View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6898_low_9 (Length: 245)

Name: NF6898_low_9
Description: NF6898
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6898_low_9
NF6898_low_9
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-236)||(111553-111788)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-236)||(16629581-16629816)
chr4 (1-207)||(17828312-17828518)
chr4 (1-207)||(17837703-17837909)
chr4 (1-236)||(16210947-16211181)
chr4 (59-236)||(44888847-44889023)
chr4 (1-236)||(7846527-7846762)
chr4 (1-230)||(16396971-16397199)
chr4 (1-207)||(53946092-53946297)
chr4 (59-196)||(2829653-2829790)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-236)||(45190885-45191120)
chr2 (1-231)||(37862800-37863030)
chr2 (1-236)||(574313-574548)
chr2 (1-236)||(12570635-12570868)
chr2 (1-237)||(22687448-22687680)
chr2 (1-141)||(16902674-16902814)
chr2 (1-141)||(16996065-16996205)
chr2 (1-236)||(3605701-3605933)
chr2 (125-230)||(21109457-21109561)
chr2 (162-230)||(69861-69928)
chr2 (174-207)||(16902641-16902674)
chr2 (174-207)||(16996032-16996065)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (1-236)||(27274154-27274389)
chr5 (4-236)||(31916863-31917095)
chr5 (1-236)||(22173225-22173460)
chr5 (1-236)||(34130462-34130697)
chr5 (1-236)||(13571653-13571888)
chr5 (1-207)||(30943798-30944004)
chr5 (1-236)||(37298787-37299022)
chr5 (1-236)||(37817646-37817881)
chr5 (1-207)||(30953220-30953426)
chr5 (1-236)||(4037952-4038187)
chr5 (1-207)||(37548609-37548813)
chr5 (9-208)||(18209806-18210005)
chr5 (9-208)||(18219144-18219343)
chr5 (1-208)||(19888353-19888560)
chr5 (9-208)||(21681703-21681902)
chr5 (1-207)||(37648003-37648207)
chr5 (1-229)||(20764404-20764630)
chr5 (1-229)||(42090498-42090724)
chr5 (1-237)||(205451-205684)
chr5 (150-236)||(19780782-19780867)
chr5 (37-224)||(20897034-20897220)
chr5 (37-236)||(20904508-20904706)
chr5 (125-236)||(21483780-21483890)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (1-236)||(20744843-20745078)
chr3 (1-207)||(2489368-2489574)
chr3 (1-207)||(13119767-13119973)
chr3 (1-236)||(19828012-19828247)
chr3 (1-207)||(4782770-4782976)
chr3 (1-236)||(20293083-20293316)
chr3 (1-231)||(51978540-51978769)
chr3 (1-236)||(12376600-12376834)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (2-236)||(23211-23445)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (1-236)||(951-1186)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-236)||(31991429-31991664)
chr8 (1-236)||(33773907-33774142)
chr8 (1-207)||(13674302-13674508)
chr8 (1-236)||(14881464-14881699)
chr8 (1-236)||(14893814-14894049)
chr8 (1-236)||(31999019-31999254)
chr8 (1-236)||(20531098-20531331)
chr8 (1-231)||(5759449-5759677)
chr8 (1-231)||(23014788-23015016)
chr8 (59-236)||(11430446-11430622)
chr8 (125-230)||(31224485-31224589)
chr8 (196-236)||(20851721-20851761)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (1-236)||(24540599-24540834)
chr7 (1-231)||(19585823-19586053)
chr7 (5-207)||(27988567-27988769)
chr7 (1-236)||(45553250-45553485)
chr7 (1-236)||(10415750-10415983)
chr7 (26-236)||(12491404-12491613)
chr7 (1-216)||(12515187-12515401)
chr7 (125-236)||(9007108-9007218)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (1-236)||(24505178-24505413)
chr6 (1-207)||(26020910-26021116)
chr6 (1-208)||(1596503-1596710)
chr6 (1-236)||(16321358-16321591)
chr6 (1-236)||(16333506-16333739)
chr6 (37-236)||(18712051-18712250)
chr6 (57-236)||(18706116-18706295)
chr6 (1-230)||(26168416-26168656)
chr6 (26-236)||(790997-791206)
chr6 (59-221)||(17824204-17824366)
chr6 (1-159)||(30657981-30658137)
chr6 (182-236)||(30657931-30657984)
chr6 (152-207)||(18201430-18201486)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-236)||(1745-1980)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (1-236)||(628-863)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (1-237)||(20317819-20318055)
chr1 (1-236)||(20308917-20309152)
chr1 (1-236)||(27066137-27066372)
chr1 (4-224)||(20314482-20314702)
chr1 (1-236)||(26193226-26193451)
chr1 (36-236)||(22960973-22961172)
chr1 (1-236)||(49333394-49333628)
chr1 (37-236)||(25039191-25039390)
chr1 (108-236)||(20328302-20328430)
chr1 (1-236)||(4950577-4950808)
chr1 (1-236)||(25823230-25823464)
chr1 (66-236)||(37012105-37012274)
chr1 (1-190)||(41543915-41544102)
chr1 (140-236)||(25044403-25044499)
chr1 (1-236)||(18096712-18096944)
chr1 (59-190)||(19748364-19748495)
chr1 (134-236)||(21792925-21793026)
chr1 (37-230)||(21821220-21821412)
chr1 (125-221)||(22956760-22956855)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (1-236)||(29070-29305)
scaffold0058 (37-70)||(55415-55448)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (11-207)||(13240-13436)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-231)||(18809-19037)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (1-237)||(146741-146975)
scaffold0014 (65-229)||(114326-114489)
scaffold0014 (1-149)||(153389-153535)
[»] scaffold1468 (1 HSPs)
scaffold1468 (1-236)||(1375-1609)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-231)||(7476-7705)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (109-223)||(4511-4624)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (37-230)||(11397-11589)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (138-236)||(54825-54922)
scaffold0018 (138-236)||(58777-58874)
scaffold0018 (138-236)||(60205-60302)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (134-236)||(15601-15702)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (120-207)||(28545-28631)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (134-183)||(6783-6832)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (196-236)||(16348-16388)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (152-207)||(92647-92703)


Alignment Details
Target: scaffold0031 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 111788 - 111553
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111788 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 111689  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111688 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 111589  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  111588 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 111553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16629581 - 16629816
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629581 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 16629680  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629681 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 16629780  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16629781 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 16629816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17828518 - 17828312
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828518 ctctttcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 17828419  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828418 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaacccatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 17828319  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  17828318 tctgatg 17828312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17837909 - 17837703
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837909 ctctttcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 17837810  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837809 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaacccatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 17837710  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  17837709 tctgatg 17837703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16211181 - 16210947
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  16211181 ctctctcctgcacaatatccaaggaagatttgaatcaactttatcctactttatccagcaatttttgatgcatatggagaagttactttttgctggataa 16211082  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | | | ||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16211081 agcct-aacaaatctcatgtcacgccttgaacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 16210984  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  16210983 ttctgatgaagaacacatcaacattctgatgttcatc 16210947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 236
Target Start/End: Original strand, 44888847 - 44889023
Alignment:
Q  59 caacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44888847 caacttttgatgcatatggagaagttactttttgatggataaag-tccaacaaatctcatgtcacgtattggataaacccagaaactcatcagacattca 44888945  T
Q  158 tccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44888946 tcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aacattctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 44889023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7846762 - 7846527
