View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6899_low_1 (Length: 890)

Name: NF6899_low_1
Description: NF6899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6899_low_1
NF6899_low_1
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (15-521)||(15284673-15285179)
chr4 (15-521)||(15227890-15228396)
chr4 (16-521)||(1900277-1900782)
chr4 (23-521)||(24460358-24460856)
chr4 (22-518)||(15391090-15391586)
chr4 (15-521)||(14235270-14235776)
chr4 (561-880)||(15285219-15285538)
chr4 (561-882)||(15227529-15227850)
chr4 (561-882)||(1899916-1900237)
chr4 (15-521)||(17014020-17014526)
chr4 (15-521)||(24592059-24592565)
chr4 (15-521)||(14665038-14665544)
chr4 (561-882)||(14235819-14236140)
chr4 (16-521)||(14763050-14763555)
chr4 (16-520)||(18800359-18800863)
chr4 (16-520)||(36344261-36344765)
chr4 (16-521)||(6569873-6570378)
chr4 (16-521)||(5005893-5006398)
chr4 (16-518)||(33673544-33674046)
chr4 (580-881)||(14664675-14664976)
chr4 (16-521)||(31126264-31126769)
chr4 (16-521)||(40105384-40105889)
chr4 (16-521)||(14098561-14099066)
chr4 (16-518)||(30753777-30754279)
chr4 (580-881)||(17013657-17013958)
chr4 (16-518)||(39850661-39851163)
chr4 (16-521)||(24112682-24113187)
chr4 (585-882)||(15391650-15391948)
chr4 (16-521)||(34188706-34189211)
chr4 (16-520)||(54833408-54833912)
chr4 (16-521)||(21969721-21970226)
chr4 (580-881)||(24592624-24592925)
chr4 (16-521)||(27163063-27163568)
chr4 (580-881)||(6569510-6569811)
chr4 (571-695)||(24460906-24461030)
chr4 (572-881)||(14763609-14763918)
chr4 (572-881)||(36344817-36345126)
chr4 (599-881)||(19372918-19373200)
chr4 (583-881)||(27163633-27163931)
chr4 (589-830)||(54833098-54833339)
chr4 (583-881)||(5005527-5005825)
chr4 (616-881)||(14098198-14098463)
chr4 (583-798)||(30753482-30753697)
chr4 (616-798)||(31126867-31127049)
chr4 (616-821)||(18800971-18801176)
chr4 (583-821)||(33674126-33674364)
chr4 (616-869)||(40105987-40106240)
chr4 (583-798)||(21969441-21969656)
chr4 (691-830)||(39850331-39850470)
chr4 (572-720)||(24112483-24112631)
chr4 (572-720)||(34189262-34189410)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (15-521)||(19456155-19456661)
chr2 (15-521)||(21702898-21703404)
chr2 (23-521)||(27118689-27119187)
chr2 (23-521)||(3784655-3785153)
chr2 (23-521)||(34157012-34157509)
chr2 (23-521)||(34303045-34303543)
chr2 (22-521)||(16163600-16164102)
chr2 (23-521)||(31891070-31891568)
chr2 (561-882)||(19456701-19457022)
chr2 (561-882)||(21703444-21703765)
chr2 (22-521)||(22925769-22926268)
chr2 (191-518)||(27392973-27393300)
chr2 (15-521)||(28882215-28882721)
chr2 (15-521)||(27434178-27434684)
chr2 (15-521)||(12655543-12656049)
chr2 (15-521)||(20837919-20838425)
chr2 (15-521)||(23128300-23128806)
chr2 (16-518)||(9349717-9350219)
chr2 (580-870)||(27434746-27435036)
chr2 (16-518)||(40233515-40234017)
chr2 (16-521)||(34286355-34286860)
chr2 (16-521)||(34291415-34291920)
chr2 (16-518)||(13936279-13936781)
chr2 (16-518)||(12586814-12587316)
chr2 (16-518)||(27777226-27777728)
chr2 (16-518)||(27816984-27817486)
chr2 (561-882)||(27392630-27392951)
chr2 (16-520)||(37375163-37375667)
chr2 (16-521)||(11634921-11635426)
chr2 (16-521)||(21676917-21677422)
chr2 (16-518)||(27803711-27804213)
chr2 (16-521)||(11641110-11641615)
chr2 (580-881)||(23128868-23129169)
chr2 (580-881)||(28881852-28882153)
chr2 (16-521)||(32049799-32050304)
chr2 (16-521)||(34861681-34862186)
chr2 (16-521)||(37685644-37686149)
chr2 (16-521)||(37700909-37701414)
chr2 (16-521)||(37925494-37925999)
chr2 (16-518)||(39051557-39052059)
chr2 (16-518)||(12716337-12716839)
chr2 (16-521)||(16829073-16829578)
chr2 (16-521)||(16891903-16892408)
chr2 (580-881)||(20837556-20837857)
chr2 (580-881)||(12655180-12655481)
chr2 (16-521)||(39890075-39890580)
chr2 (16-512)||(260488-260984)
chr2 (15-521)||(31876282-31876788)
chr2 (16-446)||(19416234-19416664)
chr2 (561-695)||(31891608-31891742)
chr2 (561-695)||(27118515-27118649)
chr2 (571-695)||(3784481-3784605)
chr2 (571-695)||(34156838-34156962)
chr2 (580-695)||(34303602-34303717)
chr2 (571-695)||(16163426-16163550)
chr2 (583-881)||(34279087-34279385)
chr2 (307-521)||(34279450-34279664)
chr2 (583-830)||(13936849-13937096)
chr2 (583-797)||(21677487-21677701)
chr2 (589-881)||(37374799-37375091)
chr2 (583-830)||(261070-261317)
chr2 (583-881)||(11635494-11635792)
chr2 (583-881)||(11641683-11641981)
chr2 (583-830)||(34286043-34286290)
chr2 (583-830)||(34291103-34291350)
chr2 (616-798)||(12716943-12717125)
chr2 (583-830)||(37925182-37925429)
chr2 (583-830)||(40233188-40233435)
chr2 (616-798)||(31876002-31876184)
chr2 (616-798)||(34861401-34861583)
chr2 (616-798)||(37686247-37686429)
chr2 (616-798)||(37701512-37701694)
chr2 (616-798)||(39889783-39889965)
chr2 (583-791)||(32049526-32049734)
chr2 (691-830)||(12586490-12586629)
chr2 (616-798)||(16829676-16829858)
chr2 (616-798)||(16891623-16891805)
chr2 (616-821)||(19416837-19417042)
chr2 (616-797)||(22926366-22926547)
chr2 (691-830)||(9350407-9350546)
chr2 (691-830)||(27776896-27777035)
chr2 (691-830)||(27803381-27803520)
chr2 (691-830)||(27816663-27816802)
chr2 (577-830)||(39052127-39052380)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (15-521)||(16626292-16626798)
chr3 (15-521)||(18530354-18530860)
chr3 (23-521)||(5652353-5652851)
chr3 (22-521)||(31033910-31034409)
chr3 (22-521)||(32292718-32293217)
chr3 (23-521)||(4625910-4626408)
chr3 (23-521)||(17993578-17994076)
chr3 (561-882)||(16626838-16627158)
chr3 (561-882)||(18529999-18530320)
chr3 (23-518)||(5713196-5713691)
chr3 (23-518)||(5724106-5724601)
chr3 (23-518)||(5767767-5768262)
chr3 (15-521)||(18051228-18051734)
chr3 (15-521)||(6192282-6192788)
chr3 (15-521)||(8295938-8296444)
chr3 (18-521)||(15740883-15741386)
chr3 (15-521)||(4721597-4722103)
chr3 (15-521)||(29148541-29149047)
chr3 (15-521)||(4796439-4796945)
chr3 (15-521)||(8301053-8301559)
chr3 (15-521)||(15892492-15892998)
chr3 (19-521)||(18330635-18331137)
chr3 (53-518)||(5756907-5757371)
chr3 (16-521)||(7073178-7073683)
chr3 (19-521)||(22387368-22387870)
chr3 (19-521)||(35880732-35881234)
chr3 (16-521)||(10396099-10396604)
chr3 (580-870)||(15893060-15893350)
chr3 (16-521)||(28115741-28116246)
chr3 (16-521)||(4416885-4417390)
chr3 (16-521)||(18276839-18277344)
chr3 (16-521)||(18307441-18307946)
chr3 (16-518)||(11110136-11110638)
chr3 (16-521)||(18292140-18292645)
chr3 (16-518)||(20576634-20577136)
chr3 (16-518)||(29664757-29665259)
chr3 (16-518)||(48465896-48466398)
chr3 (16-521)||(28021241-28021746)
chr3 (16-512)||(8211713-8212209)
chr3 (16-518)||(36996864-36997366)
chr3 (16-458)||(51782052-51782494)
chr3 (16-521)||(5609109-5609614)
chr3 (580-881)||(8301618-8301919)
chr3 (16-521)||(21674659-21675164)
chr3 (16-520)||(6542249-6542753)
chr3 (16-521)||(28339268-28339773)
chr3 (580-881)||(8295578-8295879)
chr3 (580-881)||(18050865-18051166)
chr3 (16-519)||(5466953-5467456)
chr3 (580-881)||(4797007-4797308)
chr3 (580-881)||(15741436-15741737)
chr3 (16-521)||(31964260-31964765)
chr3 (16-521)||(47023419-47023924)
chr3 (16-521)||(4346474-4346979)
chr3 (45-521)||(17984772-17985248)
chr3 (16-520)||(18242706-18243210)
chr3 (16-521)||(32439120-32439625)
chr3 (580-881)||(35880369-35880670)
chr3 (16-521)||(22870643-22871148)
chr3 (16-521)||(22885702-22886207)
chr3 (148-521)||(50133990-50134363)
chr3 (16-512)||(5013687-5014183)
chr3 (16-520)||(5596144-5596648)
chr3 (583-881)||(4721234-4721532)
chr3 (16-446)||(24328200-24328630)
chr3 (16-521)||(7996528-7997033)
chr3 (16-521)||(10643036-10643541)
chr3 (580-881)||(29149109-29149410)
chr3 (16-521)||(18225157-18225662)
chr3 (580-881)||(18330277-18330573)
chr3 (16-520)||(20066010-20066514)
chr3 (583-881)||(6191919-6192217)
chr3 (139-458)||(51797141-51797461)
chr3 (572-881)||(8211344-8211653)
chr3 (571-695)||(17994126-17994250)
chr3 (583-881)||(28116314-28116612)
chr3 (580-695)||(4625736-4625851)
chr3 (583-881)||(7072815-7073113)
chr3 (572-881)||(18277398-18277707)
chr3 (572-881)||(18292699-18293008)
chr3 (572-881)||(18308000-18308309)
chr3 (571-695)||(5652179-5652303)
chr3 (572-791)||(20065739-20065958)
chr3 (572-870)||(10395750-10396048)
chr3 (583-881)||(47023056-47023354)
chr3 (616-830)||(22871264-22871478)
chr3 (616-830)||(22886323-22886537)
chr3 (616-797)||(5466672-5466853)
chr3 (616-821)||(5596756-5596961)
chr3 (583-695)||(5713016-5713128)
chr3 (583-695)||(5723926-5724038)
chr3 (583-695)||(5757439-5757551)
chr3 (583-695)||(5768330-5768442)
chr3 (583-833)||(7996213-7996463)
chr3 (583-833)||(10642721-10642971)
chr3 (616-798)||(18224877-18225059)
chr3 (592-881)||(21674296-21674585)
chr3 (616-798)||(17985346-17985528)
chr3 (616-798)||(28020964-28021146)
chr3 (583-821)||(36997446-36997684)
chr3 (616-881)||(5013315-5013580)
chr3 (616-869)||(6542864-6543117)
chr3 (583-830)||(11110718-11110965)
chr3 (616-798)||(4347074-4347256)
chr3 (616-830)||(18242381-18242595)
chr3 (322-521)||(4893176-4893375)
chr3 (691-830)||(20577327-20577466)
chr3 (691-821)||(51781674-51781804)
chr3 (616-821)||(24327822-24328027)
chr3 (616-797)||(28338989-28339170)
chr3 (616-797)||(31964863-31965044)
chr3 (616-797)||(50134461-50134642)
chr3 (583-767)||(29665342-29665526)
chr3 (691-797)||(4416603-4416709)
chr3 (572-720)||(22387921-22388069)
chr3 (691-794)||(5609787-5609890)
chr3 (583-830)||(48465569-48465816)
chr3 (691-821)||(51796762-51796893)
chr3 (572-870)||(32438771-32439069)
chr3 (572-720)||(4892977-4893125)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (15-521)||(20461085-20461591)
chr1 (15-521)||(20340080-20340586)
chr1 (15-521)||(16207776-16208282)
chr1 (22-521)||(28151866-28152365)
chr1 (561-882)||(20460748-20461069)
chr1 (561-882)||(16208319-16208640)
chr1 (16-521)||(41793054-41793559)
chr1 (16-521)||(10962674-10963179)
chr1 (16-521)||(28584985-28585490)
chr1 (15-521)||(51638222-51638728)
chr1 (561-695)||(20340626-20340760)
chr1 (583-881)||(41793624-41793922)
chr1 (616-830)||(10962362-10962576)
chr1 (616-830)||(51637910-51638124)
chr1 (616-821)||(28584682-28584887)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (15-521)||(16449629-16450135)
chr7 (15-521)||(16041329-16041835)
chr7 (22-521)||(26484700-26485199)
chr7 (22-521)||(39210661-39211160)
chr7 (23-521)||(31088103-31088601)
chr7 (22-521)||(2775365-2775864)
chr7 (23-521)||(2108644-2109142)
chr7 (23-521)||(45733466-45733964)
chr7 (22-392)||(26682638-26683008)
chr7 (23-392)||(4200682-4201051)
chr7 (561-870)||(16040980-16041289)
chr7 (564-882)||(16450178-16450496)
chr7 (19-521)||(5127998-5128500)
chr7 (15-521)||(10916499-10917005)
chr7 (19-521)||(11424412-11424913)
chr7 (15-521)||(16518047-16518553)
chr7 (15-521)||(2154579-2155085)
chr7 (15-521)||(16503011-16503517)
chr7 (580-881)||(16518615-16518916)
chr7 (580-881)||(16503579-16503880)
chr7 (18-521)||(18540805-18541308)
chr7 (16-521)||(5146972-5147477)
chr7 (16-521)||(26435263-26435768)
chr7 (16-521)||(26274726-26275231)
chr7 (16-518)||(3445315-3445817)
chr7 (16-518)||(26537502-26538004)
chr7 (16-521)||(4144755-4145260)
chr7 (16-521)||(26319501-26320006)
chr7 (16-520)||(31564022-31564526)
chr7 (16-521)||(16736092-16736597)
chr7 (16-521)||(16751146-16751651)
chr7 (16-521)||(17523538-17524043)
chr7 (16-521)||(17529172-17529677)
chr7 (16-521)||(9618657-9619162)
chr7 (16-521)||(26669546-26670051)
chr7 (580-881)||(2154216-2154517)
chr7 (78-512)||(11441587-11442021)
chr7 (16-446)||(24592173-24592603)
chr7 (16-521)||(45387349-45387854)
chr7 (580-881)||(5127635-5127936)
chr7 (16-520)||(31124927-31125431)
chr7 (580-881)||(10917064-10917365)
chr7 (580-881)||(11424975-11425276)
chr7 (16-521)||(5159525-5160030)
chr7 (571-695)||(31088651-31088775)
chr7 (571-695)||(45733292-45733416)
chr7 (583-833)||(45387034-45387284)
chr7 (583-881)||(5147542-5147840)
chr7 (583-881)||(16736662-16736960)
chr7 (583-881)||(16751716-16752014)
chr7 (583-881)||(17523175-17523473)
chr7 (583-881)||(17529742-17530040)
chr7 (616-881)||(31124554-31124819)
chr7 (583-821)||(11441263-11441501)
chr7 (572-797)||(4145314-4145539)
chr7 (616-881)||(24592776-24593041)
chr7 (616-830)||(9618345-9618559)
chr7 (616-798)||(26275329-26275511)
chr7 (583-881)||(26434900-26435198)
chr7 (616-796)||(26320104-26320284)
chr7 (16-178)||(26513130-26513292)
chr7 (691-798)||(3445020-3445127)
chr7 (583-798)||(26485946-26486161)
chr7 (583-830)||(26538075-26538322)
chr7 (616-830)||(26670149-26670363)
chr7 (572-720)||(5159326-5159474)
chr7 (691-798)||(31564709-31564816)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (15-521)||(22888484-22888990)
chr5 (15-521)||(25199043-25199549)
chr5 (23-521)||(13184299-13184796)
chr5 (22-521)||(33877261-33877760)
chr5 (23-521)||(11325808-11326306)
chr5 (23-521)||(13440144-13440642)
chr5 (23-521)||(29888732-29889230)
chr5 (16-521)||(23892220-23892725)
chr5 (561-883)||(23891855-23892177)
chr5 (561-882)||(25198682-25199003)
chr5 (23-521)||(9548193-9548691)
chr5 (15-521)||(24687799-24688305)
chr5 (15-521)||(23717630-23718136)
chr5 (18-521)||(23752095-23752598)
chr5 (18-521)||(33777501-33778004)
chr5 (15-521)||(22998756-22999262)
chr5 (15-521)||(30934647-30935153)
chr5 (26-521)||(11549368-11549863)
chr5 (15-521)||(24970032-24970538)
chr5 (15-521)||(15658402-15658908)
chr5 (16-520)||(18500373-18500877)
chr5 (16-520)||(28649250-28649754)
chr5 (580-881)||(24688367-24688668)
chr5 (16-521)||(6874319-6874824)
chr5 (16-521)||(12132169-12132674)
chr5 (16-518)||(31826050-31826552)
chr5 (16-518)||(43078269-43078771)
chr5 (16-521)||(2511065-2511570)
chr5 (16-521)||(9317465-9317970)
chr5 (16-521)||(41674723-41675228)
chr5 (15-521)||(18375054-18375560)
chr5 (16-521)||(30152032-30152537)
chr5 (16-512)||(31431463-31431959)
chr5 (16-520)||(37671126-37671630)
chr5 (16-521)||(8665118-8665623)
chr5 (16-521)||(15758500-15759005)
chr5 (16-520)||(13324472-13324976)
chr5 (16-520)||(37358286-37358790)
chr5 (16-521)||(5637924-5638429)
chr5 (580-881)||(23752660-23752961)
chr5 (580-881)||(30934287-30934588)
chr5 (16-520)||(3789556-3790060)
chr5 (16-518)||(24681457-24681959)
chr5 (16-518)||(24723984-24724486)
chr5 (16-521)||(26480406-26480910)
chr5 (16-521)||(33516370-33516875)
chr5 (16-520)||(37770630-37771134)
chr5 (580-881)||(23718198-23718500)
chr5 (687-881)||(24951761-24951955)
chr5 (16-518)||(40473192-40473694)
chr5 (580-881)||(11549005-11549306)
chr5 (561-718)||(22888287-22888444)
chr5 (16-521)||(30168483-30168988)
chr5 (16-521)||(32599115-32599620)
chr5 (16-521)||(34616532-34617037)
chr5 (16-446)||(30029504-30029934)
chr5 (16-520)||(37754995-37755499)
chr5 (16-521)||(33292539-33293044)
chr5 (580-881)||(33777138-33777439)
chr5 (580-880)||(22999324-22999624)
chr5 (16-521)||(28959429-28959934)
chr5 (113-446)||(29966806-29967139)
chr5 (571-695)||(13184846-13184970)
chr5 (571-695)||(13440692-13440816)
chr5 (571-695)||(33877087-33877211)
chr5 (583-830)||(9548756-9549003)
chr5 (561-695)||(11325634-11325768)
chr5 (583-881)||(15658973-15659271)
chr5 (583-821)||(41674420-41674658)
chr5 (583-830)||(31431130-31431377)
chr5 (616-830)||(2510753-2510967)
chr5 (583-797)||(8665688-8665902)
chr5 (583-830)||(30168171-30168418)
chr5 (616-830)||(9317153-9317367)
chr5 (616-798)||(24681171-24681353)
chr5 (616-798)||(24723698-24723880)
chr5 (691-869)||(40473873-40474051)
chr5 (583-881)||(43077900-43078198)
chr5 (616-881)||(18375658-18375923)
chr5 (583-830)||(18500961-18501208)
chr5 (583-881)||(3789177-3789475)
chr5 (616-798)||(12131889-12132071)
chr5 (580-678)||(24969878-24969976)
chr5 (616-798)||(37771245-37771427)
chr5 (616-881)||(5637561-5637826)
chr5 (616-833)||(15759103-15759320)
chr5 (616-881)||(30151669-30151934)
chr5 (616-869)||(37358901-37359154)
chr5 (691-830)||(6874004-6874143)
chr5 (616-830)||(26480094-26480308)
chr5 (616-798)||(31826665-31826847)
chr5 (616-798)||(33516090-33516272)
chr5 (616-830)||(34616223-34616437)
chr5 (616-798)||(37671738-37671920)
chr5 (691-830)||(37754670-37754809)
chr5 (616-798)||(32599715-32599897)
chr5 (616-798)||(28960044-28960226)
chr5 (616-821)||(28648937-28649142)
chr5 (616-821)||(29967312-29967517)
chr5 (616-821)||(30029126-30029331)
chr5 (691-830)||(13325165-13325304)
chr5 (572-720)||(33292340-33292488)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (15-521)||(2403-2909)
scaffold0260 (561-695)||(2949-3083)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (23-521)||(19658752-19659249)
chr8 (22-521)||(44563106-44563603)
chr8 (23-521)||(33244670-33245168)
chr8 (22-518)||(22080589-22081085)
chr8 (22-521)||(18710591-18711090)
chr8 (15-521)||(16283454-16283960)
chr8 (16-521)||(9354627-9355133)
chr8 (15-521)||(16277559-16278065)
chr8 (15-521)||(19688103-19688609)
chr8 (15-521)||(27608609-27609115)
chr8 (15-521)||(2136963-2137469)
chr8 (15-521)||(14557629-14558135)
chr8 (580-881)||(16283091-16283392)
chr8 (580-881)||(16277196-16277497)
chr8 (16-521)||(19674446-19674951)
chr8 (580-881)||(19687740-19688041)
chr8 (16-520)||(3329212-3329716)
chr8 (16-521)||(19208065-19208570)
chr8 (561-882)||(22081125-22081446)
chr8 (16-521)||(31489455-31489960)
chr8 (16-521)||(28361660-28362165)
chr8 (16-521)||(31354529-31355034)
chr8 (16-520)||(12092429-12092933)
chr8 (16-520)||(29829328-29829832)
chr8 (580-881)||(2137531-2137832)
chr8 (580-881)||(14557269-14557570)
chr8 (16-520)||(19286468-19286972)
chr8 (580-881)||(27609177-27609478)
chr8 (16-446)||(33258803-33259233)
chr8 (99-364)||(189256-189521)
chr8 (571-695)||(19659299-19659423)
chr8 (580-695)||(44562932-44563047)
chr8 (571-695)||(9354453-9354577)
chr8 (583-881)||(18710228-18710526)
chr8 (583-881)||(19674080-19674378)
chr8 (589-830)||(19286158-19286399)
chr8 (583-821)||(31490025-31490263)
chr8 (572-797)||(31354250-31354475)
chr8 (15-126)||(18791107-18791218)
chr8 (616-798)||(19208668-19208850)
chr8 (616-830)||(28362263-28362477)
chr8 (616-869)||(3329827-3330080)
chr8 (616-869)||(29828967-29829220)
chr8 (616-830)||(19518451-19518665)
chr8 (616-821)||(33258425-33258630)
chr8 (616-881)||(12093041-12093306)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (22-521)||(14142980-14143479)
chr6 (22-521)||(26787946-26788445)
chr6 (22-521)||(27196319-27196818)
chr6 (22-521)||(27252422-27252921)
chr6 (22-521)||(22456638-22457128)
chr6 (22-521)||(13521768-13522267)
chr6 (23-521)||(8892007-8892504)
chr6 (23-521)||(8903242-8903739)
chr6 (23-521)||(33373952-33374450)
chr6 (23-521)||(28162659-28163157)
chr6 (15-521)||(27290058-27290564)
chr6 (15-521)||(13298639-13299145)
chr6 (15-518)||(27272268-27272771)
chr6 (15-521)||(22934568-22935074)
chr6 (15-521)||(23857013-23857519)
chr6 (19-521)||(26918382-26918884)
chr6 (15-521)||(26989003-26989510)
chr6 (15-521)||(24304306-24304812)
chr6 (16-521)||(16749856-16750361)
chr6 (42-520)||(20160704-20161182)
chr6 (42-520)||(22171649-22172127)
chr6 (15-521)||(24863719-24864225)
chr6 (15-521)||(15424005-15424511)
chr6 (295-521)||(22477241-22477467)
chr6 (16-521)||(29549477-29549982)
chr6 (16-314)||(17092129-17092427)
chr6 (16-518)||(34463035-34463537)
chr6 (574-882)||(20160345-20160650)
chr6 (574-882)||(22172181-22172486)
chr6 (580-881)||(13299207-13299508)
chr6 (580-881)||(24863356-24863657)
chr6 (16-521)||(29573015-29573520)
chr6 (16-520)||(4773009-4773513)
chr6 (16-518)||(3696086-3696588)
chr6 (16-518)||(16674144-16674646)
chr6 (580-881)||(15424573-15424874)
chr6 (16-512)||(4545464-4545960)
chr6 (16-520)||(4757767-4758271)
chr6 (583-881)||(22935136-22935434)
chr6 (583-881)||(23857581-23857879)
chr6 (580-881)||(26988640-26988941)
chr6 (580-881)||(26999712-27000013)
chr6 (16-520)||(4525289-4525793)
chr6 (16-512)||(4723823-4724319)
chr6 (16-521)||(30557705-30558210)
chr6 (16-520)||(27007730-27008234)
chr6 (16-512)||(28207465-28207961)
chr6 (202-521)||(27000075-27000394)
chr6 (15-520)||(27359680-27360185)
chr6 (15-520)||(27450023-27450528)
chr6 (16-520)||(27485132-27485636)
chr6 (580-830)||(24304874-24305124)
chr6 (16-520)||(26116099-26116603)
chr6 (580-881)||(16749493-16749794)
chr6 (16-520)||(27044390-27044895)
chr6 (580-724)||(22477529-22477673)
chr6 (583-830)||(26918070-26918317)
chr6 (16-446)||(16943716-16944146)
chr6 (16-520)||(29501418-29501922)
chr6 (148-520)||(17025280-17025652)
chr6 (561-695)||(28162485-28162619)
chr6 (571-695)||(13522317-13522441)
chr6 (571-695)||(33374500-33374624)
chr6 (16-521)||(26777299-26777809)
chr6 (561-695)||(8892544-8892678)
chr6 (561-695)||(8903779-8903913)
chr6 (572-881)||(29549117-29549426)
chr6 (572-881)||(27044029-27044338)
chr6 (583-881)||(3695702-3696000)
chr6 (16-198)||(27019461-27019643)
chr6 (612-798)||(4525011-4525197)
chr6 (616-881)||(17024901-17025166)
chr6 (616-830)||(27484807-27485021)
chr6 (616-830)||(29501096-29501310)
chr6 (616-798)||(29572735-29572917)
chr6 (616-798)||(30558308-30558490)
chr6 (691-798)||(4757483-4757590)
chr6 (691-830)||(4772687-4772826)
chr6 (691-830)||(27007402-27007541)
chr6 (583-830)||(34463620-34463867)
chr6 (616-881)||(4546076-4546341)
chr6 (616-821)||(16944319-16944524)
chr6 (616-797)||(26777919-26778100)
chr6 (616-881)||(28207081-28207346)
chr6 (583-830)||(16673817-16674064)
chr6 (691-798)||(27360377-27360484)
chr6 (691-798)||(27450720-27450827)
chr6 (616-869)||(4724435-4724688)
chr6 (16-272)||(27629389-27629645)
chr6 (583-869)||(27629968-27630254)
chr6 (697-798)||(26116792-26116893)
chr6 (688-869)||(27272947-27273128)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (23-518)||(21569-22064)
scaffold0109 (561-882)||(21208-21529)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (561-882)||(20053-20374)
scaffold0124 (183-521)||(20393-20730)
scaffold0124 (15-446)||(30532-30964)
scaffold0124 (580-881)||(30095-30396)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (243-521)||(1-279)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (183-456)||(1831-2103)
scaffold0415 (16-458)||(6080-6524)
scaffold0415 (583-830)||(5682-5930)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (15-521)||(46730-47236)
scaffold0089 (15-521)||(39814-40320)
scaffold0089 (15-521)||(29768-30274)
scaffold0089 (580-881)||(29405-29706)
scaffold0089 (583-881)||(40385-40683)
scaffold0089 (580-881)||(47298-47599)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (16-380)||(364-728)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (15-521)||(27297-27804)
scaffold0143 (580-881)||(26934-27235)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (16-521)||(9571-10076)
scaffold0336 (612-881)||(7874-8143)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (148-521)||(7-381)
scaffold0029 (580-881)||(443-744)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (16-521)||(8812-9317)
scaffold0159 (16-521)||(20020-20526)
scaffold0159 (616-794)||(9415-9593)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (16-521)||(6985-7490)
scaffold0350 (616-798)||(7588-7770)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (15-521)||(14675-15181)
scaffold0237 (616-881)||(15279-15544)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (16-521)||(25947-26453)
scaffold0144 (616-881)||(26551-26816)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (16-512)||(7963-8459)
scaffold0038 (616-881)||(7579-7844)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (687-881)||(48568-48769)
scaffold0099 (77-440)||(46604-46981)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (23-78)||(119651-119706)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 15284673 - 15285179
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  15284673 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactg 15284772  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15284773 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcac 15284872  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15284873 atacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagctt 15284972  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15284973 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaac 15285072  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15285073 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtag 15285172  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  15285173 gtctagc 15285179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15228396 - 15227890
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  15228396 gacatcgctgacagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattg 15228297  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  15228296 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcat 15228197  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  15228196 ataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagctt 15228097  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15228096 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaat 15227997  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15227996 ggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtag 15227897  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  15227896 gtctagc 15227890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1900782 - 1900277
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  1900782 acatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactgg 1900683  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1900682 catggtcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcata 1900583  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||     
T  1900582 tacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttc 1900483  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  1900482 ttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacg 1900383  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1900382 gatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtagg 1900283  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  1900282 tctagc 1900277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24460856
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 24460557  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24460558 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 24460657  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  24460658 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 24460757  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24460758 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 22 - 518
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391586
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctc 15391289  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  15391290 gatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttaca 15391389  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15391390 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 15391489  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391490 gtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 14235270 - 14235776
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  | |||  |    
T  14235270 gacatcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacg 14235369  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14235370 gcatggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcat 14235469  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  14235470 aggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagctt 14235569  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  14235570 ctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaa 14235669  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||    
T  14235670 gggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtag 14235769  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  14235770 gtctagc 14235776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 561 - 880
Target Start/End: Original strand, 15285219 - 15285538
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285219 catttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 15285318  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285319 gcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctt 15285418  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285419 tcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 15285518  T
Q  861 agtccccatgatgtccatct 880  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  15285519 agtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 15227850 - 15227529
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15227850 catttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 15227751  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227750 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 15227651  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227650 tcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 15227551  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  15227550 agtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 1900237 - 1899916
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1900237 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 1900138  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900137 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 1900038  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1900037 tcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacg 1899938  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  1899937 agtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17014526 - 17014020
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  17014526 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 17014427  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  17014426 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 17014327  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  17014326 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 17014227  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  17014226 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaac 17014127  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  17014126 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 17014027  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  17014026 gtctagc 17014020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 24592059 - 24592565
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||    
T  24592059 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttg 24592158  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  24592159 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24592258  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  24592259 atacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 24592358  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24592359 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24592458  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  24592459 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 24592558  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  24592559 gtctagc 24592565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14665544 - 14665038
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  14665544 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 14665445  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  14665444 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 14665345  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  14665344 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 14665245  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  14665244 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 14665145  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  14665144 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 14665045  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  14665044 gtctagc 14665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Original strand, 14235819 - 14236140
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14235819 catttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 14235918  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
      |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235919 atatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 14236018  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||    
T  14236019 tcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcg 14236118  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  14236119 ggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 14763050 - 14763555
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  14763050 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 14763149  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  14763150 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 14763249  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  14763250 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 14763349  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  14763350 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 14763449  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  14763450 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 14763549  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  14763550 tctagc 14763555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 18800359 - 18800863
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  18800359 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 18800458  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  18800459 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 18800558  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  18800559 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 18800658  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  18800659 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 18800758  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18800759 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 18800858  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  18800859 tctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 36344261 - 36344765
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  36344261 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 36344360  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  36344361 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 36344460  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | ||||||     
T  36344461 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttc 36344560  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  36344561 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacg 36344660  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  36344661 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttgg 36344760  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  36344761 tctag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6570378 - 6569873
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  6570378 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 6570279  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||| |||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  6570278 cataatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 6570179  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  6570178 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 6570079  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  6570078 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 6569979  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  6569978 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtagg 6569879  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  6569878 tctagc 6569873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5006398 - 5005893
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||| ||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  5006398 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 5006299  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  5006298 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 5006199  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || || || ||||| |  ||||||||     
T  5006198 cacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttc 5006099  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5006098 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5005999  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5005998 gatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 5005899  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  5005898 cctagc 5005893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 33673544 - 33674046
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  33673544 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 33673643  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  33673644 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 33673743  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  33673744 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 33673843  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  33673844 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 33673943  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  33673944 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 33674043  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  33674044 tct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 14664976 - 14664675
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||     
T  14664976 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggag 14664877  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14664876 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14664777  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  14664776 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 14664677  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  14664676 tc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 31126264 - 31126769
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  31126264 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 31126363  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  31126364 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 31126463  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  31126464 cacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 31126563  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31126564 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31126663  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  31126664 ggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 31126763  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  31126764 cctagc 31126769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 40105384 - 40105889
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  40105384 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 40105483  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  40105484 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 40105583  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  40105584 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 40105683  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  40105684 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 40105783  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  40105784 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 40105883  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  40105884 cctagc 40105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14099066 - 14098561
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |   || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  14099066 acatcactgacagtcagaaggttatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 14098967  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  14098966 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 14098867  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  14098866 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 14098767  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||    
T  14098766 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacg 14098667  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  14098666 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 14098567  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  14098566 tctagc 14098561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30754279 - 30753777
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  30754279 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 30754180  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  30754179 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 30754080  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  30754079 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 30753980  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  30753979 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 30753880  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  30753879 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 30753780  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  30753779 tct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39851163 - 39850661
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | |||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  39851163 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 39851064  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  39851063 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 39850964  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | ||||||     
T  39850963 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttc 39850864  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  39850863 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 39850764  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  39850763 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 39850664  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  39850663 tct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24113187 - 24112682
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||  | |    
