View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6890_high_4 (Length: 545)

Name: NF6890_high_4
Description: NF6890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6890_high_4
NF6890_high_4
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (13-534)||(16926129-16926650)
chr2 (13-534)||(16999769-17000290)
chr2 (14-534)||(10869619-10870139)
chr2 (13-534)||(24263139-24263660)
chr2 (13-534)||(27218785-27219306)
chr2 (13-534)||(21144194-21144715)
chr2 (13-534)||(27372038-27372559)
chr2 (14-534)||(44384723-44385243)
chr2 (13-535)||(41607538-41608060)
chr2 (13-534)||(24710803-24711324)
chr2 (13-534)||(24875903-24876423)
chr2 (13-534)||(22324009-22324530)
chr2 (14-535)||(21324420-21324941)
chr2 (121-534)||(16923658-16924071)
chr2 (121-534)||(16982921-16983334)
chr2 (14-535)||(24676257-24676778)
chr2 (14-535)||(24706636-24707157)
chr2 (205-534)||(17064486-17064815)
chr2 (13-534)||(23106882-23107404)
chr2 (13-534)||(23111505-23112026)
chr2 (32-535)||(23099190-23099693)
chr2 (17-535)||(27209329-27209847)
chr2 (13-282)||(23072884-23073153)
chr2 (17-429)||(23277650-23278062)
chr2 (26-465)||(12575191-12575630)
chr2 (17-495)||(19651207-19651685)
chr2 (17-429)||(24949464-24949876)
chr2 (35-463)||(27788581-27789008)
chr2 (14-486)||(45533162-45533634)
chr2 (17-436)||(20829126-20829545)
chr2 (17-429)||(23294809-23295221)
chr2 (17-436)||(1064618-1065037)
chr2 (32-324)||(25264033-25264325)
chr2 (16-486)||(30011340-30011808)
chr2 (17-436)||(31831525-31831944)
chr2 (23-440)||(12639396-12639813)
chr2 (16-486)||(30210074-30210543)
chr2 (23-442)||(24830351-24830770)
chr2 (14-110)||(9485409-9485505)
chr2 (435-534)||(9610905-9611004)
chr2 (92-442)||(22278966-22279316)
chr2 (92-442)||(24568900-24569250)
chr2 (293-534)||(23067160-23067400)
chr2 (377-535)||(22755982-22756140)
chr2 (92-442)||(22760801-22761151)
chr2 (92-442)||(25129470-25129820)
chr2 (468-534)||(17068144-17068210)
chr2 (410-534)||(21890268-21890392)
chr2 (92-259)||(25133625-25133792)
chr2 (17-102)||(19718174-19718259)
chr2 (230-314)||(17967134-17967218)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (13-534)||(23956885-23957406)
chr4 (14-534)||(29037758-29038278)
chr4 (13-534)||(8051976-8052497)
chr4 (13-534)||(12477738-12478259)
chr4 (13-534)||(19777146-19777667)
chr4 (13-534)||(8387550-8388071)
chr4 (15-534)||(14302333-14302852)
chr4 (13-534)||(40474178-40474699)
chr4 (13-534)||(18298343-18298864)
chr4 (13-534)||(27712474-27712995)
chr4 (14-534)||(12524814-12525334)
chr4 (14-534)||(14681705-14682225)
chr4 (14-535)||(15146239-15146760)
chr4 (26-535)||(18614190-18614699)
chr4 (82-535)||(16353867-16354320)
chr4 (22-535)||(18225808-18226321)
chr4 (14-534)||(14160608-14161128)
chr4 (13-534)||(14849719-14850240)
chr4 (13-486)||(8707106-8707570)
chr4 (14-519)||(14695266-14695771)
chr4 (17-429)||(15247167-15247579)
chr4 (13-429)||(15071602-15072018)
chr4 (32-533)||(27901525-27902026)
chr4 (17-429)||(16148954-16149366)
chr4 (17-429)||(16153100-16153512)
chr4 (17-535)||(15001981-15002499)
chr4 (14-237)||(56566145-56566368)
chr4 (17-487)||(1647894-1648364)
chr4 (35-463)||(51605427-51605855)
chr4 (17-436)||(3263411-3263830)
chr4 (17-396)||(15357737-15358116)
chr4 (17-436)||(11205848-11206267)
chr4 (17-436)||(29452154-29452573)
chr4 (119-426)||(33224169-33224476)
chr4 (23-442)||(14998546-14998964)
chr4 (17-436)||(44660483-44660902)
chr4 (223-532)||(15413849-15414158)
chr4 (23-442)||(15291781-15292200)
chr4 (92-438)||(9292069-9292415)
chr4 (209-495)||(15320313-15320599)
chr4 (62-384)||(18548721-18549043)
chr4 (263-459)||(20892195-20892391)
chr4 (110-277)||(12341575-12341742)
chr4 (388-535)||(15078772-15078919)
chr4 (338-442)||(13248875-13248979)
chr4 (13-54)||(15320610-15320651)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (13-534)||(8535-9056)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (13-534)||(44789973-44790494)
chr7 (14-534)||(8199755-8200275)
chr7 (13-534)||(14333523-14334044)
chr7 (13-534)||(8708732-8709253)
chr7 (13-534)||(18550380-18550901)
chr7 (13-535)||(15159679-15160201)
chr7 (13-535)||(11235835-11236357)
chr7 (13-535)||(13687190-13687712)
chr7 (33-534)||(23202255-23202756)
chr7 (33-534)||(23508382-23508883)
chr7 (13-534)||(18178869-18179393)
chr7 (15-532)||(12688629-12689147)
chr7 (14-534)||(14955681-14956201)
chr7 (14-534)||(11551725-11552245)
chr7 (22-535)||(9597183-9597696)
chr7 (22-535)||(15949-16462)
chr7 (26-535)||(14212800-14213309)
chr7 (173-534)||(10872122-10872483)
chr7 (14-535)||(15147508-15148029)
chr7 (17-534)||(320663-321180)
chr7 (14-534)||(11770864-11771384)
chr7 (13-534)||(12205400-12205921)
chr7 (14-534)||(14040822-14041342)
chr7 (14-534)||(14350852-14351372)
chr7 (13-535)||(19148338-19148860)
chr7 (13-535)||(20747737-20748259)
chr7 (14-534)||(15204746-15205266)
chr7 (32-535)||(11387047-11387550)
chr7 (17-429)||(15101207-15101619)
chr7 (17-493)||(16070899-16071375)
chr7 (32-441)||(15341652-15342061)
chr7 (17-435)||(14284980-14285398)
chr7 (17-512)||(19613825-19614320)
chr7 (17-535)||(14262848-14263366)
chr7 (35-535)||(18052575-18053075)
chr7 (35-493)||(13022526-13022984)
chr7 (32-465)||(23504489-23504922)
chr7 (37-429)||(30-423)
chr7 (17-426)||(16949076-16949485)
chr7 (17-495)||(12457807-12458285)
chr7 (17-487)||(13666712-13667182)
chr7 (17-436)||(11304867-11305286)
chr7 (17-495)||(13967272-13967750)
chr7 (23-442)||(7825119-7825538)
chr7 (23-442)||(27106406-27106825)
chr7 (23-442)||(27171500-27171919)
chr7 (17-456)||(49153507-49153946)
chr7 (17-436)||(26117194-26117628)
chr7 (92-442)||(4441147-4441497)
chr7 (14-288)||(15625898-15626172)
chr7 (23-442)||(14937566-14937984)
chr7 (92-442)||(15365159-15365508)
chr7 (317-534)||(15625681-15625898)
chr7 (21-441)||(17924871-17925291)
chr7 (117-384)||(39872-40139)
chr7 (89-274)||(15717601-15717786)
chr7 (107-284)||(23642820-23642997)
chr7 (228-442)||(13354368-13354582)
chr7 (341-442)||(13455966-13456067)
chr7 (35-198)||(14139143-14139306)
chr7 (353-463)||(14434890-14435000)
chr7 (93-441)||(21673236-21673583)
chr7 (22-273)||(17143893-17144144)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (13-534)||(33389714-33390235)
chr1 (15-534)||(21831456-21831975)
chr1 (15-534)||(21838103-21838623)
chr1 (13-534)||(51332178-51332699)
chr1 (17-534)||(16349285-16349804)
chr1 (14-534)||(19107521-19108041)
chr1 (17-534)||(41352351-41352868)
chr1 (14-535)||(21025325-21025846)
chr1 (22-535)||(21234425-21234938)
chr1 (22-535)||(17043709-17044222)
chr1 (13-534)||(430801-431322)
chr1 (17-534)||(21750093-21750610)
chr1 (13-534)||(22360929-22361450)
chr1 (14-369)||(24793303-24793658)
chr1 (17-396)||(21744241-21744620)
chr1 (237-534)||(16373682-16373980)
chr1 (17-534)||(23196938-23197452)
chr1 (17-429)||(20834589-20835001)
chr1 (17-429)||(19855563-19855975)
chr1 (17-495)||(20855449-20855927)
chr1 (302-535)||(16077630-16077863)
chr1 (17-449)||(19661825-19662258)
chr1 (179-519)||(22110190-22110530)
chr1 (179-519)||(22114039-22114379)
chr1 (17-429)||(24098292-24098704)
chr1 (35-429)||(21952167-21952561)
chr1 (17-429)||(20938752-20939164)
chr1 (17-493)||(20295606-20296082)
chr1 (208-534)||(19759753-19760079)
chr1 (17-459)||(31538686-31539128)
chr1 (14-435)||(20060638-20061059)
chr1 (14-242)||(16377587-16377815)
chr1 (17-459)||(37678308-37678750)
chr1 (23-442)||(20830087-20830506)
chr1 (23-442)||(22134252-22134671)
chr1 (92-417)||(20914871-20915196)
chr1 (23-246)||(52987212-52987436)
chr1 (14-240)||(50619084-50619296)
chr1 (416-534)||(50619332-50619450)
chr1 (14-183)||(22116417-22116586)
chr1 (173-286)||(41216702-41216815)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (14-534)||(34567564-34568084)
chr5 (14-534)||(16357572-16358092)
chr5 (13-534)||(22331682-22332203)
chr5 (13-535)||(22135737-22136259)
chr5 (13-534)||(27519477-27519997)
chr5 (13-534)||(27611424-27611945)
chr5 (13-535)||(14998534-14999056)
chr5 (13-535)||(27684195-27684717)
chr5 (13-534)||(37290291-37290812)
chr5 (13-534)||(40709850-40710371)
chr5 (13-534)||(19771030-19771551)
chr5 (13-534)||(41771912-41772433)
chr5 (13-535)||(29474868-29475390)
chr5 (13-534)||(27667285-27667806)
chr5 (42-535)||(18776865-18777358)
chr5 (42-535)||(23574798-23575291)
chr5 (14-535)||(23441279-23441798)
chr5 (13-534)||(21562768-21563289)
chr5 (13-534)||(25427503-25428024)
chr5 (14-491)||(23472341-23472817)
chr5 (18-534)||(26737527-26738043)
chr5 (14-342)||(20800659-20800987)
chr5 (17-534)||(21338096-21338613)
chr5 (17-426)||(28893741-28894150)
chr5 (17-426)||(28922567-28922976)
chr5 (17-429)||(20822610-20823022)
chr5 (14-503)||(20466895-20467383)
chr5 (17-426)||(28915212-28915621)
chr5 (17-426)||(28930480-28930889)
chr5 (260-535)||(21882018-21882293)
chr5 (21-534)||(22463003-22463516)
chr5 (17-429)||(24619094-24619506)
chr5 (17-429)||(24715325-24715737)
chr5 (17-429)||(24748353-24748765)
chr5 (35-503)||(17268151-17268619)
chr5 (17-512)||(21679577-21680072)
chr5 (17-394)||(21871850-21872226)
chr5 (17-394)||(21876130-21876506)
chr5 (17-309)||(20777190-20777482)
chr5 (17-429)||(22234719-22235131)
chr5 (17-429)||(22503836-22504248)
chr5 (17-436)||(14885790-14886209)
chr5 (86-429)||(23078957-23079300)
chr5 (17-436)||(24797196-24797615)
chr5 (17-436)||(20343432-20343851)
chr5 (14-444)||(21408298-21408728)
chr5 (362-535)||(23517595-23517768)
chr5 (71-436)||(25849225-25849590)
chr5 (23-442)||(21935993-21936412)
chr5 (17-436)||(37542180-37542599)
chr5 (23-441)||(24582355-24582773)
chr5 (89-447)||(27012223-27012581)
chr5 (13-104)||(22349419-22349510)
chr5 (398-535)||(20800517-20800654)
chr5 (89-286)||(23504544-23504741)
chr5 (335-534)||(21830878-21831077)
chr5 (251-352)||(822-923)
chr5 (311-495)||(20774850-20775034)
chr5 (265-381)||(21497147-21497263)
chr5 (125-276)||(21624140-21624291)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (14-534)||(15588245-15588765)
chr3 (14-534)||(16636530-16637050)
chr3 (14-534)||(43163854-43164374)
chr3 (13-534)||(20060906-20061427)
chr3 (13-534)||(48426204-48426725)
chr3 (13-534)||(13253447-13253968)
chr3 (14-534)||(15340026-15340546)
chr3 (15-534)||(15401371-15401890)
chr3 (13-532)||(15723786-15724305)
chr3 (13-534)||(10006357-10006878)
chr3 (13-534)||(10906967-10907488)
chr3 (13-534)||(15347097-15347618)
chr3 (13-534)||(5423782-5424303)
chr3 (17-534)||(6601493-6602010)
chr3 (13-532)||(16411133-16411653)
chr3 (17-524)||(53383874-53384381)
chr3 (14-532)||(14875352-14875870)
chr3 (14-535)||(12499004-12499525)
chr3 (14-535)||(14579795-14580316)
chr3 (22-485)||(16805808-16806271)
chr3 (14-535)||(16692920-16693441)
chr3 (17-337)||(3686897-3687217)
chr3 (13-534)||(17490607-17491128)
chr3 (149-535)||(14125582-14125968)
chr3 (13-273)||(5109463-5109723)
chr3 (14-534)||(15260387-15260907)
chr3 (120-534)||(16491140-16491554)
chr3 (173-535)||(15062474-15062836)
chr3 (13-534)||(15228416-15228937)
chr3 (13-534)||(15234284-15234805)
chr3 (17-429)||(31939775-31940187)
chr3 (17-535)||(10418890-10419408)
chr3 (17-218)||(16755557-16755758)
chr3 (17-535)||(16827048-16827566)
chr3 (17-513)||(13970965-13971461)
chr3 (35-463)||(16379791-16380219)
chr3 (32-535)||(44778013-44778516)
chr3 (17-429)||(31694030-31694443)
chr3 (35-535)||(13942790-13943290)
chr3 (32-436)||(16835370-16835774)
chr3 (35-535)||(41178288-41178788)
chr3 (37-449)||(17187226-17187638)
chr3 (17-512)||(14087462-14087957)
chr3 (17-462)||(13319347-13319792)
chr3 (333-534)||(16755757-16755958)
chr3 (17-429)||(12359372-12359784)
chr3 (51-459)||(11960048-11960456)
chr3 (199-495)||(14574729-14575025)
chr3 (18-408)||(12179231-12179621)
chr3 (376-534)||(26791614-26791772)
chr3 (13-159)||(12887841-12887987)
chr3 (17-429)||(16328505-16328917)
chr3 (17-405)||(18133191-18133579)
chr3 (17-436)||(28755183-28755602)
chr3 (17-436)||(47124809-47125228)
chr3 (14-510)||(15014609-15015105)
chr3 (23-442)||(30138665-30139084)
chr3 (23-442)||(30148216-30148635)
chr3 (23-441)||(8273261-8273679)
chr3 (182-459)||(16337522-16337799)
chr3 (23-442)||(13966206-13966625)
chr3 (23-442)||(16741565-16741984)
chr3 (23-439)||(18750806-18751221)
chr3 (23-442)||(6151715-6152134)
chr3 (23-442)||(15610962-15611381)
chr3 (23-442)||(17193953-17194372)
chr3 (92-442)||(25767177-25767527)
chr3 (95-442)||(16258003-16258350)
chr3 (92-442)||(12793000-12793350)
chr3 (371-535)||(16372168-16372332)
chr3 (94-378)||(55514651-55514935)
chr3 (268-535)||(17493396-17493663)
chr3 (17-242)||(10384730-10384955)
chr3 (93-442)||(6711344-6711692)
chr3 (335-535)||(4679204-4679404)
chr3 (167-277)||(15096030-15096140)
chr3 (346-534)||(11302947-11303135)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (15-534)||(8108-8627)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (13-534)||(20017319-20017840)
chr8 (13-534)||(17673079-17673600)
chr8 (14-534)||(19113894-19114414)
chr8 (13-535)||(18857780-18858302)
chr8 (13-535)||(22128015-22128536)
chr8 (13-535)||(22119231-22119752)
chr8 (17-534)||(19483124-19483641)
chr8 (17-535)||(21165598-21166116)
chr8 (22-535)||(30312209-30312722)
chr8 (22-535)||(22041062-22041579)
chr8 (14-535)||(19979170-19979691)
chr8 (22-535)||(15534586-15535099)
chr8 (22-535)||(32601347-32601860)
chr8 (22-535)||(22132106-22132619)
chr8 (13-535)||(23651244-23651766)
chr8 (13-534)||(21392921-21393442)
chr8 (13-534)||(21787415-21787936)
chr8 (13-534)||(21043649-21044170)
chr8 (13-527)||(21252155-21252669)
chr8 (13-534)||(21920792-21921313)
chr8 (14-534)||(20395189-20395709)
chr8 (13-426)||(20389411-20389824)
chr8 (13-535)||(20008977-20009498)
chr8 (14-534)||(22376510-22377031)
chr8 (14-534)||(22382685-22383206)
chr8 (14-534)||(22247490-22247994)
chr8 (39-288)||(16407199-16407448)
chr8 (17-510)||(23886252-23886745)
chr8 (47-535)||(20984637-20985125)
chr8 (32-495)||(23656170-23656633)
chr8 (13-429)||(22372240-22372656)
chr8 (32-495)||(22052106-22052569)
chr8 (17-459)||(29302486-29302928)
chr8 (71-535)||(21841620-21842084)
chr8 (35-463)||(31569920-31570348)
chr8 (17-429)||(16270284-16270696)
chr8 (17-429)||(21324329-21324740)
chr8 (35-436)||(6604960-6605361)
chr8 (35-384)||(20974734-20975083)
chr8 (17-511)||(31415531-31416028)
chr8 (23-440)||(16876161-16876578)
chr8 (32-436)||(14566444-14566848)
chr8 (92-442)||(20651468-20651818)
chr8 (13-273)||(19860900-19861160)
chr8 (92-442)||(22435599-22435949)
chr8 (194-459)||(12306037-12306302)
chr8 (269-535)||(19852614-19852880)
chr8 (17-350)||(27355924-27356257)
chr8 (23-442)||(21849403-21849822)
chr8 (269-535)||(19858650-19858916)
chr8 (93-442)||(21195638-21195987)
chr8 (390-535)||(16407478-16407623)
chr8 (14-141)||(22422949-22423076)
chr8 (23-276)||(23156106-23156359)
chr8 (117-384)||(19869047-19869314)
chr8 (94-381)||(23901544-23901831)
chr8 (92-277)||(22316652-22316837)
chr8 (182-403)||(22623268-22623482)
chr8 (302-436)||(1267540-1267674)
chr8 (338-442)||(23156393-23156497)
chr8 (302-436)||(6680413-6680547)
chr8 (416-534)||(22988400-22988518)
chr8 (348-436)||(803064-803152)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (14-534)||(2873562-2874082)
chr6 (14-534)||(29590679-29591199)
chr6 (17-534)||(28261959-28262476)
chr6 (17-534)||(28340708-28341225)
chr6 (13-534)||(25113554-25114075)
chr6 (17-534)||(27188438-27188955)
chr6 (17-534)||(27260285-27260802)
chr6 (93-534)||(24312006-24312447)
chr6 (14-535)||(19865688-19866209)
chr6 (17-535)||(5837981-5838499)
chr6 (14-535)||(22443268-22443789)
chr6 (137-535)||(1541966-1542364)
chr6 (14-535)||(22434870-22435391)
chr6 (20-535)||(27564596-27565101)
chr6 (17-535)||(16962207-16962725)
chr6 (13-535)||(25608619-25609141)
chr6 (17-535)||(16926400-16926920)
chr6 (13-534)||(22761213-22761734)
chr6 (13-281)||(16621838-16622106)
chr6 (13-534)||(18406702-18407221)
chr6 (14-534)||(23079471-23079991)
chr6 (275-534)||(16625737-16625996)
chr6 (14-531)||(18196492-18197001)
chr6 (17-495)||(15460377-15460855)
chr6 (13-535)||(21472602-21473124)
chr6 (13-486)||(19488030-19488503)
chr6 (189-534)||(20636235-20636580)
chr6 (32-535)||(21568768-21569271)
chr6 (17-429)||(5295968-5296380)
chr6 (14-273)||(21754481-21754736)
chr6 (175-534)||(15897096-15897454)
chr6 (120-535)||(21562997-21563412)
chr6 (14-528)||(18966054-18966565)
chr6 (26-463)||(28281584-28282021)
chr6 (17-512)||(18795714-18796209)
chr6 (17-534)||(10467611-10468128)
chr6 (18-498)||(34644349-34644829)
chr6 (17-534)||(14378678-14379196)
chr6 (17-534)||(14380228-14380746)
chr6 (17-429)||(24365519-24365931)
chr6 (14-222)||(25763987-25764195)
chr6 (14-429)||(19880405-19880820)
chr6 (23-442)||(16381141-16381560)
chr6 (13-194)||(20634698-20634879)
chr6 (17-396)||(19436142-19436521)
chr6 (23-440)||(16648737-16649154)
chr6 (167-487)||(19454469-19454789)
chr6 (23-442)||(1647582-1648001)
chr6 (92-442)||(18836745-18837095)
chr6 (333-534)||(22077768-22077969)
chr6 (89-442)||(23997342-23997695)
chr6 (92-442)||(16234122-16234472)
chr6 (14-444)||(18449602-18450027)
chr6 (23-286)||(16099259-16099522)
chr6 (173-442)||(14624275-14624544)
chr6 (92-442)||(23026553-23026903)
chr6 (92-442)||(35274923-35275273)
chr6 (256-429)||(8761934-8762107)
chr6 (110-447)||(14129558-14129895)
chr6 (92-286)||(18574439-18574633)
chr6 (13-97)||(24294540-24294624)
chr6 (173-442)||(21928299-21928568)
chr6 (359-534)||(27330537-27330712)
chr6 (359-534)||(27391277-27391452)
chr6 (23-277)||(19986184-19986444)
chr6 (317-442)||(18572745-18572872)
chr6 (17-57)||(28283917-28283957)
chr6 (338-442)||(16099144-16099248)
chr6 (15-66)||(23086505-23086556)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (13-534)||(108427-108948)
scaffold0029 (14-456)||(113806-114248)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (13-534)||(9643-10164)
scaffold0028 (13-534)||(16105-16626)
scaffold0028 (13-535)||(44319-44841)
scaffold0028 (17-456)||(49134-49573)
scaffold0028 (92-442)||(105268-105618)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (14-534)||(8566-9086)
scaffold0080 (13-309)||(49484-49780)
scaffold0080 (404-534)||(49352-49482)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (14-534)||(19771-20291)
scaffold0081 (14-534)||(35195-35715)
scaffold0081 (99-534)||(50601-51036)
scaffold0081 (263-442)||(267-446)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (14-535)||(3970-4491)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (14-535)||(29188-29709)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (14-535)||(3362-3883)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (14-535)||(38437-38958)
scaffold0042 (17-535)||(66573-67091)
scaffold0042 (14-75)||(22333-22394)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (15-535)||(27986-28510)
scaffold0023 (24-513)||(59945-60432)
scaffold0023 (14-240)||(3122-3348)
scaffold0023 (27-442)||(54571-54986)
scaffold0023 (302-534)||(3361-3594)
scaffold0023 (326-534)||(131276-131483)
scaffold0023 (13-127)||(150690-150800)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (14-535)||(7182-7703)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (22-535)||(1586-2099)
scaffold0044 (22-535)||(15326-15839)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (22-535)||(57185-57698)
scaffold0017 (14-537)||(18684-19207)
scaffold0017 (14-535)||(196104-196616)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (22-535)||(32198-32711)
scaffold0109 (164-535)||(9764-10135)
scaffold0109 (22-159)||(39697-39834)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (13-534)||(7703-8224)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (13-534)||(7189-7710)
scaffold0120 (13-534)||(13227-13752)
scaffold0120 (23-429)||(178-584)
scaffold0120 (92-442)||(23437-23787)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (13-534)||(30114-30635)
scaffold0026 (13-345)||(50168-50500)
scaffold0026 (184-535)||(29225-29576)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (14-534)||(16823-17343)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (13-534)||(7218-7739)
scaffold0358 (323-534)||(3535-3746)
scaffold0358 (13-191)||(16757-16935)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (13-534)||(13827-14348)
scaffold0324 (404-534)||(19009-19139)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (13-534)||(2438-2959)
scaffold0319 (13-444)||(25-456)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (15-382)||(23691-24058)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (13-534)||(18957-19478)
scaffold0114 (18-429)||(21161-21572)
scaffold0114 (120-459)||(45761-46100)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (14-534)||(25562-26081)
scaffold0243 (92-442)||(743-1093)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (14-534)||(102402-102922)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (13-527)||(6947-7461)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (164-535)||(277597-277968)
scaffold0005 (117-441)||(261570-261894)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (13-526)||(7549-8062)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (13-534)||(6390-6911)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (17-504)||(7273-7760)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (14-534)||(2062-2582)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (14-534)||(112105-112625)
scaffold0040 (17-527)||(16053-16563)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (149-535)||(79246-79632)
scaffold0022 (14-242)||(55230-55444)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (13-430)||(38564-38981)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (14-534)||(684-1204)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (14-534)||(2605-3125)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (14-534)||(5040-5560)
scaffold0270 (14-534)||(12170-12690)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (13-486)||(202084-202557)
scaffold0004 (17-429)||(323978-324390)
scaffold0004 (95-461)||(118468-118834)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (164-535)||(3172-3543)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (104-535)||(31460-31891)
scaffold0180 (87-429)||(12217-12559)
scaffold0180 (13-282)||(34367-34636)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (14-526)||(13645-14157)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (14-534)||(25150-25670)
scaffold0011 (17-429)||(149844-150255)
scaffold0011 (17-458)||(194324-194765)
scaffold0011 (23-442)||(181185-181604)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (13-369)||(8275-8631)
scaffold0647 (14-526)||(2085-2590)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (14-526)||(3091-3603)
scaffold0010 (17-436)||(40953-41372)
scaffold0010 (17-429)||(46019-46431)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (196-535)||(39547-39886)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (13-534)||(218036-218554)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (17-535)||(1051-1569)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (13-535)||(4944-5466)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (13-522)||(15293-15802)
scaffold0266 (92-442)||(8556-8906)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (17-533)||(68540-69056)
scaffold0034 (19-429)||(3575-3985)
scaffold0034 (32-428)||(12543-12939)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (17-534)||(22805-23322)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (17-535)||(18517-19035)
scaffold0244 (23-442)||(25403-25822)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (13-535)||(5598-6120)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (14-534)||(17834-18352)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (13-486)||(9424-9897)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (13-526)||(5705-6220)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (14-534)||(16594-17114)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (15-429)||(23697-24104)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (73-529)||(39731-40187)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (13-532)||(39376-39894)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (13-535)||(2888-3410)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (13-535)||(29901-30423)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (160-407)||(12755-13006)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (13-534)||(10962-11483)
scaffold0309 (13-240)||(16103-16330)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (14-282)||(473-741)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (17-429)||(2105-2517)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (14-282)||(55608-55876)
scaffold0031 (17-396)||(108937-109316)
scaffold0031 (302-535)||(62936-63169)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (32-534)||(6526-7028)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (14-534)||(15098-15619)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (14-495)||(40906-41386)
scaffold0102 (92-274)||(47108-47289)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (17-396)||(1176-1555)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (19-429)||(13474-13884)
scaffold0124 (23-447)||(6434-6858)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (17-495)||(32619-33097)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (17-535)||(1474-1992)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (17-535)||(5918-6436)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (17-495)||(48312-48790)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (17-495)||(80452-80930)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (13-486)||(42723-43196)
scaffold0035 (17-534)||(3920-4435)
scaffold0035 (117-384)||(11916-12183)
scaffold0035 (362-486)||(38393-38517)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (15-535)||(146-666)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (17-429)||(308-719)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (17-396)||(47654-48033)
scaffold0053 (23-396)||(56473-56846)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (17-459)||(55520-55962)
scaffold0076 (17-512)||(32297-32792)
scaffold0076 (23-442)||(41519-41938)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-535)||(50491-51013)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (32-457)||(27871-28295)
scaffold0067 (17-459)||(59834-60276)
scaffold0067 (17-459)||(50800-51242)
scaffold0067 (17-459)||(66222-66664)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (35-459)||(6783-7207)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (17-441)||(11406-11830)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (17-429)||(42191-42603)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (302-534)||(26143-26375)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (18-533)||(3346-3861)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (17-495)||(6421-6899)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (17-459)||(34714-35156)
scaffold0139 (260-459)||(28461-28660)
scaffold0139 (334-420)||(95-181)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (22-255)||(1-234)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (17-429)||(12919-13331)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (14-457)||(4358-4801)
scaffold0074 (488-535)||(4308-4355)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (171-534)||(177036-177399)
scaffold0016 (16-78)||(176925-176987)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (17-523)||(593-1099)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (71-429)||(44057-44415)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (17-459)||(20364-20806)
scaffold0058 (128-352)||(57922-58146)
scaffold0058 (14-127)||(27864-27977)
scaffold0058 (371-444)||(58188-58261)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (32-499)||(115540-116007)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (17-429)||(598-1010)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (17-429)||(1975-2387)
scaffold0222 (128-429)||(8334-8635)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (187-506)||(10166-10485)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (17-512)||(20040-20535)
scaffold0090 (17-512)||(24202-24697)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (17-429)||(5858-6270)
scaffold0367 (189-276)||(1-88)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (17-429)||(10677-11089)
scaffold0298 (17-429)||(14447-14859)
scaffold0298 (17-324)||(21362-21669)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-429)||(249887-250299)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (302-533)||(24637-24868)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (17-429)||(275-680)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (17-459)||(4956-5398)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (17-429)||(23488-23900)
scaffold0104 (206-429)||(20668-20891)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (14-217)||(8310-8513)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (13-535)||(27692-28215)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (17-495)||(1454-1932)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (17-534)||(13702-14217)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-394)||(35422-35799)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (23-436)||(100188-100601)
scaffold0020 (347-535)||(181367-181555)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (17-429)||(31939-32351)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (13-295)||(1608-1890)
scaffold0509 (13-295)||(8036-8318)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (13-217)||(1392-1596)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (14-314)||(2970-3270)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (17-429)||(232-648)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (14-444)||(85136-85566)
scaffold0007 (195-286)||(92834-92925)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (17-324)||(25-332)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (17-429)||(10077-10489)
scaffold0235 (17-429)||(20291-20703)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (17-436)||(15333-15752)
scaffold0089 (311-534)||(10606-10829)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (17-372)||(10509-10864)
scaffold0348 (351-535)||(16448-16632)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (14-436)||(6310-6724)
scaffold0117 (221-442)||(248-469)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (23-442)||(2501-2920)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (23-442)||(24655-25074)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (23-442)||(14169-14588)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (14-519)||(9650-10138)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (23-442)||(25087-25506)
scaffold0008 (92-442)||(133184-133534)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (17-459)||(28177-28619)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (317-534)||(5200-5417)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (92-442)||(72450-72799)
scaffold0021 (110-442)||(25223-25555)
scaffold0021 (110-429)||(15705-16024)
scaffold0021 (94-286)||(6628-6820)
scaffold0021 (92-396)||(32108-32412)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (23-442)||(6435-6854)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (92-442)||(19308-19658)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (17-277)||(20197-20457)
scaffold0077 (23-442)||(26892-27311)
scaffold0077 (92-442)||(16259-16609)
scaffold0077 (173-442)||(25658-25927)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (173-528)||(2763-3118)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (23-442)||(723-1142)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (23-357)||(343-677)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (92-447)||(8521-8876)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (17-535)||(5970-6468)
scaffold0149 (17-535)||(10401-10899)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (215-535)||(2148-2468)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (263-535)||(89989-90261)
scaffold0001 (263-535)||(89311-89583)
scaffold0001 (14-219)||(492389-492594)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (108-447)||(10550-10889)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (23-442)||(2579-2997)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (16-155)||(3474-3613)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (245-444)||(96423-96622)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (220-430)||(24699-24909)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (108-442)||(7601-7935)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (228-534)||(64-370)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (254-429)||(14157-14331)
scaffold0261 (254-429)||(22336-22510)
scaffold0261 (17-213)||(13959-14155)
scaffold0261 (17-213)||(22138-22334)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (256-429)||(4311-4484)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (374-534)||(17850-18009)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (15-145)||(96-226)
scaffold0405 (194-288)||(1-95)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (92-286)||(11405-11599)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (92-442)||(13509-13859)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (345-534)||(865-1054)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (119-442)||(3805-4128)
scaffold0876 (23-228)||(1572-1777)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (141-242)||(34675-34776)
[»] scaffold0730 (2 HSPs)
scaffold0730 (362-525)||(4557-4720)
scaffold0730 (18-156)||(622-760)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (23-273)||(1428-1678)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (464-534)||(1-71)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (32-145)||(194804-194917)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (336-535)||(1-200)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (404-534)||(1845-1975)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (93-442)||(15329-15668)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (455-535)||(2872-2952)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (317-459)||(11977-12119)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (245-442)||(45606-45803)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (317-438)||(8437-8558)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (227-277)||(8897-8947)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (359-429)||(48168-48238)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (89-145)||(33643-33699)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (17-78)||(24738-24799)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16926650 - 16926129
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16926650 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttg 16926551  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926550 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 16926451  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  16926450 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 16926351  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16926350 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 16926251  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926250 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 16926151  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16926150 aggaagcacagaaagttgatgt 16926129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17000290 - 16999769
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17000290 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttg 17000191  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000190 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 17000091  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  17000090 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 16999991  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16999990 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 16999891  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999890 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 16999791  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16999790 aggaagcacagaaagttgatgt 16999769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10870139 - 10869619
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10870139 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 10870040  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870039 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 10869940  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  10869939 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 10869840  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10869839 ggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 10869740  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869739 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagagtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 10869640  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10869639 ggaagcacagaaagttgatgt 10869619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24263660 - 24263139
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24263660 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 24263561  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263560 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 24263461  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  24263460 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 24263361  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  24263360 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgaccagagagttcgaattg 24263261  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263260 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 24263161  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24263160 aggaagcacagaaagttgatgt 24263139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27219306 - 27218785
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27219306 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27219207  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27219206 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 27219107  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  27219106 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 27219007  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27219006 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 27218907  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218906 cttgaatagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 27218807  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27218806 aggaagcacagaaagttgatgt 27218785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 21144194 - 21144715
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21144194 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 21144293  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144294 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttggtggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 21144393  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21144394 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 21144493  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  21144494 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagtta 21144593  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21144594 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagcgaatttctgaaaagtatca 21144693  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21144694 aggaagcacagaaagttgatgt 21144715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27372559 - 27372038
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27372559 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27372460  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372459 agaactcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 27372360  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  27372359 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactt 27372260  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  27372259 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttg 27372160  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27372159 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatca 27372060  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27372059 aggaagcacagaaagttgatgt 27372038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 44384723 - 44385243
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44384723 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 44384822  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384823 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 44384922  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  44384923 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgacttt 44385022  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44385023 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 44385122  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44385123 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctaaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaa 44385222  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44385223 ggaagcacagaaagttgatgt 44385243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 41607538 - 41608060
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41607538 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtctaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaggacagttg 41607637  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607638 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 41607737  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  41607738 aggtgtttagtgatcgcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 41607837  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41607838 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 41607937  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41607938 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatca 41608037  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  41608038 aggaagcgcagaaagttgatgtc 41608060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24711324 - 24710803
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24711324 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 24711225  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711224 agaatccatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 24711125  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  24711124 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactt 24711025  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24711024 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 24710925  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710924 cttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 24710825  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  24710824 aggaagcacaaaaagttgatgt 24710803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 24875903 - 24876423
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24875903 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 24876002  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24876003 ag-gttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagctggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgagatttg 24876101  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  24876102 aggtgtttagtgatcacaggagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 24876201  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24876202 tggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatta 24876301  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24876302 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatgatcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 24876401  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24876402 aggaagcacagaaagttgatgt 24876423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 22324009 - 22324530
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22324009 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttg 22324108  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324109 agaattcatgagaagaattatcctacacatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22324208  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  22324209 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactt 22324308  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  22324309 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagtta 22324408  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22324409 cttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaacagtatca 22324508  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  22324509 aggaagcgcagaaagttgatgt 22324530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 21324420 - 21324941
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21324420 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttaggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 21324519  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21324520 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttagcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 21324619  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||    
T  21324620 ggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgacttt 21324719  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  21324720 ggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttac 21324819  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21324820 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 21324919  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  21324920 agaggcacagaaagttgatgtc 21324941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 121 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16924071 - 16923658
Alignment:
Q  121 tgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16924071 tgagaagaattatcctacgcatgatctcgagtgggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttt 16923972  T
Q  221 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16923971 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttga 16923872  T
Q  321 attatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaaca 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16923871 attatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaaca 16923772  T
Q  421 gtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagca 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16923771 gtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagca 16923672  T
Q  521 cagaaagttgatgt 534  Q
    ||| ||||||||||    
T  16923671 caggaagttgatgt 16923658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 121 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16983334 - 16982921
Alignment:
Q  121 tgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16983334 tgagaagaattatcctacgcatgatctcgagtgggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttt 16983235  T
Q  221 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16983234 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttga 16983135  T
Q  321 attatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaaca 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16983134 attatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaaca 16983035  T
Q  421 gtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagca 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16983034 gtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagca 16982935  T
Q  521 cagaaagttgatgt 534  Q
    ||| ||||||||||    
T  16982934 caggaagttgatgt 16982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 24676778 - 24676257
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24676778 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcgtatgcttcaagacagttga 24676679  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676678 gaattcatgagaagaactacccgacgcatgatttagagttggcggctgtgatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 24676579  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||  |||||||||||    
T  24676578 ggtatttagtgatcacaaaagcttgaaatatttgttcgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgacttt 24676479  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  24676478 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttac 24676379  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24676378 ttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaa 24676279  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  24676278 agaggcacagaaagttgatgtc 24676257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 24706636 - 24707157
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24706636 gatgaagcttttgtggtatattttgatgcgtccaagttgggtttagcaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 24706735  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706736 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 24706835  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  | || ||||||||||||    
T  24706836 agtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagacagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgacttt 24706935  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |    
T  24706936 ggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgatggttagagagttcgagttac 24707035  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24707036 ttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaa 24707135  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  24707136 agaggcacataaagttgatgtc 24707157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 205 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17064815 - 17064486
Alignment:
Q  205 gagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggat 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||    
T  17064815 gagattggaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggat 17064716  T
Q  305 tatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaat 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17064715 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagt 17064616  T
Q  405 tcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064615 tcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaa 17064516  T
Q  505 aagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17064515 aggtatcaaggaagcacaggaagttgatgt 17064486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 23106882 - 23107404
Alignment:
Q  13 agatgaacctttt-gtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagtt 111  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  23106882 agatgaacctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagtt 23106981  T
Q  112 gagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattt 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23106982 gagaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagattt 23107081  T
Q  212 gaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgact 311  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||| |    
T  23107082 gaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctattcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgatt 23107181  T
Q  312 ttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaatt 411  Q
    |||  ||||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  23107182 ttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagtt 23107281  T
Q  412 gcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatc 511  Q
     ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| |  |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23107282 acttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatccgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtatt 23107381  T
Q  512 aaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    || || ||||| |||| ||||||    
T  23107382 aaagaggcacataaagctgatgt 23107404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23112026 - 23111505
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  23112026 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtccttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttg 23111927  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |  || || || |||||||| || | ||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  23111926 agaattcatgagcagaattatcctacgcatgatttggagttggctgttgtggttttcgtgttgaaaattttgaggcattatttgtacggctccagatttg 23111827  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  23111826 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 23111727  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||  | |||    
T  23111726 tagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttttagttg 23111627  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || | ||||||||| |  |||||  |||||||| |||||||  | ||||||||  |||| ||||| |    
T  23111626 cttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacagtatta 23111527  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  23111526 aagaagcacagaaatttgatgt 23111505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 535
Target Start/End: Original strand, 23099190 - 23099693
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23099190 tattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatccaagagggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 23099289  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  23099290 atcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaa 23099389  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||  | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  23099390 aagtttgaaatatttgtttgattaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattaccatccg 23099489  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||      
T  23099490 ggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagact 23099589  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 531  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||| |||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||  |||||||    
T  23099590 tgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttga 23099689  T
Q  532 tgtc 535  Q
    ||||    
T  23099690 tgtc 23099693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 27209329 - 27209847
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  27209329 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttaggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggtagctgagag 27209428  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  27209429 ttcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 27209528  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||     
T  27209529 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 27209628  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||||||||||| |    
T  27209629 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcg 27209728  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    || ||||||||||  ||||| | || || ||||  ||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  27209729 aatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 27209828  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  27209829 agcacaacaagttgatgtc 27209847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23073153 - 23072884
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||    
T  23073153 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggattaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagatg 23073054  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||  |   | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073053 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggttgttatggtcttcgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 23072954  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23072953 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaag 23072884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23278062 - 23277650
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23278062 gaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagag 23277963  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||    
T  23277962 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagt 23277863  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  23277862 atttagttatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 23277763  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||  ||||      
T  23277762 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctat 23277663  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  23277662 agcagtttagaga 23277650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12575630 - 12575191
Alignment:
Q  26 gtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgaga 125  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || || || |    
T  12575630 gtggtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaa 12575531  T
Q  126 agaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtga 225  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12575530 agaattatcccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtga 12575431  T
Q  226 tcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattat 325  Q
     |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  12575430 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 12575331  T
Q  326 cacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagttta 425  Q
    || || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | ||||||||||    
T  12575330 catccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagttta 12575231  T
Q  426 gagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgt 465  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||| |||||||||||    
T  12575230 gagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgt 12575191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Original strand, 19651207 - 19651685
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||||||      
T  19651207 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggttgtagcgtatgcttctagacagttgagga 19651306  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  19651307 tacatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 19651406  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | || || ||||| ||||||    
T  19651407 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggt 19651506  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||   ||||| | ||||||||| |||||      
T  19651507 ttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctat 19651606  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    | ||||| |||||| ||||| | || || |||| | ||||||| || ||  || |||| |||||||||||| |||||||    
T  19651607 agcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctgaagattaatagtga 19651685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24949876 - 24949464
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||  || || |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  24949876 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttggcattgggtggtgttttgatgcaagacggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgaggg 24949777  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  24949776 ttcatgaaaagaattatcctacgcaggatttagagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagt 24949677  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  24949676 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggt 24949577  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| || ||| | |    
T  24949576 ttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttag 24949477  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  24949476 aacagtttagaga 24949464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27789008 - 27788581
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  27789008 tgtgatgcgtctaagctgggtttgggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatc 27788909  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27788908 ccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 27788809  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  27788808 cttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccggga 27788709  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | |||||||||||||| ||||    
T  27788708 aaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacact-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 27788610  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||    
T  27788609 gtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagc 27788581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 45533634 - 45533162
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   ||   ||||||||||||| || || |||||||    
T  45533634 gatgaaccatttgttgtatagtaagatatgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataatatggtggtagcttatgcatcgaggcagttga 45533535  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45533534 ggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttga 45533435  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||     
T  45533434 agtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttatttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggtttgaattgctaaaggattatgatttc 45533335  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  45533334 gggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgc 45533235  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||  ||| || || || |||||| |||| ||| |||||||    
T  45533234 ttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagat 45533162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20829545 - 20829126
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| || | ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  20829545 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgcgcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 20829446  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20829445 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgtcttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 20829346  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || || |||| ||| |||||     
T  20829345 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggc 20829246  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  20829245 ttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 20829146  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  20829145 aacagttcagagatatgagt 20829126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23295221 - 23294809
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| | |||  | ||||| |||||||| || ||||| |||     
T  23295221 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtcgaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatgttaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttaagaa 23295122  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  23295121 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagt 23295022  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| |||||     
T  23295021 attcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggc 23294922  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| | |||||| || ||| |      
T  23294921 ttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttat 23294822  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  23294821 agcagtttagaga 23294809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1065037 - 1064618
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||| |||||||| || |||||| | |    
T  1065037 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 1064938  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  1064937 tacatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggt 1064838  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  1064837 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 1064738  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  1064737 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 1064638  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  1064637 aacagttcagagatatgagt 1064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25264325 - 25264033
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  25264325 tattgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtattttaatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaatt 25264226  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  25264225 atcctacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaa 25264126  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 324  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  25264125 aagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaatta 25264033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 30011340 - 30011808
Alignment:
Q  16 tgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgaga 115  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   |||  | ||||||||||| |  ||  |||||||     
T  30011340 tgaaccatttgttgtatattgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataataaggtagtagcttatgcattgaggtagttgagg 30011439  T
Q  116 gttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagg 215  Q
     |||||||     |||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  30011440 attcatgaacgtgattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttgaag 30011539  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttgg 315  Q
    |||| |  ||||| || | |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  30011540 tgttcaacgatcataaaattttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgg 30011639  T
Q  316 tttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgctt 415  Q
     || ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  30011640 gttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaaaacatt--acatgtctgctatgatggttagagagttggagttgctt 30011737  T
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| |||  ||| || || || |||||| |||| ||| |||||||    
T  30011738 gaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagat 30011808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 31831944 - 31831525
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||  |      
T  31831944 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgta 31831845  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  31831844 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 31831745  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  31831744 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 31831645  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| ||||||| |  || || |||||| | |    
T  31831644 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttag 31831545  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  31831544 aacagttcagagacatgagt 31831525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 440
Target Start/End: Original strand, 12639396 - 12639813
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || ||||||||||| || ||||||  ||| ||||    
T  12639396 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttggaagtgcatg 12639495  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| || || || | ||  |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  12639496 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 12639595  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  12639596 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcaattgagt 12639695  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||||||||    
T  12639696 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgaacagt 12639795  T
Q  423 ttagagatatgagtttgg 440  Q
    || ||||| |||||||||    
T  12639796 ttcgagatttgagtttgg 12639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 30210074 - 30210543
Alignment:
Q  16 tgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgaga 115  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   |||  | ||||||||| | |  || ||||||||     
T  30210074 tgaaccatttgttgtatactttgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataataaggtagtagcttatacattgaggcagttgagg 30210173  T
Q  116 gttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagg 215  Q
     |||||||    ||||||||||  ||||||||| |||| || |  || || |||||  | || || |||||||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  30210174 attcatgaacgtaattatcctattcatgatcttaagttagctgtagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaag 30210273  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttgg 315  Q
    |||| |  ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  30210274 tgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatacgaggcatcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgg 30210373  T
Q  316 tttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgctt 415  Q
     |||||||| || || ||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  30210374 gttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaaca-tacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgctt 30210472  T
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
     ||||||| |||||  ||||||||||||| |||  ||| || || || |||||| |||| ||| |||||||    
T  30210473 taacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagat 30210543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 24830351 - 24830770
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || ||||||| ||| || |    
T  24830351 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcacg 24830450  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||  || |||||| | || ||||| |||||  | | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  24830451 agaagaattatctgactcatgatttggaattggcagccgttatgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 24830550  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  24830551 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 24830650  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| |  || || |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| || |    
T  24830651 tatcatctcggaaaggctaatgttgttacggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcaat 24830750  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  24830751 ttcgagacttgagtttggtt 24830770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9485505 - 9485409
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9485505 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagt 9485409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9611004 - 9610905
Alignment:
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9611004 gtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 9610905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22279316 - 22278966
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | ||  |||||||| ||||| || |    
T  22279316 gcttatgcttcgaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 22279217  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  22279216 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggttgaa 22279117  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| |     
T  22279116 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtatgcttta 22279017  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| |  || || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22279016 atggttaaggacttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 22278966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 24568900 - 24569250
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| || || ||||    
T  24568900 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcgtgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttgaaggcatt 24568999  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |  |||||||||||||  |||||||| | ||    
T  24569000 atctgtatggttctaagtttgaggtattaagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaaaagatgaatatgaggcaaagaagatggttgga 24569099  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  24569100 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaagacaaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 24569199  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  24569200 atggtgaaagagttagaattgattgagtagttttgagatttgagtttggtt 24569250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 293 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23067400 - 23067160
Alignment:
Q  293 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 392  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23067400 ttgctaaaagattatgattttgagttgact-atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatga 23067302  T
Q  393 tggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatag 492  Q
    |||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  ||||  | | || ||||| || || ||||||||||||||||     
T  23067301 tggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatttgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataa 23067202  T
Q  493 tgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  23067201 cgaatttctaaagagtattaaagaagcacggaaagttgatgt 23067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 535
Target Start/End: Original strand, 22755982 - 22756140
Alignment:
Q  377 catatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggta 476  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||| |||| || ||||||||| | |    
T  22755982 catatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacattttagagatctgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactgagaa 22756081  T
Q  477 tgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22756082 tgctaaagattgatagtgaaattctgaaaagtatcaatgaagcacataaagtttatgtc 22756140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 22760801 - 22761151
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  22760801 gcttatgctttaaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgtggtgtatgcattgaagatttggaggcatt 22760900  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||  |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||  ||||||| |  |    
T  22760901 atctgtatggttataagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagaaaagatggttgaa 22761000  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    | ||    
T  22761001 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtttattttg 22761100  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22761101 atggttaaagagttggaatcgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 22761151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25129820 - 25129470
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  25129820 gcttatgcttcaaggcggttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 25129721  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||| |||| ||| | ||    
T  25129720 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttgga 25129621  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
    ||  || || ||||  || |||   |||| ||||||  | || || ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||    
T  25129620 gtatcttaatgatttcgattttcagttgagttatcattccgggaaggcggatgttgttgctgatgctttgagtagaaagacttttcatatgtctgctttg 25129521  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| ||  ||||| || | |||||| ||||  |||||||||||    
T  25129520 atggttaaagagttgaaattgattaagcagtttcgagacttgagtttggtt 25129470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17068210 - 17068144
Alignment:
Q  468 aactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17068210 aactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacaggaagttgatgt 17068144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 534
Target Start/End: Original strand, 21890268 - 21890392
Alignment:
Q  410 ttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 509  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||  |||| || |||| |||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21890268 ttgcttgaacagttcagagatttgagtctagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagta 21890367  T
Q  510 tcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || || || || |||||||||||    
T  21890368 ttaaagaggcgcaaaaagttgatgt 21890392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Original strand, 25133625 - 25133792
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||| | || || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  25133625 gcttatgcgtcgaggcagttgaaagcgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattggcgacagttgtatatgcattgaagatttggaggcatt 25133724  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaag 259  Q
    |  || |||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  25133725 atatgcatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaatagtttgaagtacttgtttgattagaag 25133792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Original strand, 19718174 - 19718259
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttc 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19718174 gaaccatttgttgtgtattgtgttgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttc 19718259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Original strand, 17967134 - 17967218
Alignment:
Q  230 aagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||| | |||||  | |||||  ||||||||||||| ||||    
T  17967134 aagagtctgaagtatctctttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgtttggagtttttaaaggattatgattttg 17967218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 462; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23957406 - 23956885
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23957406 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 23957307  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957306 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 23957207  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23957206 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactt 23957107  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23957106 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 23957007  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23957006 cttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatca 23956907  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23956906 aggaagcacagaaagttgatgt 23956885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 29037758 - 29038278
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29037758 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 29037857  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29037858 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 29037957  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  29037958 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 29038057  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29038058 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 29038157  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29038158 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 29038257  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29038258 ggaagcacagaaagttgatgt 29038278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 8051976 - 8052497
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8051976 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 8052075  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052076 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 8052175  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  8052176 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 8052275  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8052276 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 8052375  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052376 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 8052475  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8052476 aggaagcacagaaagttgatgt 8052497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12478259 - 12477738
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12478259 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 12478160  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12478159 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttg 12478060  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  12478059 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 12477960  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12477959 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 12477860  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477859 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 12477760  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12477759 aggaagcacagaaagttgatgt 12477738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 19777146 - 19777667
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19777146 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 19777245  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19777246 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttg 19777345  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  19777346 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 19777445  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19777446 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 19777545  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777546 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 19777645  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19777646 aggaagcacagaaagttgatgt 19777667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8388071 - 8387550
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8388071 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 8387972  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8387971 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttg 8387872  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  8387871 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 8387772  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8387771 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 8387672  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8387671 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgagaggtatca 8387572  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8387571 aggaagcacagaaagttgatgt 8387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 534
Target Start/End: Original strand, 14302333 - 14302852
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14302333 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 14302432  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14302433 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtaatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 14302532  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||    
T  14302533 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 14302632  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14302633 gtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatttct 14302732  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14302733 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaag 14302832  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  14302833 ggagcacagaaagttgatgt 14302852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 40474699 - 40474178
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40474699 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttg 40474600  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40474599 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 40474500  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  40474499 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactt 40474400  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40474399 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattg 40474300  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40474299 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggtatgctgaaaattgatagtgaatttctgaaaagtatca 40474200  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  40474199 aggaagcacataaagctgatgt 40474178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18298864 - 18298343
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18298864 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 18298765  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18298764 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttg 18298665  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  18298664 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 18298565  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18298564 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 18298465  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298464 cttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 18298365  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18298364 aggaagcacagaaagttgatgt 18298343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27712995 - 27712474