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaat-tccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagt-aacttttgaaggata 98  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  7846762 ctctctcctgcaccaaaatccaggacatatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgctgcatatggagaagtcaccttttggaggata 7846663  T
Q  99 aaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaac 198  Q
    || |   ||||||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7846662 aagc-ccaacaaatctcatgtcacgtcttgaactagcccagaaactcatctgacattcatcattgaagaacccagatgaagaacatcatgaatat-taac 7846565  T
Q  199 attctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  7846564 attctgatgaagaacacaacaacatgctgatgttcatc 7846527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16396971 - 16397199
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |  ||||||    
T  16396971 ctctctcctgcacaatgaccaagacagatttggttcaactttatcttactttatccagcaacttttaatgcatatgaagaagttactttttggtggataa 16397070  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  16397071 agctc-aacaaatctcatgtcacgtcttgagaaaacccagaaactcatcagactttcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatagatatc-aaca 16397168  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16397169 ttctgatgaagaacacaacaacattctgatg 16397199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53946297 - 53946092
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaac-ttttgaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||    
T  53946297 ctctctcctgcacaaagaccaagacatatttgaatcaactttatcctactttatccagcaacttttgatgcatatggaaaagttactttttggtggataa 53946198  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | |   ||||||||||||| ||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  53946197 agc-ccaacaaatctcatgccacgccttgaacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccatatgaagaacgtcatgaatat-gaaca 53946100  T
Q  200 ttctgatg 207  Q
    ||||||||    
T  53946099 ttctgatg 53946092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Original strand, 2829653 - 2829790
Alignment:
Q  59 caacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||||    
T  2829653 caacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataaagccc-aacaaatctcatgtcacgtattggataaaccgataaactcatcaaacattca 2829751  T
Q  158 tccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaa 196  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2829752 tcattgatgaacctagatgaagaacatcatgaacatcaa 2829790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 45190885 - 45191120
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45190885 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 45190984  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45190985 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 45191084  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45191085 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 45191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37863030 - 37862800
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37863030 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctattttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 37862931  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37862930 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacctagatgaagaacatcaggaatatcaaacat 37862831  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37862830 tctaatgaagaacacaacaacattctgatgt 37862800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 574313 - 574548
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  574313 ctctctcctgcaccaaatccaagacaaatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaa 574412  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  574413 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatgaacccaggaactcatcagacattcatcctggatgaacctagatgaagaacatcacgaatatcaaacat 574512  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  574513 tctgatgaagaacacatcaacattctgatgttcatc 574548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12570635 - 12570868
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12570635 ctctctcctgcacaaattctaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 12570732  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12570733 acctgaacaaatctcatgtcatgtattggatagacctagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaataccaaacat 12570832  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12570833 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 12570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22687680 - 22687448
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22687680 ctctctcctgcacgaagtccaagacagatttggt--aactttatcctactttt-caagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 22687584  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687583 acctgaagaaatctcatgtcacgtattggatgaacccagaaactcatcaaacattcatcaatgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 22687484  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatct 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  22687483 tctgatgaagaacaca-caacattctgatgttcatct 22687448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16902814 - 16902674
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902814 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 16902715  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaa 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16902714 acttgaacaaatcttatgtcacgtattggatggacccagaa 16902674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16996205 - 16996065
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996205 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 16996106  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaa 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16996105 acttgaacaaatcttatgtcacgtattggatggacccagaa 16996065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3605933 - 3605701
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  3605933 ctctctcctgcaccaagtccaagacagatttgat--aactttatcatactttatccatcaacttttgatggatatggagaagttactttttggtggataa 3605836  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | |   |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3605835 agccc-aacaaatctcatatcacgtattggataaacctagaaactcatcagacattcatcattgatgaacctagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 3605738  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  3605737 ttctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 3605701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Original strand, 21109457 - 21109561
Alignment:
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  21109457 attggataaaccctgaaactcatcatacactcatcaatgataaacccagatgaagatcatgatgaacatc-aacattctgacaaagaacacaacaacgtt 21109555  T
Q  225 atgatg 230  Q
     |||||    
T  21109556 ctgatg 21109561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 69928 - 69861
Alignment:
Q  162 tgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatg 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  69928 tgatgaacccaaatgaagaccatgatgaacatcaa-cattctgatgaagaacataacaacattctgatg 69861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16902674 - 16902641
Alignment:
Q  174 atgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16902674 atgaagaacatcatgaatattaaacattctgatg 16902641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16996065 - 16996032
Alignment:
Q  174 atgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16996065 atgaagaacatcatgaatattaaacattctgatg 16996032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27274389 - 27274154
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274389 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 27274290  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274289 acttgaacaaatcccctgtcatgtattggatggacccaggaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 27274190  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27274189 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 27274154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 31916863 - 31917095
Alignment:
Q  4 tctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaact 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31916863 tctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagaaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaaact 31916962  T
Q  104 tgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31916963 tgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccaggaactcatcagacattcatccttgatgaaccccgataaagaacatcatgaatatcaaacattct 31917062  T
Q  204 gatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  31917063 gatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 31917095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22173460 - 22173225