T  24113187 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttag 24113088  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  24113087 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 24112988  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  24112987 tatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttc 24112888  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  24112887 ttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 24112788  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  24112787 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 24112688  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  24112687 tctagc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 585 - 882
Target Start/End: Original strand, 15391650 - 15391948
Alignment:
Q  585 gggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataac 684  Q
    ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  || |    
T  15391650 gggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagc 15391749  T
Q  685 tgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 783  Q
    || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  15391750 tgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgcca 15391849  T
Q  784 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 882  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391850 tacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 34188706 - 34189211
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    |    
T  34188706 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcag 34188805  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  34188806 catgatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 34188905  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  34188906 tatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttc 34189005  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  34189006 ttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 34189105  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  34189106 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 34189205  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  34189206 tctagc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 54833912 - 54833408
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  54833912 acatcattgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttgg 54833813  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  54833812 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 54833713  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  54833712 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 54833613  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  54833612 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 54833513  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  54833512 ggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttgg 54833413  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  54833412 tctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21970226 - 21969721
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  21970226 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 21970127  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  21970126 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 21970027  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  21970026 catttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 21969927  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  21969926 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 21969827  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  21969826 ggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 21969727  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  21969726 cctagc 21969721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 24592624 - 24592925
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24592624 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24592723  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24592724 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24592823  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24592824 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 24592923  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  24592924 tc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 27163063 - 27163568
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  27163063 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 27163162  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  27163163 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 27163262  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  27163263 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 27163362  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  27163363 ttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 27163462  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  27163463 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 27163562  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  27163563 cctagc 27163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 24460906 - 24461030
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Original strand, 36344817 - 36345126
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  36344817 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 36344916  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36344917 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 36345016  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  36345017 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 36345116  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  36345117 tgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 599 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  599 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 698  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  699 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  799 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  589 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 688  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  689 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 788  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  789 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  783 gtacctctttgatgca 798  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 583 - 821
Target Start/End: Original strand, 33674126 - 33674364
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  33674126 acgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 33674225  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  33674226 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 33674325  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674326 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 616 - 869
Target Start/End: Original strand, 40105987 - 40106240
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40105987 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 40106086  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  40106087 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 40106186  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106187 tttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 583 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  783 gtacctctttgatgca 798  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 24112631 - 24112483
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  24112631 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 24112532  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 720  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112531 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 720
Target Start/End: Original strand, 34189262 - 34189410
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  34189262 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 34189361  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 720  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189362 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 19456155 - 19456661
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  19456155 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactg 19456254  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19456255 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcac 19456354  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19456355 atacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagctt 19456454  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19456455 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 19456554  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19456555 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtag 19456654  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  19456655 gtctagc 19456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 21702898 - 21703404
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21702898 gacatcgctgacagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattg 21702997  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21702998 gtatgatcgtggttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcat 21703097  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||    
T  21703098 atacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctt 21703197  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21703198 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 21703297  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  21703298 ggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtag 21703397  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  21703398 gtctagc 21703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118689
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 27118988  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 27118888  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  27118887 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 27118788  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27118787 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 27118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784655
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 3784954  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 3784854  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  3784853 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 3784754  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3784753 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34157012
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 34157310  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 34157211  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  34157210 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 34157111  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34157110 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303543
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 34303244  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 34303344  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  34303345 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 34303444  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34303445 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34303543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163600
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  122 catggtcaaacaaagagg---cttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatac 16163903  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16163902 ctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 16163803  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||    
T  16163802 acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggat 16163703  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16163702 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 16163603  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  16163602 agc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891568
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31891269  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31891369  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  31891370 tgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 31891469  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31891470 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31891568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Original strand, 19456701 - 19457022
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456701 catttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgc 19456800  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456801 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 19456900  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19456901 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 19457000  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  19457001 agtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Original strand, 21703444 - 21703765
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21703444 catttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 21703543  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703544 gcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 21703643  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703644 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 21703743  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  21703744 agtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22926268
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 22925968  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  22925969 aatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacg 22926068  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  22926069 atatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 22926168  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22926169 gtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 191 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27393300 - 27392973
Alignment:
Q  191 cgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 290  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27393300 cgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 27393201  T
Q  291 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 390  Q
    ||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27393200 taactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgagg 27393101  T
Q  391 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatata 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| |    
T  27393100 tcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcataca 27393001  T
Q  491 gcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27393000 tcattggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28882721 - 28882215
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  28882721 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 28882622  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  28882621 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 28882522  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  28882521 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 28882422  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  28882421 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 28882322  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28882321 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 28882222  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  28882221 gtctagc 28882215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 27434178 - 27434684
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  27434178 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27434277  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  27434278 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 27434377  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  27434378 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 27434477  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||    
T  27434478 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaac 27434577  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  27434578 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 27434677  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  27434678 gtctagc 27434684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12656049 - 12655543
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | | || |||||||  ||    
T  12656049 gacatcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttg 12655950  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  12655949 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 12655850  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  12655849 atacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 12655750  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  12655749 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 12655650  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  12655649 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 12655550  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  12655549 gtctagc 12655543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20838425 - 20837919
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  20838425 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 20838326  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  20838325 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 20838226  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  20838225 atacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 20838126  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  20838125 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaac 20838026  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20838025 agatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 20837926  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  20837925 gtctagc 20837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 23128300 - 23128806
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  23128300 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 23128399  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  23128400 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 23128499  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  23128500 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 23128599  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  23128600 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 23128699  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  23128700 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 23128799  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  23128800 gtctagc 23128806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 9349717 - 9350219
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  |||    
T  9349717 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgg 9349816  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9349817 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcata 9349916  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  9349917 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 9350016  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  9350017 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 9350116  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9350117 ggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 9350216  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  9350217 tct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 580 - 870
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 870  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 40234017 - 40233515
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | |||||||||||||||||||| |||| | || ||  |||    
T  40234017 acatcactgacagttagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttgg 40233918  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  40233917 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 40233818  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  40233817 cacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 40233718  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  40233717 ttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacg 40233618  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  40233617 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 40233518  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  40233517 tct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34286860 - 34286355
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  34286860 acatcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 34286761  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  34286760 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 34286661  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  ||||||||     
T  34286660 tatctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 34286561  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  34286560 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 34286461  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34286460 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtagg 34286361  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  34286360 tctagc 34286355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34291920 - 34291415
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  34291920 acatcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 34291821  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  34291820 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 34291721  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  ||||||||     
T  34291720 tatctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 34291621  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  34291620 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 34291521  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34291520 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtagg 34291421  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  34291420 tctagc 34291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 13936279 - 13936781
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||  |||| |||| |||| ||  |||    
T  13936279 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttgg 13936378  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  13936379 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 13936478  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  13936479 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 13936578  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  13936579 ttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 13936678  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  13936679 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 13936778  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  13936779 tct 13936781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12587316 - 12586814
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  12587316 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 12587217  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  12587216 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 12587117  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  12587116 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 12587017  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  12587016 ttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 12586917  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  12586916 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 12586817  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  12586816 tct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27777728 - 27777226
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27777728 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27777629  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  27777628 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 27777529  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  27777528 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 27777429  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  27777428 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 27777329  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27777328 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 27777229  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  27777228 tct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27817486 - 27816984
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27817486 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27817387  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  27817386 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 27817287  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  27817286 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 27817187  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  27817186 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 27817087  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27817086 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 27816987  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  27816986 tct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 27392951 - 27392630
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27392951 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 27392852  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
       ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392851 atgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 27392752  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  27392751 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcg 27392652  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  27392651 ggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37375667 - 37375163
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  37375667 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 37375568  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||| || |    
T  37375567 catgttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccaca 37375468  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | ||||||     
T  37375467 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttc 37375368  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37375367 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37375268  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  37375267 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttgg 37375168  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  37375167 tctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 11634921 - 11635426
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||| |||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  11634921 acatcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 11635020  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  |    
T  11635021 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgca 11635120  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  |||||     
T  11635121 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttc 11635220  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  11635221 ttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 11635320  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  11635321 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 11635420  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  11635421 tctagc 11635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 21676917 - 21677422
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  21676917 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 21677016  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  21677017 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 21677116  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  21677117 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 21677216  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  21677217 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 21677316  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  21677317 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 21677416  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  21677417 cctagc 21677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27804213 - 27803711
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27804213 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27804114  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| |    
T  27804113 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcaca 27804014  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  27804013 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 27803914  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  27803913 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 27803814  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27803813 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 27803714  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  27803713 tct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 11641110 - 11641615
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||| |||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  11641110 acatcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 11641209  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  |    
T  11641210 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgca 11641309  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  |||||     
T  11641310 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttc 11641409  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  11641410 ttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 11641509  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  11641510 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtagg 11641609  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  11641610 tctagc 11641615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 23128868 - 23129169
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  23128868 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 23128967  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  23128968 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 23129067  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  23129068 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 23129167  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  23129168 tc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 28882153 - 28881852
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  28882153 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 28882054  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  28882053 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 28881954  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  28881953 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 28881854  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  28881853 tc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 32050304 - 32049799
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  32050304 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 32050205  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  32050204 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 32050105  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  32050104 cacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 32050005  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  32050004 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 32049905  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  32049904 ggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 32049805  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  32049804 cctagc 32049799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34862186 - 34861681
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  34862186 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 34862087  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||| |    
T  34862086 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcaca 34861987  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  34861986 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 34861887  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  34861886 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 34861787  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  34861786 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 34861687  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  34861686 cctagc 34861681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 37685644 - 37686149
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  37685644 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 37685743  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  37685744 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 37685843  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  37685844 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 37685943  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37685944 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37686043  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  37686044 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 37686143  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  37686144 cctagc 37686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 37700909 - 37701414
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  37700909 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 37701008  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  37701009 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 37701108  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  37701109 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 37701208  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37701209 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37701308  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  37701309 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 37701408  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  37701409 cctagc 37701414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 37925999 - 37925494
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  37925999 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 37925900  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  37925899 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 37925800  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  37925799 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 37925700  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37925699 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37925600  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37925599 ggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtagg 37925500  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  37925499 cctagc 37925494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 39051557 - 39052059
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  39051557 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 39051656  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   | || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  39051657 catgatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 39051756  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  39051757 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 39051856  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  39051857 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 39051956  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  39051957 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 39052056  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  39052057 tct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 12716337 - 12716839
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  12716337 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 12716436  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  12716437 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 12716536  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  12716537 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 12716636  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  12716637 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 12716736  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  12716737 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 12716836  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  12716837 tct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 16829073 - 16829578
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  16829073 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 16829172  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  16829173 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 16829272  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  16829273 cacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 16829372  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||    
T  16829373 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacg 16829472  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16829473 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 16829572  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  16829573 cctagc 16829578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16892408 - 16891903
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  16892408 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 16892309  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  16892308 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 16892209  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  16892208 cacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 16892109  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||    
T  16892108 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacg 16892009  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16892008 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 16891909  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  16891908 cctagc 16891903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 20837857 - 20837556
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  20837857 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggat 20837758  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20837757 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 20837658  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  20837657 accatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 20837558  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  20837557 tc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 12655481 - 12655180
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  12655481 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 12655382  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12655381 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 12655282  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  12655281 accatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 12655182  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  12655181 tc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39890580 - 39890075
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  39890580 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 39890481  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  39890480 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 39890381  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  39890380 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 39890281  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||    
T  39890280 ttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacg 39890181  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  39890180 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 39890081  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  39890080 tctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Original strand, 260488 - 260984
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  260488 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 260587  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||| |||||||  |    
T  260588 catgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgca 260687  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  260688 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 260787  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||     
T  260788 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaca 260887  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  260888 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31876788 - 31876282
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||| | |||||  ||| | || ||  ||    
T  31876788 gacatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttg 31876689  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||| |  |||| |||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| |||     
T  31876688 gcatgatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcac 31876589  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||    