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27712995 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27712896  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27712895 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 27712796  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27712795 aggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactt 27712696  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  27712695 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagtta 27712596  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27712595 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatca 27712496  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  27712495 aagaagcacagaaagttgatgt 27712474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12525334 - 12524814
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  12525334 gatgagccttttgtagtgtattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttga 12525235  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12525234 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 12525135  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12525134 ggtatttagtgatcacaagagtttgcagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgacttt 12525035  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  12525034 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggttagagagttcgagttac 12524935  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524934 ttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 12524835  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12524834 ggaagcacagaaagttgatgt 12524814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14682225 - 14681705
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14682225 gatgagccttttgtagtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttga 14682126  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682125 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14682026  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  14682025 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgacttt 14681926  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |    
T  14681925 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgttttgatggttagagagttcgagttac 14681826  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681825 ttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 14681726  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14681725 ggaagcacagaaagttgatgt 14681705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 15146239 - 15146760
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15146239 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttga 15146338  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146339 gaattcatgagaagaattatcccacgcatgatttagagttagccgccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15146438  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| | || ||||||||||||    
T  15146439 ggtgtttagtgatcacgagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgacttt 15146538  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||    
T  15146539 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagtttgagttgc 15146638  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||| |||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15146639 ttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatgaa 15146738  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15146739 ggaagcacagaaagttgatgtc 15146760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 535
Target Start/End: Original strand, 18614190 - 18614699
Alignment:
Q  26 gtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgaga 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18614190 gtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgaga 18614289  T
Q  126 agaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtga 225  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18614290 agaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcga 18614389  T
Q  226 tcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattat 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18614390 tcataagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattat 18614489  T
Q  326 cacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagttta 425  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||| || |    
T  18614490 catccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattca 18614589  T
Q  426 gagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaa 525  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  18614590 gagatttgagtttaatttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaa 18614689  T
Q  526 agttgatgtc 535  Q
    | ||||||||    
T  18614690 atttgatgtc 18614699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 82 - 535
Target Start/End: Original strand, 16353867 - 16354320
Alignment:
Q  82 taaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagata 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16353867 taaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgttttgaagata 16353966  T
Q  182 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16353967 tggagacattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaa 16354066  T
Q  282 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 381  Q
    | ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354067 ggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 16354166  T
Q  382 gtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctg 481  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16354167 gtccgctatgatggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctg 16354266  T
Q  482 aagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16354267 aagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 16354320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 18225808 - 18226321
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18225808 ttttgtggtgtattatgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 18225907  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    |||||||| || || || |||||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18225908 gagaagaagtacccgacacatgatttagagttggcggctgtggtctttgtatttaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 18226007  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||    
T  18226008 gcgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaa 18226107  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || || ||||||| |    
T  18226108 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatggttagaaagtttgagttacttgaacgg 18226207  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  18226208 ttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 18226307  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | ||| ||||||||    
T  18226308 ataaatttgatgtc 18226321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14161128 - 14160608
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | |||||  || ||||||||||    
T  14161128 gatgaaccttttgttgtgtactgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagacggcaaggtggttggttatgtgtcgagacagttga 14161029  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14161028 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggccgcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttga 14160929  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||    
T  14160928 agtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgatttt 14160829  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||    
T  14160828 ggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagaccttgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgc 14160729  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||| || || ||  | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  14160728 tagaataatttagagatttgagtttggtctgcgaattgtcgtctcagagtgtaaagttaggaatgctgaagattgataatgaatttctaaagagtattaa 14160629  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  14160628 ggaagcacagaaagatgatgt 14160608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 14849719 - 14850240
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  14849719 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 14849818  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  14849819 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtacttaagatatggagacattatttgtacgattctagatttg 14849918  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | || || ||||| ||    
T  14849919 aagtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaatttgtgaaagactatgattt 14850018  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| || || |||    
T  14850019 tgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagtttgagttg 14850118  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || || ||||| | ||||||||| || || |||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14850119 cttgagcagtttagagatctgaggttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaaactgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatca 14850218  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  14850219 aagaagcgcagaaagttgatgt 14850240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 8707570 - 8707106
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||    
T  8707570 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgagcttaggtggtgtgcttatgcaaga--------tggtagcttatgcttcgagacagttg 8707479  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||| || || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  8707478 agaattcatgagcggaattatccaacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgcgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttg 8707379  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  8707378 aggtgtttatcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgag-cagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 8707280  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||    
T  8707279 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttagagagtttgagttg 8707180  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  8707179 cttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagat 8707106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 14695771 - 14695266
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| || || ||  |  |||||||||| || ||||||||||    
T  14695771 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttaggcttaagtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtaatagcttatgcatcgagacagttga 14695672  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14695671 ggattcatgaacgaaattatcctactcattatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttga 14695572  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |  ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  14695571 agtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 14695472  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||| || || ||||    
T  14695471 gggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgttaaaagagtttgagttgc 14695372  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    || || | ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  14695371 ttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 14695272  T
Q  514 ggaagc 519  Q
     |||||    
T  14695271 agaagc 14695266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15247579 - 15247167
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  15247579 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagaaggtaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagaa 15247480  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15247479 ctcatgaaaagaattatcctacgcatgacttggagttagctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggtattatttgtacggttccagatttgaagt 15247380  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15247379 gtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggt 15247280  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  15247279 ttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctag 15247180  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  15247179 agcagtttagaga 15247167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15072018 - 15071602
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15072018 agatgaaacttttgttgtttattattatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctagacagttg 15071919  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  15071918 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttg 15071819  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||| ||    
T  15071818 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttttttgaccaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattt 15071719  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | |||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || |||    
T  15071718 tagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttg 15071619  T
Q  413 cttgaacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||||||    
T  15071618 cttgaacagtttagaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 27902026 - 27901525
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || ||  |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  27902026 tattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaagtagctgagagttcatgaaaagaatt 27901927  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27901926 atcctacgcatgatttggaattggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaa 27901827  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  27901826 aagtttgaaatatatgtttgaacaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccg 27901727  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||      
T  27901726 ggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagact 27901627  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 531  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| |  ||||||||  |||||||    
T  27901626 tgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttga 27901527  T
Q  532 tg 533  Q
    ||    
T  27901526 tg 27901525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16149366 - 16148954
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16149366 gaaccgtttgtcgtgtattgcgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagag 16149267  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16149266 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 16149167  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  16149166 attcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggt 16149067  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||| | |    
T  16149066 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttag 16148967  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  16148966 agcagtttagaga 16148954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16153512 - 16153100
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16153512 gaaccgtttgtcgtgtattgcgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagag 16153413  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16153412 ttcatgaaaagaattaccctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 16153313  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  16153312 attcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggt 16153213  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||| | |    
T  16153212 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttag 16153113  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  16153112 agcagtttagaga 16153100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 15001981 - 15002499
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||      
T  15001981 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatggttctaggcagttgagga 15002080  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15002081 ttcataaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 15002180  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  15002181 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 15002280  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||      
T  15002281 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctat 15002380  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||  | ||| | || || || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  15002381 agcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagaga 15002480  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  ||| |||||||    
T  15002481 agcacaacaagatgatgtc 15002499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 56566145 - 56566368
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  56566145 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtataggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 56566244  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56566245 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttga 56566344  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  56566345 ggtgtttagtgatcacaagagttt 56566368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 487
Target Start/End: Original strand, 1647894 - 1648364
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||| | | |||||||| || ||  |||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  1647894 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgggttgatgcaagatggcaaggtggtagcttacgcttctaggcagctgagag 1647993  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  1647994 ttcatgaaaagaattaccctacttatgatttggagttggctgcagtggtttttgtcttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagt 1648093  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||| || | || || ||||||||||||    
T  1648094 atttagtgaccacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggagctgaacatgaggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggt 1648193  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| |||||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1648194 ttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttg 1648293  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagatt 487  Q
    ||||| |||||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||    
T  1648294 aacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttgggatgctgaagatt 1648364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 463
Target Start/End: Original strand, 51605427 - 51605855
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  51605427 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatc 51605526  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  51605527 ccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 51605626  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  51605627 cttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccggga 51605726  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | |||||||||||||| ||||    
T  51605727 aaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 51605826  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||    
T  51605827 gtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagc 51605855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 3263411 - 3263830
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||| | |    
T  3263411 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 3263510  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  3263511 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 3263610  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  3263611 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 3263710  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  3263711 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 3263810  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  3263811 aacagttcagagatatgagt 3263830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 15357737 - 15358116
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||  |  |||| |||     
T  15357737 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatcgtaaggtggtagcttatgcttcttggtagttaagaa 15357836  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15357837 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 15357936  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||| || | || |||||||| |||||     
T  15357937 atttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggc 15358036  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15358037 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggt 15358116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 11205848 - 11206267
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  11205848 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 11205947  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  11205948 ttcatgagaaaaattatcctacacatgatctagaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattctttgtacggttccagatttgaggt 11206047  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||| || ||||||||||| |||||     
T  11206048 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 11206147  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||| | |    
T  11206148 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttag 11206247  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  11206248 aacagttcagagacatgagt 11206267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 29452154 - 29452573
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  29452154 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 29452253  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  29452254 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 29452353  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  29452354 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 29452453  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |  || || || ||| | |    
T  29452454 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttag 29452553  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  29452554 aacagttcagagatatgagt 29452573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33224476 - 33224169
Alignment:
Q  119 catgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  33224476 catgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgctgtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagatttgaggtgt 33224377  T
Q  219 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggttt 318  Q
    | |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| || | || |||||||| ||||| ||    
T  33224376 tcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggctt 33224277  T
Q  319 gaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaa 418  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||| | |||    
T  33224276 gaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaa 33224177  T
Q  419 cagtttag 426  Q
    ||||||||    
T  33224176 cagtttag 33224169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14998964 - 14998546
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  14998964 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggttttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 14998865  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  14998864 agaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtatatgcattgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcag 14998765  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| || |||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  14998764 tgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 14998666  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  14998665 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 14998566  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || || |  |||||||||||    
T  14998565 ttcgatacttgagtttggtt 14998546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 44660483 - 44660902
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| || || ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  44660483 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttgggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 44660582  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  44660583 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 44660682  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||| ||| | || ||| ||||||| || || |||||||| |||||     
T  44660683 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggc 44660782  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| ||| | ||||| |  ||||| |||||| | |    
T  44660783 ttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttag 44660882  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  44660883 aacagttcagagacatgagt 44660902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 223 - 532
Target Start/End: Original strand, 15413849 - 15414158
Alignment:
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||    
T  15413849 tgatcacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaat 15413948  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| || || |    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaatttgagttgctggagcatt 15414048  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 522  Q
    |||||||  ||||| | ||||| || | |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||    
T  15414049 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15414148  T
Q  523 gaaagttgat 532  Q
    ||| ||||||    
T  15414149 gaaggttgat 15414158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 15291781 - 15292200
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  15291781 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 15291880  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | |   |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  15291881 agaagaattatccgactcatgatttagaattggcggctgttgtgtatacattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 15291980  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  15291981 tgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 15292080  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| ||||  |||    
T  15292081 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagaagt 15292180  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  15292181 ttcgagatttgagtttggtt 15292200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9292415 - 9292069
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | |  ||||||||| ||||| || |    
T  9292415 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacgttgaagatttggaggcact 9292316  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  9292315 atttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 9292216  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  9292215 atatcttaaggactttgattttcacttgagttatcatcctgggagggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 9292116  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagttt 438  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||    
T  9292115 atggttaaagagttggaattggttgagcagtttcgagacttgagttt 9292069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15320599 - 15320313
Alignment:
Q  209 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  15320599 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatg 15320500  T
Q  309 actttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcga 408  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  || || ||    
T  15320499 attttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatggtaaaggattttga 15320400  T
Q  409 attgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
     |||||||| |||||||||||  ||||| | ||||  || | ||||||||| || ||| |  |||||||| |||||||  |||||||    
T  15320399 gttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15320313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 18548721 - 18549043
Alignment:
Q  62 ggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccg 161  Q
    ||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||| |||||  |||   ||||||||| |||||| || || |||||| | ||||| ||  | |    
T  18548721 ggtgtgcttatgcaagatgggcatgcggtagcttatgcttcgagacaactgaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcaactg 18548820  T
Q  162 tagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaagga 261  Q
    |||| |||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  18548821 tagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaaga 18548920  T
Q  262 attgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttg 361  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||   | | |||||| | ||| || || ||||| || || |||||||||    
T  18548921 gttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaaataagttatcatctagggaaggccaatgtagtagctgatgccttg 18549020  T
Q  362 agtaggaagacattgcatatgtc 384  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  18549021 agtaggaagtccttgcacatgtc 18549043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20892391 - 20892195
Alignment:
Q  263 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttga 362  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  20892391 ttgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattga 20892292  T
Q  363 gtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||    
T  20892291 gcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctca 20892195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 12341575 - 12341742
Alignment:
Q  110 ttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | || |||||| | || || ||||  || || |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |  |    
T  12341575 ttgaaagtgcatgagaagaattattcgactcatgatttggaattagcggtggttgtgtttgtgatgaagatttggaggcattatttgtatcattctaagt 12341674  T
Q  210 ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 277  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12341675 ttgaagtgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcag 12341742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 388 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 15078919 - 15078772
Alignment:
Q  388 tatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagatt 487  Q
    ||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||     
T  15078919 tatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatc 15078820  T
Q  488 gatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15078819 aatagtgaattcttgaatagtatcagggaagcacagaaaattgatgtc 15078772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13248979 - 13248875
Alignment:
Q  338 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtt 437  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||  ||||||    
T  13248979 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgtttgagtagtttcgagacttgagtt 13248880  T
Q  438 tggtt 442  Q
    |||||    
T  13248879 tggtt 13248875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15320651 - 15320610
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttggg 54  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15320651 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttggg 15320610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9056 - 8535
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9056 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 8957  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8956 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 8857  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8856 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 8757  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8756 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatta 8657  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8656 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaaattctgaaaagtatca 8557  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  8556 aggaagcgcagaaagttgatgt 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 44789973 - 44790494
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44789973 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttg 44790072  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790073 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttgacggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 44790172  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  44790173 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 44790272  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  44790273 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcaaagagttcgaattg 44790372  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790373 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 44790472  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44790473 aggaagcacagaaagttgatgt 44790494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8200275 - 8199755
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8200275 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 8200176  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200175 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8200076  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  8200075 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 8199976  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8199975 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 8199876  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8199875 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 8199776  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8199775 ggaagcacagaaagttgatgt 8199755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14334044 - 14333523
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14334044 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 14333945  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333944 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 14333845  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  14333844 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 14333745  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14333744 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 14333645  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333644 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 14333545  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14333544 aggaagcacagaaagttgatgt 14333523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8709253 - 8708732
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8709253 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 8709154  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709153 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 8709054  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  8709053 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactt 8708954  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  8708953 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttg 8708854  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8708853 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatca 8708754  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8708753 aggaagcacagaaagttgatgt 8708732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 18550380 - 18550901
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18550380 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 18550479  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18550480 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagataaggagacattacttgtatgattcgagatttg 18550579  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  18550580 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactt 18550679  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  18550680 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttg 18550779  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18550780 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatca 18550879  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18550880 aggaagcacagaaagttgatgt 18550901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 15159679 - 15160201
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15159679 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 15159778  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159779 aggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 15159878  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  15159879 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttattcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 15159978  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15159979 tggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 15160078  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15160079 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgagactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatca 15160178  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  15160179 aggaagcgcagaaagttgatgtc 15160201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 11235835 - 11236357
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11235835 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 11235934  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11235935 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtcgtctttgtattgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagattta 11236034  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  11236035 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 11236134  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11236135 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 11236234  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11236235 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtgaattcctgaaaagtatca 11236334  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| ||||  |||||||||    
T  11236335 aggaagcgcagagggttgatgtc 11236357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13687712 - 13687190
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13687712 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 13687613  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687612 aggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 13687513  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  13687512 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 13687413  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13687412 tggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 13687313  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13687312 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaaaggtcacctcagagtgtgagactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatca 13687213  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13687212 aggaagcgcagaaagttgatgtc 13687190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 534
Target Start/End: Original strand, 23202255 - 23202756
Alignment:
Q  33 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23202255 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagagttcatgagaagaatta 23202354  T
Q  133 tcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23202355 tcctacgcatgatcttgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaag 23202454  T
Q  233 agtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccag 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  23202455 agtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgg 23202554  T
Q  333 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatat 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23202555 gtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatat 23202654  T
Q  433 gagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23202655 gagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagtagat 23202754  T
Q  533 gt 534  Q
    ||    
T  23202755 gt 23202756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 534
Target Start/End: Original strand, 23508382 - 23508883
Alignment:
Q  33 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508382 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagagttcatgagaagaatta 23508481  T
Q  133 tcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23508482 tcctacgcatgatcttgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaag 23508581  T
Q  233 agtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccag 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  23508582 agtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgg 23508681  T
Q  333 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatat 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23508682 gtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatat 23508781  T
Q  433 gagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23508782 gagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagtagat 23508881  T
Q  533 gt 534  Q
    ||    
T  23508882 gt 23508883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18179393 - 18178869
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggttta-gga-ggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagt 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18179393 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaaggatggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagt 18179294  T
Q  111 tga-gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 209  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18179293 tgatgagttcatgagatgaattatcccacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggt 18179194  T
Q  210 ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18179193 ttgaggtgtttagtgattacaagagtttgaagtatttgttctatcagaaggaattgaacatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatga 18179094  T
Q  310 ctttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaa 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18179093 ctttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaa 18178994  T
Q  410 ttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 509  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178993 ttacttgaacatttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 18178894  T
Q  510 tcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18178893 tcaaggaagcacagaaagttgatgt 18178869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 12689147 - 12688629
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12689147 atgagccttttgtagtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgag 12689048  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||     
T  12689047 aattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaa 12688948  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaagga-ttatgacttt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  12688947 gtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgacttt 12688848  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  12688847 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttac 12688748  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12688747 ttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 12688648  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgat 532  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12688647 ggaagcacagaaagttgat 12688629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14956201 - 14955681
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14956201 gatgagccttttgtagtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaaaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttga 14956102  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14956101 gaattcatgagaagaattacctgacgcatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttga 14956002  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  14956001 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgatttt 14955902  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  14955901 gggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttac 14955802  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955801 ttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 14955702  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14955701 ggaagcacagaaagttgatgt 14955681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 11551725 - 11552245
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  11551725 gatgagccttttgtagtgtattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttga 11551824  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11551825 gaattcatgagaagaattacccgacacatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttga 11551924  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  11551925 ggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataacttt 11552024  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||      
T  11552025 ggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttag 11552124  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552125 ttgaacagttcagatatatgagtttggtttgcaaatggtcaccttagagtgtgaaattgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 11552224  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  11552225 ggaagcacagaaagttcatgt 11552245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9597696 - 9597183
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9597696 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 9597597  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9597596 gagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgttta 9597497  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||    
T  9597496 gcgatcacaagagcttgaggtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaa 9597397  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  9597396 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgaattacttgaacag 9597297  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  9597296 tttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 9597197  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | |||| |||||||    
T  9597196 aaaaagctgatgtc 9597183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 15949 - 16462
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15949 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagagggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcgt 16048  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || || |||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16049 gagaagaattacccgacacatgatttagagttggcggctctagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgttta 16148  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  16149 gcgatcacaacagtttgaagtatttgtttgatcagaagaaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaa 16248  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  16249 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacag 16348  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | |     
T  16349 ttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggaaa 16448  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||    
T  16449 agaaagttgatgtc 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14213309 - 14212800
Alignment:
Q  26 gtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgaga 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  14213309 gtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgaaagatggtaaagtggtagcttatgtctcaagacagttgagaattcatgaga 14213210  T
Q  126 agaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtga 225  Q
    ||||||| || ||||||||  | || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  14213209 agaattacccgacgcatgacttagaattggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcga 14213110  T
Q  226 tcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14213109 tcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattat 14213010  T
Q  326 cacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagttta 425  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||| || |    
T  14213009 catccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattca 14212910  T
Q  426 gagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaa 525  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  14212909 gagatttgagcttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgataatgaatttctaaagagtattaaagaggcacagaa 14212810  T
Q  526 agttgatgtc 535  Q
    ||||||||||    
T  14212809 agttgatgtc 14212800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 173 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10872483 - 10872122
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872483 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10872384  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872383 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10872284  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactg 472  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||    
T  10872283 attgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattg 10872184  T
Q  473 ggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872183 gatatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 10872122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 15147508 - 15148029
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||    
T  15147508 gatgaaccttttgtggtaaattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaaggagtagcctatgcttcaagacggttga 15147607  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | || || |  |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147608 gaattcacgagaagaattaccctacgcacgatttagaattagttgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15147707  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||    
T  15147708 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgatttt 15147807  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  15147808 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgagttgc 15147907  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  15147908 ttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagaatattaa 15148007  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |||||||| || |||||||||    
T  15148008 agaagcacataatgttgatgtc 15148029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 320663 - 321180
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  320663 gaaccttttgtagtatattgtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaa 320762  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  320763 ttcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggt 320862  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||      
T  320863 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaa 320962  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||| |    
T  320963 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaaggagttcgagttgctgg 321062  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |  |||| |||||| |||||||||| ||  ||| |||| || | || |||||  | || |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||    
T  321063 agtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgatttcttgaagagtattaaaga 321162  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||| |||||||||||    
T  321163 agcacaaaaagttgatgt 321180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 11770864 - 11771384
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  11770864 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcatcaagacagttgg 11770963  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||| |||| ||||||| | ||||| || || || || |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11770964 ggattcatgaacgaaattaccctatgcatgatttagagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 11771063  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||  | || || ||||| |||    
T  11771064 agtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatctatttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaatttttgaaagactatgatttt 11771163  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  11771164 gggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagaaattgaattgc 11771263  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11771264 ttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 11771363  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| |||||| |||||||    
T  11771364 agaagcgcagaaaattgatgt 11771384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 12205400 - 12205921
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  12205400 agatgaaccttttgttgtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatagtaaggtggtagcttatgcttcgagacaattg 12205499  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||| || || || |||||||| || || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  12205500 aggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttaaaaatttggagaccttatttgtacggttccagatttg 12205599  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  12205600 aggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 12205699  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||    
T  12205700 tagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatggttaaagaatttgagttg 12205799  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||  |||||||||||  ||||| | ||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||| |||| ||||| |    
T  12205800 cttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagtttttgaatagtatta 12205899  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||| | ||||||||    
T  12205900 aagaagcacaggaggttgatgt 12205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14041342 - 14040822
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  14041342 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacagttga 14041243  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||    ||||| |||||||| ||| | ||||| || || || ||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14041242 gaattcatgaacgaaattaccctacgcacgatttagagttagctgcagtggtcgttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttccagatttga 14041143  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  14041142 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 14041043  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  || |  | |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||     
T  14041042 gagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgagttgt 14040943  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | |||||||||| |||| | ||||| || || || | |||| || | || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14040942 tggaacagtttacagatttaagtttagtatgtgagttgtcatcttagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 14040843  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     |||||| ||||| |||||||    
T  14040842 agaagcagagaaatttgatgt 14040822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14351372 - 14350852
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  14351372 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacagttga 14351273  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||    ||||| |||||||| ||| | ||||| || || || ||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14351272 gaattcatgaacgaaattaccctacgcacgatttagagttagctgcagtggtcgttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttccagatttga 14351173  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  14351172 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 14351073  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  || |  | |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||     
T  14351072 gagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgagttgt 14350973  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | |||||||||| |||| | ||||| || || || | |||| || | || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14350972 tggaacagtttacagatttaagtttagtatgtgagttgtcatcttagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 14350873  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     |||||| ||||| |||||||    
T  14350872 agaagcagagaaatttgatgt 14350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19148860 - 19148338
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  19148860 agatgaaccttttgctgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttg 19148761  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19148760 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 19148661  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||    
T  19148660 aagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattt 19148561  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || |||    
T  19148560 tggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttg 19148461  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||  || || | ||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||    
T  19148460 cttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatca 19148361  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
      ||||||||| |||||||||||    
T  19148360 gagaagcacagcaagttgatgtc 19148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 20748259 - 20747737
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  20748259 agatgaaccttttgctgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcatatgcttctaggcagttg 20748160  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20748159 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 20748060  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||    
T  20748059 aagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattt 20747960  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || |||    
T  20747959 tggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttg 20747860  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||  || || | ||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||    
T  20747859 cttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatca 20747760  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
      ||||||||| |||||||||||    
T  20747759 gagaagcacagcaagttgatgtc 20747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15205266 - 15204746
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||  | || |||||||| || || |||||||    
T  15205266 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgcccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggataataatgtagttgcttatgcatcgaggcagttga 15205167  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15205166 gaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 15205067  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||| | |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  15205066 agtgctcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaattgctgaaagattatgatttt 15204967  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||| || ||  |||    
T  15204966 gggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgc 15204867  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||| ||||||||||  ||||||| || ||||||  ||| ||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  15204866 tcgaatagtttagagacctgagtttagtctgcgaactgtcgcctcatagtataaagctaggaatgctgaagattgatagtgaattcttgaacagtattaa 15204767  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  15204766 agaagcgcataaagttgatgt 15204746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 535
Target Start/End: Original strand, 11387047 - 11387550
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  11387047 tattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacaactgagagttcatgagaagaatt 11387146  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  11387147 atcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcataa 11387246  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  11387247 aagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccg 11387346  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||      
T  11387347 ggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagact 11387446  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 531  Q
    ||||| | ||||| |||| ||||||||| || |||||  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| ||  |||||||    
T  11387447 tgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttga 11387546  T
Q  532 tgtc 535  Q
    ||||    
T  11387547 tgtc 11387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 15101207 - 15101619
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  15101207 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttaatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 15101306  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  15101307 atcatgaaaagaattatcctacacatgatttagagttagctgcggtgatttttgttttataaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaagt 15101406  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  15101407 atttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggt 15101506  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  15101507 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctag 15101606  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  15101607 agcagtttagaga 15101619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 16070899 - 16071375
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||| ||| |  ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  16070899 gaaccttttgttatttattgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcgagatgacaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 16070998  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16070999 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagt 16071098  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16071099 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 16071198  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || || || || |    
T  16071199 ttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactag 16071298  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagt 493  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| |||||    
T  16071299 aacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagt 16071375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15342061 - 15341652
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||   ||||||| |||||||    
T  15342061 tattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgatgattcatgaaaagaatt 15341962  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  15341961 atcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatctgtatggttccaaatttgaggtgttcagtgatcacaa 15341862  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
    |||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| || ||     
T  15341861 gagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcct 15341762  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| | | |||||| || ||||| ||||||||||| || |    
T  15341761 ggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggaca 15341662  T
Q  432 tgagtttggt 441  Q
    ||||| ||||    
T  15341661 tgagtctggt 15341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 435
Target Start/End: Original strand, 14284980 - 14285398
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| |    
T  14284980 gaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 14285079  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  14285080 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagt 14285179  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || |||| |||||||| |||||     
T  14285180 attcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttggg 14285279  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  14285280 ttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctgg 14285379  T
Q  417 aacagtttagagatatgag 435  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14285380 aacagtttagagacatgag 14285398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19614320 - 19613825
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  19614320 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 19614221  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  19614220 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 19614121  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||     
T  19614120 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 19614021  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || |||||||    
T  19614020 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttg 19613921  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || || ||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  19613920 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 19613825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 14262848 - 14263366
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  14262848 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttagatggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagga 14262947  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  14262948 ttcatgaaaagaattatcttacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagt 14263047  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||| |||| ||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||     
T  14263048 gtttagtgatcataaaagtttgtaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggg 14263147  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||  |||| ||||| |  || || || || ||||    
T  14263148 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttg 14263247  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||  | ||| | ||||| || | ||||||||| ||  |  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||  |||||||  ||    
T  14263248 aacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagaga 14263347  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  14263348 agcacaacaagttgatgtc 14263366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 535
Target Start/End: Original strand, 18052575 - 18053075
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18052575 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttaatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatc 18052674  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18052675 ccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 18052774  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  18052775 cttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggc 18052874  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | |||||||||||||| ||||    
T  18052875 aaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 18052974  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||| ||  |  |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||  ||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  18052975 gtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgt 18053074  T
Q  535 c 535  Q
    |    
T  18053075 c 18053075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13022984 - 13022526
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13022984 tgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttcttatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatc 13022885  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
     ||| ||||||||  |||||||  | || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  13022884 ttactcatgatctgtagttggcttcggtggtgtttgtttttaaaatttggaggcattatttgtacgtttccagatttgatgtgttcagtgatcataaaag 13022785  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  13022784 cttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggt 13022685  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||    
T  13022684 aaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttga 13022585  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagt 493  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||| ||  |  || |||| |||||||||||| |||||    
T  13022584 gccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggggatgctgaagattaatagt 13022526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 465
Target Start/End: Original strand, 23504489 - 23504922
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || ||||| |||||||    
T  23504489 tattgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcatgaaaagaatt 23504588  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    |||| || || ||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23504589 atcccactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaa 23504688  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  23504689 gagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccg 23504788  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | | |||||| || || || |||||||||||||| |    
T  23504789 ggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagagaca 23504888  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgt 465  Q
    |||||||||| || || | ||| |||||||||||    
T  23504889 tgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgt 23504922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 429
Target Start/End: Original strand, 30 - 423
Alignment:
Q  37 tgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcct 136  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||  ||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||||||    
T  30 tgatgcgtctaagctgggcttaggttgtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaattgaggatacatgagaagaattatcct 129  T
Q  137 acgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 236  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || || |    
T  130 acgcatgatctggagttggctgcggtattgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttcctgattcgaggtgttcagtgatcataaaagct 229  T
Q  237 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaa 336  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  230 tgaaatatttatttgattagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaa 329  T
Q  337 agctaatgttgttgc-agatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    ||| ||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  330 agccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagaga 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 16949076 - 16949485
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  16949076 gaaccatttgttgtttattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagctaatgcttctaggcagttgagag 16949175  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||  | || || ||||| || || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16949176 ttcatgagaagaattatcccactcatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttaaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 16949275  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  16949276 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattttatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggc 16949375  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  16949376 ttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctag 16949475  T
Q  417 aacagtttag 426  Q
    ||||||||||    
T  16949476 aacagtttag 16949485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12458285 - 12457807
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||   ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  12458285 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggtttaggtggtgttctgatgcaggatggtatggtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 12458186  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  12458185 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctagagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttaaggt 12458086  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||     
T  12458085 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggc 12457986  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||| ||||| | | |||||| || ||||| |    
T  12457985 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctgg 12457886  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    | || ||||||||  ||||| | ||  | |||| ||||||||| ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12457885 agcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggatgctgaagattgatagtga 12457807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13667182 - 13666712
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||      
T  13667182 gaaccttttgttgtttactatgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttgagga 13667083  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  13667082 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 13666983  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||    
T  13666982 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagt 13666883  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  ||||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | | |||| || ||| | |    
T  13666882 ttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttag 13666783  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagatt 487  Q
    | |||||||||||  |||| || || || |||| | |||||||||| ||  |  |||| ||||||||||||    
T  13666782 agcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggggatgctgaagatt 13666712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 11304867 - 11305286
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  11304867 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 11304966  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11304967 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggt 11305066  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  11305067 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 11305166  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |  || || |||||| | |    
T  11305167 ttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttag 11305266  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  11305267 aacagttcagagacatgagt 11305286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Original strand, 13967272 - 13967750
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  13967272 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 13967371  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |    
T  13967372 ttcatgagaagaattatcctacacatgatctggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagat 13967471  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| |||||||  | ||||||||||| |||||     
T  13967472 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggc 13967571  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || |   |||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||| | |    
T  13967572 ttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttag 13967671  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    ||||||| ||||| |||||| | || || |||| ||||||| | ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  13967672 aacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtga 13967750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7825538 - 7825119
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  7825538 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 7825439  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  7825438 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 7825339  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  7825338 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 7825239  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  7825238 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 7825139  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  7825138 ttcgagacttgagtttggtt 7825119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 27106406 - 27106825
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  27106406 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 27106505  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  27106506 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 27106605  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  27106606 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 27106705  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  27106706 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 27106805  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  27106806 ttcgagacttgagtttggtt 27106825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27171919 - 27171500
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  27171919 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 27171820  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  27171819 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 27171720  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  27171719 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 27171620  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  27171619 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 27171520  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  27171519 ttcgagacttgagtttggtt 27171500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49153946 - 49153507
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| || ||  ||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  49153946 gaaccgtttgttgtatactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcctctaggcagttacgtg 49153847  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  49153846 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggt 49153747  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || || |||| ||| |||||     
T  49153746 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggc 49153647  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |  || ||||||||||| |    
T  49153646 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctag 49153547  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacc 456  Q
    ||||||| ||||| |||||  | || || |||||||||||    
T  49153546 aacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcacc 49153507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 26117194 - 26117628
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||| | |    
T  26117194 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 26117293  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat------- 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||           
T  26117294 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 26117393  T
Q  210 --------ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaag 301  Q
            |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |||    
T  26117394 gttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaag 26117493  T
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |  |    
T  26117494 gattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaagg 26117593  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  26117594 aatttgaattgctagaacatttcagagacatgagt 26117628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4441497 - 4441147
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||  | || || | ||  |||||||| ||||||||||    
T  4441497 gcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttagaattggcaacagttgtgtatgcattgaagatttggagacatt 4441398  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||   |||||||| ||||    
T  4441397 atctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggccaagaagatggttaga 4441298  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  |  | |||||  ||||||   |||| ||||||||| || || || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||    
T  4441297 atatcctacggatttcgactttcagttgagttatcaccccgggaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatatcctctttg 4441198  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  4441197 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagcttggtt 4441147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15626172 - 15625898
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagt 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| | || ||   | ||||| ||||||||||    
T  15626172 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaaattgggtttaggtggtgtgcttatgca-gaa--taacaaggcagtggcctatgcatcaagacagt 15626076  T
Q  111 tgagagttcatgagaagaatt-atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 209  Q
    ||||  ||||||| | ||||| || |||| ||||| |||||||| |  || || ||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15626075 tgaggattcatga-acgaatttattctactcatgaacttgagttagatgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttatatggttctagat 15625977  T
Q  210 ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 288  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  15625976 ttgaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggcagggaaggtggct 15625898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14937984 - 14937566
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  14937984 tttgttgtatattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 14937885  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| || |  | ||  |||| ||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  14937884 agaagaactatccgactcatgatttggaattggcggcagttgagtatgcattga-gatttggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcag 14937786  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||  || |||||||  || |||   |||| |    
T  14937785 tgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagt 14937686  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||| |||| ||||    
T  14937685 tatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtctgctttgatggttaaagaattggaattgattgagcagt 14937586  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  14937585 ttcgagacttgagtttggtt 14937566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15365508 - 15365159
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| || |  | ||  |||| ||| ||||| ||||    
T  15365508 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaaatatccgactcatgatttggaattggcggcagttgagtatgcattga-gatttggaggcatt 15365410  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  15365409 atctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 15365310  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
    ||  || |||||||  || |||   |||| |||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||    
T  15365309 gtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtctgctttg 15365210  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | |||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  15365209 atggttaaagaattggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 15365159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 317 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625681
Alignment:
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| | ||| || ||  |||| |    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||| ||||| | || || |||| ||||||||| |  |||||  | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctcaatagtattaaaga 15625699  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  15625698 agcgcaaaaagtggatgt 15625681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17925291 - 17924871
Alignment:
Q  21 cttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttca 120  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  17925291 cttttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgca 17925192  T
Q  121 tgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttt 220  Q
    ||||||||| ||||  || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| |||||  ||| |||||| |  ||||| |||||     
T  17925191 tgagaagaactatctgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtttggttctaagtttgaagtgttc 17925092  T
Q  221 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||  ||| |  |||  || |||||||  || |||   ||||    
T  17925091 agtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaatgtggttgaagtatcttaaggatttcgattttcagttga 17924992  T
Q  321 attatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaaca 420  Q
     |||||| || || || |  ||||||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| ||||  |    
T  17924991 gttatcatcctgggaaggaaaatgttgttgtcgacgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagaa 17924892  T
Q  421 gtttagagatatgagtttggt 441  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  17924891 gtttcgagatttgagtttggt 17924871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Original strand, 39872 - 40139
Alignment:
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  39872 ttcatgagaggaattacccgacacatgatatggagttagcagctgtagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggt 39971  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || ||  ||||||| ||||| ||||      