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173460 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttggttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 22173361  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173360 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaacccatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 22173261  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22173260 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 22173225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34130697 - 34130462
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34130697 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaacttttttctactttttcaagcaacttttgatgcatttggagaagtaacatttgaaggataaa 34130598  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34130597 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggtcccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 34130498  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34130497 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 34130462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13571888 - 13571653
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13571888 ctctctcttgcaccaaatccaagacagatttggttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 13571789  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13571788 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaacccatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 13571689  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13571688 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 13571653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30944004 - 30943798
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944004 ctctttcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 30943905  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943904 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaacccatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 30943805  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  30943804 tctgatg 30943798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37299022 - 37298787
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37299022 ctctctcttgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcttactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggatata 37298923  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37298922 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacccagacactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 37298823  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  37298822 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 37298787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 37817646 - 37817881
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37817646 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttggttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 37817745  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37817746 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaacccatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 37817845  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  37817846 tctaatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 37817881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30953426 - 30953220
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30953426 ctctttcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 30953327  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30953326 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaacccatcagacattcatccttgatgaatccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 30953227  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  30953226 tctgatg 30953220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4038187 - 4037952
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4038187 ctctctccttcaccaaatccaagacatatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaa 4038088  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038087 acttgaacaaatctcaggtcacgtattggatgaactcaggaactcatcagacattcatcctggatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 4037988  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4037987 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 4037952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37548813 - 37548609
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37548813 ctctttcctgcaccaaatccaagacagattt-aatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgca-atggagaagtaacttttgaaggataaa 37548716  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37548715 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacattatgaatattaaacat 37548616  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  37548615 tctgatg 37548609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18210005 - 18209806
Alignment:
Q  9 tgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaac 108  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18210005 tgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataacacttgaac 18209906  T
Q  109 aaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18209905 aaatctcatgtcacgtatggaatggatccagaaactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 18209806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18219343 - 18219144
Alignment:
Q  9 tgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaac 108  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18219343 tgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataacacttgaac 18219244  T
Q  109 aaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18219243 aaatctcatgtcacgtatggaatggatccagaaactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 18219144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19888560 - 19888353
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19888560 ctctctcttgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataac 19888461  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19888460 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggatccagaaactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagagcatcatgaatatcaaacat 19888361  T
Q  201 tctgatga 208  Q
    ||||||||    
T  19888360 tctgatga 19888353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Original strand, 21681703 - 21681902
Alignment:
Q  9 tgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaac 108  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21681703 tgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataacacttgaac 21681802  T
Q  109 aaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681803 aaatctcatgtcacgtatggaatggatccagaaactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 21681902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37648207 - 37648003
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37648207 ctctttcctgcaccaaatccaagacagattt-aatcaactttatcctattttttcaagcaacttttgatgca-atggagaagtaacttttgaaggataaa 37648110  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  37648109 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagacgaagaacattatgaatattaaacat 37648010  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  37648009 tctgatg 37648003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 20764404 - 20764630
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20764404 ctctctcctgcacaaagtccaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 20764501  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20764502 acctgaacaaatctcatgtcacgtattggataaacctagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaataccaaacat 20764601  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgat 229  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  20764602 tccaatgcagaacacagcaacattctgat 20764630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42090724 - 42090498
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42090724 ctctctcatgcaccaagtccaagacagatttggt--aattttatcctactttatccagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaagggtaaa 42090627  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  42090626 acctgaacaaatctcatgtcacgtattggataaactcataaactcatcagacattcatcgttgatgaacctagatgaagaacatcatgaataccaaacgt 42090527  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgat 229  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  42090526 tctggtgaacaacacatcaacattctgat 42090498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 205684 - 205451
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  205684 ctctctcctgcaccaagtccaagacagatttgat--aactttatcctactttatccaacaacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataa 205587  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    |||   ||||||| |||||||||  |||| |   ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  205586 aaccc-aacaaatatcatgtcacaaattgaacaaacctagaaactcataagacattcatcattgatgaacccaaatgaagaacatcatgaatatc-aaca 205489  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatct 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  205488 ttctgatgaagaacacaacaacattctggtgttcatct 205451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 19780782 - 19780867