T  31876588 acacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagctt 31876489  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  31876488 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 31876389  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||||    
T  31876388 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtag 31876289  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    | |||||    
T  31876288 gcctagc 31876282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Original strand, 19416234 - 19416664
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  19416234 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 19416333  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  19416334 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 19416433  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  19416434 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttc 19416533  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  19416534 ttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 19416633  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416634 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Original strand, 31891608 - 31891742
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891608 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 31891707  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891708 gcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27118649 - 27118515
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27118649 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 27118550  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118549 gcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 3784605 - 3784481
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 34156962 - 34156838
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 580 - 695
Target Start/End: Original strand, 34303602 - 34303717
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34303602 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 34303701  T
Q  680 ataactgggcagcatt 695  Q
     || ||| ||||||||    
T  34303702 gtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 16163550 - 16163426
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279450
Alignment:
Q  307 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 406  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  407 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 506  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  507 aaaagtaggtctagc 521  Q
     ||||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagc 34279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 583 - 797
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  783 gtacctctttgatgc 797  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 589 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37374799
Alignment:
Q  589 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 688  Q
    ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 37374992  T
Q  689 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 788  Q
      || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  37374991 ttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 37374892  T
Q  789 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374891 cttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 31876184 - 31876002
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31876184 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31876085  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  31876084 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 34861583 - 34861401
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34861583 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 34861484  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  34861483 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 37686247 - 37686429
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37686247 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37686346  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37686347 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 37701512 - 37701694
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37701512 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37701611  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37701612 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 39889965 - 39889783
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39889965 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca 39889866  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  39889865 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 583 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  783 gtacctctt 791  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 16829676 - 16829858
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16829676 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16829775  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829776 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 16891805 - 16891623
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16891805 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16891706  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891705 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Original strand, 19416837 - 19417042
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19416837 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagcca 19416936  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19416937 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19417036  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  19417037 tttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Original strand, 22926366 - 22926547
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  22926366 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 22926465  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  22926466 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 830
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  577 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 676  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  677 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 776  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  777 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 16626292 - 16626798
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  16626292 gacatcgctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactg 16626391  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626392 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 16626491  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16626492 atacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagctt 16626591  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16626592 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 16626691  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16626692 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtag 16626791  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16626792 gtctagc 16626798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18530860 - 18530354
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  18530860 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattg 18530761  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18530760 gcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcat 18530661  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18530660 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagctt 18530561  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18530560 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 18530461  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  18530460 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtag 18530361  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  18530360 gtctagc 18530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652353
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctca 5652652  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 5652552  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  5652551 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 5652452  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5652451 tgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034409
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 31034109  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  31034110 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 31034209  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  31034210 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcag 31034309  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31034310 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32292718
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 32293018  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  32293017 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 32292918  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  32292917 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 32292818  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32292817 gtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4625910
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctca 4626209  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 4626109  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  4626108 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 4626009  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4626008 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17994076
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 17993777  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 17993877  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  17993878 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 17993977  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17993978 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Original strand, 16626838 - 16627158
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16626838 catttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgt 16626937  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626938 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-t 16627036  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16627037 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcg 16627136  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16627137 agtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 18530320 - 18529999
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530320 catttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 18530221  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530220 gcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctt 18530121  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18530120 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 18530021  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18530020 agtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713196
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5713492  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5713392  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5713391 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5713292  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5713291 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5713196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5724106
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5724402  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5724302  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5724301 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5724202  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5724201 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 518
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5768262
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5767966  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5768066  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5768067 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5768166  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5768167 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18051734 - 18051228
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||    
T  18051734 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattg 18051635  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
     |||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||||     
T  18051634 acatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcac 18051535  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  18051534 atacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 18051435  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| |    
T  18051434 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagc 18051335  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  18051334 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 18051235  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  18051234 gtctagc 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6192788 - 6192282
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  6192788 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 6192689  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  6192688 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 6192589  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  6192588 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 6192489  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| |    
T  6192488 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagc 6192389  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  6192388 agatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 6192289  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  6192288 gtctagc 6192282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 8296444 - 8295938
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  8296444 gacatcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 8296345  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  8296344 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 8296245  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||    
T  8296244 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctt 8296145  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  8296144 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 8296045  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
     ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  8296044 agatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 8295945  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  8295944 gtctagc 8295938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 521
Target Start/End: Original strand, 15740883 - 15741386
Alignment:
Q  18 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 117  Q
    |||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  15740883 atcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 15740982  T
Q  118 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 217  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  15740983 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 15741082  T
Q  218 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 317  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||    
T  15741083 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 15741182  T
Q  318 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 417  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| |    
T  15741183 cacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaa 15741282  T
Q  418 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 517  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15741283 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 15741382  T
Q  518 tagc 521  Q
    ||||    
T  15741383 tagc 15741386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4722103 - 4721597
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  4722103 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 4722004  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  4722003 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcac 4721904  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |||||||| |  ||||| ||    
T  4721903 atacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatt 4721804  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| |    
T  4721803 tttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagc 4721704  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4721703 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 4721604  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  4721603 gtctagc 4721597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 29148541 - 29149047
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||    
T  29148541 gacatcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttg 29148640  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  29148641 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 29148740  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  29148741 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 29148840  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  29148841 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 29148940  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  29148941 ggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 29149040  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  29149041 gtctagc 29149047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 4796439 - 4796945
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  4796439 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 4796538  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  4796539 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 4796638  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  4796639 atacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 4796738  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  4796739 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 4796838  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  4796839 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 4796938  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  4796939 gtctagc 4796945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 8301053 - 8301559
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  8301053 gacatcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 8301152  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  8301153 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 8301252  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  8301253 acacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 8301352  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  8301353 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 8301452  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  8301453 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 8301552  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  8301553 gtctagc 8301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 15892492 - 15892998
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||    
T  15892492 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttg 15892591  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  15892592 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 15892691  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  15892692 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 15892791  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||     
T  15892792 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaa 15892891  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  15892892 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtag 15892991  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  15892992 gtctagc 15892998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330635
Alignment:
Q  19 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 118  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  119 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 18330938  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18330937 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18330838  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  18330837 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 18330738  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18330737 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18330638  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  18330637 agc 18330635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 518
Target Start/End: Original strand, 5756907 - 5757371
Alignment:
Q  53 tctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagctt 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||     |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  5756907 tctggatgtcattctgancacngtagcacnnncaaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactc 5757005  T
Q  153 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757006 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5757105  T
Q  253 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 352  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5757106 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5757205  T
Q  353 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 452  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5757206 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5757305  T
Q  453 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    ||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5757306 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7073683 - 7073178
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||    
T  7073683 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttgg 7073584  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  7073583 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 7073484  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  ||||||||     
T  7073483 cacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttc 7073384  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  7073383 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 7073284  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7073283 gatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtagg 7073184  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  7073183 tctagc 7073178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 521
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22387870
Alignment:
Q  19 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 118  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  119 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22387567  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22387568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22387667  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  22387668 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 22387767  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22387768 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtct 22387867  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  22387868 agc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35880732
Alignment:
Q  19 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 118  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  119 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 35881035  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  35881034 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 35880935  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| |||||    
T  35880934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggat 35880835  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35880834 caggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 35880735  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  35880734 agc 35880732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 10396604 - 10396099
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  10396604 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 10396505  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  10396504 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 10396405  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| |  ||||||||     
T  10396404 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttc 10396305  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  10396304 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 10396205  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10396204 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtagg 10396105  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  10396104 tctagc 10396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 580 - 870
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 870  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 28115741 - 28116246
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  28115741 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 28115840  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  |    
T  28115841 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgca 28115940  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||     
T  28115941 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttc 28116040  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28116041 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28116140  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  28116141 gatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 28116240  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  28116241 tctagc 28116246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4417390 - 4416885
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  4417390 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttgg 4417291  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4417290 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4417191  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||     
T  4417190 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 4417091  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4417090 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4416991  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4416990 gatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 4416891  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  4416890 cctagc 4416885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 18276839 - 18277344
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18276839 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 18276938  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  18276939 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 18277038  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  18277039 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 18277138  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||     
T  18277139 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaact 18277238  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  18277239 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 18277338  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  18277339 tctagc 18277344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 18307441 - 18307946
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18307441 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 18307540  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  18307541 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 18307640  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  18307641 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 18307740  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||     
T  18307741 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaact 18307840  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  18307841 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 18307940  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  18307941 tctagc 18307946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 11110136 - 11110638
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||| | |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  11110136 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 11110235  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  11110236 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcaca 11110335  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  11110336 cacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 11110435  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  11110436 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 11110535  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  11110536 gatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 11110635  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  11110636 tct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 18292140 - 18292645
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18292140 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 18292239  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  18292240 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 18292339  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  18292340 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 18292439  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||     
T  18292440 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaact 18292539  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  18292540 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 18292639  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  18292640 tctagc 18292645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 20576634 - 20577136
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  20576634 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 20576733  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  20576734 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 20576833  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  20576834 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 20576933  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  20576934 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 20577033  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20577034 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 20577133  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  20577134 tct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 29664757 - 29665259
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  29664757 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 29664856  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  29664857 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 29664956  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  29664957 cacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 29665056  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  29665057 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 29665156  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29665157 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 29665256  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  29665257 tct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 48466398 - 48465896
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  48466398 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 48466299  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  48466298 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 48466199  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||     
T  48466198 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 48466099  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  48466098 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 48465999  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  48465998 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 48465899  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  48465898 tct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28021746 - 28021241
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  28021746 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttgg 28021647  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  28021646 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 28021547  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  28021546 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 28021447  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |    
T  28021446 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatg 28021347  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  28021346 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 28021247  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  28021246 tctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8212209 - 8211713
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  8212209 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 8212110  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  8212109 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 8212010  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  8212009 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 8211910  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  8211909 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 8211810  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8211809 gatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 36996864 - 36997366
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  36996864 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 36996963  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| |    
T  36996964 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcaca 36997063  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  36997064 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 36997163  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  36997164 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 36997263  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  36997264 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 36997363  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  36997364 tct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 51782494 - 51782052
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  51782494 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 51782395  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  51782394 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 51782295  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  51782294 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttc 51782195  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  51782194 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 51782095  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 458  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782094 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 5609109 - 5609614
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5609109 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5609208  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| |    
T  5609209 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 5609308  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  5609309 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 5609408  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5609409 ttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5609508  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5609509 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 5609608  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  5609609 cctagc 5609614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 8301618 - 8301919
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||     
T  8301618 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggag 8301717  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8301718 gcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8301817  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8301818 accatacctctttgacgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8301917  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  8301918 tc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21675164 - 21674659
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  21675164 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 21675065  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  21675064 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 21674965  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  21674964 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 21674865  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  21674864 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 21674765  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21674764 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 21674665  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  21674664 tctagc 21674659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 6542249 - 6542753
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| ||||   |||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  6542249 acatcactgacggtcaggaaattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 6542348  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | |    
T  6542349 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttaca 6542448  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  6542449 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 6542548  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  6542549 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 6542648  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6542649 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 6542748  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  6542749 tctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28339773 - 28339268
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  28339773 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 28339674  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  28339673 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 28339574  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  28339573 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 28339474  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28339473 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28339374  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  28339373 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 28339274  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  28339273 cctagc 28339268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 8295879 - 8295578
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  8295879 ttaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 8295780  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8295779 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8295680  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8295679 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8295580  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  8295579 tc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 18051166 - 18050865
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  18051166 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 18051067  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18051066 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18050967  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18050966 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18050867  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  18050866 tc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 5467456 - 5466953
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5467456 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5467357  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  5467356 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 5467257  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || | ||| ||||| |  ||||||||     
T  5467256 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttc 5467157  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5467156 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5467057  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| |||||  |||||||||| ||    
T  5467056 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttgg 5466957  T
Q  516 tcta 519  Q
    ||||    
T  5466956 tcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 31964260 - 31964765
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||| |||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31964260 acatctctgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31964359  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  31964360 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 31964459  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  31964460 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 31964559  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31964560 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31964659  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  31964660 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 31964759  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  31964760 cctagc 31964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 47023924 - 47023419