T  39972 gtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaa 40071  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 384  Q
     ||| |||||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  40072 ctgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcacatgtc 40139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 274
Target Start/End: Original strand, 15717601 - 15717786
Alignment:
Q  89 gtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagac 188  Q
    ||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||  || || | || || | | | ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  15717601 gtagcttatgtgtcgagacagttgaaagtgcatgagaagaattattcgactaataatttggaattagtgacagtagtgtttgtgttgaagatttggaggc 15717700  T
Q  189 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 274  Q
    | |||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15717701 actacttgtatggttctaagtttgaagtgttcgatgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaataagagg 15717786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23642997 - 23642820
Alignment:
Q  107 cagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| | | || ||||| || || || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |    
T  23642997 cagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgttttggaattggctgcagttgtgtttgtgttgaagatttgacggcattatttgtatggttcta 23642898  T
Q  207 gatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagat 284  Q
      ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  23642897 agtttgaagtgttcagtgatcacacaagtttgaagtatttgtttgactagaaggagttgaatatgagacagagaagat 23642820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13354582 - 13354368
Alignment:
Q  228 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||  |||||||  ||||||  || | |||||  ||||||   |||| ||||||    
T  13354582 acaagagtttgaagtatttgtttgatcataaatagttgaatatgaggcaaagaagatgaatagagtatcttagggatttcgactttcagttgagttatca 13354483  T
Q  328 cccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttaga 427  Q
     |  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||  || ||||||| |  || || |||||| ||||||| ||| ||    
T  13354482 tcacgggaaggctaatgttgttgccgatgccttgagtaggaagacgtggcatatatctactttgatggttaaggagttggaattgattgaacaatttcga 13354383  T
Q  428 gatatgagtttggtt 442  Q
    ||| |||||||||||    
T  13354382 gatttgagtttggtt 13354368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13456067 - 13455966
Alignment:
Q  341 aatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttgg 440  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  13456067 aatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgattgagcagtttagagatttgagtttgg 13455968  T
Q  441 tt 442  Q
    ||    
T  13455967 tt 13455966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14139306 - 14139143
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  14139306 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaaagaattatc 14139207  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgta 198  Q
    | || || ||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  14139206 ccactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgta 14139143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14435000 - 14434890
Alignment:
Q  353 gatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggt 452  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || | ||    
T  14435000 gatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaatagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgt 14434901  T
Q  453 cacctcaaagc 463  Q
    | |||||||||    
T  14434900 cgcctcaaagc 14434890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 441
Target Start/End: Original strand, 21673236 - 21673583
Alignment:
Q  93 cttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatta 192  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||| ||||  |  | | ||| |||||||| | ||| |||||    
T  21673236 cttatgcgtcgagacaattgaaagtgcatgagaagaactatccaactcatgatttggaattgacggcaatcctgtatgtattgaagatttagaggcatta 21673335  T
Q  193 cttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagag 292  Q
      |||||||||| |  ||| | ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| | |  ||| | |||    
T  21673336 tctgtatggttctaagttttaagtgttcagtgactacaagagtttgaagtacttgtttgataagaaagagttgaatatgaggcagaggaattggttggag 21673435  T
Q  293 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 392  Q
    |  || ||| |||  ||||||   || | |||||| || || || |||||||||||||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  21673436 tatcttaagaatttcgactttcagttcagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatggtttgagtaaaaagactttgcatatgtctgct-tga 21673534  T
Q  393 tggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggt 441  Q
    || | | | | || |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  21673535 tgtttaaatagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggt 21673583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Original strand, 17143893 - 17144144
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| | |||||| |  || |  | || |||||||| |  |||||||||| ||  |||    
T  17143893 ttttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtttaggaggagtgttgatgcaaaatcgtcatgttgtggcttatgcgttgagacagttgaaagagcat 17143992  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||| |||  || |||||| | || |||||  | || || | |||||||||||| ||| | |||||  ||||||| |  |  ||||| ||||  |    
T  17143993 gagaagaataatctgactcatgatttggaattggcaacagttgtgtatgtgttgaagatttggtggcattatctgtatggatttaagtttgaagtgtgca 17144092  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  17144093 gtgatcataagagtttgaagtatctgtttgactagaaggagttgaatatgag 17144144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 33389714 - 33390235
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33389714 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 33389813  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389814 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 33389913  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33389914 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactt 33390013  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33390014 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 33390113  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33390114 cttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatca 33390213  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33390214 aggaagcacagaaagttgatgt 33390235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21831975 - 21831456
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831975 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 21831876  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831875 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 21831776  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||    
T  21831775 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 21831676  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21831675 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgct 21831576  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21831575 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaag 21831476  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21831475 gaagcacagagagttgatgt 21831456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21838623 - 21838103
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838623 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 21838524  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838523 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 21838424  T
Q  215 gtgtttagtgatca-caagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  21838423 gtgtttagtgatcagcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 21838324  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21838323 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 21838224  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21838223 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaa 21838124  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21838123 ggaagcacagaaagttgatgt 21838103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 51332178 - 51332699
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51332178 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 51332277  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51332278 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcaagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttg 51332377  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  51332378 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 51332477  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51332478 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattg 51332577  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51332578 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatca 51332677  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51332678 aggaagcacagaaagttgatgt 51332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 16349285 - 16349804
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16349285 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagag 16349384  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349385 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 16349484  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  16349485 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggt 16349584  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16349585 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttg 16349684  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagt-atcaagg 515  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16349685 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtaatcaagg 16349784  T
Q  516 -aagcacagaaagttgatgt 534  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16349785 aaagcacagaaagttgatgt 16349804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19108041 - 19107521
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19108041 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 19107942  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107941 ggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 19107842  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  19107841 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgacttt 19107742  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  19107741 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttac 19107642  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107641 ttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 19107542  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  19107541 ggaagcacagaaagttaatgt 19107521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 41352351 - 41352868
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41352351 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacagttgagag 41352450  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41352451 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 41352550  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  41352551 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttggg 41352650  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  41352651 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttg 41352750  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  41352751 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgagaagcatcaaaga 41352850  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41352851 agcacagaaagttgatgt 41352868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21025846 - 21025325
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  21025846 gatgaaccttttgtggtacactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggtagttga 21025747  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| || ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21025746 gaattcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttggcggctgtggtcgttatattaaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 21025647  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  21025646 ggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgaattt 21025547  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21025546 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgc 21025447  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21025446 ttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatttctaaaaagtattaa 21025347  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||||||| ||||||||    
T  21025346 agaggcacagaaaattgatgtc 21025325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 21234425 - 21234938
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21234425 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagtttatgcttcaagacagttgagatttcat 21234524  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21234525 gagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttgaggtgttta 21234624  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21234625 gcgatcacaagagtttgaaatattagttcgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaa 21234724  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  21234725 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacag 21234824  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  21234825 ttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaattgagaatgctgaagatagatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 21234924  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||    
T  21234925 agaaagttgatgtc 21234938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 17043709 - 17044222
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17043709 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtctaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcat 17043808  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||| || || || | ||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17043809 gagaaaaactacccgatgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttgaggtgttta 17043908  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  17043909 gcgatcacaagagtttgaagtatttgttggatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaa 17044008  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  17044009 ttatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaa 17044108  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  17044109 ttcagagatttgagtttggtttatgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcac 17044208  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||    
T  17044209 agaaagttgatgtc 17044222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 430801 - 431322
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  430801 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttggatttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 430900  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  430901 agaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttg 431000  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  431001 aagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattt 431100  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  431101 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcgagttg 431200  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  431201 cttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtatta 431300  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||| ||||||    
T  431301 aagaggcacagaaagctgatgt 431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21750610 - 21750093
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||     
T  21750610 gaacattttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaa 21750511  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750510 tacatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggt 21750411  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||      
T  21750410 gtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgag 21750311  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  21750310 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgcttg 21750211  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || || |||  |||| || | || |||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||    
T  21750210 aacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaagagtattaaaga 21750111  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21750110 agcacaaaaagttgatgt 21750093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 22360929 - 22361450
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  22360929 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtcaaagctgggtttaggtactgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 22361028  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||| |  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361029 agaattcatgagaagaattaccctatgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22361128  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||    
T  22361129 agatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaagtaattgaatatgaggcagcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgattt 22361228  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  || |  |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | | | ||||| |||    
T  22361229 tgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggtaaaatagttcgagttg 22361328  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |    
T  22361329 cttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatcttaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagtatta 22361428  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | |||||| | |||||||||||    
T  22361429 aagaagcataaaaagttgatgt 22361450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 369
Target Start/End: Original strand, 24793303 - 24793658
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24793303 gatgagccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgagtttaggtggtgtacttatgcaagatgataaagtggtagcttatgcctcaagacagttga 24793402  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24793403 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggtggttgttgtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 24793502  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  24793503 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaacgaattgaacatgagacaacgaaggtggctagaattgttgaaagattatgacttt 24793602  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793603 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaa 24793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 21744241 - 21744620
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  21744241 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagga 21744340  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21744341 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctacggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggt 21744440  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| || | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||     
T  21744441 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgattgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggg 21744540  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    |||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21744541 ttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 21744620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 237 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16373980 - 16373682
Alignment:
Q  237 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaa 336  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16373980 tgaagcatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaa 16373881  T
Q  337 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16373880 agctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagt 16373781  T
Q  437 ttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaag-cacagaaagttgatgt 534  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||    
T  16373780 ttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaattcttgaaaagtattaaaaaagacgcagaaagttgatgt 16373682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 23196938 - 23197452
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||||| || ||| |||||||||||| ||| || ||||||||      
T  23196938 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcataggtggtgttctt--gcaagatggcaaagtggtagcttatgtttctaggcagttgagga 23197035  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23197036 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggctgcagtggt-tttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 23197134  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  23197135 gttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 23197234  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  23197235 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctag 23197334  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||  ||||| | || || |||| | ||||||| || ||  |  |||| |||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||   ||    
T  23197335 agcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtga 23197434  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  23197435 agcacagcaagtggatgt 23197452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 20834589 - 20835001
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| | |||     
T  20834589 gaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagaa 20834688  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  20834689 ttcatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20834788  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||| | ||||||||||| |||||     
T  20834789 atttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggc 20834888  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| ||||| |    
T  20834889 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctag 20834988  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  20834989 aacagtttagaga 20835001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19855975 - 19855563
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  19855975 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgagga 19855876  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  19855875 tacatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 19855776  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  19855775 atttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 19855676  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || || || |    
T  19855675 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactag 19855576  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  19855575 agcagtttagaga 19855563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Original strand, 20855449 - 20855927
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | || ||||| || ||  |||||||||||||||| || ||| |||| |    
T  20855449 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttagtttaggaggtgtgttgatacaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgaggg 20855548  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  20855549 ctcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagt 20855648  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||     
T  20855649 gtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggc 20855748  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |  || ||  ||||||| |    
T  20855749 ttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcg 20855848  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    |||||||||| ||| | ||| | || || |||| |||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||    
T  20855849 aacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtga 20855927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 302 - 535
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077863
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttct 501  Q
    | || || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 16077829  T
Q  502 gaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  16077830 gaagagtattaaagaggcatagaaagttgatgtc 16077863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 19661825 - 19662258
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || | ||||||      
T  19661825 gaaccttttgtagtttattttgatgcgtctaagttgggcttaggtgttgttttaatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggctgttgagga 19661924  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttg-tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || |||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  19661925 tacatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttggttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaag 19662024  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttgg 315  Q
    | ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||| || | ||||||||||| |||||    
T  19662025 tatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttgg 19662124  T
Q  316 tttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgctt 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || |||||     
T  19662125 tttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgcta 19662224  T
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaat 449  Q
    || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  19662225 gagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaat 19662258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 179 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 22110530 - 22110190
Alignment:
Q  179 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 278  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22110530 atatggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22110431  T
Q  279 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 378  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22110430 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22110331  T
Q  379 tatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatg 478  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||| || ||||| ||||| |||    
T  22110330 tatgtcctctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatg 22110231  T
Q  479 ctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagc 519  Q
    || |||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||    
T  22110230 ctaaagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagc 22110190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 179 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 22114379 - 22114039
Alignment:
Q  179 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 278  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22114379 atatggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22114280  T
Q  279 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 378  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22114279 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22114180  T
Q  379 tatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatg 478  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||| || ||||| ||||| |||    
T  22114179 tatgtcctctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatg 22114080  T
Q  479 ctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagc 519  Q
    || |||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||    
T  22114079 ctaaagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagc 22114039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 24098292 - 24098704
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || || |||||      
T  24098292 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggattaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaattgagga 24098391  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24098392 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttagttgcggtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggt 24098491  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||||| |||||     
T  24098492 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggc 24098591  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  24098592 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctag 24098691  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  24098692 aacagtttagaga 24098704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21952561 - 21952167
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |||| ||||||||||||||    
T  21952561 tgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgggttcttgagaagaattatc 21952462  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||    
T  21952461 ctacacatgatctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctgtgatcataaaag 21952362  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || |||    
T  21952361 tttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggt 21952262  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21952261 aaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagaga 21952167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 20938752 - 20939164
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||     
T  20938752 gaaccatttgttgtgtattgtgatgcatctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttaagaa 20938851  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20938852 ttcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggggttggctggggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggt 20938951  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || |||||| |||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  20938952 attcagtgattacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 20939051  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||| |      
T  20939052 ttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttat 20939151  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  20939152 agcagtttagaga 20939164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20296082 - 20295606
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||  | || ||| | |    
T  20296082 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctcggcaattgcgtg 20295983  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  20295982 ttcatgagaagaattatcctacacatgatctggaattggctgtggtggtttttgttttggaaatttggagacattatttgtacggttccagatctgaggt 20295883  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||| || || |||||||   |||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  20295882 gttcaatgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggttctgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 20295783  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||  | |||||| |||||| | |    
T  20295782 ttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttag 20295683  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagt 493  Q
    || ||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||| ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  20295682 aatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggggatgctgaagattgatagt 20295606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 208 - 534
Target Start/End: Original strand, 19759753 - 19760079
Alignment:
Q  208 atttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattat 307  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||| | || ||||||    
T  19759753 atttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattat 19759852  T
Q  308 gactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcg 407  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  19759853 gattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatctaagaattgg 19759952  T
Q  408 aattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaag 507  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||||||||| || |||||  | |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19759953 agctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtgaatttatgaatag 19760052  T
Q  508 tatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| || ||||||||||| | ||||||    
T  19760053 tataaaagaagcacagaaggctgatgt 19760079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 31538686 - 31539128
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||  | |    
T  31538686 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgtg 31538785  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  31538786 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 31538885  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  31538886 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 31538985  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  31538986 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 31539085  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    ||||||| |||||||||||| | || || |||| |||||||||    
T  31539086 aacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctca 31539128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 435
Target Start/End: Original strand, 20060638 - 20061059
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| ||||   | ||||| |||||||| |||||| |||    
T  20060638 gatgaaccgtttgttgtctactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtagggtagtagcgtatgcttctagacagctga 20060737  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  20060738 gagtacatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggccgcggtggtttttgtattaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttga 20060837  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | ||||| || || ||  ||||||||||||| |||    
T  20060838 agtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggcagaggagatgacttgaattattaaaggattatgatttt 20060937  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||    
T  20060938 ggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgc 20061037  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgag 435  Q
    |||| || ||||||||| ||||    
T  20061038 ttgagcattttagagatttgag 20061059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16377815 - 16377587
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16377815 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcatcaagacaattga 16377716  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||    ||||||||||| ||||||||||  || || || || || |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377715 gaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgtattagctgcagttgtatttgtgctcaagattgggagacattacttgtatggttcgagatttga 16377616  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16377615 ggtgttaagtgatcacaagagtttgaagt 16377587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 37678750 - 37678308
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  37678750 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 37678651  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  37678650 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 37678551  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  37678550 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggt 37678451  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  37678450 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 37678351  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    ||||||| |||||||||||| | || || |||| |||||||||    
T  37678350 aacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctca 37678308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 20830087 - 20830506
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  20830087 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 20830186  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  20830187 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 20830286  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  20830287 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 20830386  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  20830387 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 20830486  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  20830487 ttcgagacttgagtttggtt 20830506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 22134252 - 22134671
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || ||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  22134252 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcataatcgttaggttgtggcttatgcttcaaggtagttgaaagtgcatg 22134351  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||  || |||||| | || ||||| || || || | ||  |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  22134352 agaagaattatcacactcatgatttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcag 22134451  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||  |||||  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  22134452 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggtcagagtaccttaaggattttgattttcagttgagt 22134551  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | | | || |||||| |||| ||||    
T  22134552 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaatagttggaattgattgagcagt 22134651  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  22134652 ttcgagatttgagtttggtt 22134671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20915196 - 20914871
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | ||  |||||||| ||||| || |    
T  20915196 gcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 20915097  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  20915096 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 20914997  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca-cccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctat 390  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  20914996 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccagg-aaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgcttt 20914898  T
Q  391 gatggtcagagaattcgaattgcttga 417  Q
    |||||| | ||| || |||||| ||||    
T  20914897 gatggttaaagagttggaattgattga 20914871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 52987436 - 52987212
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |||||||    
T  52987436 tttgttgtgtattgtgatgcatctaagttgggcttaggtggtgttctaatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatg 52987337  T
Q  123 agaagaattatcctac-gcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||||||||   |||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  52987336 agaagaattatcctacattatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttca 52987237  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtattt 246  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  52987236 gtgatcataaaagtttgaagtattt 52987212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 50619084 - 50619296
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||| || ||| | || |||||||| || ||||||||||    
T  50619084 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttg-------------tgcttatgcaagatggcaaagtagtggcttatgcgtcgagacagttga 50619170  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||  |||||  |||||||| ||| | |||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50619171 gaattcatgagcggaattgccctacgcacgatttagagtta-ctgcagtggtctttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 50619269  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 240  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||    
T  50619270 agtgttcagcgatcacaagagtctgaa 50619296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 416 - 534
Target Start/End: Original strand, 50619332 - 50619450
Alignment:
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagg 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50619332 gaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctaagaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaagg 50619431  T
Q  516 aagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  50619432 aagcagagaaagttgatgt 50619450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22116586 - 22116417
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| |  ||| ||||||    
T  22116586 gatgaaccttttgtggtgtattgggatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcattgagatagttga 22116487  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatg 183  Q
    |  |||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||    
T  22116486 ggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatg 22116417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 286
Target Start/End: Original strand, 41216702 - 41216815
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  41216702 ttgaagatttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41216801  T
Q  273 ggcagcgaagatgg 286  Q
    ||||| ||||||||    
T  41216802 ggcagagaagatgg 41216815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34568084 - 34567564
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34568084 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 34567985  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567984 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 34567885  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  34567884 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 34567785  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34567784 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 34567685  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34567684 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 34567585  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34567584 ggaagcacagaaagttgatgt 34567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16358092 - 16357572
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16358092 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 16357993  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357992 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16357893  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  16357892 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggagttgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 16357793  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16357792 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 16357693  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16357692 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 16357593  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16357592 ggaagcacagaaagttgatgt 16357572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 22331682 - 22332203
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22331682 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagtag 22331781  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331782 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggtggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22331881  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  22331882 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 22331981  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22331982 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 22332081  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22332082 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatca 22332181  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22332182 aggaagcacagaaagttgatgt 22332203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22136259 - 22135737
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22136259 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaaattgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 22136160  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136159 agaattcatgagaagaattatcctatgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22136060  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  22136059 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 22135960  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22135959 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcggagagttcaaattg 22135860  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135859 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 22135760  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22135759 aggaagcacagaaagttgatgtc 22135737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27519997 - 27519477
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27519997 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27519898  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27519897 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttg 27519798  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  27519797 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 27519698  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27519697 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 27519598  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519597 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtg-aactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 27519499  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27519498 aggaagcacagaaagttgatgt 27519477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27611945 - 27611424
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27611945 agatgaaccttttgtggtatattgtgatacgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27611846  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611845 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 27611746  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  27611745 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactt 27611646  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |     
T  27611645 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaacta 27611546  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27611545 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagcgaatttctgaaaagtatca 27611446  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27611445 aggaagcacagaaagttgatgt 27611424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 14998534 - 14999056
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14998534 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 14998633  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998634 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 14998733  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  14998734 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 14998833  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14998834 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 14998933  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14998934 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattcatagtgaattcctgaaaagtatca 14999033  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  14999034 aggaagcgcagaaagttgatgtc 14999056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 27684195 - 27684717
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27684195 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27684294  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684295 aggattcatgagaagaattatcccacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 27684394  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  27684395 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 27684494  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27684495 tggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 27684594  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27684595 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatca 27684694  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  27684695 aggaagcgcagaaagttgatgtc 27684717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 37290291 - 37290812
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37290291 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaaaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 37290390  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290391 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 37290490  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  37290491 aggtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactt 37290590  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290591 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 37290690  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290691 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcatcttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 37290790  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  37290791 agaaagcacaaaaagttgatgt 37290812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 40710371 - 40709850
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40710371 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 40710272  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40710271 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttg 40710172  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  40710171 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 40710072  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40710071 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 40709972  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709971 cttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 40709872  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40709871 aggaagcacagaaagttgatgt 40709850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19771551 - 19771030
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19771551 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 19771452  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19771451 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 19771352  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19771351 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactt 19771252  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  19771251 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagtta 19771152  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19771151 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatca 19771052  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  19771051 aagaagcacagaaagttgatgt 19771030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 41772433 - 41771912
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41772433 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 41772334  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41772333 ataattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttg 41772234  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41772233 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 41772134  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  41772133 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagtta 41772034  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  41772033 cttgaacagttccgagatatgagtttggtttatgaatggtcacctcagagcgtgaaactaggtatgctcaagattgatagtgaatttttgaaaaatatct 41771934  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41771933 aggaagcacagaaagttgatgt 41771912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 29474868 - 29475390
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29474868 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaaactgggtttaggaggtgtagttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 29474967  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474968 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 29475067  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||    
T  29475068 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatgacttgaattgttgaaagattatgactt 29475167  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29475168 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 29475267  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475268 cttgaacagattagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 29475367  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  29475368 aggaagcgcagaaagttgatgtc 29475390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 27667285 - 27667806
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27667285 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtactaatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 27667384  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667385 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggtggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 27667484  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  27667485 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 27667584  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27667585 tggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 27667684  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27667685 cttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatca 27667784  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  27667785 aagaagcacagaaagttgatgt 27667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18777358 - 18776865
Alignment:
Q  42 cgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgca 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18777358 cgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgca 18777259  T
Q  142 tgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaag 241  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18777258 tgatctagagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaag 18777159  T
Q  242 tatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagcta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18777158 tatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagcta 18777059  T
Q  342 atgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggt 441  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  18777058 atgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagt 18776959  T
Q  442 ttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  18776958 ttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggctcagaaagttgatgtc 18776865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23575291 - 23574798
Alignment:
Q  42 cgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgca 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  23575291 cgtccaagctgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttttgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgca 23575192  T
Q  142 tgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaag 241  Q
     ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23575191 cgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaag 23575092  T
Q  242 tatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagcta 341  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23575091 tatttgttcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagcta 23574992  T
Q  342 atgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23574991 atgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagt 23574892  T
Q  442 ttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  23574891 ttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtatcaaagaagcacaaaaaattgatgtc 23574798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23441798 - 23441279
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23441798 gatgaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtg--cttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcagctga 23441701  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23441700 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttggagttggcggctgtggcctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttga 23441601  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  23441600 agtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgacttt 23441501  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23441500 ggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattac 23441401  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  23441400 ttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtgaatttatgaagagtattaa 23441301  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  23441300 agaggcacaaaaagttgatgtc 23441279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 21562768 - 21563289
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21562768 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaggtggtagcttatgcttcaagacagttg 21562867  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| |  || |||||||    
T  21562868 agaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctgctgtggtttttggtttgaaaatttggaggcattatttgtacgactccagatttg 21562967  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || | ||||| ||||| ||    
T  21562968 aggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatgattt 21563067  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || || |||    
T  21563068 tagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatggttaaagagtttgagttg 21563167  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||| | || |||||  |||||||| |||||||  | ||||| ||  |||| |||||||    
T  21563168 cttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacagtatca 21563267  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  21563268 aagaagcacagaaagttgatgt 21563289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25428024 - 25427503
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  25428024 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaggatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 25427925  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  25427924 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagactttacttttatggttccagatttg 25427825  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  25427824 aggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattt 25427725  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  25427724 tgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 25427625  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||  | || || ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  25427624 cttgaacagttcagaaatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtatagctaggaatcatgaagattgataatgaatttctgaagagtatta 25427525  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | |||| ||| |||||| ||||    
T  25427524 aagaagaacataaagttcatgt 25427503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 23472817 - 23472341
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| || | |||| |||    
T  23472817 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggtaaggtagtagcttatgcatcgaaacagctga 23472718  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23472717 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttga 23472618  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  23472617 agtgtttagcgatcataa-agtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgatttt 23472519  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  23472518 gggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgc 23472419  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgata 491  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23472418 ttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgata 23472341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 534
Target Start/End: Original strand, 26737527 - 26738043
Alignment:
Q  18 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||||||  |    
T  26737527 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggaaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggat 26737626  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 217  Q
    ||||||    |||||||||||  |||||||||| || || || || || || ||  | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  26737627 tcatgaacgaaattatcctacttatgatcttgaattagctgcagtggttttcgtacttaaaatatggagacactatttgtatggttccagatttgaagtg 26737726  T
Q  218 tttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtt 317  Q
    |||||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | || || ||||| ||| |||    
T  26737727 tttagtgaccataagagtttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagggaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttagtt 26737826  T
Q  318 tgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttga 417  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||    
T  26737827 tgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttgga 26737926  T
Q  418 acagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaa 517  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26737927 gcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaa 26738026  T
Q  518 gcacagaaagttgatgt 534  Q
      ||| |||||||||||    
T  26738027 agacataaagttgatgt 26738043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20800987 - 20800659
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  20800987 gatgaaccttttgtggtttactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagggagttga 20800888  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || || ||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20800887 gaattaatgagaagaattaccagacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 20800788  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  | || ||||||||||||    
T  20800787 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgacttt 20800688  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaa 342  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20800687 gatttgaattatcatccaggtaaagctaa 20800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 21338096 - 21338613
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||| ||||||      
T  21338096 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacggttgagga 21338195  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21338196 ttcatgaaagaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtctttgtacttaagatatagagacattacttgtattgttcgagatttgaagt 21338295  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||     
T  21338296 gttcagcgaacacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaatgtggcttgaattgctgaaagactatgattttggg 21338395  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||| | |||  |||| ||||| |    
T  21338396 ttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggttaaagagctcgagttgctgg 21338495  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| |   |||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  21338496 aacagtttaaagatttgagtttagtttgcaagatgtcatctcagaatgtgaagctaggaatgcagaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaaga 21338595  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  21338596 agcgcagaaagttgatgt 21338613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 28893741 - 28894150
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||  |||| |    
T  28893741 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgaggg 28893840  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  28893841 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28893940  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  28893941 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28894040  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| |||||||    
T  28894041 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28894140  T
Q  417 aacagtttag 426  Q
    ||||||||||    
T  28894141 aacagtttag 28894150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 28922567 - 28922976
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||  |||| |    
T  28922567 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgaggg 28922666  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  28922667 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28922766  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  28922767 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28922866  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| |||||||    
T  28922867 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28922966  T
Q  417 aacagtttag 426  Q
    ||||||||||    
T  28922967 aacagtttag 28922976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20823022 - 20822610
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  20823022 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctaggcagctgagag 20822923  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  20822922 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 20822823  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||     
T  20822822 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 20822723  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  20822722 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttg 20822623  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  20822622 aacagtttagaga 20822610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 20466895 - 20467383
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagt 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| | |||||   ||||||| || ||||| |    
T  20466895 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcg-ccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgca-gaa--taacaaggtagtggcttatgcatcgagacaat 20466990  T
Q  111 tgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatt 210  Q
    ||||  |||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20466991 tgaggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggttctagatt 20467090  T
Q  211 tgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgac 310  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || ||||||||     
T  20467091 tgaagtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgat 20467190  T
Q  311 tttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||| ||| || ||      
T  20467191 tttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagttagagc 20467290  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctga 503  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20467291 tgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgagttgtcacctcagagcgtgaagttaggaatgctaaagattgatagtgaatttctga 20467383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 28915212 - 28915621
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||   ||| |    
T  28915212 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaaccgaggg 28915311  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  28915312 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28915411  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  28915412 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28915511  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| |||||||    
T  28915512 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28915611  T
Q  417 aacagtttag 426  Q
    ||||||||||    
T  28915612 aacagtttag 28915621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 28930480 - 28930889
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||   ||| |    
T  28930480 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaaccgaggg 28930579  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  28930580 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28930679  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  28930680 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28930779  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| |||||||    
T  28930780 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28930879  T
Q  417 aacagtttag 426  Q
    ||||||||||    
T  28930880 aacagtttag 28930889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 260 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21882293 - 21882018
Alignment:
Q  260 gaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcct 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21882293 gaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgcct 21882194  T
Q  360 tgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||  | ||||| || |||||||||||    
T  21882193 tgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctca 21882094  T
Q  460 aagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21882093 gagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 21882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22463516 - 22463003
Alignment:
Q  21 cttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttca 120  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  22463516 cttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttaggaggtgtgttgatgcaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagggttca 22463417  T
Q  121 tgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttt 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22463416 tgaaaagaattatcctacgcatgatttagagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgttt 22463317  T
Q  221 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 320  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  22463316 agtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttga 22463217  T
Q  321 attatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaaca 420  Q
    |||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |  || || |||||||| |||||    
T  22463216 attaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaaca 22463117  T
Q  421 gtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagca 520  Q
    |||||| ||| | ||| | || || |||| |||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||    
T  22463116 gtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagca 22463017  T
Q  521 cagaaagttgatgt 534  Q
    ||  ||||||||||    
T  22463016 caacaagttgatgt 22463003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 24619094 - 24619506
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  24619094 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 24619193  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24619194 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24619293  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||      
T  24619294 gtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgac 24619393  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  24619394 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactgg 24619493  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  24619494 aacagtttagaga 24619506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 24715325 - 24715737
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  24715325 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 24715424  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24715425 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24715524  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||      
T  24715525 gtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgac 24715624  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  24715625 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactgg 24715724  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  24715725 aacagtttagaga 24715737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 24748353 - 24748765
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  24748353 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 24748452  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24748453 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24748552  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||      
T  24748553 gtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgac 24748652  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  24748653 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactgg 24748752  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  24748753 aacagtttagaga 24748765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 503
Target Start/End: Original strand, 17268151 - 17268619
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||    
T  17268151 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttaatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaactgagggtacatgaaaagaattatc 17268250  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || || ||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17268251 ccactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 17268350  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  17268351 cttgaaatatttgtttgatcagacggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccggga 17268450  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17268451 aaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatga 17268550  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctga 503  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||||  |  |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  17268551 gtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctga 17268619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Original strand, 21679577 - 21680072
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  21679577 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctagggggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 21679676  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  21679677 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagt 21679776  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||     
T  21679777 gtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 21679876  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  |||||||| |||||||    
T  21679877 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttg 21679976  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || || ||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  21679977 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 21680072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 394
Target Start/End: Original strand, 21871850 - 21872226
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  21871850 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagtttggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 21871949  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || || || ||| | ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| ||    
T  21871950 ttcatgaaaagaactatccgacacatgatttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagt 21872049  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21872050 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggt 21872148  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 394  Q
    |||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21872149 ttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 394
Target Start/End: Original strand, 21876130 - 21876506
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  21876130 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagtttggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 21876229  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || || || ||| | ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| ||    
T  21876230 ttcatgaaaagaactatccgacacatgatttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagt 21876329  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21876330 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggt 21876428  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 394  Q
    |||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21876429 ttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20777482 - 20777190
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  20777482 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagag 20777383  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  20777382 ttcatgaaaagaattctcctacgcatgatttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagt 20777283  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 309  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  20777282 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatga 20777190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 22234719 - 22235131
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  22234719 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagaa 22234818  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  22234819 ttcatgaaaagaattaccctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagt 22234918  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||| ||||| |||||     
T  22234919 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggc 22235018  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||| | |    
T  22235019 ttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttag 22235118  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  22235119 agcagtttagaga 22235131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22504248 - 22503836
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||  || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  22504248 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgtatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 22504149  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22504148 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggt 22504049  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  22504048 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 22503949  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| ||| | |    
T  22503948 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttag 22503849  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  22503848 aacagtttagaga 22503836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 14885790 - 14886209
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   ||||||| |||||||| || |||||| |      
T  14885790 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtagggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgta 14885889  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14885890 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 14885989  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  14885990 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 14886089  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  14886090 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 14886189  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  14886190 aacagttcagagatatgagt 14886209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 23078957 - 23079300
Alignment:
Q  86 atggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatgga 185  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||| || || || ||||    
T  23078957 atggtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggggtttgttttaaaaatttgga 23079056  T
Q  186 gacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatg 285  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  23079057 ggcattatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatg 23079156  T
Q  286 gctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtcc 385  Q
    | ||||| || | || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  23079157 gttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtct 23079256  T
Q  386 gctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    ||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23079257 gctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagaga 23079300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 24797196 - 24797615
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||| |||||||| || |||||  |      
T  24797196 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttacgta 24797295  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24797296 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24797395  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  24797396 gttcagtgaccataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 24797495  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  24797496 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 24797595  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  24797596 aacagttcagagatatgagt 24797615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20343851 - 20343432
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  20343851 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 20343752  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20343751 ttcatgagaagaattatcctacacatgatttggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 20343652  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||  | || ||| ||||||| || ||||||||||| |||||     
T  20343651 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 20343552  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| | | |||||| |||||| | |    
T  20343551 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttag 20343452  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  20343451 aacagttcagagacatgagt 20343432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21408728 - 21408298
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||   |||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  21408728 gatgaaccatttattgtatactgtgatgcgtctaagttgggtttaggtgttgtgcttatgcaggataataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttga 21408629  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||| | |||||  | || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||    
T  21408628 ggattcatgaatgtaattatcctactcatgatcttgggttagttgcagtaatttttgtacttaaaatttggaggcattatctgtatggttctaaatttga 21408529  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || ||| |||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  21408528 cgtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggcagcataggtggcttgaattgctaaaggattatgaattc 21408429  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||||    
T  21408428 ggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagttgc 21408329  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21408328 ttgaacagttcagagacttgagtttggtttg 21408298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 362 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23517768 - 23517595
Alignment:
Q  362 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaa 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  23517768 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcaga 23517669  T
Q  462 gcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23517668 gtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtc 23517595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25849590 - 25849225
Alignment:
Q  71 atgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttg 170  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||    
T  25849590 atgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggaaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttggctgcagtggtttttg 25849491  T
Q  171 tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 270  Q
    | || || || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||    
T  25849490 ttttaaaaatttggaggcatgatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacat 25849391  T
Q  271 gaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 370  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||     
T  25849390 gaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaa 25849291  T
Q  371 acattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    || ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  25849290 actttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagt 25849225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 21935993 - 21936412
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  21935993 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 21936092  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  21936093 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 21936192  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  21936193 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 21936292  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  21936293 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 21936392  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  21936393 ttcgagacttgagtttggtt 21936412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 37542180 - 37542599
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||  | |    
T  37542180 gaaccgtttgttgtatactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttacgtg 37542279  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  37542280 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggt 37542379  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| |||||||  | ||||||| ||| |||||     
T  37542380 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggc 37542479  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| || |||||  |||| ||| ||||||| |  || || |||||| | |    
