 277  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  276 tgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6800 - 6686
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  6800 aatatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatattgt 6702  T
Q  186 tatatcttgagatgtt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  6701 tatatcttgagatgtt 6686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 67452 - 67342
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  67452 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgt 67354  T
Q  183 tgttatatcttg 194  Q
    ||||||||||||    
T  67353 tgttatatcttg 67342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10152
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatg-attattatttgatattgttacatctt 10246  T
Q  194 gagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    |||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||  | | |||||| | |||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  10245 gagatgtt-tatgtgctgcttatgttgctgttgtaaaataattaagctccatgtgtcagtctaagatgtaatatgtcgttccaaagtgttggagt 10152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 135
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  219 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttga 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12327 - 12221
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatat 182  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  12327 tataatatggtttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttg-attatgatttgatgt 12229  T
Q  183 tgttatat 190  Q
    ||||||||    
T  12228 tgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12185
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12241 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1785
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgtt-cactgagtctgat-ataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||| ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| || | ||||||||||    
T  1958 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattttaatgctgtaaatgtttcagagagtctgattataatatagtttgatgttgttaatgatgtgatata 1859  T
Q  119 tttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  1858 tttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11392 - 11054
Alignment:
Q  28 ccttggggtaggaatggaggtcgattatag-tactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtata 126  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||   |||||  |||||||| |||| | ||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  11392 ccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatgtgatatagttgtata 11294  T
Q  127 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg 226  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || || | |||||||||    
T  11293 tgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatcctgagatgtt-tatgtgctgcctgtgttgctgttg 11197  T
Q  227 tctattgattaagttgcatgagtcg---------gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagt 316  Q
    | |||  |||||||||||   ||||         || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||  ||    
T  11196 tatatctattaagttgcaaatgtcgatctaagttgtgaagttgtaagatgttgttccaaaatattggagtcatataagatgtcgatgttgtccaagttgt 11097  T
Q  317 aaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  11096 aggatgtttggtccatgcatactcatttaagttgggggcttga 11054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22492 - 22154
Alignment:
Q  28 ccttggggtaggaatggaggtcgattatag-tactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtata 126  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||   |||||  |||||||| |||| | ||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22492 ccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatgtgatatagttgtata 22394  T
Q  127 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttg 226  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || || | |||||||||    
T  22393 tgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttg-attatcatttgatattgttatatcctgagatgtt-tatgtgctgcctgtgttgctgttg 22297  T
Q  227 tctattgattaagttgcatgagtcg---------gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagt 316  Q
    | |||  |||||||||||   ||||         || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||  ||    
T  22296 tatatctattaagttgcaaatgtcgatctaagttgtgaagttgtaagatgttgttccaaaatattggagtcatataagatgtcgatgttgtccaagttgt 22197  T
Q  317 aaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||| | || || ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22196 aagatatttaggccatgcatactcatttaagttgggggcttga 22154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 103711 - 103837
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  103711 taagctgcattagtcggtctaagttgaaagaggatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgttgagtccatg 103810  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||    
T  103811 catactcattcattgttgggggcttga 103837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 120197 - 120058
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgt 185  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||    
T  120197 aatacgatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttg-attatcatttgatattgt 120099  T
Q  186 tatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  120098 tatatcttgagatgtt-tacgtgttgcctatgttgctgttgt 120058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 117133 - 117095
Alignment:
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  117133 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 117095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32545 - 32472
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  32545 gatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcat 32472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 3256 - 3340
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3256 tataatatcatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttga 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3849 - 3703
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatt 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |  | | ||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3849 agttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatt 3750  T
Q  121 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3749 tgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttga 3703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 101
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||    
T  209 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatg-tttatcatttgatattgttat 111  T
Q  189 atcttgagat 198  Q
    ||||||||||    
T  110 atcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgc 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 480
Alignment:
Q  176 ttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttc 273  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||| || |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||| |  ||| |||||    
T  652 ttgatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaattatgatgttc 553  T
Q  274 caaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattcat 346  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  552 caaattattggatttatataagaggtcgatgtt-ctaagatgctaagttgttgagtccatgcatactcattcat 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10666 - 10464
Alignment:
Q  83 tataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  10666 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatg 10568  T
Q  182 ttgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaatta 280  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||||| | || |||| ||| |||||| |||  ||||||| ||    
T  10567 ttgttacatctagagatgtt-tatgtgttgcctatgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagta 10469  T
Q  281 ttgga 285  Q
    |||||    
T  10468 ttgga 10464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 82343 - 82235
Alignment:
Q  85 taatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcat----tatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  82343 taatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatgatttgat 82245  T
Q  181 attgttatat 190  Q
     |||||||||    
T  82244 gttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Original strand, 80435 - 80487
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  80435 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 80487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15111
Alignment:
Q  119 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29723
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttga 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatctgga 29753  T
Q  196 gatgttctatatgttgtctatcttgctgttg 226  Q
     ||||| | | |||||||||| ||| |||||    
T  29752 tatgttat-tgtgttgtctatgttgttgttg 29723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3246
Alignment:
Q  147 agatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatg 246  Q
    |||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgat-tgtcatttgatattgttatatcttgagatatt-tatgtgttgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatg 3288  T