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  47023924 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 47023825  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  47023824 catgatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 47023725  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  47023724 cacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 47023625  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  47023624 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 47023525  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  47023524 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 47023425  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  47023424 cctagc 47023419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 4346474 - 4346979
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  4346474 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 4346573  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4346574 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4346673  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  4346674 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 4346773  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4346774 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4346873  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4346874 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 4346973  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  4346974 tctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 521
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985248
Alignment:
Q  45 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 144  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    |||| ||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  145 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 244  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  245 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 344  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 17985071  T
Q  345 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 444  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17985072 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 17985171  T
Q  445 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985172 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 17985248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18243210 - 18242706
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18243210 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 18243111  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  18243110 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 18243011  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  18243010 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 18242911  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  18242910 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 18242811  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18242810 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 18242711  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  18242710 tctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 32439625 - 32439120
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    |    
T  32439625 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcag 32439526  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  32439525 catgatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 32439426  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  32439425 tatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttc 32439326  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  32439325 ttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 32439226  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  32439225 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 32439126  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  32439125 tctagc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 35880670 - 35880369
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  35880670 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 35880571  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  35880570 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 35880471  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  35880470 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 35880371  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  35880370 tc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 22870643 - 22871148
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  22870643 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 22870742  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  22870743 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 22870842  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  22870843 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 22870942  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  22870943 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 22871042  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22871043 gatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 22871142  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  22871143 tctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 22885702 - 22886207
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  22885702 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 22885801  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  22885802 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 22885901  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  22885902 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 22886001  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  22886002 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 22886101  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22886102 gatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 22886201  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  22886202 tctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134363
Alignment:
Q  148 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 247  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  248 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 347  Q
    | || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  50134090 gtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 50134189  T
Q  348 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 447  Q
     || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  50134190 gacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgta 50134289  T
Q  448 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50134290 caatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 50134363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5014183 - 5013687
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  5014183 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 5014084  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  5014083 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 5013984  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  5013983 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 5013884  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5013883 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5013784  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  5013783 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 5596144 - 5596648
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  5596144 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 5596243  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  5596244 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 5596343  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  5596344 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 5596443  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5596444 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5596543  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||    
T  5596544 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttgg 5596643  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  5596644 tctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24328630 - 24328200
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24328630 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24328531  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  24328530 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 24328431  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  24328430 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 24328331  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  24328330 ttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 24328231  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328230 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7997033 - 7996528
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  7997033 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 7996934  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| |    
T  7996933 catgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcaca 7996834  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  7996833 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 7996734  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  7996733 ttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 7996634  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  7996633 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 7996534  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  7996533 cctagc 7996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 10643541 - 10643036
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  10643541 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 10643442  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| |    
T  10643441 catgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcaca 10643342  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  10643341 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 10643242  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  10643241 ttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 10643142  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10643141 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 10643042  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  10643041 cctagc 10643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18225662 - 18225157
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | ||||||    || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  18225662 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 18225563  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||| ||| |    
T  18225562 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcaca 18225463  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  18225462 cacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 18225363  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  18225362 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 18225263  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || |||||    
T  18225262 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtagg 18225163  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  18225162 cctagc 18225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 18330573 - 18330277
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  18330573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 18330479  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18330478 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18330379  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18330378 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18330279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20066514 - 20066010
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| |  | ||||  || ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||         
T  20066514 acatcactgacagtaaggtgattgctgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaa 20066415  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||  || || || || ||   |||| | || ||| |    
T  20066414 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcaca 20066315  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  20066314 tatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttc 20066215  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  20066214 ttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 20066115  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    |    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  20066114 ggcccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 20066015  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  20066014 tctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 51797461 - 51797141
Alignment:
Q  139 gcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcag 238  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |    
T  51797461 gctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcgg 51797362  T
Q  239 cgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta 338  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  51797361 catgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcata 51797262  T
Q  339 gcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 437  Q
     || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51797261 acacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctg 51797162  T
Q  438 tctggttgtgcagtgccctct 458  Q
    ||| ||||| || ||||||||    
T  51797161 tctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 17994126 - 17994250
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 580 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 4625851 - 4625736
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4625851 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 4625752  T
Q  680 ataactgggcagcatt 695  Q
     || ||| ||||||||    
T  4625751 gtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 5652303 - 5652179
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 572 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctt 791  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 572 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 870  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 583 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  683 actgggcagcatt 695  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 583 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  683 actgggcagcatt 695  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 583 - 695
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  683 actgggcagcatt 695  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 583 - 695
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  683 actgggcagcatt 695  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 833  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 833  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 592 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  592 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 691  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  692 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 791  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  792 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 28021146 - 28020964
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28021146 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcca 28021047  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021046 tggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 821
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 5013580 - 5013315
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  5013580 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 5013481  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  5013480 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 5013381  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013380 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 869
Target Start/End: Original strand, 6542864 - 6543117
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6542864 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 6542963  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  6542964 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 6543063  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543064 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 4347074 - 4347256
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  | | ||||| ||||||   |  ||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4347074 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagcca 4347173  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4347174 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 18242595 - 18242381
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18242595 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 18242496  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18242495 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18242396  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  18242395 tttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893176
Alignment:
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 24328027 - 24327822
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24328027 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24327928  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  24327927 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 24327828  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  24327827 tttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 28339170 - 28338989
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  28339170 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 28339071  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  28339070 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Original strand, 31964863 - 31965044
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  31964863 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 31964962  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  31964963 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Original strand, 50134461 - 50134642
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  50134461 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 50134560  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  50134561 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 583 - 767
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 767  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 691 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  791 ttgatgc 797  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 572 - 720
Target Start/End: Original strand, 22387921 - 22388069
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22387921 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggta 22388020  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 720  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388021 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 794
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  791 ttga 794  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 48465816 - 48465569
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||  | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  48465816 acgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 48465717  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  48465716 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 48465617  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465616 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  790 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 32439069 - 32438771
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  32439069 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 32438970  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| |||    
T  32438969 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtga 32438870  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 870  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438869 tgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 572 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 4893125 - 4892977
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  4893125 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 4893026  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 720  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893025 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20461591 - 20461085
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||    
T  20461591 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactg 20461492  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  20461491 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcat 20461392  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20461391 atacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagctt 20461292  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20461291 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 20461192  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20461191 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtag 20461092  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  20461091 gtctagc 20461085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 20340080 - 20340586
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||    
T  20340080 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactg 20340179  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20340180 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcat 20340279  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20340280 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagctt 20340379  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  20340380 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaac 20340479  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20340480 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtag 20340579  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  20340580 gtctagc 20340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 16207776 - 16208282
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16207776 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactg 16207875  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16207876 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcat 16207975  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||    
T  16207976 atacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagctt 16208075  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16208076 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 16208175  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  16208176 ggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtag 16208275  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16208276 gtctagc 16208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28151866
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctc 28152166  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  28152165 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 28152066  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  28152065 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcag 28151966  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28151965 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 20461069 - 20460748
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctt 20460870  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20460869 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20460770  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20460769 agtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Original strand, 16208319 - 16208640
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16208319 catttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
       ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208419 atgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctt 16208518  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208519 tcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16208618  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16208619 agtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 41793054 - 41793559
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||| ||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  41793054 acattactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 41793153  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  41793154 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 41793253  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  | ||||||     
T  41793254 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttc 41793353  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  41793354 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 41793453  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  41793454 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 41793553  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  41793554 cctagc 41793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 10963179 - 10962674
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||  ||  |||    
T  10963179 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttgg 10963080  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  10963079 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 10962980  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  10962979 catttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 10962880  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  10962879 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 10962780  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10962779 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 10962680  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  10962679 cctagc 10962674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28585490 - 28584985
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  28585490 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 28585391  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  28585390 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 28585291  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  28585290 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 28585191  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28585190 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28585091  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  28585090 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 28584991  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  28584990 cctagc 28584985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 51638728 - 51638222
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||    
T  51638728 gacatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttg 51638629  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||     
T  51638628 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcac 51638529  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||    
T  51638528 acacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagctt 51638429  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  51638428 cttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 51638329  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    || | |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  51638328 gggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtag 51638229  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    | |||||    
T  51638228 gcctagc 51638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Original strand, 20340626 - 20340760
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340626 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 20340725  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340726 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 10962576 - 10962362
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  10962576 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 10962477  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |    
T  10962476 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagc 10962377  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  10962376 tttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 51638124 - 51637910
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  51638124 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 51638025  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  51638024 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 51637925  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  51637924 tttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 16449629 - 16450135
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16449629 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattg 16449728  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16449729 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcat 16449828  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||    
T  16449829 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctt 16449928  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  16449929 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaa 16450028  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16450029 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtag 16450128  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16450129 gtctagc 16450135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16041835 - 16041329
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16041835 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattg 16041736  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    | |||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  16041735 gtatgatcgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgt 16041636  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||    
T  16041635 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctt 16041536  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16041535 tttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaac 16041436  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  16041435 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtag 16041336  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16041335 gtctagc 16041329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26484700
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26485000  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26484999 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26484900  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26484899 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26484800  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26484799 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39211160
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 39210860  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  39210861 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 39210960  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  39210961 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 39211060  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39211061 gtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088601
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31088302  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31088402  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  31088403 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 31088502  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31088503 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2775864 - 2775365
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  2775864 ctgatagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgat 2775765  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2775764 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 2775665  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2775664 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2775565  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  2775564 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 2775465  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2775464 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 2108644 - 2109142
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2108644 tgacagttagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 2108743  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2108744 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctca 2108843  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  2108844 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2108943  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    
T  2108944 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 2109043  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2109044 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2109142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733466
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 45733765  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 45733665  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  45733664 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 45733565  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45733564 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 45733466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 392
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26683008
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26682837  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  26682838 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaa 26682937  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 392  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682938 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200682
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctca 4200852  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 4200752  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 392  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200751 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 561 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 16041289 - 16040980
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16041289 catttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 16041190  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041189 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16041090  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041089 tcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16040990  T
Q  861 agtccccatg 870  Q
    ||| ||||||    
T  16040989 agttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 564 - 882
Target Start/End: Original strand, 16450178 - 16450496
Alignment:
Q  564 ttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgca 663  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  16450178 ttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcg 16450277  T
Q  664 tacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttct 763  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450278 tacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttct 16450377  T
Q  764 tcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagt 863  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450378 tcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagt 16450477  T
Q  864 ccccatgatgtccatctca 882  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16450478 ccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5127998
Alignment:
Q  19 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 118  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  119 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 5128301  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  5128300 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 5128201  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5128200 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5128101  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5128100 taggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5128001  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  5128000 agc 5127998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 10916499 - 10917005
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  10916499 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 10916598  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  10916599 gcatgatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 10916698  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  10916699 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 10916798  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  10916799 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 10916898  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  10916899 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 10916998  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  10916999 gtctagc 10917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 521
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11424913
Alignment:
Q  19 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 118  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaa-aattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  119 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 11424610  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  11424611 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 11424710  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  11424711 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 11424810  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11424811 caggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 11424910  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  11424911 agc 11424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 16518047 - 16518553
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  16518047 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16518146  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||     
T  16518147 gcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcac 16518246  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||    
T  16518247 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctt 16518346  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  16518347 cttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 16518446  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  16518447 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 16518546  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16518547 gtctagc 16518553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2155085 - 2154579
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  2155085 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 2154986  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  2154985 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 2154886  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  2154885 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 2154786  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  2154785 cttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 2154686  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||     
T  2154685 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtat 2154586  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  2154585 gtctagc 2154579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 16503011 - 16503517
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  16503011 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16503110  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||     
T  16503111 gcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcac 16503210  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  16503211 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 16503310  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  16503311 cttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 16503410  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  16503411 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 16503510  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16503511 gtctagc 16503517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18541308 - 18540805
Alignment:
Q  18 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 117  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    |||    
T  18541308 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagca 18541209  T
Q  118 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 217  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||    
T  18541208 tgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 18541109  T
Q  218 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 317  Q
     ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  18541108 tctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttctt 18541009  T
Q  318 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 417  Q
     || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||     
T  18541008 gacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 18540909  T
Q  418 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 517  Q