T  37542480 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactttgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttag 37542579  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  37542580 aacagttcagagacatgagt 37542599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24582773 - 24582355
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  24582773 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 24582674  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | |   |||||||| |||||  | ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  24582673 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacattgaagatttggaggaactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 24582574  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  24582573 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 24582474  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  24582473 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 24582374  T
Q  423 ttagagatatgagtttggt 441  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  24582373 ttcgagatttgagtttggt 24582355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27012581 - 27012223
Alignment:
Q  89 gtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagac 188  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||  || || || | |   |||||||| ||||| |    
T  27012581 gtagcttatgcttcgaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggtagctgttgtgtatacattgaagatttggaggc 27012482  T
Q  189 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 288  Q
    | ||  |||||||||| |  || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |    
T  27012481 actatctgtatggttctaagttcgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 27012382  T
Q  289 agagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgct 388  Q
     || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27012381 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgct 27012282  T
Q  389 atgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcga 447  Q
     ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27012281 ttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggttagcga 27012223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22349510 - 22349419
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaa 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22349510 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaatgtggtagcttatgcttcaa 22349419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 20800654 - 20800517
Alignment:
Q  398 agagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaat 497  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  20800654 agagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcctagtttgcgagtggtcacctcagagtgtgaaactgagaatgctgaagattgacagtgaat 20800555  T
Q  498 ttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20800554 ttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 20800517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23504741 - 23504544
Alignment:
Q  89 gtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagac 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||| ||| || | ||  |||||||| ||||| |    
T  23504741 gtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggtcgttgtgtatgcattgaagatttggaggc 23504642  T
Q  189 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||    
T  23504641 attatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatgaagcaaagaagatgg 23504544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 534
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831077
Alignment:
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||  |||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    || | ||||| || | ||| ||| | || |||||  |||||||| |||||||  | ||||| ||  |||| | ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagcgcagaaagttgatgt 21831077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 822 - 923
Alignment:
Q  251 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttg 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  822 gatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttg 921  T
Q  351 ca 352  Q
    ||    
T  922 ca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20775034 - 20774850
Alignment:
Q  311 tttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| |    
T  20775034 tttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagt 20774935  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| | || || ||||  ||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||||  |||||||    
T  20774934 tgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 20774850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21497263 - 21497147
Alignment:
Q  265 gaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  21497263 gaatatgaggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagc 21497164  T
Q  365 aggaagacattgcatat 381  Q
    |||||||| || |||||    
T  21497163 aggaagacgttacatat 21497147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21624291 - 21624140
Alignment:
Q  125 aagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtg 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||| |||||| || ||||| ||| | ||||||||  | |  ||||| || ||||| |    
T  21624291 aagaattaccctacgcatgatctggagttagctgcagtcgtgtttgcgttgaaaatctggaggcatcatttgtatggagcaaagtttgaagtttttagcg 21624192  T
Q  225 atcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 276  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  21624191 accacaagagtttaaagtacttgtttgatcaaaaggaactcaacatgaggca 21624140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 15588245 - 15588765
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15588245 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 15588344  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588345 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15588444  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  15588445 agtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 15588544  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15588545 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 15588644  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588645 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 15588744  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15588745 ggaagcacagaaagttgatgt 15588765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16637050 - 16636530
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16637050 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 16636951  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636950 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16636851  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  16636850 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 16636751  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16636750 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 16636651  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16636650 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 16636551  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16636550 ggaagcacagaaagttgatgt 16636530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43164374 - 43163854
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43164374 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 43164275  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164274 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 43164175  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  43164174 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 43164075  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43164074 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 43163975  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43163974 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 43163875  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43163874 ggaagcacagaaagttgatgt 43163854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 20060906 - 20061427
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20060906 agatgaaccttttgtggtctattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaggaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 20061005  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061006 agggttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 20061105  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  20061106 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 20061205  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20061206 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 20061305  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061306 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 20061405  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20061406 aggaagcacagaaagttgatgt 20061427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 48426725 - 48426204
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48426725 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 48426626  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48426625 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 48426526  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  48426525 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgactt 48426426  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48426425 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 48426326  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48426325 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctcaagattgatagtgaatttttgaaaaatatca 48426226  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48426225 aggaagcacagaaagttgatgt 48426204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13253968 - 13253447
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  13253968 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttg 13253869  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253868 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 13253769  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  13253768 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 13253669  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13253668 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 13253569  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13253568 cttgaacagtttagagatatgagttcggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaggttgatagtgaatttctgaaaagtatca 13253469  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13253468 aggaagcacagaaagttgatgt 13253447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15340546 - 15340026
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15340546 gatgaaacttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaagttaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 15340447  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340446 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15340347  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  15340346 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 15340247  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15340246 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgc 15340147  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15340146 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaa 15340047  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  15340046 ggaagcacagagagttgatgt 15340026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 534
Target Start/End: Original strand, 15401371 - 15401890
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15401371 atgaaacttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 15401470  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15401471 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 15401570  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||    
T  15401571 gagtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 15401670  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15401671 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatttct 15401770  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15401771 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaag 15401870  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  15401871 gaagcacagagagttgatgt 15401890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 532
Target Start/End: Original strand, 15723786 - 15724305
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15723786 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaaactgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 15723885  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723886 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 15723985  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| | || |||||||||||    
T  15723986 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgactt 15724085  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15724086 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 15724185  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724186 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 15724285  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgat 532  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  15724286 aggaagcgcagaaagttgat 15724305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10006878 - 10006357
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10006878 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 10006779  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10006778 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttg 10006679  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  10006678 aggtgtttagtgatcacaagagtttaaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 10006579  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10006578 cggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 10006479  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10006478 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 10006379  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10006378 aggaagcacagaaagttgatgt 10006357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10907488 - 10906967
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10907488 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 10907389  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10907388 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttg 10907289  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  10907288 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtattttttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactt 10907189  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10907188 cggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 10907089  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10907088 ctagaacagtttagagatatgtgtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 10906989  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10906988 aggaagcacagaaagttgatgt 10906967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 15347097 - 15347618
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15347097 agatgaaccttttgtggtatattttgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcatatgcttcaagacagttg 15347196  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15347197 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtatcgaagatatggagacattacttgtttggttcgagatttg 15347296  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15347297 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgagttgctaaaggattacgactt 15347396  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  15347397 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagtta 15347496  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15347497 cttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatca 15347596  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15347597 aggaagcacagaaagttgatgt 15347618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 5423782 - 5424303
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5423782 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacaattg 5423881  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423882 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 5423981  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  5423982 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 5424081  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5424082 tggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 5424181  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424182 cttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 5424281  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5424282 aggaagcacagaaagttgatgt 5424303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 6602010 - 6601493
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6602010 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgctttaagacagttgagag 6601911  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6601910 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 6601811  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601810 gtttaatgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 6601711  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  6601710 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttg 6601611  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  6601610 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaacatcaaaga 6601511  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6601510 agcacagagagttgatgt 6601493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 532
Target Start/End: Original strand, 16411133 - 16411653
Alignment:
Q  13 agatgaacc-ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  16411133 agatgaaccgttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtaacttatgcttcaaggcagtt 16411232  T
Q  112 gagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16411233 gagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagccgtagtctttgtattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagattt 16411332  T
Q  212 gaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgact 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16411333 gaggtctttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatattaggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgact 16411432  T
Q  312 ttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaatt 411  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16411433 ttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagtt 16411532  T
Q  412 gcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatc 511  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16411533 acttgaacagttcagggatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatc 16411632  T
Q  512 aaggaagcacagaaagttgat 532  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16411633 aaggaagcacagaaagttgat 16411653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 524
Target Start/End: Original strand, 53383874 - 53384381
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383874 gaaccttttgtggtatatggtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 53383973  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53383974 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 53384073  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384074 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 53384173  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  53384174 ttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttg 53384273  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  53384274 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagatggatagtgaatttctgaaaagcatcaaaga 53384373  T
Q  517 agcacaga 524  Q
    ||||||||    
T  53384374 agcacaga 53384381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 532
Target Start/End: Original strand, 14875352 - 14875870
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14875352 gatgaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgagtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 14875451  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875452 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14875551  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14875552 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaatgaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 14875651  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  14875652 gatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagttagagagttcgagttgc 14875751  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14875752 ttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatttttgaaaagtattaa 14875851  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgat 532  Q
     || ||||| |||||||||    
T  14875852 agaggcacaaaaagttgat 14875870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12499525 - 12499004
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12499525 gatgaacctttcgtggtttactatgatgcttccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttga 12499426  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||| ||| || ||||||||| | || |||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12499425 gaattcatgagaagagttacccgacgcatgatttagaattggcgactgtggtctttgatttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 12499326  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||  | || ||||||||||||    
T  12499325 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgacttt 12499226  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  12499225 ggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgatttac 12499126  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12499125 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgagtggtcacctcaaagtgtgaaactgggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 12499026  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||||||| ||||||||    
T  12499025 agaggcacagaaatttgatgtc 12499004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 14579795 - 14580316
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14579795 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 14579894  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14579895 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14579994  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  14579995 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 14580094  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  14580095 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaatttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgc 14580194  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || || |||  |||| |||| || || || || || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  14580195 ttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagctaggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtattaa 14580294  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14580295 ggaagcacagaaagttgatgtc 14580316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 16805808 - 16806271
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16805808 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacaattgagaattcat 16805907  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16805908 gagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 16806007  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16806008 gtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactttgctttgaa 16806107  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  16806108 ttatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacag 16806207  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaaga 485  Q
    || || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||    
T  16806208 ttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaaga 16806271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16693441 - 16692920
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  16693441 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtctaagttggctttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgctactagacagttga 16693342  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || || |||||| | || || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16693341 gaattcatgagaagaattacccgacacatgatttagaattagcgactgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 16693242  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | || ||||||||||||    
T  16693241 ggtgtttattgatcataagagtttgaagtatctgtttgaccagaaggaattgaatatgagacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgacttt 16693142  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |    
T  16693141 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatggttagagagttcgagttac 16693042  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||  |||| ||    
T  16693041 ttgaacagttcagagacttgagtttagtttgcgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggagtgctaaagattgatagtgaattcatgaagggtattaa 16692942  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||| ||||||||||||||    
T  16692941 agaggcatagaaagttgatgtc 16692920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3687217 - 3686897
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3687217 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagag 3687118  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 3687018  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  3687017 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggt 3686918  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaa 337  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  3686917 ttgaattatcatccaggtaaa 3686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17491128 - 17490607
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  17491128 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 17491029  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17491028 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtagtctttgtattgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttg 17490929  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| || |||||||| ||    
T  17490928 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgattt 17490829  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |   | ||||| |||    
T  17490828 tgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagtagttcgagttg 17490729  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||  ||||  | || | ||||| ||  | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  17490728 cttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaaatgtcatatgaatgtgtgaagctaagaatgttgaagattgataatgaatttctgaagagtatta 17490629  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| || |||||||||||    
T  17490628 aagaagcgcaaaaagttgatgt 17490607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 149 - 535
Target Start/End: Original strand, 14125582 - 14125968
Alignment:
Q  149 gagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 248  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  14125582 gagttggtggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagtatttgt 14125681  T
Q  249 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14125682 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14125781  T
Q  349 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaa 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14125782 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaa 14125881  T
Q  449 tggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||||    
T  14125882 tggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttcttaagagtattaaagaggcacaaatagttgatgtc 14125968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 5109463 - 5109723
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5109463 agatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 5109562  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109563 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 5109662  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5109663 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatgag 5109723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15260907 - 15260387
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | || || ||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15260907 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagtttggcttaggtggtgtgcttatggaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacaattga 15260808  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || |  || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15260807 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgatttagttgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaa 15260708  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  15260707 agtgttcagcgaccacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 15260608  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||    
T  15260607 gagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgc 15260508  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15260507 ttgaacagtttagagatttgagtttagtttgcgagttgtcatctcaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttatgaaaagtattaa 15260408  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  15260407 agaagcacataaagtagatgt 15260387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 120 - 534
Target Start/End: Original strand, 16491140 - 16491554
Alignment:
Q  120 atgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtt 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16491140 atgagaagaattaacctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtt 16491239  T
Q  220 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttg 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16491240 tagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttg 16491339  T
Q  320 aattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaac 419  Q
    |  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  16491340 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaac 16491439  T
Q  420 agtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagc 519  Q
    |||| |||||| |||| || || || |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |     
T  16491440 agttcagagatttgagcttagtatgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagagga 16491539  T
Q  520 acagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||| ||||||    
T  16491540 acagaaagctgatgt 16491554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 173 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 15062836 - 15062474
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15062836 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15062737  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    | |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15062736 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagac 15062637  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| || |||||||||    
T  15062636 attgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttatgagtggtcacctcagagtgtgaaactg 15062537  T
Q  473 ggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || || | ||||||||||||||||    
T  15062536 ggaatgctgaagatcgatagtaaatttctcaagagtattaaagaggtacagaaagttgatgtc 15062474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15228937 - 15228416
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  15228937 agatgaacctttggttgtatactatgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttcgagacagttg 15228838  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  15228837 aggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttg 15228738  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  15228737 aggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 15228638  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||    
T  15228637 tagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagattttgagttg 15228538  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||| || ||||||||  ||||| | ||||| || | |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||  |||| ||||| |    
T  15228537 cttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaatagtatta 15228438  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  15228437 aagaagcacagaaggttgatgt 15228416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15234805 - 15234284
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  15234805 agatgaacctttggttgtatactatgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttcgagacagttg 15234706  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  15234705 aggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttg 15234606  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  15234605 aggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 15234506  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||    
T  15234505 tagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagattttgagttg 15234406  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||| || ||||||||  ||||| | ||||| || | |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||  |||| ||||| |    
T  15234405 cttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaatagtatta 15234306  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  15234305 aagaagcacagaaggttgatgt 15234284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31940187 - 31939775
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||      
T  31940187 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcatctagacagttgagga 31940088  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  31940087 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagt 31939988  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||| || | ||||||||||||||||||    
T  31939987 atttagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggt 31939888  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| |    
T  31939887 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctag 31939788  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  31939787 aacagtttagaga 31939775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 10418890 - 10419408
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | || |    
T  10418890 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctagacaactaaggg 10418989  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  10418990 ttcatgaaaagaattatcctactcatgacctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 10419089  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||    
T  10419090 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggt 10419189  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  || ||||| |||||||    
T  10419190 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttg 10419289  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||| ||  ||||| | || || ||||  ||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  10419290 aacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagaga 10419389  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  10419390 agcacaacgagttgatgtc 10419408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 16755557 - 16755758
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755557 gaaccttttgtggtgtattgtgacgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 16755656  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16755657 ttaatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 16755756  T
Q  217 gt 218  Q
    ||    
T  16755757 gt 16755758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 16827048 - 16827566
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||       
T  16827048 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaaga 16827147  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16827148 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 16827247  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| ||| ||    
T  16827248 gtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagt 16827347  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || ||||| |    
T  16827348 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctag 16827447  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | || ||||||||  ||||| |  | || || | |||||||||  | ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  16827448 accattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagaga 16827547  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  16827548 agcacatcaagttgatgtc 16827566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 513
Target Start/End: Original strand, 13970965 - 13971461
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  13970965 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggttgtagcgtatgcttctaggcagctgagag 13971064  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13971065 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 13971164  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | |||||||||||||||||     
T  13971165 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttggg 13971264  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || |||||||    
T  13971265 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttg 13971364  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || || ||| |  |||||||| | || ||  ||||||||||  |||| ||||||||    
T  13971365 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaa 13971461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 463
Target Start/End: Original strand, 16379791 - 16380219
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| || ||| | ||||||||||    
T  16379791 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacataaaaagaattatc 16379890  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || || ||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16379891 ccactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagag 16379990  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||  |     
T  16379991 cttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagc 16380090  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16380091 aaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatga 16380190  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||    
T  16380191 gtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagc 16380219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 44778516 - 44778013
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || ||||| |||||||    
T  44778516 tattgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcatgaaaagaatt 44778417  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    |||| || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  44778416 atcccactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaa 44778317  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
    ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  44778316 gagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccg 44778217  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||| || || || |||||||||||||| |    
T  44778216 ggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagaca 44778117  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 531  Q
    |||||||||| || || | ||| ||||| ||| |  |  |||| ||||| |||||| | ||||| || ||||| ||||||  |||||| ||| |||| ||    
T  44778116 tgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcgcagcaagtgga 44778017  T
Q  532 tgtc 535  Q
    ||||    
T  44778016 tgtc 44778013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 31694030 - 31694443
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagga-ggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgaga 115  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  | |||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||| |||||||     
T  31694030 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttggggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcatctagatagttgagg 31694129  T
Q  116 gttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagg 215  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  31694130 attcatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtttttattttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaag 31694229  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttgg 315  Q
    | || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||| || | |||||||||||||||||    
T  31694230 tattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttgg 31694329  T
Q  316 tttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgctt 415  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||| | |||||| || |||||     
T  31694330 tttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgcta 31694429  T
Q  416 gaacagtttagaga 429  Q
    ||||||||||||||    
T  31694430 gaacagtttagaga 31694443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13943290 - 13942790
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||   ||| || ||||| ||||||||||    
T  13943290 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaaccgagggtgcatgaaaagaattatc 13943191  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || || ||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13943190 ccactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 13943091  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  13943090 cttgaaatacttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccggga 13942991  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13942990 aaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatga 13942891  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| || || | |||  ||||||||||  |  |||| ||||| |||||| | ||||| || ||||| ||||||  |||||||||  |||| |||||    
T  13942890 gtttggtatgtgagttgtcgtctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgt 13942791  T
Q  535 c 535  Q
    |    
T  13942790 c 13942790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 436
Target Start/End: Original strand, 16835370 - 16835774
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||| |||||||    
T  16835370 tattgtgatgcgtctaagttgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaaagaatt 16835469  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    |||| || || ||| | ||||| || || || || ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16835470 atcccactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaa 16835569  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||     
T  16835570 gagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcct 16835669  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  16835670 gataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactttgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagaca 16835769  T
Q  432 tgagt 436  Q
    |||||    
T  16835770 tgagt 16835774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41178788 - 41178288
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  41178788 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatc 41178689  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41178688 ccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 41178589  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  41178588 cttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccggga 41178489  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | |||||||||||||| ||||    
T  41178488 aaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 41178389  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||| ||  |  |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||  ||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  41178388 gtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgt 41178289  T
Q  535 c 535  Q
    |    
T  41178288 c 41178288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17187638 - 17187226
Alignment:
Q  37 tgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcct 136  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  17187638 tgatgcgtctaagctgggtttagtaggtgtttttatgcaagttggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagggtacatgagaagaattatcct 17187539  T
Q  137 acgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 236  Q
    ||  | ||| | ||||||||  | || || ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  17187538 acttacgatttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagct 17187439  T
Q  237 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaa 336  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  17187438 tgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaa 17187339  T
Q  337 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||    
T  17187338 agccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagt 17187239  T
Q  437 ttggtttgcgaat 449  Q
     ||||||| ||||    
T  17187238 ctggtttgtgaat 17187226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14087957 - 14087462
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  14087957 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 14087858  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14087857 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 14087758  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||     
T  14087757 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatctgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 14087658  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |  |||||||| |||||||    
T  14087657 ttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacattacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttg 14087558  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || || | |||  |||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  14087557 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 14087462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 462
Target Start/End: Original strand, 13319347 - 13319792
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || |||||  | |||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  13319347 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttctaagttcggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagag 13319446  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| || || || ||||| || || |||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||    
T  13319447 ttcatgaaaagaattatcgtacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatatggaggcactatctgtatggttctagatttgaagt 13319546  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  13319547 gttcagtgatcataaaagcttgaggtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggt 13319646  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| |    
T  13319647 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctag 13319746  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaag 462  Q
    ||||||||| |||  ||||  | ||||| |||| ||||||||||||    
T  13319747 aacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaag 13319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 333 - 534
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755958
Alignment:
Q  333 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatat 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatat 16755856  T
Q  433 gagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgat 532  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||    
T  16755857 gagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagcatcaaggaagcacagagagatgat 16755956  T
Q  533 gt 534  Q
    ||    
T  16755957 gt 16755958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 12359372 - 12359784
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  12359372 gaaccttttgatgtttactgtaatgtgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 12359471  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || || || |||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12359472 tccatgagaagaattatcctacacatgatttcgagttagctgcggtggtttttactttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagt 12359571  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  12359572 atttagtaatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggc 12359671  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | | |||| || ||| | |    
T  12359672 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttag 12359771  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  12359772 agcagtttagaga 12359784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 459
Target Start/End: Original strand, 11960048 - 11960456
Alignment:
Q  51 tgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttga 150  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11960048 tgggcttaggtggtgttctaatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgaggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctgga 11960147  T
Q  151 gttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttc 250  Q
    |||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  11960148 gttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtttgaaatatttgttt 11960247  T
Q  251 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttg 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |||| || ||||| ||||    
T  11960248 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttg 11960347  T
Q  351 cagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatg 450  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||| ||  ||||| | || || ||||     
T  11960348 ctgatgcattgaggaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaatt 11960447  T
Q  451 gtcacctca 459  Q
    |||||||||    
T  11960448 gtcacctca 11960456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14575025 - 14574729
Alignment:
Q  199 tggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgcta 298  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  14575025 tggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgtta 14574926  T
Q  299 aaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 14574826  T
Q  399 gagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
      ||||| || ||||| || |||||||||||  ||||| | |||||||| | ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14574825 atgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtga 14574729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12179621 - 12179231
Alignment:
Q  18 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| |   |||||||  |    
T  12179621 aaccttttgttgtttattctgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaagtagttgaggat 12179522  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||| || || || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||     
T  12179521 tcatgaaaagaattatcctacacatgatttgtagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaagta 12179422  T
Q  218 tttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtt 317  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  12179421 tttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtt 12179322  T
Q  318 tgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcga 408  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  12179321 tgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcga 12179231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 376 - 534
Target Start/End: Original strand, 26791614 - 26791772
Alignment:
Q  376 gcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggt 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26791614 gcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggt 26791713  T
Q  476 atgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26791714 atgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacaaaaagttgatgt 26791772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12887987 - 12887841
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12887987 agatgaaccttttgtggtgtattgtggtgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 12887888  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggc 159  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12887887 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggc 12887841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 16328505 - 16328917
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  16328505 gaaccgtttgttgtttattatgatgcatcgaagttgggcgtaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcggg 16328604  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16328605 ttcatgagaagaactatcctacacatgatctggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 16328704  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||     
T  16328705 gttcagtgataataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggc 16328804  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| | |||||| || ||| | |    
T  16328805 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttgg 16328904  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  16328905 aacagtttagaga 16328917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 18133191 - 18133579
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| |||||  |||| || |||||||| |||||||||||      
T  18133191 gaaccttttgtggtttactgtgatgcgtctaagttgggtttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggttgcgtatgcttctagacagttgagga 18133290  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  18133291 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagt 18133390  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  18133391 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggc 18133490  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaatt 405  Q
     ||||||| || || |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  18133491 atgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatt 18133579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28755602 - 28755183
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| ||| | |    
T  28755602 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcatatgcttctagacaattgcgtg 28755503  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  28755502 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 28755403  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  28755402 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggt 28755303  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  28755302 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 28755203  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  28755202 aacagttcagagatatgagt 28755183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 47125228 - 47124809
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||  |      
T  47125228 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgta 47125129  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  47125128 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 47125029  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  47125028 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 47124929  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  47124928 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 47124829  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  47124828 aacagttcagagatatgagt 47124809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 510
Target Start/End: Original strand, 15014609 - 15015105
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||   | || | ||||||||||| || || |||||||    
T  15014609 gatgagccatttgttgtatattgtgatgcatctaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaggataatgaagtagtagcttatgcatcgaggcagttga 15014708  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |  |||||  | || || ||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  15014709 ggattcatgaatgcaattatcctactcatgatcttgagttagctgcattggcttttgtaatcaaaatttggaggcattatctatatgtttctagatttga 15014808  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||     
T  15014809 agtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgactagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaagaattatgatttc 15014908  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
     | |||||||| || || ||||| |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||    
T  15014909 aggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagttgcatttgc 15015008  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||  ||| |  || || |||||| | || |||||||||||  | ||||||||| |||| |||||    
T  15015009 ttgaacagttcaaagacttgagtttagtttgtgaagtgtcgcagcagagtgtgaaattagggatgctgaagatcaacagtgaatttttgaatagtat 15015105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30139084 - 30138665
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  30139084 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 30138985  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  30138984 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 30138885  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  30138884 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 30138785  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  30138784 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 30138685  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  30138684 ttcgagacttgagtttggtt 30138665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30148635 - 30148216
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  30148635 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 30148536  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  30148535 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 30148436  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  30148435 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 30148336  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  30148335 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 30148236  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  30148235 ttcgagacttgagtttggtt 30148216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Original strand, 8273261 - 8273679
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  8273261 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 8273360  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  8273361 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 8273460  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  8273461 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 8273560  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  8273561 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 8273660  T
Q  423 ttagagatatgagtttggt 441  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  8273661 ttcgagatttgagtttggt 8273679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 182 - 459
Target Start/End: Original strand, 16337522 - 16337799
Alignment:
Q  182 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 281  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  16337522 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 16337621  T
Q  282 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 381  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16337622 gatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatat 16337721  T
Q  382 gtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    ||| ||| ||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||    
T  16337722 gtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctca 16337799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 13966206 - 13966625
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  13966206 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 13966305  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || ||| || | || ||||| ||||| || | |   |||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  13966306 agaagaattatccgactcataatttggaattggcagccgttgtgtatacattgacgatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 13966405  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  13966406 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgatttttagttgagt 13966505  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| ||||  |||    
T  13966506 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaattgattgagaagt 13966605  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  13966606 ttcgagatttgagtttggtt 13966625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 16741565 - 16741984
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || |  |||| ||| ||||    
T  16741565 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcgattgaaagtacatg 16741664  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  16741665 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 16741764  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  16741765 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 16741864  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| |||     
T  16741865 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagc 16741964  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  16741965 ttcgagacttgagtttggtt 16741984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18751221 - 18750806
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  18751221 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgctttaaggcagttgaaagtgcatg 18751122  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18751121 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagat-tggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgtttag 18751023  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| | ||||  || |||||||   | |||   |||| |    
T  18751022 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttcaattttcagttgagt 18750923  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  18750922 tatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 18750823  T
Q  423 ttagagatatgagtttg 439  Q
    || ||||  ||||||||    
T  18750822 ttcgagacttgagtttg 18750806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 6151715 - 6152134
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  6151715 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatg 6151814  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  ||||||||  |||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  6151815 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagattcggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 6151914  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  6151915 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 6152014  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||  ||||| |||| ||||    
T  6152015 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttgaaattgattgagcagt 6152114  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||  |||  |||||||||||    
T  6152115 ttctagacttgagtttggtt 6152134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15611381 - 15610962
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||| |  || |  | |||||||||||||| || ||||||| | | ||||    
T  15611381 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcaaaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaaatgcatg 15611282  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| |     
T  15611281 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaa 15611182  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |    
T  15611181 tgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagt 15611082  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  15611081 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 15610982  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  15610981 ttcgagacttgagtttggtt 15610962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17194372 - 17193953
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  17194372 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 17194273  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  17194272 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcag 17194173  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||| ||| ||| |||   |||| |    
T  17194172 tgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaagaattttgattttcagttgagt 17194073  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| || |    
T  17194072 tatcatcccgggaaggctattgttgttgatgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcaat 17193973  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  17193972 ttcgagatttgagtttggtt 17193953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25767527 - 25767177
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||  || |||||||  || ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| ||||||||||    
T  25767527 gcttatgctttgaggcagttgaaggtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacatt 25767428  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||||| | ||    
T  25767427 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagatggtttga 25767328  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || |||||||  || |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  25767327 atatcttaaggatttcgattttcaattgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 25767228  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  25767227 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 25767177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16258350 - 16258003
Alignment:
Q  95 tatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattact 194  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||| | || ||||  ||||| || | |   |||||||| |||||||||||      
T  16258350 tatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaacaattatccgactcatgatttggaattggtagccgttgtgtatacattgaagatctggagacattatc 16258251  T
Q  195 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagtt 294  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |  | |     
T  16258250 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttgaaata 16258151  T
Q  295 gctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 394  Q
     || ||||||| ||| |||   |||| |||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16258150 tcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccagaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 16258051  T
Q  395 gtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || | ||| || |||||| |||| || ||| ||||  |||||||||||    
T  16258050 gttaaagagttggaattgattgagcaatttcgagacttgagtttggtt 16258003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12793350 - 12793000
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  ||||| || ||||| || |    
T  12793350 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaaaatttggaggcact 12793251  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||| | |||||| | ||    
T  12793250 atctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatacgaggcagaggagatggttgga 12793151  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| |  || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||    
T  12793150 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagtaagattttgcatatgtctgctttg 12793051  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  12793050 atggttaaagagttggaattgattgagctgtttcgagatttgagtttggtt 12793000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 371 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16372332 - 16372168
Alignment:
Q  371 acattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaac 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || |||| ||    
T  16372332 acattgcatatgtccactatgttggttatagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcagagtgtgacac 16372233  T
Q  471 tgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  16372232 tgggaatgctgaagattgatagtgaattgctaaaaagtattaaagaggcacataaagttgatgtc 16372168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 55514651 - 55514935
Alignment:
Q  94 ttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattac 193  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||  ||||| | || |||||||| || || | |||||||||||| ||||| |||||     
T  55514651 ttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgacttatgatttggaattggcggctgttgtgtatgtgttgaagatttggaggcattat 55514750  T
Q  194 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagt 293  Q
     |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||    
T  55514751 ctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtatatgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagt 55514850  T
Q  294 tgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 378  Q
      || |||||||   |||||   |||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  55514851 atcttaaggatttcaactttcagttgagttatcatccaagaaaggctaacgttgttgctgataccttgagtaggaagactttgca 55514935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 268 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 17493663 - 17493396
Alignment:
Q  268 tatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagg 367  Q
    |||||||||| |||||||| || || || | ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  17493663 tatgaggcagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggagg 17493564  T
Q  368 aagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtga 467  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||   || || |||| | ||||||| || ||      
T  17493563 aagacgttgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtac 17493464  T
Q  468 aactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |  |||| |||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||   ||||||||| |||| ||||||    
T  17493463 atttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 17493396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10384955 - 10384730
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| ||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  10384955 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgggcctaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 10384856  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  10384855 ttcatgagaagaattatcctacacatgacttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 10384756  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagt 242  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||    
T  10384755 gttcagtgatcataaaagtttgaagt 10384730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 6711344 - 6711692
Alignment:
Q  93 cttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatta 192  Q
    ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||||||| | || | |||||||||||| ||||| |||||    
T  6711344 cttatgcgtcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccaactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgtgttgaagatttggagccatta 6711443  T
Q  193 cttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagag 292  Q
      |||||||||| |  |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||  || |||| | |||    
T  6711444 tctgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagattgaagtacttgtttgaccagaaagagttgaatatgagg-agacaatatggttggag 6711542  T
Q  293 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 392  Q
    |  || ||||||| |||||||   |||| ||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| |||    
T  6711543 tatcttaaggattttgactttcagttgagttaccatcccgggaaggcgaatgtggtggcagatgctttgagtaggatgccgttgcatatgtctgctttga 6711642  T
Q  393 tggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |||| | ||| || || ||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  6711643 tggttaaagagttggagttgattgagcagtttcgagatttgagttcggtt 6711692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 335 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 4679404 - 4679204
Alignment:
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | |||||||||||||| ||||    
T  4679404 aaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 4679305  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||| ||  |  |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||  ||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  4679304 gtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgt 4679205  T
Q  535 c 535  Q
    |    
T  4679204 c 4679204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15096140 - 15096030
Alignment:
Q  167 tttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 266  Q
    |||||||||||||| || || |||||  ||| |||||| |  |||||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15096140 tttgtgttgaagatctgaaggcattatatgtttggttctatgtttgaattgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttga 15096041  T
Q  267 atatgaggcag 277  Q
    |||||||||||    
T  15096040 atatgaggcag 15096030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 534
Target Start/End: Original strand, 11302947 - 11303135
Alignment:
Q  346 tgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgc 445  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||| ||  |||| || |||||||||||| ||||| | || ||     
T  11302947 tgttacagatgcgttgagcagcaagacattgcatatctctgctttgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgt 11303046  T
Q  446 gaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||| | ||||||| || ||  |  |||| |||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  11303047 gaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtagatgt 11303135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8627 - 8108
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 8528  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8527 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 8428  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||    
T  8427 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 8328  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8327 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgct 8228  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8227 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaag 8128  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  8127 gaagcacagagagttgatgt 8108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 20017319 - 20017840
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20017319 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 20017418  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017419 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 20017518  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  20017519 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 20017618  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20017619 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattg 20017718  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017719 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 20017818  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  20017819 aggaagcacaggaagttgatgt 20017840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 17673079 - 17673600
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17673079 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 17673178  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673179 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 17673278  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  17673279 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 17673378  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  17673379 tggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaatta 17673478  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673479 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttccgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 17673578  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17673579 aggaagcacagaaagttgatgt 17673600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19114414 - 19113894
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19114414 gatgaactttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 19114315  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114314 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 19114215  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  19114214 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 19114115  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  19114114 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattac 19114015  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114014 ttgaacagttccgagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 19113915  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19113914 ggaagcacagaaagttgatgt 19113894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18858302 - 18857780
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18858302 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaaattgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 18858203  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858202 acaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 18858103  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  18858102 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 18858003  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18858002 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 18857903  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18857902 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttatgaaaagtatta 18857803  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  18857802 aggaagcacagagagttgatgtc 18857780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 22128015 - 22128536
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22128015 agatgaaccttttgtgtaatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttg 22128114  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128115 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggc-gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22128213  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  22128214 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 22128313  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22128314 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 22128413  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128414 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 22128513  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  22128514 aggaagcacagagagttgatgtc 22128536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 22119231 - 22119752
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22119231 agatgaaccttttgtgtaatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttg 22119330  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119331 agaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggc-gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22119429  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  22119430 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 22119529  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22119530 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattg 22119629  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119630 cttgaacagtttaaagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 22119729  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  22119730 aggaagcgcagagagttgatgtc 22119752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 19483124 - 19483641
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19483124 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacagttgagag 19483223  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19483224 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 19483323  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19483324 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttggg 19483423  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  19483424 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttg 19483523  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  19483524 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgagaagcatcaaaga 19483623  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19483624 agcacagaaagttgatgt 19483641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 21165598 - 21166116
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21165598 gaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatcgtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaa 21165697  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21165698 ttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggt 21165797  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21165798 gtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgatcaaaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggt 21165897  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21165898 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttg 21165997  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21165998 aacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaaga 21166097  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  21166098 agcacataaagttgatgtc 21166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 30312209 - 30312722
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30312209 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagatgggtttaggcggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 30312308  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30312309 gaggagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 30312408  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30312409 gcgatcacaagagcttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaa 30312508  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  30312509 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacag 30312608  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  30312609 ttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 30312708  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||||    
T  30312709 ataaagttgatgtc 30312722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22041579 - 22041062
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgc----ttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22041579 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaat 22041480  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22041479 tcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtg 22041380  T
Q  218 tttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtt 317  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  22041379 tttagcgatcacaagagttggaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtt 22041280  T
Q  318 tgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttga 417  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||    
T  22041279 tgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttga 22041180  T
Q  418 acagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaa 517  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  22041179 acagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatcctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagag 22041080  T
Q  518 gcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22041079 gcacagaaagttgatgtc 22041062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19979691 - 19979170
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19979691 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 19979592  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| |  |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19979591 gaattcacgagaagaattaccccacacatgatttatagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 19979492  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  19979491 ggtgtttagtgatcataaaagcttgaaatatatgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgacttt 19979392  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  19979391 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagtttgagttgc 19979292  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19979291 ttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatttttgaagagtatcaa 19979192  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  19979191 agaagcacagaaagttgatgtc 19979170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 15535099 - 15534586
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  15535099 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagatagttgagaattcat 15535000  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15534999 gagaagaattacccgacgcacgatttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgttta 15534900  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15534899 gcgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaa 15534800  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  15534799 ttatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaa 15534700  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||    