Q  247 agtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  3287 tgtcggtctaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagt 3246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5575 - 5490
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5575 tgtaagatgttgttccaaagtatttgagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 5490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3430 - 3387
Alignment:
Q  21 agttgacccttggggtaggaatggaggtcgattatagtactgtt 64  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3430 agttgatccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgtt 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 16861 - 17048
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgag 196  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||||||     
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttatatcttgaa 16958  T
Q  197 atgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
     || | | | || || || | |||||| ||| |||| | |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  16959 gtgatat-tttgctgcctctgttgctgatgtatatt-aataagctgcatgagccggtctaagatgaaagatgtcgttccaaagtattggagt 17048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26117
Alignment:
Q  92 atttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatc 191  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttg--attgtccttgatattgttatatc 26113  T
Q  192 ttga 195  Q
    ||||    
T  26114 ttga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 589 - 699
Alignment:
Q  83 tataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgata 181  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  589 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatg 687  T
Q  182 ttgttatatctt 193  Q
    ||||||||||||    
T  688 ttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 270
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6399
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| | |   ||||||||||||     
T  6215 atatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttg-atttgcatttgatattgtc 6313  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttg 270  Q
    ||||| |||| |||| |||||  || |||| |||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6314 atatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaaagatgttg 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 359
Target Start/End: Original strand, 13836 - 13888
Alignment:
Q  308 ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13836 ctaagatgaaagatgttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttga 13888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38506 - 38339
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||   ||||||||||||     
T  38506 atatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttg-aattgcatttgatattgtc 38408  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctg-ttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc 254  Q
    ||||| |||| |||| |||||  || |||| |||||| ||||  ||| | |||| ||||||||||||||    
T  38407 atatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 85739 - 85620
Alignment:
Q  82 atataatatgatttga-tgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgat 180  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  85739 atataatatgattttaatgtcgatattaatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttg-attattatttgat 85641  T
Q  181 attgttatatcttgagatgtt 201  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  85640 gttgttatatcttgaggtgtt 85620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 160
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13502
Alignment:
Q  86 aatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13430 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttg--tatgcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7884
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatat 207  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttg-cttattatttgatattgttatatc-tgagatgtt-tatgt 7904  T
Q  208 gttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||| |||| ||| ||||||    
T  7903 gttgcctatgttgttgttgt 7884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7610 - 7572
Alignment:
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7610 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 7572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 1878 - 2004
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| | |||| |||||||||||||    
T  1878 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagtccatg 1977  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||    
T  1978 cacactcattcattgttgggggcttga 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1796
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 153  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  1730 atatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatgtt 1796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 6566 - 6607
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6566 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 6607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 359
Target Start/End: Original strand, 27829 - 27955
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  27829 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgttgagtccatg 27928  T
Q  334 catactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||    
T  27929 cattcgcattcattgttgggggcttga 27955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Original strand, 27677 - 27727
Alignment:
Q  83 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 133  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27677 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcatta 27727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57807
Alignment:
Q  92 atttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatc 191  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttgttgttg--attgtcattgatattgttatatc 57902  T
Q  192 ttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagt 287  Q
    ||||  || | | | || || |||| |||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||  ||||||||    
T  57901 ttgaagtgatgt-tttgctgcctatgttgctgatgtatatt-aataagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgtcgttccaaagcattggagt 57807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 6116
Alignment:
Q  107 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttga 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6203 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatg-tttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 146366 - 146261
Alignment:
Q  94 ttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatct 192  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  146366 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatct 146269  T
Q  193 tgagatgt 200  Q
    ||||||||    
T  146268 tgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Original strand, 136493 - 136590
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | | || ||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  136493 gatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagttgtcgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttga 136590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Original strand, 145201 - 145298
Alignment:
Q  264 gatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcggggcttga 359  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | | || ||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  145201 gatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagttgtcgagtccatgcattcgcattcattgttgggggcttga 145298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11335 - 11227
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttc 350  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11335 gtcaagttgtaagttgttgatccaaagtattggagtcatataagatgtcgatgatgtccatgttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttg 11236  T
Q  351 ggggcttga 359  Q
     ||||||||    
T  11235 agggcttga 11227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48493 - 48403
Alignment:
Q  109 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgt 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48493 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgat-tatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 4680 - 4781
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  4680 tgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataagttgtggatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaagttgagggctt 4779  T
Q  358 ga 359  Q
    ||    
T  4780 ga 4781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Original strand, 14726 - 14813
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||  |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14726 tgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataaattgtcgatgttgtctaagttgtaagttgttgagaccatgcatactcattca 14813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55030 - 54945
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55030 tgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 54945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12602 - 12507