    |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18540908 tccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtc 18540809  T
Q  518 tagc 521  Q
    ||||    
T  18540808 tagc 18540805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 5146972 - 5147477
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5146972 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5147071  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||  |    
T  5147072 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgca 5147171  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  5147172 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 5147271  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5147272 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5147371  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5147372 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtagg 5147471  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  5147472 tctagc 5147477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26435768 - 26435263
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||    
T  26435768 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcgg 26435669  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  26435668 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 26435569  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  26435568 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 26435469  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26435468 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26435369  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  26435368 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 26435269  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  26435268 tctagc 26435263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 26274726 - 26275231
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  26274726 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 26274825  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  26274826 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 26274925  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  26274926 cacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 26275025  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26275026 ttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26275125  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26275126 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 26275225  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  26275226 cctagc 26275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3445817 - 3445315
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  3445817 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 3445718  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| |    
T  3445717 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcaca 3445618  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  3445617 tacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 3445518  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  3445517 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 3445418  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3445417 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 3445318  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  3445317 tct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 26537502 - 26538004
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||  |||    
T  26537502 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttgg 26537601  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  26537602 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 26537701  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  26537702 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 26537801  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26537802 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26537901  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  26537902 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 26538001  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  26538002 tct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 4144755 - 4145260
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  4144755 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 4144854  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  4144855 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 4144954  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  4144955 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 4145054  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4145055 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4145154  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4145155 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 4145254  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  4145255 cctagc 4145260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 26319501 - 26320006
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  26319501 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttgg 26319600  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  26319601 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 26319700  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  26319701 cacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 26319800  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26319801 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26319900  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26319901 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 26320000  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  26320001 cctagc 26320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 31564022 - 31564526
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31564022 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31564121  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  31564122 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 31564221  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  31564222 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 31564321  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31564322 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31564421  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  31564422 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 31564521  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  31564522 tctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 16736092 - 16736597
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  16736092 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 16736191  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| |    
T  16736192 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 16736291  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  16736292 cacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 16736391  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||    
T  16736392 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacg 16736491  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16736492 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 16736591  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  16736592 cctagc 16736597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 16751146 - 16751651
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  16751146 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 16751245  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| |    
T  16751246 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 16751345  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  16751346 cacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 16751445  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||    
T  16751446 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacg 16751545  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16751546 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 16751645  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  16751646 cctagc 16751651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17524043 - 17523538
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  17524043 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 17523944  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| |    
T  17523943 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 17523844  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  17523843 cacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 17523744  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||    
T  17523743 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacg 17523644  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17523643 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 17523544  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  17523543 cctagc 17523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 17529172 - 17529677
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  17529172 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 17529271  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| |    
T  17529272 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 17529371  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  17529372 cacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 17529471  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||    
T  17529472 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacg 17529571  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17529572 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 17529671  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  17529672 cctagc 17529677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9619162 - 9618657
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  9619162 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 9619063  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  9619062 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 9618963  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  9618962 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 9618863  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  9618862 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 9618763  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9618762 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 9618663  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  9618662 cctagc 9618657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 26669546 - 26670051
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||||||||    ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  26669546 acatcactgacagtcaggagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 26669645  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  26669646 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 26669745  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  26669746 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 26669845  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||||||    
T  26669846 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacg 26669945  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26669946 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 26670045  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  26670046 cctagc 26670051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11442021 - 11441587
Alignment:
Q  78 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 177  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11442021 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 11441922  T
Q  178 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 277  Q
    || |  || || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  11441921 gcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacat 11441822  T
Q  278 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 377  Q
    | |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  11441821 tattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 11441722  T
Q  378 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 477  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  11441721 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 11441622  T
Q  478 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  11441621 agttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Original strand, 24592173 - 24592603
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24592173 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24592272  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  24592273 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 24592372  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  24592373 cacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 24592472  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  24592473 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 24592572  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592573 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 45387854 - 45387349
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  45387854 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 45387755  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| |    
T  45387754 catgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcaca 45387655  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  45387654 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 45387555  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  45387554 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 45387455  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  45387454 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 45387355  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  45387354 cctagc 45387349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31125431 - 31124927
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||    
T  31125431 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttgg 31125332  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  31125331 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 31125232  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  31125231 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttc 31125132  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31125131 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31125032  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  31125031 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 31124932  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  31124931 tctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 10917064 - 10917365
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||| |     
T  10917064 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaag 10917163  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  10917164 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 10917263  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  10917264 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 10917363  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  10917364 tc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 11424975 - 11425276
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  11424975 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 11425074  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11425075 gcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11425174  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11425175 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11425274  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  11425275 tc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5160030 - 5159525
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    |    
T  5160030 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcag 5159931  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  5159930 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 5159831  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  5159830 tatctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttc 5159731  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  5159730 ttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 5159631  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5159630 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 5159531  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  5159530 tctagc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 31088651 - 31088775
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 45733416 - 45733292
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 583 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 833  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 31124819 - 31124554
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31124819 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 31124720  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  31124719 ttgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagc 31124620  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124619 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 572 - 797
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Original strand, 24592776 - 24593041
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24592776 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24592875  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  24592876 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 24592975  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592976 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 9618559 - 9618345
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9618559 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9618460  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  9618459 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 9618360  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  9618359 tttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 26275329 - 26275511
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26275329 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26275428  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  26275429 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 616 - 796
Target Start/End: Original strand, 26320104 - 26320284
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26320104 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26320203  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 796  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  26320204 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26513292 - 26513130
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  26513292 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttgg 26513193  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttg 178  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26513192 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  791 ttgatgca 798  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 583 - 798
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  783 gtacctctttgatgca 798  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Original strand, 26670149 - 26670363
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  26670149 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcta 26670248  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26670249 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26670348  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  26670349 tttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 572 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 5159474 - 5159326
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  5159474 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 5159375  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 720  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159374 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 798
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  791 ttgatgca 798  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22888990 - 22888484
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  22888990 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaacta 22888891  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22888890 gcatgatcatggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcat 22888791  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||    
T  22888790 atacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagctt 22888691  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22888690 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaac 22888591  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  22888590 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtag 22888491  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  22888490 gtctagc 22888484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 25199549 - 25199043
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  25199549 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactg 25199450  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25199449 gcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcat 25199350  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||    
T  25199349 atacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagctt 25199250  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  25199249 cttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaac 25199150  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||    
T  25199149 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtag 25199050  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  25199049 gtctagc 25199043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 13184299 - 13184796
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13184299 tgacagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 13184397  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13184398 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13184497  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13184498 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13184597  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13184598 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13184697  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13184698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877261
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 33877561  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  33877560 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 33877461  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  33877460 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 33877361  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33877360 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11325808
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 11326107  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 11326007  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  11326006 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 11325907  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11325906 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440642
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13440343  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13440443  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13440444 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13440543  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13440544 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 29888732 - 29889230
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29888732 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 29888831  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29888832 acggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctca 29888931  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  29888932 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacga 29889031  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  29889032 tgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcagg 29889131  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29889132 tggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 29889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23892725 - 23892220
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  |||    
T  23892725 acatcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttgg 23892626  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23892625 catgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 23892526  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||     
T  23892525 tacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttc 23892426  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23892425 ttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacg 23892326  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  23892325 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtagg 23892226  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  23892225 tctagc 23892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 561 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 23892177 - 23891855
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23892177 catttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggc 23892078  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892077 gcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 23891978  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23891977 tcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacg 23891878  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctcat 883  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  23891877 agtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 25199003 - 25198682
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25199003 catttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggc 25198904  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25198903 gcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttcct 25198804  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  25198803 tcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatg 25198704  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  25198703 agtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548691
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || ||     
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 9548392  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  9548393 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 9548492  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  9548493 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 9548592  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9548593 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 9548691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 24687799 - 24688305
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24687799 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatg 24687898  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  24687899 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24687998  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  24687999 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 24688098  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  24688099 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 24688198  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||    
T  24688199 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtag 24688298  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  24688299 gtctagc 24688305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 23717630 - 23718136
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  23717630 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 23717729  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  23717730 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 23717829  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  23717830 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 23717929  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  23717930 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 23718029  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  23718030 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 23718129  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  23718130 gtctagc 23718136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 521
Target Start/End: Original strand, 23752095 - 23752598
Alignment:
Q  18 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 117  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| | | |||| |||||||  |||||    
T  23752095 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggca 23752194  T
Q  118 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 217  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  23752195 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 23752294  T
Q  218 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 317  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||    
T  23752295 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 23752394  T
Q  318 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 417  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  23752395 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacgga 23752494  T
Q  418 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 517  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23752495 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 23752594  T
Q  518 tagc 521  Q
    ||||    
T  23752595 tagc 23752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33778004 - 33777501
Alignment:
Q  18 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 117  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  33778004 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 33777905  T
Q  118 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 217  Q
    |||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  33777904 tgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 33777805  T
Q  218 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 317  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||    
T  33777804 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 33777705  T
Q  318 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 417  Q
     || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  33777704 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacgga 33777605  T
Q  418 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 517  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33777604 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 33777505  T
Q  518 tagc 521  Q
    ||||    
T  33777504 tagc 33777501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 22998756 - 22999262
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  22998756 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 22998855  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  22998856 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 22998955  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  22998956 atacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 22999055  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  22999056 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 22999155  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  22999156 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 22999255  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  22999256 gtctagc 22999262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 30935153 - 30934647
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  30935153 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 30935054  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  30935053 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcac 30934954  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  30934953 atacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 30934854  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  30934853 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 30934754  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  30934753 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 30934654  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  30934653 gtctagc 30934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549368
Alignment:
Q  26 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatg 125  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  126 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 225  Q
    |   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  226 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 325  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |    
T  11549663 atatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatat 11549564  T
Q  326 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 425  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11549563 acttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11549464  T
Q  426 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549463 gggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24970538 - 24970032
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24970538 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24970439  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  24970438 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24970339  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
     ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    |||||||| |  ||||||||    
T  24970338 gtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagctt 24970239  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24970238 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24970139  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  24970138 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 24970039  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  24970038 gtctagc 24970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 15658402 - 15658908
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||    
T  15658402 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttg 15658501  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  15658502 gcatgatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcac 15658601  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  15658602 acatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 15658701  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  15658702 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 15658801  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  15658802 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtag 15658901  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  15658902 gtctagc 15658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 18500373 - 18500877
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18500373 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 18500472  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| |    
T  18500473 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcaca 18500572  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  18500573 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 18500672  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  18500673 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 18500772  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18500773 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 18500872  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  18500873 tctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28649754 - 28649250
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  28649754 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 28649655  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  28649654 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 28649555  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  28649554 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 28649455  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28649454 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28649355  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  28649354 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 28649255  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  28649254 tctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6874824 - 6874319
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  6874824 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 6874725  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  6874724 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 6874625  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  || |||||     
T  6874624 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttc 6874525  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  6874524 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 6874425  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  6874424 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 6874325  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  6874324 cctagc 6874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12132674 - 12132169
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  |||    
T  12132674 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttgg 12132575  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  12132574 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 12132475  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  12132474 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 12132375  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  12132374 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 12132275  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12132274 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 12132175  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  12132174 cctagc 12132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 31826050 - 31826552
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31826050 acatcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31826149  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| |    
T  31826150 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcaca 31826249  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  31826250 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 31826349  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31826350 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31826449  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  31826450 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 31826549  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  31826550 tct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 43078771 - 43078269
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  43078771 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 43078672  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  43078671 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 43078572  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | ||||||     
T  43078571 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttc 43078472  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  43078471 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 43078372  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  43078371 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 43078272  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  43078271 tct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2511570 - 2511065
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  2511570 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 2511471  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| |    
T  2511470 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 2511371  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  2511370 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 2511271  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  2511270 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 2511171  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  2511170 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 2511071  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  2511070 cctagc 2511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9317970 - 9317465
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  9317970 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 9317871  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  9317870 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 9317771  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  9317770 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 9317671  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  9317670 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 9317571  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9317570 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 9317471  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  9317470 cctagc 9317465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 41675228 - 41674723