Alignment:
Q  150 gacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19780782 gacattcatcattgatgaacctagatgaagaacatcatgaatatc-aacattctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 19780867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 20897034 - 20897220
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaactttt-gatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggac 135  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |  | |||||  ||| |||| |||| |   |     
T  20897034 aactttatcctactttatccagcaactttttgatgcatatagagaagtaactttttatggataaagcctaga-aaatcatatggcacgcattgaacaaat 20897132  T
Q  136 ccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  20897133 ccagaaactcatcatacattcatcaaagatgaacccagatgaataacatcataaacatc-atcattcttatgaagaacacaacaacatt 20897220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20904706 - 20904508
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaactttt-gatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggac 135  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || | | |||||  ||| |||  |||| |   ||    
T  20904706 aactttatcctactttatccagcaactttttgatgcaaatggagaagtaactttttatggataaagctcgga-aaatcatatggcacacattgaacaaac 20904608  T
Q  136 ccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccat 235  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  || || || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  20904607 ccagaaattcatcatacattcatcaatgatgaacctagatgaaaaacatcaaaaaaattaa-cgttctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcat 20904509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21483890 - 21483780
Alignment:
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21483890 attggataaacccagaaactcatcatacattcataaataatgaacctagatgaagatcataatgaacatc-aacattttgatgaagaacacaacaacatt 21483792  T
Q  225 atgatgtccatc 236  Q
     |||||| ||||    
T  21483791 ctgatgttcatc 21483780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20745078 - 20744843
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20745078 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctagtttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 20744979  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20744978 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggtcccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 20744879  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  20744878 tctgatgaagaacacagcaaaattctgatgttcatc 20744843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2489574 - 2489368
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2489574 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 2489475  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2489474 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggaccaagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 2489375  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  2489374 tctgatg 2489368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13119973 - 13119767
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13119973 ctctctcctacaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 13119874  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13119873 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatattaaacat 13119774  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  13119773 tctgatg 13119767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19828247 - 19828012
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828247 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 19828148  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828147 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaacccatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 19828048  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  19828047 tctgatgaagaacacatcaacattctgatgttcatc 19828012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4782976 - 4782770
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4782976 ctctctcctgaaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggtgaagtaacttttgaaggataaa 4782877  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4782876 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaaaatcatgaatattaaacat 4782777  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  4782776 tctgatg 4782770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 20293083 - 20293316
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20293083 ctctctcctgcacaaagtccaagacagatttggt--aactttatcctacttttttcagcaacttttgatgcatatggagaagtaaatttttaaggataaa 20293180  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20293181 acctgaacaaatctcaagtcacgtattggacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacctagatgaagaacttcatgaataccaaacat 20293280  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  20293281 tctgatgaagaacacatcaacattctgatgttcatc 20293316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51978769 - 51978540
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaa-ggataa 99  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||    
T  51978769 ctctctcctgcacaaagaccaaggcagatttgaatcaattttatcctactttatccagcgacttttgatgcatatggagaagttacttttttgtggataa 51978670  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | |   |||||||||||||||||   ||| |   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51978669 agccc-aacaaatctcatgtcactccttgaacaaacccagaaacttatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 51978572  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51978571 ttttgatgaagaacacaacaacattctgatgt 51978540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12376600 - 12376834
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttga-tgcatatggagaagtaacttttgaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||  |||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||   ||||||    
T  12376600 ctctctcctgcacaatgtccaagtcagatttggttcaactttatcctactttatccagcaaattttggctgcatatggtgaagttactttttgtggataa 12376699  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | | | ||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  12376700 agcct-aacaaatcttatgtcacgcattgaacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgattaacccaaatgaagaacatcatgaatatc-agca 12376797  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12376798 ttctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 12376834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 23211 - 23445
Alignment:
Q  2 tctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23211 tctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcataatttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaa 23310  T
Q  102 cttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23311 cttgaacaaatctcatgtcacgtattgaatggtcccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacatt 23410  T
Q  202 ctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23411 ctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 23445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 951 - 1186
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  951 ctctctcctgcaccaaatccaagacatatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 1050  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1051 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacccaggaactcaccagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcaagaatatcaaacat 1150  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1151 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31991664 - 31991429
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991664 ctctctcctgcaccaaatccaagacatatttgattcaactttatcttactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 31991565  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991564 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacctagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 31991465  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31991464 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 31991429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33774142 - 33773907
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33774142 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaa 33774043  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33774042 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggattgacccagaaactcatcagactttcatccttgatgatcccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 33773943  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||    
T  33773942 tctgatgaatatcacaacaacattctgatgttcatc 33773907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 13674302 - 13674508