T  15534699 tttagagatttgagtttggtttgcgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattatagaggcac 15534600  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| ||||||    
T  15534599 agaaagtagatgtc 15534586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 32601860 - 32601347
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32601860 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtctaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcat 32601761  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32601760 gagaaaaattacccggcgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgttta 32601661  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  32601660 gcgatcacaagagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaa 32601561  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| || ||||||||     
T  32601560 tcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttatagagttcgagttacttgaacaa 32601461  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  32601460 ttcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcac 32601361  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||||    
T  32601360 aaaaagttgatgtc 32601347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 22132106 - 22132619
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  22132106 ttttgtggtgtattgtgatgcgcccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttgagaattcat 22132205  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22132206 gagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttgaggtgttta 22132305  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22132306 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaa 22132405  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || || || |||||||      
T  22132406 ttatcatccaggtaaagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttcatggttagagagtttgagttacttgaacca 22132505  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  22132506 ttcagagatttgagtttagtctgtgaatggtcaccttagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 22132605  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||    
T  22132606 agaaagttgatgtc 22132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23651766 - 23651244
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23651766 agatgaaccttttatggtatattgtgatgcgttcaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 23651667  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23651666 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 23651567  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||    
T  23651566 aggtatttactgatcacaagagtctgaagtatctgttcgatctgaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgattt 23651467  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  23651466 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgagttg 23651367  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
     | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23651366 ttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgctgaagcttgatagtgaatttctgaaaaatatta 23651267  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  23651266 aagaagcacagaaagttgatgtc 23651244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 21392921 - 21393442
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21392921 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 21393020  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| || |||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21393021 agaatttatgagaagaattatcccacacacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 21393120  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||    
T  21393121 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattt 21393220  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  21393221 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 21393320  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  21393321 cttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagtatta 21393420  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||| ||||||    
T  21393421 aagaggcacagaaagctgatgt 21393442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 21787415 - 21787936
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21787415 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 21787514  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| || |||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21787515 agaatttatgagaagaattatcccacacacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 21787614  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||    
T  21787615 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattt 21787714  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  21787715 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 21787814  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  21787815 cttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagtatta 21787914  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||| ||||||    
T  21787915 aagaggcacagaaagctgatgt 21787936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21044170 - 21043649
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  21044170 agatgaaccttttgtggtatattgcaatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagtcg 21044071  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21044070 agaattcatgagaagaattaccttacgcacgatttagagttggctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttg 21043971  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  21043970 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattt 21043871  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  21043870 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtgaaagagttcgagttg 21043771  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| || |||| ||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  21043770 cttgaacagttcagagatctgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgatgaagattgataatgaatttctgaagagtatta 21043671  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  21043670 aagaggcacagaaagttgatgt 21043649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 21252669 - 21252155
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||| |||||||||    
T  21252669 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctgggtttgggtggtgtgcttatgcaagatagaaaagtagtagtttatgcttcgagacagttg 21252570  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21252569 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcg 21252470  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  21252469 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgattt 21252370  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  21252369 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttg 21252270  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| || |||| || || || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  21252269 cttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtaaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttcagaaaagtatta 21252170  T
Q  513 aggaagcacagaaag 527  Q
    | || ||||||||||    
T  21252169 aagaggcacagaaag 21252155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 21920792 - 21921313
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21920792 agatgaaccttttgtggtatattatgatgcatccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 21920891  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21920892 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttg 21920991  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||    
T  21920992 aggtgtttagtgatcataagattttgaagtatctgctcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgattt 21921091  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  || ||| | |||    
T  21921092 tgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaaggagttcaagttg 21921191  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || | |||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |    
T  21921192 cttgaatagttcagagatttgactttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctagttatgctgaagattgataacgaatttctaaagagtatta 21921291  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  21921292 aagaggcacagaaagttgatgt 21921313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 20395189 - 20395709
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagt 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||| | |||||   ||||||| || || ||||    
T  20395189 gatgaaccttttgtcgtgtattgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtggttatg-aagaa--taacaaggtagtagcttatgcatctaggcagt 20395285  T
Q  111 tgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatt 210  Q
    ||||| |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20395286 tgagaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctacagtagtctttgtgcttgagatttggagacgttatttgtatggttctagatt 20395385  T
Q  211 tgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgac 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||     
T  20395386 tgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgat 20395485  T
Q  311 tttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| | ||||||||| | ||| || ||      
T  20395486 tttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatggttaaagagttggagc 20395585  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20395586 tgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatttttgaatagtat 20395685  T
Q  511 caaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  20395686 taaggaagcacagaaagtggatgt 20395709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20389824 - 20389411
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  20389824 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttggagacagttg 20389725  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  20389724 agaattcatgagcagaattatcccacgcacgatttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttg 20389625  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||| | ||||| ||||| ||    
T  20389624 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgattt 20389525  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||  | |||    
T  20389524 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagttttatttg 20389425  T
Q  413 cttgaacagtttag 426  Q
    ||||||||||||||    
T  20389424 cttgaacagtttag 20389411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 20008977 - 20009498
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  20008977 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttg 20009076  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||    
T  20009077 aggattcatgaaaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttg 20009176  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| | ||| ||    
T  20009177 aagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattt 20009276  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || |||    
T  20009277 tggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttg 20009375  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||||    
T  20009376 cttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaacaatatca 20009475  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
      ||||| |||||| ||||||||    
T  20009476 tagaagcgcagaaaattgatgtc 20009498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 22376510 - 22377031
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || || ||  | ||||||||||| || ||| ||||||    
T  22376510 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgtaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagatagttga 22376609  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  22376610 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttaaacggttctagatttga 22376709  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
     ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||    
T  22376710 agtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattt 22376809  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||    
T  22376810 tgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttg 22376909  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  22376910 cttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatca 22377009  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| |||||| |||||||    
T  22377010 aagaagcgcagaaaattgatgt 22377031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 22382685 - 22383206
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || || ||  | ||||||||||| || ||| ||||||    
T  22382685 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgtaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagatagttga 22382784  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  22382785 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttaaacggttctagatttga 22382884  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
     ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||    
T  22382885 agtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattt 22382984  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||    
T  22382985 tgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttg 22383084  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  22383085 cttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatca 22383184  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| |||||| |||||||    
T  22383185 aagaagcgcagaaaattgatgt 22383206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 22247490 - 22247994
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |  ||  | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  22247490 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttttgcaggatgacaaggtagtagcttatgcattgagacagttga 22247589  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22247590 ggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtgctctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttga 22247689  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  22247690 agtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgatttt 22247789  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                || ||||    
T  22247790 gggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctat----------------gagttgc 22247873  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| ||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  22247874 ttgaacagtttagagatttgagtttagtcggcaaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 22247973  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||  |||||| |||||||    
T  22247974 agaagtgcagaaaattgatgt 22247994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 16407199 - 16407448
Alignment:
Q  39 atgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  16407199 atgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattacccgac 16407298  T
Q  139 gcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 238  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16407299 gcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagctta 16407398  T
Q  239 aagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 288  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16407399 aagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggct 16407448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 23886745 - 23886252
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||  | || |||||||| || ||||| ||||||     
T  23886745 gaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatgacaaggtagtggcttatgcatcgagacaattgagaa 23886646  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || ||  | || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  23886645 ttcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctacagtggtctttgtgctcaagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagt 23886546  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||  ||||||| || |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||| | || |||||||| |||||     
T  23886545 gttcggtgatcataaaagtcagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttggg 23886446  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||    
T  23886445 ttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatgatcaaagagttggagctgcttg 23886346  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23886345 aacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 535
Target Start/End: Original strand, 20984637 - 20985125
Alignment:
Q  47 aagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatc 146  Q
    |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20984637 aagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatt 20984736  T
Q  147 ttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 246  Q
    | |||||||| || || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |    
T  20984737 tggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatatct 20984836  T
Q  247 gttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgtt 346  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  20984837 gtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtt 20984936  T
Q  347 gttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcg 446  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||||  | |||||||||||  ||||| | ||||| |    
T  20984937 gttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtg 20985036  T
Q  447 aatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | | ||||||||| || ||| |  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20985037 agttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagaaagttgatgtc 20985125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23656633 - 23656170
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  23656633 tattgtgatgcgtccaagttaggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaatt 23656534  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23656533 atcctacacatgatttggagtttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtattcagtgatcacaa 23656434  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  23656433 aagcttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccg 23656334  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  23656333 ggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagact 23656234  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    ||||| | || || || | ||||||||| ||  |  |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  23656233 tgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtga 23656170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22372656 - 22372240
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||  || ||||||    
T  22372656 agatgaaccttttgttgtttattctgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttataggcagttg 22372557  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22372556 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 22372457  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||| | || || || ||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||| ||    
T  22372456 aagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatctatttgaccaaaaataattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattt 22372357  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | |||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || |||    
T  22372356 tagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttg 22372257  T
Q  413 cttgaacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||||||    
T  22372256 cttgaacagtttagaga 22372240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22052569 - 22052106
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  22052569 tattatgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaatt 22052470  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || || |||||||     
T  22052469 atcctacacatgatttggagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcacag 22052370  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
    |||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||     
T  22052369 gagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcct 22052270  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  22052269 ggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagaca 22052170  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    ||||| |||| || || | ||| ||||||||| |  |  |||| |||||||||||| |||||||    
T  22052169 tgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcatatagttgggcatgctgaagattaatagtga 22052106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 29302486 - 29302928
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| | ||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  29302486 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtgatgttctgatgcaagatggtaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 29302585  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  29302586 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggaattggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagattcgaggt 29302685  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  29302686 gttcagtgatcacaagagtctaaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 29302785  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||| | |    
T  29302786 ttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttgg 29302885  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||||||  ||||| | || || |||| |||||||||    
T  29302886 aacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctca 29302928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21842084 - 21841620
Alignment:
Q  71 atgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttg 170  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||    
T  21842084 atgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcggttgaggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttg 21841985  T
Q  171 tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 270  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  21841984 ttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatat 21841885  T
Q  271 gaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 370  Q
    ||||||  |||||||||| ||| || | ||||||||||| ||  |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21841884 gaggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaag 21841785  T
Q  371 acattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaac 470  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||  | ||| | ||||| || | ||||||||| || ||  |      
T  21841784 acgttaaacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagt 21841685  T
Q  471 tgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  21841684 tgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 463
Target Start/End: Original strand, 31569920 - 31570348
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  31569920 tgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatc 31570019  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    | || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31570020 ccactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagag 31570119  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  31570120 cttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccggga 31570219  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  31570220 aaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacacttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatga 31570319  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||    
T  31570320 gtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagc 31570348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 16270284 - 16270696
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  16270284 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaagatggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 16270383  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16270384 tttatgagaagaattatcctacacatgatttagaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggt 16270483  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  16270484 gttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggc 16270583  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||| ||| | |    
T  16270584 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttag 16270683  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  16270684 aacagtttagaga 16270696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 21324329 - 21324740
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||||||      
T  21324329 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcttctagacagttgagga 21324428  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  21324429 tacatgaaaataattatcctatgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 21324528  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||    
T  21324529 atttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggt 21324628  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| |    
T  21324629 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatgtgtctgct-tgatggtgaaagaatttgatttgctag 21324727  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  21324728 agcagtttagaga 21324740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6605361 - 6604960
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    |||||||| || ||| |||| ||| | ||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  6605361 tgtgatgcatctaagctgggcttatgtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatc 6605262  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  6605261 ctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaag 6605162  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||    
T  6605161 tttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggt 6605062  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||    
T  6605061 aaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatga 6604962  T
Q  435 gt 436  Q
    ||    
T  6604961 gt 6604960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 384
Target Start/End: Original strand, 20974734 - 20975083
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  20974734 tgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagaattcatgaaaagaattatc 20974833  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    ||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  20974834 ctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagag 20974933  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
    | | || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||| || || |||||||||||||| || || |||    
T  20974934 tctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggt 20975033  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 384  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20975034 aaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtc 20975083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 511
Target Start/End: Original strand, 31415531 - 31416028
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||  || || |||||      
T  31415531 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagacggtaaggtggtagcttatgcttataggcaattgagga 31415630  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  31415631 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctgaagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 31415730  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||  |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  || | ||||||||||| |||||     
T  31415731 gtccagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggc 31415830  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt---ccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||   | ||| ||||||| |  ||||| |||||||    
T  31415831 ttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgc 31415930  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatc 511  Q
    | ||||||||||| ||  ||||| | ||  | || | | ||||||| || ||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  31415931 tagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagttggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatc 31416028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 440
Target Start/End: Original strand, 16876161 - 16876578
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  16876161 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 16876260  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| | ||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  16876261 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttagaggcattatctgtatggttctaaatttgaggtgttcag 16876360  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  16876361 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 16876460  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  16876461 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 16876560  T
Q  423 ttagagatatgagtttgg 440  Q
    || ||||| |||||||||    
T  16876561 ttcgagatttgagtttgg 16876578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14566848 - 14566444
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  14566848 tattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgtcctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttcatgagaagaatt 14566749  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14566748 atcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaggtgttcagtgatcataa 14566649  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || ||     
T  14566648 aagtttgaagtatttatttgaacagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcct 14566549  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |  || || |||||| | |||||||| ||||| |    
T  14566548 ggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagaca 14566449  T
Q  432 tgagt 436  Q
    |||||    
T  14566448 tgagt 14566444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 20651468 - 20651818
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || || |||| ||| || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  20651468 gcttatgcttcaagacagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattagcggtcgttgtgtctgcattgaagatttggaggcatt 20651567  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    || |||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  20651568 acctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 20651667  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||| | |  |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |     
T  20651668 atatcttaaggattttgattttcagttgagttataatctcgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgcttta 20651767  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  20651768 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 20651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19861160 - 19860900
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  19861160 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttg 19861061  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| || |  || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19861060 aggattcatgaaatgaattatcctacgcatgatttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttg 19860961  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 273  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  19860960 aagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgag 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22435949 - 22435599
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||| || |||||| | || ||||||||| | || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  22435949 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacgagaggaattatccgactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 22435850  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  ||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  22435849 atatgtatagttctaactttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 22435750  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || || |||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| ||    
T  22435749 atatcttaaagattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtctgctttg 22435650  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  22435649 atggttaaagagttggaattgattgagccgtttcgagatttgagtttggtt 22435599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12306302 - 12306037
Alignment:
Q  194 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagt 293  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||    
T  12306302 ttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagt 12306203  T
Q  294 tgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 393  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| ||| | ||    
T  12306202 tactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgcatatgtctgctttaat 12306103  T
Q  394 ggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    ||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||| | || || |||| |||||||||    
T  12306102 ggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctca 12306037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19852880 - 19852614
Alignment:
Q  269 atgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagga 368  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19852880 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19852781  T
Q  369 agacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaa 468  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||  |    
T  19852780 agacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtaca 19852681  T
Q  469 actgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  19852680 attgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagaaaattgatgtc 19852614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27356257 - 27355924
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  || |||| |||||||| || || ||| | |    
T  27356257 gaaccgtttgttgtgtactgcgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtgttagcatatgcttctaggcaattgcgtg 27356158  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  27356157 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggt 27356058  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  27356057 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactaaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 27355958  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttg 350  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  27355957 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 21849403 - 21849822
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  21849403 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 21849502  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | |   || ||||| ||||| |||||  | ||||||||    ||||| ||||| ||    
T  21849503 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacattaaagatttggaggcattatctttatggttcttagtttgaagtgttcag 21849602  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||  || ||||| |  || |||   |||| |    
T  21849603 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggttggagtatcttaaggacttcgattttcagttgagt 21849702  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||| | ||| || |||||| |||| || |    
T  21849703 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgtctgatttgatggttaaagagttggaattgattgagcaat 21849802  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  21849803 ttcgagacttgagtttggtt 21849822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19858916 - 19858650
Alignment:
Q  269 atgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagga 368  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19858916 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19858817  T
Q  369 agacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaa 468  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| ||||| |||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||  |    
T  19858816 agacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtaca 19858717  T
Q  469 actgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  19858716 attgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagaaaattgatgtc 19858650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 21195638 - 21195987
Alignment:
Q  93 cttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatta 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| |||||    
T  21195638 cttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatta 21195737  T
Q  193 cttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagag 292  Q
      |||||||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| | ||     
T  21195738 tctgtatggttctaaatttgaagttttcagtgaccataagagtttgaagtacttatttgatcagaaaaagttgaatatgaggcaaagaagatgggtggaa 21195837  T
Q  293 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 392  Q
    |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| | |    
T  21195838 tatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtttgctttta 21195937  T
Q  393 tggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  21195938 tggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 21195987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 535
Target Start/End: Original strand, 16407478 - 16407623
Alignment:
Q  390 tgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattga 489  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  16407478 tgatggttagagagttcgagttaattgagcagtttagagatatgagcttggtttgtgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattaa 16407577  T
Q  490 tagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  16407578 tagtgaatttctgaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgtc 16407623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 22422949 - 22423076
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  22422949 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 22423048  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgca 141  Q
    || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  22423049 gaattcatgagcggaattaccctacgca 22423076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Original strand, 23156106 - 23156359
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23156106 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaattgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 23156205  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    |||||||||||||  | |||||| | || ||||||||  | || | ||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  23156206 agaagaattatccggctcatgatttggaattggcggcaattgtgtatgcattgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcag 23156305  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 276  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  23156306 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggca 23156359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19869314 - 19869047
Alignment:
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||| | ||||| ||  | ||||| |||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19869314 ttcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcatctgtagtgtttgttcttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggt 19869215  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||      
T  19869214 gtttagcgaccataagagcttgaaatacttgtttgatcaaaatgagttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaa 19869115  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 384  Q
     ||| |||||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  19869114 ctgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcacatgtc 19869047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23901831 - 23901544
Alignment:
Q  94 ttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattac 193  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||| |||| || || | ||  |||||||| ||||| |||||     
T  23901831 ttattcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattgacggcggttgtgtatgcattgaagatttggaggcattat 23901732  T
Q  194 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagt 293  Q
     |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||||| |||| |    
T  23901731 ctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagatggttagaat 23901632  T
Q  294 tgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 381  Q
      || ||||| |  ||||||   |||| |||||| || || || |||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  23901631 atcttaaggacttcgactttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgacgacgccttgagtaagaagactttgcatat 23901544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22316837 - 22316652
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||| || | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  22316837 gcttatgcgtcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccaactcattatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 22316738  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 277  Q
    |  ||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22316737 atctgtatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcag 22316652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 403
Target Start/End: Original strand, 22623268 - 22623482
Alignment:
Q  182 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 281  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || ||| |||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||         
T  22623268 tggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgattataaaagtatgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggcaa---- 22623363  T
Q  282 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 381  Q
       |||||  |||| ||||||||||||| |   | || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  22623364 ---ggctaatgttgttaaaggattatgattacaggttaaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatat 22623460  T
Q  382 gtccgctatgatggtcagagaa 403  Q
    ||| |||||||| || ||||||    
T  22623461 gtctgctatgatagttagagaa 22623482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267540
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| | | ||    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||| |||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagatttgagt 1267540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 442
Target Start/End: Original strand, 23156393 - 23156497
Alignment:
Q  338 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||| | |||| |  ||||| |||| |||||| ||||  ||||||    
T  23156393 gctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagactttgcatatgtctactttgatggttaaagaactgaaattgattgagcagttttgagacttgagtt 23156492  T
Q  438 tggtt 442  Q
    |||||    
T  23156493 tggtt 23156497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680413
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    | ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagt 6680413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22988518 - 22988400
Alignment:
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagg 515  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||| || || ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  22988518 gaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcatctcagagtgtaaagttaggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtattaaag 22988419  T
Q  516 aagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  22988418 aagcgcataaaattgatgt 22988400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 436
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803152
Alignment:
Q  348 ttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagt 803152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 2873562 - 2874082
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2873562 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 2873661  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873662 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 2873761  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  2873762 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 2873861  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2873862 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgc 2873961  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2873962 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtttctgaaaaatatcaa 2874061  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2874062 ggaagcacagaaagttgatgt 2874082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 29590679 - 29591199
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29590679 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 29590778  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29590779 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttga 29590878  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  29590879 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 29590978  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29590979 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgc 29591078  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29591079 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaa 29591178  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29591179 ggaagcacagaaagttgatgt 29591199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 28261959 - 28262476
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261959 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttgggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 28262058  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28262059 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 28262158  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262159 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 28262258  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  28262259 ttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttg 28262358  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28262359 aacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaaga 28262458  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28262459 agcacagaaagttgatgt 28262476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 28340708 - 28341225
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340708 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttgggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 28340807  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28340808 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 28340907  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340908 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 28341007  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  28341008 ttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttg 28341107  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28341108 aacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaaga 28341207  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28341208 agcacagaaagttgatgt 28341225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25114075 - 25113554
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25114075 agatgaaccttttgtggtgtattgcgatgcgcccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 25113976  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25113975 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttagcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 25113876  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  25113875 aggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactt 25113776  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  25113775 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagtta 25113676  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25113675 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtaaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgagaagtatca 25113576  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  25113575 aggaagcacagaaagtcgatgt 25113554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27188955 - 27188438
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27188955 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagag 27188856  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27188855 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 27188756  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188755 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 27188656  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||    
T  27188655 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttg 27188556  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27188555 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaaga 27188456  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||| | |||||||||    
T  27188455 agcacaaagagttgatgt 27188438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 27260285 - 27260802
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27260285 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagag 27260384  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27260385 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 27260484  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260485 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 27260584  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||    
T  27260585 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttg 27260684  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27260685 aacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaaga 27260784  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||| | |||||||||    
T  27260785 agcacaaagagttgatgt 27260802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 93 - 534
Target Start/End: Original strand, 24312006 - 24312447
Alignment:
Q  93 cttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24312006 cttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 24312105  T
Q  193 cttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagag 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  24312106 cttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaa 24312205  T
Q  293 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 392  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24312206 ttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatga 24312305  T
Q  393 tggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatag 492  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24312306 ttgttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatag 24312405  T
Q  493 tgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24312406 tgaatttttgaaaagcatcaaggaagcacagaaagttgatgt 24312447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19866209 - 19865688
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19866209 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttga 19866110  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19866109 gaattcatgagaagaattatcccacgcacgattttgagttggcggctatggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttca 19866010  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | || ||||||||||||    
T  19866009 ggtgtttagtgatcacaagagcctaaaatatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgacttt 19865910  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||  |||    
T  19865909 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagttcgagctgc 19865810  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19865809 ttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgactggtcatctcaaagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaa 19865710  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19865709 ggaagcacagaaagttgatgtc 19865688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 5837981 - 5838499
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||      
T  5837981 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcttcgaggcagttgagga 5838080  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5838081 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatttagagttggccgcggtagttttcgtgttgaagatttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagt 5838180  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |      
T  5838181 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaagaattgaatatgagacagagaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaa 5838280  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5838281 ttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttg 5838380  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5838381 agcagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgaatagtatcaagga 5838480  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5838481 agcacagaaagttgatgtc 5838499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22443789 - 22443268
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22443789 gatgaacctttcgtggtatactgtgatgcatccatgttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttga 22443690  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22443689 ggattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22443590  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  22443589 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgacttt 22443490  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22443489 ggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagttagagagttcgagttgc 22443390  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22443389 ttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaa 22443290  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  22443289 agaagcacagatagttgatgtc 22443268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 137 - 535
Target Start/End: Original strand, 1541966 - 1542364
Alignment:
Q  137 acgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541966 acgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 1542065  T
Q  237 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1542066 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaa 1542165  T
Q  337 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1542166 agctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagt 1542265  T
Q  437 ttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542266 ttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 1542364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22435391 - 22434870
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22435391 gatgaacctttcgtggtatactgtgatgcatccatgttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttga 22435292  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435291 ggattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22435192  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  22435191 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgacttt 22435092  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22435091 ggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagttagagagttcgagttgc 22434992  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22434991 ttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaa 22434892  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  22434891 agaagcacagagagttgatgtc 22434870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 535
Target Start/End: Original strand, 27564596 - 27565101
Alignment:
Q  20 ccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttc 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||         
T  27564596 ccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagaaagttgag----- 27564690  T
Q  120 atgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtt 219  Q
         |||||||| || ||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27564691 -----aagaattacccgacgcacgatttagagttggcagttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtt 27564785  T
Q  220 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttg 319  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  27564786 tagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttg 27564885  T
Q  320 aattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaac 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  27564886 aattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagaaagttcgaattacttgaac 27564985  T
Q  420 agtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagc 519  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||    
T  27564986 agtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagggtattaaagaggc 27565085  T
Q  520 acagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||    
T  27565086 acagaaagttgatgtc 27565101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 16962207 - 16962725
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16962207 gaaccttttgtggtatattgggatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgattacgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaa 16962306  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||  | ||||  ||| | ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16962307 ttcatgagaagaattacgcgacgctcgatttagagttagctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagt 16962406  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||      
T  16962407 gtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgag 16962506  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || || |    
T  16962507 ttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttactgg 16962606  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  16962607 aacagtttagagatatgagtttggtttgtgaacggttacgtcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaaaa 16962706  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  16962707 ggcacataaagttgatgtc 16962725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 25608619 - 25609141
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25608619 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 25608718  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25608719 agaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttagctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 25608818  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  25608819 aggtatttagtgatcacaagagtctgaagtatctgttcgattagaaggaattgaatatgagacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattt 25608918  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  25608919 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagagagttcgagttg 25609018  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
     | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  25609019 ttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagattgtaaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgagaaatatta 25609118  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  25609119 aagaagcatagaaagttgatgtc 25609141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 16926400 - 16926920
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16926400 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttacgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgacaa 16926499  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcg-agatttgagg 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16926500 ttcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttagctgttgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaaggtttgaag 16926599  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgct-aaaggattatgactttg 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  16926600 tgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatgtgagggagcgtagatggcttgaattgctaaaaggattatgattttg 16926699  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
      ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||    
T  16926700 agttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttact 16926799  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  16926800 ggaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaacggttacctcagaatgtgaaactgggaatgcggaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaa 16926899  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16926900 gaggcacagaaagttgatgtc 16926920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 22761213 - 22761734
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  22761213 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttatgtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagatagttg 22761312  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22761313 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22761412  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  22761413 agatatttagtgatcataagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgattt 22761512  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || ||||| |||    
T  22761513 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaggagttcgagttg 22761612  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||  || | || |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  22761613 cttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaattcctgaagagtatta 22761712  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| || |||||||||||    
T  22761713 aagaagcgcaaaaagttgatgt 22761734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Original strand, 16621838 - 16622106
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16621838 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 16621937  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621938 agaactcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 16622037  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16622038 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 16622106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 18406702 - 18407221
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||||| |||    
T  18406702 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgctttgagacaattg 18406801  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18406802 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattaaaaatatggagacgttacttgtatggttcgagatttg 18406901  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  18406902 atgtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaatggaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattt 18407001  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  18407002 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 18407101  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  ||||  ||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  18407102 cttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca--tctgagagtgaagctaggaatgctgaagattgatagcgaatttctaaagagtatta 18407199  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || | ||||||||| |||||    
T  18407200 aagaggaacagaaagtcgatgt 18407221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23079991 - 23079471
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23079991 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacagttga 23079892  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  ||| ||| |  ||||| |||||||| ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23079891 ggattcttgaaagaaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtttttgtattgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttga 23079792  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||  | ||| | ||||||||||| |||    
T  23079791 agtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgttttatcataaggaattgaatatgaaacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgatttt 23079692  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
     |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||  | || |    
T  23079691 agtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttaattttc 23079592  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||| || ||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23079591 tggaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcatctcagagtgtgaggctaggaatgctgaaaattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 23079492  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  23079491 agaagcgcataaagttgatgt 23079471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 275 - 534
Target Start/End: Original strand, 16625737 - 16625996
Alignment:
Q  275 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 374  Q
    ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625737 cagcgaagatgactcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 16625836  T
Q  375 tgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactggg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16625837 tgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactggg 16625936  T
Q  475 tatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16625937 tatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgt 16625996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 531
Target Start/End: Original strand, 18196492 - 18197001
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18196492 gatgaaccttttcttgtttactgtgatgcgtccaaattgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcatcaagacacttga 18196591  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18196592 gaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtatttgtgcttaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 18196691  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  18196692 agtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgatttt 18196791  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||      || ||   |||    | || || |    
T  18196792 gggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt------tgttg--tagatgccttgagttac 18196883  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |     
T  18196884 ttgaacaggttagagatttgagtttagtttgcgaattgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgatttcttgaaaagtattat 18196983  T
Q  514 ggaagcacagaaagttga 531  Q
     ||||| |||||||||||    
T  18196984 tgaagcgcagaaagttga 18197001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15460855 - 15460377
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  |||| |    
T  15460855 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctagacaactgaggg 15460756  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  15460755 ttcatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagt 15460656  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  15460655 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggt 15460556  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  || |||||||||||||    
T  15460555 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttg 15460456  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    |||||||||||||  ||||| | || || |||| |||| | ||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||    
T  15460455 aacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttgggtatgctgaagatcaatagtga 15460377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21473124 - 21472602
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  21473124 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttg 21473025  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  21473024 aggattcacgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttg 21472925  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  21472924 aggtgtttagtgatcataagagattgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattt 21472825  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || ||     
T  21472824 tggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttc 21472725  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | |||||||| | | ||||||| || ||| |  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| ||||| |    
T  21472724 cttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatta 21472625  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |||||| |||||| ||||||||    
T  21472624 gggaagcgcagaaaattgatgtc 21472602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Original strand, 19488030 - 19488503
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  19488030 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttacgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttg 19488129  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  | | |||||    
T  19488130 agaattcatgatcggaattatcctacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggccccatatttg 19488229  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| | ||||| ||||| ||    
T  19488230 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttctttgataaaaaagaattgaatatgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatgattt 19488329  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| || || |||    
T  19488330 tggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatggttaaagagtttgagttg 19488429  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | ||||| || | ||| |||||||| |||||  | |||||| |||||||    
T  19488430 cttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagat 19488503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 534
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636580
Alignment:
Q  189 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  289 agagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgct 388  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgct 20636434  T
Q  389 atgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattg 488  Q
    |||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||    
T  20636435 atgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattg 20636534  T
Q  489 atagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  20636535 ataatgaatttctgaagagtattaaagaagcgcaaaaggttgatgt 20636580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 535
Target Start/End: Original strand, 21568768 - 21569271
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || || |||||  | |||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  21568768 tattgtgatgtgtctaagttgggcttgggtggtgtcttgatgcaagagggtaaggtggtagtgtatgcttctagacaactgagagtttatgagaagaatt 21568867  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  21568868 atcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcaaaa 21568967  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  21568968 aagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccg 21569067  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||      
T  21569068 ggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagact 21569167  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 531  Q
    ||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||| |||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||  |||||||    
T  21569168 tgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttga 21569267  T
Q  532 tgtc 535  Q
    ||||    
T  21569268 tgtc 21569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 5295968 - 5296380
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  5295968 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 5296067  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5296068 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 5296167  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  5296168 gttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 5296267  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  5296268 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctag 5296367  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  5296368 agcagtttagaga 5296380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21754736 - 21754481
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21754736 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagga----tacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 21754641  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
     | |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754640 caattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgaggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 21754541  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 273  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21754540 agtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatgag 21754481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15897454 - 15897096
Alignment:
Q  175 gaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  15897454 gaagatttggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgaga 15897356  T
Q  275 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 374  Q
    || ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||      
T  15897355 caacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactc 15897256  T
Q  375 tgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactggg 474  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || || || |||  ||||||||| || |||||  | ||    
T  15897255 tacatatgtccgcgatgatgatcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagg 15897156  T
Q  475 tatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  15897155 aatgctgaagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 15897096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 120 - 535
Target Start/End: Original strand, 21562997 - 21563412
Alignment:
Q  120 atgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  21562997 atgagaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtt 21563096  T
Q  220 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttg 319  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  21563097 tagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttg 21563196  T
Q  320 aattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaac 419  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  21563197 aattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaac 21563296  T
Q  420 agtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagc 519  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||| |||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||  |||||    
T  21563297 agtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaaaagtatcagagaagc 21563396  T
Q  520 acagaaagttgatgtc 535  Q
     ||  |||||||||||    
T  21563397 gcaacaagttgatgtc 21563412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 528
Target Start/End: Original strand, 18966054 - 18966565
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagt 110  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||| | |||||   ||||||| || |||||||    
T  18966054 gatgaaccttttgttgtgtattctgatgcgtccaagttggatttaggtggtgtgcttatgca-gaa--taacaaggtagtgacttatgcatcgagacagt 18966150  T
Q  111 tgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatt 210  Q
    ||||  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18966151 tgaggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgtagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatctgtatggttctagatt 18966250  T
Q  211 tgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgac 310  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | || ||||||||     
T  18966251 tgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgat 18966350  T
Q  311 tttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||   |||||| || |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||  | ||| || ||      
T  18966351 ttttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt---agatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggctaaagagttggagc 18966447  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| || |  |||| ||||||||| || |||||  | || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18966448 tgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctatgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctcaatagtat 18966547  T
Q  511 caaggaagcacagaaagt 528  Q
     || ||||| ||||||||    
T  18966548 taaagaagcgcagaaagt 18966565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 463
Target Start/End: Original strand, 28281584 - 28282021
Alignment:
Q  26 gtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgaga 125  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| || ||||| || ||  |||| || ||||| |    
T  28281584 gtggtttattgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcataggcttctaggcaactgagggtgcatgaaa 28281683  T
Q  126 agaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtga 225  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  28281684 agaattatcccactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtga 28281783  T
Q  226 tcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattat 325  Q
     |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28281784 ccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattac 28281883  T
Q  326 cacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagttta 425  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||| || ||  | ||||||||||    
T  28281884 catccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagttta 28281983  T
Q  426 gagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||| |||||||||    
T  28281984 gagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagc 28282021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18796209 - 18795714
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||| |||| |    
T  18796209 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttatgaggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 18796110  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||  || | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  18796109 tacatgaaaagaattatcctactcacaatttggagttggctgcggtagtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagt 18796010  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  18796009 gtttagtgatcacaagagcttgaaatattcatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 18795910  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| |  ||||| || |||||||    
T  18795909 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttg 18795810  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || ||||||||||  ||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  18795809 aatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 18795714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 10467611 - 10468128
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  10467611 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 10467710  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  10467711 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaggt 10467810  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || |||||||| |||||     
T  10467811 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggc 10467910  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||| ||||| | | |||||| || ||||| |    
T  10467911 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctgg 10468010  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | || ||||||||  ||||| | || || |||| ||||||||| ||  |  |  |||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||   ||    
T  10468011 agcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgaga 10468110  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  10468111 agcacagcaagtggatgt 10468128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 498
Target Start/End: Original strand, 34644349 - 34644829
Alignment:
Q  18 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||  | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  34644349 aaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggtctaggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtagtggcgtatgcttctagacagctgagagt 34644448  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 217  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||    
T  34644449 acatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtg 34644548  T
Q  218 tttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtt 317  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |    
T  34644549 tttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggt 34644648  T
Q  318 tgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttga 417  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  34644649 tgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttga 34644748  T
Q  418 acagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 498  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||| || || ||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  34644749 acagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 34644829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 14378678 - 14379196
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgctt-atgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgaga 115  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||| || ||  ||||| | |||| ||| || ||||||||     
T  14378678 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtctaagttgggcttaggaggtgtttttgatgcaagatggaaaggtggtaccgtatgtttctaggcagttgagg 14378777  T
Q  116 gttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagg 215  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14378778 attcatgagaagaattatcctacgcgtgatttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagg 14378877  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttgg 315  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||| ||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  14378878 tgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttgg 14378977  T
Q  316 tttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgctt 415  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| | ||||||||| |||||     
T  14378978 tttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgcta 14379077  T
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagg 515  Q
    ||  |||| |||||| ||||| | || || |||| | ||||||| || ||  || |||| ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||  |    
T  14379078 gagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagag 14379177  T
Q  516 aagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||| ||| |||| |||||    
T  14379178 aagcgcagcaagtggatgt 14379196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 14380228 - 14380746
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgctt-atgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgaga 115  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||| || ||  ||||| | |||| ||| || ||||||||     
T  14380228 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtctaagttgggcttaggaggtgtttttgatgcaagatggaaaggtggtaccgtatgtttctaggcagttgagg 14380327  T
Q  116 gttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagg 215  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14380328 attcatgagaagaattatcctacgcgtgatttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagg 14380427  T
Q  216 tgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttgg 315  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||| ||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  14380428 tgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttgg 14380527  T
Q  316 tttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgctt 415  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| | ||||||||| |||||     
T  14380528 tttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgcta 14380627  T
Q  416 gaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagg 515  Q
    ||  |||| |||||| ||||| | || || |||| | ||||||| || ||  || |||| ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||  |    
T  14380628 gagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagag 14380727  T
Q  516 aagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||| ||| |||| |||||    
T  14380728 aagcgcagcaagtggatgt 14380746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24365931 - 24365519
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||| | |    
T  24365931 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 24365832  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24365831 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24365732  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||     
T  24365731 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggc 24365632  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||| | |    
T  24365631 ttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaaccttgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttag 24365532  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    ||||||| |||||    