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||| ||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  41675228 acattactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 41675129  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  41675128 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 41675029  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| |||||     
T  41675028 tatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttc 41674929  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  41674928 ttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacg 41674829  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  41674828 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 41674729  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  41674728 tctagc 41674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 18375054 - 18375560
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||    
T  18375054 gacatcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttg 18375153  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  18375154 gcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcac 18375253  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||    
T  18375254 acacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagctt 18375353  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  18375354 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 18375453  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  18375454 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtag 18375553  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  18375554 gtctagc 18375560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 30152537 - 30152032
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  30152537 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 30152438  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  30152437 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 30152338  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  30152337 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 30152238  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  30152237 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 30152138  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  30152137 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 30152038  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  30152037 cctagc 30152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31431959 - 31431463
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  31431959 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 31431860  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  31431859 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 31431760  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  31431759 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 31431660  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31431659 ttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31431560  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31431559 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 37671126 - 37671630
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  37671126 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 37671225  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |   |||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  37671226 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 37671325  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  37671326 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 37671425  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37671426 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37671525  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37671526 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 37671625  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  37671626 tctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 8665118 - 8665623
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  8665118 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 8665217  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  8665218 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 8665317  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  8665318 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 8665417  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  8665418 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 8665517  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8665518 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 8665617  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  8665618 cctagc 8665623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 15758500 - 15759005
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  15758500 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 15758599  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  15758600 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 15758699  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  15758700 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 15758799  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  15758800 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 15758899  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15758900 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 15758999  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  15759000 cctagc 15759005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 13324472 - 13324976
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  13324472 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 13324571  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  13324572 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 13324671  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  13324672 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 13324771  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || |    
T  13324772 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaag 13324871  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  13324872 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 13324971  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  13324972 tctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 37358286 - 37358790
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  37358286 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 37358385  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  37358386 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 37358485  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  37358486 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 37358585  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37358586 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37358685  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37358686 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 37358785  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  37358786 tctag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5638429 - 5637924
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5638429 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5638330  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  5638329 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 5638230  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  5638229 cacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 5638130  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  5638129 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 5638030  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5638029 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 5637930  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  5637929 cctagc 5637924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 23752660 - 23752961
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23752660 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23752759  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23752760 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23752859  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23752860 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 23752959  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  23752960 tc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 30934588 - 30934287
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  30934588 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 30934489  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30934488 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30934389  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30934388 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30934289  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  30934288 tc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3790060 - 3789556
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  3790060 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 3789961  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  3789960 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 3789861  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  3789860 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 3789761  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  3789760 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 3789661  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3789660 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 3789561  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  3789560 tctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24681959 - 24681457
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24681959 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24681860  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  24681859 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 24681760  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  24681759 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 24681660  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  24681659 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 24681560  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24681559 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 24681460  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  24681459 tct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24724486 - 24723984
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24724486 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24724387  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  24724386 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 24724287  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  24724286 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 24724187  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  24724186 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 24724087  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24724086 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 24723987  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  24723986 tct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26480910 - 26480406
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||   || | || ||  |||    
T  26480910 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttgg 26480811  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  26480810 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 26480712  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  26480711 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 26480612  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26480611 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26480512  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26480511 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 26480412  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  26480411 cctagc 26480406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33516875 - 33516370
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  33516875 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 33516776  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  33516775 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 33516676  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  33516675 cacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 33516576  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||    
T  33516575 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacg 33516476  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  33516475 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 33516376  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  33516375 cctagc 33516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 37770630 - 37771134
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  |||  | ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  37770630 acatcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 37770729  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| | |||||||||| |    
T  37770730 catgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcaca 37770829  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  37770830 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 37770929  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37770930 ttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37771029  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37771030 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 37771129  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  37771130 tctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 23718198 - 23718500
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23718198 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23718297  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23718298 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23718397  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccat 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  23718398 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccat 23718497  T
Q  879 ctc 881  Q
    |||    
T  23718498 ctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 687 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  687 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 786  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  787 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 40473192 - 40473694
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  |||    
T  40473192 acatcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttgg 40473291  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  40473292 catggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 40473391  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  40473392 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 40473491  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  40473492 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 40473591  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  40473592 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 40473691  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  40473692 tct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 11549306 - 11549005
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||     
T  11549306 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggag 11549207  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11549206 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11549107  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11549106 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11549007  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  11549006 tc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 561 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 22888444 - 22888287
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22888444 catttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 22888345  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 718  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888344 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 30168988 - 30168483
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  | |    
T  30168988 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttag 30168889  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||| ||| |    
T  30168888 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcaca 30168789  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  30168788 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttc 30168689  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  30168688 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 30168589  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  30168588 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 30168489  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  30168488 cctagc 30168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 32599115 - 32599620
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  32599115 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 32599214  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| || ||||||||| |    
T  32599215 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcaca 32599314  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  32599315 cacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 32599414  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  32599415 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 32599514  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  32599515 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 32599614  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  32599615 tctagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34617037 - 34616532
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  34617037 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 34616938  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  34616937 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 34616838  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  34616837 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 34616738  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  34616737 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 34616638  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  34616637 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 34616538  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  34616537 tctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30029934 - 30029504
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  30029934 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 30029835  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  30029834 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 30029735  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  30029734 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 30029635  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  30029634 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 30029535  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029534 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37755499 - 37754995
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  |||  | ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||  |||    
T  37755499 acatcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttgg 37755400  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  37755399 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 37755300  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  37755299 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 37755200  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  37755199 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 37755100  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37755099 gatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 37755000  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  37754999 tctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33293044 - 33292539
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    |    
T  33293044 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcag 33292945  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |    
T  33292944 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcaca 33292845  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    || ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  33292844 tatctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttc 33292745  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || |    
T  33292744 ttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaag 33292645  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  33292644 ggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 33292545  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  33292544 tctagc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 580 - 880
Target Start/End: Original strand, 22999324 - 22999624
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  22999324 ttaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 22999423  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  22999424 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 22999523  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  22999524 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 22999623  T
Q  880 t 880  Q
    |    
T  22999624 t 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 28959429 - 28959934
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  28959429 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 28959528  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||  |||||| |    
T  28959529 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcaca 28959628  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  28959629 cacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 28959728  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28959729 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28959828  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  28959829 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 28959928  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  28959929 tctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 446
Target Start/End: Original strand, 29966806 - 29967139
Alignment:
Q  113 tggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 212  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  29966806 tggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttc 29966905  T
Q  213 atatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagc 312  Q
    | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||    
T  29966906 acacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagc 29967005  T
Q  313 ttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggca 412  Q
    || || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||    
T  29967006 ttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggca 29967105  T
Q  413 acggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967106 acggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 13184846 - 13184970
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 13440692 - 13440816
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 33877211 - 33877087
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 11325768 - 11325634
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11325768 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 11325669  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325668 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 583 - 797
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  783 gtacctctttgatgc 797  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 9317367 - 9317153
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9317367 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9317268  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  9317267 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 9317168  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  9317167 tttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 691 - 869
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 12132071 - 12131889
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12132071 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 12131972  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  12131971 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 580 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 37771245 - 37771427
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || |||||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37771245 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 37771344  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37771345 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 5637826 - 5637561
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5637826 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 5637727  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  5637726 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 5637627  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637626 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 833
Target Start/End: Original strand, 15759103 - 15759320
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15759103 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 15759202  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  15759203 ttgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 15759302  T
Q  816 tttctcgaatacaataat 833  Q
    |||||| || ||||||||    
T  15759303 tttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 30151934 - 30151669
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  30151934 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 30151835  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  30151834 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 30151735  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151734 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 869
Target Start/End: Original strand, 37358901 - 37359154
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37358901 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37359000  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  37359001 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 37359100  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359101 tttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 26480308 - 26480094
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26480308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26480209  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26480208 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26480109  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  26480108 tttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 31826665 - 31826847
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31826665 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31826764  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31826765 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 37671738 - 37671920
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37671738 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37671837  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37671838 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 32599715 - 32599897
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32599715 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtca 32599814  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599815 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 28960044 - 28960226
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  28960044 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccg 28960143  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  28960144 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 28649142 - 28648937
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  28649142 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagcca 28649043  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28649042 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28648943  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  28648942 tttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Original strand, 29967312 - 29967517
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29967312 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29967411  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29967412 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29967511  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  29967512 tttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 30029331 - 30029126
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30029331 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 30029232  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  30029231 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 30029132  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  30029131 tttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 572 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 33292488 - 33292340
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  33292488 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 33292389  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 720  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292388 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 2403 - 2909
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||    
T  2403 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactg 2502  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2503 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcat 2602  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2603 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagctt 2702  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  2703 cttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaac 2802  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2803 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtag 2902  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  2903 gtctagc 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3083
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2949 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 3048  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3049 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19659249
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 19658951  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 19659050  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  19659051 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 19659150  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19659151 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 19659249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44563106
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctc 44563404  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  44563403 aatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttaca 44563306  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  44563305 atgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 44563206  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44563205 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244670
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctca 33244969  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33244869  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | |||    
T  33244868 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcagg 33244769  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33244768 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 518
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22081085
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctc 22080788  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  22080789 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttaca 22080888  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22080889 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 22080988  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22080989 gtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 22081085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710591
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 18710891  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || ||     
T  18710890 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacg 18710791  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| ||    
T  18710790 atatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcag 18710691  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18710690 gtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16283960 - 16283454
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||    
T  16283960 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatg 16283861  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    | ||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283860 gtatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcac 16283761  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  16283760 atacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 16283661  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16283660 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaac 16283561  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||    
T  16283560 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtag 16283461  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16283460 gtctagc 16283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9355133 - 9354627
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  9355133 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 9355034  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| |    
T  9355033 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcaca 9354934  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  9354933 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttt 9354834  T
Q  316 ttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |     
T  9354833 ttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgat 9354734  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  9354733 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtag 9354634  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  9354633 gtctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16278065 - 16277559
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  16278065 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16277966  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  16277965 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 16277866  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  16277865 atacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 16277766  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16277765 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 16277666  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16277665 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 16277566  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  16277565 gtctagc 16277559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19688609 - 19688103
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  19688609 gacatcattgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 19688510  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||      
T  19688509 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgc 19688410  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||    
T  19688409 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctt 19688310  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  19688309 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 19688210  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  19688209 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 19688110  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  19688109 gtctagc 19688103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 27608609 - 27609115
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  27608609 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27608708  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   || |  || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  27608709 gcatgatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 27608808  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  27608809 atacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 27608908  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  27608909 cttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 27609008  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  27609009 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 27609108  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  27609109 gtctagc 27609115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 2136963 - 2137469
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  2136963 gacatcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 2137062  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||| ||||     
T  2137063 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcac 2137162  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  2137163 atgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 2137262  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  2137263 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 2137362  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  2137363 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 2137462  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  2137463 gtctagc 2137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14558135 - 14557629
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  14558135 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 14558036  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    |||||||||||    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  14558035 gcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 14557936  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  14557935 atacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 14557836  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  14557835 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 14557736  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14557735 ggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtag 14557636  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  14557635 gtctagc 14557629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 16277497 - 16277196
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16277497 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 16277398  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16277397 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16277298  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16277297 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16277198  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  16277197 tc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19674951 - 19674446
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  19674951 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 19674852  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  19674851 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 19674752  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  19674751 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 19674652  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  19674651 ttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 19674552  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  19674551 gatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 19674452  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  19674451 cctagc 19674446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 3329212 - 3329716
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||||||||   | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  3329212 acatcactgacagtcaggaagttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 3329311  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  3329312 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 3329411  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||||| |  | ||||||     
T  3329412 cacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttc 3329511  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  3329512 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 3329611  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3329612 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 3329711  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  3329712 tctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 19208065 - 19208570
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  19208065 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 19208164  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  19208165 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 19208264  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  19208265 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 19208364  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  19208365 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 19208464  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  19208465 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 19208564  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  19208565 cctagc 19208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Original strand, 22081125 - 22081446