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13674302 ctctttcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 13674401  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13674402 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaacccatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 13674501  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  13674502 tctgatg 13674508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14881699 - 14881464
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881699 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 14881600  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881599 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatctgacattcatccttgataaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 14881500  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14881499 tctaataaagaacacagcaacattctgatgttcatc 14881464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14894049 - 14893814
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14894049 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 14893950  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14893949 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatctgacattcatccttgataaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 14893850  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14893849 tctaataaagaacacagcaacattctgatgttcatc 14893814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31999254 - 31999019
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31999254 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcttactttttcgagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttcgaaggataaa 31999155  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31999154 acttgaaaaaatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatcagacatccatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 31999055  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  31999054 tctgatgaagaacacagcaaaattctgatgttcatc 31999019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20531331 - 20531098
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20531331 ctctctcctgcacaaaatccaagacaaatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 20531234  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531233 acatgaacaaatctcatgtcacgtattggatgaactcagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 20531134  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  20531133 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 20531098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5759449 - 5759677
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  5759449 ctctctcctgcacaatgtccaagacagatttggt--aactttatcctactttatccagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttattaaggataga 5759546  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5759547 atttgaacaaatcttatgtcacgcattggacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 5759646  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5759647 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgt 5759677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23015016 - 23014788
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||    
T  23015016 ctctctcctacaccaaatccaagacagatttggt--aactttatcctactttatccatcaacttttgatgcatatggagaagttactttttggtgaataa 23014919  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23014918 agctc-aacaaatctcatgtcacgtattggataaatccagaaactcatcagatattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaataccaaaca 23014820  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23014819 ttctgatgaagaacacaacaacattatgatgt 23014788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11430622 - 11430446
Alignment:
Q  59 caacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |   ||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  11430622 caacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataaagccc-aacaaatctcatgtcacgccttgaacaaacccagaaactcatcagacattca 11430524  T
Q  158 tccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11430523 tcattgatgaacccagatgaagaacatcatggatatc-aacattctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 11430446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31224589 - 31224485
Alignment:
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31224589 attggataaacccagaaactcatcattcattcataaatgatgaacccatatgaatgtcatgatgaacatcaa-cattctgatgaagaacacaacaacatt 31224491  T
Q  225 atgatg 230  Q
     |||||    
T  31224490 ctgatg 31224485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 20851721 - 20851761
Alignment:
Q  196 aacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  20851721 aacattctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 20851761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24540834 - 24540599
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540834 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 24540735  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540734 acttgaacatatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 24540635  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24540634 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 24540599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19585823 - 19586053
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19585823 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcataaggagaagtaacttttgaaggataaa 19585922  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19585923 acttgaacaaatctcatgtcaagtattggatggtcccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccaaatgaagaacatcatgaatatcaatcat 19586022  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19586023 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgt 19586053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 27988567 - 27988769
Alignment:
Q  5 ctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaactt 104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988567 ctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaactt 27988666  T
Q  105 gaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988667 gaacaaatctcatgtcacgtattggatggatccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctg 27988766  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  27988767 atg 27988769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 45553250 - 45553485
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45553250 ctctctcttgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcttactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 45553349  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45553350 acttgaacaaatctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatctgacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcgtgaatatcaaacat 45553449  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45553450 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 45553485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10415750 - 10415983
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  10415750 ctctctcctgcactaagtccaagactgatttggt--aactttatcctactttatccatcaacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataa 10415847  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10415848 agccc-aacaaatctcatgtcacgtattggataaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacctagatgaagaacatcatgaataccaaaca 10415946  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  10415947 ttctgatgaagaacatagcaacattctgatgttcatc 10415983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 12491404 - 12491613
Alignment:
Q  26 agatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgt 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  12491404 agatttgattcaactttatcctactttatccaacaatttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataaagcct-aacaaatctcatgtcacgc 12491502  T
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
     || ||   ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491503 cttagacaaacctagaaactcatcatacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aacattctgatgaagaacacagcaacatt 12491601  T
Q  225 atgatgtccatc 236  Q
     |||||| ||||    
T  12491602 ctgatgttcatc 12491613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 12515187 - 12515401
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |   |||||  |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  12515187 ctctctcctgcacaatgaccaaggcagatttgattcaactttatcctactttatccaacaacttttgatacatatggagaagttactttttggtggataa 12515286  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | | | ||||||||||||||||||  || ||   ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12515287 agcct-aacaaatctcatgtcacgccttagacaaacctagaaactcatcatacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 12515384  T
Q  200 ttctgatgaagaacaca 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  12515385 ttctgatgaagaacaca 12515401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Original strand, 9007108 - 9007218
Alignment:
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9007108 attggataaacccagaaactcatcatacattcatatatgatgaacccaaatgaagatcttgatgaacatcaa-cattctgatgaagaacacaacaacatt 9007206  T
Q  225 atgatgtccatc 236  Q
     |||||| ||||    
T  9007207 ctgatgttcatc 9007218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24505413 - 24505178
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24505413 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaaatttatcctactttttcaagaaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 24505314  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24505313 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcattagacatttatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 24505214  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24505213 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 24505178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26021116 - 26020910
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26021116 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 26021017  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26021016 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatattaaacat 26020917  T
Q  201 tctgatg 207  Q
    |||||||    
T  26020916 tctgatg 26020910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 1596503 - 1596710
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1596503 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaattaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 1596602  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1596603 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggaccaagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatattaaacat 1596702  T
Q  201 tctgatga 208  Q
    ||||||||    
T  1596703 tctgatga 1596710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16321358 - 16321591
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16321358 ctctctcctgcagaaaatccaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 16321455  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16321456 acatgaacaaatctcatgtcacgtattgaatgaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccaaatgaagaacatcatgaatatcaaacat 16321555  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16321556 tctgatgaagaacacagctacattctgatgttcatc 16321591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16333506 - 16333739
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16333506 ctctctcctgcagaaaatccaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 16333603  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16333604 acatgaacaaatctcatgtcacgtattgaatgaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccaaatgaagaacatcatgaatatcaaacat 16333703  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16333704 tctgatgaagaacacagctacattctgatgttcatc 16333739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18712250 - 18712051
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacc 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18712250 aactttatcctactttttccagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaaacctgaacaaatctcatgtcacgtattggataaacc 18712151  T
Q  137 cagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18712150 cagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaataccaaacattttgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 18712051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18706295 - 18706116
Alignment:
Q  57 agcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18706295 agcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaaacctgaacaaatctcatgtcacgtattggataaacccagaaactcatcagacattc 18706196  T
Q  157 atccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18706195 atcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaataccaaacattttgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 18706116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26168416 - 26168656
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26168416 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttggt--aactttatcctaacttttccagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 26168513  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattgga----------tgg----acccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatca 186  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||          |||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26168514 acctgaacaaatctcatgtcacgtattggataaagccaattggataaagccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatca 26168613  T
Q  187 tgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatg 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26168614 tgaatatc-aacattctgatgaagaacacagcaacattctgatg 26168656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 791206 - 790997
Alignment:
Q  26 agatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgt 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  791206 agatttggttcaactttatcctactttatccagcagctttttatgcatatggagaagttactttttggtggataaaacct-aacaaatctcatgtcacgc 791108  T
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacatt 224  Q
     |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  791107 cttgagaaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaactcagatgaagaacatcatgaatatc-aacattctgatgaagaacacaacaacatt 791009  T
Q  225 atgatgtccatc 236  Q
     |||||| ||||    
T  791008 ctgatgttcatc 790997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Original strand, 17824204 - 17824366
Alignment:
Q  59 caacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |   |||||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17824204 caacttttgatgcatatggagaagttactttttggtgaataaagccc-aacaaatctcatgtcatgtattagataaatccagaaactcatcagacattca 17824302  T
Q  158 tccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaac 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17824303 tcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaataccaaacattctgatgaagaacacagcaac 17824366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30658137 - 30657981
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaac-ttttgaaggataa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  30658137 ctctctcctgcaccaagtccaagacagatttggt--aactttatcctactttatccatcaacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataa 30658040  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatc 159  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  30658039 agc-ccaacaaatctcatgtcacgtattggataaactcagaaactcatcaaacattcatc 30657981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30657984 - 30657931
Alignment:
Q  182 catcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30657984 catcatgaacatcaa-cattctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 30657931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Original strand, 18201430 - 18201486
Alignment:
Q  152 cattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatca-aacattctgatg 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  18201430 cattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacataacaacattctgatg 18201486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1980 - 1745
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1980 ctctctcctgcatgaaatccaagacagatttgaatcaactatatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacctttgaaggataaa 1881  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1880 acctgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcataaatatcaaacat 1781  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1780 tctgataaagaacacagcaacattctgatgttcatc 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 863 - 628
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  863 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgattcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 764  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  763 acttgaacaaatctcatgtcacgtaatggatggtccaagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaaaatcaaacat 664  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  663 tcttatgaagaacagagcaacattctgatgttcatc 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20318055 - 20317819
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20318055 ctctctcctgcaccaaatccaagatagatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaa 20317956  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20317955 acttgaacaaatcttttgtcacgtattggatggtcccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacctagatgaataacatcatgaatatcaaacat 20317856  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatct 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  20317855 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatct 20317819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 20308917 - 20309152