T  24365531 aacagttcagaga 24365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 25763987 - 25764195
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25763987 gatgagccttttgtggtgtattgtgatgagtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 25764086  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| |  || |||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25764087 gaattcatgagaagaattaccagacacatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 25764186  T
Q  214 ggtgtttag 222  Q
    |||||||||    
T  25764187 ggtgtttag 25764195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19880820 - 19880405
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  19880820 gatgaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggtctaggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagctga 19880721  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||    
T  19880720 gggtacatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgtcttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcga 19880621  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||    
T  19880620 agtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgatttt 19880521  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||    
T  19880520 gggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgc 19880421  T
Q  414 ttgaacagtttagaga 429  Q
    ||||||||||||||||    
T  19880420 ttgaacagtttagaga 19880405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 16381141 - 16381560
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  16381141 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 16381240  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  16381241 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 16381340  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  16381341 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 16381440  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  16381441 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 16381540  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  16381541 ttcgagacttgagtttggtt 16381560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 20634698 - 20634879
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  20634698 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgtgtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagatagttg 20634797  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattact 194  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20634798 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattact 20634879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19436521 - 19436142
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  19436521 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 19436422  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |  || || || ||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  19436421 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatcgggagttcgatgcggtggtgtttgttttgaaaacttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 19436322  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||  ||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| || | | |||| ||||| || | ||||| || || ||||||    
T  19436321 attcggtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggtagaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggt 19436222  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    |||||||| || ||  ||||||| ||||| |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19436221 ttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 19436142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 440
Target Start/End: Original strand, 16648737 - 16649154
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  16648737 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaattgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 16648836  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| || ||  |  ||||||| | |||||||||||| ||    
T  16648837 agaagaattatccaactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctacatggttctaaatttgaggtgttcag 16648936  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  16648937 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 16649036  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  16649037 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 16649136  T
Q  423 ttagagatatgagtttgg 440  Q
    || ||||| |||||||||    
T  16649137 ttcgagatttgagtttgg 16649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 167 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 19454789 - 19454469
Alignment:
Q  167 tttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 266  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  19454789 tttgttttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattga 19454690  T
Q  267 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 366  Q
    | ||||||||| | || ||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19454689 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 19454590  T
Q  367 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtg 466  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || |||| | ||||||| || |||    
T  19454589 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtg 19454490  T
Q  467 aaactgggtatgctgaagatt 487  Q
     |  |||| ||||||||||||    
T  19454489 cagttggggatgctgaagatt 19454469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 1647582 - 1648001
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  1647582 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 1647681  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  1647682 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 1647781  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||| |  | |  || ||||| | ||| |||   |||| |    
T  1647782 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggaggtggttgaaatatcttaaggactttgattttcaattgagt 1647881  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  1647882 tatcatccaggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatgtgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 1647981  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  1647982 ttcgagacttgagtttggtt 1648001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 18836745 - 18837095
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||| | || | ||  |||||||| ||||| || |    
T  18836745 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtacatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgcattgaagatttggaggcact 18836844  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || | || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  18836845 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 18836944  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18836945 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 18837044  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  18837045 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 18837095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 333 - 534
Target Start/End: Original strand, 22077768 - 22077969
Alignment:
Q  333 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  || ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  22077768 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 22077867  T
Q  433 gagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgat 532  Q
    |||||| ||||||||   |||| || | || ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22077868 gagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatattgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 22077967  T
Q  533 gt 534  Q
    ||    
T  22077968 gt 22077969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23997695 - 23997342
Alignment:
Q  89 gtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagac 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| || || |    
T  23997695 gtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttgaaggc 23997596  T
Q  189 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 288  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |    
T  23997595 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 23997496  T
Q  289 agagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgct 388  Q
     || |  || | ||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  23997495 ggaatatcttacggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgct 23997396  T
Q  389 atgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
     ||||||| | ||| || |||||| |||| || ||| ||||  |||||||||||    
T  23997395 ttgatggttaaagagttggaattgattgagcaatttcgagacttgagtttggtt 23997342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16234472 - 16234122
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| || |    
T  16234472 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccaaatcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 16234373  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16234372 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttaga 16234273  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  16234272 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgtggatgctttgtgtagaaagactttgcatatgtctgctttg 16234173  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| || | |||||| ||||  |||||||||||    
T  16234172 atggttaaagagttggaattgatttagcagtttcgagacttgagtttggtt 16234122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18450027 - 18449602
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||  || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  18450027 gatgaaccatttgttgtatactgtaatgaatctaagttgggtttaggtggtgtgcatatgcaggatagtaaagtagtagcttatgcatcgag-cagttga 18449929  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||  | | ||||||||| |||||| ||| ||||    | | ||| |||||  | || || |||||   |||  |||||||||| ||||||||    
T  18449928 ggattcatgaacatatttatcctactcatgattttgtgttg----cagcagtttttgtacttaaaatttggaggagttatctgtatggttctagatttga 18449833  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||| | ||     
T  18449832 agtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggtagtgaaggtggcttgaattgctaaaggattataatttc 18449733  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||||    
T  18449732 gggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagttgc 18449633  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    ||| |||||| | |||  |||||||||||||    
T  18449632 ttgcacagttcaaagacttgagtttggtttg 18449602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16099522 - 16099259
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || | ||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  16099522 tttgttgtatattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggtttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 16099423  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |  ||||||||||| ||    
T  16099422 agaagaattatccaactcatgatttcgaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttgaggtgttcag 16099323  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16099322 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 16099259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 442
Target Start/End: Original strand, 14624275 - 14624544
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14624275 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14624374  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||| |  || |||   |||| |||||| || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14624375 ggcagaggagatggttggaataccttaaggacttcgattttcagttgagttatcatcccgaaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 14624474  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
     |||||||| || ||| ||||||| | |||||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14624475 tttgcatatttctgctttgatggttaaagaattggaattaattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 14624544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 23026553 - 23026903
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| || || || | ||   ||||||| ||||| ||||    
T  23026553 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatgcactgaagatttggaggcatt 23026652  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||  |||||||| |  |    
T  23026653 atctgtatggttataagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcaaagaagatggttgaa 23026752  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
    ||  || ||||||| ||| |||   |||| |||| | || || ||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||    
T  23026753 gtatcttaaggattttgattttcagttgagttattatcccgggaaagctaatgttgttgttgatgctttgagtataaagactttgcatatgtttgctttg 23026852  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  23026853 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 23026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 35274923 - 35275273
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||| | || || || | |   |||||||| ||||| ||||    
T  35274923 gcttattcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattgtctgctgttgtgtattcattgaagatttggagtcatt 35275022  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||| |||| | ||    
T  35275023 atctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaacatggttgga 35275122  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||  ||| ||    
T  35275123 atatcttaaggactttgattttaagttgagttatcatcctaggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcttatgtttgctttg 35275222  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  35275223 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 35275273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 429
Target Start/End: Original strand, 8761934 - 8762107
Alignment:
Q  256 gaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagat 355  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  8761934 gaaggatttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagat 8762033  T
Q  356 gccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8762034 gccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagaga 8762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14129895 - 14129558
Alignment:
Q  110 ttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||| |||||  ||| |||||| |  |    
T  14129895 ttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatatgtttggttctaagt 14129796  T
Q  210 ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 309  Q
    || | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||  || ||||||| |||    
T  14129795 tttaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggattttga 14129696  T
Q  310 ctttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaa 409  Q
     |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||  ||    
T  14129695 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgtgtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttaaa 14129596  T
Q  410 ttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcga 447  Q
    ||| |||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  14129595 ttgattgagcactttcgagacttgagtttggttagcga 14129558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18574633 - 18574439
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  18574633 gcttatgctttgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatcctactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 18574534  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
    |  |||||| ||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  18574533 atctgtatgattctaagtttaaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 18574439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 24294540 - 24294624
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttat 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24294540 agattaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttat 24294624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21928568 - 21928299
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    |||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  21928568 ttgaagatttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatga 21928469  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    ||||| |||| ||| | ||||  || |||||||  || |||   |||| |||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  21928468 ggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaagac 21928369  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  21928368 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 21928299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 534
Target Start/End: Original strand, 27330537 - 27330712
Alignment:
Q  359 ttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctc 458  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||||||   |||| ||     
T  27330537 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcgagatgtcatcta 27330636  T
Q  459 aaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||  |||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27330637 agagtttgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgt 27330712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 534
Target Start/End: Original strand, 27391277 - 27391452
Alignment:
Q  359 ttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctc 458  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||||||   |||| ||     
T  27391277 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcgagatgtcatcta 27391376  T
Q  459 aaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||  |||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27391377 agagtttgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgt 27391452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 19986184 - 19986444
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  19986184 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtttgggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 19986283  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatta-ct-----tgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| || || || || ||     | |||||||| |  ||||| ||    
T  19986284 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttgcaggcactatctatatctatatggttctaagtttgaagt 19986383  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 277  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19986384 attcagtgaccacaagagtttgaagtacttcttcgatcagaaagagttgaatatgaggcag 19986444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18572872 - 18572745
Alignment:
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt--cagagaattcgaattgct 414  Q
    |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||| || |||||| |    
T  18572872 ttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctttgatggttaaagagagttggaattgat 18572773  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  18572772 tgagcagtttcgagacttgagtttggtt 18572745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28283957 - 28283917
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggttt 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283957 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggttt 28283917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16099248 - 16099144
Alignment:
Q  338 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtt 437  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  ||||||    
T  16099248 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgaaggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtt 16099149  T
Q  438 tggtt 442  Q
    |||||    
T  16099148 tggtt 16099144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 23086505 - 23086556
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgt 66  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23086505 atgaaccttttgttgtatattttgatgcatccaagttgggcttaggtggtgt 23086556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 108427 - 108948
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||     
T  108427 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacaatta 108526  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  108527 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagccgtagtatttgtattgaagatagggagacattacttgtatggttcgaggtttg 108626  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  108627 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatgattagagttgctaaaggattatgactt 108726  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  108727 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtcagagagttcgagtta 108826  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108827 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 108926  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  108927 aggaagcacagaaagttgatgt 108948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 114248 - 113806
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| | |    
T  114248 gatgaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaa 114149  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||| ||||  ||||||||| |||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  114148 gagtacatgtaaagaattattctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttga 114049  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||    
T  114048 agtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgatttt 113949  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||    
T  113948 gggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgc 113849  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacc 456  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||    
T  113848 ttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcacc 113806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10164 - 9643
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10164 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 10065  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10064 agagttcacgagaagaattatactacgcatgatcttgagttggcagccatagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 9965  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  9964 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgattatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 9865  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9864 tggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatta 9765  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9764 cttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 9665  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9664 aggaagcacagaaagttgatgt 9643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16626 - 16105
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16626 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 16527  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16526 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcagccatagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattta 16427  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16426 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 16327  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||     
T  16326 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagacattgcatatgtcttctatgatggtcagagagttcgaatta 16227  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226 cttgaacagttcagagataagagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatttcttaaaagtatca 16127  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16126 aggaagcacagaaagttgatgt 16105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 44841 - 44319
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44841 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcacgacagttg 44742  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44741 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 44642  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  44641 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgactt 44542  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  44541 tggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagtta 44442  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  44441 ctcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatca 44342  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44341 aggaagcacagaaagttgatgtc 44319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Original strand, 49134 - 49573
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||| |||| |    
T  49134 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggaaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 49233  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  49234 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttatagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagt 49333  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||     
T  49334 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 49433  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || |||||||    
T  49434 ttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttg 49533  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacc 456  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  49534 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcacc 49573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 105268 - 105618
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |  | |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  105268 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatgaaaagaattattcggctcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 105367  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||  |||||| | | ||    
T  105368 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagatagttgga 105467  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |   | | |||||  || |||   || | |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  105468 atatgttatggatttcgattttcagttaagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 105567  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || || ||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  105568 atggttaaagagttggatttggttgagcagtttcgagacttgagtttggtt 105618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9086 - 8566
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  9086 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgttcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaacacagttaa 8987  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8986 ggattcatgagaagaattatcctacacatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8887  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  8886 ggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgattagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgacttt 8787  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  8786 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtgagagagttcgagttac 8687  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8686 ttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 8587  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  8586 ggaagcaaagaaagttgatgt 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49780 - 49484
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  49780 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 49681  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49680 agaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttg 49581  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  49580 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagatggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatga 49484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 49482 - 49352
Alignment:
Q  404 ttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctga 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || || |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49482 ttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctga 49383  T
Q  504 aaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| || || ||||| |||| ||||||    
T  49382 aaagtattaaagaggcacaaaaagctgatgt 49352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20291 - 19771
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  20291 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagaaggtgtacttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcaattga 20192  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20191 gaattcatgagaagaattatccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttga 20092  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20091 ggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 19992  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  19991 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgc 19892  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19891 ttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaa 19792  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19791 agaagcacagaaagttgatgt 19771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35715 - 35195
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  35715 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagaaggtgtacttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcatttga 35616  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35615 gaattcatgagaagaattatccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttga 35516  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  35515 ggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 35416  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  35415 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgc 35316  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35315 ttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaa 35216  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  35215 agaagcacagaaagttgatgt 35195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 99 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 51036 - 50601
Alignment:
Q  99 cttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgta 198  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || | | |||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51036 cttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacgcacaatttagcgttggctgcggtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgta 50937  T
Q  199 tggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgcta 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||     
T  50936 tgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgtttgattagaaggaattgcatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctg 50837  T
Q  299 aaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 398  Q
    ||||| || || ||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  50836 aaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggtaa 50737  T
Q  399 gagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 498  Q
      || ||||| |||||||||||||| | |||| |||| || ||||| ||   |||| || | || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  50736 aggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtgagatgtcatctaagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatt 50637  T
Q  499 tctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  50636 tctgaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 50601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 267
Alignment:
Q  263 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttga 362  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  446 ttgaatatgaggcaaagaagatggttagaatatcttaaggattttgattttcagttgatttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttga 347  T
Q  363 gtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |||| ||||| |||||| |||  ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  346 gtagaaagactttgcatttgtttgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 3970 - 4491
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3970 gatgaaccttttgtggtatactgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcgtatgcttcaagatagttga 4069  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4070 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttga 4169  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4170 ggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgacttt 4269  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  4270 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgc 4369  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4370 ttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaagagtatcaa 4469  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  4470 agaagcacagaaagttgatgtc 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 29188 - 29709
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  29188 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtccttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggtagttga 29287  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288 gagttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttagcggcaatggtctttgtattgaacatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 29387  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  29388 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaaacatgaggtagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgacttt 29487  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  29488 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgc 29587  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29588 ttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactggaaatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagtatcaa 29687  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29688 ggaagcacagaaagttgatgtc 29709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 3883 - 3362
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3883 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcttccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 3784  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3783 gagttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagaattagccgccgtggtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttga 3684  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||  |||||||||||    
T  3683 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgacttt 3584  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  3583 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgc 3484  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| || | |||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3483 ttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtaaatttctgaaaactatcaa 3384  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3383 ggaagcacagaaagttgatgtc 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 38437 - 38958
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38437 gatgagccttttgtagtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtatttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagtcagttga 38536  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38537 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttga 38636  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||    
T  38637 ggtgtttagtgatcagaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgacttt 38736  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  38737 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgc 38836  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38837 ttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaattctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaa 38936  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  38937 agaggcacagaaagttgatgtc 38958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 67091 - 66573
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  67091 gaactttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggattaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaa 66992  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  66991 ttcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttggcagatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggt 66892  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  66891 gtttagcgatcacaagagttcgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatattagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggt 66792  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||     
T  66791 ttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttactta 66692  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  66691 aacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcaccttagagagtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaaga 66592  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
     ||||||||||||||||||    
T  66591 ggcacagaaagttgatgtc 66573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22394 - 22333
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgca 75  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  22394 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcttccaagttggacttaggtggtgtacttatgca 22333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Original strand, 27986 - 28510
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986 atgaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagatgttaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 28085  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28086 aattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtcgtctttatattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgag 28185  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28186 gtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttg 28285  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||    
T  28286 gtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttctagtttct 28385  T
Q  415 tgaacagtttagagatatg----agtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||||||||||||| | ||    || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28386 tgaacagtttagagctgtgagctagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctaaagattgaaagtgaatttctaaaaagtat 28485  T
Q  511 caaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || || ||||| ||||||||||||    
T  28486 taaagaggcacaaaaagttgatgtc 28510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 60432 - 59945
Alignment:
Q  24 ttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatga 123  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||  | ||||||||||| || ||  |||| |   |||||||    
T  60432 ttgttgtatattgtgatgcatctaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaggataataatctagtagcttatgcatcgaggtagtttacgattcatga 60333  T
Q  124 gaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagt 223  Q
        ||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||| || || |||    
T  60332 acgcaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtactcaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagt 60233  T
Q  224 gatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatt 323  Q
    | ||| || ||| | |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  60232 ggtcataaaagtataaagtatttatttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaaggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaatt 60133  T
Q  324 atcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtt 423  Q
    | || || ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||  | ||||||||| ||||  || || ||||||||||| ||    
T  60132 accatccgggtaagggtaatgttgttgcagatgctttaaataggaaaacattacatatgtttgatatgatggttagag--ttggagttgcttgaacaatt 60035  T
Q  424 tagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
     | |||| ||||||||||||| |||  ||| ||  | || |||||| | || |||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||    
T  60034 caaagatttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgtagagtgtgaaattaggaatgctgaagatcaacaatgaatttctgaatagtatcaa 59945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 3122 - 3348
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  3122 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtcaaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagacggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacaattga 3221  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3222 gaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtgatttttgtgttgaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttga 3321  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 240  Q
     ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  3322 agtgttcagcgatcataagagtctgaa 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 442
Target Start/End: Original strand, 54571 - 54986
Alignment:
Q  27 tggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaa 126  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  54571 tggtgtattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaa 54670  T
Q  127 gaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgat 226  Q
    ||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | |   |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||||||| | |||     
T  54671 gaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtttattcattgaagatttggagtcattatctttatggttctatttttgaggtgttcattgac 54770  T
Q  227 cacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatc 326  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||    
T  54771 cataagtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgaagatggttggaatatcttaaggactttgatttttagttgagttatc 54870  T
Q  327 acccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttag 426  Q
    | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||| | ||||| |  || || |||||| |||| |||||| |    
T  54871 atcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtataaagactttgcatgtgtctgctttaatggttaaggagttggaattgattgagcagtttcg 54970  T
Q  427 agatatgagtttggtt 442  Q
    |||| |||||||||||    
T  54971 agatttgagtttggtt 54986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 302 - 534
Target Start/End: Original strand, 3361 - 3594
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    ||||| || ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||| | ||    
T  3361 gattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatggttaaag 3460  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttct 501  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||| |  | || ||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||| ||    
T  3461 agttttaattgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattttcatcatagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgataataaattcct 3560  T
Q  502 gaaaagta-tcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  3561 aaaaagtattaaagaaagcatagaaagttgatgt 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 326 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 131483 - 131276
Alignment:
Q  326 cacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagttta 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  131483 caccaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttca 131384  T
Q  426 gagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaa 525  Q
    ||||| |||| || |  || ||   |||  || |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  131383 gagatttgagcttagggtgtgagatgtcgtctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa-ttctgaaaagtattaaagaggcacagaa 131285  T
Q  526 agttgatgt 534  Q
    || ||||||    
T  131284 agctgatgt 131276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 150800 - 150690
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    || || ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  150800 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgtgtttaggtggtgtgcttat----gatggaaaagtagtagcttatgcttcgaggcagttg 150705  T
Q  113 agagttcatgagaag 127  Q
    ||| |||||||||||    
T  150704 agaattcatgagaag 150690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7182
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7703 gatgaaccttttgtggtatactttgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtaatgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 7604  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  7603 gaattcatgagaagaattatctgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttga 7504  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  7503 ggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgacttt 7404  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  7403 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatggttagagagttcgagttac 7304  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7303 ttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagtattaa 7204  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  7203 agaggcacaaaaagttgatgtc 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 2099 - 1586
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2099 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 2000  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1999 gagaagaattactcgacgcatgacttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgttta 1900  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1899 gcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaa 1800  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  1799 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacag 1700  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |  ||||    
T  1699 ttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgatgagtattaaaggggcac 1600  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||||    
T  1599 ataaagttgatgtc 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 15839 - 15326
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15839 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 15740  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15739 gagaagaattactcgacgcatgacttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgttta 15640  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15639 gcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaa 15540  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  15539 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacag 15440  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |  ||||    
T  15439 ttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgatgagtattaaaggggcac 15340  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||||    
T  15339 ataaagttgatgtc 15326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 57698 - 57185
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57698 ttttgtggtgtactgtgatgcgtccaagttgggcttaggcggcgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 57599  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  57598 gagaagaattacccaacgcatgatttagagttggcggctgttgtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 57499  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  57498 gtgatcacaagagttcgaagtatttgttcgaccagaaggaattaaatatgagacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaa 57399  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  57398 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgcttttatggtcagagagttcgagtttcttgaacag 57299  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||     
T  57298 ttcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttatgaagagtattaaagaggcaa 57199  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||    
T  57198 agaaagttgatgtc 57185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 537
Target Start/End: Original strand, 18684 - 19207
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18684 gatgaaccttttgtggtttactgtgatgcatccaagctgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 18783  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  18784 gaattcattagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttca 18883  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  18884 ggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 18983  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||| |    
T  18984 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaatacattgcatatgtccactttgatgggtagagagttcgaattcc 19083  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  19084 ttgaacggtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatactgaagattgatagtgaatttttgaagagtattaa 19183  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtcca 537  Q
     || ||||| ||||||||||||||    
T  19184 tgaggcacaaaaagttgatgtcca 19207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 196104 - 196616
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  196104 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgtgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtcaagtggtagcttatgcttcgaggcagttga 196203  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  196204 gagttcatgagaagaattacccgacacatgatttagagttagctgttgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggt---------ga 196294  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  196295 ggtgtttagtgatcataagagtttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 196394  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  196395 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgc 196494  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  196495 ttgaacaatttagagatatgagtttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgttgaagattggtagtgaatttctgaaaagtattaa 196594  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     |  | ||||||||||||||||    
T  196595 aggggtacagaaagttgatgtc 196616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 535
Target Start/End: Original strand, 32198 - 32711
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32198 ttttgtgatatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaactggtagctgatgcttcaagacagttgagaattcat 32297  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || | ||||||  | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32298 gagaagaattacccgatgcatgacttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 32397  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaa 321  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32398 gcgagcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaa 32497  T
Q  322 ttatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| || |  |||||     
T  32498 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtccactttgatggtcaaagagttcgagttaccggaacaa 32597  T
Q  422 tttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 521  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  32598 ttcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 32697  T
Q  522 agaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||||    
T  32698 aaaaagttgatgtc 32711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 164 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 10135 - 9764
Alignment:
Q  164 gtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaat 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  10135 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaat 10036  T
Q  264 tgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 363  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10035 tgaatatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgag 9936  T
Q  364 taggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |      
T  9935 caggaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagttcagagaattgagtttcgtttgtgaatgatcaccttagaaa 9836  T
Q  464 gtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  9835 gtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 9764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39834 - 39697
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39834 ttttgtggtgtattgtgctgcgtctaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 39735  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggc 159  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  39734 gagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggc 39697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 7703 - 8224
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  7703 agatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcatcgagacagttg 7802  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7803 agaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcg 7902  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||    
T  7903 aggtgtttaatgatcacaagagtctgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgattt 8002  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  8003 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagttcgagttg 8102  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||| |||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103 tttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtgaagctagaaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatta 8202  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  8203 aagaagcacagaaagttgatgt 8224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7710 - 7189
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  7710 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgtgtccaagctgggtttaggtggtgtggttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 7611  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7610 agaattcatgagaagaattatcctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 7511  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  7510 aggtatttagtgatcataagagcttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgctgaaggactatgattt 7411  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  7410 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaatgagttcgagttg 7311  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  7310 cttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagtatta 7211  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  7210 aagaagcacagaaagtcgatgt 7189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13752 - 13227
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13752 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgtttttgcatgatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 13653  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttg----tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaga 208  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||  ||||||| |    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13652 agaattcatgagaagaattaccctacacacgatttagagttggctgctatagtcttcgatcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaga 13553  T
Q  209 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  13552 tttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatg 13453  T
Q  309 actttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcga 408  Q
    | ||||  ||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |  || |||||    
T  13452 attttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggtaaaggagttcga 13353  T
Q  409 attgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagt 508  Q
     || ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| || | || ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13352 gttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagt 13253  T
Q  509 atcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  13252 attaaagaagcacagaaagttgatgt 13227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 429
Target Start/End: Original strand, 178 - 584
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  178 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgtttcgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagaattcatg 277  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    | |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||    
T  278 aaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttag 377  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    |||||| || ||| | || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  378 tgatcataaaagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaat 477  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||| | || ||||    
T  478 taccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagt 577  T
Q  423 ttagaga 429  Q
    |||||||    
T  578 ttagaga 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23787 - 23437
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||  |||| || | ||  |||||||| || || ||||    
T  23787 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcaaccgttgtgtatgcattgaagatttgaaggcatt 23688  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  23687 atctgtatggttctaagttttaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 23588  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| || ||| |  || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  23587 atatcttaaggactttgattttcagttgagttttcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 23488  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || || ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23487 atggttaaagagttggagttgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 23437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30635 - 30114
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||||||    
T  30635 agatgaaccttttgtggtatattgtgacgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagtttatgctttgagacagttg 30536  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30535 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagtttgctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 30436  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  30435 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattt 30336  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  30335 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 30236  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
     |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |    
T  30235 gttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataacgaatttctaaagagtataa 30136  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  30135 aagaggcacaaaaagttgatgt 30114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50500 - 50168
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  50500 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtagtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttg 50401  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || |  || ||||| || || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  50400 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggcggtttttgtttttaaaagttggagacattatttgtacggttccagatttg 50301  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  50300 aagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattt 50201  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgt 345  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  50200 tggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 29576 - 29225
Alignment:
Q  184 gagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaga 283  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  29576 gagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaaga 29477  T
Q  284 tggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 383  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  29476 tggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 29377  T
Q  384 ccgctatgatggtcagagaa-ttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctga 482  Q
    | ||||||||||| | |||| || || ||||| || |||||||||||  ||| | | ||||| || | ||||||||| || ||  |  |||||||| |||    
T  29376 ctgctatgatggt-aaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttga 29278  T
Q  483 agattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  29277 agattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17343 - 16823
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  17343 gatgaaccttttgtggtatattgtgatacgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagattgaaaagtagtagcttatacttcgagacagttga 17244  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17243 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgcagtggtcttcgtgttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttga 17144  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  17143 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 17044  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| || |||||      
T  17043 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagtttgaattat 16944  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||| || | || ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16943 tggaacagtttagagatttgaggttagtttgcgaaatgtcatctaagagtgtgaacctaggaatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaa 16844  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16843 agaagcacagaaagttgatgt 16823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7739 - 7218
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  7739 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctaggtttaggtggtgtgcttatccaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 7640  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7639 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttg 7540  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  7539 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattt 7440  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  7439 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttg 7340  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||| |||| |||||| |||| || || ||  ||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7339 cttgaatagttcagagatttgagcttagtgtgttaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtatta 7240  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  7239 aagaggcacaaaaagttgatgt 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 323 - 534
Target Start/End: Original strand, 3535 - 3746
Alignment:
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || |||||| | |||||||    
T  3535 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttgaattgttagaacagt 3634  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 522  Q
    | |||||| |||||||||| || |||  |||| || | || ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  3635 tcagagatttgagtttggtatgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcgca 3734  T
Q  523 gaaagttgatgt 534  Q
    ||||||||||||    
T  3735 gaaagttgatgt 3746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16935 - 16757
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  16935 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctaggtttaggtggtgtgcttatccaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 16836  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16835 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacatt 16757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 13827 - 14348
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  13827 agatgaaccttttgtggtatattgcgatgcgtccaagctgggtttgggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgaggcagttg 13926  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13927 agaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtg 14026  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14027 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgattt 14126  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  14127 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttg 14226  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  ||||  | || | ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  14227 cttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatatgaacgtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagtatta 14326  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||| ||||||    
T  14327 aagaggcacagaaagctgatgt 14348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Original strand, 19009 - 19139
Alignment:
Q  404 ttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctga 503  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || || || |||  ||||  | || | ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19009 ttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatatgaacgtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctga 19108  T
Q  504 aaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  19109 aaagtattaaagaggcacagaaagctgatgt 19139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2959 - 2438
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  2959 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaacatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 2860  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  2859 ataattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttg 2760  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| || |||| ||| ||    
T  2759 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgattt 2660  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  2659 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 2560  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2559 cttgaatagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaattctgaagattgataatgaatttctgaagagtatta 2460  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| || |||||||||||    
T  2459 aagaagcgcaaaaagttgatgt 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 25
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  456 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaacatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 357  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  356 ataattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttg 257  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  256 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgattt 157  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  156 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 57  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  56 cttgaatagttcagagatttgagtttagtttg 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 382
Target Start/End: Original strand, 23691 - 24058
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23691 atgagccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttaggtttatgaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgag 23790  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23791 aattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggacgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgag 23890  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||| | || ||||||||||||     
T  23891 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttaaattgttgaaagattatgacttta 23990  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 382  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23991 ggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 24058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 18957 - 19478
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||| || ||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  18957 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagttggggttaggtggggtgcttgtgcaagatgggaaagtagtatcttatgcttcgagacagttg 19056  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19057 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggatgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttg 19156  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  19157 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatatgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattt 19256  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | |||    
T  19257 tgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcaagttg 19356  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| | |||| | || || || || |||  |||| || |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |    
T  19357 cttgaacagttcaaagatttaagattagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagtatta 19456  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | || |||||||||| ||||||    
T  19457 aagaggcacagaaagctgatgt 19478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21572 - 21161
Alignment:
Q  18 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  21572 aaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttcttatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctagacagttgaggat 21473  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |  | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  21472 tcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttgactacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtg 21373  T
Q  218 tttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtt 317  Q
    || || |||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  21372 ttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 21273  T
Q  318 tgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttga 417  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||  | || ||    
T  21272 tgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctaga 21173  T
Q  418 acagtttagaga 429  Q
    ||||||||||||    
T  21172 acagtttagaga 21161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 46100 - 45761
Alignment:
Q  120 atgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  46100 atgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgtt 46001  T
Q  220 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttg 319  Q
     |||||||| || || |||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  46000 cagtgatcataaaagcttgaaacatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 45901  T
Q  320 aattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaac 419  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  | |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  45900 aattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccctacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaac 45801  T
Q  420 agtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    ||||||||||  ||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  45800 agtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctca 45761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 25562 - 26081
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||| |||    
T  25562 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacaggtga 25661  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25662 gaattcatgacaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 25761  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||| || |||    
T  25762 ggtgtttaatgatcacaagagtttgaaatatttgtttgattagagggaattgaatattaggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggatta-gatttt 25860  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||     
T  25861 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgt 25960  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| || || |||  |||| || | || ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  25961 tggaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgttgaagattgatagtgagtttctaagaagtattaa 26060  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  26061 agaagcacagaaagttgatgt 26081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 743
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| || || | ||   ||||||| ||||| ||||    
T  1093 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcctgatttggaattggcggcagttgtttatgcactgaagatttggaggcatt 994  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  | |||||||  |  ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  993 atctttatggttataagtttgaagagttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgcttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 894  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  893 atatcttaaggaatttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 794  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  793 atggttaaagagttggaattgattgagcattttcgagatttgagtttggtt 743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 102922 - 102402
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  102922 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaggtggtaacttatgcgtcgagacaattga 102823  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||  || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102822 gaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttgggtgctgtggtttttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 102723  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  102722 agtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 102623  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||| ||||    
T  102622 ggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatggtaaaagagttcgagttgc 102523  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||||| |||| |||| || || || |||| |||| |||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  102522 ttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtgaagctagaaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 102423  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| |||||||| |||||    
T  102422 agaagcgcagaaagtcgatgt 102402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 527
Target Start/End: Original strand, 6947 - 7461
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  6947 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctgggtttaggtggtgtgcatatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcatcgagacagttg 7046  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7047 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagattta 7146  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  7147 aggtgtttagtgaccattagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattt 7246  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  7247 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttg 7346  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||  ||||  | |||| ||| | || || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  7347 cttgaacagttcagagatttgagtttagtgtgtgaaatgtcatttgaaagtgtgtagctaggaatgctgaagattggtaatgaatttctgaaaagtatta 7446  T
Q  513 aggaagcacagaaag 527  Q
    | || ||||| ||||    
T  7447 aagaggcacataaag 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 164 - 535
Target Start/End: Original strand, 277597 - 277968
Alignment:
Q  164 gtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaat 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  277597 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaagaat 277696  T
Q  264 tgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  277697 tgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 277796  T
Q  364 taggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  277797 taggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagtggtcacctcagagt 277896  T
Q  464 gtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  277897 gtaaaactgggaatgcttaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 277968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 117 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 261894 - 261570
Alignment:
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  261894 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 261795  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||||||| ||||||| || || || || ||||||||||| |||||| || | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||    
T  261794 attcagtgatcacaagagtctgaagtacttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgt 261695  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  261694 ttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctgg 261595  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggt 441  Q
    |||||||||| || |||||| ||||    
T  261594 aacagtttagggacatgagtctggt 261570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8062 - 7549
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| ||| |||||    
T  8062 agatgaaccttttgtggtatattgttatgcgtctaagctgggtttaggtggcgtgcttatgcaagatggaaaagtagttgcttatgcttcgagatagttg 7963  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7962 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttg 7863  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  7862 agctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattt 7763  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  7762 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttg 7663  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || || || |||  |||| |  |||| ||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7662 cttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatccgaaagtgtgaagctagaaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtatta 7563  T
Q  513 aggaagcacagaaa 526  Q
    | || |||||||||    
T  7562 aagaggcacagaaa 7549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 6911 - 6390
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6911 agataaacctttcgtggtatattgtgatgtgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttcgagacagttg 6812  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    | | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||    || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6811 ataattcatgagaagaattaccctatgcacgatttagagttggctaatgtggtctttatattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 6712  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  6711 aggtatttagtgataatacgagtttgaagtatctattcgatcagaaggaatggaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactt 6612  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  || |  |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  6611 tgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttg 6512  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || |||| ||||| || || ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |    
T  6511 cttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaggattgataatgaatttttgaagagtatta 6412  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  6411 aagaagcacagaaagttgatgt 6390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 504
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7760
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||     
T  7273 gaacattttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaa 7372  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 tacatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggt 7472  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||      
T  7473 gtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgag 7572  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  7573 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgcttg 7672  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaa 504  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || || |||  |||| || | || |||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7673 aacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 7760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2582 - 2062
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  2582 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaagtggtgtgcttatgcaagatgccaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 2483  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| || || || ||||||||  | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2482 gaattcatgaaaagaattaccctacgcacgatttagagttagccgctgtggtctttgtacttaagattcagagacattacttgtatggttcgagatttga 2383  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  2382 agtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagattatgatttt 2283  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||||     
T  2282 gagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagtttgaattgt 2183  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | |||| ||| |||||||||||||| || || |||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2182 tggaacggttgagagatatgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaa 2083  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  2082 agaagcgcagaaagttgatgt 2062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 112105 - 112625
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  112105 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcatcgagacagttga 112204  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||| || |  || || |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112205 gaattcatgaaaggaattaccctacgcacgatttagagttagccgttgtggtttttgtacttaagataaggagacattacttgtatggttcgagatttga 112304  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| || || ||||| |||    
T  112305 agtatttagtgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaagtggcttgaattgctgaacgactatgatttt 112404  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||     
T  112405 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagttcgagttgt 112504  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| || || |||  |||| || | || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  112505 tggaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 112604  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||| || |||||    
T  112605 agaagcacagaaggtcgatgt 112625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16563 - 16053
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| | || |||||||| || ||||||||||||     
T  16563 gaaccctttgttgtttattgcgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagataataaagtagttgcttatgcatcgagacagttgagaa 16464  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||    |||||||||||  |||||||||| || || || ||  |||||||| | ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||    
T  16463 ttcatgaacgaaattatcctactgatgatcttgaattagctgcagtgatctttgtgcttaagatttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagt 16364  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  | ||| | || |||||||| |||||     
T  16363 gttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaagcaattgaatatgagacagcgaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttggg 16264  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || ||  ||||||    
T  16263 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagctgcttg 16164  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||    
T  16163 aacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaagagtattcatga 16064  T
Q  517 agcacagaaag 527  Q
    ||| |||||||    
T  16063 agcgcagaaag 16053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 149 - 535
Target Start/End: Original strand, 79246 - 79632
Alignment:
Q  149 gagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 248  Q
    ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79246 gagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaagtatttgt 79345  T
Q  249 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgt 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79346 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 79445  T
Q  349 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaa 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  79446 tgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgatggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgag 79545  T
Q  449 tggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  79546 tggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 79632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 55444 - 55230
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||| || ||| | || |||||||| || ||||||||||    
T  55444 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttg-------------tgcttatgcaagatggcaaagtagtggcttatgcgtcgagacagttga 55358  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||||  |||||  |||||||| ||| | |||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55357 gaattcatgagcggaattgccctacgcacgatttagagtta-ctgcagtggtctttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 55259  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 242  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||    
T  55258 agtgttcagcgatcacaagagtttgaagt 55230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Original strand, 38564 - 38981
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||     
T  38564 agatgaaccttttgtggtatattatgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacaattc 38663  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38664 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 38763  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  38764 aggtatttagtgagcataacagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgagacatcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattt 38863  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||  ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||    