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22081125 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 22081224  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
       ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081225 atgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 22081324  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  22081325 tcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcg 22081424  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  22081425 ggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 31489455 - 31489960
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||  | || |||| |||| ||  |||    
T  31489455 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttgg 31489554  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  31489555 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 31489654  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  31489655 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 31489754  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  31489755 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 31489854  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  31489855 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 31489954  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  31489955 cctagc 31489960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 28361660 - 28362165
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  28361660 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 28361759  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  28361760 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 28361859  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  28361860 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 28361959  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28361960 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28362059  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  28362060 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 28362159  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  28362160 cctagc 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31355034 - 31354529
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||||||||    ||| || | ||||| ||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31355034 acatcactgacagtcaggagattatcatccatcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31354935  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| |    
T  31354934 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcaca 31354835  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  31354834 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 31354735  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |    
T  31354734 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaag 31354635  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354634 gatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 31354535  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  31354534 cctagc 31354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 12092429 - 12092933
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||     
T  12092429 acatcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgt 12092528  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  12092529 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 12092628  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  12092629 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 12092728  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  12092729 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 12092828  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12092829 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 12092928  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  12092929 tctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 29829832 - 29829328
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  29829832 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 29829733  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  29829732 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 29829633  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  29829632 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 29829533  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||    
T  29829532 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacg 29829433  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || || | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  29829432 gatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttgg 29829333  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  29829332 tctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 2137531 - 2137832
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  2137531 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 2137630  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2137631 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2137730  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  2137731 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 2137830  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  2137831 tc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 14557570 - 14557269
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  14557570 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 14557471  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14557470 gcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14557371  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  14557370 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 14557271  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  14557270 tc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19286972 - 19286468
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  19286972 acatcattgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttgg 19286873  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  19286872 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 19286773  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  19286772 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 19286673  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  19286672 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 19286573  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    | | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19286572 ggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttgg 19286473  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  19286472 tctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 27609177 - 27609478
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||| ||||||     
T  27609177 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggag 27609276  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27609277 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27609376  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  27609377 accatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 27609476  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  27609477 tc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 33259233 - 33258803
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  33259233 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 33259134  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  33259133 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 33259034  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  33259033 cacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 33258934  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  33258933 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 33258834  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258833 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 189521 - 189256
Alignment:
Q  99 gcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 198  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  189521 gcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagt 189422  T
Q  199 ctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttc 298  Q
    || |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||    
T  189421 ctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttc 189322  T
Q  299 cttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 364  Q
    |||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189321 cttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 19659299 - 19659423
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 580 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 44563047 - 44562932
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44563047 ttaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 44562948  T
Q  680 ataactgggcagcatt 695  Q
     || ||| ||||||||    
T  44562947 gtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 9354577 - 9354453
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  589 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 688  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  689 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 788  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  789 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 583 - 821
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 821  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 572 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18791218 - 18791107
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  18791218 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttg 18791119  T
Q  115 gcatgatcatgg 126  Q
    ||||||||||||    
T  18791118 gcatgatcatgg 18791107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 19208668 - 19208850
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19208668 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 19208767  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||| ||||||    
T  19208768 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttcttcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Original strand, 28362263 - 28362477
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  28362263 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 28362362  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  28362363 tggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 28362462  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  28362463 tttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 616 - 869
Target Start/End: Original strand, 3329827 - 3330080
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||    
T  3329827 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagcca 3329926  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  3329927 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 3330026  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330027 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 616 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 29829220 - 29828967
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29829220 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29829121  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29829120 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29829021  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829020 tttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Original strand, 19518451 - 19518665
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  19518451 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtca 19518550  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19518551 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19518650  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  19518651 tttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 33258630 - 33258425
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  33258630 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 33258531  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  33258530 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 33258431  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  33258430 tttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Original strand, 12093041 - 12093306
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12093041 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagcca 12093140  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  12093141 tagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 12093240  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093241 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 14142980 - 14143479
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14142980 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 14143079  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14143080 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 14143179  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  14143180 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 14143279  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  14143280 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 14143379  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14143380 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26788445 - 26787946
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26788445 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26788346  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788345 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26788246  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26788245 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26788146  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26788145 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26788046  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26788045 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27196818 - 27196319
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27196818 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27196719  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27196718 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27196619  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27196618 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27196519  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27196518 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27196419  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27196418 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 27252422 - 27252921
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27252422 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27252521  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27252522 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27252621  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27252622 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27252721  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27252722 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27252821  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27252822 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22457128
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 22456828  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  22456829 aatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcaca 22456928  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22456929 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22457028  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22457029 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 521
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13522267
Alignment:
Q  22 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  122 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 13521967  T
Q  222 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  13521968 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 13522067  T
Q  322 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 421  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  13522068 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 13522167  T
Q  422 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13522168 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892504
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8892206  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8892207 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8892305  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8892306 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8892405  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8892406 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903739
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8903441  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8903442 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8903540  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8903541 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8903640  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8903641 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374450
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 33374151  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33374251  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  33374252 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 33374351  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33374352 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162659
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 28162958  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 28162858  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | |    
T  28162857 tgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaag 28162758  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28162757 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28162659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 27290058 - 27290564
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  27290058 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27290157  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27290158 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcat 27290257  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||    
T  27290258 atacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagctt 27290357  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  27290358 cttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaac 27290457  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27290458 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtag 27290557  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  27290558 gtctagc 27290564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 13298639 - 13299145
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||    
T  13298639 gacatcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttg 13298738  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  13298739 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 13298838  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  13298839 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 13298938  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  13298939 cttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 13299038  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  13299039 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 13299138  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  13299139 gtctagc 13299145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 518
Target Start/End: Original strand, 27272268 - 27272771
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||    
T  27272268 gacatcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttg 27272367  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||| |||||     
T  27272368 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcac 27272467  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |  || ||||| |  ||||||||    
T  27272468 atacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctt 27272567  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||    
T  27272568 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgac 27272667  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27272668 ggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 27272767  T
Q  515 gtct 518  Q
    ||||    
T  27272768 gtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 22934568 - 22935074
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  22934568 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 22934667  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  22934668 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 22934767  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  ||||||||    
T  22934768 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagctt 22934867  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22934868 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaac 22934967  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22934968 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 22935067  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  22935068 gtctagc 22935074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 23857013 - 23857519
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  23857013 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 23857112  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  23857113 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 23857212  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  ||||||||    
T  23857213 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagctt 23857312  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23857313 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaac 23857412  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  23857413 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 23857512  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  23857513 gtctagc 23857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918382
Alignment:
Q  19 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 118  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  119 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 26918685  T
Q  219 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 318  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||||||     
T  26918684 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttc 26918585  T
Q  319 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 418  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26918584 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26918485  T
Q  419 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26918484 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 26918385  T
Q  519 agc 521  Q
    |||    
T  26918384 agc 26918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26989510 - 26989003
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagt 113  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  26989510 gacatcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactt 26989411  T
Q  114 ggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 213  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26989410 ggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 26989311  T
Q  214 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagct 313  Q
     |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||    
T  26989310 catacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagct 26989211  T
Q  314 tttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 413  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||    
T  26989210 tctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaa 26989111  T
Q  414 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagta 513  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  26989110 cggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagta 26989011  T
Q  514 ggtctagc 521  Q
    ||||||||    
T  26989010 ggtctagc 26989003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 24304306 - 24304812
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24304306 gacatcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24304405  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||| ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  24304406 gcatggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24304505  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  24304506 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 24304605  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24304606 cttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24304705  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24304706 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 24304805  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  24304806 gtctagc 24304812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16750361 - 16749856
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  16750361 acatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 16750262  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| |    
T  16750261 catgatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcaca 16750162  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||     
T  16750161 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 16750062  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  16750061 ttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 16749962  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16749961 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 16749862  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  16749861 tctagc 16749856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20161182 - 20160704
Alignment:
Q  42 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 141  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  20161182 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 20161083  T
Q  142 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 241  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  20161082 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 20160983  T
Q  242 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 341  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20160982 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 20160883  T
Q  342 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 441  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20160882 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 20160783  T
Q  442 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 520  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20160782 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 22171649 - 22172127
Alignment:
Q  42 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 141  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  22171649 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 22171748  T
Q  142 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 241  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  22171749 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 22171848  T
Q  242 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 341  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22171849 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 22171948  T
Q  342 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 441  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  22171949 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 22172048  T
Q  442 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 520  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22172049 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24864225 - 24863719
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24864225 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24864126  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  24864125 gcatgatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24864026  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  24864025 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 24863926  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24863925 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24863826  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  24863825 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 24863726  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  24863725 gtctagc 24863719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 15424005 - 15424511
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |    
T  15424005 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcg 15424104  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  15424105 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 15424204  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  15424205 atactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 15424304  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  15424305 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 15424404  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  15424405 ggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 15424504  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  15424505 gtctagc 15424511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477467
Alignment:
Q  295 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 394  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  395 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcat 494  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  495 tggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 29549982 - 29549477
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||    
T  29549982 acatcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttgg 29549883  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||||| |    
T  29549882 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcaca 29549783  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||     
T  29549782 cacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 29549683  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  29549682 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 29549583  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  29549582 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 29549483  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  29549482 tctagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Original strand, 17092129 - 17092427
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||     
T  17092129 acatcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgc 17092228  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | || || |||||| ||| |||||||||| |    
T  17092229 tatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcaca 17092328  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092329 tacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 34463035 - 34463537
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  34463035 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 34463134  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  34463135 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 34463234  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  34463235 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 34463334  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  34463335 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 34463434  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  34463435 gatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttgg 34463534  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  34463535 tct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 574 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 20160650 - 20160345
Alignment:
Q  574 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacg 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||| |    
T  20160650 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 20160551  T
Q  674 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 773  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20160550 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T
Q  774 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 873  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  20160453 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 20160354  T
Q  874 tccatctca 882  Q
     ||||||||    
T  20160353 accatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 574 - 882
Target Start/End: Original strand, 22172181 - 22172486
Alignment:
Q  574 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacg 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||| |    
T  22172181 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 22172280  T
Q  674 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 773  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172281 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T
Q  774 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 873  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  22172378 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 22172477  T
Q  874 tccatctca 882  Q
     ||||||||    
T  22172478 accatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 13299207 - 13299508
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  13299207 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 13299306  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  13299307 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 13299406  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  13299407 accatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 13299506  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  13299507 tc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 29573520 - 29573015
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  29573520 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 29573421  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  29573420 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 29573321  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  29573320 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 29573221  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  29573220 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 29573121  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  29573120 gatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 29573021  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  29573020 tctagc 29573015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4773513 - 4773009
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  4773513 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 4773414  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4773413 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4773314  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  4773313 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 4773214  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4773213 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4773114  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4773113 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 4773014  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  4773013 tctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3696588 - 3696086
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||    
T  3696588 acatcgctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttgg 3696489  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  3696488 catgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcaca 3696389  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  3696388 catttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 3696289  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  3696288 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 3696189  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3696188 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 3696089  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  3696088 tct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16674646 - 16674144
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  16674646 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 16674547  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  16674546 catgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 16674447  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  16674446 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 16674347  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  16674346 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 16674247  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16674246 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 16674147  T
Q  516 tct 518  Q
    |||    
T  16674146 tct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Original strand, 4545464 - 4545960
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  4545464 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 4545563  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4545564 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4545663  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  4545664 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 4545763  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4545764 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4545863  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4545864 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4758271 - 4757767
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||  |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  4758271 acatcactgacagtccgaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 4758172  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4758171 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4758072  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  4758071 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 4757972  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4757971 ttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4757872  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4757871 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 4757772  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  4757771 tctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 26988941 - 26988640
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  26988941 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26988842  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26988841 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26988742  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  26988741 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26988642  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  26988641 tc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4525793 - 4525289
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  4525793 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 4525694  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4525693 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4525594  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  4525593 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 4525494  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||   |||||| ||||||||||    
T  4525493 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacg 4525394  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4525393 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 4525294  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  4525293 tctag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Original strand, 4723823 - 4724319
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||  |||    
T  4723823 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttgg 4723922  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  4723923 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 4724022  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||| ||     
T  4724023 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttc 4724122  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  4724123 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 4724222  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4724223 gatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 30557705 - 30558210
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  30557705 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 30557804  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  30557805 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 30557904  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  30557905 cacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 30558004  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||    
T  30558005 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacg 30558104  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30558105 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtagg 30558204  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  30558205 cctagc 30558210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27008234 - 27007730
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  27008234 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 27008135  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | |    