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20308917 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaa 20309016  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20309017 acatgaacaaatctcatgtcacgtattggatgaacctaggaactcatcagacattcatcctggatgaacccagatgaagaacataatgaatatcaaagat 20309116  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20309117 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 20309152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 27066137 - 27066372
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066137 ctctctcttgcaccaaatccaagacatatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 27066236  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066237 acttgaacatacctcatgtcacgtatggaatggacccagaaactcatctgacactcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 27066336  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27066337 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 27066372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 20314482 - 20314702
Alignment:
Q  4 tctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaact 103  Q
    |||| |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20314482 tctcatgcaccaaatccaagacaaatttgtttcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgagggataaaact 20314581  T
Q  104 tgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattct 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20314582 tgaacaaatctcatgttacgtattggatgaacccaggaactcatcagacattcatcctggatgaacctagatgaagaacatcatgaatatcaaacattct 20314681  T
Q  204 gatgaagaacacagcaacatt 224  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  20314682 gatgaagaacacaacaacatt 20314702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26193451 - 26193226
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26193451 ctctctcctacaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactcttgaaggataaa 26193352  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||          |||||    
T  26193351 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcatacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatc----------aacat 26193262  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  26193261 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 26193226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 22960973 - 22961172
Alignment:
Q  36 caactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggac 135  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||   |     
T  22960973 caactttatcccactttatccagcaacttttgatgcttatgaagaagtaactttttaaggataaaacctaaataaatcttatgtcacacattggacaaat 22961072  T
Q  136 ccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccat 235  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22961073 ctagaaaatcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aacattctgatgaagaacacaacaacattatgatgttcat 22961171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 49333394 - 49333628
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||    
T  49333394 ctctctcctgcacaaagaccaaggcagatttggatcaactttatcctactttattcagcaacttttgatgcatatggataagttactttttggtggataa 49333493  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49333494 agctc-aacaaatctcatgtcacgccttgaacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 49333591  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  49333592 ttttgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 49333628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25039390 - 25039191
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggac 135  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  | ||||| | | ||||||||||| ||||||  |||     ||    
T  25039390 aactttatcctactttatccagcaacttttgatgcatatggagaatttactttttggtgaataaagcct-aacaaatctcaggtcacgccttgagcaaac 25039292  T
Q  136 ccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccat 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25039291 ccaaaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcat 25039192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20328430 - 20328302
Alignment:
Q  108 caaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatg 207  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20328430 caaatcttttgtcacgtattggatggtcctagaaactcatcagagattcatccttgatgaacccagatgaataacatcatgaatatcaaacattctgatg 20328331  T
Q  208 aagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20328330 aagaacacagcaacattctgatgttcatc 20328302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 4950577 - 4950808
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  4950577 ctctctcttgcaccaagtccaagacagatttgta---attttatcctactttatctatcaacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataa 4950673  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    |  |  |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4950674 ag-tccaacaaatctcatgtcacgcattggacaaacccagaaactcatcatacattcatcattgatgaactcagatgaagaatatcatgaatatc-aaca 4950771  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4950772 ttttgatgaagaacacatcaacattctgatgttcatc 4950808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25823464 - 25823230
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |   |||||| | |||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  25823464 ctctctcctgcacaataaccaagacatatttggttcaactttatcctactttatccaacaacttttgatgcatatggagaagttactttttggtggataa 25823365  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| ||| |   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25823364 aaccc-aacaaatatcatgtcacgtcttgaacaaacctagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccatatgaagaacatcatgaatatc-aaca 25823267  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||||    
T  25823266 ttctgatgaagaaaacaacaagattctgatgttcatc 25823230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 37012105 - 37012274
Alignment:
Q  66 tgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttga 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37012105 tgatgcatatggagaagttactttttggtggataaagccc-aacaaatctcatgtcacgtattggataaacccagaaactcatcaaacattcatcattga 37012203  T
Q  165 tgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  37012204 tgaacccagatgaagaacatcatgaacatc-aacaatctgatgaagaacacggcaacattctgatgttcatc 37012274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41544102 - 41543915
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||    |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41544102 ctctctcctgcaccaagtccaagacagatttggt--aactttatcccactttatccagcaacttttgatacatatggagaagtaactttttaaggataaa 41544005  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatc-cttgatgaacccagatgaagaacatcatgaa 190  Q
    || ||||||||||| |||||||| | ||||   |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41544004 acctgaacaaatcttatgtcacgcactgga-caacccaacaactcatcagacattcatcatttgatgaacccagatgaagatcatcatgaa 41543915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25044499 - 25044403
Alignment:
Q  140 aaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25044499 aaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatc 25044403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18096944 - 18096712
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaactttt-gatgcatatggagaagtaacttttgaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  18096944 ctctctcctgcacaatgtccaagacagatttgat--aactttatcctactttatccagcaactttttgatgcatatggaaaaataacattataaggataa 18096847  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | ||  ||||||||| |||||||  |||| |   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18096846 accta-aacaaatcttatgtcacacattgaacaaaccgagaaactcatcatacattcatcattgatgaactcaaatgaagaacatcatgaatatc-aaca 18096749  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  18096748 ttttgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 18096712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19748495 - 19748364
Alignment:
Q  59 caacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19748495 caacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaaacctgaacaaatcttatgtcacgcactgga-caacccagaaactcatcagacattcat 19748397  T
Q  159 c-cttgatgaacccagatgaagaacatcatgaa 190  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19748396 catttgatgaacccagatgaagatcatcatgaa 19748364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Original strand, 21792925 - 21793026
Alignment:
Q  134 acccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtcc 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  21792925 acccagaaactcatcatacattcatcaatgatgaacccagatgaagaacatcataaacatc-aacattcttatgaagaacacaacaacattctgatgttc 21793023  T
Q  234 atc 236  Q
    |||    
T  21793024 atc 21793026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21821412 - 21821220
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaacttttg-atgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa-acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatgga 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||  ||||  ||| |||  |||| |   |    