T  38864 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 38963  T
Q  413 cttgaacagtttagagat 430  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  38964 cttgaacagttcagagat 38981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 684 - 1204
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  684 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcatcgagacagttga 783  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||| |  ||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  784 gaattcatgaaagaaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtacttaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttga 883  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| | || || ||||| |||    
T  884 agtattcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgatccaaaggaattcaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaagactatgatttt 983  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||     
T  984 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgaattgt 1083  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  | || || | |||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1084 tcgaacagtttagagatttgagtttattctgagagttgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 1183  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  1184 agaagcacagaaagttgatgt 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3125 - 2605
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  3125 gatgaaccttttgtggtgtattgttatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacagttga 3026  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3025 gaattcatgaaaagaattaccctacacacgatttagagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 2926  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  2925 agtgattagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgatttt 2826  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||| || |    
T  2825 gagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttac 2726  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    |||||||||| | |||| ||||||| || || |||  |||| || | || ||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |     
T  2725 ttgaacagttcaaagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagtattat 2626  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     || |||||||||||||||||    
T  2625 agatgcacagaaagttgatgt 2605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5560 - 5040
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  5560 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 5461  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  | |||||  | ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||    
T  5460 ggattcatgaaggaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtgttttttgtactcaagatatggagacattatttgtacaattctagatttga 5361  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| |||    
T  5360 agtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatttt 5261  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | | || || ||||    
T  5260 gggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaaaagtttgagttgc 5161  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5160 ttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 5061  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  5060 agaagcgcagaaagttgatgt 5040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12170
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  12690 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 12591  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  | |||||  | ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||    
T  12590 ggattcatgaaggaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtgttttttgtactcaagatatggagacattatttgtacaattctagatttga 12491  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| |||    
T  12490 agtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatttt 12391  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | | || || ||||    
T  12390 gggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaaaagtttgagttgc 12291  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12290 ttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaa 12191  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  12190 agaagcgcagaaagttgatgt 12170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Original strand, 202084 - 202557
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  202084 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttg 202183  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||     
T  202184 agaattcatgagcggaattaccctacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttt 202283  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  202284 aggtgtttagtgatcacaggagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 202383  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||    
T  202384 tggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagagtttgagttg 202483  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||||| || |||||  |||||||| |||||||    
T  202484 cttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagat 202557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 324390 - 323978
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  324390 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttaagaa 324291  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  324290 ttcatgaaaagaattttcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggt 324191  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||    
T  324190 gtttagtgatcacaagagtctcaaatatttatttgatcagaaggagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggt 324091  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| | | |||| || ||| | |    
T  324090 ttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttag 323991  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  323990 agcagtttagaga 323978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 95 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 118834 - 118468
Alignment:
Q  95 tatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattact 194  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  118834 tatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagttgtctttgtgcttaagatttggagacattatt 118735  T
Q  195 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagtt 294  Q
    |||||||||| |||||    ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  118734 tgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaatt 118635  T
Q  295 gctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 394  Q
    | | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||| |||||||    
T  118634 gttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatg 118535  T
Q  395 gtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaa 461  Q
     ||| ||| || ||  |||| ||||||||||||||  |||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  118534 atcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgtcatctcaaa 118468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 164 - 535
Target Start/End: Original strand, 3172 - 3543
Alignment:
Q  164 gtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaat 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  3172 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaat 3271  T
Q  264 tgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 363  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3272 tgaatatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgag 3371  T
Q  364 taggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagc 463  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |      
T  3372 caggaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagttcagagaattgagtttcgtttgtgaatgatcaccttagaaa 3471  T
Q  464 gtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  3472 gtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 3543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 104 - 535
Target Start/End: Original strand, 31460 - 31891
Alignment:
Q  104 agacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggtt 203  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31460 agacaattgagaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgatgtggtttttgtgttgaaaatatggaaacattacttgtatggtt 31559  T
Q  204 cgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaagga 303  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||    
T  31560 ctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttagatcagaaggaattgaatatgagccagcgaaggtggcttgaattgttgaaaga 31659  T
Q  304 ttatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaa 403  Q
    |||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||     
T  31660 ttatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagag 31759  T
Q  404 ttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctga 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | | |||| || |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31760 ttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcaagttgtcatcttaaagtgtgaagctgggaatgctaaagattgataatgaatttctga 31859  T
Q  504 aaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  31860 aaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgtc 31891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 429
Target Start/End: Original strand, 12217 - 12559
Alignment:
Q  87 tggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggag 186  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || |||||    
T  12217 tggtagcttatgcttctaggaagttgaggattcatgaaaaaaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggag 12316  T
Q  187 acattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  12317 gcattatttgtatggttccagatttgaagttttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatgg 12416  T
Q  287 ctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccg 386  Q
     ||||  || | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  12417 ttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgctgcatatgtctg 12516  T
Q  387 ctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    ||   ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12517 cttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagaga 12559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Original strand, 34367 - 34636
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    ||  | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34367 agatgaaccttttatagtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttgggtggtgtgcttatgcaagataacaaggttgtagcgtatgcatcaaggcagttg 34466  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  |||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  34467 aggattcatgaatggaattatcctacgcatgatttggagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttg 34566  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34567 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaag 34636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14157 - 13645
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  14157 gatgaacctttcgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 14058  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    |||| |||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14057 ggattcatgaacgaaattgtcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 13958  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |  ||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  13957 agtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 13858  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||    
T  13857 gggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatggtaaaagagtttgagttgc 13758  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  13757 ttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtgaattcttgaacagtatcaa 13658  T
Q  514 ggaagcacagaaa 526  Q
     ||||| ||||||    
T  13657 agaagcgcagaaa 13645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 25150 - 25670
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  25150 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatacaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 25249  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25250 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatctagaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttga 25349  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | ||  ||||||| |||    
T  25350 agtgttcagcgatcataaaagtttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgatttt 25449  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||    
T  25450 gggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgc 25549  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  25550 ttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaaacttggaatgctaaagattgatagtgaattcctgaacagtattaa 25649  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
      |||| |||||| |||||||    
T  25650 aaaagcgcagaaaattgatgt 25670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 150255 - 149844
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || ||| ||||||  |||||||| || || |||||||    
T  150255 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagtgtatgcttctaggcaattgagag 150156  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||    
T  150155 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagt 150056  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||| | |||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  150055 attttgggatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 149956  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| |    
T  149955 ttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctag 149857  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  149856 agcagtttagaga 149844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Original strand, 194324 - 194765
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || |||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||     
T  194324 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttaagaa 194423  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  194424 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagt 194523  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||  |||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| |||||     
T  194524 attcggtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggc 194623  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| |    
T  194624 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctag 194723  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctc 458  Q
    |  |||||||| |  ||||| | |||||||||| | ||||||    
T  194724 agtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctc 194765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 181604 - 181185
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||| |||||| || ||||||| ||| ||||    
T  181604 tttgttgtgtattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcataatcgttaggttgtggcttgtgcttcgaggcagttgaaagtacatg 181505  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||  |||||||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  181504 agaagaattatccgactcatgatttggaactggcggccgttgtatattcattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 181405  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  181404 tgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaatgaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 181305  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| || | ||| || |||||| |||| ||||    
T  181304 tatcatcccgggaaggctaatgttggtgctgatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtctgctttgattgttaaagagttggaattggttgagcagt 181205  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  181204 tttgagacttgagtttggtt 181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 8275 - 8631
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  8275 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 8374  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8375 agaatttatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttgactgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttg 8474  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  8475 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgattt 8574  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 369  Q
    ||  ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8575 tgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2590 - 2085
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagt 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| | |||||   ||||||| || |||||||    
T  2590 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgca-gaa--taacaaggtagtggcttatgcatcgagacagt 2494  T
Q  111 tgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatt 210  Q
     |||  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  2493 cgaggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtctttgtgcttaagatttggagacattatttctatggttctagatt 2394  T
Q  211 tgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgac 310  Q
    ||| |||||       || || ||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||     
T  2393 tgaagtgtt-------cataaaagtctgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgat 2301  T
Q  311 tttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| | | | || ||      
T  2300 ttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggttaaaaagttggagc 2201  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||  ||||||||||  ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| || || ||  |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  2200 tgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatttttgaacagtat 2101  T
Q  511 caaggaagcacagaaa 526  Q
     || ||||||||||||    
T  2100 taaagaagcacagaaa 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3603 - 3091
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  3603 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 3504  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    |||||||||||  |||||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3503 ggattcatgaacgaaattatcctacttatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttga 3404  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||  ||||||| | |    
T  3403 agtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattgt 3304  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| || || ||||    
T  3303 gggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaagagtttgagttgc 3204  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  3203 ttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattcttaaatagtatcaa 3104  T
Q  514 ggaagcacagaaa 526  Q
     ||||| ||||||    
T  3103 agaagcgcagaaa 3091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 40953 - 41372
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||| | |    
T  40953 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 41052  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  41053 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 41152  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  41153 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 41252  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| | |    
T  41253 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttag 41352  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  41353 aacagttcagagatatgagt 41372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 46019 - 46431
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| || || |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||      
T  46019 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttgagga 46118  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  46119 tacatgaaaagaattatcctatgcatgatttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 46218  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| |||||     
T  46219 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggc 46318  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||| | |    
T  46319 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttag 46418  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  46419 agcagtttagaga 46431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 196 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 39886 - 39547
Alignment:
Q  196 gtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttg 295  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39886 gtatggttcaaggtttgaggtgtttaacgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattg 39787  T
Q  296 ctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 395  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39786 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtccgctttgatgg 39687  T
Q  396 tcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    ||||||| ||  | || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  39686 tcagagagtttaagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgataatga 39587  T
Q  496 atttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  39586 atttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 39547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Original strand, 218036 - 218554
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  218036 agatgaaccttttgcggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcatcgagacagttg 218135  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  |||||||    ||||||| ||| ||||||||||| || || || || || |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  218136 aggattcatgaacgaaattatcgtactcatgatcttgaattagctgcagtggtttttgtgcttaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttg 218235  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||| ||  |||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||    
T  218236 aagtgttcagcaatcata---gtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 218332  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| || || |||    
T  218333 tgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaagagtttgagttg 218432  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||    
T  218433 cttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacaatatca 218532  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| |||||| |||||||    
T  218533 aagaagcgcagaaaattgatgt 218554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 1569 - 1051
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  1569 gaaccttttgtagtctattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgtgttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagctgagag 1470  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  1469 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 1370  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||  |||| |||||||| |||||     
T  1369 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggc 1270  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1269 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttg 1170  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  1169 aacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 1070  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  1069 agcacaacaagttgatgtc 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 4944
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| | |||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  5466 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatgttaaagtggtagcttattcttctaggcagttg 5367  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5366 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgctgtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 5267  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  5266 aggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattt 5167  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||| |  || || || |||    
T  5166 tggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgttgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttg 5067  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || || |||||||||||  ||||| | ||||| || | |||||||||||| ||  |  || |||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||    
T  5066 ctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgagtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatca 4967  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
      ||||||||  |||||||||||    
T  4966 gagaagcacaacaagttgatgtc 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15802 - 15293
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||||||    
T  15802 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgattctaggcagttg 15703  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15702 agaattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggatttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 15603  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  15602 aagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattt 15503  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  || || || |||    
T  15502 tgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttg 15403  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || ||||||||||||||  ||||| | || || || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||    
T  15402 ctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatca 15303  T
Q  513 aggaagcaca 522  Q
      ||||||||    
T  15302 gagaagcaca 15293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8906
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||| | || ||||| ||||| || | ||  |||||||| ||||| || |    
T  8556 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcaagatttggaattggccgccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 8655  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  8656 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcacagaagatggttgga 8755  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  8756 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 8855  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |  || | ||| || || ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  8856 aatgttaaagagttagagttgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 8906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 69056 - 68540
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || ||  |||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  69056 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttttaggcagctgagag 68957  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||  ||||||| ||    
T  68956 ttcatgagatgaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcatgatttgaagt 68857  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||     
T  68856 gtttagtgaccacaaaagtttgaattatttgtttgatcataaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 68757  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  68756 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttg 68657  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  68656 aacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 68557  T
Q  517 agcacagaaagttgatg 533  Q
    ||||||  |||||||||    
T  68556 agcacaacaagttgatg 68540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 3575 - 3985
Alignment:
Q  19 accttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagtt 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  3575 accttttgtggtttattgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttttaggcagttgagagtt 3674  T
Q  119 catgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| |||| || |    
T  3675 catgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtat 3774  T
Q  219 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggttt 318  Q
    | ||||||||||| ||| | || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||    
T  3775 tcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggctt 3874  T
Q  319 gaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaa 418  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| ||     
T  3875 gaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagag 3974  T
Q  419 cagtttagaga 429  Q
    || ||||||||    
T  3975 cattttagaga 3985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 428
Target Start/End: Original strand, 12543 - 12939
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || ||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  12543 tattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagacggcaaagtggtagcgtatacttctaggcagttgagagttcatgaaaagaatt 12642  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| |  || || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12643 atcctactcatgatttggagttggctgtggtggttttcgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataa 12742  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||| || |      
T  12743 aagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcat 12842  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagag 428  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| |   |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  12843 ggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttagag 12939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 22805 - 23322
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||| | |||||   ||||||| || || |||||||    
T  22805 gaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtatgcttatgca-gaa--taacaaggtagtggcttatgcatcgaggcagttga 22901  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22902 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtctttgtgcttaagattaggagacattatttgtatggttctagatttga 23001  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || || ||||| |||    
T  23002 agtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagactatgatttt 23101  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||  |||||||||| | ||| || ||  |||    
T  23102 gggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatggttaaagagttggagctgc 23201  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    | ||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||| | || ||||| ||    
T  23202 tcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtgaattttttaatagtattaa 23301  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| |||||||| |||||    
T  23302 agaagcgcagaaagtggatgt 23322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 18517
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||      
T  19035 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaattagtagcttatgcttctagacagttgagga 18936  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||  || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  18935 ttcatgaaaagaattatcctacggatgatttggaattggttgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagt 18836  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18835 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttattcgatctgaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggt 18736  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| | ||| || || ||||| |    
T  18735 tttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctag 18636  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    || | ||||||||  ||||| | || || || | ||||| |||||| ||  |  |||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  18635 aatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 18536  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  18535 agcacagcaagttgatgtc 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 25403 - 25822
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || ||||||||||| || ||||||| ||| |||     
T  25403 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatt 25502  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| || || || | ||  |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25503 agaagaattatccgactcatgatttggaattggccgcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgtttag 25602  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  25603 tgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 25702  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  25703 tatcatcccgggaaggctaacgttgttgttgatgctttgagtagaaagacattgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 25802  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  25803 ttcgagatttgagtttggtt 25822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 6120 - 5598
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||  |||||    
T  6120 agatgaaccttttattgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggcagcttatgcttctaggaagttg 6021  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| | |||||    
T  6020 aggattcatgaaaggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttg 5921  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  5920 aagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgataaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattt 5821  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||    
T  5820 tggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttg 5721  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || || |||||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||    
T  5720 ctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatca 5621  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  5620 gagaagcacaaaaagttgatgtc 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 17834 - 18352
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |  | || || ||  | ||||| ||||| || ||| ||||||    
T  17834 gatgtaccttttgtggtgtactgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttgt--aggatggcaaggtagtagcatatgcatcgagagagttga 17931  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |    
T  17932 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtagactttgtgctaaagatatggagacattatttgtaaggttctagattaaa 18031  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |  ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| |||    
T  18032 agtgttcaaagatcataaaagtatgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaggattgtgatttt 18131  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||    
T  18132 gggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgc 18231  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||     
T  18232 ttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaatagtatcac 18331  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
      |||| |||||| |||||||    
T  18332 aaaagcgcagaaaattgatgt 18352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Original strand, 9424 - 9897
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9424 agatgaaccttttgttgtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggagtgcttatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttcgagaaagttg 9523  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||| || || |  |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  9524 aggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggcttttgtgttaaaaatttggagacattatttctacggttccagatttg 9623  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||||| ||| ||    
T  9624 aggtgtttagtgatcataaaagtctgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattt 9723  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    | |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| || |||    
T  9724 tagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatggttaaagaatttgagttg 9823  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| | ||||| || | |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  9824 cttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagat 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 526
Target Start/End: Original strand, 5705 - 6220
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  5705 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgagtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtaggttatgcttctaaacagttg 5804  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || |||||||    
T  5805 aggattcatgaaaagaattatgctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtattgaaaatttggagacattatttgtacgactctagatttg 5904  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  5905 aggtgtttagcgataacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattt 6004  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgt--tgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |    
T  6005 tggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagttggagt 6104  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||| |  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| |||||    
T  6105 tgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtat 6204  T
Q  511 caaggaagcacagaaa 526  Q
    ||||||| ||||||||    
T  6205 caaggaaacacagaaa 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 16594 - 17114
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  16594 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtacaagttgggcttaggtagtgtgcttatgcaggatggtaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 16693  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||| ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16694 ggattcatgaacgaaattatgctactcatgatcttgaattagctgcagtggtccttgtactcaacatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 16793  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  16794 agtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 16893  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||| || || |    
T  16894 gagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatggtcaaggaatttgagttac 16993  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || || |||  ||||||||| || |||||  | || |||||||||||||||| ||||||  |||| | ||| ||    
T  16994 ttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatgaattcttgaacaatattaa 17093  T
Q  514 ggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  17094 agaagcgcaaaaagttgatgt 17114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 429
Target Start/End: Original strand, 23697 - 24104
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||   | || |||||||||||     
T  23697 atgaaccttttgttgtatattctgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtggtagctgtggtttaaagacagttgaa 23796  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||  || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||     
T  23797 aattcatgagcgaaattatcctacgcatgatttggagttggttgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaa 23896  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  23897 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttattagatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttg 23996  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||    
T  23997 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagtttgagttgct 24089  T
Q  415 tgaacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||||    
T  24090 tgaacagtttagaga 24104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 73 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 40187 - 39731
Alignment:
Q  73 gcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtg 172  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||  | |||||||| ||     
T  40187 gcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacacacaatttagagttggctactgtagtcttcgta 40088  T
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  40087 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctatttgatcagaaggaatggaatatga 39988  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    | |||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||    
T  39987 gacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagac 39888  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactg 472  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||  |||  |||| || |||| ||||| ||     
T  39887 cttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttttgaaatgtcatctgaaagtgtgaagcta 39788  T
Q  473 ggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagtt 529  Q
    || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  39787 ggaatgctgaagattgataacgaattcctgaagagtattaaagaagcacagaaagtt 39731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 532
Target Start/End: Original strand, 39376 - 39894
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||| ||||| |||    
T  39376 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagctgatgcttcgagacaattg 39475  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  39476 aaaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttg 39575  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| | ||||| ||||| ||    
T  39576 aggtgtttagcgatcacaagagtttgagatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatga-tt 39674  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || || |||    
T  39675 tatttttaattatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttg 39774  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||||| ||  ||||  |||||||| |||||||  | | ||| ||  |||| |||||||    
T  39775 cttgaacaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatca 39874  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgat 532  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  39875 aagaagcacaaaaagttgat 39894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 2888 - 3410
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  2888 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttg 2987  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2988 aggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 3087  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || || ||||| ||    
T  3088 aggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattt 3187  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||| || |  |||||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||| || || ||     
T  3188 tggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagttt 3287  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||| || |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||    
T  3288 cttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 3387  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||| | ||||||    
T  3388 aggaagcgcagaaaatggatgtc 3410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 29901 - 30423
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  29901 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttg 30000  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  30001 aggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 30100  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || || ||||| ||    
T  30101 aggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattt 30200  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||| || |  |||||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||| || || ||     
T  30201 tggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagttt 30300  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||||| || ||| || |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||    
T  30301 cttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 30400  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||| |||||| | ||||||    
T  30401 aggaagcgcagaaaatggatgtc 30423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 160 - 407
Target Start/End: Original strand, 12755 - 13006
Alignment:
Q  160 cgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaag 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12755 cgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaa 12854  T
Q  260 gaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcct 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855 gaattgaatatgaggcagcgtagatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcct 12954  T
Q  360 tgagtaggaagacattgc----atatgtccgctatgatggtcagagaattcg 407  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12955 tgagtaggaagacattgcatatatatgtccgctatgatggtcagagagttcg 13006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 11483 - 10962
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||||     
T  11483 agatgaacctttttttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagaaggcaaagtggtagcttatacttctaggcagtta 11384  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  11383 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgtggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttg 11284  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  11283 aagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattt 11184  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||    
T  11183 tggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttg 11084  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || || |||||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||||| || ||| |  |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |||||||    
T  11083 ctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatca 10984  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
      |||||||| |||||| ||||    
T  10983 gagaagcacataaagtttatgt 10962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16330 - 16103
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  16330 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggttttggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 16231  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230 agaattcatgagaagaattatcctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 16131  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16130 aggtgtttagtgatcataagagtttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 741 - 473
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  741 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcttccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaaactgttga 642  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  641 gagttcatgagaagaattacccgagacatgatttagagttagccgccgttgtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttga 542  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  541 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaag 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 2105 - 2517
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||      
T  2105 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttaggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 2204  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  2205 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtagtttttgttttgaaattttggaggcattatttgtacggctccagatttgaagt 2304  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  2305 gtttagtgatcccaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggt 2404  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || || ||||| |    
T  2405 ttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctag 2504  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  2505 agcagtttagaga 2517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 55608 - 55876
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55608 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtatttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 55707  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  55708 gagttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttagctgccgtggtttttgtgttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttga 55807  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 282  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55808 ggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatatttattcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaag 55876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 109316 - 108937
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||      
T  109316 gaaccttttgttgtttattgcgatgtgtccgagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 109217  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  109216 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagt 109117  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||    
T  109116 gtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgattagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggt 109017  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  109016 ttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 108937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 302 - 535
Target Start/End: Original strand, 62936 - 63169
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  62936 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaag 63035  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttct 501  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || || |||  ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  63036 tgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtgctcatatcagagtgtaaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 63135  T
Q  502 gaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63136 gcaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 63169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 534
Target Start/End: Original strand, 6526 - 7028
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||  | ||  | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||   ||||    
T  6526 tattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtgatgttcttatgcaggatagcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgagcgaaatt 6625  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    |||| || ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  6626 atcccactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataa 6725  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  6726 aagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaaggaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatcca 6825  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||      
T  6826 ggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagact 6925  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 531  Q
    |||| || || ||||||  ||||||| | || |||||  | || ||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  6926 tgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtgaattcttgaacagtattaaagaagcgcagaaagttga 7025  T
Q  532 tgt 534  Q
    |||    
T  7026 tgt 7028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 534
Target Start/End: Original strand, 15098 - 15619
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||  | |||| |||||  |  ||||||||||    
T  15098 gatgaacctcttgtggtgtattgttatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtaggttatggattgagacagttga 15197  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15198 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttga 15297  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
     ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||    
T  15298 agtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattt 15397  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| || || ||     
T  15398 tgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaagagtttgagtta 15497  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||  |||| ||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15498 cttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatagtgaattcttgaacagtatca 15597  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| || ||| |||||||    
T  15598 aagaagcgcataaaattgatgt 15619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41386 - 40906
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||   ||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  41386 gatgatccttttgttgtttactatgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgttttgatgcaa-aatacaaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 41288  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41287 ggattcatgaaaagaattaccctacccatgatttggagttggctgcggtgatttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 41188  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41187 ggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgatttt 41088  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||||    
T  41087 ggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgc 40988  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    | || |||||||||||  ||||| | || || || | ||||||||| || ||  |  |||||||| |||||||| |||||||    
T  40987 tagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtga 40906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 274
Target Start/End: Original strand, 47108 - 47289
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||  ||||  | || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  47108 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttagaattaacggcaattgtatatgcattgaagatttggaggcatt 47207  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 274  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  47208 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtt-gaagtatttgtttgatcagaaatagttgaatatgagg 47289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1555 - 1176
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  1555 gaacctttcgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 1456  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  1455 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgtttcgaaaatttggagacattatttgtacggttccaggtttgaagt 1356  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1355 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaaatggcttgagttgttaaaggattatgattttggt 1256  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||  ||||||||||    
T  1255 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggt 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13884 - 13474
Alignment:
Q  19 accttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagtt 118  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13884 accttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagagtt 13785  T
Q  119 catgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  13784 catgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtat 13685  T
Q  219 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggttt 318  Q
    |||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||| ||||| ||    
T  13684 ttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggctt 13585  T
Q  319 gaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaa 418  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | |||||| || ||||| ||     
T  13584 gaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagag 13485  T
Q  419 cagtttagaga 429  Q
    |||||||||||    
T  13484 cagtttagaga 13474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 447
Target Start/End: Original strand, 6434 - 6858
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  6434 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggtcgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 6533  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  6534 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 6633  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |    
T  6634 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagt 6733  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  6734 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgactgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 6833  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtttgcga 447  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||    
T  6834 ttcgagacttgagtttggttagcga 6858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33097 - 32619
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||       
T  33097 gaaccttttgatgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgatga 32998  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||  |||| |||||||| ||    
T  32997 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatctgtaccgttccagatttgaagt 32898  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  32897 atttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggt 32798  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  32797 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctag 32698  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
      | |||||||||| ||||| | || || |||| ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  32697 cgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 32619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 1474 - 1992
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||      
T  1474 gaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgagcttaggcggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcatttgagga 1573  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| ||    
T  1574 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagt 1673  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1674 atttagtgatcataaaagcctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 1773  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  || || || ||||| |    
T  1774 ttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctag 1873  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||  ||||| | || || || | | ||||||| || || ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||  |||| | |||||  ||    
T  1874 agcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagaga 1973  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  1974 agcacaacaagttgatgtc 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 5918
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||||||| |||| || ||||||||      
T  6436 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtccaagatgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttgagga 6337  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6336 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatttagagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggccttacttgtacggtttcagatttgaggt 6237  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6236 gttcagtgatcataaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggt 6137  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  | ||||||||| |  || || || ||||| |    
T  6136 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaaaggagtttgagttgctag 6037  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||  ||||| | || |  || | ||||||||| || ||  |  |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||||||   ||    
T  6036 agcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 5937  T
Q  517 agcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  5936 agcacaacaagttgatgtc 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 48790 - 48312
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| |||||  | ||||  |||||||| || |||||||||     
T  48790 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatccaagatggtaaggtagtagtctatgcttctaggcagttgagaa 48691  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  48690 ttcatgaaaagaattatcgtacacatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagt 48591  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48590 gtttagtgatcacaaaagtctgagatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgagctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggt 48491  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || || ||||| |    
T  48490 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggattttgagttgctag 48391  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    | |||||||||||  ||||| | || || || |  |||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  48390 agcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 48312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Original strand, 80452 - 80930
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  80452 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagag 80551  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  80552 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 80651  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  80652 attcagtgatcacaagagtatgaaatatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 80751  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  80752 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacactacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctgg 80851  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || || | ||  ||||||||  | ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  80852 aacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaataaagttgggcatgctgaagattaatagtga 80930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Original strand, 42723 - 43196
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||| | ||||||||||| || || ||||||    
T  42723 agatgaaccatttgttgtatatcgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaatgataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttg 42822  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  |  | || ||||| |||||  |||  ||||| |||||||    
T  42823 aggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtttttgtacttcaaatttggaggcattatctgtgcggttctagatttg 42922  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  42923 aagtgttcagtaatcataaaagtttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagacagcgaaggtggctagaattgctaaaagattatgactt 43022  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| | ||| || || ||     
T  43023 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaagagttggagttt 43122  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  43123 cttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagat 43196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4435 - 3920
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||      
T  4435 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgtttctaggtagttgagga 4336  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||| || || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||    
T  4335 ttcatgaaaagaattatccaacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccaaatttgaagt 4236  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  4235 gtttagtgatcacaaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggt 4136  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||| |    
T  4135 ttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctag 4036  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||  ||||| | || || || | ||||||||  || ||  |  |||| |||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||| | ||    
T  4035 agcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctc--agagtacagttgggaatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaaga 3938  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  3937 agcacagcaagtagatgt 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Original strand, 11916 - 12183
Alignment:
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  11916 ttcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcagctgtagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggt 12015  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||      
T  12016 gtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaa 12115  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 384  Q
     | | |||||| | ||| || || ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  12116 ctaagttatcatctagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcacatgtc 12183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 486
Target Start/End: Original strand, 38393 - 38517
Alignment:
Q  362 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaa 461  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | ||||||||| | ||| || || ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||  |||||| || |    
T  38393 agtaggaaaacattacatatgtttgttatgatggttaaagagttggagttgcttgtacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcaccacaga 38492  T
Q  462 gcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    | |||||| |||| ||| |||||||    
T  38493 gtgtgaaattgggaatgttgaagat 38517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 146
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  666 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctgggcagttgag 567  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 214  Q
      ||||||| |||||||| ||||| ||| || | |||||||| || || || ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||     
T  566 gattcatgaaaagaattagcctacacataatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagatattatttgtacggttccagatttgaa 467  T
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||    
T  466 gtgtttagtgatcataaaattttgaaatatttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttg 367  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || |  |||||    
T  366 gtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgtgttgct 267  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
    |||| |||| |||||  ||||  | ||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||      
T  266 tgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcaga 167  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  166 gaagcacagcaagttgatgtc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 308 - 719
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  308 gaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagag 407  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||  | |||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||    
T  408 ttcatggaaggaattatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagt 507  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| || | || |||||||| ||||||    
T  508 atttagtgaccataaaagtttaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggt 607  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  608 ttgaattacca-tcgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctag 706  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  707 agcagtttagaga 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 47654 - 48033
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||       
T  47654 gaaccttttgtagtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgatga 47753  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||    
T  47754 ttcatgaaaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagt 47853  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  47854 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 47953  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  47954 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 48033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 396
Target Start/End: Original strand, 56473 - 56846
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  56473 tttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctagacagttgaggattcatg 56572  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    | || ||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |     
T  56573 aaaaaaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaa 56672  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  56673 tgatcaaaagagtctaaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaat 56772  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 396  Q
    || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  56773 taccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgctgcacatgtctgctatgatggt 56846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 55520 - 55962
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||      
T  55520 gaaccgtttgttgtttactgcgatgcttctaagctgggcttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 55619  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  55620 ttcatgaaaagaattctcgtacgcatgatctggagttggctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 55719  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  55720 gttcagtgatcataagagtatgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 55819  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  55820 ttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctag 55919  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||| || | |||||||||    
T  55920 aacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctca 55962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Original strand, 32297 - 32792
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  32297 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 32396  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32397 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 32496  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||     
T  32497 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 32596  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  |||||||| |||||||    
T  32597 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttg 32696  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || || ||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  32697 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 32792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41938 - 41519
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  41938 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 41839  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  41838 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 41739  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  41738 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 41639  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  41638 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 41539  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  41538 ttcgagacttgagtttggtt 41519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Original strand, 50491 - 51013
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  50491 agatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttg 50590  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  50591 aggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttg 50690  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | || || |||||||| || |||||||| ||| |||| ||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||| ||    
T  50691 aagtattcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattt 50790  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||    
T  50791 tgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttg 50890  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    || ||||||||||||||  ||||| | || || || | ||||||||| || ||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| |    
T  50891 ctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggctatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatta 50990  T
Q  513 aggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
      ||||||||  |||||||||||    
T  50991 gagaagcacatcaagttgatgtc 51013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28295 - 27871
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  28295 tattgtgatgcttccaagttgggcttaggtggtttttttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaatt 28196  T
Q  132 atcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaa 231  Q
    ||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28195 atcctacacatgatttggattttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaa 28096  T
Q  232 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcaccca 331  Q
     ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  28095 aagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca 27996  T
Q  332 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagata 431  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| || ||||||| |||      
T  27995 ggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagca-gaagacgttggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagact 27897  T
Q  432 tgagtttggtttgcgaatggtcacct 457  Q
    ||||| | |||||||| | |||||||    
T  27896 tgagtcttgtttgcgagttgtcacct 27871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 59834 - 60276
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||  | ||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  59834 gaaccttttgttgtttattgtgatgcttccaagttcggattgggtggtgttttgatgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggg 59933  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  59934 tacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 60033  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  60034 gttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 60133  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  ||||||  ||||| | ||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| |    
T  60134 ttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctag 60233  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  60234 aacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctca 60276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 50800 - 51242
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||  | ||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  50800 gaaccttttgttgtttattgtgatgcttccaagttcggattgggtggtgttttgatgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggg 50899  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  50900 tacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 50999  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| || |||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  51000 gttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 51099  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  ||||||  ||||| | ||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| |    
T  51100 ttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctag 51199  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  51200 aacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctca 51242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 66222 - 66664
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||  | ||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  66222 gaaccttttgttgtttattgtgatgcttccaagttcggattgggtggtgttttgatgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggg 66321  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  66322 tacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 66421  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| || |||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  66422 gttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 66521  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  ||||||  ||||| | ||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| |    
T  66522 ttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctag 66621  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  66622 aacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctca 66664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 459
Target Start/End: Original strand, 6783 - 7207
Alignment:
Q  35 tgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatc 134  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6783 tgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatc 6882  T
Q  135 ctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 234  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6883 ctacgcacgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaag 6982  T
Q  235 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggt 334  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||    
T  6983 cttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggt 7082  T
Q  335 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatga 434  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||    
T  7083 aaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctga 7182  T
Q  435 gtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||    
T  7183 gccttgtttgtgaattgtcacctca 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 11406 - 11830
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  11406 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 11505  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||  || || || ||||| ||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11506 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttgggtgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggtattatttgtatggttcgagatttgaagt 11605  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  11606 attcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 11705  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||| |    
T  11706 ttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctgg 11805  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggt 441  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  11806 aacagtttagagacatgagtgtggt 11830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42603 - 42191
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||  | |||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  42603 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggaaaggtagtagcttatgcttctaggcagttgagag 42504  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  42503 ttcatgaaaagaattatcctacgcaggatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgt 42404  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||    
T  42403 ttttagtgatcataagagtcttaaatatttatttgattagaaggagtttaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggt 42304  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| ||||| |    
T  42303 ttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctag 42204  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  42203 aacagtttagaga 42191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 302 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26375 - 26143
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26375 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagag 26276  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttct 501  Q
    | ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26275 agttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtgattggtcacctcagattgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 26176  T
Q  502 gaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  26175 gaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgt 26143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3861 - 3346
Alignment:
Q  18 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || || ||  |||||||||||||||| ||  |||||||  |    
T  3861 aaccttttgttgtttattgtgaagcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcatgatggcaaggtggtagcttatgcttctaggaagttgaggat 3762  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 217  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  3761 tcatgaaaagaattattctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtg 3662  T
Q  218 tttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtt 317  Q
    ||||||||||||||   | |||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3661 tttagtgatcacaaatatctgagatatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtt 3562  T
Q  318 tgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttga 417  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  || || || ||||| ||    
T  3561 taaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaaaggagtttgagttgctaga 3462  T
Q  418 acagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaa 517  Q
     || ||||||||  ||||| | || || || | ||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  |||    
T  3461 gcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaa 3362  T
Q  518 gcacagaaagttgatg 533  Q
    |||||| |||||||||    
T  3361 gcacagcaagttgatg 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 6899 - 6421
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  6899 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 6800  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  6799 tgcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggt 6700  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||    
T  6699 gttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggt 6600  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||| | |||||| || ||||| |    
T  6599 ttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacacttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctgg 6500  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || || | ||| ||||| ||| |  |  |||| |||||||||||| |||||||    
T  6499 aacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttgggcatgctgaagattaatagtga 6421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 35156 - 34714
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||||||      
T  35156 gaaccttttgtggtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttgagga 35057  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  35056 ttcacgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagt 34957  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  34956 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 34857  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| | | |||| || ||||| |    
T  34856 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacactgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctag 34757  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |  ||||||||||| ||||| | ||||| |||| | |||||||    
T  34756 agtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctca 34714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28660 - 28461
Alignment:
Q  260 gaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcct 359  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  28660 gaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgt 28561  T
Q  360 tgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| | | |||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||| | |||||||    
T  28560 tgagcaggaagacactgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctca 28461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 420
Target Start/End: Original strand, 95 - 181
Alignment:
Q  334 taaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaaca 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |  || || || |||||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgaaca 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 1
Alignment:
Q  22 ttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  234 ttttgtggtgtattgtgatgcatccaagtttggtttaggcggtgtacttatgcaggatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 135  T
Q  122 gagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttta 221  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  134 gagaagaattacccgactcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgcggtttgaggtgttta 35  T
Q  222 gtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34 gcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 12919 - 13331
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12919 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaagatggtagcttatgcttctaggcagttgagag 13018  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  13019 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 13118  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||| || || ||||||    
T  13119 attcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggt 13218  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||| | ||||| | ||||||||| ||||| |    
T  13219 ttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctag 13318  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||| ||||||||    
T  13319 aacaatttagaga 13331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4801 - 4358
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  4801 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcttccaagttaagcttaggtggtgagcttatgcaggatggcaagatagtagcttatgcatcgagacagttga 4702  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || ||  | || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4701 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctacagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 4602  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| |||||||| || ||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  4601 agtgttcagtgatcataaaagtctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcaaagatggcttgaattgttgaaagattatgatttt 4502  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  || || || || |    
T  4501 gggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagtttc 4402  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacct 457  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| | |||||||    
T  4401 ttgaacaatttagggatttgagcttagtctgcgagttgtcacct 4358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4308
Alignment:
Q  488 gatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  4355 gatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgtc 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 534
Target Start/End: Original strand, 177036 - 177399
Alignment:
Q  171 tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 270  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  177036 tgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaagaaattgaatat 177135  T
Q  271 gaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 370  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||    
T  177136 gaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaag 177235  T
Q  371 acattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaac 470  Q
    || || |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||||| || |||||      
T  177236 acgttacatatgtctgctatgatggttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagt 177335  T
Q  471 tgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||| || |||||| | |||||||||||    
T  177336 tgggtatgttgaagatcaatagtgaattcttgaacagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 177399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 176925 - 176987
Alignment:
Q  16 tgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaaga 78  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||    
T  176925 tgaaccttttgtagtgtattgtgatgcatccaagttgggtttggatgatgtgcttaagcaaga 176987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 523
Target Start/End: Original strand, 593 - 1099
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| || |||| |||||||| || |||||||| |    
T  593 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgctagcgtatgcttctaggcagttgaggg 692  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||    
T  693 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagt 792  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  793 atttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 892  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    || ||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || ||||| |    
T  893 ttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctag 992  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    | |||||||||||  ||||| | ||||| || | |  |||||| || ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||    
T  993 agcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 1092  T
Q  517 agcacag 523  Q
    |||||||    
T  1093 agcacag 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44415 - 44057
Alignment:
Q  71 atgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttg 170  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||    
T  44415 atgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtgtttg 44316  T
Q  171 tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 270  Q
    | || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  44315 ttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaattatttatttgatcagaaggaattgaacat 44216  T
Q  271 gaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 370  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  44215 gaggcagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaag 44116  T
Q  371 acattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  44115 acattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagaga 44057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20806 - 20364
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | || ||||| || ||| |||||||||||||||  || ||||| ||||    
T  20806 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgattcaagatggcaaagtggtagcttatgcttataggcagttaagag 20707  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  20706 ttcatgaaaagaattatcccactcatgatctggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20607  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || |||||||| |||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||     
T  20606 attcagtgatcataagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggc 20507  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || |    
T  20506 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactag 20407  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| | |||||||    
T  20406 aacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctca 20364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 352
Target Start/End: Original strand, 57922 - 58146
Alignment:
Q  128 aattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | |||  | || || |||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  57922 aattatcctactcatgatcttgagttagctacagtagtttatgtacttaaaatttggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatc 58021  T
Q  228 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca 327  Q
    | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  58022 ataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattacca 58121  T
Q  328 cccaggtaaagctaatgttgttgca 352  Q
     || ||||| |||||||||||||||    
T  58122 tccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 27864 - 27977
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||  | | |||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  27864 gatgaaccatttgttgtatactgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggcgtggttatgcagaatgataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttga 27963  T
Q  114 gagttcatgagaag 127  Q
    |  |||||| ||||    
T  27964 ggattcatgtgaag 27977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 444
Target Start/End: Original strand, 58188 - 58261
Alignment:
Q  371 acattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  58188 acattacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaatagttcagagatttgagtttggtttg 58261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 499
Target Start/End: Original strand, 115540 - 116007
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtag---cttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   ||| | |||||   ||||||| || |||||||||||| |||||||    |    
T  115540 tattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcagga---taacaaggtagtgacttatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaa 115636  T
Q  129 attatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatca 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  115637 attatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggttatagatttgaagtgttcagtgatca 115736  T
Q  229 caagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcac 328  Q
     || ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  115737 taaaagtctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagaccacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggattgaattatcat 115836  T
Q  329 ccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagag 428  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| |||  | ||  |||| |||||||||||||    
T  115837 ccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagctggagctgctcgaacagtttagag 115936  T
Q  429 atatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattt 499  Q
    |  ||||||| || || |||| ||||||||| || |||||  | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  115937 acctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgatgattgatagtgaattt 116007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1010 - 598
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  1010 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttaagag 911  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |     
T  910 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagc 811  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  810 gttcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaatggaatatgagacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggt 711  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||| | |||||| || ||||| |    
T  710 ttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 611  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  610 aacagtttagaga 598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 1975 - 2387
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||| | || ||  ||||| |||||||||| | |||||| |||     
T  1975 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaaaatggcaaggtggtatcttatgcttctacacagttaagaa 2074  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  2075 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcagtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 2174  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||| || | || |||||||| ||||||    
T  2175 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggt 2274  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  2275 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctag 2374  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | || ||||||||    
T  2375 agcaatttagaga 2387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8635 - 8334
Alignment:
Q  128 aattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatc 227  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  8635 aattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggaggcactgtttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatc 8536  T
Q  228 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca 327  Q
    |||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  8535 acaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattacca 8436  T
Q  328 cccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttaga 427  Q
     |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  || | ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8435 tcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttaga 8336  T
Q  428 ga 429  Q
    ||    
T  8335 ga 8334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10166
Alignment:
Q  187 acattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10485 acattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttgg 10386  T
Q  287 ctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccg 386  Q
    || || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  10385 ctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctg 10286  T
Q  387 ctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagat 486  Q
    |||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||   ||||||||| || ||||| || || ||||| |||||    
T  10285 ctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaggtgtcacctcagagtgtgaagctagggatgctaaagat 10186  T
Q  487 tgatagtgaatttctgaaaa 506  Q
      |||| || ||||||||||    
T  10185 caatagcgagtttctgaaaa 10166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20040
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| |    
T  20535 gaaccgtttgttgtgtactgtgacgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaggatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 20436  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  20435 tacatgaaaagaattatcctactcacgatttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagt 20336  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  20335 gttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggg 20236  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||    
T  20235 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttg 20136  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| || || ||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  20135 aacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 20040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24697 - 24202
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| |    
T  24697 gaaccgtttgttgtgtactgtgacgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaggatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 24598  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  24597 tacatgaaaagaattatcctactcacgatttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagt 24498  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  24497 gttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggg 24398  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||    
T  24397 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttg 24298  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || || ||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  24297 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 24202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 5858 - 6270
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || || |||||  | |||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||     
T  5858 gaaccttttgtggtttattgtgatgcgtctcaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctagacagttgagaa 5957  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  5958 ttaatgaaaagaattatcctacgcatgatctagagttggctgcggtgatttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagt 6057  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  6058 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggc 6157  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  | ||| | |    
T  6158 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttag 6257  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  6258 agcagtttagaga 6270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  189 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 10677 - 11089
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  | |||||||| || ||| ||  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  10677 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggctcaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgtaagcatatgcttctaggcagttgagag 10776  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || || |||||||| ||    
T  10777 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagt 10876  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||| |||||     
T  10877 atttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggc 10976  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | |||||| || ||||| |    
T  10977 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctag 11076  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  11077 agcagtttagaga 11089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 14447 - 14859
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  | |||||||| || ||| ||  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  14447 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggctcaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgtaagcatatgcttctaggcagttgagag 14546  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || || || || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || || |||||||| ||    
T  14547 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagt 14646  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||| |||||     
T  14647 atttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggc 14746  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | |||||| || ||||| |    
T  14747 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctag 14846  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  14847 agcagtttagaga 14859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21669 - 21362
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  21669 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagaa 21570  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  21569 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggttgtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 21470  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||    
T  21469 atttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggt 21370  T
Q  317 ttgaatta 324  Q
    ||||||||    
T  21369 ttgaatta 21362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 250299 - 249887
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  250299 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 250200  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  250199 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggtttcagatttgaagt 250100  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  250099 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggc 250000  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  249999 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctag 249900  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  249899 aacagtttagaga 249887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 302 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 24868 - 24637
Alignment:
Q  302 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagag 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| | ||    
T  24868 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatggttaaag 24769  T
Q  402 aattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttct 501  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24768 agttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 24669  T
Q  502 gaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatg 533  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24668 aaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatg 24637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 275
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||      
T  680 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagtt 581  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||  | || || ||| | ||       ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  580 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctacggtggtttttttctt-------tggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 488  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||    
T  487 atttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgt 388  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  387 ttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctag 288  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    | |||||||||||    
T  287 agcagtttagaga 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 4956 - 5398
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  4956 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 5055  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5056 ttcatgaaaagaattatcctacacaagatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 5155  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||| | ||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  5156 gttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaggtaattgaatatgaggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggt 5255  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||| |||| || |  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||   ||||||  ||||||| || ||||| |    
T  5256 ttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgcgtagatggtatgagaatttgatttgctag 5355  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  5356 aacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctca 5398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23900 - 23488
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||||     
T  23900 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagaa 23801  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23800 tgcatgagaagaactatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 23701  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||| || | || |||||||| |||||     
T  23700 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggc 23601  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||| | |    
T  23600 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttag 23501  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  23500 aacagtttagaga 23488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20891 - 20668
Alignment:
Q  206 agatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggatt 305  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||| || | || ||||    
T  20891 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagatt 20792  T
Q  306 atgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaatt 405  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |  |||||    
T  20791 atgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatt 20692  T
Q  406 cgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  20691 tgaattgttagaacagtttagaga 20668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 8310 - 8513
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8310 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatggttcgagacagttga 8409  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8410 gaattcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8509  T
Q  214 ggtg 217  Q
    ||||    
T  8510 ggtg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 28215 - 27692
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggta-gcttatgcttcaagacagtt 111  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||  ||||| ||||||||||| || |||||    
T  28215 agatgaaccttttattgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaggtggtaagcttatgcttctaggcagtt 28116  T
Q  112 gagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattt 211  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | | |||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||    
T  28115 gaggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttagtgttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtacggctccagattt 28016  T
Q  212 gaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgact 311  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| || ||| | ||||| ||||| |    
T  28015 gaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatgatt 27916  T
Q  312 ttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaatt 411  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| || ||  |    
T  27915 ttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagct 27816  T
Q  412 gcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatc 511  Q
     |||||||| ||||||||  | ||| | ||||| || | ||||||||| || ||| |  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| ||||||    
T  27815 acttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatc 27716  T
Q  512 aaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |  ||||| |||||| ||||||||    
T  27715 agagaagcgcagaaaattgatgtc 27692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1932
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |  ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  1454 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatataagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcggg 1553  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  1554 ttcatgagaagaactatcctacgcatgatctggagttggccgctgtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggatccagatttgaggt 1653  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||| || |||||||| || |||||     
T  1654 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggc 1753  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||| | | ||||||||||||| | |    
T  1754 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatgataaaagaattcgaattgttag 1853  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 495  Q
    |||||||||||||  ||||| | || || |||  ||||||||| ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  1854 aacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatatagttggggatgctgaagattgatagtga 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 13702 - 14217
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    ||  | || |||||||| || ||||||||||||     
T  13702 gaaccttctgttgtgtattgtgatacgtccaagttggcttt-ggtggtgtgcttatgcaggataacaaggtagtggcttatgcatcgagacagttgagaa 13800  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  13801 ttcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggctctagatttgaagt 13900  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||||  |||||     
T  13901 gttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatttgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatggttttggg 14000  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||| |    
T  14001 ttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagttggagctgctcg 14100  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||||| || | ||||||  | || |||||  | || |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||    
T  14101 aacagtttaaagacctgagtttagtttgtgagttgtcaccatagagtgtgaagttaggaatgcagaagattgatagtgaatttct-taatgtattaaaga 14199  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  14200 agcgcagaaagtcgatgt 14217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35799 - 35422
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| || |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35799 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgatagcgtatgcttctagacagttgagag 35700  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||  || || || |||||||| | ||| || ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  35699 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagtaagccgcggtggtctttgtttagaaaatttggaagcattatttgtacggttccagatttgaagt 35600  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     |||||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| |||| | || |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  35599 atttagtgatcacaaaagtctaaaatattttttcaatcagaaagatttgaacatgaagtagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 35500  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 394  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  35499 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 436
Target Start/End: Original strand, 100188 - 100601
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  100188 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatg 100287  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  100288 aaaagaattatcctacacatgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcag 100387  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |  | ||||| ||  | ||||||||||||    
T  100388 tgatcattaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaat 100487  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    || || |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||| || ||||    
T  100488 taccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagt 100587  T
Q  423 ttagagatatgagt 436  Q
    | |||||| |||||    
T  100588 tcagagatttgagt 100601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181367
Alignment:
Q  347 gttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcg 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  447 aatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctaaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 31939 - 32351
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |  ||||||||      
T  31939 gaaccgtttgtggtttattgtgatgcgtctaagctgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctatgcagttgagga 32038  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  32039 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgttgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 32138  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  32139 gttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggc 32238  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || |  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||| | |    
T  32239 ttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttag 32338  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    || ||| ||||||    
T  32339 aatagtctagaga 32351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1890 - 1608
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  1890 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcgagacaattg 1791  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  | || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  1790 agaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttg 1691  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttg 295  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1690 aggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttg 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8036
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  8318 agatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcgagacaattg 8219  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  | || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  8218 agaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttg 8119  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttg 295  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8118 aggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttg 8036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 1392 - 1596
Alignment:
Q  13 agatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  1392 agatgaaccttttgtggtatattatgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagatagttg 1491  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1492 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 1591  T
Q  213 aggtg 217  Q
    |||||    
T  1592 aggtg 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3270 - 2970
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| || ||| ||||||    
T  3270 gatgaaccgtttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatccaagatggcaaagtagtagcttctgcgtcgagatagttga 3171  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    || ||||||| |  ||||| |||| ||| ||| | |||||||| || || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3170 gaattcatgaaagaaattaccctatgcacgatttagagttggctgctgtggtttttatattgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttga 3071  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||| | || |||||||| |||    
T  3070 ggtgttcagtgatcacacgagtttgaaatatttgttcgataagaaggagttgaatataaggcagcaaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 2971  T
Q  314 g 314  Q
    |    
T  2970 g 2970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 232
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| | |    
T  648 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcggg 549  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |  ||||| ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  548 tacatgagaagaactatcctacgcatgatctggagttggttgtagtagtgtttgttttaaaaatttggagagattatttgtacggttccagatttgaggt 449  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||||||| |||||     
T  448 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 349  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgc----atatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    ||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  348 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattg 249  T
Q  413 cttgaacagtttagaga 429  Q
    ||  |||||||||||||    
T  248 ctataacagtttagaga 232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 444
Target Start/End: Original strand, 85136 - 85566
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||| |  |||||||||| || || |||||||    
T  85136 gatgaaccatttgttgtatactgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaggataataaagtaatagcttatgcatcgaggcagttga 85235  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| |||||  | || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  85236 ggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctacagtagtttttgtacttaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttga 85335  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
      |||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||   |||||||||||| ||     
T  85336 attgttcagcgatcataaaagttttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttc 85435  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || |||||||| || || |||||  |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  85436 gggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagtttgagttgc 85535  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  85536 ttgaacagtttagagacttgagtttggtttg 85566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 92925 - 92834
Alignment:
Q  195 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  92925 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 92834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 332 - 25
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||  | || ||||| || ||| |||||||||||||||| ||  |||||||      
T  332 gaaccgtttgttgtttactgtgatgtgtctaagctgggcttaggaggtgttttgattcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggtagttgagga 233  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  232 ttcatgagaagaattatcccactcatgatctggagttggcggcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 133  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  132 gttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 33  T
Q  317 ttgaatta 324  Q
    ||||||||    
T  32 ttgaatta 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 10077 - 10489
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||  | |||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||| || ||      
T  10077 gaaccgtttgtggtatattgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctagacaattaagga 10176  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  10177 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagt 10276  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||| ||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| |||||     
T  10277 atttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggg 10376  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  |||| | ||||||| | ||||| |    
T  10377 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctag 10476  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  10477 aacagtttagaga 10489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 20291 - 20703
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||  | |||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||| || ||      
T  20291 gaaccgtttgtggtatattgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctagacaattaagga 20390  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  20391 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagt 20490  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
     ||| ||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| |||||     
T  20491 atttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggg 20590  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  |||| | ||||||| | ||||| |    
T  20591 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctag 20690  T
Q  417 aacagtttagaga 429  Q
    |||||||||||||    
T  20691 aacagtttagaga 20703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Original strand, 15333 - 15752
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||  ||||||| |||||||| || |||||| | |    
T  15333 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaatttgggcttaggtggtgttctgatgcaagattgtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 15432  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||| |   |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15433 ttctttttaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 15532  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||| ||||||| || ||||||||||| |||||     
T  15533 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 15632  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| | |||||| |||||| | |    
T  15633 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttag 15732  T
Q  417 aacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  15733 aacagttcagagacatgagt 15752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 311 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10829 - 10606
Alignment:
Q  311 tttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaat 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |    
T  10829 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaatttgagt 10730  T
Q  411 tgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtat 510  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || | ||| ||||| || |||||  || ||||| |||||||  | ||||||||  |||| |||||    
T  10729 tgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacagtat 10630  T
Q  511 caaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
     || ||||| ||||||||||||||    
T  10629 taaagaagcgcagaaagttgatgt 10606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 10509 - 10864
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  10509 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctaatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 10608  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||| |  ||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10609 tccatgaaaagaatgatcctacacatgatttgcagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggt 10708  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||    
T  10709 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggt 10808  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    |||||||| || |  |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  10809 ttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16448
Alignment:
Q  351 cagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatg 450  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| | || || ||||     
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  451 gtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    |||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||| |||  ||||||||  |||||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgtc 16448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6724
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | ||||||||        ||||||| |||||||| || ||| | |    
T  6310 gatgaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaaga--------tggtagcgtatgcttctaggcagctaa 6401  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6402 gagtgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttctagatttga 6501  T
Q  214 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 313  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| | ||| |  | ||||||||||| |||    
T  6502 agtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttatttgaacagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgatttt 6601  T
Q  314 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgc 413  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||    
T  6602 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgc 6701  T
Q  414 ttgaacagtttagagatatgagt 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  6702 ttgaacagtttagagatttgagt 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 442
Target Start/End: Original strand, 248 - 469
Alignment:
Q  221 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   ||||    
T  248 agtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcataaggagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatctcaaggactttgattttcagttga 347  T
Q  321 attatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaaca 420  Q
     |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |||| ||    
T  348 gttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtccgctttgatggttaaagagttcgaattgattgagca 447  T
Q  421 gtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  448 gtttcgagatttgagtttggtt 469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 2501 - 2920
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  2501 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 2600  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  2601 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 2700  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  2701 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 2800  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  2801 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 2900  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  2901 ttcgagacttgagtttggtt 2920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25074 - 24655
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  25074 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 24975  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  24974 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 24875  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  24874 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 24775  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  24774 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 24675  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  24674 ttcgagacttgagtttggtt 24655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14588 - 14169
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  14588 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 14489  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  14488 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 14389  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  14388 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 14289  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  14288 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 14189  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  14188 ttcgagacttgagtttggtt 14169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 519
Target Start/End: Original strand, 9650 - 10138
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttca-agacagttg 112  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||    ||  | || |||||||| ||  |||||||||    
T  9650 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttagatggtgtgcttatgcacgataacaaggtagtggcttatgcatctgagacagttg 9749  T
Q  113 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 212  Q
    ||| |||| ||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  9750 agaattcaggaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtaattaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttg 9849  T
Q  213 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactt 312  Q
    | |||||                  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||    
T  9850 aagtgtt------------------gtagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 9931  T
Q  313 tggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattg 412  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||    
T  9932 tgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagaattggagctg 10031  T
Q  413 cttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 512  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || || |||  ||||||  | || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10032 cttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaatagtatta 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25506 - 25087
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  25506 tttgttgtatattgtgatgctgctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatg 25407  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||| | || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  25406 agaagaattattcgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctttatggttcgaagtttgaggtgttcag 25307  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  25306 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 25207  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  25206 tatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 25107  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  25106 ttcgagatttgagtttggtt 25087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 133184 - 133534
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||| | || ||||   |||| || | ||  |||||||| ||||| || |    
T  133184 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatctggctcatgatttggaattggtcaccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 133283  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  133284 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 133383  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| ||| || |  || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  133384 atatcttaaggattttgattttcagttgagttaacatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 133483  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | |||||| |||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||||    
T  133484 atggttaaagaattagaattgattgagaagtttcgagacttgagtttggtt 133534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28619 - 28177
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| | |||  | ||||| |||||||| || || ||| | |    
T  28619 gaaccatttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatgataaggtagtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 28520  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  28519 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggt 28420  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||     
T  28419 gttcagtgatcataaaagtttgaattatttatttgaccagaaggaacttaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 28320  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || |  ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | |||||| |||||| | |    
T  28319 ttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttag 28220  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    || ||||||||||  ||||| | || || |||| |||||||||    
T  28219 aaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctca 28177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 317 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5417 - 5200
Alignment:
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  5417 ttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgcttg 5318  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || || |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||    
T  5317 aacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaaga 5218  T
Q  517 agcacagaaagttgatgt 534  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  5217 agcgcagaaaattgatgt 5200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 72799 - 72450
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  | |||||| ||||| ||||    
T  72799 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcat-gaagatttggaggcatt 72701  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  72700 atctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 72601  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| ||||||||| || || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  72600 atatcttaaggactttgattttcagttgatttatcaccccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 72501  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| |  || || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  72500 atggttaaggagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 72450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25555 - 25223
Alignment:
Q  110 ttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||   ||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |  |    
T  25555 ttgaaagtgcatgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtgaatgcattgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagt 25456  T
Q  210 ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||||| |||    
T  25455 ttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttga 25356  T
Q  310 ctttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaa 409  Q
     |||   |||| |||||| |  || || |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |  || || |||    
T  25355 ttttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaatgagtttgaa 25256  T
Q  410 ttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  25255 ttgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 25223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16024 - 15705
Alignment:
Q  110 ttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||   ||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |  |    
T  16024 ttgaaagtgcatgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtgaatgcattgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagt 15925  T
Q  210 ttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||||| |||    
T  15924 ttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttga 15825  T
Q  310 ctttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaa 409  Q
     |||   |||| |||||| |  || || |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||    
T  15824 ttttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 15725  T
Q  410 ttgcttgaacagtttagaga 429  Q
    ||| |||| |||||| ||||    
T  15724 ttgattgagcagtttcgaga 15705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6820 - 6628
Alignment:
Q  94 ttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattac 193  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||   || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| |||||     
T  6820 ttatgcttcaaggaagttgaaagtgcattagaagaattatccgactcatgattaggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattat 6721  T
Q  194 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
     |||||||||| |  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||    
T  6720 ctgtatggttctaagtttgatttgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgcggcaaagaagatgg 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 396
Target Start/End: Original strand, 32108 - 32412
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| ||||  || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||||||| ||||  ||||    
T  32108 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcttgagaagaactatctgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaagcatt 32207  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||| ||| | ||    
T  32208 atctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagaatttgaagtacttgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggttgga 32307  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||| |||  || |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  32308 atatcttaagcatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 32407  T
Q  392 atggt 396  Q
    |||||    
T  32408 atggt 32412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6854 - 6435
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  6854 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 6755  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||| ||| || | ||  ||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  6754 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggtcgttgtgtatgcattgaaaatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 6655  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  6654 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 6555  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||| |  || || |||||| |||| ||||    
T  6554 tatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtctttgcatatgtctgctttgatggttaatgagttggaattgattgagcagt 6455  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  6454 ttcgagacttgagtttggtt 6435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19658 - 19308
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| || | ||  |||||||| ||||||||||    
T  19658 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggagacatt 19559  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  19558 atctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 19459  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||| ||    
T  19458 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgcttttagtagaaagactttgcatatgtttgctttg 19359  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  19358 atggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 19308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Original strand, 20197 - 20457
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  20197 gaaccttttgttgtttattgtgacgcgtccaagttgggcttaggcggtgttttgatgcaagacggtaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagag 20296  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  20297 ttcatgaaaagaattatcctacacgtgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20396  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 277  Q
     || |||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20397 attcagtgatcaaaaaagtctaaaatatttatttgatcataaggaattgaacatgaagcag 20457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27311
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  26892 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgctccaaggcagttgaaagtgcatg 26991  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | |   |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  26992 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatacattgaagatttggaggcaatatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 27091  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |    
T  27092 tgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagt 27191  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  27192 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 27291  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  27292 ttcgagatttgagtttggtt 27311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 16259 - 16609
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  || ||||||||||||| || |||||| | || ||||| || || || | |   |||||||| ||||| ||||    
T  16259 gcttatgcttcatggcagttgaaagtggatcagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatacattgaagatttggaggcatt 16358  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    | ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  16359 atttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 16458  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  16459 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttg 16558  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | ||| || || ||| |||| ||||||  |||  |||||||||||    
T  16559 atggttaaagagtttgagttgattgagcagtttcaagacttgagtttggtt 16609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 442
Target Start/End: Original strand, 25658 - 25927
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25658 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25757  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| |  || || |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  25758 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctctgagtagaaagac 25857  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
     ||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||| |||| |||||  ||||| || ||||||||    
T  25858 tttgcatatgtttgctttgatggttaaagaattggaattgattgagcagttacgagatttgtgtttggtt 25927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3118 - 2763
Alignment:
Q  173 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 272  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  3118 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacatga 3019  T
Q  273 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 372  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| ||| | |||||||||||  |||| |||||||     
T  3018 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagat 2919  T
Q  373 attgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactg 472  Q
     ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||||||  ||||| | || || |||| | ||||||| || ||  |  ||    
T  2918 gttgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttg 2819  T
Q  473 ggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagt 528  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||   ||||||||| ||||    
T  2818 gggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 723
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | |||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  1142 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcatttgaaagtgcatg 1043  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   ||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  1042 agaagaattatccgactcatgatttggaattggctgccgttgtgtattcattgaatatttggagtcattatctgtatggttctaattttgaggtgttcag 943  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  | |  || ||||| | ||| |||   |||| |    
T  942 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggttgaaatatcttaaggactttgattttcagttgagt 843  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || || ||| |||| ||||    
T  842 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgatttgtttgagcagt 743  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  742 ttcgagacttgagtttggtt 723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 677 - 343
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||  | ||||||||||| || ||  |||||||  | ||||    
T  677 tttgttgtatattgtgatgcatctaagttgggtttaggcggtgtgcttatgcaggacaataaggtagtagcttatgcatcgaggaagttgaggatccatg 578  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | || |||||| | ||||| ||||| |||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  577 aacgtaattaccctactcatgatcttgagttggcagcaatggtttttgtgcttaagatttggaggcattatctgtattgttctagatttgaagtgttcag 478  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||||||    
T  477 tgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggctggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaat 378  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 357  Q
    || || || |||||  |||||||||||||||||||    
T  377 taccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 8876 - 8521
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| || || || | |   |||| ||| | ||| ||||    
T  8876 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggctgctgttgtgtattcattgatgattttgaggcatt 8777  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | ||    
T  8776 atttgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaatatggttgga 8677  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  8676 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttg 8577  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcga 447  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  8576 atggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagtttggttagcga 8521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 5970 - 6468
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||      
T  5970 gaaccttttgttgtctattgtgatgcatc-aagttgcgcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 6068  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| ||    
T  6069 ttcatgaaaagaattatcctacagatgatttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagt 6167  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| | ||      
T  6168 gtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatga-tctg-- 6264  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
                   |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || || || || |    
T  6265 ---------------ggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctag 6349  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||  ||||| | || || || | ||||||||| || ||  |  |||||||| |||||| | ||||||| ||  |||| ||||||   ||    
T  6350 aacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgaga 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 10401 - 10899
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||      
T  10401 gaaccttttgttgtctattgtgatgcatc-aagttgcgcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 10499  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| ||    
T  10500 ttcatgaaaagaattatcctacagatgatttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagt 10598  T
Q  217 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| | ||      
T  10599 gtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatga-tctg-- 10695  T
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
                   |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || || || || |    
T  10696 ---------------ggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctag 10780  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagga 516  Q
    |||||||||||||  ||||| | || || || | ||||||||| || ||  |  |||||||| |||||| | ||||||| ||  |||| ||||||   ||    
T  10781 aacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgaga 10880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 535
Target Start/End: Original strand, 2148 - 2468
Alignment:
Q  215 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 314  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||     
T  2148 gtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttta 2247  T
Q  315 gtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgct 414  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || |||||    
T  2248 gtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgct 2347  T
Q  415 tgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaag 514  Q
    ||| ||||| |||||  ||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||| |  |||||||| |||| ||| | ||||||||  |||  ||||||       
T  2348 tgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccga 2447  T
Q  515 gaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  2448 gaagcacagcaagtggatgtc 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 263 - 535
Target Start/End: Original strand, 89989 - 90261
Alignment:
Q  263 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttga 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  89989 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 90088  T
Q  363 gtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaag 462  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| || |||||||||||  ||||| | || || || |  |||||||| ||    
T  90089 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagag 90188  T
Q  463 cgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     ||  |  |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||||||   ||||||||| |||| ||||||    
T  90189 tgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 90261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 263 - 535
Target Start/End: Original strand, 89311 - 89583
Alignment:
Q  263 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttga 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  89311 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 89410  T
Q  363 gtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaag 462  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||||  ||||| | || || || |  |||||||| ||    
T  89411 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagag 89510  T
Q  463 cgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
     ||  |  |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||||||   ||||||||| |||| ||||||    
T  89511 tgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 89583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 492594 - 492389
Alignment:
Q  14 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  492594 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgttgaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 492495  T
Q  114 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |  |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  492494 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatgaagacattatttgtacggttctagatttga 492395  T
Q  214 ggtgtt 219  Q
     |||||    
T  492394 agtgtt 492389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 10889 - 10550
Alignment:
Q  108 agttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgag 207  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || | ||  |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||| |     
T  10889 agttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaggatttggaggcataatttgtatggttctaa 10790  T
Q  208 atttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattat 307  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | || |  || || |||| |    
T  10789 gtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcatagaagatggttggaatatcttaatgatttt 10690  T
Q  308 gactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcg 407  Q
    || |||   |||| |||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |    
T  10689 gattttcagttgagttatcaccctaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttgg 10590  T
Q  408 aattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcga 447  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  10589 aattgattgagcagttttgagacttgagtttggttagcga 10550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 2579 - 2997
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2579 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 2678  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||| | | || ||||||||||| || | |   |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  2679 agaagaattatccgactcatgtt-tggaattggcggccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaag 2777  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |    
T  2778 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 2877  T
Q  323 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 422  Q
    ||||| || |  || ||||||||  |||  ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||    
T  2878 tatcatcccgcgaaggctaatgtatttgttgatgctttgagtagaaagactttacatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattggttgagcagt 2977  T
Q  423 ttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  2978 ttcgagacttgagtttggtt 2997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3613 - 3474
Alignment:
Q  16 tgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgaga 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3613 tgaaccttttgtgatatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacaattgaga 3514  T
Q  116 gttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttgg 155  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  3513 attcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttgg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 96622 - 96423
Alignment:
Q  245 ttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||    
T  96622 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 96523  T
Q  345 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  96522 tagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagagacatgagtttggtttg 96423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 430
Target Start/End: Original strand, 24699 - 24909
Alignment:
Q  220 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttg 319  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  24699 tagtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttg 24798  T
Q  320 aattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaac 419  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||| ||||| || |    
T  24799 aattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagc 24898  T
Q  420 agtttagagat 430  Q
    |||||||||||    
T  24899 agtttagagat 24909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 442
Target Start/End: Original strand, 7601 - 7935
Alignment:
Q  108 agttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgag 207  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   || |||||||| ||||||||  |||||||||| |     
T  7601 agttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattaaagatatgaagacattaactgtatggttctaa 7700  T
Q  208 atttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattat 307  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||||  || ||||||| |    
T  7701 gtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcagagaagatggttggagtatcttaaggatttt 7800  T
Q  308 gactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcg 407  Q
    || |||   |||| |||||| || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||  | |    
T  7801 gattttcagttgagttatcatcccgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtacaaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagatgg 7900  T
Q  408 aattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || || || | |||||| ||||| |||||||||||    
T  7901 aactgattaagcagtttcgagatttgagtttggtt 7935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 64 - 370
Alignment:
Q  228 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca 327  Q
    |||| |||||||  ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  64 acaaaagtttgagatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaatacca 163  T
Q  328 cccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttaga 427  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| |||||||||||     
T  164 tccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagg 263  T
Q  428 gatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaag 527  Q
    ||  | ||| | || || |||| |||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||    
T  264 gacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaag 363  T
Q  528 ttgatgt 534  Q
    |||||||    
T  364 ttgatgt 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 429
Target Start/End: Original strand, 14157 - 14331
Alignment:
Q  254 cagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcag 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||  ||||| |||||||    
T  14157 cagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca-gtaaagacaatgtggttgcag 14255  T
Q  354 atgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  14256 atgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 429
Target Start/End: Original strand, 22336 - 22510
Alignment:
Q  254 cagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcag 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||  ||||| |||||||    
T  22336 cagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca-gtaaagacaatgtggttgcag 22434  T
Q  354 atgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  22435 atgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 13959 - 14155
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||      
T  13959 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtcgaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaaccggtagcttatgcttctaggcagttgagga 14058  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||| | |||||  | || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14059 ttcaagaaaagaattatcctacacatgatttagagttaactgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 22138 - 22334
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagag 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||      
T  22138 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtcgaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaaccggtagcttatgcttctaggcagttgagga 22237  T
Q  117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 213  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||| | |||||  | || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22238 ttcaagaaaagaattatcctacacatgatttagagttaactgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 22334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 429
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4484
Alignment:
Q  256 gaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagat 355  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  4311 gaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggat 4410  T
Q  356 gccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    || ||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||| | |||||| || || || ||| ||||||||||    
T  4411 gcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagaga 4484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18009 - 17850
Alignment:
Q  374 ttgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||| || ||||| || |    
T  18009 ttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtatgc-aattgtcacctcatagtgtgaagctag 17911  T
Q  474 gtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  17910 gaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgatgt 17850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 226 - 96
Alignment:
Q  15 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgag 114  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  226 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgag 127  T
Q  115 agttcatgagaagaattatcctacgcatgat 145  Q
      ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  126 gattcatgaaaagagttatcctacacatgat 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  194 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 288  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  95 ttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Original strand, 11405 - 11599
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||| || | |   |||||||| | ||| ||||    
T  11405 gcttatgcttcaagacagatgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggccgccgttgtgtatacattgaagatttagaggcatt 11504  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 286  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  11505 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 11599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 442
Target Start/End: Original strand, 13509 - 13859
Alignment:
Q  92 gcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatt 191  Q
    ||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||| || || |||||| | || ||||| | ||| || | ||  |||||||| ||||| ||||    
T  13509 gcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcgtgagaagaattaaccgactcatgatttggaattggccggcgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 13608  T
Q  192 acttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctaga 291  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| |||   |||||||| | ||    
T  13609 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatggggccaagaagatggttgga 13708  T
Q  292 gttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatg 391  Q
     |  || ||||||| ||| |||   | || |||||| || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||    
T  13709 atatcttaaggattttgattttcagtggagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttaagtagaaagactttgcataagtttgctttg 13808  T
Q  392 atggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    ||||| | |||||| |||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  13809 atggttaaagaattggaattgattgagcagttacgagatttgagtttggtt 13859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1054 - 865
Alignment:
Q  345 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttg 444  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||    
T  1054 ttgtagcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttaagagatttgagtttagtctg 955  T
Q  445 cgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||   |||| || |||| ||||| || || || |  |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  954 cgagatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatccaaaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaggcacataaaattgatgt 865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4128 - 3805
Alignment:
Q  119 catgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgt 218  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||  |||| || | ||  |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||    
T  4128 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcctccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgt 4029  T
Q  219 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggttt 318  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   ||    
T  4028 tcatttaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagtt 3929  T
Q  319 gaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaa 418  Q
    || |||||  || || || ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||| ||||     
T  3928 gagttatcttcccgggaaggctaatgttgttattgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtttgctttgatggttaaagaattggaattgattgag 3829  T
Q  419 cagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||    
T  3828 cagttacgagatttgattttggtt 3805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 1572 - 1777
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  || |  |  ||||||||||||| || ||||||| ||| || |    
T  1572 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttatagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcacg 1671  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| |  |||||| | || |||| ||| || || | ||  |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  1672 agaagaattatccgaatcatgatttggaattggtggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcag 1771  T
Q  223 tgatca 228  Q
    ||||||    
T  1772 tgatca 1777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34776 - 34675
Alignment:
Q  141 atgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 240  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  34776 atgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctgaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaa 34677  T
Q  241 gt 242  Q
    ||    
T  34676 gt 34675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 362 - 525
Target Start/End: Original strand, 4557 - 4720
Alignment:
Q  362 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaa 461  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||| || || |    
T  4557 agtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgcgaagtgtcgccgcaga 4656  T
Q  462 gcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaa 525  Q
    | |||||| | || ||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  4657 gtgtgaaattaggaatgctgaaggtccacagtgaatttttgaatagtatcaaagaagctcagaa 4720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 622 - 760
Alignment:
Q  18 aaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagt 117  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||  | || || |||||||| |||||| |||| ||    
T  622 aaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggtctaggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtagtggcgtatgcttctagacagctgagggt 721  T
Q  118 tcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggc 156  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  722 acatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggc 760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1678
Alignment:
Q  23 tttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatg 122  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||  |  |  || | || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  1428 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgctaagttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 1527  T
Q  123 agaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 222  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||| || || || | ||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||  |||| ||    
T  1528 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatgcattgaagattttgagacattatttgtatggttctaagtttgaaatgttcag 1627  T
Q  223 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 273  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||    
T  1628 tgaccacaagagtttaaagtacttgtttgataagaaatagttgaatatgag 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 534
Target Start/End: Original strand, 1 - 71
Alignment:
Q  464 gtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  1 gtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacatagagttgatgt 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 194917 - 194804
Alignment:
Q  32 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaatt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  194917 tattgtgatgcgtctaagttgggcttcggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaatt 194818  T
Q  132 atcctacgcatgat 145  Q
    ||||||| ||||||    
T  194817 atcctacacatgat 194804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 336 - 535
Target Start/End: Original strand, 1 - 200
Alignment:
Q  336 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgag 435  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||  |||     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  436 tttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    | | ||||| || | ||||||||| || ||| |  |||||||| |||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacataaaattgatgtc 200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1975 - 1845
Alignment:
Q  404 ttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctga 503  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||   |||| || | || |||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1975 ttcgagttacttgaacattttagagatttgagtttggtatgtgagatgtcatctgatagtgtgaagttaggaatgttgaagattgatagtgaatttctga 1876  T
Q  504 aaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgt 534  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1875 agagtattaaagaagcacagaaagttgatgt 1845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15668 - 15329
Alignment:
Q  93 cttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacatta 192  Q
    |||||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||| | || || | | | || || | ||  |||||||| ||||| |||||    
T  15668 cttatgcttcgaggcagttgaaagtgaatgagaagaattatccgactcatgatttggaattagtgacagttgtgtatgcattgaagatttggaggcatta 15569  T
Q  193 cttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagag 292  Q
      |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||| |||||| ||        ||||    
T  15568 tctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatattaggcagaga--------agag 15477  T
Q  293 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 392  Q
    |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  || |||    
T  15476 tatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgc--atgtcttctttga 15379  T
Q  393 tggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    |||| | ||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15378 tggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtt 15329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 455 - 535
Target Start/End: Original strand, 2872 - 2952
Alignment:
Q  455 cctcaaagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 535  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  2872 cctcagagtgtgaaactaggaatgctgtagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtc 2952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11977
Alignment:
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |  ||||||| | |||||| || ||||| |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  417 aacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctca 459  Q
    |||||||||| ||  ||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctca 11977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45803 - 45606
Alignment:
Q  245 ttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatg 344  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || ||||| ||||    
T  45803 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaataccttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagcgaatg 45704  T
Q  345 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtt 442  Q
    || |||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |  || || |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  45703 tttttgctgatgctttgagtaaaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaggagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtttggtt 45606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8558 - 8437
Alignment:
Q  317 ttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttg 416  Q
    |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||  || ||||||| | ||| || |||||| |||    
T  8558 ttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactttgcatatgtctcctttgatggttaaagagttggaattgattg 8459  T
Q  417 aacagtttagagatatgagttt 438  Q
    | |||||| ||||  |||||||    
T  8458 agcagtttcgagacctgagttt 8437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Original strand, 8897 - 8947
Alignment:
Q  227 cacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  8897 cacaagagtttgaagtacttgttcgatcaaaaggcgttgaatatgaggcag 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 429
Target Start/End: Original strand, 48168 - 48238
Alignment:
Q  359 ttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagaga 429  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  48168 ttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacggtttagaga 48238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33699 - 33643
Alignment:
Q  89 gtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgat 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  33699 gtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacgagaagaattatccgactcatgat 33643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24799 - 24738
Alignment:
Q  17 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaaga 78  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||    
T  24799 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggtggtgtgttgatgcaaga 24738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University