T  27008134 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttaca 27008035  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| ||||  ||||||||     
T  27008034 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttc 27007935  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  27007934 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 27007835  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  27007834 gatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 27007735  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  27007734 tctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28207961 - 28207465
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||     
T  28207961 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgt 28207862  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  28207861 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 28207762  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  28207761 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 28207662  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  28207661 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 28207562  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28207561 gatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000075
Alignment:
Q  202 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 301  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  302 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 401  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  402 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 501  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  502 ggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagc 27000075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Original strand, 27359680 - 27360185
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||    
T  27359680 gacatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttg 27359779  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||||||||||     
T  27359780 gcatgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcac 27359879  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||    
T  27359880 acacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagctt 27359979  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  27359980 cttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 27360079  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  27360080 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttg 27360179  T
Q  515 gtctag 520  Q
    ||||||    
T  27360180 gtctag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Original strand, 27450023 - 27450528
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||    
T  27450023 gacatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttg 27450122  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||||||||||     
T  27450123 gcatgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcac 27450222  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||    
T  27450223 acacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagctt 27450322  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  27450323 cttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 27450422  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  27450423 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttg 27450522  T
Q  515 gtctag 520  Q
    ||||||    
T  27450523 gtctag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27485636 - 27485132
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27485636 acatcactaacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27485537  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| |    
T  27485536 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 27485437  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  27485436 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 27485337  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  27485336 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 27485237  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  27485236 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 27485137  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  27485136 tctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 580 - 830
Target Start/End: Original strand, 24304874 - 24305124
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24304874 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24304973  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24304974 gcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24305073  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305074 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 26116099 - 26116603
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  26116099 acatcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 26116198  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  26116199 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 26116298  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  26116299 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 26116398  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26116399 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26116498  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  26116499 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttgg 26116598  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  26116599 tctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27044895 - 27044390
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  27044895 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttgg 27044796  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  27044795 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 27044696  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  27044695 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 27044596  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgt-agcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
    || || || ||||||||||| | | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  27044595 ttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 27044496  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  27044495 gggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttg 27044396  T
Q  515 gtctag 520  Q
    ||||||    
T  27044395 gtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 580 - 724
Target Start/End: Original strand, 22477529 - 22477673
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  22477529 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagag 22477628  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 724  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477629 gtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Original strand, 16943716 - 16944146
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  16943716 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 16943815  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  16943816 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 16943915  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  16943916 cacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 16944015  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  16944016 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 16944115  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944116 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 29501922 - 29501418
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  29501922 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 29501823  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| |    
T  29501822 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 29501723  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  29501722 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 29501623  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  29501622 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 29501523  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||    
T  29501522 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttgg 29501423  T
Q  516 tctag 520  Q
    |||||    
T  29501422 tctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17025652 - 17025280
Alignment:
Q  148 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 247  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  17025652 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 17025553  T
Q  248 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 347  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  17025552 gaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 17025453  T
Q  348 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 447  Q
     |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||    
T  17025452 gacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtg 17025353  T
Q  448 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 520  Q
    ||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17025352 cagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 28162619 - 28162485
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162619 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 28162520  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162519 gcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 13522317 - 13522441
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 695
Target Start/End: Original strand, 33374500 - 33374624
Alignment:
Q  571 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 670  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  671 acgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 26777299 - 26777809
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  26777299 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 26777398  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtg-----gcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcc 210  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |     ||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||  ||||    
T  26777399 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcc 26777498  T
Q  211 tcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatga 310  Q
    ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||    
T  26777499 tcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatga 26777598  T
Q  311 gcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggagg 410  Q
    | || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||    
T  26777599 gtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggagg 26777698  T
Q  411 caacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaa 510  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||     
T  26777699 caacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaag 26777798  T
Q  511 gtaggtctagc 521  Q
    || ||||||||    
T  26777799 gttggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Original strand, 8892544 - 8892678
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8892544 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 8892643  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892644 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 561 - 695
Target Start/End: Original strand, 8903779 - 8903913
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8903779 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgc 8903878  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 695  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903879 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 29549426 - 29549117
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  29549426 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 29549327  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29549326 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  29549226 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 29549127  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  29549126 tgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 572 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  572 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 671  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  672 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 771  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  772 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 871  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  872 tgtccatctc 881  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27019643 - 27019461
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || |||| ||||| |||||| | |||| |||||||  |||    
T  27019643 acatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttgg 27019544  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 198  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||    
T  27019543 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 612 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  612 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 711  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  712 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27485021 - 27484807
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27485021 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 27484922  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  27484921 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 27484822  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  27484821 tttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  816 tttctcgaatacaat 830  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 29572917 - 29572735
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29572917 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29572818  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  29572817 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  791 ttgatgca 798  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 691 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  791 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Original strand, 34463620 - 34463867
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  34463620 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 34463719  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34463720 tttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34463819  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463820 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Original strand, 4546076 - 4546341
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4546076 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4546175  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  4546176 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 4546275  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546276 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 821
Target Start/End: Original strand, 16944319 - 16944524
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16944319 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 16944418  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  16944419 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 16944518  T
Q  816 tttctc 821  Q
    ||||||    
T  16944519 tttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 28207346 - 28207081
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28207346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 28207247  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  28207246 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 28207147  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207146 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 16674064 - 16673817
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  16674064 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 16673965  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16673964 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16673865  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673864 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 798
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  791 ttgatgca 798  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 798
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  691 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 790  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  791 ttgatgca 798  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 869
Target Start/End: Original strand, 4724435 - 4724688
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4724435 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4724534  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  4724535 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 4724634  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724635 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 27629389 - 27629645
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||  ||| ||   |||| ||     
T  27629389 acatcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgt 27629488  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||| || || |  || || ||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||| |||| ||||| |||||    
T  27629489 catgatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcata 27629588  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagg 272  Q
      | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||    
T  27629589 cgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgagg 27629645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 869
Target Start/End: Original strand, 27629968 - 27630254
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | ||||| |  |||  ||    
T  27629968 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggta 27630067  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
     ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27630068 gctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgcc 27630167  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
     |||||||| ||  || |||  || || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630168 atacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 697 - 798
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  697 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 796  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  797 ca 798  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 869
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  688 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 787  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  788 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 869  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 23 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22064 - 21569
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 122  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22064 tgacaatcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatc 21965  T
Q  123 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||| |||  |||||   |||     
T  21964 atggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcg 21865  T
Q  223 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  323 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 422  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  423 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 21569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 21529 - 21208
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21529 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 21430  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
       ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21429 atgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 21330  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||    
T  21329 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcg 21230  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  21229 ggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 561 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 20374 - 20053
Alignment:
Q  561 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 660  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20374 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggc 20275  T
Q  661 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 20175  T
Q  761 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20174 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20075  T
Q  861 agtccccatgatgtccatctca 882  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20074 agtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 183 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20730 - 20393
Alignment:
Q  183 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 282  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20730 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 20631  T
Q  283 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 382  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 20532  T
Q  383 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 482  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 20432  T
Q  483 ggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20431 agcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagc 20393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30964 - 30532
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataa-ttgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  30964 gacatcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactt 30865  T
Q  114 ggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 213  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30864 ggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 30765  T
Q  214 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagct 313  Q
     |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||    
T  30764 catacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagct 30665  T
Q  314 tttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 413  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||    
T  30664 tcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaa 30565  T
Q  414 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 446  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30564 cggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 30396 - 30095
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  30396 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 30297  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30296 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30197  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30196 accatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30097  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  30096 tc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 243 - 521
Target Start/End: Original strand, 1 - 279
Alignment:
Q  243 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  343 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  443 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 183 - 456
Target Start/End: Original strand, 1831 - 2103
Alignment:
Q  183 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 282  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1831 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 1930  T
Q  283 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 382  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 2029  T
Q  383 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6524 - 6080
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  6524 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 6425  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| |    
T  6424 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcaca 6325  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  6324 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 6225  T
Q  316 tttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 413  Q
    || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||    
T  6224 ttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaa 6125  T
Q  414 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 458  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6124 cggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5682
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaat-ggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaat 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||       
T  5930 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggc 5831  T
Q  682 aactgggcagcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtta 780  Q
    |  || |  ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  5830 atttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccatta 5732  T
Q  781 ccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 830  Q
    || || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5731 ccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 46730 - 47236
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  46730 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 46829  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  46830 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcac 46929  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  46930 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 47029  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  47030 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 47129  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  47130 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 47229  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  47230 gtctagc 47236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 39814 - 40320
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  39814 gacatcattgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 39913  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  39914 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 40013  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||     
T  40014 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctc 40113  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| ||||||    
T  40114 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaac 40213  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  40214 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 40313  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  40314 gtctagc 40320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 30274 - 29768
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | |||| |||||||  ||    
T  30274 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttg 30175  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    || |||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  |||||||||||     
T  30174 gcgtgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcac 30075  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  30074 atacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 29975  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  29974 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 29875  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  29874 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 29775  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  29774 gtctagc 29768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 583 - 881
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  583 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 682  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  683 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 782  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  783 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47599
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |||     
T  47298 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggag 47397  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  47398 gcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 47497  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  47498 accatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 47597  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  47598 tc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 380
Target Start/End: Original strand, 364 - 728
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| |||    
T  364 acatcgctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattgg 463  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  464 catgatcatggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcata 563  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||     
T  564 agtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttc 663  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  664 tttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27804 - 27297
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagt 113  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  27804 gacatcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactt 27705  T
Q  114 ggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 213  Q
    |||||||||||||  ||| | ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  27704 ggcatgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctca 27605  T
Q  214 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagct 313  Q
     |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||    
T  27604 catacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagct 27505  T
Q  314 tttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 413  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||    
T  27504 tcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaa 27405  T
Q  414 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagta 513  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  27404 cggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagta 27305  T
Q  514 ggtctagc 521  Q
    ||||||||    
T  27304 ggtctagc 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 27235 - 26934
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  27235 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 27136  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27135 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27036  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  27035 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26936  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  26935 tc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 10076 - 9571
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  10076 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 9977  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  9976 catgatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 9877  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  9876 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttc 9777  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  9776 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacg 9677  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9676 gatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttgg 9577  T
Q  516 tctagc 521  Q
    ||||||    
T  9576 tctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 612 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  612 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 711  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  712 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 811  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  812 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Original strand, 7 - 381
Alignment:
Q  148 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |    
T  7 agcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttg 106  T
Q  248 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||    
T  107 gaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctc 206  T
Q  348 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 447  Q
     |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  207 gacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgta 306  T
Q  448 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaact-cggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 521  Q
    || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  307 caatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 881
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  580 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 679  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  680 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 779  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  780 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 8812 - 9317
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  8812 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 8911  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| |    
T  8912 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 9011  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  9012 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 9111  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  9112 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 9211  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9212 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 9311  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  9312 cctagc 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20526 - 20020
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaata-attgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    |||||||||||||||| | | ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||    
T  20526 acatcactgacagtcagaaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttg 20427  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||||     
T  20426 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcac 20327  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||    
T  20326 acacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagctt 20227  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  20226 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 20127  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20126 ggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 20027  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    | |||||    
T  20026 gcctagc 20020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 794
Target Start/End: Original strand, 9415 - 9593
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  9415 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 9514  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttga 794  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  9515 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 6985 - 7490
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  6985 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 7084  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  7085 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 7184  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  7185 cacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 7284  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  7285 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 7384  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 515  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  7385 gatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 7484  T
Q  516 tctagc 521  Q
     |||||    
T  7485 cctagc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 798
Target Start/End: Original strand, 7588 - 7770
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7588 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 7687  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 798  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  7688 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Original strand, 14675 - 15181
Alignment:
Q  15 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 114  Q
    ||||||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||    
T  14675 gacatcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttg 14774  T
Q  115 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 214  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  14775 gcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcac 14874  T
Q  215 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 314  Q
    | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||    
T  14875 acacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagctt 14974  T
Q  315 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 414  Q
     || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  14975 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 15074  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15075 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtag 15174  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    |||||||    
T  15175 gtctagc 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 521
Target Start/End: Original strand, 25947 - 26453
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  25947 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 26046  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |    
T  26047 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcaca 26146  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||||     
T  26147 catttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttc 26246  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaac 414  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| | |||||||||    
T  26247 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaac 26346  T
Q  415 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 514  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  26347 ggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtag 26446  T
Q  515 gtctagc 521  Q
    | |||||    
T  26447 gcctagc 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Original strand, 26551 - 26816
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26551 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26650  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  26651 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 26750  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26751 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8459 - 7963
Alignment:
Q  16 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||     
T  8459 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgt 8360  T
Q  116 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 215  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| |    
T  8359 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 8260  T
Q  216 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 315  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  8259 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 8160  T
Q  316 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 415  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  8159 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 8060  T
Q  416 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 512  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8059 gatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 7844 - 7579
Alignment:
Q  616 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 715  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7844 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 7745  T
Q  716 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 815  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  7744 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 7645  T
Q  816 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 881  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7644 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 687 - 881
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  687 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 780  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  781 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 879  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  880 tc 881  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Original strand, 46604 - 46981
Alignment:
Q  77 agcaacccaaa-ggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat-catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagagga 174  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  46604 agcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagagga 46703  T
Q  175 gttgcaatgttacgaacgtcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgag 271  Q
    ||||  |||||||| || ||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  46704 gttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcg 46803  T
Q  272 ggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagc 365  Q
    |||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| ||    
T  46804 ggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggc 46903  T
Q  366 accttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggc--ttgccctgtct 440  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  46904 gccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 119651 - 119706
Alignment:
Q  23 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtag 78  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  119651 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtag 119706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University