T  21821412 aactttatcctactttatccagcaacttttttatgcatatggagaagtaactttttatggataaagacaggaa--aatcatatggcacacattgaacaaa 21821315  T
Q  135 cccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatg 230  Q
    ||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21821314 cccagaaactcataataaattcatcaatgatgaacccagatgaagaacatcataaacat-taacattctgatgaagaacacaacaacattctgatg 21821220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 22956760 - 22956855
Alignment:
Q  125 attggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaac 221  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||| | ||   ||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22956760 attggataaacctagaaactcatcatacacttataaatgatgaacccagatgaagatcatgataaacatc-aacattctaatgaagaacacaacaac 22956855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29305 - 29070
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29305 ctctctcctgcaccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 29206  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29205 acctgaaaaaatctcatgtcacgtgttggatggacccagataatcatcagaaattcatcctggatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 29106  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29105 tttgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 29070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 55448 - 55415
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaacttttgatg 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55448 aactttatcctactttttcaaccaacttttgatg 55415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13436 - 13240
Alignment:
Q  11 caccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaa 110  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436 caccaaatccaagacagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaa 13337  T
Q  111 atctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13336 atctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatattcaacattctgatg 13240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18809 - 19037
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18809 ctctctcctgcacaaaatccaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttcaaggatata 18906  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907 acctgaacaaatctcatgtcacgtattggatgaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacctagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 19006  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19007 tctgatgaagaacacaacaacattctgatgt 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 146741 - 146975
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  146741 ctctctcctgcacaaagtcaaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatgaagaagtaactttttatggataaa 146838  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  146839 acatgaacaaatctcatgtcacgtattggatgaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaatatcatgaatatcaaacat 146938  T
Q  201 tctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  146939 tctgatgaagaacacagcaacattctgatgttcatct 146975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 114489 - 114326
Alignment:
Q  65 ttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaaacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114489 ttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaaacctgaacaaatctcatgtcacgtatgtgataaacccagaaactcatcagacattcatccttga 114390  T
Q  165 tgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgat 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  114389 taaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aacattctgatgaagaacacaacaacattctgat 114326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 153535 - 153389
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  153535 ctctctcctgcacaaaacccaagacagatttggt--aactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttttaaggataaa 153438  T
Q  101 acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatca 149  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  153437 acatgaacaaatcttatgtcacgtattggatgaacccagaaactcatca 153389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1609
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttgatgcatatggagaagtaactttt-gaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||    
T  1375 ctctctcctgcacaaagaccaaggcagatttggatcaactttatcctactttattcagcaacttttgatgcatatggataagttactttttggtggataa 1474  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1475 agctc-aacaaatctcatgtcacgccttgaacaaacccagaaactcatcagacattcatcattgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 1572  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1573 ttttgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7476 - 7705
Alignment:
Q  1 ctctctcctgcaccaattccaagatagatttgaatcaactttatcctactttttcaagcaacttttg-atgcatatggagaagtaacttttgaaggataa 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  7476 ctctctcctgcacaatgtccaagacagatttggttcaactttatcctactttatccagcaacttttggattcatatggagaagttactttttgtggataa 7575  T
Q  100 aacttgaacaaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaaca 199  Q
    | |   ||||||||| |||||||  |||| |   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7576 agccc-aacaaatcttatgtcacacattgaacaaacccagaaactcatcatacattcatctttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatc-aaca 7673  T
Q  200 ttctgatgaagaacacagcaacattatgatgt 231  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7674 ttttgatgaagaacacaacaacattctgatgt 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 4511 - 4624
Alignment:
Q  109 aaatctcatgtcacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatga 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4511 aaatcttatgtcacgcattggacaaacccaaaaactcatcagacattcatcattgatgaatccaaatgaagaacatcttgaatatc-gacattctgatga 4609  T
Q  209 agaacacagcaacat 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  4610 agaacacaacaacat 4624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Original strand, 11397 - 11589
Alignment:
Q  37 aactttatcctactttttcaagcaacttttg-atgcatatggagaagtaacttttgaaggataaa-acttgaacaaatctcatgtcacgtattggatgga 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||  ||||  ||| |||  |||| |   |    
T  11397 aactttatcctactttatccagcaacttttttatgcatatggagaagtaactttttatggataaagacaggaa--aatcatatggcacacattgaacaaa 11494  T
Q  135 cccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatg 230  Q
    ||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11495 cccagaaactcataataaattcatcaatgatgaacccagatgaagaacatcataaacat-taacattctgatgaagaacacaacaacattctgatg 11589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 54825 - 54922
Alignment:
Q  138 agaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  54825 agaaactcatcattcattcatcaatgatgaacctagatgaagaacatcatgaacatc-aacattttgatgaagaacatagcaacattctgatgttcatc 54922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 58777 - 58874
Alignment:
Q  138 agaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  58777 agaaactcatcattcattcatcaatgatgaacctagatgaagaacatcatgaacatc-aacattttgatgaagaacatagcaacattctgatgttcatc 58874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 60205 - 60302
Alignment:
Q  138 agaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  60205 agaaactcatcattcattcatcaatgatgaacctagatgaagaacatcatgaacatc-aacattttgatgaagaacatagcaacattctgatgttcatc 60302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Original strand, 15601 - 15702
Alignment:
Q  134 acccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtcc 233  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  15601 acccagaaattcatcatacactcataaatgatgaacccagatgaagaacatgatgaaaat-gaacattctgatgaagaacacaacaacattctgatgttc 15699  T
Q  234 atc 236  Q
    |||    
T  15700 atc 15702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28631 - 28545
Alignment:
Q  120 cacgtattggatggacccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatcaaacattctgatg 207  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  28631 cacgcattggataaacccagaaactcatcttacattcataaatgatgaacccagatgaagatcataatgaacatc-aacattctgatg 28545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6832 - 6783
Alignment:
Q  134 acccagaaactcatcagacattcatccttgatgaacccagatgaagaaca 183  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  6832 acccataaactcatcacacattcatcaatgatgaacccaaatgaagaaca 6783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16388 - 16348
Alignment:
Q  196 aacattctgatgaagaacacagcaacattatgatgtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  16388 aacattctgatgaagaacacaacaacattctgatgttcatc 16348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 92703 - 92647
Alignment:
Q  152 cattcatccttgatgaacccagatgaagaacatcatgaatatca-aacattctgatg 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  92703 cattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacataacaacattctgatg 92647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University