Alignment:
Q  243 catgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcat 336  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12602 catgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcat 12507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39275 - 39190
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39275 tgtaagatgttgttctaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatt 39190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 634
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1050 - 970
Alignment:
Q  266 tgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcattca 345  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1050 tgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattca 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1338
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 1338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15072
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgat-tatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 15072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20816 - 20724
Alignment:
Q  252 gtcaagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||  | |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20816 gtcaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataaattgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccgtgcatactcatt 20724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18250
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 167  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  18170 atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttga 18250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 227
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4340
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgatatgtt-tacgtgttgcctattttgctgttgt 4340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7506 - 7468
Alignment:
Q  321 tgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7506 tgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttga 7468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15417 - 15375
Alignment:
Q  315 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggctt 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15417 gtaagttgttgagtccatgcatactcattcatgttgggggctt 15375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Original strand, 53649 - 53755
Alignment:
Q  255 aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtccatgcatactcattca-tgttcgg 352  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  53649 aagatgaaagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagatgatgagttgttgagtccatgcattcacattcattgttggg 53748  T
Q  353 ggcttga 359  Q
    |||||||    
T  53749 ggcttga 53755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Original strand, 53482 - 53540
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 146  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  53482 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 53540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 60418 - 60334
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttc-ctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcat 342  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| || |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  60418 tgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcat 60334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1073 - 1012
Alignment:
Q  236 taagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattggagttatataaga 296  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1073 taagctgcatgagtcggtctaagatgaaagaagatgttccaaattattggacttatataaga 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 127
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 154  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1529 - 1488
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1529 tgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtc 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 9697 - 9782
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||   ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9697 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcatt 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10858 - 10773
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10858 tgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgaggtgtataagttattaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 11700 - 11785
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  | |||  ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11700 tgtaagatgttgttccaaagtattggaatcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgctgagtccatacatactcatt 11785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14303 - 14218
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaagtaaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14303 tgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 14218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11595
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6948
Alignment:
Q  141 tatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttg-agtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtt 6948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18017
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38246
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 296
Target Start/End: Original strand, 8006 - 8215
Alignment:
Q  87 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtt 186  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||   | || ||||||  | | |||||||||||||    
T  8006 atatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgt-gatgttgttgatttgt-atttgatattgtt 8103  T
Q  187 atatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgtt-gtctattgattaagttgcatgagtcggtc-aagatgtaagatgttgttccaaattattgg 284  Q
    ||||| |||  || | | |||  || |||| |||||||| || | || | |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  8104 atatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgttccaaattattgg 8203  T
Q  285 agttatataaga 296  Q
    | |||| |||||    
T  8204 atttatttaaga 8215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 56835 - 56792
Alignment:
Q  315 gtaaggtgttgagtccatgcatactcattcatgttcggggcttg 358  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  56835 gtaagttgttgagtccatgcagactcattcatgttgggggcttg 56792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446608
Alignment:
Q  97 atgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 446608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 76864 - 76823
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  76864 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc 76823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 446502 - 446417
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtt-cctaagaagtaaggtgttgagtccatgcatactcatt 343  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  446502 tgtaaaatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttaattccatgcatactcatt 446417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 163004 - 163103
Alignment:
Q  58 tactgttaacgttcactgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag 157  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| || || | || || ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  163004 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gatgttgttaatattatggtaaatttgaaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaag 163102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9877
Alignment:
Q  91 gatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9930 gatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1315
Alignment:
Q  88 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1259 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 343
Target Start/End: Original strand, 19334 - 19419
Alignment:
Q  260 gtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgtcgatgttcctaagaag-taaggtgttgagtcca-tgcatactcatt 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||  ||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19334 gtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Original strand, 58819 - 58871
Alignment:
Q  174 atttgatattgttatatcttgagatgttctatatgttgtctatcttgctgttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  58819 atttgatattgttatatcttgagatgtt-tatgtgtcgcctatgttgctgttgt 58871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 6932 - 6987
Alignment:
Q  145 taagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgat-tatcatttaatgttgttatatcttgagatgtt 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 8325 - 8365
Alignment:
Q  259 tgtaagatgttgttccaaattattggagttatataagatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8325 tgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79319
Alignment:
Q  89 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 145  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  79264 atgatttgatgttgtta-tattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatat 79319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University